Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE021899

[Submit comment/correction]

Sequence	AE021899
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE021899
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ACCGCTCTCACCCACCCGGCCAGGCCACCCCATTTTGATTTCAACATTTT CTAAACCAACCCCCACGTAATTCCCGATACTAAAAGCGAACCACCTTAAT TCCATTAAAATATTTCCTCTCCACCACTCTCTCTCCCTCCCTCTGGTGAC TCTGTCCCTGTCGCTGGCTCTCGGGAAGAGAGAGAGAGAGAGGGGCGTAC GCGAGCTGCCGCGGAGGAGGAGGAGCCACGGCAACGGGGACACGCTTCCT GGTTCCGGGAGCGGGGACGGCTCGAGCTCCTGCTGCCATTTCCGTGGCCT CGGCGGTTGCCAGATCGGCTGGTTTCTGCGCTGATTTTTGCGGTTTTTTT AGAGGAGTTTTTGCTGGGCGGGGGCGTGGATTGGCGCTGGCCTGAGTTTT GAGGAGGGGCCGTGTGGATTTGAGGTGGTTCCCGCGGAGATCCCGCTGAG GCCGGGAGTTTTGGTTCTCCTCGAGGTGATTTCGGGCGCGCCGGCCGGCG ATGGCATCGGTGGAGGTGCGGTCCGTGCGGAAGTCTTCGGCACTGCGGGC GCGCGGACCGGCTAAGCTGCAGGCCACCCGGTCCATGCCGCTCGACTACA GGCACTCGGCCAAGCCTGCTGGCGCCGGGCCCAGCCCGCCGGCAAACGGC GTTGGGCGCCGGGCTGCGGCGGAGGAGGAGGATGGGGAGGTGCTGCCGGC CGAGGGAGACGCCGACTCTCCGTACAGCTCCAAGGCGGCGACAACAGAGG AGGAGGAGGAGAGTGGTGAAGGTGGCGGGGAGGCTGATTCGGCGTCCTCT CCAGCTGCGGCACCGCGGAGGTCGTCGCCGGACGCAGCTGCCGGCCCCTC ACAACGAGACGCCAAATGGGGTGACACGAGCTCCTACGGTGCTAAAAAGG TGGCTCCCCTGCCTTTTTCTTCCTCTTGTTCTCCGACACTTCTGAAATGC CAAAATTCTTATGGATAATGCCTGATATTTAGTCAGTTCAAGTATTTTGA AATTTCCGAATTAGTGAAAACCTGTTATTCCGAGTTCTTTTTTTTTGTAG TTCAAATGGAATTTCTGCAAATGTTATGCCAACCAGCTCTAAAGGTTATT TCGAGCTATAAAGTGTAAGGCTGAGCTATATAGATTAAGATGTAAAGAAG GTGTCAACTGAAGTTTTTGCTAGAGTTCTGGGAATGTATTCTTCTGTAAT TTTTTGCCACTTCTAGATTGTTATCGAGATGTGATCCGACATAAACATTG CCACTCGCTAGCAACAAGAATTTCATTCCACGTCTTGAGGAGATCTCCAT GTTTTTTACTACCAAGGGTTTGTTAAACCAGTAAATAGAGCTCCACCATT TAAATTTGTTACCCACCAATGGTGTTTCAGTGCTTCCTATTTATTTGCTG TCACGTCTGTGATAGTTCGCCTGCTCTATGTACTCATTATCACATTGCAT AATACTATTGTGTCACAATTATGAGATGCATTAGCTTGTTATCAGACATG CATTTTAAATTGGTCAACTTCTGTAATTATGCAAATTTATATACTTGTAT ATGTTTTTCAGTTTGGTGTACAATGCTAATCTGCCGTCTACCCTACACTT CTTGCAGAAGCATAGAGTTTTTTGTCAGCTTCCAAATGGTGATTGGGCCT TATGCACTGTGATTACTACATCTGGTGACGAGTCTGTAGTAAAGGTTTCT