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GrainGenes Sequence Report: AE047851

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Sequence
AE047851
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE047851
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTGGCACACAACTCCAGGAAAATTCTACGGTCTTCGAGCTGAAATTAG
TATATGGGGCTCACCAAATCAAAAAGACTCTCAAGAAACTGGAGCATCCA
TACAAATATACTGTCAAGATGAAGGATGCTACAACATGGTTCAAGTTGGA
TTTCATGTATAAACATATCACACATCCATCCTCATAAAATCAAATACTAT
TCAAGAAATTGTTTTATTCTAGTTTGGCTTGCAGGTTTCCCCCTCTTTAT
ACCATAATAGAGACGTTCGTTTCTTCACATACTGGACAGTAAGTGTAATC
TTGCTCTTTTATTAAACATATAATGTCGAGGCATACCCTACAATTTATGA
TTTTGCACAAATTTGGAGGCATTATCTATATAATTGTAGGTATTTGTTTA
TTCATAACTTCTTTCCTTTCATAATTGCTCAGAAGGACTCCAAGTCAGCA
GGATGCTATAACTTGCAGTGCCCAGGATTCATTCCTGCAAGCGGAGCTGC
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ACCACTACGTCAGACTTAGCCTTAATAAGGTGCAACCTTTTTCCAGTATA
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AAACGTGTTTCTCTTTCTCATGTTAAAATTTGACTTTATGAGTGTGGACA
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ACCCCATCTTTTCTAGGTTACTTTCCGGTGGAGCTTTGCCCCAGAATGCC
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GTCCTCCAATGGGTAGCGGCCACTTTCCCGATGAGAAGGATAATGATAAG
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GTTACACAGAAACTGATCTCCTTCCTCATTTTAACAAGGGGTACGCATTT
CACTATGGTGGACCAAGTGGGTGTCTTGGTTAAAGAACACCAGTATGGTT
GATTTTTCTGATTCAATAAATCATAAATTTATTAGTAGTGAGAAAATTGT
ATCCCTACTTGTTTTGAATTTTATGCAAAAAATATGGAAAAGGAGGACAA
GGTAGACTAAACTAGGAACATATTGAAGGGGCTTTACAAAAAAAACTATA
CCCGAATCTAGATTACAATAAACAAACCGGTTACTAAATGCCTCTACGTG
TTTGGCTAAAAGAATCTCAAACCGAAGACCCAAATTTTGACTACCCCAAC
CAATTATGGTGAAGGAATTGGGTAGCCAAAATCTTTATTCTTGAAGATAC
CCAAAACATGATACACAAACTAAAACCTATATTTTGGCTATCGTCTTCTC
ATGAACGATAATCCTAATTTCCAATTCAACATTCAAACAAGGATAAAATT
AGTACAACATAATTAAAATAAATACATCATTTATTAAACAACCTTGTAGT
TCAAGACATAAATTGAATTGAACACTGGAACACTAGGAGAGATGATGACA
AGTTACTACCAATAACCCATAGTTTAGGGAGTGGACTACTCCCTTCTCAT
GCGAGGAAATCAGAAGGAGTCGGCAATGGTGGTGCGGGAGACCCTGGAGG
