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GrainGenes Sequence Report: AE011809

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Sequence
AE011809
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE011809
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCATTTTCTGATTTATAGATTCTAGATATGTTGATGCAAGCAGAAAATGA
ATGTATTGTCTGCATGTTTACAGGGACAGTATAGAAATGGCAAAATTATT
GCAGTAAAAAAGCTTCATTCCATGCCAGGACTCAATCAGGAACAGTTCCA
GAAAGAATATACTAATCTTGTAAGTCTTCAACATCAGAATATTGTGAAGT
TAGTTGGATATTCCCATGAAACTCGTGGAGAATACTTAGAGTTTGATGGA
AAGAGGATATTTGCTGAAATCCAACACATGGCGTTGTGCTTTGAGTATAT
GTGCAACAAAAGCCTTGACAACTGTCTTCAAGGTACGAGGGTGCCCTAAT
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ACTGTGTTGACCATGATCGACACAAAAGGCCCAGCATAGGAGATATTGTC
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TGTATTAATCTTCTCAGATGGTACCTCAACAGGAAGAGAGTGGGCTCCTC
GAGGTCCATCCCCGCCAGCTTCGCTTTCCCTTCTTCGAGCGAAAAAAGTC
ATTTTGCCCTCTCCGCCTAAGTAACAGCACAGACAATCAGGTCGCCTTCA
GGATTCTGCCCGAGAAATGCATCGAAGGGCTATCGGAGCTCAATGGCATT
GTGCCACCAAGGTCCAGCCAAACCTTCTGTCTACTGATGGAAAAGGAGCC
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ACGAGGACATAGTAGACGTAGACGACAACTTCCTACCGGAGGTCATAGAG
CACACTCGAGGCAACAAGGTGCATAAGGTGGCTTTAATGGCGACAACCGC
CGAGGTGAGTGACTGATCACTAGTGCTTCATTCGTCACGAAATTGAACTT
GAGCTGAGACAGCAGCAGCATCTTCTTGTGTGACTCTTCTTTGCTTTCAT
CTCGCGGGGGTTGCTCTTTGTGCCATGCATGGTGTATCAAACAGGCGATT
CAATCGGGAGTAACCAAGGTGATAAATTTCATTTCTCCCTGCTTACATCT
TTCTTTTAGTACTGTACTAGTATTTTAACGAAGGGCTTTACCAACAATAA
TGCATGATTTGTACATTTATTAGGTCATATGCCGGTTGAATCCTGGGGGC
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TAGGATTAGTTTTCTAGATCCACATGCTATGATACCGTGTCTACCTAAGA
TAGCAACACAATCTCTTTTATCATTAATTACAGTGACACAATTTGCATGC
ATGTAATGCATGATCCCACCTATGATACCCCCACTAGGACTTGTCTAAGT
TATTTTCCACTATGAGGGTAGTAACTTAGACTAGTAACATATGCATGTTA
CTACTCTAAGTTACTTTCCACTATGACCAGCCTTCTAACTGCACATTTGC
ACGGGCCAGCCATGCGCAATATCATTTATTAATGTTACCATAAACTTGAC
TATCGGTATGCATGAGTTCAAAAGTACTCCCTCTGTCCGGGTTTACCTAT
AACCAAGCACGGAGGGAGTGTATGGTATTATAAGTAATTATAACGATACT
TCTAATAAGGACATTTTATTACTTTCAAGATTTAAGTATTATACCCGGTC