GAAGGGAAAGTAAGTTACCTAGAATCTACTCCCAAGACCTTATTATTACT TCAAAACTATGATAATCTTACTCCCATTCTTCTGATTGAAGGTACTAAGA TTGAAAACAGAGAGCCTTCAACCTGCAAATCCTGAAATTCTTGACGGAGT GGATGATCTTATGCAGCTGAGCTATTTAAGTGAACCATCCGTGCTGTACA ACTTGCAGTACAGATATTCTCAAGACATGATTTATGTGAGGATATATTCA GAATTTTGTCTTTTCTTCAGGACTTTGATGGCTTTCTTAGTGATATGTTA TTTCATTGTAGACTAAAGCAGGCCCAGTTTTGGTGGCCGTCAACCCTTTC AAGAAGGTTGCACTGTATGGTAATGAGTATATCAATGCATATAGAAATAG AACAATGGACAGTCCACATGTGTATGCAATAGCAGATTCAGCCCTCCGTG AAATGAAAAGAGGTCAGTCTGCTGTTGTTGTTACATATTTTTTGCTGGTA TAATCTACACTTCTTTTTTGAAAAAAAATCATCTAGATTTATGCCTAACT AATTGTCATGTTTATTTGCAGATGAAGTTAACCAGTCCATTATTATAAGG TTGGTATCTTTTTATCTGTAAGAAGCATCCAGTGGGATCATATTGTAATA AACTCTGCATCTTAATTGACATAGAATAGCTAGCTGAGTCAATCCACATG AAATGTGTTTTTTGGGTATTATGCAATTCGTTTTTGGCATTGGTATGGTT TCATTTCTGCTACTTTCAGTGTCTGCTGAACAGAATAAATAATGACTTAA CCAGCCAAATGCACTTATATTAGTTGCTTCATTGATAGATAAGTACATGA ATTGTCCATCATTTCAGTTCAGGCCACACCATAAAGATTCTTCAGGGATA TTAACATATTTGCTGTTGTTCATATACCTATTCCATTACCCGGTTCACTT GAAGTAAGTAATAAACGTGTTAGATATCTTGTGACACCGAACCTTATAGT TTTATGTATTTCCTTAGATTGGAATAAACAGTGGATTAGCACACCCTGCA AATATCTAAAAAGAAAACAATGCTGATAGAGAAAGTTCAATTCTATCACT TTTGTAATAACGACTAAGTTTGCAGTTTCAGTTCTTTTATTTCATTGACA TCGTTTAAAAAGGAAATTGTCTTCCTTTCTTGTTTAAACCATGATATCGT TACAAATGAATGAATGATGCCATTATTGTATGTAGTGGTGAGAGTGGAGC AGGAAAAACAGAAACTGCAAAGATTGCCATGCAGTATTTGGCTTCTCTTG GAGGTGGAAGTGGCATAGAATATGAGATCCTACAGACCAACCCAATACTC GAGGCCTTTGGCAATGCAAAGACATTAAGAAATGATAACTCAAGTCGCTT CGTAAGTTTTTTCTTCTGGGTATACCAATACTGTACTGCAGTCGCAGAAC AAAGTTTGGCTAATATTCTTAGTTGTCATTGCAGGGAAAGCTCATTGAAA TTCATTTCAGTACGACTGGAAGAATATGTGGTGCCATGATTCAAACATGT ACACAAATTCTACCGATTATACCTACTTTATGTCATTAGCATTTTCTGGC TTAAAATTAATTTATGATTACTAATGATGAAATTTTCTAATGATCTTGCT GCATGCACAATTGGACAGTTCTACTTGAGAAGGTAACTTCAAATTTTGTG GTTATCTATTATCTAAATGCATTTTTATGATAAGCAATCTAATCCCACCT TTTTCCACTATGGTAGTCAAGGGTTGTACAGTGTGCAGTCGGTGAGCGTT CCTACCATATATTTTATCAGCTATGTGCAGGTGCTCCACCGGCTCTCAGA GGTACATTATCTATCCATCCACTATGAATTGGTTAGCTGCTGGCTTATTT GATTGATGCAGAAATACTTGATGGCATCTAAATATCCTCTAAAACTTCTT