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GrainGenes Sequence Report: AE045669

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Sequence
AE045669
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE045669
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCATAGTCGTTAAACATGTGCTGTGATGCGTAGCTACGGCCGGCCAAAT
AATTCACTTCCAATCATCACTACTTAGCTCCATGGATCCTTGTGTCATAC
CACAGTACCAGTACACACAGTTAATAACACAAAAGCAAGCATCCGCTGAG
ATCTCACTCGAGCGAACCATGGCGGAGTTCGCGCTTGGGTTGACCAAGAC
GGCGGTGGAGGGGACGCTGATCAGGGTGAAGTCGGCTATCGAGGAGGAGG
CGAAGCTCAAGGTGCGGGTGCAGAATGACCTGTTGTTCATCTCCGGTGAG
TTCCAGATGATGCAATCGTTCCTAAAGCTCGCCAACAAGGAACGCGCCAA
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ATGTCGAAGACTGCGTCGAGTTCGTTGTCCACTTGGACAAGCCGTCGCAC
TGGGACTGGGTGCGCCGACTGGCCTCCTCCTTCCTGGTGTGCATGTCACC
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GAGGACGACTCCAACTCCAAGCCAGCAGTTATTTATGTCTCCTCTCCGCC
AGTGCCGCCGGAGCTTATCCTGCCAGCCGACACCGCCGGCAGCGGCAGCA
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CGGCAGTTGGCACTTGCACTCTCCTGCACGGGGGATCCATACCAAGTATC
GGACCTTAGACAATTCTCCGACGGTCAATCTCTATGTGCCTTCTTCAGCA
GGGTTCGTAAGCATGCTCAACTAGCCACTTTCTTATAGTTCTGTTAATGG
TTTACATGTTAATCAACAGTACTAGTACTATCAACTCCTTTCACGCTTTC
CTTTGCGAATGCACGTTGCTTTGTACTTGAATGTTTTCATGTGACAAACA
TTAGTAAATTTTTATGCATAACTTGATAAGTTAATCGAAGTGACCACTCA
CCTACCTTCTAAGATAGCATATATACACAAGACCCATGTTAATATCAAAG
AAAATTAAGGAGAAAGACCTAATGCTTACATTTTATGGTCACACATTATA
ATTCATGAGAGTTTCTGTATTCGACTTCTCTCCTCTCCTCCTGAACCCAA
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CCAGGCCCCTCCCCGCTCTTCTCCGGTGATGGCTGGCGTCGAGTAGGATG
AGGGTCCCTCCCCTGTACAGTTGTAGTGTAGATGTTCTTTGCTTTGCCCT
GGTGGCGTCTGCCTACGTGGCGTCTAAGGGTAGGACGGCGGTCTACGGCA
GCAGATTTGCCACGTCCTGAACTTCTACTACTTCGTTGCTCTTCGTCGGT
GGCAGGCGGAGGCGGTGGCGAGTTGGAGAGGTTCCTGCATCCCTCTAAAT
AAGGCTTGCCCCGGGTGCTCCAGGCCGGTGTTGCTGGACCAATGCCGACT
TGGTGCGGTCGTCTTCCTCGTCGTTGCGGTGCTCTCATGGGGGGAGCCAG
ATGCAGCGTTGAAGAAGCCCGCCGCTCACCCAAATAAAGTCCACGCAAGC
TCCATCTCCTGTAATCTCCGGTCGTCTTCTTCAGCTTGTGGCAGCAGCGT
GGAGTCCGACGACGGCCAGCGTTCCCTGAATCAGTGGGTGGTGGCTTGCT
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GCTCCGGTGGGGATTCGTAGCTGCTCCTTGCGGAGAACCCAAGCGGTGGC
