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GrainGenes Sequence Report: AE008209

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Sequence
AE008209
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE008209
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCAAAATTGGTTCGTACCTCACGACCACTCCAGGCGACTCCTCACGACTT
CACGAGGAAAACCATGGCGACTGCTAGCTAGGGCAGCTGTGGCGAGGCGG
AGACTCGATCAGGCGACCGGAGAGCCCCTGCCGGCAAGGGCGTCCGTCGC
CCAGGGCCCAGCCCCGTCCCCAAATACCCAAGCGGCCAATCGGCAAATCC
TCCGATTCTCCCCAGGCGCAAGTGACAGGTAACTCACTTCCCCAAACCAA
TTCATGGCAAATCTGGATACCAATTTACTTATTGGCTGTAGCAACTAATT
TACTTCTTGACAATTTAGTGGCATGAATAATTTATTCATTGTTTCTTACA
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GGTTTTCAAAAGAAAAAGAGATGAAGTTGAGGAAAACCAGTCACAGTCAG
TACCAGCAGATCATCCATTGCCTTTACTTGAATTAGAACAGCATCCGCAA
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TTTGACCGCTGCTTCCTCACCCTAAATTCTCTTCCACGTTTACTTATTCC
TCCCCTACGCTCTCAGCCAAAAAAAGAAAAAAAAAGAAGCTCGGCACCGC
CGCCGGCTACTGTTGCCTTCCTGCGTTGCCGCCGCCCTTAGGCCTTGCTG
CCGCTGTAGGCCGTATCATCATGCTCGCGGATCAAGGGAACCCCCCGAAA
CCCTAGATTCGGTGAGTCGTGTATTTCTGTAATCCAATTTCTCGCGAGGT
GGAACTCCTCTGGATTTTGTACTCGGGATGCCTCTGGTCGCCGTCGGAGC
TATTGTAGTTTAGTGCTGACTGCTGACGCAGTTTTATTGTAGCAAACTAT
TTTCGCTTTTTTGTTTTCAGACTGGAAAAGTAACTAGAGATTATTCTGGA
ACATTATTTCTGGCACTGAATGGCTGTAACAAGGTTAATTTGAGTCTCAT
AGGTCATATGGCGTGGGTTTTGCAGATTGTAGCTTGCGTTTGCTCTAAGG
TTGCTTAGTCCTTGTGCAATGGCTCCGCATTATCAATCCGCTACGCTGAT
TGCTTCTCCGTCCTATCCGAACGCCATCACCTGGTCATGCGAGAACTTGG
TGGCTGTTGCTTCTGGTCACATTGTTACCATCCTGGTATTTGCAGTTTCA
TCAACCTATGGGAACTTGCTTGCAGGCATTACAATACTAAAGTTCATCCA
TTCGATTGACCTTGCATTCATCATGTTTTCTATATAGAACCCAGCCACAC
TTGAGGGGCCTCGGGGCTTTGTCTTGCTACGTGCTAGTGAACCTTTTTCC
ATTGGAGTTGTTAAACGAGAAGGTATTGGTCTTTCAGAGAAACACAAGTT
TTTGCTATGTTCCTTTTGTTGTATGAAGCTTGACATGGTATCAGAGCTCT
TTGATTGAGAAGGAGGAGGGCCAGCTTCAAAGGATGATGTTGATTAAGAT
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TTTATATTCTCTAAATTAAATGCCTGTGAAAGTCCGAGCTATGTATTTAG
TTCTGAGACACTGGACAGCTTGAAGTTTTGAATTGACACACGCTCAGTGA
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AAGATACACATTTTTTTATTTTGCACGAATTAATAAAGATGTAATTTTAT
TACTGAATCTGAGTTTCTTCTCAACATCAACATTGCAGTGAAAATATGAT
GCTAATATGCTGTTCGAAATGAATGGAAAAGCCAGAAACATTTGAGACTA
TAGTTATTTATCTGTCTTGATTAGTGACAGTTTAAGAGATCAGATACTTT
