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GrainGenes Sequence Report: AE004005

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Sequence
AE004005
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE004005
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ACTTAAACTCCCCCATAATAACGAACGAATCGCCCTCTCCGGTTTAATCC
AACGCATCCAAAGCATTCATTCATTAACCCGCACGCGAAAAGGAAGTGTG
GTCAGGCCAGGAGAGAGAGAGAGGAAGAGGGAGACCAGCCCGTCCAGCCA
GCCAGCCGGGTCCATTCAGGCGGCGGCGCACACAGAGCAAGCAGGAGGAA
GAAGAAGCGGGGATCAGCGAGCGCGGCGTCCGGACCCCCTCACTCCCCGC
CCCGCCCCGCCGCCGCGGCGCCACAGCCCAGGTGAGCCGGCTCGACGGGT
TCCCCTTCCCCTAATTTTATCCGCGGATCCTTTTTCCTTCGGCCGTTTCT
CCGCCCAGCTTGCGCTGTCATCTCTGTCCGCGAAGTGTCCAATCTCCGGT
GACCTCTGCGCGCCGCGAATTGCTTTTCGGTTTGCGCGGGGTTTCGAGCG
GTCAAACGCTCCAATTCCGGTCGAGTGCCCCGGCGAGCCCGAGGTCAAAC
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TCGATGTCGCCACTCAGATTCCGCCATACGCTCCTGGCGATTGATTGATG
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GTGGGTGACAGGTTCAGTCCAGTTGAATCTAGGCAATTCAAGGTTTACTT
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TGCCATGAAATGTAGACAAGTTGTGTTGTTCAATTGTTGTCCTCTCACCT
TTCATCCCATACATATTTTTTCGGGGGATATCAGCTGTGAGCGTGTGAAA
TATATACTCCCTCCGACTCAAATTAATTGACTTGGATTTGCCTACATTCG
GATGTATCTAGCACTAAAACATGTCTAGATACATCCGAATCTAGACAAAT
CCAAATCAATTAATTTGGGTCGGAGGGAGTAGAATGAAAGATAGCCGAAC
ATCCAGTTATCTAAAAGAAGATAAACCCAATGGGATTATAAGTGCTTCCG
TGATATAGTTCTTACATCCTGATGCTGTATGGCTGGATGCGTGTTCTTGG
TCACACTAATGAAACAAGTATCTCCTTTCTTGGATGAGTAACAGGCATTT
AGGATGGTGAGCAAGAACGATGAGTCTGAAGGGCTCAAATTCAGCACGTC
GCACCTGGTGCAGACAACCGAGGAGGTTGCAAAAGCATTTATTGCTGCTG
CTTCAGCTGCCACTGTGCAGTCGACGCGGCCATCTGTGGTCTATTCGTCT
GGAGAAGAGAGTGGCAGCCCAATGCGGAAGCTGCAGCAGCAATTCTCGAA
AATTATGAAAGGGTTTTCTAATTCACCTGAAGTGTCTGGAACGTACAATC
CAGAGATTCTCACTACACACAAGCGGCAGTGGTCGAGGTTCCAGCTCAAG
TCATTGGTATGTCTGTCTCTACCTATGCTGAATTCGTGTCTATCTATTGT
GCTATACTTGGTGTAGAAATGTGGGGTATACTCTGCTGATTAACTAAGGT
TCTTAGCCAGAGCTATAACATTAAGTTATGATATGGCATCTGGTTTTTTA
AACTAATAGGTCCGTTCCTTGATATAAGGTGTATAGTTTTCTGTGAAAGT
TTTCGTAATATAAGGTGTATTGTTGAGTTGGACAAATTTACCCCTCCTTG