TTTGCGTAACTAAGATACACATAGACACAACAAGTCCATCCAAAATGGAA
AAAAAGTGCAAACCGTTAAACTCATATGATGATGGAGGACCAATCTGTAG
ATATCCATGTTGGACAAAAATCCCCTCTCCACGTCCTCTAACCGTGTAGA
CACCTCCGTAAACAGGTTTTGATTCTCCACACGTTATACAGATGACCCTG
AACAAAGCATACTGATACATCGGTAGATAACCTGCATGAGAAAAGAATTC
TTACTGTTAAGAACCTTCTCATTTCTACATAGCCAAACAATCAAATAACG
GCAACCGTTCCTATCCTAATAAGAATGTTAAACTTGTGATCAATACCAAC
GTTAGCAAAGCTATCTGGTGGATACAAGTTAGAAGCAATTAGGTCGACTG
ACCATATAGCATGGCAAAATTGCACGGGACGAATAAAGTGTTTGATTGTA
TCATCATAATGATAAAACTACACACTTTGTACTTTCATGCCAAATTTTTC
TTAATAAGGTTGTCTTTAGTGAGTATTAAACCTCAACGTAGGTACCAAGA
TTTTTTTGAAATTTTAGAAGTATCTTCATTCTTCACATGTTCTTATTATT
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AAAGAGAACTTTTAATATTTCCCCCTTTATTTTTTTCAATATATTTTCTG
GAGTGTTTCGTCTAGGACGTTTCTACCCTACATGAATGCAGTTTGTGTGG
GAAGATCAACATGGTCTGAGTTCAAGCTTGTATTGTTGGTTCATTTATGT
TTCATTGACCTTAGACAACTAAATTATTTCACTGAAATTTAGGTAAAACA
AATCTATTTTTTCATCATGAATAAGGCAGAACAAACATAGAGGGTCCGCT
TCAATGACATCAAGAAGTTTTTTGAAAATGGTTCATGGTTTTTGAATTTT
TTTGGTTATAATTTTTGAAATTTGGTTCATGAATTTTGAAATTGGTTCAT
GATATTCGGCAAAGTTCATGGTAGTTCAAAAACTGTTCATGATTTTTAAA
ACATGACCATTCAATATGATTTTTGAAATTGTCAGAGGTTCAAATTTCAA
AAATTGTTACGAGGTAAAAATGTTAATATTTGAAAAAGATTGAGTTCTGA
AATTTAATCATCGAGTAAAAAAATTCATTTTTTTAAAAAAATCATGATTT
AAAAATGTTGGATTTAAAATTTATCAATGGTTTTAAAAAGGTTTGTAATT
TTTTTTAAAAAAAATTGTTCAGCTGGTATAAAGACTCGCATTGAGCGATA
CATAGTGCCGACGCTGGGTGCAGCAACACCTCCCAGCCGGCCTAGTTACA
GGCCTTGTCCGACCCAGAACATTGGGCTTGGACGCCGAGCTAAGGAGGTA
GTACTAGCTGTGCGTCGTCCCTTCCCGAGAAGCCACACAGTGATCAGCAT
CCGGCCAAAGGGTTGTTTTCTGAACCGCTGGAACCATCTCAGACTGCTCA
CTGCTGGTACTATATCCGGACAGGAGGTGAACGTGTGTGCATTTTCTCTC
TGATCTTTTGCGCTGCGGTGAGTGTGATCTGGCTCTCAGCTGCAGAACTA
AACCAAACTGACGTCTTTGGATTGGGATTGAATTGAAGGGTGCTAGAGCA
AAAACTTCCGTTGTTTCTGGTAGACAAATCCAAAGTCGATGAATCTCCTT
GGACCTAGCTAATTACTTTGAACCTGTCGTCACAGACACATCTTTGTTGG
TTGTTTGAGCGGTAGGTCTCCTATTTGTCTTCATAGACTTAGCATCATCA
TTCTTATCTCGGCCTTTCTCATCATCATCATATTATCATTTTTGCGCCTC
CAAACAAATGGCAAAAAGTCAGGTCCTTGAACAAATTAGTCAGCCGCCTC
TATACGGAAAAACTCATAACCACAACTCATAACAACTACTCCCCCGTTCG
GAAATATAAGACACTTTAGCTTTGTGAAATGAATGACGTTTTTTAGTGTA
