Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE005821

[Submit comment/correction]

Sequence	AE005821
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE005821
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTGACATGCCTTCCACGCTCGGTTGACTCCCACGGGTCACCAGTAAACTC TCGCCTCCAGGTATCCGGTAATCCCCACCATCCTCGCTCTCCCTCGCTGG TCGCCGCCTCGCACCGCAGCCCCTCTCTGCTCTCCCCGTACACCCCTAGT CCCACCGGTGACTCGCGCCCGGAACCCTTGGCACCGGCGATAACTGTCGA GCAGGCTATGGACGGCAGCGGCGGCGCGGTGGAGCTGCGCGAGACCCACC GTCTGACGGGCCACGCCGACCGCGCGTGGGCACTCGCGTGGAACCCCAAC CCGGGCTCCGGCGTTAGCCCCGTCCTTGCCTCCTGCGGCGGCGACAAGAC AGTACGGATCTGGAAGCGCGCTCCCGACGGCGCCTGGCAGTGCACGGTAA AGGCCAGGCTAGTTTAGTTTGTTATAGAGGTCCACATTGCAGTGATTCAT TTTCTTCTTTATGCCCGTTTGGTTTTATTAGGATGTGCTCGAAGACACGC ACAACCGCACAGTGAGGTCGTGCGCTTGGTCCCCTGACGGGAAGCTGCTG GCCACCGCGAGCTTCGATGCCACCACGGCCATATGGGAGTACTCCGGTGG GGAATTTGAGTGCGTCGCCACACTGGAGGTGAATTTTTTGCTGAATTTGT TTTTACCGGTTAGGTGTTATCACGGTGTGCTATTAGGAGTTTTGGTTACA TGTGGATGTTAACGCTCTGTTACCGATGCGTAGGGGCATGAGAATGAAGT GAAGTGTGCGTCATGGAGCCCGTCTGGGTCGCTGCTCTCGACATGCAGCC GGGACAAGGCAGTGTGGATATGGGAGATGCAGCCAGGGAACGAGTACGAG TGCGTAGCGGTGTTGCAGGGTCACACTCAGGATGTGAAGATGGTCCAGTG GCACCCGATCCTTGATGTTCTGGTTTCCGTCAGCTATGACAATACGATCA GGGTAATTTAATTTGAAATAATCACATGAACCATGCACACATTAAATTCG GCCTGCGCTATTTTGTTTGATGCCTTCAGATTGTAGGATGGTGTAGGCAA AAGGGTGTGCTCCTGCTCAGTTTGGTTTGTACTGTAGTATTTATGTGACA TAATATGGAAGCTTCGATTTAGGTCTGGGCTGATGATGGCGATGATGAGT GGCATTGTGTACAGACATTAACTGAATCAGATAACTGGTAATTATGCTCT CTGGTCCAAGCCATTTTTGCTATCCTATGATTGATAAACTTTTGAACTAG CTTGTGGTATTTTGAATTATTGAATCGTAATATCATACTAATTATTCAAA CGAAATTCCATCTTATGTGATGCTGATGATTGCAAAAAAAAGATGTGATG CATGAAATTGTCCATTTTATGAGTTGCTTGGCTGTTGATTTTATTATGCT AATGTATTCACACAAAATTCCAGCTTATGCTATGCTGATGATTGCAAAAA GAAAAAATGTTATGCATGGAATTGTCCATTCTATGAGTTGTGTGGCTGTT AATTTTATTAATTGGATGAAAACTTTTGCTCCACGACCATTCCCTCTTAT ATGGACAGTCAGATAACAGTAATTACATCCAAGTGGTTCTCTTTATATTG GTATATATATCCTATAATTATGTTAGTTGCATTTTCTTTCCTTTTCCAGT