Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE047951

[Submit comment/correction]

Sequence	AE047951
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE047951
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGATATCGACACAGCGGGGCGGAGCCACGGTCGCTAGCCGGGCTCGCGG CGGCCGGCCGGTGACGGTGAGCGGCCCCGCGCACTGCCCGCAGGAGGAGG AGTCCGCGACCGAGGGATCCGCTGCGCCGTCGAGAGCGACCACTGGAGCG AAGGTGCGTGGCTTTACTGCTGCTGTTCTTCCCAGTGGTCAGATTGCATA TGTAATAATTTTTCTGGAACAAGGGGGGAAGGGTTGCGCCTCCGGTACGA CTGCTGATCGTGCTATCCGCTGCGTCACACGAAGATTCATAGAACAGCGA TGGGGGAAAGGTTGCACAGTGACCCTACCCTGTCTGCAATGTAGGATTCA GGGAAAATGGACAGTTACACACCACATGGCACTCGAATTTGCAGGAATTT ATTTAGTCACACATGTGGTGAGTCTGGGGGTAAGCGATTCTTGTGAGAAA CATCATGTGACCGCGATAGCATTGCCAACACAATTGTCGTTAAGCGAAAA GTTCGTGTGTGTCAAACCAACCAGTTTGACATTAGTAGGCTTGGCTCCAG GTGAATCTCCCCTTGCTTGTGAAGCACTTCAATTGCTGGATGAAAGCACG CGGAAGCTTTCTGCCAGGCTCGATCTTCTCGCCGCCAAGATCGACAACAT TCAGTGTACGGGTGGGGATATCATTCTTTGAAATTGCTTACCTAAAAGGG GACCGGGACGTAACGTTTCAGTTGACTGCTTTGCATGATAGGAATGCCTG CGAAGATCGTTCAAACTTGAACATAGCAAAATCTTGGAAGGATCAAATGG CTGACTAATGAATTTCTCAGTGTTTCAGTTTTTGTTTTTGAAAAAGGTTT TTATGGCATGTGCAATAATCAAGTAAATTTTAAGATCATCTCAACTCATT TGGTAGTATGTGTGTGTGTGTTGTTACCAAGTTATTTAAAACTTCTAGAA TGCTTGAGGTTATTGTACTGCACCTTTTCTTCTGCTTGGTCATGGGAAGT TAGTGATGGTTGTGTGCAAGAAAAAAAGTTTAACTAACACAGTGTAGATG CAGTGATATCAAAATGCAGCCATTATTTGTTGCTACTGATGAGAAAAGGC GATTGACTTGTGAAAGCTAGCTTCTACCTTCCTCATTTTATTTATATTTA TCCACAAGATTACTAAATGGACGCATACTTCGAAGATCATGTTCACATTC GTATCCATATTAATCCGCGCTGTCTTTCTAGAGTTACGTGACGAGCAACG ACTCTGAAATATATTATAGTTATAGGTGGAAGCTTTGTGTATAATACTTT TAACCAGTCCAATGTGATGTTGTCTTGAAGAAGGAAAATTTTGATTTGTG GAGGGCAACTATGAAATATCATGAGGCAAGTGAACAAGTGATCGTAATAT TTCTTATCTGGTCTTATCTACAAGAGAGTACTGACAGATGAAGTTGTAGG AGCGTAATTTGTACTATGCGCCGACATATCATGTATCAACTTGTTGCTTG TCTCCAATTCTTCTAGCCTCCTATGGTATTGGTTTTTATTTTTCATCAGT AAGTCTGGCCATGCCAAGCTAGTTCCAGCCAATCTATAGTTTTATCCTTT GTTTAAACAAGAAGAAAAAAGAGTCCTTCAACTGATAAGAATAAAATTTG