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GrainGenes Sequence Report: AE015196

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Sequence
AE015196
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE015196
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTCTCTCTCCCCCCGAGCCCCTCTGCCCTCTCCCTCCCTCGCGCGCCGCC
GCGCCGCCGCAAGATGCGGACCCTCGCCGTCGCGAGCCACGTATCGCCAT
CCGCTGCCGCTCGACGGCGGCCCCGTTCGTCCGCCTCCGGCAGGTACGGG
ACCCCTCCTCATTTCACTCGCCGCTAGCGTCGATATATAGAGTCGTCCGT
GGCACGGGTAGCTCCGACGGCACGGTCGCCGGCTCGGCAGCCTAGACGTG
CCGAGGTCTGGCGGAGATCGGCGCAATCTTGCGCCGGTAATGTATTGACC
GTGGTTGCGGTTTTCTGGCTCATTTGGGATGGGATTTAGATGCCTAAACG
GGGCGTATGTGTTGCTATTTTGATGGTGCTGTGAGGCGGTGCAGACGTCG
CGAGGCAGTGCTTTCTACGGTTTGCATCGACTCGTTTGATTTTCTTGAGA
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TATCAGTCTACCTATCATTAATAATACATTTTGCATCAATAACATGATTG
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TCTTGTTGTGAAATAATAATCTCTTTCAACTCGAAACAATTTGGCTTCTA
TTTATCCAATGTACAAATCCCAGATGCACAAGGACCACGCTGTCGTCCGC
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AGTGTTCTCAACCTTTCTGGGGTAGTTAACTTCTAAAGTCTCGTGTTAAG
CGCCTAATCTGCATTAAGTTCTATTATTGATATTGTACATCTTCATTAGT
AATATTTTGAGGTCAGTTATGCCTTGCCAAATTTCAGTCAATATTCCTTA
CTGGTTTTGTCCCTGTCTTGTTCAGGATAGGTTGCTCTCAAGGGAGTTTG
CAAAGACATGGTTCGAAGAATCTGCTCACACCAGCAGCCGGTAATTTGCC
TTCCGCCAGGCCATTGTTTGTGTTCAAGAACTCTATATTAGCACTACCAT
ACATCTTGCGATAAAAAAATTGTTAAACGCCTTGATGTATATAAAAAATC
TTTCAAATCTTCAACTCTAGCCACCAATTCTACTATGGAAAACTGTAATT
TGGTCTTGATTTTGATCTCACCATATTTACCTGGTCAAAGAGTTGGCTAT
GGGCTTGGATCAAGTTTGGGTTGCCTCAAATGCTTGGCCTGAGCCCAACC
TGCTTTGGACCAAAGTCCAAACAAGTAGCATTCTTTATTTTTGTTTAAAA
AGTATATGAGCTTATGTCATGTCTAATGAGAAAATGACCAATTAAATTTT
AAAATATGATAGCAGTTTAGTTGCTGACACTCTAGGCCCAGCTCATGCTC
TCATTTTCCAGACCCAGCCTGGCCACCAGCCATGAACAAGTTTGGTATTG
CCCATCTCCATAACTCTGTCACAAGACAAAGCTTCAATCATGTAGTGTCA
ACTTTTTTTGGGACATCCGGGGGCAGAACCAGATAAGTACGGCCAGGAGG
ACCAATTAGTAATATTGGGCCCATATAGGACGGCTCCCACCAGCAACCCC