AAGCTTGTGCCACTGCTATCCATGGTCAAGGGAACCACTCCGTGCGGCAG
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CTCAGCCATGGCATGTATCGGCCTATTGGCGTCAAGTGGTCTCGTCCCCG
TCGCTAGTAGTGCTGGCCATGGCGTCAAGTTCGCCCATGCTCTTGGTGGA
GAAGGACCTAGATCCGATTGCTTTTTCTCTTCTTTCTATAGGGTCCTTTT
TGTAAAAGTTCATGGCATGGCTGTAATTTTGGTTATTCCTAAGGTCATGC
CTGTATCTGTACCCACCTTTTAATGCAGCTTTGGACCCTTCTGGGTCCTT
TCCCCTTGTTCAAAAAAAATTATAATTCATGAGGTTAGCTGAATATGTAT
TAGAGTCAAGGACAAAAACAACTTTATTACATACAGTTGGTGTTAGAATT
GTCCGAATGATAAATTACAAGTTTGTACTAGGATTAAATATGTATAACAA
TAGTTTGATAATATCCGTAGGTGAGATGAATGAATTTAGGAGAATATAGT
ATGATGATAACTAGACATGAACATGGGGAGACCGGCCCGAGAATCACGGG
CCTGACCTGGCCACATCATGTTGTCAGTTCTGGGCTCGAGCCTAGAACTG
AGCCCGAAGGTCAGGACGGGATGGGCGCAGGCCTCAAAAATAGATGGTTT
TAGTTCAGGTCAGGCCAGGCTCTCTGGGTCAAGTCGGGCTTTTTGGGCTT
CCACGTTTGGGCCTGATTTTTAGACAATTCAGGCTTGGGCCCCAGATTTT
AGCGTCAGGATTTATTAGGCCTGACTCTAAACCCAGCACACCCCGAGAAT
TGCCCAGGTGTTGTGATAACCATTATATACATGGATGCATATTAGTTGTC
AAAGTCTCAAAGGTTGACCTCATGCATCTCTAGGAGGACGTCAAAAGAAA
TTGGAGGGAGAGTATGAGAGAAAGACCGAGCTTGCTACAGAACAGAATAA
AATATCTACAAGATGTTGTGGGGGATACTAAACACACATACTTCGCTATC
CTTGTAATTTGCGTTTCTAATATAATTACATCCATATTTTGTTTCAAAAC
ACAGACTTCTCATGCACTTTATAACCAGATCTAAACCTAATGGGGAGAAG
GGTATCCGATTAGGTATTCTTCATGTGTATGAGAATATGATGCTCACAGA
TTGTTGTAGCCATATACATTTTTTTGTTGCTTAATGAATACCAAGTGTTC
CTTCTGGTTTCTTCAGAATACATAAGTATAAAAACTTAAAATTATTAGCA
TTAATGGGGATTTTGATCTAGTCCTAACCTTCTGACCATCCGTCTCTGAA
TTGCAGGTTTGTGGACATAACAGTTATATGGCTGAATTTATATGGCAATT
AAGACGTCCCGGTGTTATGTCTGTGTTCAGAGGGGGTAAAGAAGAATCAC
ATCTCATTGGCAAAGTGGATAGAAAAAAATCACACCTCATTGATGAAGTG
TATAGAAGCATAGTAGAAATGTCCAAAAAAATTGAGGAGTCTGATTTTGA
AAGGCATGTCTGGTTAGATGTAACCCATGAGTTAAGTCTGGAGGTTTTCT
CTAGGAGGTTACTTTTGAGTTTCCAATCAGATGATATTCGAGCCAGTGAA
ACTATTGCGGTTGATGAGGTTGATCCCATGCGTGTCATTGAAATGTGTCA
TAAGTTTTTACGTGGATACAACTGTCTCGTTGTTATTAACGGTTTGGGCT
CGATAGATCACTGGAACATGATAAAAGAAAACTTCTTATCCGAGCCTACC
AAAAGCTGTATTCTCATCATTACTGCTGAAGAGAAGGTGGCAAGGCATTC
CGTAGATGCGGAAGATCGAGTGTTCAATAACAGAGATTTAGAAGACTTGA
GAATGGTATGCATGTTTTTTATTATGTGTACTAATCCCAAAACTAATATT
TATTATTATTCTAACAAATAAGCTTGATTATTTTACCCTCAAACATGTAC
TCGACTTTAATTAGTTTTTCTCAAAGCTAATTTATATTTTGCTTTCTACC
