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GrainGenes Sequence Report: AE047045

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Sequence
AE047045
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE047045
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGAGCAGAGCAGAGAGGCATTCAAGATCAAAAACCCCAATTTTTTCCCC
TTCTCTCTTCTCCTAGCCTGCTCTTCTTGCTGCTCCCCCGAGAAGAGAAT
TTCTTTTTGCTGCTCCGTCCTTGCATTTGCGCGAGCCTTGAAGTGGGGGG
CGACCATGGAATCAGCGCCGGATGCGGCGGTGGGGAAGAAGCCGGACGTG
TGGGAGCTGTTCCGGCACTACGACAAGCTCTACTTCCGCGGCGCGCTTGA
CAGCGCCGCCTTCGAGCTCGAGTGGACCTCTCCGCGCTTGAAGACGAGCA
AGTGCGTAGGCCTCTCCTCTTGCCCTCTTCCTCCTGCTGCTCAAGTCGGT
TCTTGCGCCCCTGTTTCTTTGATTTTGGGCATGCCAGGTTGTTGCTGGAA
TCCCCGTCTGGCTCACAGAATTTTTCTTCGATTCTTTAAAGACCGATCAT
GCCTAGGATCGGCGGTGCGTTAGATTCTTCGCAATTTCCACGGAAGATGG
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AATTTGTGGCTTTAGCCTTTAGGCCAACCTCAGCATACTGCATCTGAATT
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CCCTTGAAGAGCATACTGCATACGAATTACAGACTCTACTTAACATTATG
GTTTGGCTGTACTTACTTATTCACAGTCTAAAAATGGCTATGCAAACGGA
AGAAACATTTCATAGATTGTTCTGACATTTAGATTATCTCGATGCATTTA
AAATACTGAATATGGGGTTGGGCACGTGCCAAATTAGTTATTCCTACAGA
AATTGGTGTACACAAATGTATTTACAGTACATATACTTTTTTATTCGAAA
TGGGGTATTCCCCGGCGGCCTCTGTACCGATTGGTACATACAGCCTTTTT
ATTACTTCATTCAGAATCTGTTCTTACACATTATTACATCATGGGTCACA
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GACTTTTCATCACCATGTTAAGCGAAGACCAAAACGCCAGTTGCACTGGC
TGTATGAATGCCGTGGAACTGATTCCAGCTGGCTGCACCCAATATCCAGA
GTGGGACGCTTCTCCGTTGGTTGTAGCAAGGACCACGTACGGATCCAATA
GGTGGCCAATGGAATAACCTGCATAAATGAAGAAGATTTCGCACTGTTAA
AGATATAATTGTTTCGCACATTCCATATAGCCCATAATATGGCGCACACT
CCAACACGGATCTGAACTTTATCATCCTTTCCAACTCCAGCCAATCAATT
ACCAAACAAATTTGTTATATTTTTTGGAGGAAACGCTCCGCACGCGCTGC
TCTCGGGAGGGGCGGCACGGGTGGAACCCTAAGCCGCCGCCGCCCCCGAC
TTCTCCTCCCGCTCCTCCTCCGCTGCCACCGGCGGGCTAAGCCCGGCCGG
CCAACGGTGGCGGCGGGGCTGCTTCCTCGCGTGGTGGCCTCTCCCCCGCA
GGAAGCCCCTTGGGCGCTCGATGGTTGTCGCCCTGACGGTAATCTGATGG
CGGCAGGGTCTGGAAGCCGGGGCGGCGGCCTCGGGATTTGATGGCGGTTC
TCCCTCGACGGATGGTGGCGCGGGTCGCATCTGCTGGCAGAGGCTCGGTC
CTAGGATTTCTCTCACGCCAAGACGAAGATCTGCCTTCAGCCTGTTTCCA
TAGATCTGGTGGCAGTGTCGTGTTCCGGAAGGCTCCGCCGGCGAACTCCC
ATAGGCGATTCATGCCTGGAGATTGCTGGAACGGATGAGATTCGGTCGCG
