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GrainGenes Sequence Report: AE027186

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Sequence
AE027186
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE027186
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ACTTTCCCACCGCCTGCAAAAAAAAAGATTAATTACAGGCAAGCCCCTCG
CTACTTCTCTGTCTCTCTTCTGCCCTCGTCGCCTTCTTCCTCCTCCAGCT
CCTGACTCCAATTCCCTTCCCACCCCAAACCCTAAAAACCTGAATGGCTC
TCGCCGCGAGCTCCCCGGAGGCTCTGTGTCATCCCCAGTGACCGCCGATC
CGCCCCGCCCCCGCCGGCCCCGGCCGGGCCGAGCCGCAGCGGCCCGAATC
TCGGAGGAGGAGTCGAGATGGCGACGCGGCCGCACAACCAGAAATCCAAG
ACGCTCGACAACAAATACGTGAGCGTCCCCCCGCCACACCGCCTCGGATC
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CTCTCACTCACTGTGTTTGTGTATGTGTGTGTGGGCGGGCGCAGATGCTG
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CCAAATACGTGACATGGATTTTGACAAATGTAGCACGTCGTATGTTTGTC
GAGCGCGGTCATATACTCATATGGAGGATCTCTTTTCCAAATTCACAACA
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GAGCTTGTGAGCTCCTTTTTCCAAAATAGATGACATAGACTTCGGCAAAC
GTGGACTTGGGAAAGAAACATGACAGTTGACATAGTCAAATGCTGTCCAC
TGCTGTTTCATTATCTTCTATATTTATGTGATTGGTGTTGTTTCCCAGAT
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TAGACATAGTATTAGTAACATTCCATTAAATGTTCCACAGGGATTCGATT
GTTTCCTCATCTGTTACAGAATACTCGTGCTTGTACAAAGCCTTGTAACT
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TTTCATTGACTGGACTGTCTAAATGGGAAACCATGCTGGTTGACATTTTT
GCTGGGCCAATTGTGAGCCAACTGTTGAAGTCATATAATTGTTGTGGTTC
ACAAAAATTAATACAAACTATAAAGTACTAGTAGTTTGTATAAGTTATAT
GGCTATGTACTACTCATGAATATACTCGAGATTAATTTTAGAAGTTTATC
CTGTTAGTGTTAATCTCGTGGAAATGGAATGACACTAATGCCACACTTTT
GTTTCCTTTTGTTACTTGGTGCGCATATAGGTTTAGTGCTGAAACGAGTC
TTTACCTTTAAGCAATTGTCATGTACTACAAGCAATTGTACACATAATAT
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CACCGTAATATTTGGTTCTAACAAACTATCTTTTGTGTATGTTCTGTTAA
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CTACTCTGTTACATTTTCCCCCATTTCGTGTTTACTTAATTTTTGCTGTT
GCCATTTTCTACTATAGTCAAAGTTCTGTGTGCCAAATTTATGCTGAAGA
ACAATGAGAGGCACCCTTCCCTCAGTTGACATCATAAATTATGTGAACTT
ATTTTTGAATGCTCAGCTAGCTATGTAAACACATGATACTCCCTCTGTCC
CAATGGCATGTGGCGCCATAGATTTGAGTGTTTTTTCTTTGACCACTAAT
TTGACCAATAATACGTATCATTTGTTGTAAAAATTATACCATTAAAAACT
TTATTTGAGTATGTATTCAATGGTATAATTTTTGTGACAGACGATTCATG
TTTTGTTGGTCAAACTTCGAGCTCGAAAAGTGTGTACGCCACCTAAATTG
GGACTGAGGGAGTAGAAATTAACGTGGATGATCAGAAGTGTATGAAAGGG
TCTTGATTTCTTGATTTTTAATATAGATATTATGTCCTTTTTTTTTATCC
CTCATATCATACCTATTGTTAAAAGACCCTTGATTTTTGAACATCTATTT