TTACATATGTCAAAGTTTAACTCTCCGGGAGTGGAGTTATCTTAACAGAC
GACTCTTGTGTTACTTGGTCTTGTTACTTAACAAGATAAATTGAAATTAA
TAAGTGACTCAGTGGTCATTATTATATTCATTAGATTACCCTGGTTTAGA
CCTCACCTTACTAATTACGGGTGTAGGTTTTAGATGGCGATTTTCAAAGT
TCAAGAGCCATTGTGAGGCCTTGCAAGTGTATTGAGAACATAGAAAAAAA
TAGCGCGTTATTTCGATGCTAATAATGCACTATTGCATATTTTTGGAGCC
CACGCTAAACTAATCAATATGCAATGTCTCGCTAATAGCGATATAGCACG
CTAATAATGTAATTTTAAGGTCGACGCTATTTATTTGCTATAGCGCTATT
TTTTACCTTGATTGAGAACCTATAATTCACTTCACTATTCGAAGTGTCTT
ATTTAGTTTAGAAAGAAAGGTAGCACTGCCAGCCTCCGCATTATACTGAT
CGGTTGCTTTACACGTCTAGAAATTTTTATTTTTTAGAAAAATGATTGCA
AGAGTTTTATCTTACTTGCAGATGGAGTTATTAATGGAAAGGTACTTCCG
GAAGGAGTGCCACTTGCACATTGGGGTTCACCGTGTGACTCGTTTTTTCT
CTGGTAGACAACTGCAGGCATTTGAGTGGAGGGAGAAATATGGACTTGTT
GGGCATCAGAGCGAATGGAGTGGCCTTTGCGATCAGTTAGAGGGCAATCC
TGGGGTGATCTCAGTGTGGGGTGTTGCTGGGGTTGGTAAAACAACTCTTG
TCAAACACATTTACTACACCAATATAATTGGCTTAAGCCAATGTAATCTG
GGCACCGGTGTGACACAGTATAGTTGGGTTGATGTGACTTATCCATTCAA
TTTGACAGACTTGTCTAGAAGCTTACTTCTGGATTTTCATTCTGATAATC
TTGAAGCCAAGGAAACCGCAGCTATTGGTATGATGGAAGGGCAGGACCCA
GCTCAAGAGTGTCGTAACTTTATGTGCCGAGTCAAATGTTTCGTTGTTAT
TTGTGGTCTGCGATCCATTCAGGACTGGGATTTGATAAAAGCGGCATTCT
TATCTGAGCCTATTGAAGGATGCATACTTGTCATTACAAATGAAGCAAGT
GTAGCCAGACATTGTGCAGATGACGCAGATAGAGTGGTCAACGTCAAAGG
TTTAGAAGCTAACGCGGCCTTTGCTCTTTTCACAAAGGTGTGTTGACTCA
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GTTTCTCTATAATAAATAAATATGAAAATATAGATAGAAGGAGGCTATCC
CAACGCAACTATCTTACCACGAAGTTCAGGTATGCCACGCTGCCTCGCAC
CCTTCCCGCCACATCCACACATTACAAGAAATCAGCGGTGTGTCGAGGGC
CGGCTGCCCTCGGCGTAGCCCTAAAATGCCGTCGGCACAGGCGGTGCCGA
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ACTTTTGGCCGTCGGCATAGGCTACGCCGACGGCTTGGTGCCGAGGGCAG
CCCTCGCGTAGCCCCCTCGGCATAAGGCCCTGACCGCATAGGCACTTTTG
GCCGTTGGCATAGCCTAACGGCCGGTCGTAAAGAAAAATTTATTTTCCAT
TTTTTTATTCTTTGAAATGTTTGACTCATTAATCTCTCACTTCGAATATT
TTTAACACTAATTACACTTAATCTTCAGTTAAATTGCAGTCTTGGTCAAA
CTTCCCAGTTTATCACCCATTTGCACACTACTCTACCCCTAGCACCCTTA
ACTTCTCTATTCCTTCCGAATGAGTTTCCACGAAGCAATTTGTATATTTT
TGTCAATACTATGATAACAATCCTATTAACTCTTATATAATTATGTCACA
CATTTTTATTTTTTAAAATTACGAACAGTTATTTAAGTAAACAACAATGA
ATAAGTAATAATATTATTGATTTCAATAAAAATACAATGATTTTACTTTT
