Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE006898

[Submit comment/correction]

Sequence	AE006898
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE006898
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAAATCTCAAATCGCAAATCGCGAAGCGCCTTGGTTAACCAAAGCGCCGT CCTCCTCCTCCGAGTCTCCGACGCTTCCAAATCTCTCTCTGCCGCCCCCC CACCGACGGCTGGACCCTCGGCGCCAGTGACCACCACCATGGCGACCGAC CAGAGCGCGGAGCAGTTCAGGGGCCAGGCGCGGCTCCCGGGCTTCGCGGC GCCGCGGCGCTACGATCTGCGGCTCACGCCGGACCTCGCCGCCTGCACCT TCTCCGGCTCGGTGGACATCTCCCTCGACGTCGCCGCGCCCACGCGGTTC CTCGTGCTCAACGCCGCCGACCTCGACGTGTCCCCCGCCGACGTGCACTT CGCGCCCCAGGGCTCCGACCAGGTACCTAGCTGCCTGCTCTCTCGCGCTC TGTTACGGGTGGCTGGGCTTGATCTGTTGGTGTGAGGCTGGAGATTTGAA AGGTGGGGCGTGGGGATTGGCCGAGGGTGTAAGGCGGGGTTTAGGAAAGG GTTTGTCGCCAGTGGATTGAAGTTTCGGTTCCCAAGTTGGAGGTGACATT CTAGCATTGGCTTGACAGGGGAGGGAGGGAACGAGATCGATTTCGTGCAG CTTAAATTCGTAGAAAATCATCTGCACTGCAAACTAGGGCTTGTGGGTTA CCTGCTTACAAGTTACAACTGAATCAAATTGGAAGCTGTCTCTATGGGGC ATTGCAATCTTGGCATTTCATTCGTAGGCTTATGATTTGGAGAGAGGATC ATCATAAGTGGAGTCCATGGATTTGTTGTGTGACATGAATGTATGGTTTG AAAGTGTCACACAGATTTGTGGTTTGCTTTTTTTGAGACAGTGATTTAGT TTAGCTACTTGCCTGTTTTGGTTGAAGCTTCAAGTGAGTTTCAGTAATCG TTAAGAGGTTTCAAAACAAAACTCGACACACCTTTGACATCAATGTACAA GTGAGACTCTAGATTAAGGTAGAAGGTAGGGTTGTGTTTTTATGGATAAA TCTCTGACTGGAAATTGCAGTCATGAAGCTTTCGTATTAGGCAAAGGATC ATGATTAAGATTAGGGATGGACCGTGGACAGAAAGCTCGAAAACTCCCGA TCCACTCGACTCATCGCAATCTTGGCTTGAACTCCTTTCCTTGACAGGTT GATCCGAGCAATTTTTTTGCTCCTTATGACAGCGAGCCTAATGAACGAGT TACTTGTTAAGTACTTGAATCACCCATACCTATTAACTATAATTAGTGCA CATGCACATACCCATTTCATACTTAAATAGTTAAAATGCACCACTTCTTT CCTCAGTTCGATGATATATATTACATAAAATAATACAAACCTTTTCACGT TGCTTGCTGTAGAAGGTTGTTTTTTGTTTAACTTTTTAATTTCAGTTTTG TGCATGGCCCAAAAGTTAACAAGCCAAAGCTAAACTTGGGCATTTGACGA ACTGATCCAAGCTAAAAGTTTTGCTCTTCAATATTAAAGCGAGTTTGAGC TTGCTTGTCTTCAAGCCCTAGTTAGGGTACACTAGCTTTCTTAGGGTTGA CAACTGTATTGCAATATTTTTTCGGAACTTCACTCCATGTATTGTTCATA AATGATGATAGCTTTTGCATCAGGTGTTGCGTCCTGTGGAAGTCACCAAT