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GrainGenes Sequence Report: AE046508

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Sequence
AE046508
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE046508
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTACCCGTCGCCGTCGAGGGCGGTCGCCGACGCACCTTCCTCTCTCTCCT
GGCGGCGGGGTTCGAGTTCGGCGGCTCGGCGCGGCGGAACTCCAGCAGTG
GCTCGGCGCGGCGAAGACAACGGAGGAGCAGCTAGGAGGCTGCGGCATCG
TAGCGGGCAGCGACGGTGCCGGCCCGACGGTTTTGTGCGCGTGTGACAGC
GCCGGCGAGTGCGCCCGGCTCGAGCGCGCGGCGAGCCTCCACCAGCGTCA
TGGAGATATGCCATGTATTCCCCGTGTCAGATTAGTGGCATGGGGATTGG
GTCCGGTCATTGATGCCGCAGATGGGGAATTTTTGACGTCTTAGCTGCTG
ATTTTGGTGATTTGAGGGAGGAGCATCTGCACGCTGGGAGGATCCAGAGG
AAAGAAGGATGGAGAGTTTGGAAGGGAGGCCACAGCCCACAGGAGAGGTG
AAGGATCGGCATATCGGCTAATCATGTTGCTGCTTAGCCATGCTAATTGG
AGGCACATTAAAATTATCTGGTGTATAACCTTCTTGCATCTGCTATTACT
GGTTGCACGACTATAACTCTTTCAGTGTAATATAGATAGACTATGCAGAA
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GTGATGTGGTTCATGATCGGATAGTATTCAACACTTGCACTCATATGGGG
TAAAGTAGCACTCTAGTTGTCCTTGTTCTAGCCTGATTCCTCGTACCAAT
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TCTTCTAAGCTGTCCACAAGGAGGAGCACCAGCAGAGCAAGATGGGGTAA
TACTACTATTTGATGCAGAAAATTCAAGGCCGGTTTCGTCCTGGTCTGTA
AAGAAGGTATGATCGGTTAAATTATTATGTTATTATTATAACCAGCTATT
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ACTTTTTTCTTCTAGGCTGTTGACCAATCCATTCTATTATTCAAATCAAA
TAAGTGGGTTATGTTCGTAGTTAGCATTCAATGGTCCATTCGCCGCCTGG
TTCTTTTAACAACACAATGGCCCATCGTGTGCTTAGTTTCCCGTTGTTTA
GGATCTGCTATTTTCTTAGTCTGGTTTCTTCTCCTCCACTGTGCATCTAT
CTCTTTTAAGGGGAAATGACCAATCAGTGTGTATTAATGAATAGCTTTGA
TTACTTTCTCGTTTCAGGCAAAAGGAGGTAGCATTGCTTTTGTGAAGGAT
GATTGCTCTATGGATGCGGACACCAATGCCACGAAACATGAAGAGGCTTC
ATTGCTAGTTTATGTAAATGGTTCACATGAGTATGTTATCTTTGATCCCC
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GCAAGCGCACACAGAAAAGTGTCCAGGCTGATGAACCTGGTGAGTTTTTT
GTATTGCTTTTTTGTTCATTGTCTTAACCTGCTCAGGTTTACAACCAGTA
TGCTCTTTTCCTTTTAAATAGCATCAAATATCTTAGAGGGCGTGGTTCTG
AAAATCATTACTTTGTGCATGGAGAAAGATATTTTGTTTGTCGCTCTAGA
ACCTGTAGAAATTTTTCTTATGCTCATATCTGTCATTGCAGCACGGATCG