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GAATTAGCTAGTTGCACGTACGTGAGTAGGAAACAGAATTAGTATCTTCT
ACGTCTTCTTTTTTCCTTTTGATTTGTGGCTGCAGTACGTGAGGAAACAG
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TGTGGTCGAGCGGATGGATATGGATCGGGAGAGTCAATCACAGAGAAAAT
TATGGGATTGGTTATGCTAATTTAGGAGGTAATCTGATCGGGAGAGAGGA
TGCCCAGATTTTCCTATTTCCCCTCTACTCTCACGTCAATCACCAGGGGT
ATTAATGTCTCAAAGCAACATAATTTGCCCTCCCAGCCTGTGCGCTAAAA
TTCGTGCAAGAGAACTATACACCTTATATCAAGGGACGGAGGGAGTAATA
ACCTTGTATTGCTGTTTATAGTGACTAAAAGTATCTTCATTTGCAGCTAT
CATCCAACCAGAATACTTATGTAGTTGGCATAGAGTATTTGATAAATTGA
TTAAAATTGTTCTATCCAGTCTCTACAATCATGTAGTATGCCTGTGAGGG
TACAATATCAGAGACAGTTACATGTCTGGGACCACTGGAGTCTTATCACT
ATATTTTCTAAATTTGACACTTCAATTTCTTCAGGAGTGATTGATCAGTT
ATTTTTAAGTTACTTAGAACTGATTATGTATAATTCGTGGTGCTTGGGTC
TGAGTAAACCTCGAATTGGATCAGAGTCCAAGTCCAAATTCTATGTGCCC
AACTAACGTCCACTCTACCGTGAATGGAATCCATATCCATGTCCATCCAA
TCCAAGTAGCTATAACAACTGGTTTTCCAAGGTCCAATTGGACCTTAATC
ATTAGGACCTTAATCATTAGTTCATTAATGGGCACATTGAGATCAAAGAG
GAACCTAGCAGTACAGGGAACCAATGAGCGGTGTAACCTAGCTGGACGGT
CGATCGTAGCAGAGCAGGGCGTTGCCTTCATGCGTCCGCGCCGAAAGTCC
GCGAGACAAGGAGCCGGTGTCGGCAGACAAAGGGGAGGTTGAGGCGCTCC
TTGTAGCCAGGCAGGATGTGAGACTAGATTAGCCCGGAAGCTACGAGGGA
TGATGCGCAGCGGCGGACTGGAGCAGGACAAGCTAGTGCATGTGGCCGCG
GCAAGCGTCAGTGGTGAGCTTCTGCCGGATGCTTGCGGCAGCAGCACCAG
ACAAGGTGCCGGTGGCCAACATGTGCCACGACGAGCTGCTGGCGTATGCA
TGCAGTAGTGGTGCCAACAAGGTGCCGGCGGTCAACGTGTGACATGGCAG
GGATGCATGCGGCAGCAGTGCTAGACGGGGAGCAAGCAGTCAACACCGTG
CTGTGGCGATCCAAGCTAAAAAGTGAGGCAGCGCATGTGTCCAGTGGATA
TTCGGCTGTCCTTTTGAGGTCCAAGGTGTATCGAGCATTGTTGGATCTTT
TGTCCTGTTGTTGTCCATGTCCACTAAAGTCCAATCCAATAGGGTCCAAC
GAACTTTAGGTCCAAAGTTCATGGACTATAGAAATTCAATTCCAGAGTTA
GGTCTGAGGTTTACACCAGTTGACTAATGAGTTGTGAGAGCTATTCTGCT
GTTGATATACTCCTTTATTCATCTACTGAAGTGGTTTCATATTTTTATAC
TAAGTAGAGTTACAGATGCTTAGTACCTTCTCTAGACAAAAGGTAAAGTA
TCTATTTACGCTTCACACACAAAATTTGTTTGTTCAGGATTCTTCTTGAT
TATCCGATCTAAGTGCAATAGATAGGTATGCACTGTAAGTGCTTGCTAAT
ATAACTCCTCCTTTTGAAACTGGCAGTGCTGGTAACTTGTCGCAAATGTT
GAGAGCATGGTACCTTTTTTTTTGGAACAGGGCAACCGGTGCATTGAAGA
ACCATCACATATTTTTGAGAGCATAGTGATTGTGGGGCTTCCTCCTCAGG
CAGATATCCATGAGTTAGAAAACATTGCTCTAGGGAGAAATGATGACGAA