TTGAATATTGTCCTTTTCCTTTTATGTATTACAAAAACCACTATTTGTGC TGCTCAGTTTCCAACAGAGATTATATCCTTCTATTGACAATCGACGTTGC TTTTGATGTTGCTCCACTCTTTCGTGTTGCACAATCCTTGATTATTGTAC ATGGTTTCTTACAATGTTTCAATACAGAGAAGTTGAATTTGAAGAAGGTG GATGAATACAAATATCTGAAACAGAGTTGCTGCTATTCAATTGCTGGTGT GGATGATGCTGAAATGTTCCGTACTGTAACGGTATAATATACTTTTGTTC CTCATTCTACATAAAATACCTTTTTTTTACATTGCCAGGGCCACAACAGT AAATACTTTGCTATATAAGGCTAATTTCATGGAAGCATCTTCATACTTGT ATTTTTTCTTCTCTACTGTCATGTTTGTTGACTTCTCTTTTTTTTCTAGG AAGCTATGAACATCGTCCATATCAGCAAGGAAGACCAAGATAATGTTTTC GCAATGGTTTCTGCTGTGCTATGGCTGGGAGATGTCTCTTTCACAATTAT AGATAACGAGAATCATGTTGAGATCATTGTAGAAGAAGGTAAAAAGAACA AGTATGCTTTCAGTCAATAATATGGTCGTATGGACAATACATCCACCATT TTTTGGTCCCTGTTGATGATTTGCAACATATTGTTAGACATCATCAGTTT TGCATACTGATGATATGTTGTATTTTGACAATTTTGTTAAGTGTTGTATA ACATACTGCAATTTTAAAGTACTGAAAACAAATTACCATCCTATTTCAGC TGCTGAAACGGTTTCAAGACTTCTTGGCTGCAGCATTGAAGATCTCAATT TAGTTCTGTCAAAGCGGCACATGAAAGTTAATAATGAAAATATTGTCCAG AAGCTTACACTTACACAGGTTAGTATGTTTCTCAACTAAAAGGCTAGGGA AAATAGTAGCCATGACGTGCTATTTGATTATCTCTTATGCACCCACTTCT CTCTGGATATTGCAGGCAACTGACACAAGAGATGCGCTGGCCAAAGCCCT ATACGCCAGTTTGTTTGAGTGGCTTGTAGAACAAATTAACAAGTCTCTTT CTGTTGGCAAGCGTCGAACTGGGAGATCAATCAGTATTCTTGATATCTAC GGCTTTGAATCATTTGATGTAATGTACTTGCCTTTGACCTGCTGGCATCA CATTTTCGTTGTCAAATGTATTCTCATGGCATGCTATAAACATGCAGAAG AACAGTTTTGAACAGTTCTGCATCAATTATGCCAATGAGAGGCTACAACA ACATTTCAACCGCCATTTGTTTAAGCTTGAGCAAGAGGTGAGCTACTTTA TGGTTTAACTTTCCGATGTACTCGCAGCATTGTAGTTTTACTCAGCTAGG TACCAGCAGGTTATAATGACCATTCTTATTATGTAACCGAGTTCAGAATA CTTTAACATCATTCACTAAAGTTTTTTTTTATAATGGTTTCAAGTTCTGT CAGAACTGTAATGTTAAACATTAGCGGTGAAGCAAACTTTATTGTTCTTC CTTATCTGTCGAGATGAAAAATTGCATGTGCTTCTTGAAAATGCTATTTC TAATCATTTTCACTCCGTATTAGCTAAATTCAGAAAGGCAGATTTGAGGT TGTTATACCTTGCCTTTGTTTTGTGTAGTCTGCCCTTTTGGGCTTAAACT GCTACTTCTACCTTTTCAATACACTGAGATGCAAGCGATTTTGTTTCCTG AAAAATAAGATTGTTATATAGTCACTCCATGATTTATCCACTTCTATGTA GAAATTGTCTGAAAATGATATGGTTTCTGTGAACAGGAATACGTTGAGGA TGGCATTGACTGGGCTAAGGTTGAGTTTGAGGACAACCAGGACTGCTTGA