ATGTGAATTGAAATTTAACAGCTGTTTGCTCGATCTGAATTGTTCCGTTG
TCAACACTTGCAGATCTCTTTCAACCATGTTTAGTCCCTACTTTCTTAGT
GCGTGATACTGAACCATGCGCACGGTCAATTTCATGGTCCCGGCCAGGAT
TTGCACCTAATTCTGGGTATATGTAGTTTTAGTGGTATTCAAAGCTATTT
TTTCCTTCCTGTAAAGTTTATAGCTAATTTTTTCTTGTTTATATTGATAA
AATATTTCAGGTGTTTGCTTGCTGTTTGCACTGCTGATGGTCATGTGAAT
CTTTACCGCCCACCAATTGGGGAATTTTGTGATGAATGGGTTAAGGTAAG
CCTATTCTGTTAATATTTATGTATAATCATAATATGCATGAAACTTTCAT
GTTAAAACAACTAGAAAGTTAGATGGAATGCCCACCAAATTTCTATTTTG
TGACACACGTGATCTGTAAATATTCCTCGAGGACAAGGAGGTCAGGATGA
GCTCGCTGTTACAGCTTTAGTAGCAGTACTTCCTCCGTGAGAAATCTATA
TCAGTACTAAAAGCTCGAGTTCAATAGTGCACATGCATGGTGCTACTACG
CTACTCAGGCTGATCAAGGACGAAACCAAGCTTTGGGCCCGACACCCTAG
GCCTTAGAGTGTGTTTGCCTGGGAAATGGGATGTCATTAATCCCGAGTGC
TGTATATTGCGTTGTACCTGGTCTCTTGGGGTTTTGTAACTATTTCTACC
TTTTCAATACATCGAGACGCAAGCTTCGCATTTTCTGGAAAAAACACCTA
ATAGATGCACAGTCCCAACTTATCTTCATCAATTGCGTGAGTTCATATGT
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CTGTGGTGAATGAGCAATTCCTAGGGTTTGCAAGTGACTTCCACGTGCAC
AGTGACTATTAAAAGTAAACTTCCATTGCAGTTTTGGTTTGTCTATTCAC
AAAGTTCTTTATTGTTCTTTCTATCGAATTCCTTACAGGTTTGTTACTGG
CAGAATTGTTTTTCATACTTTTGTTTATCTGGAGATGATCCAGGTCTCAT
ATACTGATACACTCATGAACTATTCCTAGGTTGTGGATGTATCTAAGTTG
CTGTTCAACTATTACAAAAGTATAAACTTCGGAGAGGATTATACTCCTGA
TTCAGTTCCTCAGGTATGCTCCCTTCCACTTGAGCACTGCACTGTTCCTT
TACTTGATTATCTCAGAGTTTTATTGTTAAACGTTTTCTTTCATATATTA
GGAGAAGGTAAATAGTAAGCAAGCACAGGAGATAGGATGTACTGCTCAAC
TGCAAGAACCCCTTTCCTGCAGTGATCTTGGACAGAGAAAAAGGAAACCA
GCAAGGCGAATGATGTTTTCCTTTTTCAGTTATCAAGTTTTTTCACATCA
TCAAGGCTTTGCAGTTAGAAAAGCAGCATCTAGTTCTGGAATAATAGGAT
TGTCCAAAGTTGATTGTTCAATCAAGGGAAAGTAAATTGTGATTTTTTCT
CGCAAACACACTTCTACATCACATCGACAGTCTCTCCAAAGAAAAATTTC
TGTTCAGCAGTTTGCTCTGATTTGGATGCGATCGTGCGAGAGATTTTATA
TATATTGAGGATATTTTTCAGTTTCTTTCTAATCAAGTCCAATCTTTAGT
GAGAAAGGATGTTCACCGATAAAAAATTATTAGTAAATTGCAGCAACAGT
AACACTATATGGTAGTTCATCTTTCCTTTTCTTTGCATCCATATTCATCG
AATTAGACTGGCAGAGATCTAAGAGTTCTTGCAAATGTGGTAGAATTGAG
AAGGCTAATTCTAAGTTTACCCCTACTTGAATTAGCATTAGATGTGACTT
CAGTGTGATTAACATAAACAAACATCTGTCACACTGTGGTGTGTGGTTTT
AAACCAGCGCTAGCGGTATGGAGGCTGTTGCACAATCAGGTTGTGCTTTG
TTGTTGATTTGTAGTTTTTATGATTGAATCGAAGAAGGTCAGCCGAGCTA
AGGGTAGGCATGCTGCTAAATTCTATTCATCTTGACTATTATGTAGAGTG
CCAACAGTTGATATGCCAGCCTTGTCTACCCTGTTCACATGAAAATTTCT
TTGGCATTGTTTGGTTCCGCTCATGCATGACAACACCTTTTCGTTTTCTC