TAGGTTTACTCCAAACCTCTATGAACCTATACACTGCTAAAATACATCTA
GATACATTCCATTCATAAATCTAAAACGTCTTATATTTCCGAACGGAGGG
AATATTTGTTATCATACATAAATTTTGGATGTAAGGAAAAACTGTGGGTG
CAACATAACCTTTTCGAGTAAAGTAGTTCTATCTGTGCCAAGTCTAGTAT
TCCAAGCACTTGTATGACAGGTGGGATACAGGATCTAGATCGTACATTCA
GCACGTGACTCAAGTAAATGTTCAAGTACTCTATAGAAACCGATTGATTA
TATTTTCAAAGTGTGCTATTTGTGACACAGGATTTTGGGATGTCGTGGTG
GTGGGCTAGAAATTTGGAACTATAAGACCCAGGTATGTCGTTGGTGCAAA
TTATGCCTCAGCTCGTAGTTTTTACAGGGCCAGTTGGAGCACACATGCGA
TACAAGAGCAAGTCTAATAATGTTTAATGGATCAAACTGATTTGACTATG
CTATTTTACAGTACTTGAGATTTACTGATTTGTCAACGTTGGTGCGCAGG
AAAAAGTGTCAGCACTAAAACTTCCAAATCATAGTAATACATTTCGTTGC
ACAAAGTTCATTGCATCCAAGCACTGGTTTTCAGCCGGCGATTTGGATGG
GCGGATCCACATACGTGCATGCGTGACAAATAAAGAGGTCACGACATTCA
AGGCGCACGACCGTGTGGTTATCTCGATGGCCGATCACCCAAGTGAGCCG
CTGTTGTTGTCATCGTCTCAGGATCACCAAATCAAGCTTTGGAACTGGGA
TGCTAACTGGAAGTGCATTCGAAAATTGAAGGCACACTCAGCCAGTGTGG
AGAAACTCGTGCTTAATCCAAGAGATAGCAATTCTTTTGCTAGTATTGGC
TTTGACCATAAACTAAAGGTTTAATTGGCATTCCTTTTCCTATTTTTCTA
TATATAGACATTTTTAAATATAATATAAGGTTTATATTAATGCTAATATC
CTTGCAAAATATGCATGGTACCCATGTGAATTACTTCTTGCTTGCCAAGT
CTGATGTTACTACTTAAGACAACTTATCTTCCCTAAATTTACATAAGAAC
TAGAACTGACTTAATACTAACAGAGGAATTTATATACATCAAGGACAACA
TAGTAATGTTTCGAATCTTCATTCTAGAGATGCTCCTCAGTATGTGGATC
TCGCCGTGCCTTGAGCCCTTACACAGGTTGGTGGTCTAAATAGTGTTGGC
CCAGTAAGGTTTTCGGCCTTGTTACCCCTATTAATAATAAATTAGGCCTT
TCACAATGGAAATTTTTTAGCGTTGTATTTTAGGCACTTTGTTTATGTGG
CACTATAGTTAATGAGGAAAGAGATTGAGGTTATATCTTAGGCTGGTCAT
TGTGGGGAGTAACTTAGAATGGTGTCATGCACATGACACTAGTCTAAGTT
ACCACCTTCATAATGCATAGTAACCAATAGGTAGTGTCATAGATGACTAC
ATTAATTAGCTTATAGACTCATTTTGTCTAGAAAAGTGCGATGTTATGGT
AACATAACTAGTTATCACAAGACTCTTTTTCTACAATTAATGATATGCTA
TGTTACCCAAATGTTTACGTGACATTGCATGTGGTTCTAAGTTACTATGT
ATGTTATTCCCACTGTGACTACCCTTAACTGAGAAACACCTCTTGCATGA
AACCATAGGCAAAAAACAGTGTTAAGTCAATCACATGCATGCGTGTCCTC
TAAATCATTAAATATAGAGACACCACTTAAGAAACAATCTATTAGAGAGG
TTGTCTCTTAACCATTTATTTCTCCTATGATGCCTTGCTAAGATACACAC
CATTGTAAAAGGTCTAGATACACCCCTTGCATGTATTCATAGGCAAAAAT
AGTTGATAGCCAATCAAATGCATGCGTGAGAGCAAAAATATTAAATTAAA
