Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE039785

[Submit comment/correction]

Sequence
AE039785
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE039785
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGCTCCTCCACATCTCCGAGTTCCGACCAGCCACCGAGACACGCCCCCGC
GTCTCCGACCATGGCGTCCGCCTCCGCCTTGCCGCGCACCACGCAGCAGC
TCGTCGACGCCCTCACCTCCCACCTCTCCCTCTACCACGCCTCAAACCCT
AGCCCCGCCCTCTCCTCCTCTCCCCCCTCCCCGCGCGCCGCGATCCTGCG
GTGGCTCGCCTCCCTCCCGCCGGCGTCCCGCGCCGCGGCCACCACTTCCC
TCCTCTCCCCGGCCGCGGCCGACGCGCTCCTCTCCATGCTCGACCGCCTC
CGCGTCCGCGGCCACTCCTCCTTCTTCGTCCTCGCCTCCCCCTCCCCCGC
CGAGCCCACGGTCCTCTCGCGCCTCTCACGCGGCCTCCTCGCCCGCGCCG
CCGCCGCCTCCCGCGCGCACGAGCTCCTCTTCTCCCGCACCTTCCTCTTC
GCCTCCTCCCCTTCCTCGTCGCGCCCCGATGCGATCACGGTCGCCGAGTC
CCTCCTGGCGGACCTTGATGCCTTCGTCGCGGCCATGGACGAGATCTCGG
GCGGGAGGTTCCTCCGCTGCGGCGACGGCGAGGTCGACCTGGCCGCATTG
GCGTCCGAGGAGTTCCCCGAGCTGCCCTGGCTCAAGGCCAAGGGGTACTA
CGTGATCGAGGAGTTCGTGGCCAATTGGGTGGAGATCGCGCTGCGGATGT
CGTGGGTGGCGGCGATGGCGACCGGGGGAGGCGGTGGGAAGAAAGCGGTG
AGGGTTGGGAAGTGCGTCAAGGAGAAAGCTGGGCTGGCGTCGACCGCCTT
CTGGAGGGAGAAGGGGTATGTGGATTGGTGGATGAGGCTGGAGCCTCGGG
TGAGAGCAAGGATCACCGGAGCCTTCTTCGGCAAGAGTGCAGTAGCGCTG
GTACTGTGCCCTCTTCTCTACATTTTCGAATTGATTGTTGTTCATGGATA
TAGAGTGCTATGGCCGCTGCATGTCTCAATCGTATGCATTTGATTTCAGA
CTATAAATTGTGTATACAAAGTGCCAAAGTTTCAGGAAAATGCTGCATTT
TAATTTGTTAGTTTCTTTGGCATCATGAAGTGAAACTAAACTTCGACCTG
TAACACGTTTGCTTCTTATTTACATATGAGCGTCAAAACATTTATCTGAT
CTAATTAGGATATAATAGATGAGCTGAATAGATCTGATTTTAATTTTCCA
GAGCCAAATGCGGTGCTCCATAAGGGCAGGTACAATGCTGCGCTTAGCAC
AGACGTTAGGGTATAATTCCCAGTAGTTAGGCATGAATCCCGATAGATCC
CGGGAAAAGGCTTTGCGTCGACGCGAAAGTTTACTACCGATTCTAATCCA
TTTATTATTCTTTTTATTCGCTTAAGCGTTGACGCTCCCGTATTAGCGTT
GGAGTCTTCGGCTCTTGCATGGCCGTTAACGACTTTTGCCTTTTTTTCCT
GCGTGAAGCGCCTCTACAAGCGTTCCGTTGTACATGCCCTAACATGTACT
GTTCCGGTAAGGGAGTAGTTGTGGTATGACTTTTCTCCTATCAGTGTTAA
CTTTAGCAAACATAGGTTCAGTTTTAAGTAAATATGGGCAAGCAAATCTA
GTACACTAAAAAAGATCTCCTAGAAAGTATCTGATCAGGACAAAAGTGCT