GAACTGAAGGATGAGATCTTGATTATTCGCTTCAATGAATTGCTTCCTCT TGGGAAGGGAACTTTGGTAATTGCATTTCAGGGAACTTTGAATGATAAGA TGAAGGGTTTTTATAGAAGGTAATCATTTGGTATCTTTAAGGCTATTACC AAATATATACATGCGTGCACATTTTGCATCATCAGAAATATTGTTTCACC AGCTCTGAATTCTTCTCTTGTTTTATGGAGCATATTTTGATAATAGGTAA ATTAAGTCATCAGTCGTACTGTTGTGGCTAAACAACGAGAAATAGGTTGT AATTTCTCATAATTTCAAAAGAGAGAATATAAAAGATAATCACTATGGTG TTATTAGGGGATTAAATGCTGTTAGATCAGATTGGATGACTAAGATGGTT TGTGTCATACTTAACTCGTAGATTTTATATTGGTATAGAAATTTGTGAAA AAAATCATATTAAATCTTTCTTCTTGGTTTTTTAGTGTGTATGAGCTCAA TGGGGAGAAGAAGAACATGGCTGTAACCCAGTTTGAACCTGCTGACGCAA GGCGCTGCTTCCCGTGTTGGGATGAACCCGCTTTCAAGGTTTACACCTTT GCTTTTTACTACTCCATTTTTTTCTGTGATACTCATATATGGTTTTACAT CCATTGCACGGTAAAAGGAATACGTGTATGGACAACACATGATAACATGG ATGTAGTGTTCAAGTGCATTAGGATTCTGTTTATTTAGCTTTTGAGAGAA TTCCTTATTCAACACTACTTAAAAATATGATTCCTTATTTGGCCCTGAAA AAGTTTTTTTTCCCATTTGACATTTGGGCTAATATTGTTGACTTATATGA CACTGCCGTTTGTTCCGTTACATTGTTCCATCAGTTTTTTTCTGGTCGAC CAAAATACCCCTAGGTAAGTCGCTCATTGTGAAGTCAATATCCTTTGCCA AAAAAGCATGCTCGCTGCTGGTCAGCTTCCGAAGGGGTGTCCTGGGGTCT TGCGCCACCTGCTGGTTGGCGTGGTATCCATGGAAGGAGCACCAAGATGC TTATAGCTTCTTCTAGAGGAGGTTTAGTCCAAGTGAATTAAGTGCACATT CAACATATTTGCTGCTCCCTGTTTCAACCGTTGGATCCAGCAGGTGGTCA TTCGAGGCCTTCTTGCGTTCACAGTGATGTAATGTCCGTGTCGGACTATA CTGTCCCACTTTGGTTTAGTGTCGTTTCTTCCCTCAAAGAATTCGTAGAA GCACCAGTTTTGGTGTTTGCAGTACAGAGGGAAAGCATGTAACGGAACCA GAGGCACATATTTTGGTTCAATGTCTACAAAATTTTGAAACAGGGAGCAT CAAATATATTGAATTTGAATGTCTACAAAATTTGGGTCACATAATGCACC GAGGGCAAAAGCGTATTTTATATCCCTATTTAACACGGTAAGTGCTCAAA ATGAACTAGATTGTCATATAATGCAAAAAATTTAGACCAAGTGTCAAATA AGGAAGAATTTTTTCCAGGGCCACATAGGGAATTATATCTTACTTTTCAT GGAGTCCATGAATCTTGTGTGACATGACATGTTCTGTTCCGGTTTGGTAT TAGGATTTGACTTCAGTGATGAGTCAATTGTATACGAGATACTGAACCTT TTCCCCTTTCATAGCTTTGGATCTGAATTGAATAGTCAATCCACATGTTG AAGCTTCTAAAGCTCTACATGATATGGACTCCTTGCCAAGGATTATGAGT CCAACGACTAGTCTAGACTAGTCCAACGACTAGTCTACAAGTCCTAAACT GACTGTCGACTCGGTTGGTCGATTCGACTATTTCCTCGATTCGATTGAGT