TTCCACTTTGCTAAAACATAATCTGGGGTTACATGCCAATCATAGTAATT AGTTTGTGTTATATATATTAACTATTATGATTATCTTTAACGATTCCATC TTGTTTGGATAGTATGATCCACTTTCTATGATTTATCTTCAGAAATAGCT GAACATATATATCTCCATTTCATTGTTCACTTCAATTGTCAATGAGCATT ATTTCTCTCACTGGTAACAGAATACCGTACGTTGACTGTTCTTTCTGGTT TTAGTACTTAACTGATTATTGGAACTTTCCCCGCTGCAATTGATCTCCTT CTTGATTGCAGTGGTCATTCCTCAACTGTATGGTCAATATCTTTTAATCA GAAAGGAGATAGGATGGTTACATGCAGGTTCGTTCTACCATGCTGGATTA GTATCCCTCATTTTTCCCCATACCTAGGTTCCGATGCTCTGTTTGGAACG TGGTATTTTCCCAGATTCTTTAGTGCTGCTGAATTCCTGTGTTCCAGACA GGACATAGAGAAGTTACTAACGTCATATAGTTTTTATCCAGTGATGACTG TACTTTGAAAATTTGGGACACAAGTATTGATTTGTCGCAACCAAATACTG GAGAAGGTCATGAATCTTGGTAAGAGTTTTCTTATTGATGCATAACCTCT ATATTTGGGCAGCATCATTATTTTTTGTACTTGCATTTTTTTGTATAAGT TTGATAACACTGAAATAACGCACCTGGGCCTAAAAGATATGGCTGCAGAA GAAGACAAGCTGTGTGGTAATTCATAGTTTAGCCCCCACTCCCCAAAAAT TGGACTATGCCAGTAATAAATCAAGCATATTATTGTTCTTGTGCTATAAT TTGGACAGGTGTAAAATATTGTGGATGCGCCTGTTCATCAAGTTGTTTCG TATATCCCAGTATACATTCTTATTTGCAACGGAACTTGTATAAGTTGGAT GCACTTAGAACATCTCCAGCGGTGCCCCCAATAGAGCGTACGGCAACAGT GCCGGACGAGCGCTATTGGGAGCGTAGGAACCATGTGCCGGTGCATTGGG GTCGGCTGCCCCCAGCGGGGACCCCCAATAGGCCATCCCAATAGATTTTT TGCCATTTTCTTTGCAGATACAACCATATTTTACCTAAACATAGAAATAA ATTGTTCATACAACAATTCAAATAATATTACATCTAGATCTAGACAAAGG TTTGGTTTCCTTGGAGCCACAAATTCTCAACAAGATCATCTAATGCCAAT TGAAAACATCTCATTCTTCACAGATTTGCTTGATCCTCATCTTTTCCTTG TTCACATCACTAGTTTCCAGCAGTTCAAACAACGTATATACCAGCCTCTT CTCCTCCTTCAGTTCTTTCCTTTCCTCATCCCATTTCTTCTTCTCCTCCT TCAGCTTGTTCATCTCAAATTGAACCCTCCTAAATCCTAACCCTACACTA AAATGCGGAAGAAGAGCTCACATCGTCTTCGTCGTTCCAGCTCGGCATGT CGACGACGGCGGCAGCAACGCAGGGATGGCGGCGCGGTGTGGTACGAACT GCCGACGGCTGGATCCTAGCGAACGACAGCTGAAGAGGGCGTGTGTGTGT GGGGAGGGGGGCATTGTTGCTAGGTAGGCGCCGTCCAAATGTTGGCGTCG AAACGGGGTGGCGCTGATTTGGCGGGGGTGGGAGAGGAGGCGAGCACGGG AGAGGCTGGGAGAATTGCTGGGTCGCTGCCGTGTGGGTAGCGCCTGTTGG TATCCTATGTGGCTGCGTGTCCGGCACTCCCATGCCGGTCCCTATGGGTC GGGGTGGCGTGGGTGTGCAGGACAGTTTATTGAGCCCCGCGGCGTTGTCC