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GCTCTGCAGTCTGTTGCCATCATGGAACATGTCTTTAGTTCCATGGTGAA
GTCAGTGTGCGGAGAATGTCATGGAAGCCAAGATTGGTGGACTAGCTATG
GTGGCTCGAGTCCTGGTGGCGATGAGGAATTGGCTTGGTGATTCATGAAT
TGTAGCAGCGGCATCGGAAAGTGGGGGCGGCAGCATAGGAGGAGTTCACA
GTCTTACCTTGCAGGGTGAAAATCCAAGGTCTGGCCTTAATTGGTTGTGC
CTGGCAATGACCTTGTTGAAGGCATTGTTTTGTGAGCGAGGACTTTCTCC
AGGGTGAAAACCTATGATCTTTGATCGGGCGATGACGGTGCTTGTGCTCT
GTTTCCTTCTTGAAGGCATCGCTATTGGATATGTTGGACTTCTGGTGTTG
TTCTGGTGGGGTTAGTGTCGCTGCTACTTAGGATCTAATCACTGTAGCGG
GACTTTTCTTTTTTGTAATTCTTCTTCCTTTTTTTGGCTGTGTGCATCCG
TATTGCCAATAGGGTATGCGTTGTTGCAGAGGCTGGGTGTAATTGGTATC
CGTGTGATATTAATATATGCTCATTTCCAAAAAAAAAAAATGCACGATAC
GCCAGACTATTCTAGCAAAAGGGCAATCGAAAAATAGGTGTTGTATTGTC
TCTTCTTTCTCACAAAAACAACACTTTTTGCTGCGTTGCCAACTTCTTTT
GGCCAAGTTATCTTTTGTAAGGAGTACCTTTCTATGCAAGAACCACATAA
AAATCTTAATTTTGAGTGGAACTTTCATCTTCCAAATATATTTTCTTAGG
AATCTTGTATGAGCGTTGAGTAGATCAAGGTAAAGATTTAACAGTGAATT
TACCAGATGATGTTAACTTCCAAACAAATTTATCTGGCTGATCAATAAGT
TGGATACACATCAGGCGGCTTACTAGATGAATCCATCTATTCCATTTGTT
TCCAGTTAGAGTCCTTCTAAACTGAATATTAAGCGGATTATGTGACGAAA
CATTCGCAACAGTAACTTGTTTATGTTGTGCAATGCGATATACGGAAGAA
TATTGTTGTGACAGCGGCTCTTTGCCTAGCCAAGTATCTTCCCAAAACTG
AGTGTTCAAACCATCACCAATTTTAAATGAACCTCTCTCAAAAAAATCAT
CTTTGACTTTCATGAGGCCTCTCCAAAAAGGAGAGTCAGTTGGTTTCCTC
GTGACTTGCGATAAGGTTTTCGAGTGCAGGTACTTATTTTGCACTAGTTC
ATGCCACACCCCTTGTCCATTCAAAAGCTTATAAAGCCACTTGCTTAGTA
AGCATTTGTGTTTTAAATCTAATACCTCAACACCGAGTCCCCCCCTGATC
TTTGGGTCTGCATATAATATTCCATTTAGTGAGTCTATATTTTTTCTTGT
GACCGTCACTTTGCCAAAAGAAACGAGATCTAAAGAAGTCTAATCTTTTT
GTCACCCCTTTGGGTATTTCAAAGAAAGACAACATGAACATCGGGAGACT
AGTTAACACTGAGTTTATAGGAGTCAATCTATCACCATAGGATAGGAGCT
TACCTATCCAGCTAGATAGCTTTCTTTCGAATCTGTCCTCTACCGGCTTC
CATTCTCCATTCTTTAATTTTCAATAATGGATTGGTATACCGAGATATTT
GAATGGCAATGTTTCTAATTCACACCCAAAAAGGTTTTTGTATTCGGCCT
CCTCCTCCTTGGCTCTACCAAAGCAGAAGACTTCGCTCTTGTGAAAGTTA
ATTTTTAGCCCCGAGAGTTGTTCAAAAATGCAGAGAATGACTTTCATATT
TAGAGCTTTCTCTATGTCATGCTCTAAAAATATGATTGTGTCATCAGCAT
ACTGAAGTATGGAGACACCCCCCACAACTAGATGAGGTATTAAACCTTCT
ACTTGGCCATCCTCTTTTGCTCTTGCTATCATAATGGATAACATATCTGC
CACAATGTTAAAGAGAATAGGTGATAGAGGATCCCCTTGTCTTAACCATT
TTTGTGTTTGGAAATAATGACCTATGTCATCATTAACTTTGATACCCACA
CTTCCTCGACTAACAAAATCTTGTATCCATCTACACCATGTTGGATCAAA