GTACAACCTCTAAGATACAATGCATTTGAGAGGTTATCTCTTAGATATTT
AATACTCCTATAATAACGTGCTAAGATACACTCCACTGTGAAAGGCCTTA
AAGTAGGCCACTATTTTTCATGTTAGGTCTTCCGATACTCATGTTACTAT
ATGCTCTGGCTGTTTCGATAATAAAAATGTTGTTGCTCATTCAAAGCATT
TTATCAAGTGATAAGAAAATTTTACTATTTTTTTGGACCGGAGCAACAGT
ATTGTATCGATAAGATTAATGTTTGCAAATTGACAGATCTGGAAGATTTC
TTCACCTCTCCCTGTCGCCATAGTGGACTGCCATGAGGTTCTAATAACTC
TTGAGTATTTTCAACCGGATGGTGATCGGCAGTACATCCTCACCGGATCT
ATGGATGGGAATGTTCGAGTATGACATCTTTACTCACCGATAACATGTAA
GTGTATATATGGATATTTTTTCACTCCAACGCATGCTTGTCCATCTTTTT
TTTACCAGATCTGGGATGTGAAGACGAAGACATGTATCCGGAAAATGGAT
GGACTGGAACCTTATCCTAGCCGATGCATTGCTGCGCTAAATTGGTTCCC
AGACCGTACGTGTCCGTTGTTAGTTACAATTTTAAAGGGTGGCATTACTT
GCTTGTACAACTTCGATACTGATAGGTAACGTCTCTTCTTCCACAGTCTA
ATGTGGGATCAACGAAACACGATGTTTGAGTATACAGGCTAACTTATATT
ATTTTGCAGCTATGAGAATTCGATTGACTTGAGACATGGAGAATCCAACA
ATTTCGGTCGCATTAAGGACACAGAAACGTAAGAAGAAATTTTCTCAACA
TGTTTCGCGATTATAATCTCTATCTCCATTATTATTATATATATTATTAA
ATACCTTAGGGTGGTTTTCGTTCCCTCGCCCGTCTTCATATACGTCGCCC
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CTTTCTACTTCCTCCGTTTTAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAAA
GAGTGTATCTAGACCCCTTTTAATATATAGGTTCGTTTTAAAATTAGATA
AATCTACACTAAAAGAAGTCTAGATACACACTCTATTCACAAATCTAAAA
TATCTTATATTTTAAAACGGAGGGAGTAGGTGATAGTTTCAAAAACGACT
CTAGGTCGGTCGATCGGATAAAGGTTTTCAATAGCACGTCCGTTTCCAAA
CCCCAATCACTGGTTCCATATATAGGCGACAACGTCAAGAGAGAGATCGA
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AAAGCAAGGTAGCGAGGGAGCCATCTCAACTCAACGGAATCAAATCAAAC
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TGCATGTCGCGCTAGTGTGTAAGTGTCTGGTTTTGACTCCGCCGTGTAGC
CACTCACCCATCGTCCTCCCTGTACACGCAGGAACATACGCGTTCTCCCT
CCGTTTTAAAATATAAGATGTTTTAACTTTGTATAAAGAATATATCTAGA
CTCTCTTTAGTGTATAGGTCTATGTAGGTTTAAAATGAACCTACACACTA
AAAAAATCTATATACATTTCTTTTACAAAGCTAAAAAAAACTTATATTTT
AAAACCGAGGGAGTAGCGTGGGAATGCACGATCGAATGCCGCTGATGCTA
CCGCGACACCCTGGGCGCCGTCTCCGGAGCTGTCGGTTGCGTCATCCGAA
TCGGTCTACGGTTCCCGCCTAGCAGGCGAACAACAAGCAGAGGAGGAGGA
CGAGGGTCGCGTAGACGACAGCAGCGCAGATGCAAGTGGACAGTCAAATG
GACTAGGCGGATAGTCCGCTAGACGCCGCCTAAATGACTGCATGCAAACT