ATCTATTCGAGAAAGTATGGTCACTACACTGTCTTCAATGTTGGCATCAT TATGAAATTATAACTATATTATTCTGTGGGGGAAATGCTTTAAATTCTTC ATATACCAGTACTTCATTAGACAGCATGTGCCTGTTTCATTTGACATCAA GCGAAGAGGGAATGCCTTTGTTTCGCTGGAAAGTTGGTAACTTACAAGAT TATAAATTTATTATAATTGCTATTTCCATATCATGCAATCATTTCTTAGC TCAAAATACACTACTAAAAAAATCAAAATATTTTGATAGGCGGTCCCACA TCCTTAAAAATATAGCTTCCGGATTTCAAATTGTACCAATATGCATATAC TTCCATTTGTAGGAACACCTGGGTTCTATAAACTTGGTAAATACTGCTTG ATTGACTCATCCTAACCTTGTACAAGTAAAATGTACTTACTGGTTTCTCA AACCATGATGATAACTAGCATTAGGAAAACAAGGATGGAACTTATAAGGG CAGCCACAGCGTGTGCTTGCCAAATCTGACACAGTGGCAGCATATGGCAT AGATGCCAAATTGCTAATTTTCTACAACGTAGAGGTTGCCAAATACTCCC TCTGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTTGTGAAGCGAACATATCTA GACTCCTTTTGGTGCATAGAAGTGTTCTACGCACCAAAAGGAGTCTAGAT ACATTCGCTTCACAAAAGCTAAAACATCTTATATTTTCAAACGGAGGGAG TACATGTTAGGTAGGACCTGCTGCAAGAGAGAAGCAGCTAAAATATTCCA TTCTCTCTCCCCTCCTATCCTCACATCACTCTCCACGTACACATGTTGCA TGCAAAGAACTATAATTTATTCATCATCTCAATTTGGCATTGGAGCAAGA GGGTGCTCCGGTTCCATATTTTGCACCTTTTGGAACTACCCTCACAATGT ATGGAACTAGTTCCAAAAGCTAAAAAGGCAATTTGGAACTACATTTAGCT ACACATTGTGGGTGCCCTAACTGGCTTATCATGATGGAATCTGGGTTCCC AGAATGGTTGGTTTAACCTTGCTGGAGTTTTGATGACTTCTGTAGTGTCC TGTGGCAAAAAAAGAAAAAAGTACATCCAATTTTTTTATCGTTGTTTGAG AACTTGGTAAAATGTCTGACATTCTATCATTTCTGTATATCTTCTTAACT TGACATGAAACCTACTTGCTATTCAGTAATAACTTTTTGCCTCTTTCATT CTTTGTCTTGCTTCTCTTACTGGATACAGAAACCACTGGGTTTGTTGTCT CTGCTGGATGAGGAATCTACATTTCCTAATGCCACAGATCTTACTTTTGC TAACAAGCTCAAGCAACATCTTGACACCAATTCTTGCTTCCGAGGAGAAA GGGGCAAGGCTTTCGCTGTTCGTCACTATGCAGGAGAGGTTGGAAGTTGT CATATATCCACTGCTATGTTCACATTGATATTTCTTTTAGCACACGTTAA CTTTATTTCCATTTCCTTGATGATCAGGTGGCATATGACACATCAGGTTT TCTAGAGAAGAACAGAGATTTGTTGCACATGGACTCAATTCAGTTCTTTG CCAAATGCAAATTGTCTATACCACAAATGTTTGCATCCAAGATGCTTGCT CAATCTGATAATACAGAATCCGTTCCATATAGGCCTAGTGTTGCTGATTC GCAGAAGTTAAGTGTAGCAATGAAGTTCAAGGTAAAAAAGTGTGCACACA AACAACAATTTTATGTGATCTTGAATGAATCTGATCAACTGTTATTGATC ATCTGTGTAAATGTTTTGCAGGGACAATTGTTCCAACTTATGCAAAGACT TGAAAGTACAACGCCACACTTCATACGTTGTATTAAACCAAATAATTTGC