TTGTTTTCGTTCTTGGGGACATCTAATTTTGCTGTCCTTATATTTCTGTT
TTTCATCTCAGTTCCAATGTCATATGCTCCGGTTGGAGTTATATTTTATC
TATACATACTACATAGTTACATGCTGTTTTAACCTTTTTATCAACCAGAC
ATGCACGCTGTAACCATCTAAGTTTTGCTGTTTCCTTTGCATCCAACCTG
TTTCTTGCAGCAGCTGTTTCAGTTGAACAAATTGAAGTCAGTACTTATCT
TCCAAAAGGTGATATGTGGTCTGTGCACAAGTTTGGTGGCACTTGCATGG
GAACACCTCAGAGAATTCAGAATGTTGCTGATGTAGTTCTTGGTGACTCC
TCCGAGAGAAAGCTGATCATCGTATCTGCAATGTCCAAAGTTACCGACAT
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AAGCGCTGGAGAAAGTTTTTGAGAAGCATATGTCTGCAGCGAAGGACCTT
CTTGATGGAGAAGACCTTGCAAGATTCTTGTCTCAATTGCATTCGGACAT
CAGTAACCTTAGAGCAATGCTCCGTGCTATTTATATAGGTTTGAAATGCT
AATTCTCTGTATCTCACTGTATATTGTTTTTAAGTGCCTAGTCTTGATTG
CTAGGTCCCTAGAAAGTATGGCTTTTGTATAACGTCTCTCGGAAGTATGT
TCTTTCACTGTCTGTTGAATTCTTTCTTCTGTTGCTATTGCTGTTATGGG
GAGATTGTTGATGTTCTGCTAGATCCTGAGTTCTTCACGCTTTAATTTTT
TTCATCAGAAGCTTAAGCACCATCCCCCTGCTTGAATTTATTTCTTGTGA
AAGCTTATTTTTTTGGTATATATTTGTTTGAGTGTCACATTTTGTCCCAA
CTCACTCTCCATACATGTGCCTCTGCTCACTTGAAGTATTGGCGGAAACT
GGTTGGGGGCACTGGGGCAGCCTCTGTATGTGATTTACTGTCAGATAGGA
TAGCCATGTGCTGATTAGCATGTTCACTTATAATTTCATCTAGTTTAACT
TCATTTCAGAAAGACATACAATCTTGTTTTGCATCATTTTTTGCGGATAC
ACAATCAGAACACTGTATCAGTTACAACTGTTCGGGCACATCTTTTACCA
AATGACTAGTATTCTGGTATATCAGTATATGCTGTCTTCCATCTTACTGA
TGATTGACTTACCTGCTGCCATTCGAGTAAATAGGAAATACTGTGAAAGT
CATAATCTTTTAGATGTGTAATATCTTGGTTCTTTGTTTTATGTTTGCAG
CTGGACATGCAACGGAATCTTTCTCTGAATTCGTTGTTGGGCATGGAGAG
TTGTGGTCATCTCTGATGCTATGCTATGCTATACAGAAGGTACACATGAA
AAGTGCTTATGAAGTTATACAACTTAGCTCTGAGTTTATTAATGTATAAA
TGCTGCAGCATGCACTCTAACATCCTAGAATTGGCAGATGTCTCAATTTT
TTCTATGCTACTTGAAGTTGCACTTTCTAATGTGAATAGCTAACTAAACC
ACAACAATTCAATAACATTTGCTTAAATTATACTCCCACTCCCACCCTAT
CACATGTGCTGAATTAACAAATACACCTAACATAATGAAAGGTAAACATC
AGCGATGAGAGCATAGGAGCTTCAAGTTTTGCAGGGATGTTCTGCAGGGT
CTTTCTAATTAGTTTTGCAGGGGCTGTTATGACTTGTGAATTTTGGGAGG
CTCGCATGCTGTTGTAGTTCAGTCCTCATCTTAAAGTACCTTACAGGATG
TGCATCCACCACCATATCCTGCTATAGTTCAGTACTGAGAAGATGCCAAA