AAAAAAAAAAATCGCTTTCACTAATTCCTTTTGTTGCCAAAGTTTGTCCA
AAACCTGGGCCAAGAAATTGAAATAAAAATATACTGCCAAAATTGTCAAA
CAAGTAGGGTTTGATATTTGTGTATGGCATGAACCTAGCGGCCCCTTCTA
TTTTCTCCTTCTGCTTCTCTTAGGCTTATTTCTTTTATTCCCTTTCACGA
GCCAGCATTGTTATATTGTACCTGAATTTACTTTAGTAGATCTTGTTTGT
TTGTAGATTTACGAGCTATGTTTATGATGAGGATGAAGGTTATTTAGATG
CTTCAAATGATGCAGATTTCTGGCTCAATCCATGCTCCAAGTCAAAGGTG
ATATCTATGAAAAAGGTATGGACTCTGCATGTTCACATGTACAGATTGAC
TCTGGATGTTCACAGTAGGCTGAAGTTTTGGTTCAAGTCCAAAAACAATT
GAGTCATAAAAGGCAAACAATCGTGTTTATCAGTAGTTAGCAAATGAAAC
AACTAATTATCCTGTAAAATCCAAACTGTTTCAGAGCCTATATGTTTGGC
TTTCCTTTTTTATTTATCAAACATCCCCAGACATCTCTGTGGAGTTCTAC
TTATTTATCCATTGTGTTCCCAGATTGTCAAACCTGGACATAAAATCGTC
CTAAATGGGCTAGGTGGCTCACAAGGTAACAAAGCAGCACTCCCTTGCAA
TGTGGAGAACACATGTCTTCCTCTTATCACTGCAAAACAGTATGCACGTC
GAAATGCAATTTTGTCTTCTCTGGTAGTTGCATGGTCTCCAGTTCTGCCA
TCAGGAGACGCCACTTCGTGTTTGTTGAGAAATTGGTGCGTTCTTGCTGT
TGGCTCCAAGTCCGGGGATGTTTCATTTTGGAAAATATGCAAGCCCGAGT
ATTACACAATAGATGTTTGCATGGTTAACAGAGATCCTATACTCATCGGG
GTTCTGAAAGCTCATACTTCATGGGTTAGTGCTATCAGTTGGGAAGTTCG
CTCTGCAGACTCTTCAATGTCCTCACTACTTTTAGCAACTGGGTGTTCAG
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CTACCTTATTACCTGCTTGACATGTTTTTTGACTTAGCTCCTTGTAATTC
ATGAACGGTAAAAAGATAATTGTGTTTAATCAACCATGAAGTTTGAACAT
GATCTTTGAGCTAGTAAATAGTAATAGTGCTTTAGAACAAGTTCCCAGGT
AAGCATGAGACATGCCTTTTCATACTTCTGCCTTAAATGAAGTTTTTTAA
AATTAAAAAACATCTTCAGAAAGTTAAATTCATACTCTCTACCATGTGAA
ATTGAAGCATTGATGAAAATGATCTTCCCATATGCGAAATGATTTTCCTG
GTCATTTCAGCACCACAGCTACTAAATTTTACTACCTCCATTCGTAAATA
GATGACATCATAGAATGTGTGCAGCAGTACTTCCCTAAGGTTTCGGGGGA
AAATTTCCGGCTGGGTTTGATCCCTTGGACCTCCACACCCTCTTATATAT
ATAGCACAACTTAGCCTTACATCTTCACTCATACACTGGAATGATCTAGA
CTCTAGTAGGACACTACTACTATACTAACACTCCGTAGAATACTCTAGAC
TCAACTAGGACACCAACACAGACTCCAACACTCCACTAGAATACTCTAGA
CTCTCCTAGGATAACACTACTACACTAACTCAGATTCCAACACTCCCCCT
CAAGATGGGCATGGGTTAATCACCACGGCAATCTTGCTACAACTCCATGA
AACTTACTACAACCACCACACATCTAGCTTGCAAGCACACAAAGATACGT
AAGAGCATTTTACTCTAGCTCTTGCTCATCGGTTTTTCACCATATGCGGT
CAAGCACCCATTCGACACTGAAAATTCAAGCAGACAAACTTTGCATCAAG
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ATGCGCCTTCTCATGTGGAGGTGACCATGGCCATCTTGCTACAACTCCAT
GAAACTTATTACAACCACCACACATCTAGCTTGCAAGCACACAAAGATAC
GTAAGAGCATTTTACTCTAGCTCTTGCTCATCGGTCTTTCACCATCGGCG
