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GrainGenes Sequence Report: AE036552

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Sequence
AE036552
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE036552
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGGTCAAGCAAACCACACGACACCACTCGGCACGCCTCTCTCCTCCTCCT
CGTCGCCGTTGTCTGCTCTGTATATACAAAGCAGGCGGAGGCGGAGGCGG
GCGCGGGCGCCTCCCCCACCATACCCTCGAGACCTAGCCAAGCATACGCG
AATCGCCGATCCGGACCAGGGACCATGGACGCCAACGCCAATTGGCGTCC
CACCCAGGGGTCCGACCCCGCCGCCGCCGCTGCTGCAGCGGCCGGCGTTG
ACCCCAACGCCCCCGCTGGAGGCGACTGGCGCGCCCAGCTCCAGCCCGAG
GCGCGCAGCAGGATCGTCAATAAGATGTAGGGACTCCTAATTGGTTTGAT
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CAATTGAACGCGGGTTTAGTGACGAAGAGGTGCAAATTTGTGGTGGCATA
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TGGGCGACTTTTCTGCGCTGCAGCTGCCAATTTTTTTTGTTTACTGTTGA
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CGAGTCGCTTATTTCCGGACGGAGGGAGTGCATTTTTTTTCTGTGGCGCC
GGGACTTGGAACTGGTACCATTTGGAGCAAATCCCAGTTATTCTAGGCTT
TTAGCATTTCAACCTAAGTATACATGCAAACATTAAGTTAATAAGTAATA
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TCATAATCTTGGTTGCCATCAATAACATGTTGAACCTAGTAGTATTGTAC
CTTGAGTCCTTGAGTACCTCCAGTTCATGCATGTTTGCCAGTTATCCATT
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TCTTGGACCAAAAACCAAACAAGACATTACTCCCTCCTTCCACTGTGTTT
GAACGAGCTTCATCTCACGGTGTGTTTGGGAGGGCTCTACACCACCCCAA
CTCCACTCACCTTTAAACTCCCCTCCACCTCCAAGCTCTGGAGCAGTAAA
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TCATGTGCCATGTCTACACGTGAAGGTTGTGAAGGCTGATGAATAAAATC
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AATTAGCAGTCATGCACAAAATCATCCGATTAACAGTCACTAAACAATCC
TTGACTTAAGCATAAATGACAGACATACGTTCAGACGTTGAGTTCACAAT
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TCGCTTGAAGTTTCATGGATGAAATGTAGGACTCTTTTGAAATGCGTGGA
CGCCGACCTTATGCTTCCCAAGTTATGTTCTGGGGTCAAACTGTTCACTC
AGTGTCTCTTCTATCTGCATGATGCTGAAACATCCTACATATCATGTATT
GGTGAATAAGTCATTGCTGCTTGTCCTGCATTATGATAAGAAGGGCATTT
TTTATATGAGAAGTGCATACAGACCTGCGGTTCAAAATTCAGGATTCAGG
TAGCTTGATGGAGTAGTTGCCGTATAATTCGGGTCTTGGTTGCACCTCTC
TGGTTGTCCTCATTCCATTCAATGGCAATCATTCCTGATAAAATAAATCA
AAGTTTTACTCATCATATCATCTTACCAGTAAATATTTCATATATTCGAT
ATATCACTCCTGTTAACTTCTTTCTCTGAAGGCAATAGAATATTTGTTAC
AGGAATATATCAACAGTAATCATCAATATCTATGGTACCACAACAATCAT
CTGCGTGAAGCACCATGGAAATGTTTGTTACTATAACATCAACAACATTC
