Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE008680

[Submit comment/correction]

Sequence	AE008680
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE008680
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGTCCATGGGTAATTTGGTCACTTCACAAGGGTTTCGCACCCTCAAAT AATGTTGGTGAGACGGTAGGCAACAGCCTTCGCGGAGGCTCGGTGTGACC ACAAATCTTTCCGCCCACCTCCCCAAAATTTCAAATCCCCGCCGTCTCCG AGACCTTCCTTTTCATCACCGTTTACCTTTTCCACTCGGGAGTTTGCGAG CAGAGAAGAGAAAGTTTGAAATCCGAAGCCCCGAGCGCTCGGCTACCGGG CGACGCAACGCCGGGGAGGGGCGGCGAAGGTGAGGTTCCCTCTGTCTCGA CCGTCGGTACTAGCCTACCAGATCCACATGAACCCCTCTATTCCTCGCTC GATCGCTCCCGCTCCGTTTCTATTTCCCGGTGTCTGATGATCTTGTCTCC TCTTCGTCTTTGGGTCAGCTTGGCTTGGACGGCGCGGCATTGGGAGGAGT TCCTCGTGGATCACTCGCTGCGGTTCGTAGCAGATTCACCGGAGGCCTCG CAGTAGTGGCGAACTGGAGCTTCACGACTTCCGAGGCGTTGCCGGAGATT CTTAAAACTAGGAACCGATTCCGGATTCCCCTTTCGATTGGCTCGGTTAG TGGCGAACTGGTTTAGGGGTTGGAATTGGATCCTCGCCTGTGCACTCGCT ATTCGATATATTATAGTTTCAACTCGATTGTACGCTTGTTGTGGCAAATA TTTGCCCAGGGCATCTGATTCCGCTGGGTTTGCTCGGTTTCCATCGGTTG CTGTCAGATCCCTGCTTCCTTCATGGATCTCTTTGTTGTAATGCTTTTGT GTTTTGAACATGTGGCTGGCTGCCGCAACTGTTACAATGTGCCAGTATTG CGTTGTCCCAGTATTTCGGCGAGTTAAGTTATTTTACTTTGCGGAAGACA ATCTCTGAATGATGAGACCACGTTTACTCTGGTACTCTGTGATATAGTTG CACCTGCTACGTTCACTAATTTAATACATGTGTTCAGAAGGGGCTGGTCC TAGTATTTCTGATTAGGCTAATTCGACCTTCTAGGTATTGTATTAGTGCC TGCAGTCTGTACTGCATTTCCCACCTAAAATCAGGTTATGATCTTTGTTA TTTTGTAATTTCAGTCACCATCGAAATTAAGACTTGGCAAGAATTTTATT GCAGTTCTGTGTTACTATTCATTTATAAATTCTCTCTCAGGCATGGCTCA TAGCCTGACATGCTGTATTTCCATAAAGGACATGACATCTTTGTTAGATG ATACACCTCCTACTTTTATTTGGTCATATATTTAAGTATCAGTAGTTGTC CTTGATTCTATGCCAACTCTGCAATGCAAGTATGACCTTTTCCTTTTTCC ATAAACAATATGCCACCATTTTTTTTCCTACAACAATGTTTTCTAGGTGA TGCATCTTCGCAAGTATTCTGTTTATACATCTGTGAAGTTTATTTGATCT TAAACGATGCTTTAACATTGGCAGAACTTTCTCTAATACACTTATTCTCT TTTTTTTCAGCTTCAGTTTAAGTTAATTTGGTATATTATCATTCCAGAAA CTGTAGCAATGGAAATCGAGCTGCCGAACATCCAGAAAGTGAGTAGCAAT TCCTGTGCTAAATTGTAGGATGTGCCTACTGCTTCAGTTTCAGCTTTCTT TCATAGTAGTATTTAACAACTCATGCACTATGATGTGTCTAGGCTGCATC AAGTGATTACTGGAGTTTGGCCAGCAACCAGTATCCATCTGGTAAGTTTC CTAAGGTCTCAATTGGCATCCCAATTTCAAGGGCAGGTTCTGTATCAAGA GGCAGAGATGCTGCTACTGCCCCTGCATTCGAGAGGAACTTGTCCCAGGG AACTGATGGAAGATCTAGACCCCCTAAAGGGTGTAATGCCTCACTCCGAG