GTCAAGCACCCATTCGACACTGAAAATTCAAGCACACAAACTTTGCATCA
AGCTAGCCACCTTCAATCCTTCTTGCATTGGTCCACTGTTGCCTCTTCAA
CCATGCGCCTTCTCACACCGGCGCGTAGAACGGCGGCACCACACGCCTTC
CCTCGTCAGCTTGAGCATAGTCATTGCCTCTTCATCACCTCCGGTTCCCG
CAGAACCACGGCTGCCTCATCTCAACAACAGCTCCTACTGAGCCACAGCC
GCCTCACCTCACCAGTCAGCTATCCACAGTTCCACACACTCCTAACCTCC
ACATGCCTTCCACCTCTCCAACACAGTCACGTGCTTGACCTCTACCTCCT
CTCCATCAACCCTCTGGCCATCTTGCCTCAACCATCTACGCCTCGGTCAC
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ATCAGCTCCTCCCTTACCATCTCCATTACCACACCTCCACAACATCTTCT
CTTCAAGCTCCACCACTGCGCTACAGCCATCATCTCCATAACACAGATGC
CTAGCTACTTCACAACCGCCGGCATCGCCTCAGCATCTGCCCATCTCCGA
CCAGATCAGAGGTCCTCCTCCATCCTCATTTTTTCTTGGTCCCCAAATCC
AACCTCGCCAACTTACTATCCTCCTATCAGCACCTCAATTGCACCATTCT
AAGTAGCTTTCTGAGCAACCCTCATGCAGAGCAGCAACCAAGCCTCACAC
AACGCACCGTTCAACATGAGGTGGCTACTGCCTGCAGAGAGCAACGGGGT
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TTAGGAGGAGGAGCCTAGCTCTGATACAGTGATACCATGTAGGTTTCGAG
GGAAAATTTCTGGATGGGTTTGACCTTCACATCCTCTTATATATAGCTCA
GCTTTATATTACATCTCCACTCATACACTAGAATAGTCCAGAATCTAGTA
GGACACTACTACTATACTAACACTCCCTAGACTACTCTAGACTCAACTAG
GACACCAACACAGATTCCAACACTCCACTAGAATACTCTAGACTCTCCTA
GGACAATACTACTACACTAACTCAGATTCCAACAAAAACTTATTTAGTTT
CGTCATAAGAAACAAATATTATTAAACGTGATCTATTTACGAATATTGGG
AATATATTCTGATTATTCTTGTCACTTCTTAAATCAATAATAGTTCACTG
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CTGTTCTTTATTTTTGCACATAGTTGATATACACTAGCTATTGGTGAAAC
ATCCGATGAGTATGGACAAGCAAGTCTTTTGACTATCATGTTATCCATTC
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CTCGTCAATTTCATTATATGTGCCAGCTCAGCCTCAACATGGGATTAATC
TTAATTTGGCAATCGGAAGAGTGTCTGGGTCATTGGAAACATGGTTGTGG
GATCCATGTAGAAACAAAATCGAGAATACCAGTGCATGTCATGCTCATGA
TCAAGTGGTAAAGTTTCATTGCATTTAAGTATCTTCTCTCTTCAATAAAA
GAAAAATAAATGGCTAACATTGCCTCAGGTGACAGGGTTATCGTGGGGTT
GGTATGGCCAATGTTTGTACAGCTGCAGCCAGGTCAGTTGACTTGCCACA
GCACTATTTAGGCTACAGATTTCATGGACTATTTGTTTATTAGCTTGTCT
AGAAGCAAAATATATTTGTTCTCTGAAGTTAATGTACTCATACCGTGTAG
CTTTTCATTTTGACTAGTTGCTGTTTACTTACTGGAAAGAGCTACACAAA
ATGAATTTATTTTATCTAACAGTATATTATAGTAGTACTATTCTGGTGGA
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AGATACGCTAATGTGGTGTGTTAAATGCCAGTTACACTGGAATTAACAAA
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TCCTATGGTGAAAATCTCTAAATCGGGGAAGCTAGTCAATGACTTGACCT
ACTTATGGAAAAGGCCATGTGCTGGGGATGATACCTTTTGATACTATAAA