ATTATGCTTCTATCTACGGAACTTCCAAAACTGGAAATGAAGAAAGAGGT
TTCAGATACCATTTATCCCATCAGAGAGACCTTGGGAAACTACGTTCACA
GGATCATCTCCCGTTCTTCCACCTCTCACGAAACTATGTTCTGTTCTCTT
GGCACCATTGCTGGAGAAGAGACTAGTTGCACACGAGTGGGAAACACCGA
TATCCCATCGTATAATGCTATACTTGCTGGTTGCAAATGACAATGCACAA
GGGAAAATGAACATCAAGAGAACATACTCCTGGTGGAGGTAGCATTGACA
GATGTTCTGGAGCTGGCTCAGGACCGCGTTGTCATCGACATCGACGCCGA
TAGCAACTGTTAGTGGTGACCGAATCTGAGTTCTTTTTGTAGTGATGTTT
AGGAAGTGTCGGTGTACCGAGCAGGGGGGACGTCACCGCCGTCGGCCAAC
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GGGAGCTCATCTACTGGGACTTAGCCAGCGCTGAGCTGGTGCGGAAGGTC
CACGTCGGTCTCCCAGTCCACTCCATGGTGAGCTGCTCATCCGCTGTTGT
ATGCGAGCCTGTTGGTTTGTAGACGAGATAAATGGGGCTGATGTTTTGGA
ACTGTTTGAGTGCAGGTGATTCCCAACATAACCAGGACATTGAAATCAAC
CGAGGTGTATACTCCTTTCGCATTTGTCTCTGTGGAAGATACGAGTAAGC
CAGCCAATAATAAGAAAGCATTGCGCGGGCAAATTAGAATTTATGACTTG
ACAAAAGGGCACCAAGTGGGTTGTCTACTGGCTGAGGTGAGGTTTTCACA
TTATAGTCGCACATTCCCTTGTTGCAATGAGTATGTACGGCATTTTTCAA
TGCATAAAATTTCATAATGGCATTAATAATTTTCTTTGATCTAAACAGGC
ACGCAACCAGAAAAGATCGTCGCAAGTGTTTCTGGAGAATTTTGGGCATT
GCAAATAAGAGACAGCTCTATATATGGAGCATACCTATGAAAGGTTTCAA
GCCTGATAAGGAAAATAAAGCTTTGTCATACGGAAAACTTGAGCACCCTG
GCCTTCCATCCAAGTGAGAGAATTGTGGCTGGTGGTGTCGCAACAGGGAG
GATCTTAATTTGGAGAGGTTGTGTAAAGGCAAAACTTTCTGGAACTCCTG
GTGCGGTAAATGAGTAAAGGGATGGTGTAAGGGGTCAAGATGATGCAGAT
ACTTGCACTAGATTACATTGGCATTCTAGCGAAGTGAAGTTTCTCAAGTT
TGCCTCTGATGGAGCTTACTTGTTCTCAGGTTTTGCTTACTGGTGCATTT
ACTTTGTATACACCATTGTTACACCACATGTTAGTCTCTGTATGTTGATC
CTGTTGTCTAGTCTTATAATTTCACTGACAAACTTCTTATCTTAATAGGT
GGTATGGAGGGGGTTATTGTTGTATGGCAACTAGATACTGGAAAGAGAAG
GTAAAAGCCATGTCTAGGATCTCCCCTTTTGTTCTTTGTAGATTTTCCAG
ACTCTTCCATTTCCTGTGTAAGTATTAATTCTTTTACCTCATGTATGATA
TTTGGTGTATTTACAAGAACCTGAGACCTATTTGTCTTTAGAAAATTTAT
TTGTTGATTTATGAAGGTCTCTGAATCTGATATTCCAGCATGTCATAGCT
ATCTATAATGGAAATTAATTTTTTTCAGATCTGTAGACATACTTATATTT
TGCTCCCTTTCTTGGTTGAGAGTAATAGAATGGAAGTTTATAAAATAAGA
CCACCAGATTCTGAGTAGGCACACCTGGTGTGGCATATGTAAACATCCAT
GCTGTCATTGTGCATGCTTTCATAATTTGTTATTGGAGTTTCCTTATGCT
TTATAGTTTGGACCCATGATTCCGATTTCCCTCCTTTTCTTGTGTTGCTG
