Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE029840

[Submit comment/correction]

Sequence	AE029840
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE029840
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAAAAAAAAAAAAGCAAGTCAGCATATTGTTCTGTAACAGTCACCCACAG CATGTTGCTCTTTATCCATGTCGTGGGCTGCCAATTCAGATGTACTACCT AATTAGTAACACAAGGAGACATTACCATTTATATGTGTGTGAGTGAGACC GCACCGTCCCGGGTTCCCCTATTATTGAGCAAGCACATGTAAAGCTCGCC CCACTGTCCTCTCATCATCTCTCCAAACAAGGGGGAATTAAGGAAAATCG TGCTTCTTCATCTCCAGCAAGCTCAAGGTACGTAGATGATCTTCCATTCC GTGCATCCTAAGTCGAGACTTGAGAGCAGAAAAAAGACATGTGTGTACTG ATTCCTTTATTTTTTTTAGAGAAAGAATGGCGGCCATGGGTAATCTGCTA TCCAAGGAGCTGGGTCTTCAGATGTATGAGGACTTGAAGGGTGCCGTGCC CTGGCTGGTTCAGTACCTGAAGCCAACACGGGATAGCGTGAGGAAGATGA AGGAGTCCATGAACAAATTGAGGAGCAGGATGCAACCCGTGGCGCGCAAG CTATTGGAGATCTGTGAGAATGGTTGGTCGCCGCGGGAGTCGACGATAGA GTGGATCCATAAGGGCTTGGACTATAGCGCGCGCGTCCAAGTGATTGTGG ACCGGTACATCCAGCTTCGGGATCGGCACACGGGCAGCGCTGCTGAGGCC ATGCTCCACTGCCCCTGCGACGCCGTCCTCGCGAGCCGGCAGATCAACAT GGATGCTCTCGGCTTGACAGTGGAAGTCATTGGCCACTACACAGATGGCG CGACGTATGAGAAAGACGAGTACGACACTGGCAATACATGCTGGCGCAAA TTACCCGGATGTGCTCCAGGGCCTCTATAACCTCATATCCAAAGTAAAGC AGGTATAGCCTATCTGACCGTGTTCATACTTCATAGTCATTATTGTCATA GGCTAGCGTATCTGACTTACTCTTCAACCCTCATCGTTCAAGTTAGAGCG CTACTCCGAGGAGGTGTTAACGCTCTATATCGGAAACACCATGGAAACAA CCCCCATGAGCGATGATCACGGTTTGTCTGAAAACATCCACAAGGTATTC AGCTTCCAGACTCCACCATTGTTTAGATACATTCAAATTTAGATAAACTT GCGATCTTTTTTTAGGATGGAGGAACTAGTTTTTTTAAGCTAAATCATAT GTTCCCTACTGCGTATGTTTCTATTAATCTATTATATACTACTCACTCCT ATCCAAATTAGTAGATTCAGATCTATCTATATTCGGATATAACTGGCCGT GTTTTAGTGCTAGATACATCCAAATTTAGATAAATCTGAGTCCACTAAAT TGGATCATGGAGAGTATGAAAGCAAGATATGAATGTCTAATAAAACCATT ACATTAAACCACATCATTTAAATTTATTTTAATAGTTGGATCTATAATAT ATGGCTAGAATTTACCAGTGATCATGTAACCGTTTAAGTAGGCCGGTTTG ATAGGTTTTGATAAGCTCATTAGTTGTACAAAATAAAACATGAAAACAAA ACTGACACGGTCAATGGTAAAGACGTTTCTACAGGACTCCTAGGGAATCG AATGTTTTTCTTCTTGACTGCTGCCAAACCGCTACTCCCTCCATTTCAAT AAGGCGCGCGCATTTCAAAGCAAAGTTTTACCGAATAAATAAAGCAACTA AAATGTGATTATGTTGTGTAAAAAATAGTATTGTTGGATTCGTATTGAAA