CGCTCCTTTAGTTGATGCAAATGTTTTCGAGAATTGCGTTGCTTTGAGCT
GAAGGTTTTCTTACTTTATACAGAATCTTAATCACAAAAATATTGTGAAG
TATCTTGGATCATTGAAGACAAAGAGCCACCTCCACATAATTCTAGAGTA
AGAAATCTCGAATCTTCACCGACAATGTTTGATAAGAAGTACATGCATAA
CAGTAAATTTTAGCACTGATACTGTGTGATGATGTAAGGTATGTGGAAAA
TGGTTCACTTGCCAATATCATAAAGCCAAACAAATTCGGACCATTTCCTG
AATCATTGGCTGCTGTTTACATCGCTCAGGTGGATATACGGTGATTACTG
TGACTTTACATTTTTTTGGCTATGTCCGCTTCTAACTTATACATTACTTA
CCAGGTGTTGGAAGGCCTTGTTTATCTGCATGAGCAAGGTGTCATACATA
GAGATATCAAGGGTGCAAATATATTGACCACGAAAGAGGTAAATGGCTCC
ATCACTTGCATATTTGAGCATGGTTTTTATTTGGTTTTATTACTTCTGAT
GAGTGATGCTGAAGTCAGGCGACAGTATTAGCTTATAAGGAAAAACTATA
GAAGGGATATGAAATCTTTCTACAGTTCTGTGAATATTATGTTTCAAATC
AATCTTTTGAATGAACTTTCTGTTGGTAAGAAAATAAAAAGATGCATGGA
ATGGGCATCCTGGGATGAACTCGTGGAGATATCGCAGCCTGGCATTTTTT
GTTGGAATAGATAACTACAGATGTACTATAACATTAGCTGGTTTTATTGT
CTGCTCTTGATGCTTTGGCCTTTGGGTAGTAAAAAAAAGGACAAATCCAG
CATCAGTTACAATATGATGATTCTCAAGCTACATGTTAGTATGTTGGAAC
CTATGACATTTTTTGTTGCTGTAGAGTGAATATTATGCGCATAACCAGGA
AGCACACAACTTGATTAATATTTGCTATAATCTGGTTGTACTTCTTTCAC
TTGGTACAGTACTAGTATGTGTAATAGCCGCCAATCCTTGATAGCCGCAA
GCATGATCCCTCAGTTGTAGTCACATGGAGGAAGTAGCTACTTAGCCAGT
AATATGTTGCACAGAAATATTTAATATGATTGATGAGGCACAAGATCAAA
CTTGAAATCTACACCTACCATGGTGCACGACCAAAGGGCATTAGAAGTCA
TATTTTATTGTGATATGTTACTATTTTCCCCTGAAGCTCTCATTTATTGT
TTAGGGCCTAGTTAAACTTGCTGATTTCGGAGTTGCTACTAAATTAACTG
AAGCTGATGTAAACACACATTCAGTGGTTGGAACACCATACTGGATGGCC
CCTGAGGTATGCTAATTTCCTGTACCTTCTATGGCTGCTGAATTATTTGT
TAGGTCCACTGGCACGCCGGATTAGTTTCTTAACTTGTTAGTTGTACTCC
CTGTGTCCAGAAAAGGATTTCTCAACTTTGTCTAGATTCACATGTATCTA
CACACTGAAATGCATCTAGATCATGGTTTTTAAGGTGTTAAGGCGACCTA
AGGAGATCTAGGGGCGCTCTGACGCCTAGGCGGGCGCTTTGGATGCCTAG
GCGCCTAAAGTGGCCATTTTTCCAAAGCGGAGGAGGGGCGCCTGGACGCC
TAAGCTAGGCTACGCCTTTTAAACCATAATCTAGATACATGCAAATCTAG
AAAAAGGATCCTTTTCCGGACAGAGGGAGTAGTTTTTTTATTGTTAGTTG
TCTTAAAGGTGTTGTCCTGTTCCATTGTACTTTGTAATCAAATTTGAAGC
ATTACATAGAAATAGTACAAGCATCACTTCAGGAAAAAAACCATTTACCT
AGATGAGCATAATTAAATTTAATATTCCTCCTTTTTGTTGCTGATAGAAT
TTGTTGAAACTGTGAGTATGTGGTAAAGGAACTTATTCTGTCAGTGTGGC
AGATGACTTGAGTGATCAAATTACCCCTCTGTTTCATATTATAAGACGCT
TTGGGAAACGGTGATATTTTCTTTTCCACGGCGATAATTTTGACACAAAG
AACCAGCAAATGTATGGTGCGAAAGTAAGACTTCATCCACTGGATCTGCT
CCAGGAGACCAGGATAAGAAAAAACTTAGTAAATATACTAAATTGCACGA
AGTGCTATTAGCATCTGGAATACTAGTATAACATAGTCAAACCAATACTG
CTGATATGATAGCATCACAGCAGGCGTTAGCAGCCAAAATCGATCAAATC
TTAACTTTTGGCTATAGTTAATATTGCAAGGTGCTAGTATGTGGCAGCTA
