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GrainGenes Sequence Report: AE039751

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Sequence
AE039751
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE039751
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAGCGAGACCCCGCAAAGCGCCAACAGGTTTGGGAATTGCCTATTAAT
AAGCAAGTGGAAGCGCGTCAATTCTATGTTTCCGAGGGGCCATACCAGCC
ATACATGAGAGAGTATCCATATAATACCGATGATTCAAAACATCGTCGCC
GGTTCCAGTTTAGTTGGTTCAAGCCATTTCCTTGGCCAGAGTATTCACCT
TCAGCAAATCGTGCATATTTCTTTAATTGTTTCCTCTTTTCTAGAAAGCC
AATTGGGAAGTGTGGCTCAAATACATTCACTATTTTGGGCTTCGATAAGT
GGAAAAAGGTAAATAGTGGAAAAGATTGTGCTTTTCTAACTCATATGGGC
AAAGATGCTAGTTCGGCCCATAACTACTCAACTCGTTGTCTTGAGAATTT
TAAAGATAGCACGACTCATATTGATAAGGTGATTGAGAAATCGTCTGCAA
AAACAATTGCAGATGCTAGACTAAGACTCAAAGTTACAATTGATTCTATC
AGGTAAGCAATAATTTATTATATATTCTATCATAGCAATTATAATATTGT
ACATATTGACCATTTAATACGCATTTTTGTGACATGATCTAGGTGGTTAA
CATTTTCGGCTTGTGCTTTTAGAGGCCATGATGAATCTCCAGGATCCATA
AACCAGGGTAATTTCCTTGAATTGTTAAAGTTCTTGGCTTCTTATAATTC
AGAGGTGAAAGATGTCTTAGATAATGCTCCTGGGAATGCGAAGTACACCG
CTCATTTAGTTCAGCAGGAAATTCTTGGTTTACTTTCTCGGAAGGTACAA
ACAACAATTAGAGAAGAAATTGACAATAGTAAATTTTGTATTATGGTTGA
TGAAGCCCGTGATGAATCTAAAAAGGAGCAAATGGCGTTAGTACTTCGAT
CTGTTAACAGTGAAGGGCTTATAAGGGAGCGTTTCCTTGATGTTGTTCAT
GTGAATGACACGGCTGCATTGACTCTCAAGGAGTCAGTTTGTGCTATTCT
AGCAGATAATAACCTAAGTGTGCAAGACATTAGAGACCAAGGCTATGACG
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AAGGAGTGCCCTTATGCGTATTATGTTCACTGTATGACTCATCAACTACA
GTTGGCTCTTGTTGCAGCATCAAGGGAGGTACAAGAAGTGCATAATTTTT
TTCAGCATGCAATTTTCATTATAAATGTTGTTAGTGCATCGCCTAAACGG
AATGATGAGTTACTAGCAAATCAAGCTGCATAAATTGCACGTGAAATTGA
ATTGGGGGAGCTTGATACCGGAAAAGGGGCAAATCAGATAGGCTCTTTAC
AGAGGCCGGGGGACACTAGATGGAGTTCCCATTTTAAGTCAATTCAGAGC
TTGAAGAAGATGTTTGGTGCTGCAATTGCTGTCTTGCGAAGTATAGCAAA
TGATCGTTCGGTCTCAAGATATTCTCAAGGAGATGCTGGAGGTGCCCTGA
AGATGATTATCTCTTTTGATTTTGTGTTCGTTCTGCACCTCATGGAGAAA
ATTATGAAAATCACCGATGTCTTGTGCCAGACGCTCTAGAAGAAATGTTT