ACATTGTGGCTAAACTCAATTATAGGAGCAGTGGCTCATTGATGTTACTT
TCTCCTAAGTGGCAAAATTTATGTAAAGACAGTAGCTTAATTATTACATT
CAGGATGTTTACTTCTTATAAAGAAGGATAAATCTTGCAGCATATGAATA
TGATAAAATCTTACTTAATTTCCCTTTATCATCTTACATAGTGTTTCTTA
ACAAACTGACCTGTACTGTCTGATCTAAATTATGCAGTCTGGAGCATCTT
GTAGTTGGATGGATACAAGAGAAGTTCTAGTTGTAAAACCTAGTGGCCCT
GACATGGTAGATCCTGATTATATGGAATCTGAGAAGCGACTCCAGAAATG
GTTTTCACGCCAACCTGCTGAGATAATAATTGCTACTGGCTTTATCGCGA
GTACCCCTGAAAACATCCCTACTACTCTGAAAAGGGATGGAAGCGATTTC
TCAGCAGCAATTATTGGTTCTCTTGTTAGGGCACGTCAGGTCACAATCTG
GACTGATGTTGATGGGGTATTTAGTGCCGATCCTAGAAAAGGTTTGTCTC
ACATGGGTCTTGGGCTTTTGAACTAAATATTTTCCATTGGATTCGCTCAA
ATTTTTGTGTTGAACGTTGCAAATACATAATATTTTTGGGAGTATCTAGT
GCACGGAATTCTCCATTTCCCTTGTACAAGGAATTAAGTATATATCTGAT
TGACAATCATCTGATTAATGCAGTCAGTGAGGCTGTGATCTTAAGCACAT
TATCGTATCAGGAGGCCTGGGAAATGGTAATTTCTCTATTCTTGAACATG
TGCTCATATTACTGCTTTCAAGCTTTTACTAATGTTGAGCACGGCGACAC
AACAGTGTGTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGATGCTGCATGATTCCA
GCAGGGGTCTTCCACAAAAAAGAATGTTTCATCGCGTAAAATTGGTCTTT
GGTTGAGCTGGAGTTGCTTGCTGGGAATGGGAACCTAGCAATTGTGGGAT
CCATGTGCACTAAATTCATTCATTTCTTGCACTGAAGCTATTTGATCTCC
CACACCAAACCTCATTGGTAACTTGAATTTGTTCTTTGCAGTCATATTTT
GGCGCAAATGTGTTGCATCCCCGTACCATTATACCTGTGATGAAAGACAA
TATTCCCATTGTCATTAGGAACATGTTCAATCTCTCTGCCCCTGGAACCA
TGATTTGCAAGCAGCCTGCTAATGAAGATGCTGATTTGGATGCTTGTGTC
AAATCATTTGCCACTATAGATAAATTAGCCCTTGTTAATGTTGAAGGGTA
AGTCGGTATCATTTGTTCTTGCTTTGTATTTTTTATAATCTGGTTATGAT
TTTAATCTCTGTGATAGTGTACTCTCATGCTCTTCAAAAGACCTAGCAAG
ATCAACTCATATGAGAAATAGAGATATTGACATACGTGCAGATATCATGA
CTTTGTATTACTAAAACTGGTTTCTTCTATTTATTTAACGATCTCCATAT
CTTTCTCGCAGAACTGGAATGGCTGGTGTTCCAGGTACAGCAAATGCCAT
ATTTAGTGCTGTTAAAGATGTTGGAGCTAACGTTATCATGATATCTCAGG
TAGTTCATGTCTTTCAGTCTTTTGCATCTCCATATGATTCATTAGGGTTC
TTCCTCACTGTAAGATATGTGCAGGCTAGCAGTGAACACTCAATATGCTT
TGCTGTTCCGGAAAAGGAAGTTGCAGCAGTCTCTGCCGCTTTGCATGCTA
GGTTTCGCGAGGCATTGGCAGCAGGAAGGCTATCTAAGGTGACTCTTGTC
TTTGAAAAATACTCCTTTTGGAGTATGACATTTACATAAAGGGGTTAATT
