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GrainGenes Sequence Report: AE044594

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Sequence
AE044594
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE044594
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAGAGTCCACCGCCAAGTTCCCCTTCCCCCCTCCTCAACTCCCAAATAC
CTCCTCGCCGCCGGGCGCCGGCTAATCGGCCTTGGCCTATCTCCCGCCCC
ACAAGCGGCACTCCAGTAGCTCCAACCCCACCCCGCCCACCTCCTCCCTT
CGATCCCTCTCTCTCTCCTCTTTCCCTCGTGGCCGCCACCATCTCCGCCC
GTCCAACAACAAGATCATACACGCCGTCGGTTGCGTCTCCCGCTGGTCCC
CGCTCCCGCCTTTCTCCCCCGACTCAGACGATGCGGAATCTTTCCGTCTC
GAGTCCTTCGCGTGCGACCGCGTCGAGCGCAATACCGGCGCCAAGCCCCT
CGTCCTTTCACTCTCCTCACCGAAAGGCTCCTCCGGATCAGCAGAGGCCG
CGGCCACCGCCATCGCCGAGAGGTTCCTGCCAGAACTCCTCGCTGCGGCG
GAGAGGGCGGGAGCGACGACGCACGATGCTCCCAACAAGGAGGAGGCGGA
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TGGATCACACGTCTCCTTGGACTCGCTCCGCAACGCCGCAAAAGCAGGGA
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GGGTCTTTAAATGTATGATAGATATTTGACAAGCACCGAAGTGATTCTAC
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AGGTGCGCCTTCCAGTCTGCCCTTCTTATTTTATTTTTGGTTTTTAGAAC
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AGATCATGTATGGCGCTAAATGTTAGCTATCATTACTCCCTCTTCAGGTT
TACAAGGCTAATAAATTTTATCTTTAATCAAAGTTGTTTAGTTTAATTTG
ATATAGGTGGTTTTTGGGTTGTCTGAGCTTTTAGTTAGGGATCAATAGCT
CATGTGCGACATATTTCCCTGTAATTGGAAGGAGAGCGACGTCGTTGGCC
GAAGTAGCTCACGTGTGACGTTTCTGATGGCTAAAACAGCTCCTGTGCGA
CATGAGTCCTCAGGGCATCTCCAGCGGCACGACCCAAACGGACCGGCCCG
TTCGCTCACCAAATTTGGGCAGCGGATGCGTCTACCCTGACAGCCCATGT
CCTCCCCTTGACCTTGGTGGTCCCTACCGCCAGTGTTACAAGAACCACCT
TTTTTCCACCAAACCCTCTTCCAAATTTTGGTCGGCGGCTACGGAAGCCA
TGGAGACCGCCGCTGGCCCTGCCGCTTGTGGCGCCGCCAAGAAGCTGCCC
AAGCCGAAGAAGCTGGCCAAGGATCTGACGCCAGAGGAGCTTCGCTGCGA
GTCGTTGAAGCACACAACACACAGGACTTAGAAAGGATGCCAAAGCTCTG
ACAATGGCGGCCTTGCTCGAGGGTGAATGGCTGAAAGAGAACGACCGCAT
CCTCCCGATGCAGGCCAAGGTTAACATCGACGTGATGGCCAGGCATGCTG
CCCCCAGGCCTTCATCATGTTGACGGAAGGGGCGCTCACCGTCGCATTGG
TCCAGGGCGTTGTTCTACCTCTGGCTGCGCCTCTCCATCCGTGGCCGGCG
TATCGTCGACAAGCTTGGTCTTGTCAATGCCAAGCGACGGGAGCCTCACA
TACGCCTTCGCAGGACGGGAGCCACACGAGGCACGGTGGCGCGCTATCTC