GCTCGTAAATACATGATTTAATCGTGTAGCATTTGTTAGGGAAACCTGAG
AACGGATGTCAAGATTATACTATTATTATCTAGGGCACATGATTTAATTG
TGTAACATTCTGTTAGGGAGGCCTTGTACATTAGTGGTGAAGCCTTGTAC
ATTAGTGGTCGGTGGATTTAAGTATAATTTTATCATTTTCAAAAAGTGAA
TTCATACCCACAATTCTCCTCTAGCTTATGTGAAAACCTTCATTTTCTGG
TATTTATTTGTCTGTCTTTCTTGGTCATCATGTACTTGCAGATTGACAAG
TGGTCATCCTTTTAAGAAACAATTCAGTGTTTTGTTTAACTACCGACTGA
AGAAAATTGTTATTCTCAGTATGTTAGTTGCTTATGTTGACCAGCTGTGC
TGACACAACATGGTGTACACGAATTTTGAGATCTTTGCCACCCCATACGG
TCTTATTTTACATAGTGCTAATATCTGGGAAGAGAATCACGAAAGTTTGT
GTTAGTGTTCTGTTAAACTGAGAAAGTTGCTATGCCTCGAGCACATCTAA
GTCACATACTAATAGCTCAAGTTTGCAGGCTAATGAGATTGGTGAAGGGC
CAGATGTTGCTCTTAGAGACAAATCCTGTTTATGCTTAGGTGATCCTGGA
TCATTTGGCGCAGACAGTTTGTATGGAAGTGCACGACAGTCTTTTTTCAG
AAAGAATCAACCTGGTTGCACCGATGTTGCAAGCATTCTGTCTTGTAAAA
AGAAACATGCTTTTGCTAATGAACTAAAAAGACTGCTACTGCTTCAGGAG
ATAGTGTGTTTAAAGAGCAAAATTACTTACTGTGGTGATGATGCAATCTT
TCTCACTCCATTAATGTCAACTGGCACTGTTTCTGACCTTATACTCATGA
GATTAAGAAGACTTCTCATGGTGGTCTCGACGGAAAGTATAAATTTTGAA
CTCATTGGGGATGGAGCATCAAATACTCCCAAAAAGAAAGATGTCGAAAA
GACAAGTGGAAGTTCTCGAAAAGGAAAGAAGAAAACTAGTAGCTCGAAAA
AGCTATTAGCGTCTTCCAAGTCATCCAAGGTATAGCTCATTCATGATCTG
TCTCTAGTTTTTTCATAGACATGGGGCTTTATGCTTCACCGAGCAAATTA
GCTAGCCTGACTGAACAACTTCTTTCCAGGACAATGGAAGCAGTAGCACA
GAAAGCCGAAATTCTAGGGTCATGCCTAAGTCTAACCAGCGGACTCCATC
TGTTCGAGGCACTAGTATTGGACCTGCTTCTGAAGAAACTCCTTGCAAGG
AAATCGTACCAACGCCAAAGGTGGTAAGCATACTTTTCTCTCTTTTGCAT
AATCCTATTTTTTGTTTATTAAGTCATGACTTACAAGTGGCATACTTTAT
ATCTTAGGAGCAAGTTATCAGGTTGGGCGACTGCAATAATCAGTGTAGCA
AAAAGAAAAACAAACGAAAAGGGAAAGCAAAACTCTCTGATCTGGCGAGA
ACTGAGAATCCTGGGCCAGGCAGATTGAGGAAAGCTGTTGCTCATGCCTC
TACAGAAGCCGTGTATAAATCTGCTGATGCAATAGATGCTCCACCTTGTG
TCCCATCGCATGTGAATTCTTCCAGTAATGACATCCCTGAAGCAGTCGGT
TGCTCTGACTCTTCAAGTACCTTTGATGGAACTGAAGAAAAAGACATCAG
AAGCAGTACAAAGCTGGAAGATTCCTTATGTTCTTCTACAATTATCTCAT
CAATAACTACAAAGCATTGCCAGAGTGCACACAAACCTGATAACTTTAGT