CCCTTTCATACGCATCACTTGCTGCAAAAAAAAAAGGCCATCGCACTTTA
TTGTATGCCTTTTCGAAATCTATTTTAAGAATTACTCCATCCAATTTTTT
GCTATGCAGTTCATGAATCGTTTCATGTAGAATCAGAACCCCTTCTAAAA
TGTGTCTACCCGGCATGAAAGCTGTTTGGGATGGTTGAATCTCCTTATGT
GCAACCTCAGTTACTCTATTAGTTCCCACTTTTGTAAAAAAATTGAAGTT
CACATTTAACAAACATATTGGGCGAAATTGCTGTATCTGTACAGCGTTTT
CTTTCTTAGGTAATAAAATTATGGTTCCATAATTAAGGTGAAAAAAAGTG
GCAGTTCCCCTTTCTGGAATTTCGCAAACATATTCATTAGATCTCCTTTA
ATAATATTCCAGAAACGCTGATAGAATTCCGCTGGGAACCCATCTGGTCC
TGGTTCTCTATTAGTTTCCATTTGCATAATTACATGATGTACCTCTTTCT
CTATGAAATCGGCTGTAAGTATATTATTTTCTTCTTGAGAAATTTGAGGG
ATGTCAGCTGTTTGAGATTCTATTAAAGAGAAATTGTTTTGAGCCTCTGC
TTCGAATAATTTCTTATAGTACTCTGTAATGTAGTTCTTCAGGTTCTCTT
GACCCAAAATAGTACCTTCGTCTTGTTCTAATTGGTAGATTTTCTTCCGT
CTATGTTTTCCATTTGCTATCATATGAAAATATTTGGTATTGCTGCCCCC
CCTTTGAACATGTCTAACTTTTGCATGTTGTGCCCATTTCGTCTCTTCAT
CCCGTCTAAGGGAAGCTAGTCGATAATTAGCATCTCTCATGCTATCCCTT
TGATCTTGAGAAAGGGGAATTATTTTGGCTTTGAGGTCCAGTAGATCTAT
AATATTCGATAGCCTCTCTTTTTCTTTTCTGTATTCACTACTTTTATTTC
TAGCCCAACCGCGTAAGAAATTACGCCAATGTCGGATTTTATTCTGCCAT
ATTTCCATTGTTGTATTTCCTTTATGAACCGTCACCCATTCATTAGCTAC
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GTTGCTTGTTACCTAAATGGGCTTGTTCCCCAGAATCTAGTAACAAAGGA
GTATGGTGTGAGTCTGCTCGAGTTAGAGCTCTTACACTGACAAGAGGGGA
TTTTTGTTCCCAGGAGACACTAGCTAACACTCTATCTAGCTTTTCATAAG
TTGGAATTGCTTTTCTGTTTGCCCAAGTAAACTATCTACCTGATAGAGCT
ATTACTTTTAGATCCAAGCTTTCAATAATAGCATTAAATATGAATGGCCA
TCTGGCATTAAAGTTGGCATTGTTTTTCTCTTCTTGTCGTCTAATAATGT
TGAAATCTCCACCTACTAATATGGGTAAAGGGTCATCTTGGCATATGCGT
ACTAACTCCGCCAAAAATTCACCTTTTTGGGCATCTTGAGCAGCACCATA
AACAGCAACCAATGACCACTCAAATTTATCAAGCTTTGAAACCAAATGAA
ACTTAATACACCGGTCTCCCGGGGTTACATCTTTCACTTGTAAAGTTTGA
GAATTGATTCCAACTAATATACCACCTGATCTACCTCTCGGTGGTATGCA
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TTCTAACCATGTGATTAACTACTTGAACCCGAACCGATTTCAAACATAGC
ATTTTCCTATTCACTTCTTGTTTGAGCAATTAGCTCTTTAGATTGCATCA
CATCCATGACAAGTTCATTATCACATTAGTTAGATAGACTTCTGCAAGAG
GTTTGTTCTACTGCATGTTGATCCTGGGTTCTAAGTTGCGTGTTAATAAT
TAATATACTGTTTCACTCAGTTATTAAACTGTCTTTTCATTGTCTATAAG
CAGTGGCTTCGGATCCTGTTCATTTGGAAAAATGCGCAGAACCATAACAC
TCTATAAGCCAATGCTGCAACATCACACAAAGGCTGATCTGAAGAATGCT
CTGCTGCATCTGATGATTCATGCAATCATATTTGTAAAGCATGGTATGAC
GAGTCTCAGGTAAATGCTCGCATCCTGTTAACTAAGATTGTGCCTTCCAT