GGCTCGGCGTGTCCCAGTCAACGTCGTCGGAGACATCGTCCATGCTGCAT
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ATATTAGCACCCTTATATACCAGTTACACCTTTACATAACATAGATAAAA
GTACATGGACACGACACGACATAGGTAAACACGATTAAAAAGACCTAACA
AACACAACACCATCTTCAATCCGGGCGCTTCGCCACCATCTTCACTCCTC
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AGTCGAAGTTGGTGAAGATGTTGTATGTGGTGAACGCGATGAACTCACAA
CCGCACCAGAAGACTTGGCCGACAAGTTGGAAGGCGTCGAACGAGTTGGT
GAATTGGGCTAGGGGCGAGATGAGGGTGACACATGCAAGGTCATAGGTAT
CCCCAAGCCGGAACATCACCGGCGTGCCCTATGTGAGGTGGGCTTACCCG
GCGTGAAGGAACCAGTGGCGAGCTCGGTCGGTCCCCTCCACCTCGAGATC
GTGCGCACCTGGAGGGTGGTCTCCACGACGACGCCGACGGGGTAGCGCGC
CTCCGGCATGGTTGGCGGCGCACGGAACGTCAGGACGTTGTACTATGACA
CCCCGTTGACGTTGTCGTGGAGACCATCCTCCAGGTGTGGGCGATCTCGA
GGTGGAGGGGGCCGATCGAGCTCCGCCCGCTAGTTCCTTCACGCCGGCTA
TGCCCACCTCCCACGGGGCGCATCGATGATGTTTCACCTTGAGGAGACCC
ATGACCGTGCAGACGTTACCCTCATCTTGCTCCTAGCCCACTTCACCAAC
CCGTTTTACGCCTCCAGCTCCTCGGCCAAGTCTTCTGGTGCGGCTACGAG
GTTATCACGTTTACCACATACAACATCTTCACCAACTTCGACTGCATCTT
CCCCACCGCCAACCAGATGCACACCCTCCGGTACAACGTCGATGAGAAGG
AGTGAAAATGGTGGTGAAGCGCCTGGAGTGAAGATGGTGGTGAAGTGCCC
GGAGTGAAGATGATGTTGTGCTTGTTTGGTTTATCTATGCTGGGTCGTGT
CCGTGGACTTTTATGTATGTTATGTAAGGGTGCTACTCGTATGTAAGGGT
GTTAATATGTAAGGTTGCTACTCGTATCTTATTTATCTATTTCGTTATGC
AAAAATTTATTTGTCTTATTTATACACGTTTGCATTTTATTTGTCCCAAT
TTTTTATTTGTATATGTTTGCATTTTATTTATCCCAAAATTTTGAAATCT
CACTATTTATTGATTTAATCTTCATATTTTAACACGGCCCCATTTTAACA
CTACATGTCACATAGTGATATTGCATGAAAAGAACTACTTATCATTAAGC
AATGTGCATAAAAAAGCTCAAAAAGAAGTCTCGCAATGCTGAATTTCATC
AAGAGAAACTACATAAGTGCACGGGCAAAAAGGAAAGCACTACATAAAAA
CTACAAAAGAAATTAAACAAGCTCAAAAAAGTGAAATAAGATAAGGTACT
CCCTCCGATCCATATTAATGTTCTTAACTTTGTCTAGATTCGTATGAATC
TAGTTAAGCATTTAGACTAGATGCATTCGTATCTAGACAAAGTTGAGAAC
ACTAATATGGACCGGAGGAGGTATTATCTTTTTAGTAGAAAAGAAACATG
AGTTTGAAACTACACTTATTTTTAGCTGTGTCAATGGCCGGTGCACTCTA
CACAAGTGCATAGTCAATGCCTGTGCACTTTTTTTAGCCGAAGCTACACT
TCTTTTATAATTGGGCCTTGCTACGTTTATCGACACGCTAAGGTCTGGCC
TTTTCTAACACTGATCATTTCTATTTCGGCCTGACCTTTTCTAACACTCG
TCGATGTGACAGAGCCAAACAATAACATTATTTTTAGCCGAAGCTACACT
TCTTTTATAATTGGGCCTTGCTACGTTTATCGACACGCCAAGGTCTGGCC