ATGTTTTGTATAATTATTAGTATGCATTGCCAAGTTGATATATCATATTC TCTAGGAACATGCATCGATGATAGAAACTGGGTTTGAACGGTCTGCCATT TCAAACAAGCTAAAAACATCTCATACCAAAGCTAGTATGTTTTGATCTTC AGGGTAATAATTTTCATGCTTTGATACTAGTGTTTGTCGTACCCCTTTTG AGTTTGTTCATGTTGGTGGTAATAATTGATTGGCCAACTAAATCAGTATT GTATCTTGAGCTTCATGATTACTGGTTGCTAACAGCCTAACACACTTATG AACTGTTGGGTTTTCTGAAGGCAATAGTCTGGCTTGTCTAGAGAGTGAGG TACATGCATACAACAAGATTCACTTCCTAATTAGGTAAACTTGTCGATGC TTGTTAAGTTGGTGGGATTAGTTTGTTTTACACACTATTGATTAATGCTA GTGTAGTGTCAATGAAGTAACAACCTTGTTCTTTCCCTGACAACTTAATG CTTATCTTAGTTTAACTGTGCACTACAAGAAAACAGTTAGGTTAGCAAGG GATTGATGGATTGAATTTTTAATTACTCCCTCCAGTTCAGTATATTAGGC ACACACGTAGTTTAAGAAAATCTTTAACCTTCAATTTTGAGCAAGAAAAT ATGCAATATATGCTTCAAAAAATATATCATTGGAAACTTCTTTTGAAGAT GAATCCAATGGTATAATTTTTGTGGCATATTATGTAAAATTTGTTGACCA AAATTTGTAGTCAAAGTTGTTCTTAAACTACGTGCGTGCCTAATAACTGA ACTGGAGGGAGTACAAAATAATGAGGTGCTATGGACCTTGCTGGAGAGCA GAGGTTTTTCTTCTAGGTTCTATATGCAAGTATTTTGTTGGTCACATTTT AAATCAAATACAATTTTGGTTTGATTCTAGCACCAAGATAAGAGATAAAG TAGACAAGAAATACTCATCATGTTAAAATTCACTTATCATCTTGGAGTGT CGTCAGATTCATTCTGGTTAGGGCTCGGGAAAATAACATTGGCTTGGCAG GATAAAGCAGCCTACAAAAGTTCCCCTCAAAAACACTTTGTGATTAATGC CCTTCTATGTCATCTGCATATTTTGATTGTTATTATATGAAGAAAGTCAG GCCTTCGTCCGTGCTGTACTCCCAAGGTTCACATCAGTAATCAACTTTGC ACTTAGGTAAAGGTTTGTCCTTTTGATGCACATAGTCATCGGTTTGCTGT AAAATGCATGGGATTAGCTATGTTTGTTATGAAAGGGCTTTATGTGATGA ATTGAGGTTTACTTGTGAAACACTTCACGTTATGAAATTACGTGGCAGTC ATGTACTCATGTTTGTAGCTATATTATGAAACCTAGTGTATAATACACTG CTACAATGAAACAGAGTAGGAAAGGATTTGGTTGTCAGTGACGGAGCATG AATCCAAATGTAGAATTATTTATAAGTAGAAAATTGTTATACCTAATAGT GAAAGTCTCATCTAGAAGAAGGGGCCAGCTCCCCAACCCCTTGGCCCTGT TCGTGTGTTCCTATAAATTGAATAGATGAATCCTACGTCATTGATGTGTG AGAGAGATTGACCCATAACTACTCTCTGTGACCGATTGATAGAACCGCGT CAATGCCAAATGGAGTCTTACTGATAAAGTTATCAAATTATTCAACGTCA TCACCCAAACAACGACCAAATTAAAGCAGCGTTCACATCAAAGTTGTTTG TAAGAAACTTAGGCACGCAATCGCTTGTTGTCGACATCCTTACCCGACTG TGAAGATTTGTTAGCTAAGCATTCATCTACTCAGAGTAGACCTAACAGTG ATATATAATTGCATAATTCCTGTTGGCTATTCACTAGGATGTTGGAAATG