GGCATCCTATTGGGAGGGCGGCTGGGAGCCATTTCACGTCCGGCGCCCCA ATAGCCCTATTGGGGCGCCGCTGGAGATGCTCTCATTTTTTCAACAAGGC TTTTGGCTGGGAGCCATTTCACGTCCGGCGCCCCAATAGGGCTCTCATTT TTTCAACAAGGCTTTTGGCTCCTGGGTGCACTTGCATCCGGATGAACAGT AAAATCATAAGAAATGTTTCGAAAATTCAAAAAATCTGAAACTTTTCGAC AACATAGATGTTTGTGTCTTCTACATGCTTGCAAAGTTTCAAAGTTTCAT GAAGAAAAGACATATGGTGTGTCCTAGATAAAATAAACAGATCTCGAAGA ATTAAGTTTAGAAACACCAGATTTTTCTTTTTTAACACATGCCCCTCAAG CTTGGCTCTTTTAACGAAACTTAACATGTGCTCATGGAATATGGACGTAA ACTTGTGTAATTGTTTCCAGATTTTTGTGGCAATTATTTTTGGGGAAAAC GCAAAGGACCTTTGCATTTCATTTCATTGGAAAGACAAAGTTGTTGTTTA CGCGCCTCCTAAGAGGCAAACGTACAAACGAAAAAGAAATACAATCAGTG GACATCCCAGGTGGTTGGCAGGACGACGTGGAGGCCTCTTGCTCCGGCTC TGGCCCAAAGGGCAGCTTCATCCTTGATCGCGTTCAGTACGGAAAGTGAG GAGGGCCTGGCATTGTCGAAGACGCAGGCGTTGCGGTGCTTCCATGTCAT CCATGGCACGAGCAGGGCGATGAAGGCAATCCCCTTGTGCATTGGTTTCG GGGTTGCTTGCCGTGCCGCGCGGCACCAGTCGTCGAGAGTGTCGCTGGCG TCGGGGGGAGGGCAAGGGATCCGTAGCTATGCTAGGACATTGTGCCATAC CTGCTGGACGAAGGGGCAAGCCATGATCAGGTGGTGTATCGTCTCTGGCA TCTGATCGCAGAGTAAGCAACGCGGGTGGTGTTGTAGCCCGTGGCGTGCG CGGCGCTCGGCCGTCCAGCAGCGATCTTGGTCCGCGAGCCAATGGAAGAA TTTGACCTGCGGCGGTGCCCAAGTCTTCTAGATGAGCTTCCAAGCTCTAG CGGCATAGGAGCCATGGAACATGGCTCGGTAGCAGGACTACGCGGTGTAG GTGCCGCTGGCTGTCCATCTCCAGATGAGGCGGTCGTCGTCGGTGGAGAG CTGTGTGTTGCCTGTGTTGGCAACGCGCTGCCGGAGTTGCAGGTATTGCC CAATTTCCTGCAGGCCGATTGTGCCTTGGATGTCTCTAGCCCAGCTGTTG TTGGCTAGGCCAGGTCGGGATGCACTCGTATAGGAGGGGCGCGATCTCGT GAACAGTATGTCCCTCGATCCATCTGTCTTCCCAGAAAAGGGCCTTTTGG CCATTGCCAATCGTCATAGTCGTGGATGCTAAGAAGATCTCGCGCTCCTC TGGAGAGAATTGGAGGTCCAGTCCATGCCAGGCACGGGTGTTGTCCGTCC GATATAGCCATAGCCACCGGACATGAAGAGTGATGCCAGCGCGCTCAAGA TCAAGAACCCCGAGGACCCCGTGTTGTGGACGGCATACTTTGTCCCAGTT GACGTAGCAGTGACCGCTCTCGGCCTCCTTTCTCCCTTCCCAAAGGAAGG TTCGCTCAATCCTTCACAACTGCTTCAGTACCTTTTTTTTTTTTGGGGGG GGGGGGGGGGGGGGGGGGGCAAGCACCATGAGTTGGTGGAGGGGGATGGC GTTGAGTACCGATTTGATGAGTGCGAGCCGCCCAGATCTGTTCATCAGTT CTTTCTAGGTGGGCAGGTGTGCCGCTGTCCTCTCTACCAGGGGTTGTAGC