TTTCTAACACTGATCATTTCTATTTCGGCCTGACCTTTTCTAACACTCGT
CGATGTGACAGAGCCAAACAATAACATTATTTTTACTTAACACTGGACTA
TGCATTGCACTCTGTCTTAACTGACGAACTAATGAAACGAAACAAAACGG
AGAAAACTTGACCGAATTCGTGCTGCCTTTTATTCAGGGCTAATCCAGAC
AACAAATCATCCATGTCATTAGGCTTATAAAGCATGACGAAGCTAACTAT
AACACTGATTACAATGTATAACAACTAATGATCAGCAAATAAACAAACTC
GAGAGCAATTACACAAAAATAAAAAACTGCAGCCATCAGATTTGCCTGCT
TTTTCAGATCGATAATTTGCCTCAAGTGCTTGTTGAGCTTCTTCAATTCT
CCCTCGGTGACCCATTCTCCCTTCACTTCCGCACCCACCACCGCCAACGG
TAAATTGAGCTCCTGGGATGCGCTCCCATTCAAATCAGTTGCACCCTCTA
GTTGAATCGTCTCAATATACTCATCCATCCACTCAAAATGCCAGCATTTC
TTCAGATTCTGAAATCGGAAAGATAAACCGTAAATCCCAAATCCGAGGAA
AAACCAGAAATTGGTATACAAAAACAAGAAATTGGCTGATGGGTAACTCA
AATCTAACCATCCCTGCCTCTGGCTTCCTCTCGCATTTCACAAATTCGCA
CCCATAGTTGTCATTCTTCTCCCTCATAGTGACCAACCGCTTCACTGGCG
CGGTGCATGGGCAGTCAGGGCATCTTGTCATCGACACTGCACTATACTGC
GGCCATGAGGGTCGGGAGACTAAATTGGAGCTCGACATCTCTCGTCGGCG
TTGCCGCGCTTCATCGCTAGAGAAGAAGAAGAAAAGGGAGGCGTGGCACG
GTCGCGAGGATGGCTCAGGCGCAGGGATTACTCGGGCTGCTGTCTTTTAC
TAACGATGAGCTCGATAAGTTGTGGGTCCTGCTCTGTAAGGTGGATAGGT
GGTGGGTCCTGCGCTCAGTGGACAACTTGTGGGTCCCGCGCTGAGGTGGA
TAAGTTGTGAGTCCTGCTCGGCTCACATAAACCAAAGTGTTAAGATTTCT
CTTACGGTAAAGGACTCATGTCGCACGGGGATCTTTTGGCCATCGGAAAC
GTCGCTCGTGAGCTATTTCGGCCAATGGTGTCGCTCTACTTCCAATTCCA
AGGAAATATATCGCACAAGAGTTATTGACCCTTTAGTTAGATAGGCTATA
GGCTCCTTTTGCTTTTAACTGTTTCTGGCTCTTTGCATTTGCTTATATTT
CGCGTCATCTTGACATTTTCTCTCTAAGACAAAATGGCATGCATTTGGGT
GAGTGTTTGATGAAAAACATCTACAAGACCCTATAAGCACATAATGAAGA
CATATTCCGTGATAAGTCTAGTGGTAACGATTTGGAATTATAGATGTTGA
TATTTGTTATAAACCTGGTCAAACTTAATGAAAGTTTGACTTAAGGGAAA
CTTAACAGTGCTTGTAAACCTGAATGGAGAGAGTATCATGCTTAATTTTG
ATTCAAAGGAATTGTTGGGCAATTAATATGTAGCCACACATACAATTTGT
TTTAATGTGGAAACATGTAAATACTTATGAAAGAATTATTTTTATAAAGC
AGTCACATATCTTGTTCGTAGGTCTATAACAGAATGTCAAGCTCTAAAAT
CCTTATGTTCCCTTAGCTCAAAAACTGCAGAAACAAGTCAAACTCAGCCT
GATAGCTTTTTTCCTAAAAAGCAAGTCATTATGTTGCTTACTGGTAGGTT
GCCTTTATATTAATTGAAGTGTGATTGTTCTTGTCACTGGTGGATGTTGT
CTCTGGTTATTATTCATTTTTGCCTCTTTTTTTTCTCTTTCTACTGCAGA
TATTGTTTGGTGTAACATATTCCCCTGTATATAGGTCATATTCCCCTGTA
GATAAGTGGAGGAAATCTTGAAACTTTCTTTTATATCCTCTATAGGGGCA
TTTGGTTAGATTACCGTGGCTGTGCTAAATCATTCATATGTACTACACTA