CGAGACTAGTCCTGGACTAGTCTAAACTAGTCCTGCTGTTTGACTCGATC GACTCAATTTTAGCCGGATAAGTGAGGCGCTCAGGAAGAAAATTGGAAAC CCTAGCTAATCAAGACTTGCTATGTGAAGTTCTACATTCTAGCATTATTA TGTTATGTAACTTGTGTTGAACTTATGTCAGTTTTAGTTATTAAATCTCC TATCTGGTCGCCATACATGATAGTATTTTGTACTAGCTACTGCTGAAGTA CATGTCGACTAGTCGATCAGTAGTCTAGACTAGTCTCGACTAGTCTATGA GTCGGTACCCCAACGACTCGGCTCGACTTGTCGACTCGTAATCCTTGCTC CTTGCATGTTATCTGATTGTATTCCACAAGAGGAGCATTGTTTGATTTGA TGCTATTTATGGACTAACTACACCATAATGAAATAATATATTGACTTATA GGGTATTTTCCTTAATGCTTAATAGAGTAACAGTATAACCTGTACAATTT AGGCAATTAGCTTTTCAAAGAAGGCTAAATTGGGCACACATCAGTTCGTC TCTGTTTAGAATTGTACATCTGTACATCTTGTGAACAGAAGGATAAAAAG TAAGCCACTTTAGATTATTATATATGTTACTGAGAGTTTAACTGTTCCAT TCACGCTACAGGCTGTATTCAAAATTACTCTGGAAGTTCCGTCTGAGACT GTCGCTTTGTCGAATATGCCAGTTTTTGAAGAGAAGTTCAATGGCCCCAC CAAAACTGTCTATTTCCAGGAAACTCCAATAATGTCAACATATCTAGTAG CTGTTATTGTTGGCATGTTTGACTATGTGGAAGCTTTCACCAGTGATGGT ACCTTAACTTCTCTGTTTCCTTATCTTACCATCAGACATCTTCTTAGCTT TCATCTTTTTGTGGTTCATGCCATGAATATAATTGGCCTGATCTCCCTTC CTTTGCAGGTACTAGTGTTCGTGTTTACACACAAGTTGGTAAGAGTGCCC AGGGAAATTTTGCACTAGAGGTTGCCGTGAAGACACTAATCCTCTTCAAG GAGTAACTTTCTAATCTCCCGCCTTACTATATTGGTTGACAATGTTTTCT TGTGCTTTTGGTGTGTTCCAGCTAGATCTGTATTTTCGCAAACCCAATAG TGTTACTTAGGAGGTTCTTTATTGATAGTTACCATAACATTAAGATGCAA ATAACACTATTATTGCACATAACTGTTGAATATGCAAACATTGTGGACTG TTAAATATGCAAACATTGTGGACTGATGTGGCTTTAGATGTTTGTGTAAA TGCACCCTATCAGGAGCCCTGTTTTTCCCCTCTATATCCAGTATAACCTT ATTAAAATTGCACTTTTAGCTCATTTTGGATAGGCATGGTATATTGATTA TGCAATGTTGACCTTCTCTGGAGATGACATTTATGACTTAGATAAGCATT TCAATTTTTTATATATTTTCATTCTTTGATGATTTATCAAATTCGTACCC CTTCTGCATATTACTTAATAATGTGCATCTTTATATATATTTGAGGATAT GTTGAGGCATCTGTTATTCGTTCAGGCTAATGATGATTGTTTATCATGCC AGGTACTTTGCTGTGCCATTTCCTCTCCCAAAAATGGATATGATCGCGAT TCCTGATTTTTCTGCTGGAGCGATGGAGAATTATGGCTTAGTTACATACC GTGAAACTGCTTTGCTATTTGATGAACGACACTCTGCAGCTGCTAATAAG CAAAGGGTAGGGTTCTATGGAATTTTTATTTCAACTATTTAAACTATTTC