Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE004980

[Submit comment/correction]

Sequence	AE004980
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE004980
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATTTTCTTCACCCACCATATCCCGCCGCTGCCCTAGCTTTCGACCTTCGG CGACGCTCCCCTCCTCTCCCCTCCCGTCGTCTCCTTCCCCAGCGACGAAC ACCCTCGAAATCTGTGCCTGATCCGGGAACGGACTCCTAGATTCCACCAT ACGAATCCTCTTTCCCTCGCTGATCTCCTCCTCGCTGTTCGATCTGCCCG TTCTCTCGTCGATTCCTGACAAGATCTGAGCCCTCCTCCACCCATGGATC CGCGCGCCAGGTACCCTCCCGGAACCGGCAATGGTCGCGGCGGAAACCCT AACTACTACGGTCGTGGCCCGCCGTTCTCGCAACAGAACCACTACCAGCA ACAGCAGACGTCCTCGGCGCACCAGCAACAGTATGTGCAGCGCCAGCCCC AGCAGCATCACCAAAATCACCACCAACAGCAGCAGCAACACCACCACCAC CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTGGATGCGGCGAAACCAGATCGCCCACAG CCCAGCGGACGCGTCCGGGACCAGCGGTCCAAAGGCTGTGGCGCCATCAC CGACGGCTGTCGGCAACGATTCTAGGTAAGAAGATGGAAAGCGTAGTAGT TTGGACGGCAATTTGGAGGCTATGGTATCTGTTGCTTCAACACATAGTTT AAGCACCACCAATGTAGCTTGTGAAAACCAACCATATCCAGTGGGAGACG CTTCCTTTTCTGTTGCTAAGCAACTCACACCAGTTTTCTGCATTCTATGT TTGTAACTGGACTCTGATACGAGTAGTTTATCGACCATAGCGCAAGTAAT GAATCATTAAGTTAGACATGGTCGTGAATAGTCACTCCCGTGGACAAACT AGATCTGGAGATGGCCACCGAGTAACTATGCTCGGCTTTGTGCAGTTCGC AAGATTGGAAGGCCCAACTGAAGCTTCCACCTGCAGATACACGATTCAGG ACGGAGGTAATTCATGCCATCTTGATTCCTTTTTTTTTTGGTTTTTTTCT GGAATATGGGTACCATCTGTACCAGGAGTGCCTGAACATAAAAATATGTT GGTCGCCATCTCTACTTTGTGTAACTAGTCTTTTCTTTTTCTGATAAAAA ATCTACTCATGACTTCCTTCATTTATCATTGTTTATCTTTTGTTGCCTTA CATCGAATGCTGAATGTATTTGGTCTATGATTAAAAATTGGGGGGGAAGC TAGGTTTGAACATTGTTTTCTGAAATCTACAAGTTAGTTTCACACTAGAA CTCCGCAAATTGTTATTTACTTGCATTGTCAACATGAATAAATGAGAATT CGTCCTATGTTAGTGCAATGGTAATACTGGCATATGAACCGTAGTAATTT AGATTATGGATTTTTAGTTTTGACTATTGTTAGATCCCTTTGATCTTTGG TTGATGCCGTGACCTGGAGCTGGAAGGTGCTCTCAGGCCAAATGAACTGT CAGACTGCAGGTACCATAATACTGGTTTGCTGGTGCGTGGGAAGGGGTAA CAGAGGTACCAGAGGTACAAGATGGATTAAGGCTGAGCCATCTTTATCGA TTGCTTGGTTAGATAAGCCTTGGTTGCCTCTGTTTAAGTAGGATGTCTTA CACATGAGATTCCAACAGCAGTCCTATTTGAACACCGACTTGTTTCTTAA ATAACTGAAGACTTTACCTGATACAATAATACTCAACTCTCCAAACATCA CACTAATGCCGAATATGATCTAACCGGTACCAATCCTGATTGGATCCTGT GCTTGTGCCACTCCATCTGTCACCTAGTCACTTGCCAAGTGGGTGGTAGG GAACTTCCCACATAGCAACTGGAGTTCATTTTCTTTGGGTTATAAATGTT TCCCACACTTTGGTGGGGCGATGCAGTACCTCGGCTACCAATGAGGTTAT ATGGTTCCACACATAGGTGCTGGAAGTACATATTTAAGACTAAATGTGTC TTGAGTTTGCATTGTGGTATTGGATTTCATCAGTTAAATTATTTTGCTTG