GGATTTAGCCATTGCTACTTTCACCATTTGGAGATATGCCATTACAAAAA
CTGAACTTGGAGATATGCCACTCCAACTTTCTCATACTTGTACCTATGCC
ATTTTCTACACTTAAAGAGAATAGCGGTTCAAAAATACGTGTAATCTGGT
GTGTACTGTAGTATTTACCATAGCGCCCCTGTTTTCAAATTCCGACAGCA
CTTTTGGGTCTCCGGGCGCCAAAAAATTAAATTTTGGCCAAAATTTGAAC
TTCTCAGAAAAATCTGGAAAAATTACAGAAAATAAAAAACACTAGTATGA
ATCTACTGTTCTAATATGAGCCATTTCTGGGCAGATTTGGACCCCTAAAA
TTACATTTTAAGTTCTGTCCAGTCATATTGTGGCTAAAAATAAAAAATTC
AAGTTCTCTGTACATTCACGGAGTTGGTTGGGAGGAGGTTGGGATTGGTG
CACTCACATGAATAGCGATTCAGCGACCTGCAGCTCCATGCCGTCCTCCA
GCTACCGCCGCGTCTCTGGAAGCACCCATCTCCAAGCGTTGGAAATTGCA
ATGGCATAAAACCAATTAACCCTTACATAAATCAATAGTTTCAATAGTTC
AAGGTGGAAAAGCAAACTTCTGCAAGAGTTTAAGGTTGAAAATGAACCTT
TTCCTTTACTTTCCATATGGGCGACATGGCTAGGAGAATAGACACGACGA
AGCAAAGTTGAGAAAATCAAACTTGTCATAGCACTATGGATATGTTCTAA
TAATTTTGGAAGCACTCGTCCTGTCAATTTTCTTATGAAGTATTTCTTGA
TTTTTTCATCAAAGCAAACATAATAATTTGAAAAGTATCGTTTTGTAATC
TTTGTCAGATTTTGCTAAAGGAATTTCATTGTAATGCAAATGCGTAGCAA
AGTCTACACTGGATACCAAACAAATTCATGCCTTGCACATGATTCTTTTC
AGGTTGAAGTCATTCAGGGTTGCAGCATTCTTGCGGCTGTTGGTTTGAGA
ATGGCAAGTACTCCAGGAGTCAGTGCAATCCTTTTTGATGCGCTAGCAAA
GGTGCTTACAGTTTTGGGTTGGTAAAAATTTGATTGCCTTTGATACTGGA
CTCATTTTTCTGTAACAATTGGTGCAGGCAAACATTAATGTACGAGCGAT
AGCTCAAGGTTGCAGTGAGTACAACATTACTGTCGTGTTGAAGCAAGAAG
ATTGTGTCAGGGCTCTCAGAGCTGCTCACTCGAGGTTCTTCCTCTCGAAA
ACCACACTTGCTGTTGGTATAATTGGACCTGGTTTGATTGGCGCAACACT
GCTTAACCAGCTTAGGGAACAGGTATCTTGTGTTTGATACTCATATTATG
CACTGAACAATATTCAATATTTTAATTTATTTTGGAGTTGTGACATCTCA
TCCCTAGGATTATAAAATGTATATCCACCAAAAGAGAGTTTCAAGAATCC
CAGTGATGAAATATCTATTGGTAAAACACGTCGCAAAAATTACAAGAGAC
TGCCACTTCATTTCAAGTTTTATTGCAAAAACAATGCTCTCAGTGTAATT
TGTTAAAGAATCCTGAGAAGTATTTTGTTTGAAATGACAAAGTAGTCACA
TTTCGATTTAGTCAACCTCCCTTCTTCTGTGTCATATAGTGGTTTTTGTG
GCTCTAGCGCTTACCATACCAATGAATGTGCATAAACAAGATACTCCCTC
CGATCCATAATAAGTGTCACCCATTTTGTACTAAGCTAGTACAAACTTTG
TACTAGATGAGCGGCACTTATTATGGATCGGATAACTGTCGGTCATTAAT
GGCGAGCAGTATGTGTATATAGTGGTATTGCTCCCGGTTAGTTCGTACAT