TGGGCAGCAGAGGGCTTGTGTATGGTGAGGGGGATCCCCAGGTACGTGAT CGGAAGATCCACGATGGGGCAGCCGAGCTGGTTTGTCACCAGCGTGGCAA GCAGCTGGTCGCAGTGAATTAGAGAGGCGGGGCTCTTGTTGTAGTTGACC TGCAAGCCTGAAGCTCGGCCGAAGAGCTGTAGAATCTCCTTGATGGCAGT CATGTCATCGGTCATGGGGTGGCAGAATAGAATGACGTTGTCCGCGTACA GGGAGAACACCGGGATGTGCCGTCGTGGGTGCAGCTCCTGGAGAATGCCG GCTCAAAGCGCCAGCTGGACCAAGCGTCCGAGCGCATCCACCGCGAGCAC AAACAACTGCGGTGAAAGGGGGTCGCCTTGGCAGAGCCCACGTCGGCGCC AGATGGGGAGTCCCAGCTCCCCAATGATTAGCACGTGTGTGTTTGCTGAG GAGAGGAGGATCGCCAGCCAATCCAGGAAGCGATCAGTGAATCCATACTG CTGTAGTATCTCGAAGAGGAAGGCCCAAGAGATGCTGTCGAAGGCACGGG TGAGGTCCAGCTTCAGCAGGACACGGGGAGCACGAAGTCGGTGAAGCAGT CGTGCAGATTGTTTGACCAAGACGAAGTTGTCGTGGAGGCTCCTACCCGT GATGGACGCGTTCTGGTTGACGCTGACGAGGTTGTCGAGTTTCGGTGCTA GGCGTAGCAATAGCAGCTTAGTGAAGACTTTGGCCACCAGGTGTATCAAG CTAATGGGTCGGTAATCTCCCAGGGCGCTGGCATCGGCGCGTTTGGGAAG TAGGGTGAGTAGAGCCTGGTTCAGCCGGTGGAAGCCACGCCCACGTAGCT CGAATAGCTGCTGGAAGACATCAATGAAGTCTTGCCTGACGGTGCTCTAG CATGCTCGTAGGAATTCAACAGTGAATCCATCAGGGCCAGGCGACCTGTG GGTAGGCAGCTGCTTGATAGTGTCCCAGATCTCGTCAGCGGAGAAGGGGG CGTCGAGTTGCTGCAGCGTGGGGTCGGGCTCGATGAGCCTAGCGAAGTCA AGAGTGCAGTCCCGGTTCGCATCTGTACCCAGCAGCCCGTCAAAGTGCTC AAATGCGGCGTGCACCATGGCAGGTCGGTCACTTATCGTCTGACCGTCGA CGAGGAGTGCATGGATCCGATTCTTCTGCCTGCGGTAGGAGCATTGCTAG TGGAAGAAGGATGTGTTGGCATCACCATCTTTCAGGGACGCGATCCGAGC ACGTTGTCGTGCAATGGTGCGCTCGAGAGAAGCAAGCCCGAGGTATGTGG CCTTGAGTTGCTTGTGGAACCATGCTTCGTGGGGTGAGAGGGTCCTAGCT CCTGGGCTTTGTCGAAGCGTAGGATGGGCTCTTTGGCGATTGCGAGTTTC ATGCGCACATTCCCCACGGACTTCGTGCTCCAGCTTGTTAGCTTGCGGGC GGTGGTTTGGAGGCGGAGTGCGAGGCGACGGAAGGGATCCGTGTCGTGCA CCGAATTCCATGCAGTGTCCACGGTGTCTCGGAACCCATTGAAGCGAAGC CAGAATTCCTCGAAACAGAATCATTGATGGCCAGGCAGGGGGCACAGCCA AGTACCAACGGGCAGTGGTCTGAGAGCACCGATGCGAGGCAGCGTAAGTG GCAGTCACCATGCGTTTAACTTTGAATTGTCACCATGTGGCAATTATAAC ACCATTTTTTTAAACCAGGTGCATATGCACCCAGGTTTAACTTTGAATTT TCATTATTTTCTTGCTATTGATATTGATATTTACATTGAGTAAACTTGTG CTCCTTTTTATGCGTACTGCAATTGTAGCACAACTAAGCCCTTCCCACAC ATAGGTTGAGGTTCTGACTAGTTGAGACATACTTGCTTGTTCTGACCGAG