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GrainGenes Sequence Report: AE002424

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Sequence
AE002424
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE002424
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCGCCTAGCATTGCCGTCCCGCCCTGCCGCCCAGCATTGTCCCCAAG
ACGCCCAACAGTGCTGCCCCTGCTGCCGCCAAATGCGGCGCTCTGCCATG
GAAGCCAGCCCCACCGGTCAGTGACGCAGCACGCCAGGGATCGCGAGCTG
CACCGAGCTTTTGGGAAGCTCGGGCCGAGCTCCATTCCGCAGATAGCCGG
CAGCTTCGAGCTGGCTCGGCCTTGGCTGGAAAAGCTCGAGCTTTTTTCTG
GTTCGCACCGAGCTGGACCGAGCCAGCTTGTGTCAAGGTATGGCTCTGCG
TGTGGTGACTCCTGGTGAGGTGGGTTAGTGGCCGGGGAGGCCTGTGATTG
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AATCCCTATAAGATTTCACATGTCATGGCATCAGATTCCTATATCTTTTC
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ATTTTTATTCTATGTTTATTTGGATATTCCAGTACATAGTGCATAATCAA
AACAATGACATATACATATTATTCTTGTTTCTAAGGTATTGCGCGGTGTT
TTTGAATGCAAATGGACAACAAGAAAAATAGTACACAAAATGTTGACCTC
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CCCTATTAGAAGAAATCACAAACTGTTTCTCAAATAATTGTATAATTGGC
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AAATTTACCGGGCATAGGTAAATAACAGCACAGATATCAAAGCACGTGCG
GGAGTGCCATATGAACTACCCACAAGTATACATGTACAAAATCCATACTC
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GCTCCTACGACCTAGCTTTTCCACTCCATGCAAAAAAAAATGTAATCGTA
AAGAAGGCTAGTTAATTCTTGCGATTTTTTTACTATCACGATGGATGTGA
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TTTCGAAGTTCATATTTCTAGTAATGCTTCCATTCTTTCATTACAATTCA
TACGACGTAGTTGAATAAACAACTAGAACATGGTTGACTTGCACATTGTT
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TCTTACACCGAGATTCCCTTCTGTTTGTATATGCAACTCTTTCTGTCCCA
CTCGTAAACCATCACTCCCTCTGTATTTCTAATGGACACGTAGCAGCACC
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TTTGGTGAGTCAAAGAACCCAGCTATGCGTACCACACTGTTTAACATACA
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TGCTGATCCCCATGATTCGTATCGCTCGAATTCCTCTCATTCGTCCAGCG
GCCAGGCTCGGACCATCACATTGGCGATGGTCTGAGCAGGATGTGTTCCC
ATGCAGTGGGGCAGCCTTGGTCCTCTATGTGCTCCTCCCCAATTAGACAC
TGGGGATTAGGAGTGGCAGAATGTTTTTTGAGATGTCGATGGGCAGAATT
GGGGAATGATATTTTAATCCGTTCAATGTTCTTGGCTTCAGCAAACAACT
AGAACATAGTTGAATTGGATACTATCGCCACCGTTTTTATGTTTCCAAAT
AATTTATGTTTTTAAATTGGTACCCAACAAGTATTAATGTGAACCCAAGC