TGATTCCGACGACGGTCCCCATGCATTCTTTGCTCCAATATGCTCTCTTT
GTTTTGTTTCTCTCTGTTTCATGGTGGTTGCCTTGCCTGGGCCCTCGATA
AAATACAAAATGATAGAAAAACTTCTTCTGTAATTTCCATGGATTTTTTA
TGTTCAACAAAATATCTGGGCATATTCTAAAAGTTGATAATAAACAGTTG
CAAAATTAACTAAAATTCAAAAGAAATATATATGATTTAGACCTATCAAT
ATGGATGGAAACATGGAGAAGTGCACATTTTGCATTGGCAAAGCTGTGTT
TCTTTACATTGTATTGTAGTTTCATGTCAAGGTGTGGAAATAGACGAGGA
GAAGATCAAGGGCATTCGTGATTGGCTACCACCACAAATTGTAAATTGTA
TCTGGTTAAGGTCAAGGTGTAATTCTTTTGTTTAACGAGCGTTGTGTTAC
TTCCTTTCTCCTGCGCCTACGCTCTCCGCCACTACAGGAAACGGGGTTTT
TATCGACAGCCACAAATCCTCGGGAAAGAGGTATGGAGATCGTTGCCCTC
GACATCTTTTTAATGGCAACCCTGGCATGGCATGCATATAGACGACCATC
AGCATATGACGAGGTTTTTTCTTGACCGTCGGAGAACACAAGCCCTCAAC
ACAAAAAGAGTGGTTTGCCGTCAGTTTGACGTTGTTCGTGGATACGTCGA
TGGCCAGGTCCTCAGCATACCTATCTATAACGAGCCTCTAGATGCCGCCA
CGTGTCATGTGTATGTCGAGGGTCCGGCCAGCTACATAGACTGCTCACGC
TATCCCCTAGACATTGTTGCGTGTCCAAATATGCCACATTCCTCACTATC
AGCATACACCAAGGTATGTTGATGGCCTACCAGTTGGCACATGTCCCTCT
CGGAGATCCTAGTTGCCGCCACATGGACTCTATGTCGAGGGCATAGCCAT
CGGCATACCTCGGTGTTTATGTCGATAGCTATGCCCTCGGCATAGAGTCC
ATGTGGTGGCAACATAGTGGCCTGACCAATTTTGGACACCAAATGTCTCT
GTTTGGGTCGGCCCAGGGACAACAAATGTGGCATTTCTTTGCCCTGGTCC
ATTTGGTGTGGGAGGGTTGCTCCCAGCGGCCTGACCCATTTTACCTTTTT
ACCTATCATCATAGACGATGTACTGTATTAAGATGGAACGCCCCGTCGGC
GACCACTCCTTTCTCAGGGTCTGCATGTTGTTTCCCGCACGGGGGCAATC
ATTTGGCGCGTGCTGCCAACTTTCTTTTCCTGTCGTGGCCATGGGCTATA
TGAAGGTCGTCGCGGCGAGATGGACAACCAAACCATAGCTAGCCACGAGC
CGGCAATGCCTCGCCGCAGGATCACCACATGGTCTAGAATTAGCACACTC
GTGCGCGAGCGGTTCCTGGCGGAGGACGCCAAGGCACACGACATCTCCTT
TGTGGAGACTATGTAGGACAGGGAGAGAGCAGAGCACGTGGTGGAGACAC
ACGAAATAGTGGCCGCGGCGCAGGGTGCGGTGGCGGTGGCCGTGACAGAG
CCCATGATGACAGTGGCCGGGTTGTGTATGACACATACACGGTGCTCTTG
GATGACGACGACTACTTCGACTGCCTCGATGACCTTGACGACGAGGTGGG
TGTGCCAGATGTGAGCGACGAGCAGCGTACTCTAGAGAAAATAGTTGCTA
ACCTTTTAGGATACTTCGAAACAAAGAGGAGAAATCTTAAGTGTGGCTCG
AGCACCTCATATCATGTTTATCTTGTGTGAACTCAAGTGTCATCGCTCTC
ACAGGCATTTAATCGAGCACCTCTAGTGCATAAGAGAAAAAAACCTAGCA
CAAACTTTGCCACACCTTCCCCCATGAAAAAATAGAGGAGAGCATGTGCC