TAATTGTCGACTGAGGTTCCATTTGACTTAAAATCCTTGCTATTATGTCA
TATTATCATGATATTTTGACTTCTCTTCAATCTTCATCATCTCTTTTCTG
CATATATTATCATGATATTTTGACTTCTCTTCAATCTTCATCATCTCTTT
TCTGCATATATTATCATGATATTTTGACTTCTCTTCAATCTTCATCATCT
CTTTTCTGCATTAGGTCATTGAAATGTCTGGTGTTTGTGCTGCATCTGAT
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TGCATCCACCAATACCAGAAGGATTCTCTCCTGAGAGCACTGATTTTCTG
CGTCAATGTTTTAAAAAGGTTTTTTATTGTATCTCGTTACTATTTTTTAG
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AGACGAGTAGCTTTTTAGACTGTAATATTATTTCTATATAAATAGACACA
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CGTCTATCTCTCGATCCTCTTTTTCTCACTTGACGACTGACGACGTCTGT
GCCACTGCCTGCCGCTCTGGCCGCCGCACACTGGCGAGGTTCGGCCCTGG
TCTCCTCCACCAATTCCCTGCCACATATGTCTGCGCCTGTACGCACGCGA
CCTGCCAACCCTAGCTTGGTCTTTTGCACGCGACCTGCCAACCCTAGCTT
GGTCTTTTGCAGTTTCGGCCGCTGCCGCTGGTTCTACATGGCTCTGCCAC
TGCTGTTCTACATGGCTCCGCCATGGTCTCCTCTCCTCGACCGGTTCCGA
AGAAAAAGAAGCTGTGTGTCGTTTGGTCAGGGAGAGAAGAAAAAAGATGG
AACCGTTACCATGGCAATAGTGTGTTAAATTTAGTTTGGTGTGGGGATAA
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ATATGTTTGTTCCATGCTCATTCCGATTGTTCTATCTCATGGCATTTCTC
TCCATTTGTAAATATTGGATACTAACAACTACTACAGCAATGTGACAATC
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GTTGACGAGGATGATCCAGTCCCAAGTGGTGATAATCATGCTGGGTTTTC
TGGCCCACCAGGAGATACACAATCGCCCGTGGCTTCTGACATTGAACAGG
TAAGCTCTTCAGGGTTCTTTTCACACCATGTTCATTTTCCTTGCATGGTA
TCCGTTTAAAGTCTCATGGGTCTCCCATGAGATTATAGTGGTCTCAGTAT
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CTGAATCTGCTGGACATGGTAAATCTGACGAGCTTCATGATGGAAAACCT
GCCGAAAGCAGTAGTTCAAAAACTGTGGAACTTATGAACGATAATGTGGT
TCCCAATAAAGACCCTACATTAGTTTTTCATGAAAAACTAGCAGTGGAAT
CTTCTTCTGGAGTTACTGATTTAAATGGTAAGGTATTACATGAACTATCC
CCAGATGGTCTGCCAAGTAAGGTAGTTAGGAGCAGCCAAGAATCAAAAAA
GGGTGACAGCAATCATTTAGAGCTTGAAGGTAAAGAACGTTCAAGTTTTG
AAGATGACGATGCTTTCTCCTTCCAGGCTGGGAGACAGAATATCAATTTC
CAAAAGGTTAGAACTCTCTGTATGGTAATTTGGCTTTGCACGCAGAAAAA
ATCTAGTGCTTTCTTGGCCAAGAATGCAGATACTTGATTCTTTATGGCAT
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AAGGAGCTCAAGGCTAGGATGGCAGAGAAGCAGAAGGAAAATGAAAATGA
GCCCATGAATGGTGGGAAACTTCTTCAATTATTGCGTTTTAGGGATGGCG
ATCTTGATGGAGCGGTATTGCTTTCACTACTATGTGTTCTACTTTCCCTT
CTTTTAGAAAATCAAAAGATAGATGAGATTTTGATTACTGTACCTGACAT
GATATTATCATCAAACTCATTGTGCAGGAATTTCACGACAACATTCCAGG
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CTTGGCAGCGGCAGCGATCCACTGCTTGGTTGCAAATTCACAGTCCACAT
TAAATTTCAATTGTCTAGACCTAGATATGTTGTTCTTCAAGGTGTTTTAA