CGCACGTTCCAGTGATGCTAATTTTGTACCAATATTCTTTATATATATTT AGAGTAAATCTTGCTCAAAGAAAAAAACACGCAAAAAGAGAACGTCTTAT TCCTTGGGACGGAGGTAGTACCTCCGATTCAAATTAATGTTCTCAGATCT GTCGAGATTCAGATGTATCTAAACGTTAATATATATGGATCGAAGGGAGT AGTCATATCAGTCCGGGCGCGTTTCCCGTGCAGATGTATACCATAATCTG GACTGACCATTTGTGTCTCGTTTCATGTATATGTATTTCTTGATCAACAC GGGCAGTAAGTTCAAGCGGATGCATTGTGAAACGATTCAATAGCCGGCAA TCATCAATGCATGCATGTTCTATACATGCATGCATTTGATTAACAACATT GCTGGGCGTCCCTGGAGATAATTCCTCGGATCCCCGGTCCCAGCCTTGAC ACGTATCCAATAAAATACACCCTATACACATTTTTACTAAACCGTCCCAC TGTTTTACAGACAAGCAATGAGGGCACTCGCAAATCATCTTTAGCTTTAT TTGAAATTGACGGAGAACTACAATTATAGATTCATGGGCATTCACATTAT GTCCCAGAAAGTAATCCATTCTTATAGCCACTATGCTTGCTCGATATACA CCATATGTGCACAGAACATTTTTATCATGTTGAGAAAGAGTTATATTTTA ATTTTGTAGTCTTCTAGATTTTACCGGTCAACATCGCCATCTCGACCTAA CAAAATAATTGTCTAGAACTTAGGCCTTTCACAATAGGGTGTATCTTAAC ACGTTATCATAAGAGTTATAAATACCTAAGAGACAACCTCTCCAATGCAT TGTATTTTAGAGGTTGTATCTTAATTTAATATTTTTGCTCTCATGCATGC ATTTGATTGGGCTATCAACCTTTTTTGCCTATGATTACGTGCAAGGGGTG TATCTTAGATAAGATACAACAACACCTCTTTCATCCTTAATTGACATGCC ACATAAGCATTTTGCATAGTATGACATGCTAAGAGACTCTCATTAAAGGC CTTATAGCTCAACTATCAATTGTGTGATCTTACCTTGAGTCCGTACTTCA CATTTAGAAGTAGCCTGGATCCACATGATTGATTATGATGAAAAGTAATT TATGCCTATGTAATGTATTATTGGTATGTAAGTTTGTGTATTCTCAGTTT TTACATTCTAATGTACGATCATGTGGTTTGCCCTTATTTTGTGGCATAGG TAATACAATTCTTTTTCATAGTGAATATTTTTTTCATGGGTCAAAAAACT ATATTAAGGACGTACTATGTGTTGTTTGACATGATTTGAAGTCGTAATTA AGTTTGGACTGTGAGCTGATGGGTATTTCTTATACAATGTTAGATCGGTA CACATGGTTAGTACTTAGATTTGTTGGTCCATTAATGGAACAAACAATAT TTTCTTTAGAATCTAAATTGTCTAAATAACTATTTAGAACTGATAACTCA AATAACCATGGTATTTTGCACAGTAATATTATGTCATGATTAATGTCGCT TTCAAAATTAATTTAGGTGCATTTGATGGAATAAGAAGAAAAGCATTATA GGCATAAATAATGCATGTCTACATAAGCTTTCATTTTTTTCTTAGATCTG CCATCCTAATTATTGATGTTGAGAAAAAGGTGTATTTTAGCTTTGTAGTC TTCTATATTAGACCCGTCAACACCACCATCTAGACATCACGAAATAATCA TATAGAGCATAGAGCTAAAATATGAATTGTGTGCTACTACCTTGAGTCCA TTATTCACTTTTAGAAGTAACTTGGATGCACGGATTGATTATGGCAAAAA ACAGTTAGGCGTATGTAATGTATTCTAGGTTTCGAAGTGTGTGTTTTATT TTCTTTGCAATCAAAATTATCTAAATAATTATTTAGAACTGATAGTTCAA