TACTTTGCTGTGAATATGATTCTCCGTCGTCATTAGGTATTTTACGATGA CAGATCAAATCTATAACTCCTATAAATCAAACCCCACTAAGATTCATTTA TGATAGTCTATCTACATCATCAAATAATAACAGCTGTCTGATTCTGATTG TCACCCCTACCTAATCCGTCTATTACTTTTGTCTCAGTTTTCACCATACA CAGGCAGGCACACAAAGCTAACTTTGCCCATGTCCAATTGATGATCCGAG AGATGCCCTGTACCGGCATACCCCATGTCCATATTGCTTTCTTCACTTGA AAAAGAGAGGAAAAGAACCGTGTCATCATAGTTGTACCAATAATATTTCT TCTTCCATCATATAAATGTTACATCTAACTATGAATATGCACAACTTCCC TACACAGCTGGTACCAAAAATCCAGCATAAAAATGAATGAGAATTATACT GCAATACCGATCTATACCTTCATCAATTCCTGCAGCAACTCGTGGGGCAT CCTTCTAATTCATTTAATTGTTCTAGTCATACTGGACAATGCTGAACATA TTTGCACAATAGAATATTTGCTCTCGTCAATTTAGCAAAACAAGACAGTT GTAAGCCATTTTGTAGGAATTGATTTATATCTCATATGCTGTTTGATGGC ATCCTTCTGAATATTATTACTCAGTCCCTTCCTTTTCTGTTTAGGTTGCA GTTGTTGTTGCACATGAGTTAGCTCACCAGTGGTTTGGAAATCTTGTGAC TATGGAATGGTGGACGCATCTATGGCTGAATGAGGGTTTTGCAACATGGG TAAGAAAATTATTAACACAACAACATCGAGAAGTTGCATCAATTTATGTT TTTGCTCATTTGATGTTTGTCATTGCAGGTTTCCTACTTGGCTGCAGATT CTTTCTTTCCTGAATGGAACGTTTGGATTCAGTTTCTAGAGGAATCTACA ACAGGTTTCAGGTTGGATGCTCTGGCAGGATCTCATCCAATTGAGGTAAC AATAATTCTATCCCTGTTAGCATGCTATGCTATACCAAGGAGTATACCCA ACATTTTTCTGTAGATCTTTCTACTTTTGTTATGATGGCCAATTGGCTGT CTAATTCTATTTGTCCAGAAAATTAACATGGTGGCTATGTTTATTCCCTA TACTCTTGTTAACTAAAACACATTGGGCAATTATTTACTGTATGGAATCA CCTACCATGTGTCATATAACATGGTGGCTATGTTTTTTTTACTTGTCAGT CTCCATTATAGAGCATAAGCTGTGGAAGTTATTTTTTGTTAGTGTTAGGA AAATTAATGATATAAATGTGAAAGCATTTTTGATGATGCATATCATATGA GTATATGACTACCTTTTCTTGTCGGTAGCTTAATGCACAGAAGAAAACAT TCATGCTGGGTAGTTAGTTGGGGGAGGGGGGTATGTAAGTTTTCACGTCT TCAAATCTCATGCTTACCCAAGAAAAGAATGGAAAATGCCTTCAGAAGTG TAATGCAGTATGCTTGAGATGCTTTTACATGCCTGTAGCATATATCTTAC AAGTCTCCTGCTATGACTGGACAAAAAGGAAAAAGAAATCAACTGCTCAC ATTTCCTGTAATACTTAGGATGAAAGGTTGGTATGTCACATTGAAAGATC GGGGTTTTTGGAAAATCACGTCAATAAATCTTTAGGAGACAACTTCTCAT TTATGCCCTCCCCTAAACTGTTTGACCAGCCGACCCATTGTCAATTCTGA TCCGACATTGACAAGGCTCTGATGCTGCCACGGCTGCAAAGCTTCTTCTT GCTGCCAAGGTCATTGCCACAGTGAGTCCACCTCACATCGAGGAGTGCAG