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GCAGAAGTCATGGTCCTGTTTTCCGTGATTGGATGGATGCTATCAACTCT
TGCTCCATTGAGGATTACCTGGTTAGTATTTTCTGGCATATAAGTTCTAA
AACATCATACTCCATTGATGATTTCGTTTTCGCTTGTACCACCCAGAGAC
CAAAAGGTGGCTATTGTATCACCACCACCCATGATTTCAGTCTGGAAGAG
CTCCAAACCATCCAAGGAAATCTGTGGAAGGTACTACTTTCCATAGCTCT
CTTTTTTAACGCCCCTTTTTGTTGTTAAATTTCTTCCTAGTTTTACCTCT
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ACTTTTGAGGGCCACGAAGCTGGGCCCTCCATCTGATTCCTGCTGTATTG
AGAATGTTAGCCAACATGCTACCTGCGGCAACATGCTTTGCCACTGGCAC
AAGTAAGACTGCATACGTTTGCCCTGACGTATAACCCATCATGATTATAG
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CGAAATTGCCTCTGAATCAGTCAGATGCATAATGACCTCACAAACTGATA
ATTAGATGCATATTCCATTTGTTTTTATACTCTTGGTGCCTTATATCAAT
TTATCTCTTGATAATATTTACTTTCAACTATTGTGTTGCATGGTGAGCTT
CAAGGTATATTGACTGATGCTATTTTTGCAGCCACAAGATGAAGTGTGGT
GATATATATGTGGTGCCAGGGAGACGGGGTCAAAAGATGGTTCCGAAAGG
TTCTGCTGTTGGTTGTAAGCTCTGAACTAACTTGGCTCCTGTGCTTCATA
GTTTTCCTACTATGTACTCCAGTTGGAGTTGTTCTTCGAAGGTGTCCAGC
ATTGGTCGAGATGCGGCTTTGCTGCTCAGTTTAGGACATGCTCTTTCATG
TTGTAGTTGTTTTGTCCGTAGTGTCTGTCTTTGAACTCGCCAGTATGGAG
TTCGTACTACTCTCGTTGTTTGTAGCGAGTGGTAGTCGTCTTGTACTTGA
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AATCCAACTTAATTAGTTCGGTTAACAATCAATTTTACATTCTTGTATCT
GCCATTGATGGTGCATCAAGTTCGTGCAAGTAGAATTCAAGTATCGATAT
AAGAAAACACATTATTTATTGTGATCATGCAGCTCTTTGTGTCCATTCTG
TATTTTATTCTGTAGGGCATATAAAGTCAATTAATCTTGGGGAAAAATAA
AAGACCTAGTAACAGAATTAGAATATAGCAGGAGAACCTTCTACGCGACG
AAACCTTTTTATTTATATTCAAACTCTGTTTCCTTAATCGATATAAACTA
GGGATAACTAGAGCTAGAACTTGTCCCTACGCCTGTAGGTAGCCCCCACA
TGGCAGTAGTGAACTTTTGATCTGTTCAATCATTTCATTATGCGAACTGT
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GCGGGGGCTTCTGACTGAAACATCTGAAACATCCAAGTCACAAGACACTG
TACAAGAATCAGATTCAGATGAAGATCAGGAGAACTCTGCTGTGGCAAAG
GGCAAGCTTCTCTTTCAAGTGGGCGGCAGGAACGCAAAATCACCTGGTAG
TAGCTCCTCGTGGAAGGCAAGCAAGAGTAATGTGCCTAAAGACTTCCAGA
AAGCAATTGTGCCTGCTACCCCTCGTAGAAAATTGAAGCTGAAGCAGGAG
TTTTTTGCATTGGAGAAGCGCGAGCTTTTCTCTATAGGAGGTTGCAACAA
TGCAAAATCACTGGGTAGTTGGTCCTCAAAGAAGGCAGATGACTTTCAGA
AAGCAATTGTTTTGTCTGATCCCCCTCTGAGCAAACTGAAGCGGAAGCAG
ACATCTGTTGCATCGGAGAAGCATGAGCTTAGACCTGTAGAGAGTTTCTA
CAGTGCAAATTCGTCGAGAAGTAACAGCTGCAGGAAGGAAAACCGGTGGC
ATAAGCCAGAGCACGTTCAGAAATCCAACGTGCAGCCTGCTACATCCCAG