TCTCACAAGAAGCTGCAAACCATGGTGGATCTGCTACAGAGGCACCCGAA GCCGTCCCTGTTAATCTTTCTCTATCACAACCTGATGATCATGCACGTGA GAAGCCAGGAACCTTTTCCTTTGGAACAAGAAAAGAAAAAGGCAGCCAGC TTGACCAACTAGAAAAGACACCCTTTGAGAGTTCACAAGGAAAGCGTATA GTGGATTATGCAGATAAAACCAAACCCAACAGCGAAGTGCTCAGGATGAA GCTGTGGGAGATCCTTGGCGGTACTGCACAAACCAAGCAGGCTGTTGCTT CACCAAACCCTGAAGACATTGAGACACCTGACCAACCTAAAAGACAAACT GCCAATGGCCCATCTCCAGGGAACAAGAAGGTTTACACATCACCTCTTCC TGATAATATCAAGACACCCGATCTGCTGAAATGTCAAACAGCTAGCTATA CGAAGAGTAAACCATCCTCTGATCCAATTGAGTCAGATTCTGATACTCCA CAAGTAGTTGAAATAAGGCCTGTTACTCGCACCTTGGGACGCAAGAAAGC ACCAGCAGCCTCCAAGCAGCAGGATAAGAGCCAGAGTGCAAAGAAACCAT TATCTACTTCACGTTCTGCACCCAAGCAAAAAACACTGGACAATGTGTTT GCTTTCAATGAGAAATGCACACCCAAAACAGTGGGGAAATCTGCAAATGG TAACTCTGCCTGCTTGAGAAATCTCAGAAGCTCTAATAGGAAAGCTAAAG TAGAGCTTAAGAAGATCCATTGCTCTGACAGGATTTCCGACAAGACCACA CAAGATGATGATATGGAAGGGCAGCTACGTACTAGAAATGCACCATCAGA GAATAAGGGAGAGAAAACCGCCTCCTATTCTTCTTTGTCACGAACTGGAA AAACTGCCGAGAGCCGTTCTAGAAGCCCTACAAGGGAGAAACCATTGAAG GGAATGGCTAAAGTTGGGCCAAGGAAGATGCAGTTTTCAGAGAAGTTGTT AGCCACGACACTGAAGGAGGGTGAGGATAAGGTCTCTTCTCAGAATATTT CACCAAAGAGCAAGGAAAATTATTATTCATCACTGCACCAGAAGGAGAAT GCTAATTTCAACAAAGCCTCAGACAGAAGTCCTCAGGCACATACATCAGC TGGAAATAATTTTAACTCGCCACTGTATGGTGCTGCTAGTCCATCACCTG AACCAAAAAAGTACCCATGGGATCACGAGGAAAGTCCCCAGATAAATGGT AAACTTGGAGAGAAGTTTGACAGTCCATTGGCAGACAGATTCAGAGACAT GCAGGATGATTTTGTAAGTCCTACTTTTGCAAATAATGTAAATGGTTACC ACCAAAGAAGTAAAATGCTAGACGATGACACATACAGTCCCAAAAATCCA AGAAGTGTGAACATGTCAAGATCAAGTTCCTATGCTTCTGATCCAGGGTC TGAGCCATTGGTAAGTTTCAAACCTCTCTGTAACAGATTAACATAGTAAC TCTATCTGCTTGTCACTCATTAATGAATTACTGATTTCCAGGATGAAATG GATAAAACTGATGAGCTACCTAGCTGTGAATCTCCTAATTCTCCAAAAGA TAGAGATAACAAACAAAAGCCATACACTTCACCCATTTCACCAGATGAAG ATAAAGGAGCTCAAATTTCTATTCCAAGCTTTCGGAAAGGTCTGAATACA ACATTGCAGTATTCCATACACTTTATACTGTTCCTTTTGGATTTAGTGCT ACATTTATAGAATCAAAGTTGTCTGTTTCTTTTCAGAGTGCTACTCCTCC TGTTCCGCACTAGGGCAATACTCTTTTAGAACACATCCTTCTCCATGTAT ACATACATAAATTGAACGGTTTCTCTATGTATCGATTACCAGTTAAATAT TGGCAGAGCTCCTGTCCTTTCCCTGAAAAAAAAGTTAAACATTAGGAGTC AGAGCTTCAAATAGTTCTACTATGCATCAGCTGTATTTGAAATGAATTTT CATAGCATCAGTGTCAAAGCCTCCAATAGTCTTACTGTGGCTTTAGGGTT AAGGCTCTCCAAACATAATGTAGTGACTTGCTGGTATGCTAACTACCTAC ACTTACTCTTTTTATATGTATGAATTATCTGCTCATGAAAGCCGTTCAGA