ATATATATAGGGCCAGCCTATTGGTCCCGGTTTGAGATACAAACCGGAAC
TAATAGGTGTGCCAGGGCTGCGCAGCAGGCACCTAACCCTTCTCAAACCG
AGACTAAAGGTCTCTTACGGTGGGGCAAGTGATTTCGAAGATTCTGGCTG
TCTGGTTCGGCCGATTAGTCCCGGCCCCAGCTACAATCGGGACTACTGGC
CCGAACCGAAGAACTTTTTTTACTAGTGTCTGCTCGCATCGTTCGAGACC
ACCAACCATGACACCTTTGGATGACAGTTCATGGTTGTCGAGTGGGCGGC
CCTACAAGGAATGCTCTTAGCCAGGGAGGGCACGTCGGTCAGATGTGTCG
CGTCAAGCCAATCCTAGACGGATGAGCACTAGGCGCACGAGGCCGTGGTG
GAGGCGAGGGATTAGCGGCAGGAGGCCGTGTTGGAGGATACGGAGGCGCA
GGAGGCCAAGGAGAGCTGGAAATCCAGGATGGAGTATGCCCTGGTGCTAG
GGAGGCATGAGAAGGAGGCCTCAAGAACCTGCTGGACTCCCGGCGAGAGG
ACCCAAATGTCGCCTTGCCGGGAGGGTTACGCTGGACGATGGAGGTGGCA
ATCTCGGCGACGCACCTTGCTATTGGGAAATTGTGCATCAATGAGGCGGC
CCCTCTGTCCACACTGGGGCAAAGGATGGCACGTAGTAGACATCGCCGGA
GTAGGGCAGTACGGCCAACAACTTTTTGGATTGTCGTCGTAGTAGGGTAG
GATAGGCAGAATGCTTTTGGATAACCGCCGTCGTATTTGGGCTAGCGTGT
GGATTATGATGTAGTGTGTGGATTATGATGTAGTGAGAAGTGAAAAATGT
TTATTTCCAGCCCAATTTTAAGCGAGGAATTGATCGGCACGAAGCGCGTC
AGTCCATTTGGATTGAGACACTGGAACATGTTTTGGAGAATCCTCTTGTT
CAATCAGACCAATTTAGATAGGCCCGGTCCGTTTGGGTCGACAAGCCATA
AACGAGTGACAGTAAGTAAATTCACCCTGACCGTGCAGCATAGTGCGAGC
AGGTACTAGCAATTCCCCGAAGATCTGATCCTCAGTCTCCTGACGCTTCA
GGGTTGGTGGCGCCGGGACCTGGAAGCTGTGGCAGAACCTAAAAACTTCC
GGAAGTCTGGACAAATGAGGTGAAGATGCGATTTTTTCATACAAAATCGC
TATAAAAATCTATGAAAACGCAAGTTTTGCGCCGTCAGCAAACCTGGACG
GCTGTCTGGGCTGGAGAGACGCTGGGTTCGCGCATGTATGACTCTAAAAT
TAACATTAGGGAGGTGTTTCGGTCACCTAATGCTGCTATAGCCATTGTTT
GATGTACATAAATCATTTAGCAGTAGAGTTGTCCTGAAAATTGGAGCTGA
GGCTCATACCTAGAGAACTTGCCCGATAAGGGGCGCTTTTGATCAGCAGC
ATTGCTTGATCGTACATAGAAACTTTCCTTGAGGTAACTTTGGTGGTTGC
TCGGAAGAAATTGCGAGTGTAACCAGTTGGATCAATGGCATTGGCATCTA
CCGCTACGTGTAAACTGTGGGTCAGCTAGCCCCATGGTACTATCTTGCCC
TGCATGCATATACTGAGAACGAAGTATTGCGCTACTCGATCGGTGTTTGT
GCAGTCATCGGTTTCTGCCGTGCGTATAACAATGTGTTTTATCTTAGAGA
GAAATAATGATAGGCATGTGAGAGGGCTGGACGTTTGCGGGGTAGTGCAA
GAGAGAAGAGAGAAGAAGGCTCATAGTGTGACTACCAACTGGGGCAATCT
GCTACAATAGCCGGACACGCCAGCGTTTGTGGTTGTCCTGATGGACTTAT
CCGTGACCCAAATCTGATGCCCGGATGGGTCGGTTCGGCCTAAATCTGTC