TCCGGGTTTTATTCTGTAATTGCTGAAACTTTATGAGTCTACTTTCGATT
AACGAGATACCTGGTGGACTTGTTTCATTTTATCATACATGCTTGTAATA
ACTTGAAAAGTTGAAGATTTTATTCATTACTGCACACTGTTATCTTAAAC
CTTATATTTTCATGCTGATGCTTAATATTTTCTTCTTTATCAGGATAATT
CTGCACACTGTTGGATTTTCCAGGAAAAACAACTTGAAGAGATTCCTGTG
CACACAAATTTTCAGGAGTTAAAAGCGTCAAGAGATGTAAAAAAATCAGC
CTCTTCATATTCCTGTTTTCGCTAAATGTATGTGTTTTTCTTTTCTTTAG
TTTCATATCCATTGTGCATGCAGCTATCAGAAGTATCGGATCAATGCTTT
GGACTTTCAATTGCACCTGGACAACTAATGATTGCTATAGTATGCCATAG
ACTTTTTCATGTATACATTTGTTGCTCAACTGCACAGTTTATTTTCTTTT
CTAATTTATGAACATTGTCTCCTTCAGGTTCGCAGCTTGGATCCAAATCT
GTTAGATCAGATGTATCAAGCCAGGTAATTTTATTTACGGGCTCACTGAA
AAGTTCCGGGGTCCTACATAAGAATCTTGATATAATGATTGCATTGCGGG
ATAACATTATAGAATGCTTGTCATTGTAAGTTTGTAACAATTTGTTAATA
AAACAACAGGACACACAAAGCAGTGGTTGAGTTCATTTGGATTGGTGGTC
AGTTCCTTGGTCTTCCACTAGTCAAGGGCATTAATATCTGCACTCAGCAA
TCTGGCACTAACTTCCTATGGTGGGGATCCAACATTTTTTGGTCATTGAA
GAAATATGAGAGTGGTGAGACGGGGCTGGCCTTATGGGACATCATAGCTG
CGCTTCAAGTGCTCAAGAAATCTGCACCAACATTTCTGGAAACTTTAATG
CTTAAATGGGTCTTAGGTTTGTTTTCAGATAATGTACAGTGTGGTTCTAT
CAGTATCCTGTATCACTCAAGAAAGGACATGATGTCCAAGGCTAGCTTGA
GGAAGTTACACTTGCTGAATATCATTATTAGGAAAGTAATGCTGAGCGAT
CATGGACAGTATTCTTCTGGTGGAGAAAACGGTAATGATGCGGCAACTGA
TCTATGGGAAAATCTTCTAGTAAGCAGTGAAACAGAGCTGCGGGAGAGGC
TTGTAGCTTTCACTTTTGCTGCTGTCTTGGATCAAATAGCATACTTGCTC
AAGGGCACCTCTAATGAGGACATGTGGTTTCCTGTTGGAATTGCCCAGAT
GGATTCTTGGGTATCTACGAATAGTGGAGAAGTGCATGATCATCTTAACT
CTCTCAGATCGAGGATCAAAGACATTGGTAGCAGGTATATTCATTGTGCT
TAATTCATTGATCGTAGTCAATTTCACTCCTGAAAGGACATGAAACATGT
GTTTGTTTCCTTAAAAGTTTAGTGAAACACGTACTGTATTTGGGTATTGT
ATGTCTTGTTAATTGTTTTGATTTTACAGGATTGACTCGGTGTGTGAATA
TTCCGTAGAAGAAACCTGCCCCTACTGCTCTGCACCAGTGCCCTTGGAGT
CACCTGATGTAGCCCTGTGCGGAGGCGGGGATCCTGCTACTGCCCCCGCT
GGAAGGCACAAGCTGTTGAGATGCAGAGCGTCGATGCGGCTGTGCTCCGT
TCTGGACCCAACCTGGTATTGCGTATGCTGCGAAGGAATGGTCGACAAGC
TGGTACCGGAGACCTTCTTCGCATCCGCGACAGCTTCCCCTTTGAATGCC
AACTGTGACGAGGAATCACTTTGTTTATCAGCGCCTGCTGTTCCGCTTTG
CCCCTTGTGCGGTGTACTGCTGCAGAGGCCGACGCCGGAGTTCCTCCTTT
CCGTCTCCCCGGTGTAGAAGCTAGTGGCACTTGCCAGTCCCAAGTGTGAC
ATCCAATTTCTTCTTCTTCTTTTGCAGTGGTGTGCACTTGTTTTTAGTAT
AGGCTGCTTGTAGTCTGCGCAAAAAACAAGCGTTGCTATGCCACTACCGA
GATGTTTTTCGTGTGTTAGTGCCTTTTTCTTTTCTATATCAGCATGGGTC
ACTCGTGTAAGGCAACAGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.