TGGAACACAAGCAACATGTGGCATCTTTTGTCATGTGAATGCATGCTACT TCAAATGTGTTTCGTTAGTATCATTTGCTAATTTCTTTTGTTTAGTTATC TGACCACTTTTGTTCTAGAAAACAAGTAGCATGAGCTAAGCTCTTCCCAT TACATGTTGTTTTGAGATGTGTAAAACGGTACGTCATGTATCCAGAAATT TGCGTTGTGGTATTGATTTCATTGGTTCTTTGTCTGCAGGATATAAATCT CGCAAATGGCTTTCAGACATAGACAGCCCTGATAAATCTCATGTAAATCT GGATAGGAAGTCACATCTAAAAGAGGGTAAAAGAGGCAAAAAGCGCTTAC CTTCGCCTATTCCTTTTGCCACTTCTGGTAAAGTTGTTTACCTTCTTGCG TGAATTTAAAGGTTGCAGTTCATCACTAATATGTCCTTACAAAAAAAATG TTCTTACTATTCAGGAACACAAGAAACTACAATGTCCGACAAAGAACCAG CAGAATCCCCAGATAACTACCTAACCAGGTCCGTCTTTGGTTTTATTAAT AAATACATAGCTGATATTGTTTGTTGGTCTAATTTAATTTCTCGATTGCA ACCAGGGCTTTTGATCAGTTGCTGGTGGTGCTGGGAAGGTTCCAAACCAA GATCAAGTTTGAGACAAGCAATAAAAGTAATGAGATACTGGCATCTACTG GAGAGATAATAAGCCGGCACCTCAAGGGGGTTGAGGTGCAGATGCAGGAT GATTTGTAAGATTTTGCCAATGTTACTAAGAAACTACTCCCTCTGTTCAG AAATATAAGACGTTTTAGCTTTGTGAAATGAATGTATCTAGACGCTTTTT AGTTATAGGTTCACTCTGAACCTCTACGAACCTATACACTAAAAGACATC TAGATACATTCGATTCACAAAGCTAAAACGTCTTATATTTCTGAACGGAG GGAGTACATATATTCGCTTATGCACCGAATTGTATATCGGCTTGTTACAG ATGTATCACATGTACTAGAGCTGCAAGTTTATTTGATGCATGATATTTAA CTCTGCTTTCAGGGATAAGCTGGTAAACGCAGGGAAATCTAAAAGAAAGC GACTAGAATCAACATTTGAAGGTACGACTTATGTTATTTAATGCAGACAT TAGTTTTGGGGTATGTTACTGTGAATCGTGGTCTTATGAAAATGGACACG CTAGTCAAAATCCTTCAGAAAGCAGTTGATCTGTACAGATGGGATGTACA AGCGTTTTGATCCATTGGGCCACTCATACAGTCATACTTGACCTATTTGG ATTATTCAGCTCAAGCAATTTGCAGAATCTTATACTTCAACATAGAATTG TAAAATGTTTGGAATATAGAGAAGTCAAGTTAAGTAGTAGAGATAACCAC GCAGAAATACAAGTTATGATCTGATTCCAGCATGTTATGTTGGTCCTACA TATCGTAAGATTTAAAAGAGCATAATAAGCTGAATGTCGGATGCATGTGA AAGACCCAACAAATCTAAGGTTTAATAGGTTGAACAATGTCGGATATTAA AAATTATGATTTTTGAATCTCTTAAACCATCTTAACACTGAAGCATAAAT TAGTTCCATGAAATATTAGTTTGAGAAAATCTAATGTACTCTACCATTTT ATAATCTGCTCGCAGTTATCCAATATGCTTGATTCTTTCTTATTCATTAT CTGTCACTCTTTGAACTTTTTAATGTACATGCATACATAGAGGCTTGAGG CCTGTTTGGTTGGTACACTAACCATGCCGCACTTGTGGCAAGATTCCTTT GTGAATCCTTATACTTTACCTGTTTTCCTGCATGTTTGATGCTGTTTCTC CTGAATCATGTTAGCTACTCAAATGATATAATATTATCTGGCTCTCTATA TCTTCTGATTTCAGAGCAACAAGAACAGCTAAGGGTTCTTCATGAGAAGT TCAAGGAAGAGGTAAATCAGCAGTTGCTTGGTTGCAAGAATTCTCTTGAG GATTTTGAAGCCTATCACACAGAACTTAAGGGAGTGGCTGACAAGCAAAG TAAGTTTAAGTTCAAACCTTACATTTGAGCAATGTAAAGAAACATTTACT TGCTGGACTATTTATTGCAAATGGATATTGCACCAACATCCAAAACTGTG