ATAAATTGTTATGGTACTACAAAAAACTTCTTCTATGAAGCACCATGGAA
ATTTTTGTAACAAACATTAACAACAGTCATCAATTTTAGTGGTAGCACAA
GAATCATCTTCTATGCAGGCAACAAAAGCAATTATCAACTTATGGTTCCA
CATTTATCATCTGCCTCAGTTTCAAATTAAACAGTGACAATACACGTGAG
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ACCTTCTGGCCACCGAGTTCCTGCAGAGAAATGGTCGAAAGGTGGTCGGC
AAGGTGCAGCTGGAGGCTGTCGGCGGCGAGTCCTGCTGAGTGGAAGCGGT
GACGGCTGGGTGGCGGGGCCGTAGGCATTGGACCAGTGCAAATGGCAGCA
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ATGGGGCACAGGGTTGGCTGGTGACCTGGGGGTAGTTGGGTGGCATTGGT
GGGAATTCACATCAGCTCCAGGGCCAGGTGAGTATTAGTGGCGGTGGAGG
TGAATTGGAGCAGATGAAGCACCTCTTTCTCTTCCAGTAAAATGAACTAC
GGGCTAATTCAACTCCACTCCACCTGAAAAATGAAGTTGATGGTAACAAC
TTCACCTGCTCCACTGACGAAGCTGTGGAGTGGAGCTGTCCTAGACACAC
CCTTAAGGGCATTTACTCCACTCTGGTAAAACAATCAAATGTATTTATTT
CGTCGGGGTATATACTCCACTTGGAATTTCTGTTCGTCTTGCTTATTCCA
TGCAAACCATTTCCTTTTTTGCGTTCGAATGGTCTTCATCATATTTCCCC
ACTCAGTGTTGGTGAATGTCTTTAGAGGGATTATTTGGTTGGGGGCACTG
TCACTATTTGGTTTGGATTTTCAGTTCATATCGCTTATTTGAGTCAATCT
GTTTGTTGCTAGATGAGCGTGTTCCTATGGTTATATGTTTCAAATGTTAA
TAGCTGAAGCATAAACTGCTAATCACACAAGAAATTTTGGTTGCAAGCCA
CTATTAGTAATTTGGTACAAACCTTGACATCATTTTCTTTTGTATTACCC
AGTCTGATTATTTGCGGAAAATTTCTTTGAAAATGCTCTCCATGGAGACG
AAGACTCAACAGGCTCCTGGAAATGCTCAAGTGATTCCAAATCAGAACAA
CCCTGGTCAAGGTACCTGATACTGTAAACTGAGTGTTAAAAGTTTTATCA
TCTCCACTTTTGGTTATACAATCACTACATTACTTGTGGCAACCTCTTGC
CGTATGATTGACAATTTTATTCATCGCATTAAGTGGAGAGATTATGTGTA
TTGTGCATAAAATCGACCTCCGCGCCTGTACAGCGCTGTGTATAAGAATT
TTACATCTAGCTTGTGTGTCATGACATGAGTGCTTAGTTATTGAACCCAA
GCCGGTGATCGACATGGTAAGTGTCTTGGTTCAGTGGTTTAGGGTTTAGT
GGTCCAAACAATAGGTGCAGTTGTCCAACCTATGGTTTGATAAGACAGGA
TCATTTTTTTCCAGTTAGTATGGTAAAAACAATGTGAAGTAGTTTAATGT
TCATGTTGAAATATAACAAACAAACATAGCCTAGTTGCTTATTTGGCTGA
GGTATTCCGCCTTGCTACCTTAAAGATGGTCTGATTCCTCCCACCTACAG
CATGTTTTTTATGGTCTCCAGTAAACCACGGCTGGTCTGACTAACCCCTG
ATTCAGTGCCGAACTGGCTGTTCAACTTGGTTACTCACCGGTTCATAGCC
AGATTGATTGGATGAACAGTCCTCACTGCAAACAACATTGAAACAGGGCT
TGATTCGGTTTATTATGATCTGGACTTTCTCTGATGCATGTGTCAGCAGT
AGTAAATAGGTACTCCCTGTGTTCCACAATGGCTTATATTGTGCAACAGA
GGGAGTACTGTTTACACAATAATGTGGCATGGACAGTGCCATGCAATTAC
TATACAACATCCGATCCGATTTACTTGTCGCAGGTTTAGGCAAGGTTTTG
GCAGGTTTAGGCAATTGTCGGAGGAAGTGTTATATTTTGCAGTCAGTGCT
ATAAATAGGGACCAGAGAGTCCATTTAATTTTCCCTTCCAACTAGTTGCT
ATATTTTTGTGTCTGTTTCTGCCTTGTAAGTTCTACATCTTTTATATAAG
AAGCCAGGAGGTCTGTTATATCTTTGAATAAACAATAAATATATCAATGT