CTATTCATTATAAGCCCCTAGCTAATAGTAATCTTGCTTCTCATTCTTCT
CCACTTTTACTTCTCGTGCAGGTTGAATTGAACCAGATACGACAGTTGGT
GGAAGACATATCTTGTCTGTCCAAAGATCTTGACTTAAGGCTGATGTTGA
GTACCAAAAGGATCCTGAAAAACGTAGATGTAAGTTCATGTTGGAACTAC
CTTGATCCTCTCTACCTTTTCTTCGAAATAAAAGGAAAAAGCTCGAGCCA
CTCTGTTACAAGCTTATGTTCTGTAGACTCGTTTGATATCACTTGCAGCC
TGAGGTGGAAAATGCCATACAGAGCTTAGTGTCTTCAGCTATTCTCGATC
CTAATGTAAAAGGGGGACTCAGATGGCCACTTGGGAAGGAGTCGATTGGT
GAGAGGTTCAGCATTGTTGGAGTGTGGCATACCAACTACAAAGCTTTCAG
GAATAAAACATCGAGATTCAAGCTAAGGCATGCTGACTGGTTTGACCACC
GGAGCTCGACGGGGGAGGTTTCCAATGAAGTTACCTTTAAACTAACTGGT
ATATCAAACAGACTGCAGGTTAGTAAACAGCAAATTGATTCATAAGATAA
TATCATGATGAATCTGTGGTGTTCTTGCGCATGTTAATAGATTTTTGGTT
ACATGTATGATGTTGTATGCTGGCTAATGTTCAAACAATGGTATACTATT
TATTTGTGTCTAGTATTTCATTAGCATGCCGTGCATACCTAAAATGAACA
TCTTGTTTTCGTGCCAACATATGTGTACTCTGGTCTGTAATTATTGCTGG
TGTAATTCCTGATCGACGGTGGATTGAACAGCATGATGATTGTCTTATTC
ATTATATTTCCCAGGACGGCAATAAAGAGGCGGACACTGTGAAGGAGATG
CTGGAATCTGCTGTGCGGATGATCTGGGACAGTGCTTTGTGCTACAAGAT
GGCGCACTGAGCTCGGTGGTCGGCCTCGGGCTTGCGGTAGGCCGACAAGC
ACATTGCATCATGTGGTTGCTTAACGATGTTAATGTTGGTTTGTTGCCCT
GCTTTGTAAATAGTTTTGCTCCGCAGTGAATTTTCTGAATTGAGGTTGAC
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CCCTTCTACTTCATATCTTTTCATTTTTCTAGCAGGGCAAGTTTTCGCCT
CCTAGGGCCGTGGCTGCTTGCTTGCAAGTCTCGTGTCCTGGGGCTGTGGC
TGCTTGCTTCTATCGATTCTGAGTTGGTTCACTAGGGTTGACCTGGTTGG
TGAAAGTTACAGCGTGTTTGGTTGGAGGGATTTGGAAAGAGGGAATGGGA
ATTGAAGGGGTGTGGGGGTTAAAAGGCCTCGTCTGGTTGGGGTAGTGGGA
ATTATGAACGGAAGAGGCAAGGGAATTGAGGAGGCCAACTCGTTTTATCT
TCCATGGGGACTGGTAGGTATGCAGGCGGACACGGATTTCCGCCAGGCCG
CTCTGTCCGCACCGCCCAAAAGTGCAAAACGGCTAAGCGGCTGGGCCACA
GGCATATAGCGGGCCAAGCGGAAAACGCCCACCGAGCCGCCACGGACCGC
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CGCCTGGCAGCTTCGCGCCGCCCAACTCCCGGCCATCCCTCCAAGACCTC
CCCTCCAAGAACTCCCCGGCCATCCCCTCCAAGATCTCCCCTCCAAGAAC
TCCCCGGCCATCCCCTCCAAGATCTCCCCTCCAAGAACTCCCCGGCCATC
CCCTCCAAGACCCGCATGTCTTCGGCACCCTCCCTGTCGACCACCTGCAG
AGGGATGTCAGATGCGGTGGATGCAGCGGCACAACACGCGGCAGGGGAGG
GGAGGAAGAAGCCGCCGGAGGAAGAGGAGAAGAATCCGGCGGCGGAGCGG
GACAAGAACTTAGGCGAGGGCGGCGGTACCCACCTCAATTCAGAGAAGGT