TCTTGTGTCATTGCTATAATTTTTTATCTTATGTTGAGTTAGTGCACTAT GTTCCTTCCTTGCTTTGTGTATTGCTGTGCTCTTTATTAGTACCTAATTT TGTTCTTTGCTCAGGATGTTACTGCCACCAAAGGAAATGAGTTTGAAGAC TATTTTCTCAAGCGAGAACTCCTGATGGGAATATATGAGAAAGGATTTGA AAAACCCTCTCCTATCCAAGAAGAAAGCATTCCTATTGCATTAACTGGCA GTGATATTCTTGCTAGAGCAAAAAATGGAACTGGCAAGACTGCTGCATTT TGTATTCCTGCACTCGAAAAGATTGATCAAGACAAAAATGCCATTCAAGG TTTGCTCTACACCCTCACTTGATCTGATAGATACTGTTTACAGGTCAAAT AGTTACCACTTCCTTGATAGTAATAGCTGGTAAATATTTCGACATGTATG TTTGTTTCCTCTCAACCTGGTGTTTTCTTTGTGTATGTGTGTGCATATGT ATACACGCTGGCTATATTACCAGAATGTTCTAATAATGCAATGCTGCCTC TTGTGATATGTAGTTGTTATAGTTGTTCCCACAAGGGAATTGGCTCTACA GACATCGCAAGTTTGCAAAGAGCTTGGCAAGCACCTGAAGATCCAAGTTA TGGTCACCACTGGTGGAACTAGCCTGAAGGATGACATTGTTCGTCTATAT CAACCTGTCCATTTACTTGTTGGAACGCCTGGGCGTATTCTGGACCTTAC CAAGAAAGGTGTTTGCATATTGAAGGACTGTTCAATGCTTGTTATGGACG AGGTAATTCATTATAAGCTTGTCTAAATACTGTCACATTACTTGCATTGT TTTGTAAACGAGTTTTGTTATATGGATTTTATCATCTTGTTCCGTAGTTA GTGTCTGTTCACTTGTATCTGTATGTGTCTGTTTGGATGTTTACTATACT TTTCTGTGCCAAAAAGTTTACCAAGCCACATTTTTTGTGGCTACTTGTTG CAACTAGCAAAATTTTGCTGGGCTTGTTAGGTTCACAGCCAAATGTTGCC ATGCTTTTCTATGCTTTGCCATGACGTGAGTTAAGCATGTTTGGCTGAGT TAAACAACTGCTTGGTTTGTGGCCACACCTGTGGTAATACTCCTTTTTTT GGCCAATTGCAACATGGGTCCCACACGTCAAATAAGTGTGGAAGGAGATG TCCTTAGGCTAGCCAAAGTGTGGCTCCTATATTTGATAACCTAAGTTCCT AACATAGAGACTTTTACAAAAGAACTTGTTAAGTTTGCTAGTACTCAATA CAAGCATACTCCTTTTTTTGGCCAGTTGCAACATGGGTCCCACACGTCAA GTAAGTGTGGAAGGAGATGTCCTTAGGCTAGCCAAAGTGTGGCTCCTATA TTTGATAACCTAAGTACCTAACATAGAGACTTTTACAAAAGAACTTGTTA AGTTTGCTAGTACTCAATACAAGCATGCATTTTTATGTTAATGTGAAGCT AAGAAACTGTGCTGTGCCACTACCACAGTTGCAACCCTAACTTGTTCACC AGCTAACCAACTCGCAATCACACTTTGCATTCAGTTATCATTTCAAAAGT GTCTTAAAAAATACTTTTAGAAGAAGAATTTGTAGCTATTGGACTATGCA GTTGTTCTCATCCATATAACCAAAACCGCAAGTGTCCAAGAAAAGCCCTT CTACTCTATGTGTTTCTAATGAATATTTTGCAATCTTATATGTTTCTCCG AGTAATTTTCCTTTCTGAAATTAGTGTTAAAAACTTTTTGGTGCCTGAGC ATGTGAACCCCCTATACTTGAGTTACCATTGAACATTGGGAAAGAGCATG TAGAAGGCAATAGTTTCAGTCTGTAAACTAATATGGTCCCTTAGGACAAT AGTAACTGGAACTGAGAGATAACATGGTGCTAGTCTTGGCCTCTAATCTA CTACTCCCTCCGTCCCAAAAAAGGATATCATGAATCTGTCTAGATTTGCA TGTATCTAGATGCGTTTAAGTGTATAGATACATATGAATCTAGACAAATC CGCGACATCTTTTTTTGGACGGAGGGAGTACAATAAAATGTACTTGAGCG ATATTTTTGTAGAATTTATGTTAAATTGAGTTTGCTTGATATTGTATTTT GGTTCTGCAGCCTTGTACTCCCTCTGAGAAAGGAATTTATGTTGCTCTGT TTCCCAATATAAGATGTTTTGGGAAGCTAAATTAGCTTCCCAAAATGTCT