GCGGTGAAGATAATCATTTGACAATTCATTTATTTGCCTAATCAGATTGG
AAAAGAAATGCTAAGATTTTGCCTATACATATGTAATATGGGCAACTATG
CATGAGAAGAATATAATAAATCGTTGCATTCTATATTCTACATGACCAGA
ACTCTAGTATAAGCTGTTTCTGCTACAAAGCCTACACCAGAAATGAAATG
TTGAGTTTGACGCCTTGACCTGACAACCGAACAATTCGAAGGTAGAGTTC
ACTGTTCACCACACTTTTACTCTACTGATTCAACTTCTGTGCAGGTAGCA
GTTCTCAAGGAAAATATGAATATTGATGTGCGTGTCATCGGAATAACTGG
TGCAAGCAGGATGCTTTTGAGTGACGCGTATGTAACTGAATCTTCTCTCC
CCCACCCCCTCTGTCAACTAATTGATCCTTTGCTTTGCTCTGGGTGCTGC
TTTCATGCAATTAAAAGTGGGTGCTGTCCCATGAATCTGTCTCTTTGTTT
GGTGAATTTCTCTTGACTGTCATTGGCATCATGTAACTGGAATTCTTTGT
TGCCCATTACACTTTTGTTTGCTCCTTCATTGTGATGCCTTTGTAATAGT
TAATGGCCTAATACTATAGATGGGGAGTTATTTAATGTTGAATTAAAACT
GTATTTGCTTCTATCTGAGAAATGCATTTCCAGGAATCAGCTACATAGTT
AGACAGGACCATGACAGATTTTGCATTAGATATAAACCACTGCTCATATA
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CTTGCTAATTTTGTTCGCCATTTGTCTGAGAACCATGTGTTTCCAAACAA
AGTATTAGTGGACTGCACAGCAGATGCAAATGTGGCATCTCACTACTATG
ATTGGTTGAAGAAGGGTATCCATGTCATCACGCCAAACAAAAAGGCGAAT
TCTGGGCCACTTGATCAGGTAATATTTGGCTGGCTAAACATATTTCGCCG
CTTTTTGTTAATTTTGAAATAATATTTAAGCTTTCTAATGATCATGGACT
GTACATCAATTGACTTCATCAAACAACAAGCTTTAAGTGGATCAAGTCCA
CTTTGGTGCATGTGTTCTAAACATAGAGTGGAAAAAAGAGACAAGAATAA
TGATACGAATTTTCCAAGATCTCAGATAGAGTTCAGATTACCGAGCAGCC
ATGCTTCCTCTCACTGACTAATATTCTGGGCGTTTGAATAACTGGCTAGT
TATCAGGACTTATAACTCCATCTGAGATCTTATTGCTCTCAGAATGAAGA
TCCCAAACACACACATCAATGTCAACTCCCTGTGTTTACTACCTTGCACC
TCTGCATGCCAGTTTGTCTGCTGGATTCTATGAACTAAGAAATGTTTTGT
GTGTGTGTTTACAGTATCTGAAACTAAGAACTCTACAGCGTGCATCATAT
ACTCATTACTTTTATGAAGCAACGGTTGGTGCGGGCCTCCCAATCATTAG
CACCCTGCGAGGTCTTTTGGAAACAGGCGACAAGATATTGCGTATTGAAG
GCATTTTCAGGTGTGCGTATGCTTGAAGAACACAGCCAAATTTTATTTTT
ATTTTCACAAAATGTAGTTTTAGTAATCCGCAAATATGTCAGTGGAAGTT
TATTTGCAGAAGTATATGCTCTTTTTGTCCATTAATAGAAATTTTGTTTC
AAAAGCTTTTGCACATTTTTTCTTAAAGAGAAACAGGTTTCAGTTACAAG
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GCAGTGGGACTTTGAGTTATATTTTCAACAATTTTGAAGGAACAAGAAGC
TTCAGTGATGTTGTTACTGAAGCAAAAGAAGCTGGATACACAGAGCCAGA