GGATATTCTAAATGCATTAGATTCAGTTTCGAACACAAAGATATTATTGG
GTAATCTTAGAGAAGATGGTTGGGAACCTCTTTTAGAGGAGGTCAAGGCT
TTTTGTGTCAAACATGAAATTGAGATCCCCAATATGAGTCTCAAGTAAGT
CCCCTTTTGCTCGATCTATTGAGTAGAATAATATTTAATCAGAATTATTT
TCCTCTAACATATATTGTATTTTGTAATATGTAGGTATGTTGATGTGACT
TAGTCTCGGAACAAACATGATAACACCACAATGAACCATCACTACAAAGT
AGATGTGTTTTATGTGGCGATTGATCAACAGTTGTTTGAGCTAAATGAGC
GATTTAGTGTTCAAACTACAGAGCTCCTCACACTTTGTGCATCCTTGGAT
CCGCGACATGAATCATTTGACATGACAAATAATTGCACCCTTGCAGAGAA
GTTTTATCCAGCAGATTTTTCTAGTCAAGAACGAGCTCAGTTGGAGTCTC
AACTTCCACATTTTCAGTTAGATGTTTGTAATCATCCAGAGCTCAATACA
TTGGCATCACTTGCTGATTTGACAGCCGGACTAGTTAAAACATGTAAAGT
GTCTATGTATTCAATGGTTGATAGACTATTGCACCTGGTCATCACTCTCC
CAGTGTCCACTGCAACCACGGAGCGAGCTTTTTCAGCAATGAAGCTTATC
AAGACCCGTCTTCGAAATAAAATGGGTGACGACTTTCTTCGGCATTATAT
GGTCGTATACATTGGGAAGGAAATAACTGCAAAGATAGACGTTGAAGATA
TTATTGATTTATTTGACAGGCCTGGACGTAGATCTAGATTCAAACAGGTA
GAAATGTAGTTTCTTTTAATTTGAAGACATATATTGTTGCGATATGATAT
ACATAGTATAATTATGAGACTTGATATATTTTCTTGTGTTATCACTTTTA
TGGTCGATGTCTTCTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACATTGCTCAAA
TCCTGGATCCGCCCCTGCGGGTGGGGGGGAGGGGGCTATTACATGTGATG
TTTTTATCATCACGTGTCTATGTGCGTGGACTTTGATCCCATTTGTGTCC
ACGTCTGGATGTCGTTGGGCAGCACCTCACACGAGCTTAATTATCGTGGT
TAGCCGCGCGCCTTCACTGTAGCATCCAAAGATATGCTCGTCCCATGCAT
ATATAGTCTAGCAAGCCTCTCCGGCTCTCCGTCTCCCGTTTCAGTGTCGG
CGGAAGCTCGTTGGGTTGGCATGTTTGTGTGTTGCATCTTTCCTTTGTTA
GGGGCGAGCATCTGTGTGTGGTATTTTGAGTTCGGTCATCTAGGTTTACT
TACGGTAAAAATAGGGTTTGTCTTCATTGCTAGAAGTAGACTTGCTATCG
ATATGGCCGGACACATATAGAAGAAAAATGAGTTTTATTATGAAACAGTG
GTATCTCGAAGAAGGCAATTATCAGACCCGAGAAAGTATCGACCAACGTC
ATATCAGCAACACCCATGGTAGAAAAGAAAATAGTGGAGCAGACTTGCGT
GCAAAAACAAATCGGCAACGCTATTTATATACAGAGTATAATTAGGAAAT
GAACCGAGCATGTACCACTCAATGGTTCCTCCCACTCCACGGCTTGAAGA
AAAATACAGTTCATACTGAGAAATTTAGTTGGGCCGATTGTATTGGCCCA
AACTCATTGTATATAATACTTGGTCCAAAGTCCAAACGCGTTGCTGGGAA
CTAGAGGAAATAACCTTCACGTCCAGCCATTCCTATCGCCGCCGCCTCTG
TCTCCATCTCCCACGATTTCTTTCACTGCGCCGCCGCCGCTTGGTCTCCA
CGCCAAGATCGGCCAGCCGCCTCCCTCCAAATCTCCATGGCGGTAAGGAG