TTGAATGAGCAGGGCCCATCACACACTCTTCTAAATGGATCTATAGTTCA
ACCATCGTTTTGTTCACCTTCCAGAAGTGATAATGTTTTATCTGGTAATC
CATGCAGAAACTCTGTTGACTCCTTGGCAAGATCAGCACAGGATAAAACT
GACTGTGATATAACACAGGGAGCTTTGCCCGGACTTGTTCCTGGTGTTGG
TACAGGATACGAGAAACACGTGGATCATAACTCTGTAGTGACAACCGATA
AACTTTTACCATCAGTCATTCCTGCCAACATTCTCCAAAGTGCTCTAACT
GACAATGGTGCTGTAATGAAGAATGGCGGAAGTGAATATTACGCGTTCAA
CAGGAACCTACTGGGAGGAACATCATATGAGTGGCCTAGTGTAGCACCTC
ATTTTGTATCTCCTGAACTGCAACAGCGCCCTGCTGCAGCAGACAGGCTG
CATCTTGATGTTGGTTACAGATGGCCTACTCAATTTGACCAGCCTTTCCT
ACCTGCCAACCATCAGGTTAGAAGCTCGCCTATTGAAGCTGGATGCAATC
AAATGTTATCTTCTCGGTCAATGCCCTTGAGTTTTGACTGGCCTCCTGTT
TTCAGAGGTTATGGTAAATTGACTCAGAATGCTGCTTTAAGTTATGATCC
AGTGTTTGCCCCACATATGCAGTCTTCTGCCTGGCCTGGGTTTCCTGCTC
AACTAATGCAAAGAGGTGGCATTTGTAGTGAAAAAGATAGGAAATATTTT
GGTGATAGTGACCCAAGAAACACATCGGATGTTGGCGATGATGCTGAAAG
CTATTGGTGTTCTGAAGAAGAATCAGATGGCCATGCCGTTTCTGGAAGAG
ACATTAATCAATATTTTGGTGGAGGCGTGATGTATTGGAGTCCTGCAGAA
CATGCCGGAACAGGATTTTCGAGGCCACCATCTCTTAGTTCAGATGACAG
TGCTTGGGCTTGGCATGAGGCAGATGTTAGTCGAGTTGTCGACGATCTGG
CTATTGGGATTCCATCAACATATAGTGCATCATCACCACCATCAACTCCA
TTCTGTCCCCAAAACGAAACTTCTGATCCTACCCCTCAGCCTGGTTGTCA
CTCAAGGGTAGGTGCTGACAACAATAATGAAGCTTTGCATGCTCCATCTT
CCACTCAAGACAGTCCTGAAGATAAGACTACTTCGGCTGTGAAGACTCCA
TCTTGTGCCAGTGAAATAGTAAAGGGAGATACATTACCATATGCAATGTT
GCGTCCAATAGTTGTTCCTAATATATCACGAAGGTTATCAAGATCTGACT
TTAGGGGTGGTCATGATCACAGGAGCCCATGTGTGTCTTCGGCCAGGAGG
GATATACCTCTTGTAAGAAGACCTCCATCACCAGTGCTACTTAGTGTTCC
TCGCGTTCCTCGGCCACCCCCTCCTTCTCCTGTTGGAGAGTCAAGAAAAC
GTGGATTCCCAATTGTTAGATCTGGCAGCTCAAGCCCGAGGCATTGGGGG
ATGAGAAGTTTGTTTCCTGACGATAAAATATTCAATAGGGCTCAGTTTTG
CTTGGATGGTCCTGAAGTTGTTTGGCCGTCATGGGTGAATAAAGGCACTA
CTACTGGTACACTAGTGCAAACAATTGAGGATACTGTCTTGCAGGATCAC
CTTGTTAAGATTTCACACCTTTCTCGTGATCAACATGTAAGGAAGTGATT
ACCGTTCTTCTATTTTGATAAGTATTCGCAGTGTTTATGCCTTCCTGACA
TATGTTTTTGCAGCCAGATGTTGCACTTCCTCTGCAGCCATCTGATATGT
TAAATGGTTCATCTCACAAGGCATCCCTCTCTTTGATGCACAATGCTCTA
