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GrainGenes Sequence Report: AE024787

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Sequence
AE024787
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE024787
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATTTTTTTGTTCCCCTTGGCGGAATCCTCCTCATCCACCGCCGGCCATCT
CGAGGTGTCATCGGCGCCGGCGGTGAGCAGATGGGAGAGACTAGGGAAGC
GAGCATCGGCGGAGACATCAGTTTTCCTTCCGGCGCCGGCGACGCGCGGG
CGGAGCAATGGAGGTCGGAGCGGAGGGGAACGCGCGGCGAAGCGGGAGAG
GCGCCGGCGGCAGGCCATTCTGGTTAAGGAACACTGCACAAGTTTTTAGT
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GTATGAGAAGCTCCATATAGAAGCAGCTCTGTGGCCGTCTGATTGAATCC
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ATAAGCCAGCGATGCTTACTAGCTATGGTCCGAAACTGCAAATTTCTTGG
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TGCTTTATATGAGATTTGCATCATATGGATTATATGTATAGCTTCTACGA
AAAAGATGAAAATATATTTTTTGATGTTACTAATGATTCTGATTTGGCAT
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GACTCGGAATGAACTTTATATGCACTATAGTTTGAAATGGAGGGAGTAGT
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GTTATGACAGTTGACTGAATGATAGCTCATGGGAAACAAAAAATAATTCG
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AATGCCTTTTGCAGATTCATACAGCTTTTCTGCGCCTCTCAATGTCCAAG
AGTGAGTGATTCTTCTTCATCTAGCCCACTTGGATCTGCAAGGTTAAGTT
CAGCTGGATGGCAGGAGACTGGCCAACTGGTCACCAACATCATCTGTAAG
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TGACCAGGTTCTGTAATTACTCCCAGTTCTTGTATTCTACAAAGTCAACA
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AGCTAGCTAGACATACATGCACCCAAATATCTAAAACTGATTCGATGTAT
TAGACTGAGAGTATCATCATCAGGGGCAGAGTACTTGTATCTAGCCGGAT
GGACATGCAGCAGGGTACATTTTTTTACCTTGCAATCAGACTGAAAATTA
GTCCATGCACCCCTGTATCCTGTGATTAGTGCACTCCTATGGCTTAAATC
TGCCCATAATTGTACGTAGGTCATGAGTAGTGCACCCTGATGAGCATTGG
TCTAGCTCCGCCCTTGATTATCATCCGCCGTGAATAACTAGCGGTACAAC
CATGAGTTCATACAAACATAAACCCACAACAATGCATAGTAGAGCTGAAT
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TGTCCTTTTGGCAAGGATGCACATGGCAAGTTATTCCTTTCTTCTTTGGT
CAATCCTTCCATTAACCTTTATCCCTTAGCAAGATGTATTCTTTGCTTGT
TGCTGTAACCAAGTATGGCATCTTTGCTCCTATTGATGTTTCAGTTTGCA
CTAGCATATAAGTCACCAGTTCAACTGTTGAAACGCCTGGCATTCTCCTA
TCTTTGCCATTTGTTTCTCCTGCAGCCACTGATTTTGTTCTTTGAAGTTC