ATACCCATGGCATTTTGCATAATAATAGTATGTCATGATTAATGTCACAT TCAAAATTAATTTAGATGCATTTGATGGAATAAGGAGAAAAGCAGTATAG ACATACATAATGCATGGTTACATAAGATTTAATTTTTTTCTCACATCTGC CACTTGGATGACACTTCAATAGTTTAGGCATATGTAACGTATTCTTGGTT TGCAAGTGTGTGTTTTATTTTCTTTGCAATCTAAATTATCTAGAACTGAT AGCTCAAATACCCATGGAATTTTGCATAATAATATTATGTCATGATTAAT GTCACTTTCAAGATTAATTTATGTGCATTTGATGGAATAAGGAGAAAAGT AGTATAGGCACCCATAATGCATGGCTACATATGCTTTCATTTTTTATCAG TTCTGCAACTTATATGACACTTCACTTCATCCTAATAATTCTTGTTGAGA AAGACGTATAATTTAGTTTTGTAGTCTTCTATAAGATCATCTTTTGATTT TGTGTGATTGTTCGTGCTTAGCCTATAGAAATAAGTTAGCCAGAAGTAGG CTTGGCAAGATAGGACCTTGACAGTTGCTGAGATGGAATAATTCTCAAAA CATGCTTAAGCCCCGTTTTAAGATGCTCTTAGCAATGGAATAATGACCTA AGAGGAGCTCTGTGATTGACATAGTGGAGTCATTACAAAGCACAACCCCC CTCTCTTAAAAAACAGTTGGCGAGTCTATGTAGTTTTAGTTCCCGAATGA AAACAAATTACGACGGAGGTTGGGATTTCCAGTAACCGTGGTTACAAAAT CCCGAGCATTTACCAACCAAACATTTTTAAACGAAATTTGAAATCAAAAT GTCCAATTGCCATTAGTAATGCTTTCAAAACTTATTATTACCAAAAACCA ATGCTAGTGTAGTGGTATTTTCCTAGCGCAACCGCCTTAGTCGACTCCTC TATCGACATAAATTTACATCTGAAAATAAAAACCTGCAGAACGTCGGAAT CAAACCGCGCACAGAGGTCGAATTATCTCATACATACATGCGCCATGTCT TTCCAAAGCGGAGGTAGAAAGGCAACATCCTATTTAGCTATATATCAGCG TTTAAATTCAAAAATTTCAAATAGTCCCAGAAAAATTTGTTCCCAGTTAC CAGGCAGAAACCGAAATTACCGACCGGTAAGGCGGTAACCAAAACCCTCT CAGCCGAGGGTGTGTGAGAATAGATGTAGATAGATGATTACGCAATCTAA ACTGACGGTGTTAACATGATAAAATGCCTTTTCTTTCTCTCCCACCCGAC TACCTCGAACAACCCGCAGGCCCATACCTTACTTTCCCACCTACCTAGCC CCGATGTAAATACTAACGGGAGTTCTCCCTTAATTTTAATTTGAGCCACA ATGCCAAGGCTATGTGCACGAGCGTAGCCATTAGGGTAATCCATCAACAT TGGCAAGAGTACCACCACCGGTATTTCAAGGAAAAAAACTGAATAGCTTG GTCACCGTCGCAGGGGAGTCGGGAATATGAATCTCCATTGTCGAGGACGT AGCAGCCGGGACACATATAGCGAGGATAATCCTCCTCGCGGCAACCATGA GAAAAAAAATCCAAAATCGATATGGTGAATCAAGATCTGAAAACCGTACC TATAAAAATGTAATCACACAACACCACCATTGACGCCGGGAAGATCTTGT CATCGAAGAAAGGGCTGAATATCACTTATTGCGGATGCTAACTTCTCCAT TGACGTAGCCGCCAAGAAGAAGATGTCTACCAAAACTCTAACCTAATTTT ACCGAAACACTAATTTTCTTGAAAACTCTACCCATAGATCGGGTTCCACA CCCCTCCCGACGCCGGTGAGACCGGCCGGAGGAGGGGGGAACCGACCTAT