GCAAAGAAATCAAGAAATATATTTAGCAATAACCAGCACCAAGTTCATGC
TGTATCAAATTTGGAACCTCAGGTTATCACTCACCGCATCCATTGTTTCA
TGTTATTTACTATGATGAGTAATAACCCTGACATATGCTTTTTTTAAATT
TAAAAAAGAAGTTCATATTGCTGCCTTCCTTCATGCTTCTGAACTCCCAT
TTTTTCTCCCCTTGTTTTTTTCCAGAATAAAACTTTTGCTATTTATTTTC
TTGTCCTTAGGTCCTTTTTACATACCCTCCTGAGAGGTCTCTTCCACTGA
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CACATTCGAACTATATAAACACTGATACTTAGTATTTCTGTATAGCAATA
TTTTGTAACAATTATACATTTGACTTAATTTTTTACTAATTATTGTGGAT
ACTGTTATGATGGTTCGGTTCAGATCATAATACTGTAAATTGCTAGTCGG
GTTACATCCAATTATAAGACAAGGACAAAGTATGTAGCACACATGTGTAG
GAGACACAGGGGGGGGGGGGGAGTGGAAAAGAAGACAAATATGAGAATGT
AAAAATGTTAGTTGGCATAACATGTCGCCCTATGCTGAGTCAGCAGCCTA
GTTGTCTCTACACCCACCACATATGCAATATTGTCCCCAAAATCTCCTCG
GGGATTCCATTAGATGGTTTGAAGGCCCAAAATCTCTCTATGGGCTATGG
TCCAGTCGGCCATTTAGACTATTCCTGAAATATGACATGTCAGCAGTGGA
AAGTAAACCATACAATCAGAACAAGCAGTACCTCGAAATTCAATAACATT
AGTGAAACTAGAACTAGCCATTAAGGCATAACAGGAGTCCGGTGGTTATC
ATATGCTATGGCTTTTAAGTTTCAGTATGGTCATTCCCCCACCAACCCAC
ACAGTTCTTATTTTGGTAGGCTCTGTTACAATGTTTCGATCTTGCTTCTT
GCGCACTTCAGCGCTCTCCTACAAAAATTATCGAAAATCTCAGTGACATA
TAATTTAGTTTCTGTTGGGGGCAACACTGTAACTTCAAATTTTGTGGCCT
GAGTATGGTCCCTAGATTCCATGACTCAAATTAGGTTCATGCTGTCAATG
TTTCTTCATTGTGCGCTAAGCCTTTTGAGGTCATATAATCACTTCTCACC
AAATAATTTAGCTATATTTACATTTGTATTAGGTTAATGCTGTTGAACGG
ACTCCTTCATTCAGTGAGCTGAACGAAATTCTCCTAGGGCAGGTGACTGT
TCTCCACTTGGCTCGTGCTTTATTCTTCCTTCACTGAGTTTATACCTATT
TACTCGACAAGTCTCACGGTTACTCCTGAAACCACATTGTGAACTATACA
CAAGATTTACAGCTTGTCACAGAGTACATGTTTTATTTTTGTAATTCTAC
TCATAAGCAAGCTTAATCTAGTCTATTCAAGGTTTTTGCTGTGAATCTTA
TGCTTTTTATGTTGCATATTCAGGAACAGCTCAAGGAAAGCAATCAATCA
TTCGTGTTCCGTTTACAGGTATATTTATATCTTTCTCCTTTATACCTATT
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TACACTATATGGATGCTGTGTATTGGTTGAAGAGATTGTACAGAGACCAT
CAAAGCTAGTTTCGATGCTCGTGAATGAAAAGCCTGTATTTCCACGCCGG
AGTCGTTATGTAGTAACCACACCCCGGTGTTATTGCATCCTGTCTAGGCT
GCCATTCTTTGACCTACATTTTGGGGTGCTGCAGAGGTAGTGTATAGTGC
TCACCATCGTCTCATGTTATCTTATTGGTTCTTAATATCTGAAATATCTT
TTCAGTTCAAGTCTCTTTGTCAAATTTTGTGGGATGGTATAAATGGAAAC
CTACGTAATTTGTAAAGCACTTATTAATTCTGCTTTTATGCAAAATAAAT
CATTTGCAATTTATTCATTTCACGTGCTTTTTGTTTATTTCTTATATCTG