CTTCAGTTCTGTCCTACCTAGAAGCATCACTTCAATTTAAACTCTCACTT
GTGTTTCTTTCGCTCACTTTCGTGCTTCCATATCTAGTTATGATTAATCC
TTTTTCTAGTCATCATCAGGGAAACAAAAAAAACTTTGGTGTTTTCCCCT
CTTGTTTTTTGTTCTTACGCATATAACTATTTTTTGTCTTTGTTTCAAGT
GATCCATAAAAAATAAAAATATATTTGTGTGTTCCATTTTTAATCACCTT
TTCACTTTATCATTACAAAAGGAATTCAAAATATAGTGGTGTTTTCCCTG
TTGATTGTTGTTCTTTCACATATATAAAATAGTCTTTGTTTCTAGTGACC
AATGCAAATAAAAATTTGATTGCATGCTCCACTTCGACATTGCTCTTCTC
CAGCGATGAACATTTAGAAAATAAAATTGTGTTTCCTTTCACTGTTGTTC
TTTTCGATTTACTACTGCTCATTTACTTTGTGTATTTGGTATTGTCTTGT
TGTCATACCTGTACTTTGTTATCTTTCTATTGTAATAAAACAAAAAACAT
TGGTTTCCTCCCCCCGCCTGCTTTGTTATTTCATCGTGTTTTATACCTTT
CTTGCTTTTTCTACTGATTAGTTTGACCAAAAACACCAAAATGATCGTTA
TATTTTCCCGCTATTGAGATTTTTGAAGTAAATCTAGTTGATCAGATCGA
TCATCTCTTGACGTTCATATTACAGTTGCCACATTTTACCCAAGGTAGCT
TTTTTGTTATTTCCTTTTTTTATTTGTGTGCTATATAACAACTAACAATT
TCAACTCTTTCTGTTTTCTCAGGACTGCTCAAGAAAGCTTGTGTTTTAGC
TCTCAAGCGGAAACAAAGCCAATTAATATTTATTTGGAAGGCTTCAGGTT
TAAGTCGTGCTGTTTTCTTGGAGATCTAATAAGCTGCATGCCATTATATT
GTACAAGTTAAATCATTCCCTATTCGAAGCTTCTCAAAGGCCAGAGCTGC
TGATCACAGGTAAATATTCATATACGTTGATGCATGCACATCACTATAGT
TAATCAATATTATATGTACCAAGCATTGGTCTCGATGTTTTGTTTTGCGC
GTCATTTAAATAAATTTTAGATATGCCAAATAGTTTTTGGAAAAGAATGT
TCGATGAGATTTGTGAACTTGTTCCTAGTCTCCATCAAATCGTGTTGCAC
CCATTCGGGTCAGTGCGTGCGTGTTTTGATGTGTGTTTACGCATGAGTTA
TCCTTATAGGACATATATGTCAACATGAAAAAGGTTGATACAAATATGCA
TTGGCAAAATCAAGATGGACACGTACTAGTGCACCAAAACTCTTCCCACA
ATTTCCTCTCGTTTTCTTCTCTTCCTTACAAATAATAGATGTAGCAATTG
TGGGCAACCAACATTTATTGTGAACAAGGGTATAAATTCTTACGAGTATT
TGTTTCAGTCCTTAGTGTCATCTCTAAGACCAAGCTGTATTTTATTCGAT
CTTCCCTAGGTGCTTTGTGTATTGATCTTGTGCATTACTCATATGCGAGT
AACAGAAAGCAAGCTTGAACAACTATACCAAGCTGAAGACAAGGCTAGCT
GGTTCTTTCAGTTTCCTACAGCACGTTCATTTACGAGTAATGCGCAGGAT
TAAAGGACATTTCCTTTGTCTTAGCTTAGCTTTTGCTTTTCCTTGTCTGT
GATAATAACTCATATTATGTAAAATACAGAGTATACATATCACAGATTTG
AGAGTTCATTTCATTTTCCTCTTCCACTTTTCATCTTTTATACTAAAAAA
CTGCCACTAAGGCCCCCAAATCCCTCCAACTTATGTTGTCCTCATGTATA
TGCATGTTTAGAAAACTCCCAGATTTCCAATACAAGAACTACTAGTTAGA
CATACATGCACCTAAATGACTAAAAATGATTCGATGTATCAGCCTATCAG
GCGAGAGTATTATCATCTGCTGCGAATACCTAGTTTCTAAACTGTGGGAC
ATACATATATATACACACAACCATGAATTGGAGAGCTGAATTGATCCTTA
ACACAAAACCATAAATAGTAGTCAAATTCAAGTACAGATGATATCCTTCG
AATGGATGCACATGGCAAGTTATCCCATTTCTTCTTTGGTCATGCATGAT