ATGTTCCTTCTTTTTCCTTGTAATTTCGATTTTTTGGTAGGATTCTATCT
GGCGTAGCTGGTTCTTTATTCTTGGTAGGATTGATGTGCTTTCTGTAGTC
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TAGTTACATCTGCTCAATACTAGAATTTTCTTTAACTTGACTTGAGAACC
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TATCAGTCGAGTTCATCATTTTTCAGTTTAGTACTGTACTATCTAAGCAC
TATTGTATTGTCTATGCTCTGGATATAACTAAGGTTTCACTACTGTAAAT
GAGTTTTTAATTTCTAAATAGATTCATTGTTAATGGTGTGACAGATTACC
TGCTTTGCAAGCACACAAGATGAGCAAGACCCTGATCCCGAGAAGACCCA
GCTACATATTGACACAAAGAAACCAGCAAGCGATGACAGTGGTGAGAAGA
CCCAGATGCCAATTGACATAGAGGAACAAACGTGTTTGATGGCTGTTCCA
GGGGAAGAGAATGACTCAAATAATCTGCAAATGAAGAAAAGGAAAGATAA
GAAAAGGAAGAGGAGTGAACTTAGGCAGATTAAGAAAGAGCAGCAGTTTG
GTGGTGCCGAGAAGACCCAAGTACCTGCGGATGTACAGAAGTCAGCAAGC
AAGGCTTCTTGGAGGTGGCGTGCCTCCTATTCCACTAGGCTACACCACAA
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ACCGCGTCGTCCTCCTCGACACCAAAGAAATGATCATTGATTCCCATTTC
CTCAAGGAAGGAGAACTAATCAGTCAAGGATCGGTGTTTGAGTTCCCTTG
CCATAATGTTGAGATTGGTAAACAATTGATGAATATGAAGAGGTTGGAGA
AGAAGAGGCTTGATAGGAATTGGGAGAGAACAAAAGAATTAAGGAGGAAA
ATAGTGGCATCGCCTCAAGGAAAATTGGTAAGATCTTCGATAGGCACATT
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GGAAATCAGAATCTCCTAAGGCTGATTTCACCCGGTTTCGACCACGGAGA
CTGAAGTCTCTGATATGGAAAGAATTCATTCCTATATATGATCATGGAAA
AGTTGTGGAAGGCCAGTGCAAGCACTGCAATGAAGTCGTTCCTGCCTCGA
AAAATTCTGGAACCAACCATGTTCATAGGCATCTAAAAAAATGTCCGACG
AGAACTAGCATGCATGAGATGGTTGCGAAAATGAGAGCCTCTACATCTTC
TCCCCAAGTCGTTTCTTTAGATAACTGGAATTTCAGCCAAAAAGAATCGA
GGAGAGCCCTTGCAAACATGATAGTTCAGCATGGGCTACCATTCTCCATT
GTAGAGTATAGTGGATTCATAAAATTTGCCAAAAGCTTGAATCCTATGTT
CAAGATGGTTTCAAGGACAACTATAAAAGATGATTGTTTGGACTCCTACA
AAGAGCAAAGGTCATTGTTGCGAGAAACATTGAAGAACTGTGGTGCTCGA
GTGTCATTGACTGCTGATATGTGGACATCAAATCAGAGGTTGGGTTACTT
ATGTGTCACTTGCCACTTCATTGACAAGACATGGAAGATGCAAAAAAGAA
TTCTCAGATTCTGTATGATGGAAACACCACATAATGGCTTCCGAATGTAT
AATGTCATGTTGAAAAGTTTGCAATACTGGAATATTGAAGACAAGATCTG
TAGCATTACATTAGATAATGCATCAGTCAATGGAAAAATGATGGAGCATT
TAAGAGAAAACTTGATGAAGAAACAAATGTTGATTTGTGAAGGTCAACTA
TTTCACATCCGCTGTGGTGCACATGTATTGAATCTCATTGTGCAAGATGG
TCTATTTGTAAAGAAAGATTCCGTTGATAATGTCAGAGATGGCATCAAGT
ATGTTAAGAGTTCGCAAACTCGAGAAGAGTTGTTTGGAGAGATTGTGAAG