AGAGCTTTATGTTTCATTCATGATCTTTACACGTTCATTTTCTTCTCTTT
GTTATACTAGTATAGTTTTGTCCCTGCAACTACTACATCTGCTTCGGATG
TTGCACAGTACTTTCTAGTCTTCTAGTTACAATATATAAATTTTGCATTC
GTGGATGTGCTTTGCATTTATATGAATTGTCTTTTGTAGTTATTCTCTCC
ATGTGATTCTCAATTCAAAGTTCTTCGAGGTCTTACTTTTGTAAGGCACT
CATGTGAAGTTTTTGTTTTACTGTCTTATAAGAGTATTAAGGTTACGTCC
AGAAGCCTGCATGATTGGTTTGATTTGTCTTAGCCTCTTAGATCTTTGTC
AAACATTCCTGTGTGTGTGTCTTGTTGATGCTATCACACTCAATATTAAT
GATCCACCCTTTTCATCTGCCTCCCGTAAGTCTCTGCTATGTTTCTTATG
CAGTATTCTTATGGAAGAACGACTTGAATGGCTCACGGATGGTGTTAGCA
TGCTAAATTCATTATCACCTGATGAAACCTTTGAGGATGATAATAATTGT
GAAGGCACTGAAATTGTAGGACAGAAACTGTATTTTGATGGTACAGTAGT
AGAGATATCCTCCGAACCAAATATGGATGTTTCCCCGAAGCAGCTGTCCG
ACTCGGATAGCAGTTCTAGGTGTAGGGAGAACCAACTGGACTTCATCTCC
CAAGAAGGCCAACAGGAAAGCGGTTCTCCTGTCAAAGAACAGAGTAATCT
TGCAACAGGAACAGCTACTCAGTGTGATACTGCAGAAGAGCCTGACAATT
GTGTCTTAGATGATACAACGACGGATATATCTGGAGTTAAGACCCATGAA
CCGGATTGTATACTGGTTGCTCTGAGTCAATCCGACGCCGAGAAAAATTG
GGATTTTTCACATGAAAATGTGTATGATGGAGAACTCGATATCTTTGTCA
ATGATACTATTTTGCCGCTTATACGGTCACGCCTTAGTGAAGGTTCTGAA
TCGCCTCCAAGGTATGGTTATGATACTTAGATTCTAGCAAGCCTGGTATT
TTCCTCATCGCACTTGAAAAAACCTTACATTTGCTAGGTAGATTCTGTTA
GTTTGTTCCCTTCTCATTATTGCAACAATCAGCCTAGTCTTAACCCCGAA
TGTTGTACTAACACTTAACATATAGCCAGATACAAATGAATTATGCAATC
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TTGTTTTCATACTTCATTTTACGTGAGCATCAGCCCCTTAATAGATTCAT
AAGAGGCTCTCAATTCCAATACCATCACCTCAGATCCTCTTGTTATGTCT
GTTATTATTAACTGTTGACACAGTGTGACTGTGAAGTACGACTTAAACTT
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GAGGTAACCACCTTTGTCTGCAGTTCCCAAGGTTCTCCTTCTGAAAGCAT
AACTTTGAGAAATGATAACCATGATGTGGATTTGGAGGAGCCATCTTCTA
TCGGTCATGGAGACGTAGTTGGGCACAACAGTATATTGCAATGGGCCAAG
GTTCTGTATGCATGAAAAATTATTAATTCTCTTGCTCAGCTTCTCTTTTT
GTGGATTTGTTGTGTGACCTGATGTTTCCTCCAGTCAAAAAAATATGGAT
CTTTGCAAGTCGTCTGCCAGTACTACCAGTTGCAGTGTCCGGCCAGGGGT
TCATCACTTAATTTTCATCCATTGGAGCACTTGCATTCTTTGAAGTTTCA
CCGGCCAGGTGAAACCGCTCTTCATCTTGCTGGGTCGACTATTGATCTTC
GGTCGCGTGATACAAGCTTAGAGGTGGCTGAGGTAATTCATCCGATACAT
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TGACATATCTATTTCTATTTCAGATGCGTAATGCACTCTTTGCGGAGGAG