AGCATTGGGCAAGGATCCTCGCGTAGGTTCATTCTACTAGCAGCACGCCT
TGGAGTCTGGGTTCGATGAGCATCACGCCATCGACGCTGTTTCTCACCAG
ATTGATGCGGCGCTCCACGAGCAGGCGCGCGGGAGCTCCTTAGGCAGTCC
CGGGGATGGAGATGGAGGAGCTCCTCCACGCCTAGGAGACCGTCAGCGGC
GAGCTCACCCGATCTCCATTGGGATTTGATGTGCCCTTTGACATCGCGCC
GGAGACCCTCTGCAATACTGTGCTCTAACCCTGAATCTGAACCAATGAAA
AAAATAGCGCACTAACTTAAATAGCGTGGGCTTCAAGAAAACGCTACGAA
CGCTATAGCGCGCTTGACCAAAAGTTATGAAAAATCAGGATTTTAGTAAC
TATAAAAATCATAGATATAGCATTATGCAGCTATAAAACCACACATATAG
CATTATGCAGCCAAACATCAACTAGAGATAGTTCACATAGTCCATAACTC
CATATCACATAGCCGAAATGCCATATCTCTAAATAATCAACTGACGTTCT
GGGTGTTATCCTGTTAGGGTTAGATGGATTAGGATAGGCCACCAGGCCAA
AATAGGCCAAAATGGGGAATGGGCTACTAAAAATTAACGAAAAAAATAGC
GCCGCTACAACGTAACGTCAAATAGCGCGAATAGTGCCGTACTTAGCACG
CGTAGCGCCATAGCGCCCCTCGAATGCATAGCATAACGTCCAGCTCCTGA
ACTATAGCGGTGCTAATAGCGTTAAATAGCACGCTATTTTTTTCGTTGAT
CTGAACCCTCTTCCCCCTAACTAAATGAATCGATTTTGTTGCCGAGCAGC
CAGAGAGATGGACCCTATTGGACAGATAGGTGGAGATAATGCGCAACTTC
TTGGAGCGGTATGCCTGCTGCCCCAACACCTTTGATCTTCTGATCCATCG
TAATCAAGGTCACCCCCATCCTACTCTTGTACATATCCAATTTCCTTAAA
CCCATCAATGTTGGTACACGAAAATAGAATCAGCGAGTACAAATTATTTG
GGATTACCTGACGTTGTGTGTTTTGAGAAGCACCTCTACTGTTCTAATAA
CCTGATTTGCGCTTGCAGGCATCTCATACGACAGAGATGATGACAAGAGC
CTTGGGTATGGCCAAGTCATGTGAGGCAGCATGTTTCCGTCTTGTTTCTC
ACTTTCATATGGATAACAATATGGATCCGTGTATATGTGGACAATCACCC
CCGTCTCTTTTTGTTCAGCCAATGCAATTACTAGTTCCTTGACCTACACT
TCAGAGGAGAAGGATAGAGGTGCTGTTACTAGGACAGATGGGAAGGCGTG
TCACGTTTTATCCGCCAAACCGTTCGGACTTGGCATGTCAGATACTGGTG
CACTCATTTTATTCTTATCCAGTTCTTCTTATAGCTTAGTAGCCATGAAT
GTATCATCAAAATATGGTCTCCATGTGGTATGTTGTGTACTCCCTCCGTT
TCAAAATATAAGACGTTTTAGCTTTGTGAATGAAATGAAATGTATCTAGA
CCACTTTTAGTATCTAGGTTCATTAAATTTGAAGTGAACCTAGACACTAA
AAGGAGTCTAGATACACTACTTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTG
AAACAGAGGGAGTAATTTCTTGGAAGCTACATGAACTTGTGGTTCCTAAG
ATGGACTTCTGATTCTATAGCTTGCACTGATATGTTGTGCTTTTGTAGAT
TGTCATGTCTGGAGTTGAGTTAGTGGGCTACTGTAGCACAGTTGGCACTT
ATATCATCCAACCAAATAAAGAGAAAATGTTCTTTGTTAGTTTTGTACTA