TCGTTTCCCTCCTTTAATCTTTATCCATTTTCTTCGTGAAACCCCTGCCC
TTTTACACAAGATACAAGTGCAATCTTTGAAACCCTCACCCTTTTACTTC
CCAAGATACAAGTGATCCTGTTTGTACACAAGATAGGAGTGCAATCTTTG
AAACCCTCGCTCTTTTACTTCCCAGCCTCCTACATCCAAAACTTTCGATA
TTATTCTTCAAAATTCTTGCATTTCTGTCCTGGATAGAAGTGTCACCATA
ATTTTAGCTATACTTATTGTTTCACTTGTGTACATTCTTATCTTGTATAG
GATTAATCCTCTTTATAGTCACCATTACAAAAAAACGTCACTAGTGTTAT
TCTCTCTTGTTCTTTTACATATAAAAATAGTCTTTGTTTCTATTCATCAA
GAAGAACAAAAATAGTTGTGGATACAACTTTTAATCACATTTTCTATTTA
TATAAAGAAAAAACATGGTGTTTTCCCTGTTGATTTTTCTTCTTCCATAT
GACAAATAGTCTTTGTTTGTCGTAATCAATAAAAATACTAAATGAATTCG
ATTGCCCACTTCGCCATCACTCTTTCACTTCTTCTGTACAATCCCTTATC
CTTGTGTTGATATTAAAAATAACTTATGTTTCCCTTTGTTTAAGTTCTTT
CAGATTTACGAGCTTTTAATCAAGAAACAAAAAATGATTGCCTTTATGTA
TGCTATTGTGTTCTTTCATATCAATACTATTTTTTTTAACTTCATCACTT
TGTTATTTCTCCATGTTTATAGCTGCTCTCTTCTCTAGTTATCAGTTGTA
CCAAAAACACCAAAAATAGCATTACATTTTCTCTCTACTCACATTTTCAA
GTAAATATAATTTCTTAGATCAATCATCTATTGAAATCCATATATTACGG
TGCCAAATTCAACCTCTAGGTGCTTTGCATATATTTTTTATTGTTTTATT
ATTTTATCTATTTCTGGGATATATAATAACTGACAATGTCAATTGATTCT
GTTTTCTTAGGACGGGACAAGAAATCTAGTGTATAGATTTCAAGCAGAAT
CATCAGAAAATTAATATTTATTTGGCAGCCTTCAGTCTAAGTACGTTGTT
GAGTATTGCTATCTGAGGACCCTCATTAACCAACTTATTCCCGGTATGGA
TATTACCTGCTTATGCAAATGATCTTGTGATTCATTACCGATAGCTGATT
CAAACAATCTTTTCAATTCTTCCAGGTTAAATTTGTGCAAACTATTCAAT
TTGTTACTCTACTGAACATAACTCATGTCATCATCTTCATCAGAAAAATG
GGATGAGTATAAGCGGGAAAATTGGCCTCGTGATCTAAGAGATATAGACT
GTTGGTATGATTTGAAACTTCCTAATTTACAATCAATCCTTTCTTAATTT
ACCAAGTGCATTTTAATTGGTTGTCCATGTTTCTTTTATAAATAACATTA
TAGTGATTATTGTACTTAATAGTCACAATCCATTCATTCTTTTTGTGAAT
CTATATCTAACAAGATACTCTATCCCCCAAACACCTCCATAGAGGTGGCC
TCATTCACATGATATCCTGTCATAAGGTTGCTTGGCCTAGGAGTCAATAG
ATTTTGATTTCACCTGCAAAAATGTTGAGAAGAACATATTGAAATAGATT
ATATCTAGTGTTCCAGTAATCGAAGTTGAAGACAGATCCATTTGATTGTG
CGGTATATTTCACTACTACACAAACAATCATCCGAGATGGGTCCAAAAGT
GTGTCCAAAACGATCTGATGGCCCATCTGGTTAAAAGGTCAGAAACAAGA
GGGAACCATGAGAGATGTGTGCAACCCCGCCTAAGATCACATATAAATAC
ATGTGGACGAAATGACAAACCGTCCTTCGATGTGTTCATGTTTGTTTTAA
TACAACAACAGTTGCTCACCGATTTCGGCGGGGACTTGGGTACGCGCCGA
TGAGCTTATGGTCTCGCTCCTCGACTATGGAGAAGATTAGGGAGACCGCA
GCCATAGCTCATGTCTCCCTATTTCATGCCCCATCGTACACGGAAGCCGT
GCACGCTCTTGTCATTAGCACAAGCGACACTCTTGGAACGATGACCTTTC