AACTCCCTGCCATTTACGGACAAGAACTTGTGCTTCAACAACTAAAATGC TGTGGGGTTCTTGAGGTTGTTCGAATTTCAAGATCTGGGTATCCAACAAG AATGACTCATCAAAAGTTTGCTCGGCGGTAAATCAAATATCTGTATATGC ATTACGCTGCTGTTTTTTGCCGTGTGCAGAAGTTAAACAATTCAAGTTAT CAGGTATGGCTTTCTTCTTGAGGATGTCGCATCTCAAGATCCGCTTAGTG TTTCAGTTGCAATTCTTCATCAGTTCAACATTTTGCCTGAGATGTATCAA GTTGGCTACACAAAATTGTTCTTCCGAACTGGTCAGGTCAGTTAAGCAGC TGTTGTTTCATTTATTAATGCCCCTTGGGTTATTGTTGTATTCCATACAT TCTCCCAATACTTTGTTTATGCTCTGTATCCTTATCAGATACTTCTGATA CTCAATTGGGTTTGACTTTGATATGAATGGATAATTAAATTAATATTTCT GACACTCCCTGATTCGTTACAGCAGAGCAGCTGACTAATTTGCTATTCTA TTGATATGCTAATGATTGCAAGTAGACTGATTTCCTATTGTCTAGTAAGG ATATACTAAGTACATTCAGTGAGTAGCTTGTAGAGGCAGTAAGATATCAA GTGTAATGTCGGAGAAAGAGTCCCGCGTGGGAACAAGGGGTCCAACAAGC CCTGAGTTCGAGAGGGGGCTGAATCACGCGTTCTGAGCTTCTCGGCGATG GTGGAGGCGGCGGTGCACGGACACGACAGAGAGGTTGACACGTTTTTTTC TTTACCCAGGTTTGGGACCCTCGTGAGGAGGTAAAACCCCTACTCCTGCT TGGCTGTATTGCTCGCGGTGCTTCGCGAGGGTACAGTGGTGAACCAATGT CTAGGGTTACATATCGCAAGGATCAACCTCCTCTAAGGTAGTGAAGGTCT CCTTATATCGGGCGGCCGCGCCTCTTCCCCCAAATACTGGGCGGGAAGGG TCACCACATTCCCGCCATTGGAAAGTGTTCGGATTCTTCCCTTGTCCACG AGCTGGTCCCAGCAGGAGGTAGTGGCCTGCTGCTGAGGTCACCGACGACG CGCCTTCTGCCTTGTCACGTCATCCTGGTCTCCTTGCACCAAAGTAGCGA TGTCGGGCCTCAGCGTAGCTCCCGCGTCGTCTTCCTACCTTAACACCGAA GCAGCCAAGCGGTGAACCACTTTCCTGGGGCGGTCCGACATCAGCTTGGA CCGACCGTTTCACCCGTCGCGACGTGGGACTCGGGTATGTCCCCACAGTA CCCAAGCCAATCCCTCGTCAGGGGCCAAGGGCTCCTGAGGAGGCCTCCCT TAGCGTCTTTCTGCCTCGGCCACCCTCACCCTGTCTCCCAGAGGGTGCCG CCCCTCTCGAGGGTGAGCAGCGCGGGTCTGGCAATTTGACGGGACGTGGT ACCCCCGGTGCCAGTAGTCCGACATGTATATATTCTACGGTTTTAGTAGG GAGTGATCCTATTAATCATACACTATAAGGAGTAAAAGAGCACATAAATT GGGATCACAATATCCATGTAGCAAAGCATCACTGATATACACACAATAGG GGTCTATACATAGAATATATATATATACACAACAAGATGACGGCTTCAAA TATGTAATAAGGAAAAAATATTCAGGTAGGTAGGGATCCAAGAGCAAAGT TATTCAAGGAGAAATCCAAGAGCACAGTGGCTCACACATTTTAAAACTAC ACCTGGTGATCTGTTTAGTGAATGACTAGAGGCTCTCAATCTTCTAATGC ACACGGTGGTGTCGGCTCATCTTTTTGTCCTCTCATATTGTGTATATATG ATGTATCCTTGTTTCTGGAAAATGTCGCATCACTGTGCTTGTACTTCCAT ACCTGTATCGCGCATCGGGTGACATGCTTTTAAAGTAAAACCATTGGCCT