GAAAATGCTATTTTCTCTTACTTGAATGTTCAGTTGGTGGTTTAGTTCAT
CTTCTGAACAGTTTACGTACTAGTAACGTGCATTTAATTTTAAAATTTGG
CTAGTTATATCATTTCCGATCACAAGAAGCTACTGCATTCATGTGATAAT
TTTGATAATGTCCTTCATGCTGGATTACTAGACCTTTTCATAATTCACAC
TAGTAATGCATCGTTCAAATATTTCCTAGGATGTATCGTGACTAGAGACC
CAGGTGAACTGTGGTCTTTCACTGAAAATCACTACTAAAATTGCAGTACC
TTTTTCCCATTGCACACCACTATTTTCGGTTATCCTAGTTAGTATCGATC
AATGAAGCCAGATCAAGTTTTTGACATTGTCGGTGCTGCATATTCTATCC
TGTTGTGTTGTATAGGGAATAGTAAATCAAGCTTGACTCCGGGTACGTGG
CCAGGGACACCACCACCGTCGAACGGATCACCATTTTCTCGATGGCCTTG
CGTCTCTGCTCGTAGCAGTGTACGTCTTCTCATGTTCTGATTATACTTGG
TTGACACCCACCAACAACCTCTCTATTTATTTTGTAGTAGGAATAGACTT
TTTTGTGGTCAAGTTTTTTGTTGTCCTCCAGTTAGCTTTTGTTACTTTGT
TCATGAAACTCAGTAATATATGGACTGAATTAAGAAATTTTACAGTTTGA
TGTTGTATTTTATGTAAGTATACACAATTTGATGTGACCGTGCAACATAA
TAGAGCATATGTGTAGATTGTGGTGTTATTTATGCTCGGAATTGCAAGTT
TTGTAAGTCTAGTGCTTTATATTTGCATGATAAGATAGTGCAATGTCCAC
AAGTTACAGAGTAAATGAATAAATGGAGTTTGTTTGCTTGTGCTTCCTTG
TCTACAGTTTCTTGCTCAAATTCAGCTTTTCAGCACCGTGTTCTCTTCTA
CTGATTGAGTTTTACATCACCTTGTTCTCTTCTGTTGTGTAGGAAAGGAA
GGAGTATAGCAAGGGCAACTCCTAGAACACCACCACCCTTAAGGTATCAC
GGTTCTGCTTGAAGGCCATGTGTCATTGTTCGCAATGTATAACTTCTCGT
CTTATCTATGATCTTTGAGATCTTGATAAACAACATCTTGCTATGTTTCT
TGTGTCATTATAGTAATCTTTGGAGTGCATTTCCATACTTTGTGTTTCAT
GTCATTGTTCTCCAGTTAGCTTTCCCTAGTGACTCGTTTAAACATGGTTC
TTTCATGGCGTTAATAATCGAGCCTTGTTAGGGATTCTTACTTTGTTTTT
GAACCCCTTTCTTCCACTGTCATGTGATGCCTTGGTCTCCATAATGGAGC
ATTGTCCTCTGAATTAAAATTCATGGAAGTTCAAAATTTAGTGGTGTTAA
TCCATGGAAGTTAATACTTTCATATAATGATAGATGTGTTAAAACTGCTA
ATTGTGTGTTCTCATGTATTAACATTCGTGTATGGATCTACGTTACATGT
TTGCTGATTACATGTAGAAGCAAACAATTTAGTACCTTCTATGTTTCTAG
TTTGTCCCAATTAAAGTCGATTTAGTAGCACTATTCCTAAATATTTTCAG
TATGCAATTTCAATCCACCGCTTGTAATAGTTGGTGCCTTGGTAAGTGGC
TTTCAATGTAGTGCTTCTTCTTTTTTGCAAGATTTATAGTGAATCTTAGA
AACTAGCTAGTTTAGATTCAGTTTCTGTACCCGATAGGTGCTTATGCAAA
CTAGAAACTAGCTAGTGTTTTCTAAAGCGGAACAAAGACCTTTTAATCAT
CCATATGTTATTGTGTTACTCATGGCTGGTGTCATCTGGCAATTATACTA
TTTAAAACATTTTACCTTCTTTTTTTTTTTCCTAAAATGATGTGTGGTTG
