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GrainGenes Sequence Report: AE018893

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Sequence
AE018893
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE018893
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGTTCCCACGGAAGCAGATGATTGCTCCGCTGCGCGCCATGGGAAAAT
GAAGGCTAGGTCAGCTCCCTCCGTCTTCGTCCAAATCGGCGAGGTGCCGC
TTGGCCTTCATCTAGGAAGAAATGGAAGGGGGTAGATATACTGGCTGCTA
CAGAAACAAAAGGAAAAGATTGACATGGAAATAGGAATGAGAAGGGGAGA
GGACGCATGGAAAGACAATTAAGTTGGGTTTCCATGAAGACCAGGGAATT
CCTTATCGGAAAAAAATGAAGACCTGGGAATTAATGGTTTGTTGGTGGAG
AGGGAGAGGAGAGGACACATGCAGCCATGCAGGCAAATGATGCGAGGAGA
AATGAAATGATACACACTCTGACACCAATTGATGATGCGGCAAAAAACTG
ATGTGGCATGTTGCTGATGTGGATAGGCTGCATGTTTAGAGAAATAAGTT
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TTTTTCACACTCATGGCCTCCTTAACACACTTTGAGTAGACCAACTCTCT
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GGAATGCTTTTATAATTTATAAACTGTAAATTACACGTTGTCATACATGA
AGGGGCTGTTTGGTTCTCAGCCACACTTTGCCAAGCCTAAGTTTGGCAAG
TGTGGCAGCCACAAAAGTACGGCTAAGAATTTGGAAGCCACAAAGTGCGG
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AAGTGTGGCAAAAACCAAACACTTGCCAAACTGCCAAACTTTGGCTTGTC
AAAATGTGGCTAGGAACCAAACAGCCCCGACATGAACAGCCCAAGAACCA
GTCACCAATGAACTGCATCTCTGTCTTCCAGTCATCGTTCTCTCATGATG
TGAAAGATATGTCGTATGGTGCATTTTTATCTCATTTCTGAACTGTAATT
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AATGTACGTATGCTCCCTCATCTGTGAATGCTTTAATGTCTGCATCTTGG
TTTGATACCATGTTTGCATTATTTAATATGTTTATTATATTGTGGTTTTA
TATGACATTTGTAGATTGAAAGGCCTTATGTTCTCTCCAAGTGCAAAGAT
TACCCCAAGTTTCAAGCAGTAGCTATTGCCATCCAAAGGTCTGGCTTCAA
GGTAACCTCTTGTGCACTCGATGTTATAGCTATGTGATGTGAAGAATACA
GTAACTTCTAGTGTTCTGCAAATATTTCTGTTCCACGTGATTGTTAAAAT
TAAAAGCTATCACTATCAAGAATGTCCAGATCGGATACCAGAAACCCAGG
ATTTCCAGAACATAATTATCAAGGAAGTATATTTCCTTGTTTATATGATT
CTATTTGGTCAATTTTTTGCGATTCTGGCTTTTGTGGGTGCTGGTTCGTG
CCCTCTATCTGCAAATACCCAGGAACTTGCAATAATATTGAGCCCTGCAA
TTTCTGTGGTTGTTTTGCAATTTAAGTCTTGTTGTGATTCAGTTTATGGT
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GACCTTTGTGTTTCATTTCATTGGAAAGACAGAGTTGTTGATTACACGCC
TCCTAGAGGAGGCAAAGCACACAATAAGGGTTATTACAATCAATGTACGT
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AGTTGAACTACCTGTTGTCTGTCACTCCTGTTGGCATTGTAGAATACATG
CTGGCTTCTTGGCTGGGAATGATGGTAAGAGTTCTTCTCTTACTTGTGTA
TTTTTCAACCATGTTTTTTAGTCTTACAATACTGTGCGGCCAAGATTCTG