CATGACAGGTCATTGTGTGCCTAGCCATGCTTCAGCATGCACAGCTCCTT GATGCATGCATGCAGGGACTCGACTTGGGAGTGTCCCGCAGCCTCGCTCT CATTTGCCTCCAAAGACAGTGACTGGCCAGCCAGGTGTGTAGTGCAGCAG CAGCATAAGATAAGCATGGAATTCCGTTTAGTGAACTGATGTGCTCCTAC TCTAGCTTCTTGGGAGCTATTTTTTTTTGGGAAAACGCAAAGGATACTTT GCGTTTTATTTCATTGAAAAGGTAGAGTTTGGAACACGCCTCCTAAGAGG TTACAACCTTGTTACAGAAGGAAGCTATTTGCCCCGACTCACAGGTGGTC TTCGGGCTAATACGGGCTCACGTCGCAGAGGGGCGTGTGAGATGGTGCGC TTTGGCAGTGAAATGTACCATTCTGCTCTGCACAACTGGCCTGCTTAGGC TAGGCAGGAGCTGTGATATTCCACTCCATTGCCTCCCTCCTGCGACTTGA AACTTCAGTTAGGGTTTAGTATGGCAAGTCATAGAAGTTACCTACCTTGG TAAGCTATGTGCTTCACACATTTTTTTTGGAGGACTTGAGCCTGGGTGGT ATTGTTCATCTACCAGTTGAGCCAGAGAACTAGGTTCAGTTCCTCACTCC CCACATCTTTAATAGCCCCAACATGTTTCTGATACTTTTTTGAAATGCTG GAGAAAATTTATTTTAGAGTTCTTATAAAGCCTGATCAGATTTTATTGAA GTGATACTGAACTTCTCTTTGTGCCAATTGATTACTTTATACCTTATCTA ACTGTGATGCTATGTGGCTTATTATCTATTATTTCAGGTGGATGTAAATC ATGTTGATGAAATAGATGAGATATTTGATGCTATAAGCTATAGGAAAGGT GCTGCTGTTATTCGGATGTTGCAAAGCTATCTTGGGGCTGAGATCTTCCA GGTTTGTTTTTCTTATTTTCCCCTTTTCTTAGTTTATCAGATTTATCAGG TCATGTGATCCTGGAGGTATGATTACTTTTGGAATTCTACGTACGGCTTG CATTGCATTATCTTTTGCCAGAAGGACATTACTCTGTTATTTTTCTTACT GAATGTGGACAGTTGGGTGAACTAAACGCATTCTTAGCTGTAGTTGTATA AAGTCCCTGGGAACTTAAACTTTGCACATTAGTTTCACATGTGTTCCTTG TTTGCTAGAAATCACTGGCTGCATACATAAAAAAGTATGCATATTCAAAT GCCAAGACAGAGGACTTGTGGGCTGCCCTTGAAGAGGGGTCTGGTGAGCC AGTAAATACGTTAATGCATTCGTGGACAAAGCAGCAAGGTTATCCTGTTG TCAGTGTAAAACTGAAGGATGGGAAGCTAGAGCTGGAGCAGGTTGGCCAT GGAGATCCACAAATCCTTTTCAACTTTACATGTTTTTATCAGAATTCAGA ATCAAATTTATTATCTTGATTGAGGCTTTCTGAGCATCCTTTTGTCTTGT CTCTTGCAGACACAGTTCCTGTCAAGTGGGTCCGAAGGAGTTGGGCAATG GGTGGTTCCCATCACACTATGTTGCTGTTCATACTCGCTTCAACAGAAGT TTCTTTTCCGGGAAAAACAAGAGGATTTCAAGTTGGCAGGGCTTCTAGAA TGTCAAAAGAATGACGACTTCTGGGTTAAACTTAATGTCGACCAGACTGG CTTCTATAGAGTAAGCTATGATGAGGAACTTGCATCCCAACTTAGGCATG CAGTTGGGGCCAATAAACTGAGCGCAGCTGACAGATATGGTAAAACCCTT TCATAGTTGCTCATAACTGTATAAATTCTTCTTCCAAAAAAACTGTAAAG