ATTGTACTTCACGCAAGTATTTAATTCTTAGTTGTGTTCCTATCTTTTTG
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CACAATCTTATACCCAGCATTTGCATATCTAGTACATATGGACGCAAGTA
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TAAGGGGCTGGATGGTGGATCCAAGGACTATCCCGACATCCATGTGAGTG
AAAGACATTCTTGGCCAGCTACTCCGATCATGTACACCATGCTATAAACT
TCTAGAGTTTTTAAATACCCTTTCTCGTTTTATAAATAACATGAAACTAT
GTACATACAGTATGAATGTACTTTCTTGGTATCAGCCTCGCTTTCATTTC
ACTTTAGACCATGATTCCCGGCAAAAAAAAATGATTTTTGAACCTTAAGA
TATATATCCTTCCTAAAATAATATTCCTCCATGAATTGTGAGGCAAAGAA
TAATAGTAATGAAAAGTAACCACGTTGCTCCTGCTTGAAGAGCTTCTCTA
TCAAAGTACTAATCATAATCTAAGGGAGAAATTAATGATTTTCTTAAATG
CACACAACAACATATAGGGGATTTGGGGAAGTTATTGTATTTTGTGAAAA
TAAGAATCAACATGCTAGGACAGGTTAAGTTGCACGCTGAAATATCGTTT
ACATCGAATAAATAGGTGAATTTTTTTTGATAAAGCAATATATTAATATT
GCAAACATACCAATTACACCTAGCCTCTGCAATAATAAAATTTCCGAAAG
AAATTACGAATGCATAGAGACCTATTACAAAAGAACAAGAAGAAAGGAAA
AAAAAGCCGCTACGGTGATCAAGACACTAGCTGCAACACAAAACTCTACC
AAGACAGCACCCGGAGTCCAGGCTCACAAAATAATATCTTCAAAAAGGTC
ATTGCCGGCACAACCAATTAAGGTCAGACCTTGGATTTTCACCCTGGAGC
AAGTCCTCCCTGTCAAAACAATACCTTCAAACAAGGTCATTGTCAGGCAC
AACCAATTAATAGCAGACCTTGGATTTTGGTCCTGAAAGATAAGACGATG
TACTCCTCCTATGATGATGCCCCCGCTTGCTACTGTCGCTGCTATAAGTC
AAGAACCACCAAGCAAGGTACTCATCGCCACGAAAACACAGTCCGCCATC
ACTAGTGGAAGTTAATTCTCTCTACCAGTTATATAAAACCTATAAGCATG
CAAACTACAAAATAAACTTGGGGAAAGTTGATTGCATGATATAGAGAATT
ACAAACACAAGAATTACCACTAAGGTTCAGATAGTTGACGATATTCCTAA
AGAAACCGAGTCCCAGTCACTAAAATCCATCTATATCTCCTTGAGACAGG
ACAAATAGTCCATGTCCATTCACAAGGAAAAAATCTTCACATGACATAAG
CAATCTCCGGACTTCACAAACTCTTGGCGGCTGCACACGGTTTTGAAGTG
ATGCATAGCTGGATAGGCCCTTCATAAGGTAGCAAAAATTATAAAACATG
GATCTTAAGGCCCTTGCAAATGTTCACTAGGATAGTTTCTCAAAGCAGTG
AAGATCTCACAAGGGATTGGACCAAAGTGTTGCGAATAGGTGCAAGGATA
TGGGTGTAAGAATCTAGTACGGCGACTTCCTGTTTGTCTACTACAACAAG
CTCTACTACGAAAAGCTTTGCCTGGCTCCGGTGATGGAGGGGTGAGGATG
GCGGCGCGCCTTTGGCTCGCGCTAGTGGTTGTAGTCGTCGCTAGGTGCTC
CAATAACTTATTTGTAATTTTTATTACTTTTGGGTCTATTTGTACTACTA
TTGATGATTATTAATAGATTGGTGGAATTTCGCAAAAAATGGTATTTTAC
TCTCTTTCATCTCGCACACTTTGTCACATGATGCCAAGGGTTATATATTT
GGCAAAAGAGAGAATCCAATTGTTGCAGCAGAGAGTAACACGGTTGGTAG
TTACACATGGAGAATTGGAGATACCGTTTAGTAAATGACCATTTAAAACT
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ACTAGATCAGTCTCTAGAATACCTCTAGAAACCACAACACCTTGGAGGTA