CGGATGGTTCGTCTCGTTGGGACGCCACATTTGGCCTAGCTATCCGCATG
GACCAATTAGAACGCGGTCGGATCTTTTGGGTCTTCCCGGTGAAGATGCC
CCGAGAGAGCTTCATTTTATCCCAGTTTTAATGTCCCTAATAATGCTTTA
GGTGACAATAAGAGAGCTATTTGAGCATTTGGACGTGGCTTGCTCTAGCT
AAGCCGAGAGACACCGACGGTGGCCGTCAGAATAGCTCCAGCTAACGATG
GCCGAGCTGTGCCGACATGTTTCCTAGTCGTAGTCATCTCTTCGCTCTGC
CGACGATACCGGTAAATTACTGCCGGCATAGTTTTTAACCGTCGGTAGCC
TCTATTCTCTGGTGTCGGGGTCTCGTTGCTCACCGTGGTAGTTTCATGGA
TCCTGATCTTTTCAGGTCGAGATGAGATGCATTTGATTTGTTAAGCTCGC
AGACCTAGCACCGGCGCATGCTTTCCCCCAGCACCGGGAGTCCGGGACAG
AGTGATGCATGTCTATTGTAGTCTTGATTTTTGTTGCTTTCAAAAAAATT
TTTGAACTTTACTATAACTGAAAAGTAAACCAACTGTAGTTACTTCGGTT
GTACGTACTAGGGGAAAGTATGAGCGTCGTTAGAGCAGCTCTAACGGGTG
ACTGTGAAAACGCGAACTGTAAACACACGATACAGATGATGTACTCGCAA
TTTACAGGTTCGGAATCCGTCGCGGAGAACGTTGCCTGTAAAACGAAACT
GATAATTTAAAATTTTGCACTCGCGGCAAAATTCGATAACGAACACGGTT
CAAATCATTACATATTCAGCAAAATTAGGAATAAAAGCAACGATTTTACA
GCTCTGCTTTACATAGGGGAGGAGCACGGCGGTGTTCTATACAATTGGAG
CTTCGGCGTGGCGGCAGGAGCTCCAAGATGTGGTGGCGCGGCGGCGGGAC
CTTCACTCCATGGAGAGGTCGATGAGGATAGCCAGCTTGAGCTTGATGAC
GTGGTGCGCGTCGTCTCCCTATCCCTGGCGACGCGCGTGTTGACGAGCTC
AACGGCTCGGCCGCTCCGCCTGCTCGCGGACGATCTCCGCCTTGCGGCGA
GAGCTCGAACTCGCGGGCCAACATCTCGAACGCGAGACGCTCCTAATCGG
AGTCGTTGGCTTAGTCGACGGGCCGCACGTGGGGGAGGCGGGGGGCGAGC
TCCAGTCGTCGGAGTCGGAGCCGGAGGAGCAGTGCGGGAGCTCCCCTCTC
CAAAAGGGGGCTCACTGGCATGCGTGTACCTATGAATCGTCGGCATGTGC
TATGGGGACGGCGGCCAGTAGCGCTCCATCAGCACGGTGTAGAGGCCGGG
CGAACGACGCCGGCGGACGCATCCTGCGGTTGGTCCACTTCTTTAACGCC
CTTTTATTCGCGCCCTCGGAGCGGATTATATTCTACCACTCATCCTCGGT
GAGCTCGCCGCAACGGCGAGGAGGAGTTCGTCCACCATCACCCTCGCCTC
CGCTGCACCCTCCCCCGACTCTGAAGTGGCGGCACGACATGTCGCGGTCC
TTGCGGTGGAACGCCCGCGATTGCTCGCCAAAGTTGGAGCTGGCGGCGGT
GCTAGGGTTGGGAGAGGGAGTGAGAACGGGTTTGGACCCTCAACCGCTCG
TGCGCCCTCTACTTGTACCAGTCGTGTTGGGCAGTTAATGGGCCAACGTA
AACTATTTTATGAGCCAGGCCTGATCTACAGTCACTGCTAGAGCGACTGA
AAACGCGCGGACCTGTAAACCCGTCGAAATTTTACAGTTTTCGCATTTAG
AGCCACCGTTGGAGCTGCTCTTACAGGGTTCAGAAAGATTAGAGTTCTTT
GGTACATTAATTACTTCAGAAATTTCACGATTTGGAGTGTTCAGATCATA
AGTTATTTTCTACTCCCTCCTACTCAAATTAGTTTACTTAGATTTGTCTA