TCGTATATTTCTATTTAATATGGAATAATTAATATCTTTAAATCCGTAAA
TCGGATTTCGACAAATAATATGTCTAAATCGATCAGAAAAATAAGAGGAA
TCCATATATGATATCTGTATAATCTTATCACAAACTATGCCTTGATTATA
GCCATAATTTGATTTGCCTATTTCAAACTATGGTCAAGGCGGCGGGCATG
AAGATTCTTAGTTCGGGATTGAGTCTCGCTAAATTTAAAGTGAATCTCTG
ATGAAATAGCATATTGTAAACCTAAAAATATATTTTTTAAACATGAGCAT
TAGATCATGTACATGTAGTTAATCTAACCGACTTCCTATCGATTCGACAG
TTATTTGTCTTTTCCTTGAGGCGTGGACGGAAAGGTTTAAGATAGCCTAG
TTGAGAAATTGTCCATGTAAGGTGGTCTAATATTTTTGACAAATGGGGTA
GTACCAATGTAAAATTTTCATTTGGTGGTTGTTTCACAAAACACCCCGTC
TTTGACACTCGGAAAATGAAAAATGGCTTTTTCGTGGGACAAAAAGGAAA
ACTTCATTCTGCAAGATTGTAAGCCATCTCAAGATGCACACGTGTGTATA
ATATGGGCACATTATTAAAAAAATTGTCGCGATTCTAGCCATAACATTGT
TTGTTTGGCCTAATTGCCATGAAACTTGGAACATGATAGCTCATTTTGAG
AAGGTTTTTTGTGGTATTTCAATATTCTAAGTTTGGTATTTTTCTTTGCA
ACTATGTCACATAATATGACACCACACAAAGGTTTTATATTGTTTGGATC
GTTTTTGAATTTTTTATGCCTGTTTCAAACTATATGTAATGTTTTTACAT
TTTACCTAATTTTTTTACAAATGTGTAATATTTGAGTGTAGATGGATAGA
TACTCCCTTCGTTCTTTAATATAAGGTGTATAGTTTTCTTACATGAATAT
TATCGCATAGGCTAGGAGGGCACATTTCGTTGCTTTCGAACGTGAATACC
CCCGACAATTGACGTGATATAGAGATAAAATAGGAAATATGGGCATCTTC
TCTATCTGATCGGGTTAATTGCCTCCTAAATAAGCGGAACAAATCCTAGA
ATTCTCTATACACCTTATATTATAAATTTTTTCTCAAAAAACTACACACC
TTATATTAAGGAATGGGGGAGTATTTTTTGAATTAGAATGATTTGGTTAT
GATTTTTTTAAGATTAATGTGGTAAAAGTAAAAATACCTATGCCGAGGGC
TTTGCCGTTGGCGTAGCTATCCTACGGAGAGGACAATCCTACGCCGATGG
CCAGCTTCGTGGGGTGCCCGGCTCGTGGCCTACGCTGACAATCCCGACTT
TTGGCCGCCGGCGTAGCATCTGGCCCTCGACGCCCTCGAGTTTTCCTGTA
CTGAAATCTCCGGCATCACCTCAACTTACACAAGGGCCACCTCGTGCGAG
GCCTAGTATTGCTGCTTCAAACCTCAAAGAGGTGTAGCGCCATTAGTTGC
TCTCATGGACATTTGCTAGTAGAGAGGATGCCGATGTCGACCTCATGCTC
TTGGTGTTGCTCGGGAGCTCAAGGAAGTGGTGTTCCATGCACTACAGGAA
TGGTTCGGTAAGCTATGGGCCAAAAGTCGTCGGCGTAGGCCATAGACTAT
TTGGTAAAGATCTCCCTCGGCGGAGCACACGGAGGCCGTCGGCATATGAA
AATCTGGCATATCCTAACGACAGGTTGCAAAAATAATTTCAAAAAAAATT
ATTCAATTTTTTCTCAACTTCTTTTAATCTTTGAATTATTTAACTCGTTA
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ATATCATCATGTCACACGTTTTTTTTGAAATTATAAATAATTATTTAAGT
AAACAATAATGAATGAGGAAAAATTATTGAATTCAAATAAAATATAATGA
TATGTTTTTGTATTTTCTATTTAATATGAAATAATTAATATTTTTAAATC
CGTAAATCGGATTTCGACAAATAATATATCCAAATTGATCAAAAACTGAG