TTCATGTTTTGTCACATGGTATGATCCGCTACAGAAAAATCATTTTCTAC
CGCAAAAACGCTAAGTGACCATGGTGACCCCTTCTGCCGTGTCCGGACGC
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GCCACAGCGTACGACCATACCGGCTAGCATCGTCCATAGTATCACTGGAA
ATGCCCAGTCACATCGTAGCCCGTACCTATCAGGCGACCATGGGTTGAAG
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TTCACTCTGCATACACGCACAACCTTTCCTCCCCTAGAGGTAGAAGAGAG
CAAGCTGGGCTCCACGCTAGCAGGCACCCCCATTTGTAACATTGAGCACC
TCACACACTCGATATATCTGACATGGACGTAGGGTTATTACCGACGATCT
ATCCTGGGGCCTGTACATGTATAAATCTCCGTGTTCCTGAGGTAGTTAGC
CCATTGAATTGTGGCCACATACTCTACATATACAAATTCACTCATCGGGA
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CTAATCCCCATTTCACTCAGGTCCAACCTGAGTAGGTTCCGTACTCCTTT
AAGTGTGTGACCCTCTAGGTTCACGACCACATGGACATAAATCTGGAACT
GGATCAAGGTGGTCCAATGGGCTTTGGACCTAAAAGTTGTTGGACTAATT
TGGACTGGACTTCTCTGGGCATGGATACGAGTGGACATAATGTACAACAA
TATTGGATGGACTTTGGATCTGAAAATTGGGTAGTCCAAAGTCCCCTGGA
CATCCACGTAACGTGATTCGCAGCAGCTGAGGCAGCGATGGAAACGAATG
GAATCGGCTTCATCCTGACTTTCTCCGCTCCTCTCGACTCCCCATCCAAG
CGTCTTGTTTTAATTAATAGTGGGTCCCACGCTCAGAAGATACAGGTGCA
CGACACGTCTCCCGGGAAAAGGGTGCACGCGCTATGTGGATTTTAAGAGC
GCGAGCTCACGAGACGGGGTCCATTTGGTTTTGGATGGATTTGGACTTCT
TACGTGTGGATTTGGAAGGATTTGGACTTTGTTAATTTTTGTTTGGACTG
GACGTGGACTGGATCACGTATATTTGTATAACGATTGGGTAGTTTGATAC
TAGACCTGGACATTGGTCCATTTCCAGGTTTATATGGACATGACTGAGCT
CCTCTCCGAGTTCCCGAGTATCTCTGCGTACACTACTCACTTCCATGAGT
TCTCGAACTTAAGTCAATAGCTGTAGAAGCTCCTAGCAGAACATGCCAAC
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AACATTTCTATTCCCTCACCATCCTTGTTGATAGCTTGACCTCTCTTCTC
GATCTGATGACATAGATTCCCAGACTGGTTTAACTCTTAAACCCAAGTTG
CATGGCCGTACTTTTCGAATCTGATTGCTTGAGAGGGCCTAGAGAATATT
TCTCCGAGTTGGAGGGGCAAATCCCGTCTTGGGTTGACCATGCCTCGCAG
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CAAAGACTAAAAAGATTTCTTTTTGTTCGCTTTCTTTTTGGTGTGGAATG
ATTAAAAAGATCCATCTCTAATTAGTATTATTAACATCTAACGTCCCACA
AAACTGACTAAGATCTTTCAAGGATCAAAGTCAGAATAGGTGATTCATTA
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CTCCAGGAAGAAATGTGGTCACAATAGAAGTTTTCTGAGGATAAATAGAC
CTGAATGATTAAAAATAAATAGTAGAATGAATAAAAGAGTAAGTTGAACA
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CCCATTTTCTTCCCAAATTACTAGACCTACTAAGCCCTATCTGCAATCGC
TATGACCTACCTGCACCTCTGCCCCCACTTTGCTGAGCGTCTGTGCAAAA