GATTCGATTGTATCTAGACGTGATTTAGTATTAGATATATTGGTATCTTG
ATAAATTTGAGTCGGCTAATTTGGGTCGGATGGAGTATATTAATTAATTG
AAATGATTCTTGATCTACATAAATTATTTCCTAAATATTGTGATCCCTAG
TGGACCAATAATATAGATCATTAATGTACATTAATTAATGATTAACAACA
TTTAATTTAAGTAATAAAATGATCTACGCAATATACTATGATAATAAATT
CGTCAATAGTAAGAGATAGTACTCCATATCAGAAAATATTGTAAAAGATT
CTTCAATAGCCCTTCATTCAAAAATAAGTGTCACAGTTTTTTCTAGATAC
GCATGTATCTACACACTTATTCCCAAATGGAGGAAGTATAGATGAAAATA
TGGTCATTCATTGGATTTAAATGCGGGCAATTATTAGTGAACATTCATGG
GACAATTAATATATACCATATCAGAAAATATAAGCATGTTGATATAATTC
ATTAAATGATGAATGCAGCCTAAATATTCCGGACAAAAATGTGGGCTCCT
TTTCATATATTGAGATCTCCAAAGAGCATACACCTAAGGAACCACACAAT
TCCAAGTTTCGTTGAAGGACACATTTCCTTGAACCCATGGATTGTGGTTA
TGTCGTCTTATCAATCTTATTGTGCTTTTCTTTCACGCCTTGCTATATCA
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TTTGTTCACCCCATCCCAGACAACATAATCCTGATAATTGCTATTATGTC
TAGCTAGTTGTTGCCAGTATCTGTTAACATTTGTACAATTATAAATTAGG
ACACCACATGTCAAAATAAATACATATATTATCATTCTCATAGCTTGGTG
CGACAATTATGCTACTAGCCAAGAGCTAACATTTTATTTTACAGAACGCC
ACTCATTTCAATCCTCTGCCTGTCGAGTTCTCCAAAAGTCAAGATGGGAG
TAATATTATTTCTCATGTAATCTCTCTCTCCAATTTCACGTGCAAGATTT
TTGTATGTTTGTTTATTCCTAGACGAGCATTTGACCATACATATGCATCA
CATGTTGATGTATGCACCATGAAATGTGATTTGAGTAAACATATCATGAG
GAAAAAAACCCGAGTATTGAATCCTAAAAAAATAAAAATAAAAACCCACA
TGCATGGATGGCAGTCGGTAGTCATAGATACAAGGTGCATATTAGCTGGT
TTTAGTAATCATATATAGCTTATTGACAAAAATTCATGTCTCTCGAGATG
AAGGAGCTTTGTGTTTTATTCAAAAGAAGAAAATCAAATATATATTAAAT
AACAATGCAGACACTAAGTTTGGGTATCAATATATATGGGGTCAAAGCGA
TGGACCATGTAAACAAGACACGCCACCGAAACATCGTCATGCAATCCATT
TGAATAGGCACCTATGCCGTGATTTGCTGGTGACTTACCCTTTTTGTTAC
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AACAACGCAATGCCCTAGCGTCCTTATGGATGCATACAACCCAGAAAAAG
GAAAGAAGAATTACAAAAAATAAAAGTCCCGCTACAATGATCAATTCCTT
ATAGCAACGACACTAATATCACCAAAACACCACCAGAAGTCCAACCTCTT
CAATAGTGACGCCTTCAAGAAGGAAACAATACACAAGCGGCGTCATCTCC
TGATCAAAGATTATAGGTTTTCACCCTGAAGAAAGTCCTCGCTCATAAAA
CAATGCCTTCAACAAGGTTATTGCCAAGCACAACCAATTAAAGCCAGGCC