GAATCGACGGCTTTATCCACATGGGCTGTTGCATCCTTATGTGGATGCCT
CAGGTTGGAACATGTAAGTATCCTTGACTTAGGGCGTGTTTTGTTTTTAG
CCCAAATGCGTTGCCAAAATTTTGTCCAGGTTGTGCTTGCCCATGAGTTG
CCCAGTATTGGCAAATGGTAAGTACAATGAACTAGAGCGGGCAAAGGAGT
ATTGGCATGGCAAAATAGTTTGGGCCAACCTGGGGGGGCAAATGGGCTTA
TTTCATACAATTTCTTCAGGAAATGTTCATGGGCTGGGGGGGTGCCCCCC
CCCCCCCCCCCTGGCTTGGCTGTAGCTCCGCCCGTGCTACTGATCCTTCT
ACCAATCTAGTTGCTTGAAACTGTCGTTGGAAACACACATCAAAACGTGT
ATAATACGAAAGCCCCCCTGCCCCCCTGTCAAGAATTTAATTTCTTCTCC
CTCCTGTCCAAAATAAAAGGCATATAAATTTAGTCAAAAGTCAACCTTGT
CTAAGTTTGACCAAGTTAATAAAAAAAATGTAAATTTAGTATAAAAATAT
TATGTCCTTAAATTGCCTGTGATCAACACTTACCTGTAATTATAAACTTT
GAATTGATTTGTTGGCAGGTAATGACACTTTTTGCTGCAGCGCTCCTGGA
GAAACAGATTGTTATTGTCTGTTCTAATTTGGTATTAATCCGAGTCTCAC
AATGTTCTGGCCTTCTTAATTTTATTGTATTTATATTACACACCAGTTAG
TATTTATCTGTGACTTAGCTAAGCATATTCTGTTACAACAATAGAAAAAT
CATATCATATGTATTTATTATTTAATAAAGAACATTAAGAATACTGCAGT
ATGTTCTGTTTAATTGTGTGTGCATTAGCTACAGCAAACATGTAACTTGC
AAGTAACTTATGTATTCATTGTGTTACTGCAAGTAACATTCAGTAGACTA
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ACGAAATATATTCAAGCTTACCTCCTGTGATCTCTCCATCATTGGATCCA
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TTGTAAGTTCCTGAGCTGAATTGGCACTTCTTTGTTTTGATAAGAGTAGA
GAGAACCCTGTCGACAAATAGTAGTGATATTTTTTTAACCTATTGGCTGA
TGGATGGGAGGTGATCTGTATATATTTGACCATCTGATTGTGATTTGACA
TGTCACCATCAGTTTTAATTGAGTTCATTTGAACATTCGATTCACAACTC
ACACAAATGTCATGTTTAGGTTGGTGTACAGAACAAAACATCTGATCTGC
AATCCAGGCTAGCAAATGCTGTGATCATTGATGCGAACAAGAATCAGGTG
CCTGCAAAGTGTATTTCTTTCTATTTACCTGTGGTGTCCTGTTACTTTCT
GGAGATAAATCGTGTTCACAGTAGTGTTAGTGTTAGCTCTGTTTGGTTCC
TAGCCTTTTACAAATCTTGCTGATTTTAGACTTGCGCATCATCAGATTCG
CTTGCAGTATCATTTTTAAAACATCCAATGCTTTAGTATGATGGGTTCAT
AAATGATTTGAATACTGCAACAAGCTATTACTGATGAATGGATTCATTGT
GGATGTAGATTAAATCTGCTTCAGTCCCGCAACTTCCTCAACAGAGAGAA
TTGCTTTCTGCCTTGCGTCCGTATCATTCAAGACTTGTGGGCGAAAGTTA
TCTCGCAAGAAAACGCCCGGTCTATGAATGCACAGATGCCCAGGTTTGTT
ATGTTTTGCCTATATTTTATGTTGAATTATTGAAGTTTCAAGAATACATT
TTGCTATTGCTCAAATAGTTGTGTTTTGCTTCATAGTTTTCTTACTTCTC
TGGGTTATTGCACAAAATTATTGTTTTCGCATGGTATTTACAATTTACAA
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ATACTCACTGTTCATTGGGATCCCTCACTTTCTGTATCCTGTGAACTTCC