GGAGGAGGCGGAAGTGTTGGCGGCGGCTGGGAGAGATGTACGATTTGGGG ATCCCACCTCTAGTTAATTTTGAGATTTCTAGTGTAAAAGGTGGGATCTA GATGGGTCCCAATTAACACCTTAGATGCTACCACAATAGGCAGAAATATC TGCGATAGATATATTATAAGGCGCGTGAAGGAATAGAGACCTTTCATGCG TTTGGTACTTGGTATCGTAGATTTCAATTTTGTCCAATTGGAGGCTGCCA TGTCGTCTTCTCCATAGTTTTTTTTGTGTTATTTTATTCTTAGTCCACCC GTAATTTTTCGACGGTATTTATCGTGCATCTATGACAATACATTACTAGA TCATGATGGCACGCGTTGCCGCGCCGTCTATTTTGGCAATAGATTGTTAG GAGTTTCTATAATACTATGGAGGCACAAAACATAAAGTTAATTTTCACGT TCATGAGCTAACCATTATACTATTATTTAATAAAAGATATGCAATGCCCA CACCCACCCTCTTGAGAAAAATTGAGCGCTGAAAACATTCGATGAATTTG AATAATTTCAAATGCAATGTACAATGGCTCAATATAGGTGGTGGGGCATA TTTATAAGTTAGGAACTTTAATCAACCTCGATTATAAGACCACATAAAAA TGATATTAATTAGTTAATCAATAGTTAGAGCAAGGGCAATAGTAGAGCCA ACTGCTGGCTATAAGCCATGTCCATGTTATCTAGAGTCAACCTAATAGCA ACATGTATAATAGATAAAGATAAAAATATATTATTTTATTAATATATGGC CCACTTTACAGTCTCACATAGTGCCTAGGAACACGTGGTGTTAATTAAGA GCCCACTCCTCTTCTCTCTCATCCAACTAAGCACAAATATACTATTTTAA GTCATGTAGCTTGCTGACTGGATTTTATTGTACTTGCTCTTAGATGACAG ATTTTCTTCACAAGTATGAGAAAATTCTAATGGTAGCACCATATTTGCTT TCCCTTCTTGCAGAATCACCACAGATATGCAATAAATAGTACATCATCAT AAATCACTTATTGAATCTTTTGTTTCAAGAACGTTATCCAAACTCTCATA TCTATGTTACCTAGCACATCATAAGTTGTAGATTTTGAAGGATCTGAACC AACAAAATAAATCGCATGAGAGCATTATAAACATACCACATAGATCATGG ATGGAACGAAGCCCTTGTCCATGTCAGTCAACTAACCGTGGTGAATTTCT TGACTCAATTGTTCGTCATCATTTTGCATACCGTGTATTGGCTAGGAGGC ACCCATAGACCATACCAAATGAGTGGATCTTGACTTCAAGAAGTTTTATT CACCTGTAAAATAAACAAAAGTACACAAGTTTCATCGATTTTTTTAAGTT ATATAGTGTATTATGTCCCAACTGTTAACCTGGAACACTGATAGAATTTC AAATATCAATTATTTCTAAATATGTTGTCTCCAAAAGAGGGAATCCAATG CAATTAGTACTTGGTAGGCTTCAGCAGTTAGGCAAGACTATTGTTAATAT GAACAAAGAATTATTATTACCTTTAATTTATTTTCTCATAGATTAAGCAC AAACTTGATAAGTTAAATGATTGCATTGTTCTTAAGATATAAGGTCAAGA TGCAAGAACAATGCAGTATACATATGCAAAGAAAATAGAGTGAGAAATAA TTTCAAGTTTCTTAGGAATAAAACAACACTGATTGTTGGAATTAAAATAA TTCTACAAGTAGGAAAAGTGACAATGGCTTTATTTATAAAGCGGGGGGTG TAATGCTTGTTTTGTTTCGAGGAAAAGTGACAACAGAGTTCTAACCTCTA ACATAGTGGTAGTATGATAAAAATAAAATTGTATATATAGTTTCAGCCGT ATACATTGGTACATAGAAGGAAGAAGCTAGCTAGTAAGATAGAAAATTGT