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AGGGAGATTCCGTTAGACTTAACTGAATCATTGTGGCTAGGTTGGGGCAA
GGGTGCGGGCTATGGCTAGGGTTAGCGGGTATGTACAGGGCATCATGTTG
GGTGATTTTGTGAAGAAAACATATAACTGGAATACGTCTCCAATTTGGTA
ATCAAATCAACGGCCACATAGCCTGCTCGGTGGGCCTGAGCTATCAGAAG
TATGGCGAAGTGATTAAATGGCGCGCGCGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGG
GGGGGGGGGGGGGTAAATATTGTCGCACTATCACAAATACAAGGTAAAAG
TTGGCACATGAAATTAAATGAGGTAAATAGTGTCACATAATCACAAATAA
GGGGTAGAAAGTGAATTCACACAAAAAATAGTTGTTATCCCTAGCTCTGT
TTTCTATATCTCAATATCCTCCTGAGTCTTATGTTAAAGAATTGCAGAAG
GCTTTACCTGTACAAACTGGAAACCTGGATGGCAATACAAATAGAAACTA
GAAGGGCCTATCTTTGAGTTCTAGATGTAGCTCTTATTGACCATGCTTGT
TGCATTGTAGCTTAGATGTGTTGTCTTTTCTGATGTTTGTACGACCATTG
CTTTGTGTATGATATATACATCCTTTCTTAAGTATCTAATACTTAATCAT
GTCTAGATACAATCGAATCTAGACAAATCTAAGTTAACTAATTTGGGTCG
GAGGAGTAATAATATCTCAGTCACTCCTGCTTTTTCCAAAAAATGGAATT
CCCAGATAAAAACTCGTCGTACAGAAAGAAGTAATTTGGCCATGCACGTG
CATTATGTGTTGATCTTTCCGAATACATGTGATAATGATACTAGTTGATT
TGCAGGTTAAATGGGTACCATAAAGCAGTAGAACATCCTGGTTACTGTTG
TAATAAAGATGATGACTTTGGTGTCTTTTGGATTGTTGGGGCGGGGCCCA
TGTTTTCATTCGCACGAGCCATATCAGGCATCATTTCAGAGAAAATCAAT
AATATATATGGACCTTATGAACACGTGATAAAAGTGGATCTAAAGCCCAC
GCCAACAGGGAAGGAAGCCCGAGGAAAAGGCATCACGAGCATCAAGTACC
AGCTGACTCTTGCTGCGGCAAAGGAGCTCGGCCTGCTCGACCAAGAATAC
AACAGGCTCAAGGAAAAGCATGACCAGCTACAGTACTACACCTATGGGCG
TGATGGTACCTCTCAAGATTTGGCAAATCACGTGCATCAGATATCTCCTC
TAGTCGGCAAGCTGTTGTCCTCCAAGAAGTATATGCTAGTACTCAATAAC
CTCCAGTGGCCAATTGAGCCTCTCAGTTTTACACCGGATTGCGGGCTTCC
TTTGCTCCCCTGGACAAGTTCTCGATGGCTCATCTCGCCCACATCTCAGG
ATGTCTACAAAGAGAGCAAATCAGAAGACAATGGGGTGTTCAAATCCATT
CACGAAGATGAACATGTTGTGTTTCTCACCATCTTTGCACTGTGTCAGTC
GGCTGAGCACATGCTCAACACGATCTGTCAGGAAAGCATAGAGCATTGGC
ATGTCATAGCCATCAACTGCTTTCACTATGCCATGATGATCTTTGCCAAC
CATTCACAAGTGGCGGCTGTTACCTCGGACGAGCTCATCCACCAGTGGGC
CACCCTCCTGCCACGCATGACCAACACCATCAGCAGTAGCAGCAAGTGTT
CTGATATGCGTCGAGTTGGAAGGGTCATCCTTGAAGCGTTTGAGAAATAC
TCTTTGTTGCAGCTGCCTTTCTCTCCTGCTAATGAAGCTCGTGAAGCCAC
CAATACCGGTGCACAATTCTTTGCATACCATGGCCTCATTGCAGAAAGCA
TCACAATAGATGAACTCACTGATAACAAGAAGAAATGGATCTCCTTCGTC
GGTGACCATGGATGCCATGTAAGCCGAGAATGGTTGTTGAGTCAGGAGGA
AGAAACCACGGGCACTACTGCACTTATTCTAAAAGCTTGCTCACAGCAAT