AAAAAACCGAAGGTAGAGGAAGACTTGACTTTATCAGAGAGATATGGAGT
TTTCTCTCTAGGGAGTTACAACAATGCAAAGCCACCAAGAAGCAGCACGT
CCAGGAAAGCAAGCACGTGGCACAAGCCTGAGGGTGTTGAGAAATCCAGT
GTTGCGCCTACGCCTCCCCCAAAAAAACTGAAGATTGAGGAAGACTTGCC
TTCATCAGAGAGATATGGAGTTTTCTCTCTAGGGAGTTGCAACAATGGAA
AGCCACCACGAAGCAGCACGTCCAGGAAAGAACGCACGGGGCACAAGCCC
GAGGGTGTTGAGAAATCCAGTGTTGCGCTTATGCCTCCCCCAAAAAAACT
GAACACTGAGGAAGACTTGACTTCACCAGAGAGACATGGAGTTTTCTCTC
TAGGGAGTTGCAACAATGCAAAGCCACCAGGAAGCAGCACGTCCAGGAAA
ACAAGCACGTGGCGCCAGCCCGAGGGTGTCGAGAAATCCAGTGTCACGCC
TACGCCTCCCCCAAAAAAACTGAAGATTGAGCAAGACTTGGTTGGCAAAC
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GAAGGCAAACTGCACAAGCCTGGAGACACTCAGAAAGCCACCGTGCTACC
TGCTGCCCCTCCCAGAAAACTGAAACAAGACCTTGTTGCATCACAGAAGA
ATGAACTTTCCTCTTTCCCGGGGAAGAGCAATACAAGGGTACGGGACAAC
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ACCCGTTGCGCGGACCACTGCCCCTCAAAGTATACTCAAGCAGCAAAGCA
AAACTACCTCCTCTACCAAGGCAGAGAAGCGGCACAATAATCCTGAAGAC
CTTCGGAGAACAGTTCTCCAGCCTGCTGTTTCTCAAGGTAAGCTGAGGAG
GCAACCAAACCCTGCTGCGCCGGAGAGGCCAAAGACAGGAAGTGTTGCAC
CTGAGAAGAGAAGGACAAGAAGCGGAAAGAAAAGGGAGTATGCTTGCATT
AGCATGTGGGCGAACATCTATGAGTCGGAATGCTCGAGTGGATCCGCCGA
GCCGCTGGTCAACAAGAGAACAGAGCGAAGGAGACGGGAGAGAGAACGCT
TGGTTCAGATAACCTACTCGCGGTCGAGGAAGCTAGGCGCCAGTGGAACA
AGCTCCAAACCTGCTGCTGAGGAAGAAGTATCGTCTCAGCAAGCCATGCC
ACCACCTCAATCCCAATGCCTGGATTTCATTCTTATCGATGCTATTGCTA
CTGACAAGGCGGTGACTCGAGACCCTAGAGATCAGTCCAAGGCACCAGCT
ACACGCATGGCCACTGTTGTTGTTCCTCCTGCGGACAAGGTGATGACTCA
AGCTCCAAGAGGCCAGTCCCAGCCACCAGCTAAACGCATGGACATTGTCC
AGCCTCTCGCCGACCTGGTGATGGCTCGAGCCCGCGGAGATCAGCCTGCT
CCATCTACATGCATGGACATTGCTGCTGTCCCTCCTGCTGATGTGTTGGC
TCAGGCCCCTCCTGTACATCAATCGCAGACACCAGCGCCATGCTCCATCT
CTACGGGTCAAGTGGTTCCACCTCCTTCAAATCCAAGCAGTTACCCTGAC
GTGATAGACATTTCTGATGATGACTGAACTTTCTTTCCATCAACTCTATA
CTCTGCTTATGGTTACAATAAGGAGGTACTAGTAGTAGCGACCACAATGG
TTTTAGCATGACGGATTTGCTATGGAGGCATACGGCTTTGATCTGAATAC
GGAACCATCCTGTGATTTTCTGAGTATAATTGGAGACGCTGGCTTGTGCT
GGTGAACTCAAGCATGAAAAGTTAGTTGCATTGTAATGTTGATGTATGCT
GGGAAAGTTTAGACTTGTACTTGTGGTCAGCTGGTGCTGCTCCATCTCAT
GGGCACCATGTTACTGGTTATTGTCACTCCTTTGCTTCTTCCTTTTTTAG
TGGATGTCACTGCTTGCTTACCATGCTGCTTTTATGAAACATGACATTTC
ACCAATGAAATATTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.