GGGATGATAAAATGTTCTTCTTACTGTAGTGTCACCGTCAAGTTTGATGT
TGAACACTAAAATGATATATTTTCTGTAGCATTAACACAGTGCACTACAT
TGCACCCTTTGCCACCCTGATTCTACTTGGAGATCGGCGGGACAACCAGG
ACTTCCTCGAGCACAAGTGTCCTAGGATGGACACGCTCGCTGGCATCATG
AGGTAATTTCACTCTCTCCAGTCCCTTCTAGTTTGGTATGGTTGGTTGTT
GTCGATGGTGTGCATTATGTATGTTCTTTCCAGATGTGTTTAGTAGTCTA
GGGACCTGGGTCAGAAATTTTTCTTGGGAATTTGGAAGGTCTTGAAGGAC
ATGTGGATGTACTCTGCATAACAGAAGAGAGCCCTTGTTTGCAATAATTT
ACACATGTTTTATCTAATTTGCACCTGCTTGGAGTTGTAGTGTGGTATAG
CCTTTGTGTTGTGAGATGTGCCCTTCATATTTTATTTTTTGATATATTTG
TCTAGTGCTATGCAAAGCACCAAGTTAACATAAAGGAACAATTGGTGATT
TGGAAATCATATAAGTCAAGTAACTGGATTACTCACATTCTTCCAAATCT
GCAAATGATTTGGACCATGATTGTGCTTGCAGTTTTCCATTTTGATTGGT
TAGCCTACCTATCAGTCATTTATGTGAGAACTAGGCAGTGGCCTAGTGGT
AGGATCACAGTGGTGCATCGCTGCTGACTAGATTTCGTATACTTTGAGGA
ATGAATTTCTAGTATCTCACCTTCGGTGGGCTTCTTCTATAATAATATAT
CGCCAAGGGCTAGTCCTGGAAGGTCTCCCTTTTTTATTTCTGTGAAAAGT
TTGTTATCGGCTACCACTAAATGCTCTCTGTAGATAATTGATATCAAAAG
TACGAAATAAATTCTTCATAATGTTTGTCCACCTGAGGTTTAAAGGTTAG
GTCATGGCATCTCATTATGTTTATTTCTACCGCTTACATACTTAATAAAT
AATGCAGGAACATTAAAAAATCGGATAAACACTTATTTTGCTCTTTGTCC
ATTGCAAAGATTTTGTATATGCAGGACATAACTGATTATTGGTGAATACA
TCTTTCTCTATATAAATTTGCTAGGTGACGTACAAACATAGGTTTGGAAT
TCTTTGTAATTTGGGAATTATTATCTGTCAATCTTTAAAGTGCAACATAA
GAGAGATGTGCATTTACCAGATTTTGATCTGTATTGGCCATCTTATTATT
CTAACAATCACTCATATTTGGTATAATATTAACGTAGGTCAATGGATATC
TGCTCATGTCGCCCAAGAGGCCTCCCACTGCCAATGGCATCTTGCTACTT
GACTGTGGAGGACCAGGACTTCCTCGAGCGGGACATGCTCGCCCTGCATC
ACCATCAAGTATGGCGTCGAGGTAATCTCACTCGCTCCAACCCTGGTGGT
CTAGTAGCTGTAGATGGTGTGCATTATGTATATTCTTGCAAAATGTGATG
AATAGGTTAGTGGATCCGTGAGAACTTCTGCTAGGAAATTTTTGTGTCTC
GAGGCAAGTGTGGATAGATATGTACTCTTCAGAACACAAGAGAACACTTG
TCTATCCAAATCAAAATACTCTGTGAGTTGTGCCCGGCCCTTCTTATTTT
TTACCATGCAATCCCGTATTGGGATGCAAAACAATGAGTGTTGGCATTAG
GTGCTTTCTATGGGAGTTCAGTGCAAGTTGATTTCTGTTAATGCTGCAAG
ACCATATATTTTATCTTTTTGTATGGTTAACTTTATCAGTTATCCCCATG
TTAGTTGATCTTAGCATTTAAGATTTAGGCATGCTCACAATAGAACTTCT
GGGAACTTATTCTCATCAAGCTATGTAAGCATCTCATGTTAGTCGTACCT