CACACATATTGTCTAAACTGTACCATTTCTTGCCAAAACTCCTCTTTCTT
CGTGTTCTCGATCTCTCCTACACTCCACTAAAATCACTCCCTTCTTCCAT
CGGCTGTCTCAGGAACCTTCAGTTGCTCTCACTTCGAGGCTGTCATGGTC
TAAAAACTCTTTGCAGTTCCTCCACAACTAGTGCCACAGACTCGATAAAA
GGTACTAGTTCACCATTGTCTACACTATACCAGCTTGAAATACTTGATAT
GAATGGAGTCCCTTTGTCTCATCTGATCCAAGATGTAGCCAGCCAAAAGA
GCAATTTGATATACCTCAACATGTCATATTCAGAAATAACTGCTTTCCCG
CTCTCTTTTTTTCAAGATATGTCAAACCTTGAGGAGCTTATCCTTGTCAA
CTGCTCCAACCTTGTGGAGCTACCTCCTTCCATGGTTGCGCTATCCAGCC
TAACGGTCCTTGAGATCACCCGGACTCAAATAAAATACTTTCCACATAAG
ATATTTGAAGAAATGCAGAAGCTTAAGTCGCTCAAGCTCATTGACAACAA
TAACTTGATTTCACTCACAAGGCCAGTCTCTAGGGTCCATGAAATCAAAT
TGGAAGGGCATCCTAACCTTAAATCCTTCTCGCTGATCGGTGCACCTCAC
ATTAAGCGGCTGTCTTTGCGCAGATGTGGAAAACTCGAGTCTGTCGAATT
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CTATTGGGGGTTCCTTCTATGTTGCGATTTCCTTGGCATATGGTACAGCG
ACTTCCAGAGGTGTTTTACTTTGATCAGTGTCCAGAAGGAAATGGTACTC
ACTCTGGTCAAGTTTCACAACTGTGTGTTAGTGACCCCAAGTTCTTCTAT
AGCTTCGGAAAATCTTGTGTGGATTTAGTAAGGAATGGACGGTTTTTCCA
ATCCTTCAGTGTCCAAGTTACACCATGCAGCACAAATTACATGCGGCTGC
AGCATGAAGAAGAAACTTTTGATAACAAGTTGCAGAATTTTGTGCAGAAG
CAATCAACATATACGGATATATATAACAGCTGTTATGCAGAGGAAACTGC
GATTGCATCCCCAATTACAATCCCTGTTCGCCGAACTGAGCGCCATGTAC
AGATCACAGGGATGCAAGAGGCACCTTATGGTTTATACAATCTTCTGAAT
GTCACCAAATCAATATCAGTGACATGTGATACTTCCATCGGTTTTTTTTC
TTACTTGAGCCAATATCAGGATCTGGAAGAATGCGAGCTACGTTGGTGCG
ATAAAATGGTGGTACTTTTCTACTTTAATTATGACATGCAAAATTTACGA
AATCTGCATGTCAGCAATCTCAGAAGTCTAGTTTGGTTCTCTTCAGAACG
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ACACTTGACATTCTGTGCTGCTACAACCTCAAGAAAATTTTCTATGAGGG
TGATCATCCAGGTTGCAGATATCGGCTCCTCCCATACCTCGAAAGGATAC
GTCTCCAGGAGCTTCCACTGCTCCAACACTTCAAAGACAACAATGCCACC
ATAGGAGCACCCATGTGGAAGGAGCTCCATGTCCGGGGTTGCTGGAGCCT
CCAACACCTCCCGCGCCTACGTGGTCCGCAAGAGACGGTGAAGGTGAATG
GGGAGAGACGCTGGTGGAGCAAGCTCCAGTGGGGCTCCCCCGGGGACTGC
TACAACTACGAGCCCAAGCTTCCTCCGAAGTTCGCATCCTTCGATGAGCG
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TTCAGCATGATTCGTAAACACCTGCCTTGTTAACGGTGTTCCAACCTACA
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TTGAGTGTCAGTTATTCTATGTTTTGTGATACATGCGTGTCACTTGAGTT
GTAACAATCTAATGTAATGTTGGTGTTGGGTGTTAAACTGTGAGACATGT
TTAATTATCAACAGTGCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.