CTAAATTTGCACTAACAGTGTTGCACCTATAGTTTTGCTTTAGTCACTAA
CTAGCTCCACATTGTGTCTATATTTAATACTGTTGAGTTTGTTATATGTG
TTTTGTCGAACCTCCTTGTAAGAGGGTCGGGTGCTACTGTAGTTCATAGA
AGGGAGTCAACCCTGCTTATGAGGAAACCAGGCCAGAAAACCTTACAAAG
CTCGGTTAATTAGATGAAAACCTGGTGAAACCCCAGACAATGTGCAAGCT
ACCTAGCTAATCTAGGTCTGGAGCACTGCCAGACAAAAGCAAAACTAGTG
AAGCAAACTAGCGTAGCATGCGCAAACAAAAGCATACATACCCCTCACTG
ACATTGCCAGTCGTGTCATCGTTGTCTCCCACTGCACTAACGACCTGACC
GCTCCAACTTTATCAGTTTATTCCCCCTCCCCAAACCAAAAACCAAATCC
GCCAGTCAGATAGATGCAGGAGAGAAGACAGGTCCTAAGGGAAGCGGATC
TTGGTCTCCAGCTTCGATCCCAAAATTAAGTTTGTCTGGGTTCCTGTCTG
GTCATACCAAAAACATCCTTGGAGAAATGTTGTGCCCTGGTGCTAGTATC
AGGTGGTTTCTGTCAACATCAGTGGAACATACTGAACTACTGTATAGTTC
GGCTGGGATGAGGATGATGATTGATAGAGTGAGGTTGACCGCATTTTTCG
TTCATGATTGGGCCACGAAGACTGTTTCCAAGCTACAGTTTTGTGCAGTT
ACCAATTTTTGTGGCTCATTGTTTGAGTTATTGCTGGACTTGTTATTTCA
GGTTTCATGTACAAGTAACCAAGTCCATCTTCTAAAAACACCTAATATGG
AGGTCCTGAAAACCATTTCTGGAATTAACGTTTGTACATCAAAGTCTGCA
GTTCTGCCATTTATTAGTTAATGGCAAGAAATGAAAATGCCAGCTTTCTT
ACTCTTTGTCTGTTGATTATTCAATATGCTTAAGCCTTCTGGTTATATTT
TCCCAGCTACCTATTGCTTCCCCAGACCCGAGTAGAGGAGATGTGCATGG
ATTTGATTGCACTAATGGCCTTGTTGCTATACCAACGGAAGGTTACTGTA
TACAGTTCTGCAGTTTGTTTGAAAACACCGAGGTTTCAGAGGTAAGACAA
CCAACTTAAGAGATTTATTGTGTGAACATTTTAATAAGATTGACCCCAAT
ATTGTTAACCTCTTCAGGTGCAAGTTTTTGAGAGGAACTTTCAGCCTGTT
GATGATAATTACGGTGCTATACCTTTGTCCCATACTGTCAATGCTTAATC
ACTTACGTTATCTTCTTTATATCCTTCATTTAAGGCCTTTTTTATCATTT
CTCGTCTCATGGTTATATTGTATCTTATTCATGTGATAATATATGGAAGC
ACCAAATAATCTGCTGTAATCCCTGTGTCGTACTTACTATCATACATTTC
TTTCATTGGGATCTCTGGCATAAACTGCTCTCTGTACATTGTGGCCGAAT
AAGTTGTCACTTTATGTTTGGTGTTCGTACTTTGACATGTGTTTCTTTTT
CAGAAAAATGAACATCAAGAGAACATGCCCCTGGTGGAGGTTGCATCGAC
AGATGTTCAGAAGCTGGTCTCGCCGACATGGACGCTTTGTCAGGTTTCAC
GAAATCATGTACCTGGTGCTGGTAGCAAGCGTCAGTGGTGACTGAATCTG
AGTTCCTTTTTGTAGCATTGATATTTAGGAAGCGTCAGTCCATTGAGCAT
AGCAATATTTTTCTGAATATCTAATTTTTTCTGTTTTTTGGGTGACACGC
GTGATGTTGTGATTTAGTGGCAGAATGCTATCCTGGGAAGTGGGAAGTGG
TGGGAAATGATCAATTTGAGTTCTGTTTATCATATTTAGCAAAAAAAAAA
TTGTCAAAAAAGTAAGTTGAAACAAAAAGCCAGGTGCTAATATCTAGCAC