TCGAGGAATGAGCGCTCAGAGGTTCTTTATTAAATCATAAATTTTTGTCC
TTGAGAAGAAATATTTTCGGTTGTACCAGAAAAGATGGGCGCAGGGATTC
CGGACCTAAGACCCTATTATGATAGTTCGAAATAATATGACTCAAGAAAA
TTACATTCTTCATAGGATCTATCCATTTTCTCAATTTTTAGGGGAAACAA
GGATTCTTTCCAATAAATAAAACTCACTAAAACATTGTAACTCAAGCAAG
TGATTAGTTTCTTTATTTCCTTGTCATTAATCCTCATATGTATGCTAGAT
GCACTTCCATACATGTAGTTACCTTTTCATGTTTTAACAACACATGGTTC
ATATATACTTGCTACACTCTCCTCTCCGATGATTAGTTAGAACATCTTAA
TAAACTGAGTTAACATGATATTCATGGTCAGGTGTTTTACACTATATTAT
CTCTTTTTACCCAATGTATGAAATATGAGAGTCCTTTCATCCATAGATCC
GTCTTCTGGACTTCAATGGGGGGAGCGCTTTCAGCTAATCAAGGGTATTT
GTGATGGCTTACTTCATCTTCATGAGAAGCGCATTCTTCACCTGGATTTG
AAGCCTAGTAATATATTGGTGGATGAGAATATGTTACCCAAAATCGCCGA
CTTTGGTCTCTCAAGGTGCCTTGGGAAAGAGCAAACGTGGGATCTTGCTT
CAAACCAATATGGATCGATGTAAGATAATTTGTTGAAAGCTCCTTTTTGT
TTATCACAAATTTATATTTGTGTGCACATTTTCCATTGATACCACTTTAT
AAATATTCTCGTAGGGGATATTTGGCACCGGAATGGTATAGAAGAGAATT
CACATTCGCATCGGACATTTACAGTCTTGGTGTTGTTATCATGGAGATAC
TGACAGGAGTTAAGGGGTATCCTAAAATTGATAACGTAAGAAAAATTAAG
CGTTTGCTACATTTCAACATTTTCAAATAACTATTATTCTTATGCTAGGA
CTTAAACTAGAGAAATTATGATAATCATGTGTTAGACAAACATAGTAGTC
TAGACCATCATCTATTCTTGTAGCACTCGGCCACATGAAGTACCACATTG
CTTGCTTACTAACATGAGGTACACTTGCATATAGGCTTTGCTGGCCTAAG
AATTAGCACTAAAATCATGGCACCCTACTTGCCGTTTGATCACTGTTACT
CCACCCAAATGATCAAACTTATGAGGAAATGTTGAAAATGTGCTTATACA
TCTTTTCACGCACTTGTAGCTCTCAAATACCTAAATGTTGACCAAAATGG
CCGCAAGTTTTATTTTGAAAAGGACAATCCATTCTAGAACTTGATATTGT
GCTGTATTTCATACACCAACAGACGAGATCACTCTTTAGCTTAAACGAAC
AAGAACATGTGAGAAATGCACTTATGCTTGTACAGGTAAAAATTACATCT
GACATCATATGTGGTCATAGTTCACTACTACTCTAGCCTTCTGTCTTAAC
CCTGACAAGTACGACAACACAAGCCTAGGATCATGGAGGCAAGCTCGAAA
ATCCATTTCGGCTCACAGGTGCAAATGAACCCACTGTGTGAAAACATATC
TCAAAATGTTAAAAACTTAGAAAAATATTTGCATGTATATCTGGACACTA
AATGTTTGTACACAAGTTTGCGGGTGAAAAGAACATTTTAGATGTCCCAT
GTAAAAAGACAAATTTCATTGCTCTCCAATGTGTCTAATCACGAACATGT
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GACCGTACCGTGCGTCCCCCGGATGATGGGAACATCCCATCGTCCTGGTC
TCTCCGTGCGACACGTGTCGCCATAAATAGCCCAAAATCCCGCTTTTGCT
GCGAACCGTTCGTTTTTTGCTACAAAATGTCCCGTTTTGCTACAAATGCC
CCGTTTTTGCTGCAGTAGTAAAACACGACTTGGTCTAGAAAATAGAAAAA
CTGTCTCCGATCCCGCTTTTGCTGTCGTAGAAAAAAAAGGCCCGCTTTTG
CTGCAATAGCAAAAATACAATTCTCCCCAGAAAACTCGCTGGAAAAAACC
TCACCGGAGTCGACGTAGCAAAAAAATTAACCTACCGTAGCAAACCCAAT