AACAATCTAAATATGATATCCATATCGACTTATTAGAAACTATACCGTGA
TTATAGCCATAATTTCACTTGCCCGTTTAAAACGGCAGGCATGAAGATTC
TTAGTTCGGAGTTGAGCATCGCTAAACTTGCATTGGATATCTGATGAAAT
ATAGAATATTGTGAACCTAAAAATATTTTTTGTAAAAAATCATGAGCATC
AGATCGTGTACCTATAGTTCATATTTGACCCACTTCCTACCGGTTCGGTA
GAAATTTGTCTTTTTTACCAGGGATAAACAGAAAGGTTTGAGATCCCCCT
GTTGAGACATTGTCAATGTAAGATGATCCAGTATTTTTGAAAAATGGGAT
GGTAGTATTTTGAATTATCCATTTGGTGGTTGCTTTACAAAACCCCCCGT
TATTTGCGTTCGAAAAATGGAGAATGATTTTTTTGTAGGACGAAAATGAA
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AATATGGGCACATTATCACAAACTATGCCTTGATTCTAGTCATAATATTG
GTCATTTGATCTGAAAGTTAGGAAGACTCGAATGAGATAGGTCATTTTGT
GAAGATTATTTGAGACATAATCAATATACCAAGTTTGGTATTTTTCCTTC
CAACTATATCACATAATATGACACCACGCGAAGGTTTCGCATTGTTTGGA
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CTTCTTACCGATTCAGCAGAAATTTGTCTTTTTTACCAGGGATGGACGAA
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TTCACAAAACCCCACGTTTTTTGCGCTCGGAAAATGGCTTTTGGGTGCGA
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TGGGCATATTATCACAAACTATACCTTTATTCTAGCCATAACGTTGGTCA
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GTTTTTGAGACATAATCAATATACCAAGTTTTATATTTTTCCTTACAACT
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CTTGATTTTTATTTACAAATGTGTAATATTTGAGCGTAGATAGATAGATC
TCATTTTTCTATAAATTTTGATATATTATTTATATTTTTCTGAATTAAAA
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AAAGCGTCTAAATACATCCATTTCATAAAGCTAAAATGTCTTATATTTCT
AAACGGAGTGAGTATATGTTTAGTACCAAGCGGGCTTGTTCTTTTTTAAC
TGATTAAGGTAGTGAACCCGCTCCACGATATTACCATGCTTTACAAGTAT
GTTACTAGTAGCCAAAATTATGTTCAAGGTTTAGAGACGTGAAGTAAGGT
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GCGTTGTTTTATTTCTGTTCCCCTATTTGATTTCAAGTCATATTTTGGCC
TTATACACTTTGCGTAAGTTTATTACTATTTTGAAATTAATTTGGATCTA
TTACCCATTTGATCTTTAGAATGCTTAATTTAGTTTAGTTTCAAATTTTA
ATTATGTTTCTCCTTCAGAATTTAACTTCTCGGAAGATCAAAATATTGAG
TCCCCGCGAGGAGGAGCTTTCAAAGATCATCCTGACAAAATGTGGAGGGC
ATCTCAAAGTAATTGCTGCAATACGCAAATACTGCCAGAAAGAGTGTGAA
ACGGAAACGGCTTTGAAGTCCATCAATGATAACTTCATGAGCATGTTGGA
GAAGGACCTGAGATTCCATAATTTGAAGGGTCTCTTCTGTTGGATGCAAA
ACTACTTTGATGCTTGCCCAGATTCACTTAAGCCATGCATCTTCTATCTG
TCAATATTCCCTTCAGATCATGGTTATAGGAGGAGGCGTTTGCTGAGGCG