ATGCCACCAAGGGGGATGCAATTTGCGCTTTTTTTTATTACGACTGTGCA
CCTCGCTCTCGGAGGAGATCTTTTCACTGCATTTATATATTTTGTCCCTG
CGCACTACTCGTTTGTGCTGGGTCAGGGACGGTTGGGCTCGGAGGCCTCT
TTTGTTGTGCTCTTGGGCATCTTTTAGCAGCTGACAGCCGTGCATGTCCC
CTTGGAGGCGATGTAGTCGGCAGGATCCCGTCTAATAAACCGGTCGCGTC
GTTACTGAGTTTCCGGTATGGGACTAAAAAGAAAAGATTCGAATGTTACG
TTTAGCGTGTCCCGCAGCGGCAGCGGGCCTCCGAAAAACTCGCTAATTCT
CTGTACCGGTCGCTGTTAGCGGGCCTCCGCACGTTAGGTTAATTCCCCGC
AGGCCCGTTACCCTTACGCCGCTAATTCTCTGTACCGGTCGCTGTTGATG
GCAGTCGCCGAGGGCTCCTTCCTCTCTCTCCTGGCGGCGGGGTTCGACTC
CGGCGGTTTGGCGCGGCGGAACTCCGGCGGTGGCTCGGCGCGGCGAATAC
AACGGAGGAGCAGCGAGGAGGCCTCGTGATTCTGCGGCACCGTATCGGGC
AGCGACAGTGCCGTCCCGACGCCTTTCTGCTCGTGTGACAGCGGCGGCGA
GTGCGCCCGGCTCGAGCGCGCGGCGAGCTTCCACCAGCGTCATGGAGACA
TACCATGGCACGCCCCGTGTCAGATGTGTGGCATGGTCATTGATGCTGCA
ATGGGGACATTTTTGACGGCTTAGCTGCTGATTTTGGTGGTTTGAGGGAG
GTGATGCTGCACGCTGGAGGGCGAAAACTCGCATCGTCGACGTCCCCGAG
CTCCTGGTCCTCGCGGCGGAGACTCGCATCGCCATGCTCTTGTCATCCCC
GCGGAGGGACAAGGGAGGAGGCGATGCTGCTGACATCAATATAAGTAGTC
AGGTTGTTCTATGCACAATGCACATGCACTTGCTCTACTCCTCAAGATAC
TGAGTGACGAGATTAACAAACCCAACAACATTTGGGCCAGTAAATTCTTT
CAAAATAGAACGGATTCAGTAAGCATTTGTATCTGTTTCTTTGAAGGGAA
AATGACCAATGCCTGTATTAATGCAGAACTTTGATTACCCTTCTCCATCT
GGCAAAATGAGGTAGCATTGCTTTTGTGAAGGATAGTGTAGCTGACGCAG
ATCGGAAAAAGCCTCCCGGGTCGCATCCGCCCGGGCAACTCCGGAGGAAC
CCAAAAACCCTAGCCTCCACACTCCCGTCGTGCCCTTCCTGGCCGTTGCC
GCTGCCGGTGGTGGTGGCGGCGCCCATCCCGCCAAAGGCGGAGGGAAGAG
CGGCATGCCCAGGCTGATCCTTAGAGCAGACGATCTCGGTGTCGAGGGCG
TGCACGGGTTGGTCGGTGAAGGAGAAGGTGAGGATGGCATCGACGACGGG
GCTAGGGCTGCATGGACTAGATCGCCTGGCGGCCTCCGACGCGCTGTCTT
CGATGGGTTCGATCTAGTCCAGCGGTAGCCACCCCGCGTGTTGACATGAC
ATGGTTGAGGATGGGAGGAGTGGGGCTATGACAACGGTGGTGCCTCAGCC
CCTCGAACTGGTCACTTCTCCTTGTTTCGACGTCGGCTAGTGCTGAAATC
GCCGTCTCCTCTGCAACAGGCTGGTGGCATGGGGGCTGCCAACTTCATCT
GAATAAAGGTGGTTTGACTCTACATTTCTTCGAGCACCAAGCCGTTGATC
TAACTCATGAAGGCTTCCTTGATCTTGACATCGACGGGTTTCGGTCTCCC
TTTTGGAGTTTTTCGCAGTTTGGTGTATGATGTCATTGAATTTCTAGATC
GGAATCTATCTGGTCGCGCACGCCCTTAATTTTTGCGAGTGAGGCCTTAC
GAGGGTTCGCCGTGAAGCTTCACCGTCTTGTCGGTGTCATGGACATGTCT