GCACATATTCATGGGCCGATTGGCCTATTGAAACCTCACTTTGTTATTAT
CTGCAACGTTGTCTGCATAACTGTGACCACACCATCAGGCTTTGTGTACT
TTGCTGCCTCCTGCTCTATTATGAGTAGATATATACTTCTCTTCAGAAAT
TGTTTCTCGTTTCCACAGTTTCTTAAATAGCATCATACTTTTATTTGCTA
ACTTGTAGGTTTTGTTATCTTTTAACTTGAAGTGCTGATTATTAAACTAT
TGGGTGTTGGTGTGACCTATTTTATACTAATAATATTGTTTTGCCAGCCA
ATCACTCTTGCTTTGGTATATGTGGGAACAACACTAAAAGATCCATCAGA
TGTGACTCATGGGTGGAGTGAGATCTCCACTACTAGATGGATGAGCAATT
GAGTCTTGTAGCATTTGCCTACATTATATTGTTGAGTAGATATCATGTTT
GTTATAGAAAATATAAGTATAAAATTACATTATGTATATATTTTCTCCGC
TGTATTCCTCGCGTTCCCTCCCCAAGTTTCTTTTATATCGCTCATGCATT
TTGCCATATACCATGTCTTATTTATTGTGCCAAATTCAGATTAGTGAAAT
TTACTCGTATTATTTGATCTGATGTTCAGTTGGTGGACTTGTGCAAAACA
AAAATGCATGCATGTACATGATCTATATTCAGAAGTTGTTTTTGACTGAT
GAGAATTTCATCACAAGTTATAAGTATGTCGTAGTGGAATATAGGTTTTA
TATGCTAGGCTCATGAGCTTGGTATTTCCTGGTAGCACTAAAAAAAAATT
GTCTATATATAATGTGTTTAATTAGGCTAAAGTACCATATCTGTTCTTAT
CATTTAAATTAAAAAAAATGGAGGAGATCATATTTACCTGATCACCAATT
GCATAGATAATTTCCTTTTAATCTGTTTATGATTTTCCTTTTAAAGTAGG
TATTGCTTTATGCACAACTTAATGGCTTCTTTTCTTCGCAGGTTCTCATA
GTTTCTGGCTTTGTAATGTTCGGTAAGTGCCACTACTCTCCAACGTTGCA
CGGATACAGCGATACGGATACGGATACGGATACGGATACTGATACCGCGA
TACGGCGATACGGCAATTTTCCGAAAACACGGATACGTGGATACGTTTGT
ATATATATAATAAATATTAATAATTCAGCAAATAATTCCCAACAGTGCAA
TAGACCAATAGTGCATCCAATAAAGTACTAATAAATAAAGAGTGCAAATT
TAGTAGACAGACGACACGACAAAATAACACCACATCAATCACAACTTGGC
AAGTTTGAACTCCAGGTAATTGTTCAACAACTTTATTCTCCGAGGCCTCA
AGATCATCTAGCGGCACCTGTAGCTCTGGATCATCTAGTGAGCTTCTTGA
CGGCGGTTGGGAACCAGGGAAACTAACCTGCACAGTCCGGCGGCAGGCGA
CGGCCGGCAGAGCGGGCTTCTTGACGGCTGGATCGTTTCTCCAGCGAGGC
GGCGCAGTAGCAGGCCGGCCACCGGCGATCTCTTGGTGTGGCGGCGTGCG
ACACCCAGGTATGGTTACCAGGAGGTGAAAAGACAAAAGGCTGGATCGAT
AGTTTATATACCCTAGGGATTAGCAGAGGATTAGGGTAATTCCATATCTA
AAACGTATCCTAGAGGTATCCTTGCTGTATCCGAATTTATTTTTTAAAAA
ATAAAAAGGAAAATTGCCAGATACGTCCGGGATACGTATCCCGCCGTATC
CCCGCGTATCCCCGTATCCCCACGTATCCAACCCCTGATACGTGGGTTTC
CGGCCGTATCCGTGCAACGTAGCTACTCTCCACAAACCTTACTACCCATT
TCTGAGAATTAATAAAATCTGTAGTTTCTTCTGCTTACATGTTAAATTGT
TTGGTGAGTTACAAGGGTTATTTGTTCTGTACTTAATCTTGCCGGCTTGA
ATTTGACACGCTTGGAAGCTTTTTGCTTGAATTTATCAGCGTTTATTTCT
GAATAAAGCACTGTTCCGTATACGTTTGTAAGTTGTGTTAAATTTGTACT
ATACTTAACAGTTTTAAGACAATCCTTAGCCTGCAAATTTGTGTCCTTCA
TGTTTTTCGGTGGAAAACTATCGTTGCTATTATTCATATTGTCAGGACTT
TTTGTCTGGTAGGATCATGCATTGATTCAGTTTATATTGGTTCACTATCC