AATCAACAGTGTCTAAATACCCTAATTAATCACTTCCGATACGAAGTTTT TTTTCTCGCTGCAGCTTCTAGTGCGAAGGACTCCTTTTCTCTTCGTCTGC ATCTTCTGAAATTAATCTAGAGGGGGAAGGAATATGAATTAATTAGGATT GGACGAGACCATGGAGATGATAAAAGGAAGGAAAAAGATAAGAGGGATTA CTTGATAGATGGGGTCACCATTTGTTACTCGTTGCCGACCACAGCAGGAG AGATTGGTACATGGTCGTGGCTTCACCATCGATCACAACAGGTGCTACCA TTAGAATTTTCTCATACTTCAACTGCTGGCCAACGGTGGCGGCCATCGCC ATCGATGAGGGGAACGCAATTGATGGCATTGCGTGATGCTGCTGCTTTTT CCGGTGTGGAGGCCGCGATTTGGGGGTCCTTCCCATTCCTCTAATCAACT TCTGCCACCGATGATGGACGAATGATAGCCGCCCACACGCTAGATACATT TGCCCGGACGCCATGGAGGAACGGCAAACAGCGAGCGAAAGGCCACTTGG AAATCGAGGTCGGACGGGGGACAACGCCGCTCTCTCTCCCCTCTCATCTC CTTCCCTCATTGTCTATCTATCTCTGTAGTGCGGCGGCGACGGCGGCACA GTCGGGATGGAATGGGATTGCGGTGCGGGGAGCCTCGTGACCGTACAGTT ACGATCGAATGGGGTTTGTCCGATTTGTTCCGCACAGTAGCATCCCCTAG GGATATGTGGCCCACGCGGAAGCGTCTGCCTCTTCGGACGGCCTAGATGA CCGGAAAGGTGATCTGGTGGCTAAAATCGGTAATGGTCTAAGAAGCCTCC GGTTTGTCCCAGTTTTAATATCCCTAATTATGCTTCGACTATAATTCTTT GATACAACTTTTCGGCCGTCGTTTTTTGACAGTAGTTACGGTAACTCTTT TCCTATGTGTAATTTCCAAACAGTATCCGTCAATAGATAGGATAGATGAA TTCTTGGCTCCTCGGACACCAACGTTATCAACCCTTATAGTGAACTGTAG AGAGCCTAATTTGTACCAATCACGGTGTGCCAAATCGGTGTTTAATTCTG ATTTTTTTACAACATTTTTACCTTTCCTCTTTTTATCCTTTGATAGTGAT TTTTCAATGCAACTTTCCGGCTGTTATTTTTCGGCCATAGTTAGTGAATG CCTACAATAGTACGTTACCGTGATTTCTTTACACAACTTTCTAGCCGTTA TTTTCGACCCTAGTTACCATATGCCTACATACTATATACATATTTCTCTT TGTATCCTTGACTATGATTTCTCAACACAACTTTCTCGCCGTAGATTTTC AGCAGTAGTTACCCTACTCCTATTACAGTAAAAAAAATACATTTTCATTT CTATATAAAGGACCGTAATTCGTCGACCCAACTAGCAGGCCATTATTTTT CGACCGTAATTATCCTTCGTTAAATCTTTGAATGAGGGTAATTTATGATC ATAATTTGTCACCAATTAGAAACATTATTTTTTCCTCTTTGACGGTAATT CTCCCTCATATTTATTTACCACATTTAAATCTTTTTGCCTTGCTTCAGCC CTTCCTTCATCTAAACCTTCTAGGACTAATCTATCTTTATGGGGAAGACC CTTCATCTAACTTCCGAGCTACCCTGTCAATTGTAAAAAGTAGTTGAGTC GTGTCTTACAGGTGCATAAAGAGTGAAATTTCATGAGAGAAATTTATAAG CGCCCTAGATCGACACAACTTTTCAGCCGTAATTTACCTACATAGTTATC CTACAGTAACTATTCGGCGGTTAGCAAATTTGATGAGAGAAATTCAAAAT CGGTATTCTTTTTTGAATTATGCAACGGGCATGACGTGTCACGTGTCGCC GCGCCAACTTGCCAGTATAAGATGGGTGTGGTGTCCTATGCATATATTGT