ACTTTAGATTCCATGAAACTAACAGTGGAGAAAGTCATGGCGAATCGGAG
GTTTGTAATGGAGGAGAAGTATTTGGCTGTGATGAAGACTTCGCAACATA
GGTTCTTCCTGTGTTGTCGGGTGTTCGGAGACTTATAGTAGCAGCCTTGG
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GGTTGTACCTGGCAATAGCCTTGTTGAAGATATTATTTTCGAAACTCGAA
CTTGCTTTAGGGTGAAAACTCCAAGATCTTCGATCGGTCGACGACAACGC
TTGTGCATTGTTTCATTCTTGGAGGCATTGCTTTCAGAGCGTCTTGTTTG
TAGTACGAGTGTTGTATTCGGTGGTGGTTAAAATTTTTCTGTTGCAAGTG
GTTAACTTCACGGCAGGATCTTTGTTTTACTTTCTCTCTTTTTTATTTTT
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ATTGCTTTTGTGAAGGATGATTCCTCTACGGATGCAGACCCCAATGCCAC
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ATTAGATCTTTGATCCTCGAAACAACAGGGAGTCACAAACTGGCAAGCAC
GCACAGAAAAATAATCAAACTGATGAACCTGGTGAGTTTGTTGTACGTCT
TACTTGCCTAACTTGCTTATACTCCCTCCGTTTGGAAATATAAGACATTC
TAGCTTTGTGGAACGAATGTATCTCGACACCTTTTAGTATATAGGTTCAC
TCCGAACCTCTACAAACCTATACATTAAAACACGTCTAGATACATTCGAT
TCACAAAGCTAAAACATTTTATATTTCTGAACGGAGGGAGTATTTATGAT
CCGTATTTTCTAGTGGGACGGTTTATATGGTACTTGAATATCTTATGACA
AGTTGACACCTCTTCGCTTGTTATATGGCATCAAATACCTTAAAAGAGAA
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ACTCTAAAACCTGTAGAAAATGTACTCATTTTCATCTCTCTTCTTGCAGT
AAGAATCGGTTATGCTTCTATGTATGGTAAACTCCCAAAACTAGAAATCA
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GAGAAGCACCGAAGTTTTGTCCCATCATATTATTGGCACACTTGCTGGTT
GCAAATGGCAATGCACTAGGAAAAATGAACATGAAGAAAACATGCTCCGG
TGAATGAAGTATTGACATATGTTTAGAAGTTAGCCCTGAACTATAATATC
ATCAACAGTCACATACATAGTCATGCACCTGGTGGTGATGGAAACTGTCA
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TAACTAAATCCGTTTTATTTTGGGTGATAAATGTGATCTGGTGGCACAAT
GGCTGTTGCAGAAACAGGGAATGTTCCGGCCAGTAGGAGAGTGTAGGGGC
AAGATTAGATCATGTTATGCCAACTTCAATGATTTGGAGACTGAAAAATT
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ATGTTCTTTTAGTCAATTCTTTCAGAAACACCCCGTTGATTATTTGAGCG
CGATGTATATGTTTGAGTTTCATGAGTTTGAATGCGGAACGATGCACCGC
AATCTGGGCCTGCCACTCACTCGGTTACAGTGGTGGAGCTAGCATGTAAC
GGTTGGGTTGTGAACCCAATGAAGTTTCGCTAATCTAGACTACATTGCTA
CTTAGTACTATTTGTCACTTAGTTAGACCATAGTCATGTAGAGATGAACC
CATTTATTTATTTTGCTGAATTCGCCCCGCTCGGTTATGCTTCCATTAAA