TTTACACTCGGATGTTTCCGTTTCTCAATCAGGAGTCAAGAGTTCAACAG
TATGAATACTATTTTTTTTGCTTTTGAACATTTGTAGATTCTTTCAATGA
TATTAGAAAGGCACAAGACAATAGAAAAGAGGTACATTCTGAGCTTATGT
TCTATTTCCTCACCATATGATATGACAATGCCAATGTGCTTTCCTTTTTT
ACTAGACAAGCTCATGATATAGTTATCCTAACTTGAATTCGTCCATGTTT
AGATTACATGGCTAATAAGGCCTGATAGTGTTTGTGTATGGCTGCTGAAT
GTGTGTGTAATAAATATTTCCCTGTGCTCATATTTTCCTTGGTATGCAGG
TTTATTGCTATTTTTTGTTGTCAAACCATTCTGATCTAGCTAAACTGATT
ACAGGGATTTGAGATTGTCTATGTATCAGCTGCAGCCTAACGAGATTATG
TTCTTATGTGATTCTATTCATTATGATTACACTTCGGCAAGCTGGTGGCC
AGCTCCTATTCATTATGATTATGCAAAGCCTGTGATGGCACATGTTCTTG
GTGTTACAATATATCCTAGAAATTCTATATTACTAATCTTGGTTTCTCTT
TGCTTTTCAGGCAACTGCAAAGGAGGTGAGAGCTCCGAAATGATTCTGGT
AGGACCAACTGCAGTATTTCTTATGTTTGGCTTACCATGCTTTCTAGATG
CTTGAGGGATTTTTATCCATTGTACTAGCTTCATCGCAAAATATTTTTTT
TTTTACCGCTATTGATGCCATCTGAGTTTAACTGAATAATTTGTCTATAT
CCACTCATGAATAAGTGCTAGGTTTTTAAAAATATTTGCTTAATGATTTT
GCTTGCCAATGATTTCTTTGGGATACAAAAATAACACCGCTGTTTGTTTC
CACCTGCCATGTCGGGTGCTCGCGTATATAGTTTGGTGGGCTAAAGTTGA
ACTTAATTCTTTACAATGGTACATGTATTTATGATCCAGCATGTTTTACC
TGGTGGCTCTAAGCAGCTGCTATCCTTAGTGGAAAAACATTCTTTCGTAT
TTTCCCGGTGGCTCTAAGTAAGTCGTTGTCGTAGAGAGCTCAGGCGGATG
CACAATCCAAGAAGAGAACCTGAATCATAAACAAGTATAGTATTAGAAGT
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GTCTGATTGTTTTAACTTTAGATTTATCGCTTGCAGGTTTATGCTTTGCT
TTTTCAGAACTTTTGCCTTCTGGTGACATAGTTACATGAAACGTTGGTAG
TTGTCTGCTTTCCAAACCTGATACCAGGATCTCTCCTTTATTTTTTTAGG
CCACCCATCTTTCTTGACCAAATCTTTCACTTTTAGGGTGTGGTATGATC
AAGTGGTGCTCTCTAATTTGTCCATTTGCACATGATTGAGGTCTGTTATT
TGTCCTATTGACTGGATTTTACAGGTCGAGGACAATGGTGAACTCAGAAT
CTTTGCTCTGTTGTTTTCTGGCACTGACGATGTGGGCCTTATACTAGATG
ATGCAAAGGTGCGTCTCCAAGCTTTCTTTTTCCACACATTACTTCATTTA
TAAATTGCCTTTTGTGTTTCGAAATTTATGGCACAATTTTTTCCGAAGTT
TCTTCGTTTGAAGAAGAGTATATCTGTTATTTCTCATAGAAGCGTCTACA
TTCATTGTCTAGCTAGTGCTGCACACATGTCTTTTGTATTTAGTTGCAGC
TTGGAATTTAGATAGGTAGCTGTACTATTTATGTACTGGAAAAAGGTGAA
TCCCTTTCTTGTTTCAGCGTATATATACCAGGCTAATGTCTAGGTCCAGT
CAGTTTTTGGTTATGAAAAATAAAATATGGCCATTATAGATATTATAATG
CTCCTAAATAGTTAGATAATTCATGTTGATGTAATCTTGAGGTAATTCAG
GTTGCTGTATAATAGTATTTTCTTTTTTTGTATCTATGAATCTGTTAGAT
ATCTCAAGTTTAAAGCATTTACCAATATCTTTCCATAAACTTAGTGAACC
ATCTAATCATTTAACCTGTGTCGCACCACAATGATTCCACTAAATGTACA
ACAATATGATCGGGGGCATGCAATAACAGAGGCTAAAGGGGCTTGATCAT
ACAGAGTTGGCGCATAGGACAAGACCAACGAGATAAAATGTGTCGCACTA