TAGGAAATAGTATATATAATTAGAAGACGAATTGGAATTATCGAAAGGAG
TCGGACAGGACGGGAGGATTTGGCGGATGTCCGCGTGCATATCCCTAAGC
GCAGGCGATATAGCTTTTGAGCGAGGGGTACGACCCAAGTCTGGAGACCG
TTCACGGCGAAGCGGTAAGATGTAGCAGCATATATATGACCTATTATTTC
TAGTACTGTATTGTTTTCACGGTAGTCATGGGTAGGACACATAGACAGGC
ACCTACCTGTAGATCGAAAACCTCGGCATGCTAGCTTGTCCATTTGGATC
GGACGCGTAAGGCCGCCGGCACTGACTCTCTCTGGGTCGGCAACTCTGCA
GCACAGTCTTCTGCTCGTGGAGCCGCCTGGGGTGGCACCAAGTGAAAACC
TTGGAACGGACTTCAGCACGCGTGAGCATACGCGTTGCATGTAAAAGCGT
ACGAATATTGGGCAGCCAAGCGGCCTAGGGGGCGAATACCGATGGATGTC
CGCTGGAACATTGCCGACAAGGTCTAAGCATATTTCCGCAAGTTTTCTTA
GGTATAAAGAGTCTAATTTGCAGTTTTCGTTGGACTTGATCGTGTTGGCA
AAGCGATTTTTGGGCCAAAATTAGGTCTTATATACAGTACTTTTTTGTCA
AAAACAAAACTCCTGCAATCAGGAGGACATCTAGCACTAAAAGGGACCAA
TATGAAGCGGTGAGCGGTGTCACAATGAGAAGAACACATTGGACAGTTTT
TCAATCATCAATCTGTACCAAAGGACATGAATATTTTCTATAGGAATAAA
ATTGCAACTTGTGACTTTTTCTAAATAACTACTAGCTTGCAGCGATGTGT
GAGATCGTTTATATGTTTGTCAACGTTTAAAAAATGTACCAAGAGGGAAA
GAGGTTGGAGAGAATTGGTATTTACGTTGTAGAAATAGAAAGCAAATGCC
TCCATGTTTGGCATATTTTTCAAATTTAAAACAATTATTTCATTTGTGTT
TCATATATTTTTATTCCGTAGGAACACATGCACGGGCATTTAGCTAGTAT
ATCTAGTAGTAGTATATATGTGGGTGGAACAATGTTTATCATAACTCTTA
GACTACCTCCAATGGGGTATCATAGGTGGCATCAAGCCTTACATGCATGC
AAAATGCTTATGTGTCATTTCAATTAATGATGAAAGACTAGTATGATACG
TACTACCACTATGACCAGCCTCATAGCATGTGGTATCATTGCACATGGAA
CTAAAAAAATAATCTTGAATAAATCTTGTACATAATTTTACCTTGAGATT
TACAAAACAATAAATACACCAAGACTGTGATATTATGCATTATGGAGATG
GTATCATATACTAGTATCATATACATGATATTACTATATGATATCCCCAT
TGTGAATAGTCTTATAAAATCCTTCTCTCATTAAATGTAACCAAGAGATC
TCTTAGTAATTAAGGCATATTATAACTGTATTGGCATGGAGAATACAGGT
ACCTTGTAATCTTGATACCCAACAACCCGGCAACTAGCTAAAATACCAAT
ATACGAAATTCCTTCCTCAACCGCCTCCCAAACGTACATCATGTAGTGCC
ATGCAGCAATCAGTATTATATGCTTCTAACTTTATAACCATATACTTATG
CAGTGCAGCGATTGGATTTGGTGGCAGAGTAGCAGTGATGGAAATCATTT
AGTTTTACTTACCCCAAATGAAACATTCGATAGCCCTAGCGGTATTTGCA
GATTCTTTTAGTGCATGAAGATAGCAATGAAAAATCGCACGTTATATGAG
CATGGACAACTGGTAGTAGAAGTCTGGGGATGCCAAAAAAGAGAAGATAT
GAGTCATGTTGTTCATTTATACTCTACAAATTTTGTGTTATCTTCATCTG
TAATAAACCGAAGATATACTTTACTTTTTTGTTTCTTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.