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CCCCCAACAAACACGTTGTTGCGAGTCATAGATCACCAAGCTAGTTACTC
ATCGCCACAAAGATTCAAATCATCACCGCTAGCCCACATGTTCATGCCTT
CATGACTTCCTCCGCATCTGACTTCACCATGGATCGTCAACGACATGACA
CATGATGGTAACAGATAGCAGAGCTTCACAAATGCTCCCTCTGAAACCAA
ACGGCCAAAAAAAACACGGGTGTACGTGAACGAATTCCTTCCGATCCATC
TGGCTTTACCCCTACCATGAGAAGGAAACTAGACACTGCCAGCCTACAAA
AACACTCGAGTCACCCCATCGACAAAGCACACGACCTCAGGATCAATCAA
TGTAGGCACTGTCACCAGAGGTCTCCATTGCACTATACTGAATTACACCC
TACAAGAAAAATATACTAATGAACACTACTCGACAAGGCATTAAAAAAGT
CTATACGAGCTCCAAAGGATCACAAAGAAAATTTCATCGTAAGTGCTATC
AAGGAGAATTTGGTACTACATCTAAGAAGATACACTGATACTTGGTATAT
ATTCGCGGTTGCACTCCACGCATTTTCAGCTATTTACTAATCTCAGCTAT
AACTCTGTATCAACAGTATGCAATGTGGCACACACCGCCAGGAAACTTCT
ACGGTCTTCGTGCTGAAATTAGTATATGGGGTTATCCAGATATAAACTAC
TCTCAAGAATCTGGAGCATCCATACAAATCTATTGTCAAGATGGAGGACA
CTTCAACTTAATTGAAGCTGGATTTCATGTATAAACAGAACGCCCATCCC
CATTATCTTAATACCATGCAACAACTTTTTTTTACTATAACTTGGATTGC
AGGTTTCCCCCTCTTTGTACCATAATAGAGATGTCCGCTTCTTTACATAC
TGGACAGTAAGTGTAACCTTTTTCTTTTAATAAACCTTGTGATGTCAAGG
TATATGCTACAGTTATGTTATATTAAGTGTACTATTTGGAGATATTGTTA
TTTTAAGTATAGGTATATTTCTATATCCACATGACTACATGTTTTATTTT
ATCATGCTCAGAATGACTCCAAGGTGGCAGGCTGCTATAACTTCCAATGC
CCAGGATTTGTTTCCGCAAGTGGAGCTCCATTGGTGCCTGGCCAAGCTGT
TGCTCCTCCATCAAGTTACAACCAGTATGACCACTACGTTAGGCTTAGCC
TAAATAAGGTCCGCAACTTTTCAAGGAAATACAGTAATACAATATTCCAT
CAAATTGAACATACATGATAGCTTATAACTTATTTCTACTTATCTGATAA
ATAAAACCCATAAAGCTGGAATTTATGAGTGTAAAGTTTATTATACTTTA
GATACTAAGTAATATGATATGGTGTTTTAGTATCAGAACATGGAAGTTAA
GAATCTAAATAGGTGCACTTCACTCAAGACTATTGTTAACCGCAATTTGT
TTTTTGCTCTTGTTTTGCATGAAAATGGACATCTCCCTCCTCAACAGGAT
CCAAACTCTGGAGATTGGGTGGTGTACCGACATGATTTAGGAACTCCACA
ATTCTTGGGTTATTTTCCAGTGAAGCTTTGCCCCACAATGCCACTGATAC
AAGCATTGGCGGGATTCGTGAATTACTTCAACACTACAAGTGGTCCTCCA
ATGGGTAGCGGACACTTTCCTGATGGGAACGATAAGAAATATGCATACTT
TAAGCATATTAAGAAATACCACTCCAACGGTCACCCTTACGACCCAATTG
TAGCCAGTATGGTCCCTTTAAATGACAGGCGGGATTGCTACAAAGTAACT
GATTTCCAACCTGATATTGGCAAGGGATATGTGTTCCACTATGGTGGACC
A

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.