GTGAAATGCCATGTATTTACATTACTTTGGTTTTCATACATTTCTAGTTG
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TGGAGTACAGCAAAATAGTAGCACAGCTGAATCCTGGGGAAAATGAAGAA
GTAATATTATCAGCATGCCAAAAGCTTATGCTGTTCTTCAATCACCGGCC
TGAGCAAAAAAAGATTTATGTGTCACAGAACGGTTTCCTTCCATTGATGG
AGCTTCTTGAACTTCCCAAAAACCGTGTATGGAGTTTTACTTTAGTTTTA
CAAAGTATTTTTTGGTGGTCTTTACGCTGAAAATTGTCTGTTTATTTCCT
GCAGATTATATGCTCTGTTTTGCAACTCATCAACTACATTGTAAAAGATA
ATACAGGCTTCCTAGAAAATGCCTGTCTTGTTGGCCTTGTGAGACTTTTG
CTCCACTTCCGAAGTAATTTATGACCTATAAATTGTGTTGACATTGTAGA
ATAGATGATTGATATTAGAAATTTATTTGCAGATTCCTCTGGTGATGAAT
TTTGCTGTGCCAGATCGTGCAAAGGAAGTCCGGATGCAAGCATCCTTTTT
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CAGTTTTCCATCTCCAGCACCTTGACGTTGCAAATGTTCATTGCATGCCA
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GGTAAGTCTGTACATTTTTGTCTCAAACATTTCAGTTAAATTTTCCTGTT
GCATCCTTTCGTATTACTAATCTTTCATGATTAATATATTCCATAATATT
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TGAAGCAACACGATATGCTTCTATCTCTGGGTCAGGTGTTTCAGTCACAC
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GCAGTCTGTACAAGCAGATGGAGATAAGCATAATATTTTATTGGAACCTT
CAGCATCACCTAGGTTTGGCGATATAACTGCTGCTGGTCACATTGATAGA
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GTCATCAACAGACAGATCTCCGAGGCATATAGAACTAGTATCAAATGGGC
ACAGTAGTGGTCAGAACGATCAAATCCGACCTCTACTTAGTTTGTTGGAG
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CAGAGAGGAAAACAAATGGTGAACTTGACTTGTTAATGGCAGAATTTGCT
GGTACAGTTCTTAATTCCGATTCTTTATTTTATTTTTTAGAATATTATAG
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GGATATGCCCTTACAGTGCGGCTTGCTACTACTTTGCCTTCTGTTCCTAC
CTCAGGGCTCTGCTACTTGTCTGCTTCTCCCCAACCTCCCTTGATCAGTG
AGGGGTTAAAGTTTGGGTTTACAGATGAGCTTCGAAAAGAGGTTGGTTGT
GGTTGCAGGGGTGTTGATGGCAAGCACGTTGTGGGTGGAGGAGAAAGGGT
CTGGGAGGTAGGGAGATGTCCAGCTGGGAAATATATGGGGAATGGGAGAG
TAGGAGATGTGTAACTTGTTGCAGACTATATCGTGCATGGTGCAACCTGT
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TCAGAAGAAAAAAATGAAGTTTGGTCAGAAGGCAGAACCTACTCTATATT
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GGAGCCTGATTCTGGATGTTACAGCAGCTCCCTTTAACCACCAGGAAACA
ATTTCGGGGCAAGCTGGTCGGCTGGACCTTGTGTGCCCTGGTTTGCATTT
TAATGAAACAAAAAGGTAGAATAGAGACTTAGCAGAAGGGACGAGTCATG
AGTAGCATAGCTAAAACTGAAAAACAACCAGATAGAGACATGGAAGGACC
CTCCAAAGTTTCAATAATTCAAACCAAGATAATCATAGCAGTGCAAGGAT
CAGTCGTTGCTGCTCTGCTCACCATCTCCTGTCCATTGGTACTTTGCTTC
AACTATTCCCCTGCTGCTGTCTTTACAAGTTACCCGGTGTTTCAAAAAAT