TGGAATATCTGGGTTTCTTGTAGATGAGAGCATTCAAGAGGAGTAGCTTT CATGATCATAGAATATAGATACTGAACTTCCGTTCTATCTATATGCACTG TGCGTTGTTTGTGTCCTTTCACTTTCCTTTTGAGGAAACCATGAAATATA TTTTTTCACACCTGAAGCAAGGTTGATATTGCTTACTTGATATGGATATC TGTAGCATCATAACATCTTGTATGCTCCTTGTGTAGCACTAGTAGCAATA ACACAGTTTGGTAATGCTGGGGTACATAAATTCAATCGATTTTTGTTGTT GAATGGTAAATAGGTCAGTCGATTTTCTTGTCCAATGGTACATCTGTACG TGAATCTACAAGCAGCAATGGAAGCTTTATGGAGTTATGGGAGATATATA TCTTTGTTAACATGGAGAGTAGGTGGGATGGAAGAAAATACTAAGGAAAA TACTTTGATTTATGCATTGGCATCTCCCTTCTTTAAAGCTGTAGATAGAA GCGGAATGTTACGTCTTCAGCAGCTAAATTTTCCCAAGTGCTTTTGCCTG CTATTTTTTTTATTGGATTGAATTAGCCATGCGAGCTAATTGTGGAGAAA TTATCTCTTTAGGTATAGCAAATCATGGGTCAGACCGATAAAAAGTACTA TTTTTATTTTCTCCTTGGAATATGCTCTCTCGAAAGTTTATTTGATCAAA TCTCCCCATTTTACTAGACCTGCATTAATGCATGCACATCTTAGACACAG GTTGTTCAGAATGTATCAATTTAATATAGCATGTCTTCACAATCACATAG ACTAGCAGAAATCCTCTCTACATCACATGCTTTTAAAAATTCTGAATATT ATTCTACAACTAAGCTTTGTAGGAAAAGTAGCAATATACAACTCAACTTT TATCTCAAAAGTATATTATTTTTCAACATTGGAGAAAATTAGGCATTCTC CAGTATTTTCTTGGTTCTGGGGAACAATATTTCTTACTTACTGCAAAAGC TACGAGATGAAAAGTTGCTGGTTTACTGCTTTGTTTAATAAGATGCATGG TGACTGTATTTTGGATGACTAAATTGCAAAAAAAAAAATTCTCAGAAGGG ACAGTTGGATCCAAAGGTTTTCGCAGATGCAAAGTTCTGAGGCGTTAGAA ATTGCATGCAAGACAGCATTCTACTCTCTCATGGTCTTGACACAGGTTCT GCATGTGTAGCAAGAAACCTCTCTGCTTTGCTTGCTGGTTGTTTCACTTT TAGGTGTTCTTAGGTAGGAAAAACATGTCAGTAGGGACATGTGATGTTTT TTAGACAGCGGTGACAATGGTATTGTCGCTGTCTGTCAGGTAACAGTGCT AAGAGGCCCACTGCAGGAAAGCTGAAAACCAATTGCTTGTTCAATCTCGG TCTCTTGTTCTTTCTTTCCCCCCCACTTCATTCACACTGCGTCTGTTCTT GATTCCTGGACAAAGCATAAACTTGATGTGTTCCTTTCATCTTTTCATGC AGGAAAAAGATATCTGCACCAGCCATGACAGGATCGAGGATCAAGTGGGA GCAGGGTTCAAAAAGCCAGCCATTTAGGTGGCTAGAATGGCATCTAGGCG CCATGCTGTTTGGCGCTTGTCTGCCGCCTCGCAACTGCGCAACTCCTGCC GGACACTTAATGTAGTGAGCATCAGGCTATGTTCTCCAGCGATCCAGTGT CAGAGACCAGAGAGCTTCCATCTACGTCTACGAGCTTGCTGTTCTTGTGT CAGAGATTCCTTCTGTCCTTGGCACATATTTTGTCAGTGTTTCTAGTGTT AGTGCACATGTTTCTGAAATCTTATGTAAATTCTTACCTATAGTTTTAGC GATAAGTAATGCCACCTTTTACCCCTGTCAGATATGTTTTTTTTTTACCA