GGATCTTTCGTATATCCACATATATGCATCTTCTGTCTTTTATAGATGAG
TCATGAATGTCATTTTGCTGTTTTCCATGCACTATCAATTGTTGATTAAC
TCGCAGTTTATGAATTTTAATGTGTATAGGTTCTTCACAAGTTTTGATTT
ATTTTAGCATGTCTTTTCTGATTGGCAACGAATGCATATCCAGCTTAAAA
GAATGCACTGCCACTTGGTTGGGTGCCACACCACTGAAAAAAACTACTTG
GTTCATCACCAAGAAGGTAACATATATACCCAGGAATTGAAATATTCAGA
ACAACTCATCTATACTAATTGTGTTCACGATTCAGATCGGGTTGCCCAAA
GTTTAGTAGTAATATCATAAATGCTTTCACTATCCTTGTTCTGAACCTCT
TATCATGCATGTTAAACATTGCATTCCAATGGCATAAATAGGAACTTGGA
TCAACCTTTCTTTGTTCATTACTCCATACAGGTCATTTAATTATTGAACC
TTAATGTAAGCATGTTGTTTACTTACAGTTCATTCCCTATATGGATGAAA
GGCGTCATCTTTCAGCACCATTTTACTTTCACTAGGATACATATTTAGAG
CATGGTTGCATTACTTTTAGTTGATATTGTATTATTCATATTTATTAGAG
CCTAGTTGCATTACATTGCACTCTAAGCCCTGCATGGTGAGAGTCTGCAT
CACCTCCTTGTTGTGCATAGCATAAAACCTTCATTATACTTGTCATAAAC
CTCAGATCTTGATATTGGTTGTTGTTTGTATTGATGGCATTACAGGCAAG
TTGCGGGTTTCGGTTGGTCACCATCCCTGTGTTCCAGGACAATGAAGCGA
GAGTGAAGTGGGGCAGGTATATATGTCACCATTTAGCGCTATTGCAAATT
GTAATTTTCTGTAAAATAAATGGTGATGTTAATTTCAATGTTGTAGTAAC
AATTGTCAGTACACCCGTGTTGGAACCTTGTTATATTGGTGCTGGTATCT
AGCTTACATGTCAAATAAATTTGTTTCTCTGGATGAAATGAATGTTGTTT
CTTGGAATTGTAGGCTAAAACGATAGTTCTGTCAAAGTTAAAAAGAATCT
TTTGTCTAGTGGTTTTATATCCGACTTGCACATGGCCCATCTTATATGCA
CCTCAATCCATGTTCTTTGTAAAGCCATTATTGTATTATTATTGATATTT
TCTAGAGCTTAGGTGTGTTACATCACATTTTGTGCGTGTATGATGAGAGT
TCCATCTTTTCCACATCATAAACGCCTTCACTATATATCCTTCTAAACCT
CTCATCCTGTATTTTTAGGGATCCCAGTGGAACTTTACTTAGTGGCTGGT
TGCATATATTGAAAATGGTAGTTGCAAGTGAAAAGCACAATATCTCTTGA
ATTTTCTTTCAAGAAAGCAGATATCCAAGCATTTTTACTTTGGACTAGTA
TTATTAGCGTAAAGGTGTAGATATATGAAAAAAATAGTTGAAAACAATAC
CCATAGGTAGTAGTTTGTTCCATTTCTTGACATATTATTGTTAAAGCAAG
TTCTGAAGAATGGTCTCAAGGTGAACCTGTAGAGAAATGCTTTGAGTGTC
TTAAGCTCGAACATGTAGCAGCTTCTGTAGCAGGTTTGACATGGGAGAGA
AAGACATGTAATATTGTAAGAACATGCCATGTTTTGCAGTGTAGCCAGTA
AATGCTTTAAACTGCCAATAGTTCAACCGACTAAACATTTTTGTCATGTT
TCAGGAGCAGAAAAATGGAGTGCCAGAAACCGACAAAGCCAATGGTTTTG
TACACAAGGCCATGGTCCTCTTGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.