CCCAAGAGATGATCTATCTGGAACAGATGTTGCCAGAAAGGTAGTTCTTG
GTTTCTTTTGAAAATATTGTCACTAATTCCTGGTTGTTATTTGATATTGG
GCTCTGTGGCTAGATATATCTTATTGATTGACCCATTTCTGATTCCTATC
TCCATATCTAGAATAAGCTTTGCAACTTCTATTTGATTTGGACCAAGTCC
TCCCTATTAACTAAGTTGAATACTCTTGGGGTGATATTGGGTACCAGATA
CGTCCTTGGAGCCTTTACTCAAAGTTCCACGTTCTTTTACTAGGCTCATT
TCTCTGGCAAGATTTCTCTCAAAATTATATTTACTCGTGTGCATATTAAC
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TCCAACTGCTTTTTGAAGGCATTTTTTGTTGTTGTCGTTGAGAAAACGCA
AAAGCTTTGCGTTTCATTATATTGGAAAGGAAAGGTAGAGTTTTGTTACA
CGCCTCCGGGGAGGTTTACATCATGTTTACAGCAGTAGCGACTTAATGCA
CATCCCAGGTCGTCAGCACTATGTCCCTAAGCCCCTTGGCTCCTGCTAGA
ATCCATGCTGACGCTTGTTTGCCTCAAATTTTACGCCATGAGGTTTCTAG
CTTTTCCTTGTTTAGGTAGACGAGGTCATGTCTGTAAAGCAAAACATATG
ACAAACGCTACATTCTTTGATGACTTAGGTAAAAATGGAAAAAAAAAATA
CCGGGTTAATAATTTGAATACTTTTTATACTACATCTTTTATTTTGAAAA
CTTATGTTTTCCATTAACTTCTTTTATTAATTATTCATCATAATTTTTGT
TGCCTTTTGGTGGAGCAGGTCATTATCCTTGCAAGAGAGTCTGGTTTGAG
ACTTGAGCTTTCGGATATCCCGGTAGAGAGCCTTGTGCCAGAGGCTCTTA
AGGTAAGAATTGGTTTATCATATTCATAACAGACGATACCTTGTTATACA
TTTACAGCTTTACACTTCCTAATTGGGTTTGCCATGCAGTCATGCTCGTC
GCCAGATGAATTCATGCAGAAGCTACCATCGTTTGATCAGGATTGGGCCA
GACAACGCCATGATGCTGAGGCTGCAGGGGAAGTGAGTGAACCTTTCACT
TTCTTGAATTGCCCCCATGTTCTCTGAATTGTATTGTTTATCTAGCTTTT
AATTGGGCACACACTTCATACCGTTTACTCTGGATGTTTCCAAAAATTAT
TGAGTAGAGGTGATTTGAGTTCTTTTAACCTGAAGGTACTACGGTACGTC
GGAGTTGTGGACGTGCTGAACAAGCAGGGACGAGTAGAGCTGAAAAGGTA
CAAGAGGGACCACCCATTCGCCCAGCTATCTGGCTCTGACAACATCATTG
CTTTCACCACCTCGAGGTACAAGGAGCAGCAGCCGCTGATCGTTCGAGGG
CCAGGTGCAGGTGCGGAGGTGACCGCCGGAGGTGTCTTTTGTGACATCCT
GCGTCTGGCATCCTACCTCGGCGCTCCCTCATAGACTTGGTGACTGTATT
GATAAATTTACTGCTGTAGATGGACGGCAAAGATGTACTACTATTCTTGC
ATATTGGACCTGGTAGCATTTTGTTCTGAATAGGTGTGAGGAAAGCAAAT
AAAGTTTACATGACTTCTAGTGTGCTGTCCCTTGGTAGGGGGTGTAGGGG
TTTGTTCTTTTAGGTGCTTTTTTGCCACCCATGCCAAAACTGTTGTTGAA
TTATCAATGCAATAATAATGCCTGTTCTGGAACGGATGACTTTGGTACT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.