TTGGATCGCGGAGGGTTACTCCAGGGACAAATCCAGCGGTAGTACCGCGG
AGGAGGATGGCGAAATGCTCTACTGCAAGCTCGTAGATCTGAGCATAATA
CAAAAGAAGTCACCAACCAGCAGTAGCAGTAGCAGCAAGAAAGTTGAGAT
GTATCAAGTCAATGGGTTCTTTCGTGAATACATCCTATCACGACCAATGG
AAGATAATCTTGTGTTTACACTGGAAGGGAATTGCAGGCCCAACTCCGAA
CACACGGGAAAACACCTCACCATAGGGAGAACATGGGACAGAGACGAGAT
TGTGTTCAAGAGCTTGGACTTGTCGAGACTGCGGTCTTTGACAGTGTTTG
GGAATTGGGAACCGTTCCTCATTTCGGAGAAGATGAGGCTACTCCGGGTG
CTGGATCTGGAGGACACCTCGGGTGTAACAAATAATGACCTGAAGCAGAT
TGGGAAGGCAGTGCCTCGCCTGAAGTTCCTGTCTCTACGAGGTTGTGAAA
AAATTAGTCACCTTCCTGATTCACTAGGTGACATGAAGCAGCTACAGACT
CTTGATGTGAGGGGCACCCAGATAGTTAAATTGCCATATGTTGTAAACAA
GCTAGAGAATCTGCAGTATGTTCGTGCTGGGATGCCACCGTCGGGTGATG
ATGATGTCACATCATCCTCCGTGGTAGCAGAAGGAATAACAACAGAACCT
GCTGCAACCGCAATAGAAGAAGAAGATCAGACCTCAGTTCCACCACCAGA
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GCACATGCCTCCCAACATCAAGAGTTAGATGGTCATGGAGGAAGAGCAGC
AACAGTGATTCCTTAGCATCCAGCGGCTTGTCCAAGTTGATTGAAAGGTT
CGGACTCCATTGTGGCAATGGAAAAAATTATGGTGTTGAGGTTGCGGCAG
GAGTTGGGACCCTCACAGCCTTGCGTACTATTGGTGTCGTGAATGTGAGT
GCTGCAGGTAAGAATGGGAAGGCCATCCTAAAGGATCTCAAGAAGCTGAC
ACAACTGCGCAAACTCGGGGTGTCCGGCGTCAACCGGAAAAACTGGCAGG
AGTTCTGTTCTGCCATCTCGTGTTACGCCCATCTCGAGTCCTTATCAGTG
AGACTAGATTTTTGTAATAATAAGAAGAAACAGAATCAAGATGATTTGTG
TTCTTTGGATGACATCTCTACGCCACCAAAGAACCTCCGGAGCCTCAAGC
TGTACGGTGGTGGCAACCTACAAGTATCTCCGATCTGGCTGAAGCAGCTT
TGCAATCTTAGAAAGGCTCATGTCGAAGATCTCGAGCTGATAGTGTCAGA
GCAAAAGGACATAGACAGCATTATAGAGTTGCCACACCCGAGTGCGTTTC
GCCGTCTTTGTGTCAAGCCGGTGCGGGATGGGCGGCTAACTTATGGTTGG
TACAGCGAGTATGATTTGAAAGATCGGTCTGAGGGTGCGAATGAACTCAA
AGCCCCAGTCCTCAAGATTGATTGCAGCGGCTACAAGATTGAGATAGTCT
TTGGACCGACGATACCAGAATTCGTCAAGGTGCTGGTGGTTCACTGCTCT
GCTGCTGGGTCGTCTTTGGAGCTTTCTAACTTCGTTTATCTAAAAAGGCT
CGAGCAAGTCTGGCTTACGGGTGCCCACAGCGACATACGACTCAGGAAAC
ACTTGCAGAAGATAGTTGCCGAGCATGAGAACAAACCTGTCTTGCATATG
GGTGACGAACTGATCCAACAATCTCTTGAGCCAGAAGGCCCTACGCCTTC
TGCATGCTAAAAAGCATCTTCCTTCATCGGTGTAATCCAAATTGTTCTTC
TTCATTGTTTTAGTTTGTACCGCTGAATGTTCTAGTGCATTAATTTGGTG
AAGAACTTCTCAGTTGTGTAACTTTATTATGTGGCCATTTCTCTGTTGTT
TGCTACTTTCGCGTGCGCTACTTCCATAACTTGAAGTGATATCAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.