AGACGGTGGTAGCAGATTTTCTTTGCTTTCGAAGCAAAAAAAGGTTCGTT
CCAGAAAATAGAACGTCCCGCCGGAGACCATATAGTAAAAAAATTGTGCT
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AACCATAAGACGGTTGTAGCAACAAAGTTCTTCTAATGTAGCAAGAAACT
AACTTCGCCGGAGACATCGCCGGAGACTCTCGTCCGCAAACATCGTCGGA
CACCTCATAGCAAAAACTTTACACAATTGTAGCAAAAAAATCCAGTAAGT
GCAGCAAAAACAGCAACTTCGCCATGGAAACTTGATATAGCGGCGAGGGA
GGCGCAGCGGAGGTTGACTCGGCATAGCGGCTGTAGGAAAGGAGGTCGGG
GGCAGCCCCACCGCCTCCATCTCTGTGCTCGCTCCTGCTACAGCGACCTC
CGGGTTTCAGCGCTGGAGCACCGTCCCTCTGCATCGAGCAAGACCAAGCC
CAGCAAGCTTCCTCCCGTGTCCTCGTCCACCCGCGTGCGCCGCTGCAGCG
TCCGCGCGCCCGCCTCTCGGCCTCGCGCTCGCCACGATGAACCTACCCTG
CGAGCTCTGCTCGGAGGCTGGCGGCGGCACGATTAGCACCGGCAAAACGA
GAGAGGTGAGCCCCTGCTGTGAGGGGATGGTGGCCAGCGATGACGGTTCT
ATCTCCGGCGACCGGATGGGGAGAAGGGGAGGGGAGAGGCACGCGGGAGC
AGGGGAGGTGGTGTGGTGCCTTCGGGGCTGAGGGTGAGGAGAGGAAGATT
CCTCCGGCCGGCTCCGTGGGATGAGCGGCGTCAGCGGCGGCTAGCCCCGA
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TTGTTTGTGAGGGAAAAATCTGCGTAGAGATAAGGTAGGGGAGGGGTGGG
CCTTGAATAGGACGTGCACTCCCGGGAGACCCGGACGATGGGATGGTGCG
ATCCCCCGGGGGATCATCATCATTTTCCTTTCTGAAAACTTGTGTACGAA
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TTATTATGAGGTAAACAAGCCAACACGTCCATCCACATAGGATAAATAAT
CAACTCTGCTTAATTATATGGTGAATCCTAATTATAGGACAATAATAAAA
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AAAATGTATTGCATGTAGTGATGCCATTGCTCAATCCAGTAGTTAATCAC
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TTGGTATAGATTGTGGATCATGAATCGTCGAAATCACAGTTTCAAATTAG
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ATGCAAAATTATCAATTCCAGTGTACCACTTTGTGTGAGAGAGGTGTCAT
ATAATGGTAGCGTTGAAGCACCAGTAGAGAAATAAACAATGATGCAAATG
TATTAGGCCATTTAATAAAGTTCATAATTTATACAACTTTTAATAGGTAG
ATAAAAAGTGCATTTATGTTCATATACCTCACATAATTTTAGATTTTTTG
AGAATCGACATTCTAGTATATATATTAGACGGATAGGAGATACAACTTTA
ATTCCTTGAATGGGTCAATTTTAAGATCAGTTTCAAATGAAAATTGCTAG
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AAGGCTTGCCACAGAATGTTACCAAGGCAAGGCTAGTGATGACACTCTCT
GGAGAGGGTATCATGAGCAGTTTGAATAATTATGATCCGGTAAAGAACCA
CCTTGATCAGATTCTTGTAAAGGGGAGTTTTCTAGCATGGAGACATAGAT
CTCTCTAGTGTATGCATGTCCAAGATCCTATGGTGGGTTGATGGTAGACT
AAATACCAATAACATAAGCATGTTTAGTAGCATCTACATGCATGACATTC
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AACCATTTTGCATAAATCACAGAGCCTTCTACCATGTATTTCTGTTCCAA