CAACTTGGCATCATCTGTGAGAAAGAACCTTCACTTGACGTTGCCACACG
GTGGAACTCAACATACCTTATGATTGACTCGGCATTGCCGTACAGGGAAG
CATTTGATGAGTTAGCTAAGCAAGATCGGCAATTTAAGTATGCTCCTTCA
GAAGAAGATTGGAAAATGGCTGAAGCGATCCGCTCATTGTTGAAAATATT
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GCCATTTCCATGAAATGTGGAGCATTAAGCTGTTGTTAGAAAAGCAAGCA
ATGAATAAAAACAAAGACATCTCAACCATGGTGAGCGAAATGCAGAAAAA
ATTCGACAAGTACTGGAAGGAGTCGTACTTAGCAAACTGCATACTAGTGG
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GCATTTGGAGGGAGTGCAAGAGAGCACCTTGAAAAGGTGGCAATGATTAT
GAAGAGCCTTTTTGAAGAATATTCCCATAAAATGGGAGATTCTTTTCCCG
ATCCTTCGGAAGAAGTTGAAGTTGATGAGCTTGAGGAGATTGATAATCCA
TTGGCTGATTGGGAAGCTCATTTGAGGATGCAGAAGAAACAAACAACAAA
TGAGCTTGATAGGTATCTGAGTGAAGATTTGTTCCCTCAAGAAAAAAAAT
TTGACATCTTGGAATGGTGGGAAATGCACAGTCCTAAGTACCCAGTTCTG
TCTCACATTGCTCGTGATGTACTTGCTATTCAAGCATCAACCGTGGCATC
AGAGTCCTATTTTAGCACCGGTGGTAGAACAATCAGTGATCACAGGAACA
GGCTAAAGAGCGACACGGTCAAGGCGTTGATATGCCTCCAAGATTGGCTA
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TACTTTTTCTAACTTGATGATCTTTCAATCTTTCAAACCATAAGCCAACC
AATAAAGATGACGAGGAAGAAGAATACTTGGTAAGTTTGGAACCTAATCC
TGAGTATGAGTAAAGAAATCATGTAAGTCTTTGTCTCATGTATCAAACTA
CCAGGTATTCTACCAAGGAAGCGAGTGCGATGAAGAGAGACTGATGTCCC
TCACAAACAAAGGTTAGTAATCTTACATGAGTGAGTTGTGAGACACAACC
ATGAATGGTCTCTCATACAACCATGTTGCCAACTTGCAGTACATGGGCAG
GAGTGATCTCCAAACCGTGCCAACAGATTAGTAGCTTGTTGCAAAATTCA
AATAGGTAAACATTTGTCAAGTCTTATCATGATCCAAATGAGAGTATGCG
ACTGTCATTATTTAGTCTCCTTGTTTTAAGAAGTGAAAAGCATGGCTATA
TCCGAAAGGAGTAAACAAATATCCTGAAAGTTCGATGTTGTTTCTTGTTT
AAGAAGTGAAAATCATGGCCATATCTTGAAAGGATTAAACACATATGTGC
ATGTGGTCATTTTGTTATGTGTTCAATACCATCTTCTTTAGTTACATCTG
CTCAATACTATAAGTTTTTTTAACTTGTCTTAGTGCTACAATTTTCAGTA
TGCTCATCAGTGTTCTAATCCCTGTTACACATGCTCAATATTGAAACTAA
CCGATGAATAGTGCCTTCTTGCAGAATGAGCTGTTGATGTATGCTGAACT
TGAGTATATCCTGAAGATTTGAATTTTGTATGCACTACTGCAGTTACATC
ACAAAGATATTCTTATTTGACAATCACTCCTATTCGCGGCATCTCAAATC
GAATCGTTTGTAATGATTGATTGTAAAATATCAGTAGTTTCTAGTACTAC
TGAAGTACTGAACTATGTTTAATCTTGAAATTCTTGCCACTCTGTGCTGT
TACAACAATGAATTGATGTCCTAAATTTCCATACTGCTAGCTGCATGTTG
CCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.