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AAAGGCAAAAGTGGGCTTGGTCATAAAAGTTGGCGCGTAGAACCTGTCCA
AGACTATTTGAATCTGTCTTCGTAAAAAAATTTGAAGAGATTATACACTA
CCAGGCCATTGCATAAGCACTCTGGATATGAATATGAATCTGATTGAGCC
ATTTTATTTTTGCAAGTGTATATTCACCAAGAGACTGGAGATTTCAATTG
CTACTACTACACTTACAAGGAACATTATTTTCAGATCATTTGCTATAATA
TCCTATTAGTTATGGTCACTGTAAGTGTAGCAGTATGTATTAAAAATACA
AAAAATTAGCTTATCCCCATTAAAGATTTTAAGTAAATATATATTCAAAT
GGGAAGAAGCACTAGCAACGTAGATACTGCTCTCCTTTTGATCTGGTGTT
CGATCTCTTATCTTCGTGCAAATTAGCAAATCCGCACCACATTAGTTTCT
TCTGAAACTTTGTAGTACACATTGTTTTTTATGCACTTTCAGAAGTTAGC
AAATCAGGGCGAGCTAGAAGTGGACATTTAAGATTTAGAGCAGCAACAGC
TCAGGCATCAAGCTTTTAAAACCAACCGATGGCTCAGCGGGACAGCGGCT
TTGCATCACTTATAAATTGTATGTTGCAAAGGTAAATGTGTCATTACTCA
TTACAGTTGTTTAGCCGGAGTGACTTTTTTTTATTCAGTTGGTCTTTTGG
ATTGACTGCGACAAGTATGTCGTGAATTACGTCTCAGTTTTAGGTATTTA
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AGGGAATTTTCTCCCCACGGAATCAGAACTCATATTTATATTAGTATCAC
AATTTGGAAAAAATGTTAATAATGTACTTTAGTTTGCAAAAATGAACAAG
CAGGGCATTTTCTACCCTCCTAATTCTTTTCCTGGTTTTCTCTGTGTTAG
AAAAGGCAAGAAGTTGGTTCAGAAATGCTCTACTTATTTGTATTTGGATT
CGCCTAAGGTTGATTGTGTTGTGCCACATGGTACATTGGTAGATAGGAAC
TTTGCTACTCACTCCGATCCATATTAATTGTCGCAAAATCGGATGTATCT
TGACATGTTTTAGTGCTAGATACATCCAATTCTGCGACAATTAATATGGA
TCAGAGAGAGTACATAATACGCAGAGGAGATTCAGTTAATATCAAGTTGA
TCATATTTGGGTTTTCTACAACTGATTGAGACTTTTATACTAAATATCTC
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TAGGCTCTTGCTCCCTTTTCTAGCCTGAAGTAATTATTTTATTTTTATAT
GCAACCATCCGTCGACACAAAGTAGCAGCAGTTTATTTTATTGTATATTT
CTGTACAACACCTGATCTATGCTTTTACATTCTTTGATCATGTAACTTTA
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ACCCTTCACCTTTGCTTGTGTGCATCTCATTCAGAGTTGCTTCCATCAAA
ACAAAAAAGTTCGGTAGATGAAGTATTAGGTAAAATATGTCTGGTAACTA
CATGTTATACTACATGCATTTCAAGAATTTGACACCCTTTTTTGAACGTT
GTCCAGCAAGTTTTGTTCTTCCTCACCCCGAGCATGGTCATGATGTTTTG
CATCCAATTCTTTCACGCATCATAGGTGGGACACTGAGTTCTGATATTTA
GTTTTGGATTTTTTTTCCCCTTTGGATAAGAGTGTACATATGAGTTTTAA
GGGATATGACCAGCACTCAAATCAGCGCATGGTAGAACTCAAAATAGAAC
TACCCTCTCCACCTTTTCAGCAAATGTTGTATGCCTGTTGCAATTAGTTG
CTAGGGATCCAGTGTCAGCGCAACACTAGATTTATCATTTATGGATTTAC
GTAGAAACAATTTCTATTTCTTACTTCGTTCTTGGACGCAGTAGCAGGGT
ACCATGCAAATGGACGATTCATGATTAACCTGTGATGATAAGCTCACAAA
ATCAACATTGTAATAGATGATGAGCTGCGGTGAGTTTTCACAATGCTTCA
CATTAGGATTAAAAGTAAAATTTGCTACTAAATTGATAAATTTTTGATGT
TGTAGACCCTTTACGCGTAAACATAGCAACCACCACCGATCTTGATTATG