AGTTTAGTTCAAGGCCTTGACATGGTTCTGAACTTCTGAGCATACAGGTT
GAAGCGGCCAAAGGTTTCCTTGCAGAACTTAGATCCTATCTTGATTCTCT
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ACAAGGTACGTGATTATCAAAATGCATGATCGTGATATTCTTTTGTTCCG
TTTTTTTGTTGGACAGTATGTCGTGTCGTCAAGTGTTAAGTAGGATTCTA
TCAGCAGCTTTGTGCAAGTGTAGCATACTCGTTGCTTATTCAATTTGCTC
TTTCACATAAAATAACTACGAGTCTATGACTACTACTCTCTCCGTTCCAA
AATAAGTGTCGTGGTTTTAGTTCAAATTTGAACTAAAACCACGACACTTT
GAATTAAAACCACGACACTTATTTTTGGAACGGAGGGAGTAGGTTCTAGC
TGTAGCCATGTGTACAATATTGATTGCTAACGTGAGTCTATAGCTTTGAA
CTTCTGAATTACTGACTGGTTTTGCTGTGTTCACACAGGTTTCATTAATT
TTAAGAGAGAGCTTCATCGGTTCTTTCCCGACCCGGGATAGGCCCTTTAT
GAAGGTATTAAATTGTGACATTCCCATTTTTCATTGTCTTCTAGCTTGGC
TGAGTTGGTATATCTTATTCAGGAATCCATTTGCCACCTTACATATGATA
TGCTTATGCATGTTCAAGTGAATCATATACTAACATTTCATTTCGTTTTT
GTTGACAGCTGTTTCTAGACACACAACTGTTCTCGGTACATACAGACCTA
GTCCTCTCCTTTTATCAGAAGGACTGAGTCTCTCTTAACGACCTGACTGT
CGTCAGAGACATGATTTTTCCAAGGTGCAAAACTGAACTTTGTTCTTTCT
ATTATATACTACCTCCGTTCCATAATATAAGCCTTTTTAGAAAGCTGTTT
TAGCTTGCCAAAAAGGCTTATATTGTGGAACGGAGGTAGTAGATGATTGT
GTATCACTTGTTTGCCTGCTTGCAAATAATAGTTATATGCACTTGCAGCT
ACAAACTTAGTACAAACAGTTGGCATGTGGCCTTTAGCCCTTATTAGGTA
CAGAAACCATAGCTTTATTAGGTTTGTAACTTTGGCCATAGACCTTTGAT
CTACCACAAAAACACAAATCCTATGTTGTCAATCAGGTGACAGAAAATTC
CCTGTAGTAGCATTGCTTATCAGCTTTATTGCTTTTCTGAGTCTGTAGTC
AACTGTCTTTTACCAGCTTTAAAGGTTGAAGAGTACTGCAGGGAGGATTT
AGCCAAAATATGTTGTCTCGTGCTTTTTTAAAAACAGTACCTTCAAAAAT
ATCTGACATGTCCATTTGTGCCACAGCTTTTCGACGTTGACCTCAACTGT
ACATATGGTGGTAGAAAAATATGATCTGCCTTTTATCAATTTGGGCAGCT
CATAGTGGGTTTAGAAGCTGCAAGGGACAACCCATATACTGTTGGCGAGC
TTGTAGATTATTGAGATCCACTCCAGGCAATGTTAAACCAGAAGCTGCCC
CTGGAGCTGTTGTAAATTAGTCCTGCTTGGCGGTGCTGCTCCATCTAAAG
ATTTTGTTGGCAGTAGCACTTGCCGTGAGAAACCTCTCTGGCTTGTTCCA
TCATATCCTACAATGCAAGAAACTCTCAGTCATTGGGATCTCACTGTTCA
TGTTGCAGCTAGTGTGTGTGTGCCGGGAGGATAACGGAAAAGTGAATACT
GTAACTTAAGAATATACTAGGGTTGAGGCTGATGCAATGTCAAATGACTA
TCTGTATCTCAATTTTGCCGTGTGACATTTTTTGTACAAACAGTTCTAAG
TGTGATATACAGGGAACTTTGAAAAATCATGATTGTTTTGCTCAGATTTC
TCTAGCAGGATGTTGGTCTCAACTCTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.