CATGAAGAGATCGATCAATTCTGTAAGCAGGTATTCTTCCTTATCTCCTG
CCTTTTGCATCACAACCTTCATGAGTGTGTCCTATGCGGTCATTAATCAC
TACCCTGTTGCCAAGTAATTGCATGTCGTGCCTTAGTTTGTTCCTGTAAA
ATTTCTCCTTCGATGGATGTTGATTCTAGTCATAATCCTTGCAAGGTTGC
TGCTGGGAATCTGGTGACGAAGCCTTATATAAACTGGGCTGTCAAAAGAG
TCACACGATGCCTACAAGTTCTCTGGCCTCGCTCACGTACAAATCTATTT
GGCTCAAATGCCACCGGTTTGGCTCTTCCAACTAGTGATGTAGATCTTGT
GGTTTCTCTTCCCCCAGTTCGAAATCTGGTGAGTTGGATGACCATCAATA
GCTTTCAACATGGTAGCTCAACTGCAGTCATCTTCCTGCTATCATGAAAA
CTAAGTCCTAACTGTTTCCAGGAACCTATTAAAGAAGCTGGAATTTTGGA
AGGCCGTAATGGCATAAAGGAAACATGCCTCCAGGTAAATAGGTCTTTTG
CTCTCTGGATTATGTAATAAGTGAATGTGCTATTATCAGAAACGTATTGA
GATGTTAATGGTTGATTGTGTTTGCGTGTTTGTCTTAAACTGCGGTTTCA
CCATAGTTGCAACAATATAGTATACAACGACATTTCTTGTTAGAATTATG
CTAGGAAATAAATGAAGTATTAAAGCGTTTCTGATCTTTTGGTATGTGCC
TTGCCCAGAGGGAAAAAGTAAAGCTGATCTTCACTGGTCTTTTTTGTTTT
GCTGTAGCATGCGGCAAGGTGTCTTGGAAACCAGGACTGGGTTAGAAGTG
ATTCCCTCAAAACGATTGAAAACACAGCAGTAAGTCATAAGCGCCTTTCA
TTTGCTAGTTCGCCAGCTATTCTTTTTTCCTCATTCTCTTATAAATAAAT
CTGCAGATACCTGTGATCATGCTTGTAGCACAAGTACCTTGTGACATAAA
TATGTCCACTGAGTACCCTTCTGTTCTGGATAGCTCACAAGAAAATCCAG
TCAACATGCTAGGAGAGCAAGGGAGCCCGCCTCGTTCTGACAACTCTAGT
TCAGAAGGCAGCAACACGCTTATGTCCTCCAAAATGAATAAGGATGATTG
CGATATTGTGAAGTCAATTCGTCTTGATATAAGTTTTAAATCACCATCCC
ACACAGGACTGCAAACTACCGAGTTGGTAAAATCAAAGGCCTACTATCAA
TCTGAATATTTTGAATACAATAAGTTCCTCTTTCCTTCCATTACTTATTT
TGATAGAGATGCAAGTGGGTCACCATTAGGGTACTCTCTATCCTCTTTAG
TTAAAAAAAATGAACTGACTTTTCCAAACTGATGATGTCATTGGAAAAAT
TAGTTCATTTTTTTGAACTAAAGAGGGTAGAGTGTACCCTAATGGTGACC
CACTTGCAGCTCTAGTTTTTGAGATCTTCTATCACAGTTTTGGCACTCCG
TATTATTATCTCCAATTTATTGTAACAGAAAACCAAACTGCATTTTTGTA
ATACTGAATATTGTGAAGCGTTAGTCATGAGCATAGCATGATCATCGAAT
ATAAATACACATAATATAATGTGGAGTGTTTCATTGATATGATTAAGTAT
GTCCTTGATTGACACATGTCTCTTGTACTGCCTTAAATATCTTGTCTAGT
GACTCCTGTGTAATACTCTGTATTGCAGTTTAATATTGCATAATCTATGT
GTGAAGTATGATATTAATCCAAACCGTATATATGATTAATGCATAAATTT
GCCATCTTAAATGGCTTCGTGTCAATCGTACTTGGTTTGAATTATCAGCT