ACCTGGAGTTGAACAAAGTTGTTTCGGGTATACCTCTCATGAAATTATGC
TCCATTTTCTTGGCATCATTGCTTGCGAAGAGACCAGGGAGGAGCACTGA
AGTTTTGTCTCACCGTATAATGGTATGCTTGCTGGTTCCAAATGACAATA
CACAAGGGAAAATGAACATTAAGAGATCATGCTCCTGGAGTCCTGGTGAA
GGTAGCATTGACATATGTTGAGAAGCTGGCTCAGAACGCGCAATGTCATT
GACATCGACGCTTTGTCAGGTTACACGGAATTATTCACCGTGTTATAAAC
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ACATTTAACATGGAAAAACCTCTCCAACAAGAGAGAAAAAACCACGGGTG
TCAACCAGCGAAACTTCACTATATCCGGGAGTGTTTTCATAATGCCGGAG
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GCGGTGAAAACCTAGGTCTTCAACGACCCCCCCTCGCGCACGGACCAGAC
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ACTGAGCATAGAAAATTTTCCCTTCTGTTCAATTTGTAATCTGAACAACT
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TTTACTCGCACAAGCTCCTTTATCTTCTAGTGAGAAATTTGATCCACCCA
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TTTGAGCTTATACTGATTTATGTTAAGTGACACACGGCATGTGAAATTTG
AATCTTGTTTGCTTTAATTAGCAGAAAATTTTGCCCCAAATAACAACTTG
AACAAAAAGTTACAATCTATAATTATCTATTTACTCATTTGAGAAAACTT
ACTCTAGAAACATACTTCAAATATATTTGATAGACTTGTACACTTTGATG
CTCCTCACCAATAAATTGTTATATATTAAAATTAATGCACACATATATAA
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TAAAAGGAAAACTATGTTTATATATATATGCGAGAAAAGTAAAAATAATA
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TTTAACATTTGTCAACACATCTACATGCCTAATTCTGCTAGATATAAAAA
CATAATATAATTGTAATTTTGTTAAAAAATAATAATATAGTTGTAAAGAT
TGCAATGTAATTTTGTGTCCACAAAAAGGAAACTTATATTTAGTGACAAC
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TGCTTGGTTGGGTTCGGAGACCTCTTTTTTTATGCTCTTGGATATCTTGC
GTAGCTAATAGCCGTGCATCTTCCCTGTGTTAGCGAAAGTAATGGAAGAG
TTTCATCTTATAAAATAGTTATATTCTTACTAAACTTAGCTATGTGGTAC
TAAACTACCGAGAGGATAATCTGTCGTACGGTTAATTTCGCGCCCCTTGG
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TGGCATAGGAAGTTAGGCTCTGATCAAATACAAATTTTCTTAAGGTTTAG
AAACAACTAAAATTAGAAAAATATATACTTACTAAACTTGACTTACAACC
AATTAAAATCTGACAAACTAGTGCACAATAAGATGGATTTGGGGGTATTC
ATTGCATCATCGCTTTTGGTATTTTGTTCTTCCTACTTTTTTTATATCAT
CCACCTTTTGGCAGACCATTGCCATGGGGGCTTGCAATGTCTAGCCTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.