ACACAGATTAGTTTTTTTTAATTCTAAACTACTTGTATATAAATCCCCAG
TCACACTAACTAAAAGTACATTGTATTTTGTTGTGACTCTTTGTGGGTGC
GGGTGAATCATGCAGTGTTGGTACTATTAAAATACTGTGCAAGTGATCTA
AAAAAACTGTGCAAGTAATGTGAAGAGGTTTAATGTGATAATACAACCTT
TCTGTATGTTCTAATTGCTCTTTCTATTTCGTGCAGAGGTTTCTAGACAG
GGAAGAGAGAATGGTAACAGTGATTCTAATATAAAAGCTGCCAACAGAGT
TCCAAGTATGAAGTATGCAACATCAATCGGTCCAACAGCTTCCAATGAGG
GAACATCAACATCCGGAGCAGCATCACAGACAGCATCTGGTGTGTTATCT
GGATCAGGAGTGCTCAATGCAAGACCACCAGGAAGTACAACATCATCTGG
TCTATTAGCTCAAATGGTTTCTATGAGTGCAGATGTTGCACGCGAGTATC
TAGACAAAGTGGCAGATCTTCTTTTGGAGTTTGCACAAGCAGACACCGTC
GTAAAATCTCAAATGTCTAGTCCAAGCCTTCTAGCACGGCTGTTTCAGAT
GTTCAACAAGATAGAATCTCCTATTCTTCTGAAGGTAAGGCTTGAAGCAT
TTACAAACTGTTTCTGCTAACTTTTCAGGCAAGGTTTGTGTTTTCCATCT
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ATCATTTGTCTGGTGATCCTAATTGTTTGGAAACACTTCAACGCACAGAT
GCTATCAAGCATCTGATACCAATTCTTGAACTTCGGGATGGACCTCTAAT
TTATCAAATACATAGTGAGGTGAGTGACTTAAACATGCTTAGTTTGCCAG
AAAAACAATCTTAATGCCTTATTTTGAGAATAATCTTAATGACGGTTGGT
TATCCAAAATCTGAAATAGGAGAGGTACACAATTTATCTTCTGATGTAAG
TTTCTGTGCACATCATAACAGCCTTTTCCTTTCTCTATTTAGGTCCTTAA
TGCTCTGTTCAACCTTTGTAAGATCAATAAAAGAAGACAGGAACAGGCAG
CTGAAAATGGGATCATCCCTCACTTGATGAATTTTGTCATGTCAGACTCA
CCCCTTAGGCAGTATGCTTTGCCTCTGCTTTGTGATATGGCTCACGCTTC
TCGCAACTCCAGAGAGCAGTTACGGGCTCATGGAGGTTTGGATGTGTACT
TGAACCTGTTGGAGGACGATGCATGGGCATGTACTGCTTTAGATTCCATT
GCCGTTTGCTTGGCTCATGACAATGATCACAAAAAAGTAGAACAAGCCTT
GTTGAAGAATGATGCCATCGAGAAATTGGTGAAGTTTTTCCGAGACTGCC
CTGAACAGTATTTTGTCCATATACTGGATGCTTTCCTCAAGATAATCACG
TAAGAACACAGAGGGTATCATTTCATGTTGGATGTCATCTTGTTTATAAT
GTCATAGTGTATTCATAGATGCATGTTTATGCAATGTCACCGCAGGAAAT
CATCTCGGTTAAATACTGCAATAGCCATGAATGGATTGACGTCATTGCTT
ATTGCAAGGCTTGACCATCGAGAAGCTATCGCGCGGCTGACTCTGCTGAA
ACTAATAAAGGTTTGTAGTTATTCTTTGGTTTCATGATCAAGCGGTTCTA
TATATCAGTGAAATGTTTCATTTAATCATGTATGATGCGAAACTTGTAAG
TAATATTTTACTGTATGCAACCTTTTCCAGGTTGTCTATGAGCATCATCC
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ACCTAATTGAAGAACGCAGGGATGGGCAGCGTGGCGGTCAACAAGTGTTG
GTCAAACAAATGGCCACCTCGCTGTTGAAAGCGCTGCACATCAATACAGT
CTTGTGATTTATTTTTCCTCTCAAGTTGTACATGTTTGCTCCGGAGGAAA
AAGTTTCTCCTTTCTTTTCCCAGCTGTGATTTCCCTTGTCGTGAGCACCG
GACAGCTTGTTGCACCTGCTCCCTCTTTTATCGGGAGAAAGGTTTGACGG
TCCGGTGCAAAGATAACGGGGTCTGTAAATCCCTGCATGGTTGTTTTGTA
CTTAGTGAGTGTACTGTTAGTGGTGTTGCTGTATGCTACCTGCCTGAAAT
TTTCAATAGAACAGCTGGTGTAGTAGACTTATTTTTGTCGGCATCTTGTG
TTAGTGAGATTTTACCCGTTGTTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.