TGCTCTGTCAGTTGTCACATGTTCAAAAGTAGTAATGTTTTCCCATATAA
ACGTACTCCCTCCGTTCCAAATTATAAGATGTTTTAGCCTTCTTCTAAAA
CGCATGTATCTAGACGCTCTTTAGTGTGTAGATTCAGAGCAAAATGAGCG
AACCTACACACTAGAAGACGTCTAGATACATGTGTTTCAGAAAAAAAATC
TAAAACATCTTATATTTTGGAACGGAGGGAGTAGTTGTTTTTAGCTTGTT
GCTCTTACATCTTGCCTCAGAGGATCCTAAGGATAAGATTGTCACTTGTG
ATTTCTGCTTTTTAATGATGTAATGATGATTGTTCAACTAAGAAAAAGAG
ATGCAAGAGCCAGCAGTTATAATGTTTTTTGTTTATGTAGTGTACAGCGT
TTGATGATTGGTCCTGGTTCCTTTTCTCAAGTTCAAGCCATACATGAATG
GGCAGTTAGCTAGCTGCTTGATAGGTTGAACCATATTATCTAGACATGAC
ACTACCACATGCTTTGGTGCCCACAACATTATGCTTGAAGTCATGAATAA
GATTTTTTCAGGACTAGAATTATAGATTCATGTTTCCCCAGTCTATTTAT
TCGCTTTCTTCCTTATGTTGCTACAGGTTCGTGAGCTGACTCAGCAATTT
CCTGCGGCTTTACCCCTTGCCTTAATTATGAAGAAATTTTTGGCGGACCG
GAGTTTAGACCACCCATATTCAGGTGGTCTAAGCTCTTACTGCTTGGTAT
GTAGATTTTCATAATACTCATGTGATTCCTTTGGCGGCAATTTATGGCTA
TTTAAGTTTGTGTTTGCTTGATAACTTTATTATTCACGAGTGCGCCCATA
AAGTTATGTTTGCGTATGTACTCTTCCGATCATTGCTTTTGAGTTAGTAA
TGATTCTCTTATTTTAATAGGAACTTTCTCCTTAATTTTATTAGGTTGGT
CACAGTTGAAAGTTCTGTACTTATGATGATTTAGTTAATTTGTTAAACCT
TTCCAGAGAGTTTAAAAAAGTTCCAGCAGATAATATGTACTCATAGTGAT
TGGTAATGTATGTCTAACAGCAGCCCAAGTATGATCCGCAACTAACTTCT
ACTTTCTTATATCTTTTCCATCTTTGGATAACATACTTGAATCTTACCAT
CTGGTCTTACTTTTCATGGCAGCATGTTATATTGATTAATGACGTTTTAG
CTCATTCAGTATTTTTCTGAGTAAAAAAATGGTACCTGGACTCTTGAGAT
GGCAGGTGGAAAGAACTTATTCTGTAACATCCTTTGCAGGTGTTATTAAT
CACTCGTTTTCTTCAGCATGAACATCATCTTGGTCGGCCTATTAACCAAG
TAAGCTGCACATCTTAAATAACATAGCTCAGTTGGTTCTGTATCATATAA
ATTATATTTTACTAATCAGTTCTCTTATCTATACTATTAAATTGGAAAAA
TAACCCCTCCTCCTTTTCCTTTTAACAAGTTCACATTTTTCTTGCAATCT
GCCACTAATATTGCATTCCTGCTGTTTTGTGTTTGGCAGAATCTGGGCAG
CCTTTTGATGGATTTCTTGTATTTTTTTGGGTAAGGGAGTACACATGAAT
ACTTTACTGTTCAGCACACTAGGTGAACACACAAGTACATGATGTAGAAA
AACTGTAAAATGTGGCGGAATGACCGTGTAGGGTCATTGTGTATGATTTC
GTTTTCAGAATAGCTAAATTTAGTAATATATTGGTGCATGTGATATCTAT
TTGATGTCAAGCATCCTGGTTGTCAGGAATGTGTTTGATCCGCGGCATAT
GCGAATTTCCATCCAAGGAAGCGGAATTTATTTGAACCGAGAAAGAGGGC