TATATTGAAAAATAGAGGGAGTAGTTATCAATTATCAATAAATAAATATA TGTATATACATACATATATGTGTGCTTTCTTATGCGAGGTATCGACTTTT CATGCAGGCAGACAAGCTTCTCTCTCCTGAATTTCAACCTTCCATAGAGC AGCTGATCCGTTACCTTCCAGCGAGTCGACAGATTTTAATGTTTTCGGCA ACATTCCCAGTGACTGTCAAGGAGTTCAAGGACAAATATCTGCCTAAACC TTATGTTATTAACCTCATGGATGAACTTACACTGAAGGGAATTACACAGT TTTATGCTTTTGTAGAAGAGAGGCAGAAAGTTCATTGTCTTAATACCCTC TTTTCCAAGGTTTCACTTTGTTTCAAAATTTAGTTAGGCATTTCTATCTC CTGCATAACATATAAGTAATTCAATTTATGTTTGCATTCGTACAGCTACA AATAAATCAATCAATAATATTCTGCAACTCTGTGAATCGTGTTGAGCTAT TGGCGAAAAAAATCACGGAGCTTGGTTACTCCTGCTTCTATATCCATGCA AAAATGCTGCAAGACCACCGCAATAGAGTTTTCCATGATTTCCGAAATGG GGCATGCAGGAACCTTGTTTGTACAGGTAAGCAATTCTGTGTCATTTTTA TTGCCCACTTCCTTTTTGAAGGACATTGCTTGTTCATCTTTTCCCTTTTC CCCACAAGTACAATTATTTGGTTCAATCAATCTAGCTTATGTCTTCAACC CTGCTATTGTGTACTCTGTACTTTATTTTCATGAAAAGGCACATATACTA TTCTTTGAACAGTTTATTTCGAATTCTAGCTTGGGCCAATCACTTGTACA TGTTTTGTCTTTTATGAACCATCTGTGTAGTTTGTTATTTTTAACTTCGG ACAGTGAGTTCAATCCACTAAGACCTGTCAAATTTCAAGTGACTAACTAA ATGATGATTGCCACAACTTAGTTCTGGCAGTGAAAGATATAATGGGACAG AAAAGCCTAATAGCGTCTTTCATGCCAACCAATTATACAGTGGTTACATC TTGATAAACTTCCATCAGTTGCTTGTTATAAGCAGAATCACTTCAGTGGT GACTTTATTAAGAAAAATAAAATTAAATGATTGTGTTGCTTCTGTTCTTT ACCATGTGGGCCCTGGCTAGTAGAATAGTAAGTGTTCGACTTGTTGCTAG AAGTCTGGCATGTCATTCTTTTCCAGTTTCTTATGTTTGTGGTCACAACT TTTTCAGATCTTTTCACAAGGGGGATAGATATTCAAGCTGTCAATGTTGT TATCAATTTTGATTTCCCCAAGAGCTCTGAAACATATCTCCACAGGGTAT GTCATCGTAGCGATTTTTGACTTAATCCTTATGCTGTGAGAGTCGAATTG TCATATTTTATGTTGCTCCCAGAATAATATTTTATTTGGTCCACACAATT TTTTTTATCTGCACAGCAAAATAGAAATCTCATATCATTTAAATGGTTTT ATAGTTGACAATTTTTTGTGTACTTTTTGTTCATAATATGTTTTCCAGCT TGTGTTTTTTAATGATTCACTTGACCTTTTTGGCTTTTTAGGTTGGTAGA TCTGGGAGATTTGGTCACCTTGGTTTGGCTGTGAATTTGATTACCTACGA GGATCGGTTTAACTTGTATGATCATTTTCGTACCACAAATTTCTTGAGAT CTTTAAATCCATAGTTTCTCTCTTAACTAAATATTGTTTATGCGATCAGG TATAGGATTGAGCAGGAGCTTGGGACTGAGATAAAACCGATACCCCCTCA GATAGACCAGGCCATATATTGCCAATGATGGGATACTGTTTTCACATGTA TTCACTTTCTCTGAGATTAATAAGACAACTCTTGTAAATACCGTCTCATC ACCCATCAGGTAACAAATTGTTCTTTGTGGTCAATGTCTTTATGTCATGC TCCAGAAGCAATTTTAAATCACAAATTTACAATTACTGCGAAGTAGGCTA TCCCCTGAAGCTTTATTTTTCCATTGTCATGGGTTTATTTTTCAAATTCA CAATGACTGCAAAGTAGGCTATCACTTGAAGATTTATTTTCCATTGTCAT GTGAGGGTTTGTTCCATTGTCATGTGGGGGTGTGGCGTGACACCCATGGG CCGTTTTACTCTGAGAACTGTTTGCGAATCTGCACAATTTTGGTACTCCC