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AAACATTAGATTGGTCCAAATAGTAGTATTTTGGAGTAGAGACTAAAACT
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ACTCAAATATATTTATATTTTGACATGATAAGAAACAAATGTAGAGATGA
ATATAACGAATAACAATTAGCCTCAAGTAACATACTGTTGGTGAAAATAT
AAGACCAAGCATGACAATATGTGCAAGCCAATGTGCAATAGTACCAACCA
TACCACCAATGATGAGTCGCATGAAGGAAGTGAACACATGGTTTAGATAT
GAGACATCCATACTAGATTTAATTATTTCTAGAAATGATATGAACGATTT
AACAAACACACCAAGTTGTTGATATCCTTTGATCTCATTACCAATGGATA
ACAAAAACAAAAAATTAACAAGAATGCGTGTAGTCGAAATTTCCAATATT
GTTTAATAGTATATAAAAAATCAAGACTGGTCAAGTAAAAATATACCATT
TGACATTTTATATGTCGCAATGATTTCATGTAGCACTAACATTATAAGGA
ATAGTAATATGAAAATAATGGTCAACCTTTGTACCGTATACCCTTTCAAA
AACTCAAATGAAATGTATATGTAGGAATTCTAGATGCACAAATGTGCACG
TTACACTTCTATTTAAAATTTCTATATACATTTTTTGTTTTAGGAGTTCC
ATTATTTGTTTGTTCTCTCAGTATAGTATGTAACTGAGAGTTTACTATCT
AAATCTTACTTACATCGCAACTTTGTAGTTAATAAAAGATTGGACAACTC
GGCTGGAGGGGTCAGATCAATGGGACACAGAGTTGACCCAAATAAAAGTA
TGCACTAAGATAGGGATAGAGTGCATGCACTTCGACCCAAAGAATAGACC
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GAACAAGATTTTCATGATAAAATTGTAAATCTTCCATCTAAGTCCATTGG
AAAAGATCTCAAGCAGCATGTTGAAATGGAAGAACTTGCTCAACTTGTGG
GAACATCTAGAGTAAGACATTGTAAGCAAGGGCAAGGAGAAGATTCAGCT
GATCAATGGGGGGAGGAAGATACGATGCAAAATGTCAGCCTTCAGGGTGC
AAGCATTTCTACCTCTAAATCTGGTGTGCTCTACAAGTTAAACAATTTGG
ATATATTCCGCGTAAAAAAACCATCAAATAATTTCGTGAAAAATGGCGGT
CCTACATTGCAGGCAAGGGGAAAGGTGTATATTTTCAGCAAGTTGGATCT
AAAGGAAATTTTAAAGGCTAAGAATGTTATTAGTAAAGATGGATTTGGAG
AAGTTTACAGGGGCACTATTCGTCATGAACTAGTCGCAGTAAGGAATCCC
ATAGGTGCTACCGTGGCAGAGAATGAAAAGTTTACAGAGGAATTGATGAT
CCAAGCTAAACATTCCCACAGGAACATCAGTTCGCCCATTGGTTGTTGCT
TGGAAGTTGACATCCCAATCCTAGTGTATGAGTTCTCATCCAAAGGAAGT
CTCCATGACAATCTTCACGGCAACAACAAGGTGCCTCTTGGCTTAGGTAC
GCGTTTGCGTATTGCTGCACTATCAGCAGGCGGTCTAGCTTATATGCTAT
CATCAGGGACAGTGAAAAGTACCAAAATCTTACATGGTGATGTTAAAACA
GAAAATATATTCTTGGATGAAAGCTTTGTGCCAAAGGTCTCACACTTCGG
CATGTCAAGGTTATACCGACGAACAAGTATATTCGTGAATGACATGGCTT
ATATGGATCCAGTATACCTACAAACAGGCCTATTGACCGAACAAAGTGAT
GTCTACAGTTTTGGAGTTGTCATTCTGGAGCTCATTAGCAGGAAGAAGGC
CACACAGTCAAACAATAACAGGTTAGTCAGGAAATTCCTTGAGAATCACA
AACAGGGGAGGAGATCAACTGAGCTATTTGATAAGGAAATTGCAGTGGCA
GGACATTTCAAACTTCTTGACAGTCTCGCGGGAATTGCTGTAGAATGTCT