ACTCTTTTAAGGACTATGAGTTGGGTTCTATTGATATTGTCATCACATTA CAGCAGCGAAGCTTATTGCCACTCTGTTCCCTTTCCACACCATCCCTCCT TAACTGGTCAATTATTATTTTCTTTCAGGCGACATGTTTCTACTCTAACC GGATATCATGGTCGAACTATTTTTTCAGCCCATTGGTCAAGGTTAGCTGA ACTCCAGTCACATATATGTTTGCTGCTTCTGAATTTCATTCATAGGTGGA CATTTACTCTTTAATCAGCTAAAACACAAGCATTATTTATGAATTCAAGC AAAACAAATTATATTTTATGTAAGTAAACTTAATTATACACATCAATATT CCTGTTGGACTGATGGCCAGAATCCTGCAGAATCTGCTCAAAGTCCTTAA CTGTCTGCTACATGTTTAGGGTATATTATAGTTTTATAAAAGATAGGATT TCTTAGCCGGAATCTGACTATTTACGCATATGTGTCAGACATTATCATAT GTTTATGTTGAACAAACTTGATCTCCCAGAATTGGCAAATTATGCTGTCA TTTTGAATCATCAGAGACACTGTTGACCATTCTAATCTACTGAATTCTTT CCATAGGTGACAACAACATGAATTGCCATGCTGAATTGAAATGGGATATC TTTTATACTATTCTTTGACATTTTTCATGCTCCTCTTTTCATGGCAGCGA GGATGTTATTGCCAGCGGGGCAGGTGATGATGCTATCTGCTTATTTGTTG AAGAGAAGAGTAGTATGGTATCTCACAACTCATGCTTTATCTTTGTGGGG TGTGCTTAGCTTACCTTTATGTCCAAGTTATATTTGGGGTAGATAGTGAA GCACGATGTTCCAACATGGATTGCATACTTTAGTGGTCAAAGTTTTGTAG GAATAAATGCTGGAGGGTTGTTAATTTTTGTAGATGCACATGACCATTGG CGTCTGAACAACTATTTTATGCCCTTTATTTGTGTTACACTTTAATTAAT TTATATCTATATCCCTTTAAAAGAATGTATGAATGATGGTATAGTTATTG TTTCTAGGTACTATCAATGACATTCTCTTTTGAACAAGCTGGAGGCAGCA TAAGATTTGTGTGCATCAAGTATTAACAGTTACCCTGGATGGCGCAGGTT GATGGGCCTTCTTACAGATTAATATTGAAAAAGGAGAAGGCACATGACAT GGATATAAACTCTGTCAGATGGTGTCCTCAGGTAATTTCAGATAATTAGC AATAAAATTAGTCTTATTGTGTTAAGCTGGCAATGGATTTCATCTGTTTC TACCTTAGTGTATCACTATTGCGATTTGTATGGTTTTGAGTATCTTTTAC TTCAAATATAGGACCCGAGGGTGTTGGCGTCCGCAAGCGATGATGGCACG GTGAAATTGTGGGAGCTGCAGGGGAATATACTGGATTGAATTGTATCCAG TCTGCTGTAATATGATTATAGTTCTAGCTGTGTACCTTAAGATCATAGAA CAGAGTAGGAATCACTTTTTGTTCTCTGTTCTCCAAAACAATGCTCTCTA GGTTAGCTAATACTTCTGTTTCTGAGAGAGCTTGCAAGGTGATGGTCTTT TAATAGATTTGCCGTCCAAGCTAAGAGCATATGGCACACTTACAAGACAT GGAATTGTTTGTGTATACACTATGAAATGATAGATGTGTTATCTAATCAT CTTTACAAATAAGTAACGATACGGCAAATTAAGCTCATGTACACAGATAA GTCCTGCATATGGATGCACGTGTTCTCTTAAGTTTTTGCCTGTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.