CAATCATGTTAATCTTTGTCAACACAGAACCATGAACTATCACCGTCGGA GCACTCTGCTTATAGATTGAGAACTCTATGTCACATAACCATGAACTATC ACCGTCCGGAAAAGAATGTCGCAGATTTATCTAGATTCGCATGTACCTAG ACGCGCTTTAGTGTATAGATACATGCAAATCTAGACAAATCTGCGGCATC CTTTTCCGGACAGAGGGAATATATGATTCGAAGCTTGAAGTTTCTTTCTA TATACTCCCTCCATATCATAGATAAGTGACGTTTTGGACACTGACATGGT CTTTATGTTGTAAACTTTGACCACTAATTTCTAATATAATATATGTGCAC AGAAACCAAGAAAAATATAAGACTCAAGAAATAAATTTTGAGACAAGTAT GATTTTCAAAATTTCAATCTGAATAATTAAAAAGATAAATGTAGTCAAAG TTTCAAATGTTTGACCACTGAAGGCATGTCCAGAACATCACTTATTTGTG ATATGAAGTAATATGGTTAAATCACATGTTTTTAGTTTACTGCCAATCTG CATTGTCACATGATCACAAGAAACATTCACTGGTGTGGTAATTATTGTTT TAACCCATTGCTAAGAGGTGAACAGAATGATTCATCATACAGCCACGTCA AGGAATCTATTTAAGTGCTCCATTTTTGTAACCGTTGGCCACCTAAATTA CCACTGAACCATGGTGCTCTTTTATGATTGCATCAAACAGAAGCGTCACA CAAAAAGCTCCTCCAACATGCTGAGAAAACAGTCGGTTCTCAGCTCAACG ACGCTGAAATCAAAATCGCGGGGGTTCAGAAGGTAAGACGACAACCATCC CTAAACCCCAGGGATCCCGTATCAATCAGATGGCCACCTTATCATGAAAA AAATGTTTTGCAGAGAGCCCGGAAGAAGATGAACGGCTTAAAATACGTAC TCAGGGAGCTTATCATGGAAACTGCAGATTGATCAAGTTCACCTGCTTTA CATAGCTAAGGCAAAATGAGTAGAGTGCCACATCACAATCAAGTCTATGG CTCCATTTTACAAAGGGTATAGGAGGATGGTGCCAGAATGCATATAAGGT TCCTTTTCTTACAATTACAAGTTGAACTCTGTCAAGACTGTTACGGTAGC ATTTGTGTCAGTGGTTCACTAAGTTACCATCCCGGGAACTTGCCACCATA GTGTCTTAAGAACAAAGCAATCCTCATTTATCTGTTCCCTGCTGTTGTTC GTTCTTTCAGCACTTGCTGAGTTGGGACTGCAGTGTTTTCTCGAGTAATG TAATGATTCATTGTGAAATTGCAAATGCTTAGGTTGGATTTGCTGTCATG TGAACGTAATGGATGAAAAATCAAATGGACTCGTTTCTTTTTGCCATTTC TTTTATTCCTGCTCATGTATACAATATTGTCTGGATCAGACAATGTTCAC CATTATTTCAGATGTATGTCTACACAAATGGTTATGCCGTAGTACATCAA AATGGGAACTAACCATGTCCTCTGTACAAAACAGAGATAATACAGATCTA CAGATTATTGTATGTACTCCCTCCATCCCAAAATAAGTGACTTGAGTTTG TCTAGATTCGCATATATCTAGACATGTTTTAGTATATAGATACATACGAA TTTAGACAAACTCAAGTCATTTATTTTGGGACGGAGGGAGTATATTTCAT GTTGCTAATCTAAATAAAAAAGATCAGTTAACGAGATGCTTATTGTAGCC ATCCTGCACCTCAATGACCTGTGAGATCAGGACATATGATGTCCTATGGT GGAAGACAAAAAAAATGATACTAGTGATCATGCTATACACCACCGTACTT TTCCCATTAGACCGTACAGACTTTTGCTGTCAAGATCAATGGAAGTCAGG TTGACCTGTCGAAGTCAAGCACCTGTGCCACATCCTGCTGTTTGGATCGA CAAGCCTTGGCGTTTTGATGACTTCTGGTATTGGCAAGTACACATTATGT GTGTTGCATACTCCGGTTGTGATGCCGCTGAACCCTGCAAAGGCACCATG AACCTGCAAGGTTCCATCAGGGACTAATGTTCAGAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.