TGTTAACCTGTTCAACTATTTTTACATTATTATTATTTGATATATACAGG TGTACTTGATGACACATATGCCCTCTGTATGGCTGGTAAACAGAAGCTGG TCACGCTGCTGCATTTGATTGCCGCGTACAAGGATGAGACGGAGTATACC GTGCTCGCACTCGCCATCCAAGTACTATTCTTTCTATACTAGTTGAACTC TGTTTCCTAAACATGATTCTGCTCTAAGCATTTTTTTCTCTTGGCTTCAT AGACAAGTCTGAGCATTTTCGAGATGATGGCTGTTGCTGCACCTGGGGAG TTGGGTAATATGAAGAAGTTCCTAATCGACTTTCTTGAGCCATTCACACA GTAAGTTAGTTGCTCTTGCCATTCTGTAGTGGAAATATAGTTTATTATGC AGTCTCTCCTAACCTCGCAGAAACCCTCTGCAGGAGAGTTGGATGGGATG CTAAGAGTGGTGAGGGACACCTGAATGCATTGTTAAGAGGTACACTCTTA ACCGCTCTTGCGGAACTTGGCCATGAGGCTACTATAAATGAAGCCGTCCG TCGGTTTAATGTCTTTCTGGAAGACAGAGAGACACCACTCCTTCCTCCAG ATGTCCGAAAGGTTAGCTCCATAACGTAATGCACATTATGCATAGCTAAC TGTGCAAAACATGTGTAGTCCACTTGTTAACCATCTTATTGTATTGTAGG CTGCATATGTTGCTCTGATGCAGACAGTGAGCAAATCAAACAAAGCTGGC TATGAATCACTCCTGAAGATATACAGGGAAACCGATCTGAGCCAGGAAAA AGTCCGTGTATTAGGTAATTTAATATTTTTATTTCATCAATGACTTTTGT AGGTGGTAGTGAGAGAATTTCGGGACCTGACAAATTTTCTGATCCTTTTC TCTCAAGGTTCTTTGGCATCCTCTCCTGACCCTGATGTTGTTCGTGAAGC ACTGAATTTGGTGCTATCTCCTGAGGTAACAAACAAGAGATAAAAACGTT CTTGACAATACAGTTAACTCTTAACCTAGCTGAACTCTTGATATATTTGC ATGCACAGGTAAGGAATCAAGATTGTATATTCGTGCTCCGTGGAGTGACC GCAGCGGCACATGAGGTTGCATGGGCATGGTTGAAGGTATTCATGGCCAT TTTTGTATTTCCTTTGCGCGTTGCTGCTTCCTTTTTTGCTTCTGTACTGA CCATATTCCTTGCCCATGGTTCAGGAAAACTGGGACTACATCGCAGAGAC CTTCACTGGACACATTCTCACCTATTTCATCTCCGTCACTGTCTCACCTG TACATGTCATAACCTCTTTGCGAGCTTCATACAAGCTGGCACACACACAA CTAAAACTTAAAATGTGCTTACACTGATCTAACATTGTTGATTTGTTTCA GCTCGCCACTGACGAGAAGGGTGATGAGGCAGAGGAGTTTTTCAAGACCA GGACCAAGGCGAGCATCGCGAGGACGGTGAAGCAGAGCATCGAGAGAGTG AGGATTAAGGCCAAATGGGTCGAGAGCACCAAGGGGGAGGCAGATCTCGG TACTGTTCTCAAGGAGCTCGCTCACAAGCATTGAGACGTTAGGTAGTCGG AGCACATCCAGCCCCACTCCTGTGGTGGTGGTTTTCTCGAGCATGTAATA TGTGTACTTCAGAAGAATCTGGTACTAATAAAAGGCGGTTATGAACTTAT GGCTTGTCGCTGAACGTTCTTGAGATAACTAAACACATATTGTCATGTTG GCGATGGAGTAGATCCGTTTGTCGTCTCATGCTGTTTGGTTCTGTGGAAT CAAAGCTGCACGACG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.