AAGACCGACAGTTAACTCGTAATGTTGAAGCCAATGATTTTTCTAGCTCT
TTACTTAATTTCCAGTTTCTTGGGCCACTCAATCCATTTTATTCAGATCT
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TAGAAACAATCCAGTGAGAATACAAACTATATACTTGTTACTTTTCATAG
ATTGAGTCAGAGTTATAGTAGAGAACACTTACATGTAGACGATGGCATGA
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TTGATATGCTTCCTGAGAGAAAATGACAAACAACTACCACATTTGCGGCA
GCTAAGTCATATAACTACCGGCTTTGCTCATTTTGTCGAAAAACACCGCA
TACTGGGGCAGACAGTTGACAGAAAGCACTGATTTTGCGCTAAAGCCGTA
TTAAACAGATTTCTGACAGAGTGGCCCTACCGTCAGGTCTAGTTGGCAAA
AATTAAGGCCTGAGGAGAAGAGGGGAAATTTTCTTTTTCGTGGCGTTGAC
TGAGCTAGCTTCGCGCACAATGCCTGCTGTTGCGCGGCCGGCCGCTGCTG
GCCGGAGCTCGCCACCTCCATGTTGCTGCATGTCACCGTGCACGCTACGC
AGCTCGCCCGCCCCTGTGCAGTTCCGCCGCCACACCCCGGAGCTCGCCTA
CGCCCGTGTCGGGGCTGGCAGCGTCCGTCCTGGAGCTCGCCTGCACCGCA
CCTCCATTTCTCGAGCTCGACTTCCTCTTCTCCGACCCAGCGCGGCGCGG
ACGAGGCGGAGCTCTGGCAAACGCGCACCAGCCTGCCGCTGCCGCACGCG
CACCAGCCTTCTGCCGCTGCACGCGCACCTTCAGCCCGCCGCCGCATGCC
CTTGCCTCCCGTTGCACACCTGCAGCTCGCCGCCGCGCGCGCCCCTGCCT
CTCGCCGCAGCTCGCGCACCAGCCTCCCGCCGCCGCACGTGCACTTGTAG
CTCGCTGCCGCATGCCCCTGCCTCCCGCTGCGCGCGCAACTGTAGTTCGC
CGCCGCCCGCGCCGCTACCTATCGCCGCCGCGCACCCCTGCCTCCCCGAG
GTAAGTGATGCGAATTAGGCTCCGGCAGGAGCGCGTCAGCCTTCTCGCTG
CTACTGCACTGCTACCCCCGAGGCTGCTGGAGCCTCCGTCTTGCTGGCGC
ATGGGGAACCTCCGCGGCGGAGATGGAAAATTTATCCGTATTGGCGGGCG
CAGGCGAGCTCCGGCAGGGCAGTGCGGGCGGGCCCTGGTGGGCGCCGAGA
TCGAGCTGCACAGCGTGCGCGGCACAGGAAGGCACAGGAAGCAGCGCGGG
GGTGGCCAGCTCCGGCCAGCCGCAGCACGGCTGAGCTCGAGCAGGCGCGT
GCGTGAGGCTAGCTCTCCACTAGCTCGGTCAACGCTAGGGAAATTAAATT
TTTTACCCTCTACCCCTAGGTTAGTCCTAATTTTTTTGCCACGCAGACCT
GACAGTGGGCCTTCGTTGTCAGAAAACTAATTAAAACGCTTTAGCGCAAC
ATCAGTGCTTTCTGTCAACTGTCTGCCCCAGTATTCGGTGTTTTACGACA
AAACGAGCAAAGCCGGTAGTTATATGACTTAGCTGCCCTAAATGTGGTAG
TTTTTTGTCATTTTCTCGCTTCCTGAGGAACATTTATTGAATTTTTTCAG
TTGTGAAATGATCTTTTTGTGAAGGAATATCGAGTGTAGTAGCATAACAT
ACTAATGTTTCTGCTTTCAGCCTTCTTGTGACAGAATATTTAGTGAATTC
AGTATATAGACCAAGCGTGCAATATCTAAATTCCTCTTCCTTTACATGTA
GGTGCTGAGAGCATCAAGGAGACAAGGATGTTGCTTCTTTGTGTGTTTAG
ATGACAGATGGTGTTTCTAGGTGACTGGTTCAATAGTAAGCCATGAGGAT
CAGCACACTCTCACCTCCCCGGGCATCATTGTTGGACTTTGTTTTCTCTT
TTTGTTGCTATATATTGTTCTGAGAAAGGCGCTATCTAATGTAGATAACA
ATAGGGAGTTTCATGTGGAGCTGAACATTTTCATCATTATTCATATTTGA
AACCGTGCCCTTGTACTCATGAACATCTATGGTATATGGACTTTGATCTG
TCATAAATTATTTGTCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.