ACAGGTAATAAAAGTCAATATCAGTGATACATCGGTTATTTCTATCATCC
TCTGCCTATAGTAATTTTCCATATTGTTGATTTTGTAGCATTGATCCTAT
TCACATTGATGATCCTCTTTGCCCTGCTAACAATGTGGGCCGGAATTGTT
TCCGGATCCACCAGTGCATCAAGGTTAGTTGAAATTATCTTTGCTGGACT
GACTGAATCCATCTTTTGCTGTCTAGAACTTTTGGAGTCGTGGCAATGCC
ATTTTCTGTGATTATGTTTATCTTTGATGCGGTATTTTTTCTGACTGGGG
AATCTCCGTATCGATAATTCAGTTTTTGCTCACAACTATTACTAGTGTAG
TACTCTGTTTGGCCTTTGAACATATAAATATCCATGCGATAATCACAGAT
TAACCACTCCTATTGTTCTATCTTGTGCATGGCAGGCTTTTGCTGATGCT
TTTGCTGTTCTAGAGAACGAGCTACTGCAGTTTACTGCAGAAAGCAACAT
GCCTGCATCATCATTCAGCCTACTGAAGAAAATAATCCCAAGTATTGATT
CTAATGAGTTGTAGCAATACCTCTGATATCACAAGCTACAGGCACTCTTT
GGTTGGAATGGCCCGTGCTGCGTTCTAGACACTGAAGAAGGTTAGTAGAG
ATCAAAGTTACATGTTGATCTTAATTCTAGGTTATTTTTTCCTTCTGGGT
CCATCTTAATGGTATGGATTGAAGTTACATGTTCTAGGTCACTTTATTAT
TTCTGGAAGGTCAAAAGAACGTTGATTGCAAAACCTTCGTATTCAAGTGT
TCTATTTAGTGCAGGCTTGTTCCAGTGTGTGATGCTCTCCTCTTGCCTCC
CGCTGCCGAGAGCCTGGGACCTCTAATCGAGGTATAGGCAAGAAGGTGCT
GTACACAGAAGGTACTGTACATGTCACCTCTGTAACTTGAGCACATCTAA
TCACTTGGTAATTATATCTTATCTGCTCGATATCATGAGCTATAGATCCT
TCACCTCAAGTCGATATTTTGTGTTGCCAAGGATGTGGAAATGGACTCGC
TCCATGGTATGTGATGATAGACCTGCAAGGTCAAGGACGGAGCAGTATAG
CAGGTCTGCACGGAACTTTTGAACCGGACGGAGCAAGTGGGATAAGCTCT
AGCAGAGCCTCTACATGTTTCCTGATGCATCTATTCCCTGAGCCTCAGAA
AACGATGAAGAAAACTGAGACAGTCATATCCATATGGAGGTACAAGTCAT
TTGTGCCTTTTGCAGTAAACATCGAGGAAATGCTATGGTGGAAGCTACTC
CTTTTCCGGATGGAAGAAGGAACCTGCTCCTGTGCTGTAGTTGGCACCGG
ACTTTTGGTACTGGAAGAATGACAGGCGTAATGGAGCAATTTTCCAGACT
TCTGTGCTAAGAAAGAGAGATCCTGAAGAGGAAGATTGTTCCCTGGACAC
ACGAAAGGGTAACGGAAGATTATTGCCGTGATCCCGAGTTTCAGATTCAT
CATTGCGGTTACTCGCTGATGGTATCGCCGCAACATTCTACAAGTTATTA
ACTTACTCTTTTGTGGAAAGAAGAAATGCCAAGCTTTATTCAGAATTTTG
CAAGGCTTGATGGAGTAGTTTTGGCTCATTTATGCATAATGGTTACAATG
TGAACGATACATTTGATAGATTTTATCTACAGTATGTGCAGATGTAATTG
AGCTATTCCTTGTGGGCTCATTTATAAAGCCACGCGTAATGGTTACGATG
TGTCGCATTTGATAGATTTGAACATATAACATGGGCTAAAGAGCCCCTTT
A

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.