TGATGACGACACGAGTCGAAGACCGGCAATGTCAGATGTTGCAAAGCGCC
TTTCCATACTGCATCGATCCGTGGATTAAGGCATAGCCCATTGGCTAGGG
TGGGCTGATGCACTCCCGCCCGCCTAGGTTCAAGTCTCCGTATTAATTTG
CGTCTGAGGTCGTACGTATATTTCTAATATATTAAAACCGCTTTGGGTGT
CTCCCCTTAAAGTCATTCATCATACTATCATACTGTATCAATCTCGAGCA
AATCGAATGTCCCAACCACGGGCAGGCGGTGCTCGCCTGGGATCTCGCGG
TGCTCACAAGGAAGAGCAAGCAAGTACACTAAGCTCGCCGGCATGCTGAG
TGCGATGACATAGACAAGAAGTTTGGGCAGATTGTGGTACTGTCTTGTAA
CGAATCGCCTGCAAGGCTACAAATCGCTGTTAATGTTGAATTAACGAATA
TGCATTGTCTTAATTGTTTGTCTGGTAGAACCATGAGCTGGTACCAGAGA
TACCCAGACCGCCTATTGTATCCCATATTTTGTCGAAAGTATTGGCAAGG
CTAGCGAGTGCGCACTCAGTCTATTCGGGTTCGAGTCCCATCTGCGGAAA
ATTTCCTCAAAGGATGGAGCCCATCTGCAGGGGATTTCGGTCAGGCGGCG
GGAAATGAAAGCTGAACGTCCCGGTCGTTTGTGGCGGGCTCCGACGGCGG
ATCCGGCCGTGGCGGCGAGGAGGAGGAGGAGGAGCGTAGCGCTGTGGTGG
GTCGTATTCTGCCTGCTGATTTCGTCGGAGATGGACCTTGCGGACCTCGT
ATATCCCTTCCATTCCTCGTAGTCGTGGTGACGTACAGGGAGGGAGCGTG
GAGGGCTCTGTCGATCCGGAGCTAGGTGGGCAGGTGTTGGGCGTGCAGAA
TCAAGCACGTCGGAAGATGTGAGCGAAACACAAGTCGGTCAATTTCGCTT
CCCTGATCCTCAACCCGGCCGAAAGGGCGGCCCATCTTCAACCTGTATTG
CGGAAAATTTTCTATTTGAGGTGGGGTCGCGGACAGGGAGTAGATTTTTA
CCGACCAGAATATTAGGCCTTTCACAATGGGTGTATCTTAGCGGTGTATC
CTAGGCACTTGCCTATGTGGCACTATAGTTAATGAGGAACGAGATTGTGG
TTGTATCTTAGCTAAGAAACACCTCTTGCACAAAACCATAGGCAAAAAAA
GCATGGTTAGACCAATTATATGATGCATGTCATCTAAATCATTAAATGTA
GAGACACCACTTAAGAAACAATGCATTGGAGAAGTTGTCTCTTAACCATC
TATTTCTCTTAAGATAACATGCTAAGATACACCACATTGTGAAAGGCCTT
AGAGTAGCATAGCAAATGGATTGTTTTTAAGCAGTCTGTAGGCCTTCAGC
TCCCCTAGGCCCTAGGGGCACTTTTTGTTTCGTCCGCAAAATCGGCCCAG
CCAACGCTCCCAGCACCTCGTTTTCAGCTGGAATGGGCCTATAATCCGTT
CGGCGAAAATCCAGTGCGCTGGGCTCGCCGAGGGGTGTCGGACGAAAAAA
CCCGTAGGAAAAGCCCTTCCGCCAGGTGGCCCCGTCCTGTCGGCAAGAGA
GCTTCATCGTCCTCATATCCTCGCCTCCCGTGCACGAGTTAGTCGGGTGC
CGGTCAACTTTTACTCAGGCTTCCCACACAATCCCATCCATCTACACACC
TCCTGCGCGCGGCTCATCCCCTTGATACGTCCATTTTGCATCACTATTCT
ATGTCATAATTCACTATTATTCATTGATATATTTCGTATGGTGATACTTA
TGTTATTTCATCTATTTTTGCATGGTTGATGACTTTTGGAGCATGGACCG
CTGCAGTCAGGATTCTGATGGAAAAGGTGTTGTTTGGACACAAATTTCGC
GAAGATCAGAAAATCCGGAAAAATATACGGAAAATTCTATTTTTCTAGAA
GACTCAGGATGCCAGAAGATGGAGTGGAGGTGGGCCACAGGGGGCCCACA
CCACCCCATGGCGCGGGCAGGCCTAGGGCACGCTAGGGAGTGGTATGGCC
GCCCTGGCCCACTCCAGCCTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.