ATGATATTTATATGAATGGACATTACATGTTTGCAGGTCCTTCCTAAAAT TTACAATTCATCATTATTTGTCTTGAGATGCTTGTCTATACAATTGTCTC CTACTATTATTTAAGCTTATAATGACAAGTATCTTCTGCTCCTTCTGCCT GTTGATATTTTGGAACTGAAGATTGGCAAACTTGAGAATACTCGAAATCG TACTCTACATGGTGTTTTAAGGGTTCAAAGCTGTTTCAGAGGGTATCAAG CACGGCGGCATGCAATTGAACGGATTAGAGGAGTTTTGGCTCTTCAATCA TGTACGACGTCCAGCTCACTGTCCTTATGCACTTCTCTGTATTTCTTGTT GCCGTATATTTTCCTACTCATCTTACTGTATGGGTTGGTTGCTCTTCTCT TCTTGCAGTCATTCGTGGTGAGAATGCAAGACAAAGTTTTTCATCTCTGC TAAGGAAACATAGGGCAGCTACTGTTCTTCAGAGAAATCTAAGAGGTTGG CTTTCAAGAAGATATTTCGTTAAGATACGGAAGGCTTCAGTGGTAATACA ATCTGGTAAGGATATTTTTCTCATTTTCGTAGGACTTTGTAAAGATGGAA GTGCTAGTATGACTCACCGTTTCTGGTTGTCTTAAAATAAATGTGAAGGT ATCCGTGGTTGTCTTGTTAGAAGATGCGCCGGCAATGTTGATCTACTGAA TGTGTTACGAGAATTTGAATCGAAGAAGGTACACTATATCTGTTTCTCTG CTCTGTTACTGTTTTCCCCTGTGGTGTGCATGTAAAATACGAGGTACCTG ATAGTATTCCTCTTGGCCCACCTGGTCAGTTGGGACTGTTAGAAACATTC TACGCACTATCTGCTCAAACTAACACATGAAATAAGTTCTTCCAGGAGGC AGATGGTGACCAAATTTTGATCAAGGCATCTTTCCTTGCTGAGCTACAAA GGCGAATCCTTAGGGCCGAGGCGACAGTTCGAGAAAAGGATGAAGAGAAC GAGATGTTACACCAGCGGCTTCAGCAATACGAAAACCGATGGTTAGAATA CGAGCAGAAAATGAAAGCGATGGAGGAAATGTGGCAGAAGCAAATGCGAT CATTGCAATCAAGCCTGTCCGTAGCAAAGAAGAGCCTTGCTCTGGATGAC ACACCTAGGATGTCAGACTCATCCGTGGAGCAGAGTTGGGAGAGCAACGG GAATCATGTCGGTGGGGGCTCCCAGCTGGCCCCTCGGATCACTGGGCGTG AGATGAACGCCAGCATCAGCGTCATCGGCCGCCTAGCAGAGGAATTCGAG CAGCGGAGTCAGGTCTTCGCTGACGATGCCAAGTTCTTGGTGGAAGTCAA GTCCGGGCAGGCGGATGCCAGTTTGAACCCAGACATGGAGCTCCGCAGGC TGAAGCAGAACTTCGACTCGTGGAAGAAGGATTTCAGCTCCCGCATACGG GAGACCAAGGTGATCCTGAACAAGCTCGCGACTGGGAGCAGCGGGGGCAA CGAATCTTCCCCAAACTCCGCGAAGCGAAAGTGGTGGGGCAGGCTGAACA CCTCCAAGTTTTCTTGAATTTATCTAGAATGATGTAGTAGACGGCCCCGG CATTTTACACGTCAGTGCTAGTCCTAGAGCTTTGAGTGCTGCGAAGTCCA GTGTTTTGGACTGGATATGTAATATTGTGGAGGGCGAGTTGTATAGTTCT TCCACAGCTGGGCTTCTTTGCAGAGCCCAAGAACCACTGAGTTATGATGT AATTACTTGCTAAGGTATACTACTTAAAAGGGGGAGATTGGTGATTGCTC AGTGTTTGTTCTCTTGTCGTTTTGTCTGTTGTATATGTGTATATTTCTAT GCGGTTAACTTCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.