TCCGTCCCAAAATAAGTGACGCCGTGACGGTTTTTTCTAGATTCGCATGT ATCTAGACATGTTTTAGTACATAGATACATGCGAATTTAGACAAACTCAA GTCACTTATTTTGGGACGGAGGGAGTACATCTTTGGGTTGTCACTTCACA AATTTAGTCCATTACATTTGGATCACCTTGGGTTACATATTAATTAATAT TAGTACTGTGAAATTTATTCTGCTTAGGCAGTTTTTTTTATCTCAGTCAA CTATTTAACTTAAAAGAACTACTTGTATAATGGAAGAACTTTGTAAAAAT ACACATCGAATACTACCTCCGTCCCAAGGCTTAAGGCATATAACTTTTTT CAAAAGTCAAACCAACTAAAGTTTGACCAAGTTTTTAGAGAAAAATATTA GTATTTACACTACATAATCCATACCCTTTCATACATCATGAAATATATTT TCACATGGTATCTACATAATATATTAGTTCTTGATAGTTTTTTCTAAAAT TTTGGTCAAACTTTACATGGCTTGACTTTTCAAAATAGTTATATGCCTTA AGCCTTGGGATGGAGGGAGTATTTTTGTGCATGTAAGGGCAGATATTTTA TCCGAAAACCATACATGGCCGTTTCATCTTTTTGGCCCTACCTGACCAGT CAATATCTATATTCCTGTGTGGCTCACAAAACATAGACCCAGCTACTCCC TCCATTCCAATGAATAAGGCGTGCAAGCTTTTCAAGATTTGTCTTTGCCC AAGAATTAATCCATGTATAAAATATTTGATACTCCCTCTGTCTCGAATTA GACATCTAATTCGGGACAGATGGAGCATATAATTGGTATCATTAGAAAGT ATTTCTCAATACGAATCTGGGACTTCTTTAATTGTTCAATTATTTTTCGT ACGTATCAATCTTGTACTATATAATAGAGATATTGTTGCACAATTGGTTA GTTCAAACTTTGTCTCGAAATGTGTGTGCGCATTATTCATAGGAACAAAG GTAGTAGATGGTTGCAACGCATACAATCAGCATGGCAGCTGTGGTGTGGC AAAATCAGGGTGAGTCTGGTTAGTTCTTGCCAAGTGGGTAGCACCTGTAC TGCTGATGTGGAGGATGTTTCAGCCAAGTTCTGCACCACATAGTAAATGA TGGGTGGACCCAGTTAGCTAGGACAAACACGTGCAGATTTTTTGATGAAA TCAGCCTCCCATATCAGATCTGAATGATGCATTTGCAGATTAATCCAGTT TCTAACAGCACATGCGTATGATTTTCCACGGTTTTGTTCTGCATGCTTAC GTTTACCATTTGTCACGGCTTATGTTTACCTTCTATCATATCTGCAGGTT TTATCATGGACCTGCTGTGGTGTATGGGAACACTATTGTGGATCATGTGT GAGACAAGATATCCAGCTTGGCGATTTCTCATGGACCTCGTTATACTGAC ATTAGGGTGGTTAACCAGGGCAAATGCCCTGTAACTTTCAGCACAGCGGT TGTACATTGCTAGGCGCCTATTCCTGGGCTTGGCGTGGCCTTTTAGTTCT TTCCATCATAGTTCCTGTCTTTTCTTCGGTGTCATTAGCTATCTCTGGCA GGACATTTTAACCCTGTTACTTACTGGTTGTGTGTGTCTGCGTTGTTGGT GCGGCAAGTGGATATCTCAAGTCCCGGCTTTGTCGTGTGTTGTTGACTTG TCAATCAGAAGTGGGTCGTCCAACTTGAGCTCTGAATTGTCAATGCCCAG TAGCTGCTAGGGCCTTCTTCAGCTATTGGTCGTGAGTTGGATATTAATCT GTCAATAATGTGCAGTGAGCTGCATTGGGCTATGCAGCCGTGCTCCTGCA TCATGCATAGTATGGCTAGGAGCCTTCAGCTAGTGGTTTGTCAATAATTG TAGTGAGCTGCATCGTGCTATGCAGTCTTGCTATTGCATCATGCCTAGGC ATTGTGCTTGAATGCCATGATACTCATTTAGATTCTGCATTGTCTTTCCA AGTCGAGAACATTATTGTTCGATTAGCAGAGTTTATCTACTGCTACCTGT GTCGGAAGGAAGTTGTCAACTTATTCTATAGTAGACACTGGACTGTTACT CGCTGTCCCTGTTTTGTTGCTGTTGTGAGCCATTGTTTTCTTGGTTCATT CTATGCTGCCTTTTATATCTGTATGTTGTATGTTTTCTATGATGAAGTGA TAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.