ATCTGCCAGATATGAAATTTATTCTGCACAAAAGTGTAAATTGATCAAAT GAACCTTTTTTTTTTGAAATCTTGATCAAATGAAGCTTTAACCTGGACTG ACCCCTTTTTTTTGTGTGGAGAATGAAGATTAAATTTTGCAGCCCAGAAA CGACGGCCCAAACTTAGACCATGGACCCGCTAAGAGAACGTCTTCTTTTC GGCCCAAATTTCCTGCAACGATTTAGGATAGGCCCAAGCCTAGCCCAGAG GGAGGGAAAAGAACAGTTCCGACCTAAAACCCTTCTTCCCAAACGACCTC ACCCAGAGAACGCGAAGGCGGCGAGGAAGAAAAAGAAGAAACAAAATGGT GGTCCGGATCCGGCTCGCGCGGTTCGGCTGCCGGAACCGACCCTTCTACC GGGTCATGGCCGCCGACAGCCGCTCCCCGCGCGACGGCAAGCACCTCGAG GTCCTCGGCTACTACAACCCGCTCCCAGGTCAGACCCGCCCCACCTTGAA TTCCCACTCGATCTGTTCGAGCAGCCCCGTGGCCGCTTCTTGATTGAGAC GACTCGGCTCCGCTTAGTAATGCTGCTCGGGTCATTCTTCCTGTGAAGGA TTTTGGGCGCGCCTGGGAGCTCTAGTGGTAACCGAAGACTAGCTGATATA AAGAAGTTTTCTGTTTCTGTTTGCAGGAAAGGATGGTGGCAAGAGGATGG GGCTGAAATTCGACCGGGTCAAGTGAGTTCTATACCTGCTCCTGATTTTT CATTTTGGAGATTCTTGTTCAGTTATATTCCTCTTTGGAGAAAATTCCAT GTATTGCAGATTGTTTGTCCATTCCTGTAATAGTATTGAGTTACTCTAAT ATTAGTAATAATCTTTGATTGACGGTAGAGGAAATGAAATTTAGGGTGAT TCAGTAATCTTTCCATGAGGCGTACCTTTGTATCATTTGGGATGTTCACA AGGTAAACAAAAAGAAAGAAAACTGAAACCACGCGCTGCTGCACTATTAT GCTTGTTCACTGTACCCACTCGTTCTACCCTCGCTGCCTCCTTCCTTGGA TAACCAAATTACAGAATTGAAAGAATAACGATATAGATGCTACAAGCGCG TGAAATGTGCTTGATAAGTATTTGCTACCAATGTGCTTATATGCTGTTTT CTCCAATTGCCTTGCAAGGCCACATAAATCATACAACTGCATTGACACCA TACAACTATACTCGTGTCATGTAGGTACTGGCTGTCTGTCGGGGCACAGC CATCCGATCCTGTGCAGCGTATACTCTTCCGCGCAGGGGTTCTGCCTCCA CCTCCGTTGCTAGCTATGAGCCGTAAGGGTGGACCTCGTGATAGGAACCC CATTCATCCGATGACTGGCCGTCCCTTGGATCTTGAGGGCGTCACAATTG TCGATGATCCCAATGCTATTGAAGGTGATGCTGAAGAACCTACAGAACCT TCGTTGGAGGCATGAAAGATTTTTCTGTTCTTGCATATGGAATGGTGCTG CAAGACGGAAGAACTTGTTTGTTGTGCTTCTGATAAGATTATGAGTGTGG CAACAGTTTAGTCATGTAAACTCTCCTTTGTATGCCTTTTTAGAAATGCG GCACCGCAAAAGTTAGCTGTCACCACTCTCCAGTCTAGTACTACTATTTT ATCTCCTATAATATGGTTCCTTTTGAATGGATTATGATGGTATAAATTGC ACATTCAATGAATTTCTGAGTTCTTTTTGGGTGCTCAAGTTGACAAATAA TCTTCAAATGTTGAAGGAGTGCTCCATAACTATTTGTGGAGAACCAACAT ATGCTTGATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.