GCACTAGTATAACTTGTTAACTACTCCCTTCATTCACTAATATAAGATAT TCTAGACATTTCAAGTTGACTAGATACATCCTAAAATGAGTGAATCTACA CATTAAACATGCAGGTTAGAAAAAAGATTAAATGTCTTATATTAGTGAAG GGAGGGAGTAACTAGGAAGTGGGTCCATGGACTCTGCACCTAGGGGCAAG ACTTGACAGCTAATGATGAAGATATATTGATCCTGATGATGTTTCAGCTA ACTCACATTATTTTCAAGAATTCGCAGTCCATGGAGAAGCTGGTGCTGAG CGCATTCAGCAGGTACGAGAAGCTGGAGCTGAGCGCATTCAGCAGGTACA GGGCCTTGTCGCGGTGCGAGAAGGACAACATCCCTGTGATGGTACGAGTG AAGGCGCCAAGGTACGACTACGGGTGTCGCTCACCCATAGACCTGGTCAT GGTGCTGGACATCACCGGAAGCATGGCCGGCGGCGAGAAACTTAGTCAGA TAAAGCAGGGCGCTCTGTTCGTCCTCCGCAACTTGCAGGCGGAGGACCGG CTCTCAGTCGTGGCTTTGCACAACAGCTGCACGCATCTGCTCTTCCCGCT GACATACTTGTCGGACGAGGATGGGAAGAAAGCGTGGGCGAGAACAAAGA TGGAGGAGTGGCCATCAATTGCCACGCCTGTTGACATCATACAGGCACCC GCCTTGGAAGCTGTCCATCAGGTTGTCGACGAAGTTGTACTAAATCAGCG ACACATACTATGAATAGATTGGAAAAGTATTCTCCTTAATTAAATTGCTT AAAATGCAGATTCTGGCCCAGCGGGTGGATCATGGTATCCGATTGGCCCG CGTCATGGTGTTAACCGACGGTTTAGAAGGGAAAGCCGCCATCACTACCA AAAGACATAATCCTCCTACCTACACCTTCGGCTTGGGCCCTGAACACGAC CGGTGGAAAGCTTACGACGTCGCATCCCAGGGGAACGGCACCTATTCCTT CGACTCCACCACGGACCTCAAGAGCATCGGAGCAGCCATGGCACTCTGCA TCGGTGGCCTAACGTCCATCTCCGCGCAGCACATCGAGATCTCCATCCGC TCGGAACAACCAGCAGGGGTAAGGATATCTCGGATCACATCTGGGGCCTA CGACAATCACGTTAACGAGGACGGTACGCATGGATCCATCATCGTCGACG ACATCTACAATAGCGAGGAGAAGAACTTCCTCGTCTACGTCAACGTCCCG AGAGACGACGCATTCTTCCGGTGGACAACCAAAACGAAGCTCCTGACCGT GAAAGCCTACTACTACTGTCCGGTGAGCAACTCTTGTGTGTGGGTTGATC CAGTCGAGGTGTCCGTAGAGAGGAAGGGTCAGACTCAGGCGAGCAGCCAG GCCGTTGAAGTGGCAGGCGAGGTCACCAGAGCCAGGGTTTTCGAGGAGGT CGCCAAGAGAGCAGCCCATGGGAGGACCGATTCTGGTTTCAGTTTGGCGG CCGTACGGAGTACCATCGAGGACACGCTGGAGGCCAAGGCAGCCAAGGAG ACATGGGAAGGCCTTAGCAGGGATCTTGATAGCATGGAGGACGCTGAGAC AGGGATACCCTTCATGCTCTCCTGGCTAACATCGCACCAGTGGCAGCGTG CAGCCATGCCGGGCTCCATGTCCAAGAGCGTGTTCATGAATTTCAGGACC ACCAGGATGAACAACTTGATAGACTCGGTGGACCTTGCTCCCGTCGACAT CCGTGCACACACATGAAGCCACGGAGGTCGGTTTGTGCACATACACGTTG CTTCATCGTTCAGCTCAATTCTCGCGGTGCCCTGAGATATACCAAGGAAC ATTTTGTGTATGCCTACGTACTATGCCGTTACTTCAACTGTTTTAATAGT TTTATAGCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.