CTGCAGGAAGCTGGATGTTTACTGAGCTCACCCTAAATGTAACTTAGTTT
AAGGTTGGAGTTACTTTACAAGTCTAACAATTGAGTTACAGCAACATTGG
ACCATCTTCAGCTCTTTGCAGAATTACGTTTATTCTCTCTTTACTGCTAC
TTCTCAGATGTGATCTGCTTCTCAGCTTGCCGCAAAGGAACTAACTATTA
GCTGTTAAATCAGTTGGTCAGCTGTACTTATGTTGTTTCTTTCTTAATAA
AAAATATGCAAACCGTTGTTTGCATGTTCTCTAAAAACTCAGTTTGGCCA
GCCCCTTAATTGCTCCATTGTATGTTTTTTCTCATTGAAATTGGGTAAGG
ACTTACTGTCTAAATCTAATCTGTAAGATGCTGCTTTCAGTGCTTTGCTT
CCTGTTACAATTTTGAAGTATTTGTTTCACATGATATTTAACACGCACAT
GGTATCTTCCCTCAAACAGCTCCTGGACTCGCTGCACAAGGTAGTAATCA
AGCACAGACATCAGCAATTTCCTTGATGTCTCAGCAACAGGCCCGACAGC
CGAATACTTCTACATCTGTACAAACTTCTTCACTCACTAATATCGGACAG
AATTTGCCGGGTGTTAACCAAACATCAACGATGCAGAATGTGTCTGTCAT
GCCGCAGAACACAATGAATAATGGTTTGATTCAAGGCACTTCACAAGATA
TTTATCAAAGGCAAATGGTAGGAAGGCAGCAGCAGCAACAACAATCACAG
CAATTGATGTATCACCAGCAGCAAATGTTGGTGAAGCAGAAATTGCAGCA
GAATTCACTTATGCAACCGCATATTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTCTT
TATTGCAGCCAACACAGATGCAATCTTCACAGCAACCCATGATGCAAATG
TCGTCTGGCCTTCATCCTGGACAGTCCACCGTTCCACAGTCACAACCAAT
GGCCATGCAGTCAGCTACTCAGAGTGGTATTCAACAGAATCAGTTGAATT
CCGTACAACAATCTGTCCAATCATTACTCCAGCAACCTCAGCAATCTGTT
GGGAGACAGCAGCAACAAGCACAGCCCTCCATGCATCAGCAGTCCTCTCT
GCAGAGTCAACAGCCAAATATTTCTTTACAACAGCAGCAACAACAGTTGA
TGGGACAGCAGTCAAATTTACAACAAAATCAGCTAGTTGGTCAACAGAAT
GGTGCTATGGAGATGCAGCAGCAACAGAGGCTACCAGTTCAGTCAACTAA
TCTTTTGAATGTGCAGCAAACACAACAGATGTTGAACCAGCAGTCTATAC
CCTTGCATCAGCCACAGCAATTGGGCTCTCAGGCAAACATGCCAAGTCTA
CAGCAGCAGCAACAAAACCAACAGCAGCATCTTCTTGGAACTGTGCCTAA
TGTTTCAACTATTCAGCGGATGCATATGCTACAAACAAAGGCTCAGCAGC
CGCAGCAGCAACAGCATACTCAGCAGCCATCAATGGGTTTGATGCAACCT
CAGTCTCAACACAACCAACCTCAACAATCGCAGCAGCATCTTATATCCCA
GTTCCAGTCTCAGCCTAACCAAGTGCAACAGCAATTGGGAATGCAGCAGC
AACCCTCAATGCAGCAACGACTTCAAACTTCAGGTGGCATGCTCTTGCAA
CAAAATAACATGGAGCAGCAAAAGCATATTCAGGCACAAAGAGGCCTTCA
AGAAGTTTCATCTAGTAGTAAGTTTTCACATAAGCTTTTTTTGTAGATGC
ATCATGCTCTTATTGTTCCACCCTCTTTTTTCTCCTTATTCTTATGTTCT
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AATAGTGTGATGTTCATCAGGACCCCATGCCCTTATAGTGCTAACATTTA
CATTGGACTAATACGGGTTCTTATTAGACTACAACCTGGACTCTTGGACT
CTACGGGCACTGCAAGTGCATTGTATCTTACGCTGTACCGTATGCATTAA
ATATGTATTTCGACTATTCCAGGGTCTTGTGTCTCTTGTAATGCTCAAAG
GTGGCAGTGTTTCGTAGGTGTCCACATCAGATTTTTGTCTCTGGCTTGGA
GTTAATGAGGAGAGATGATGAAACAGTCTCTTATCCTAAATAGCGCCTCT
TCACACAATCCAACATAAACATCATTAAATCTTGTACTCATCATCCAATT
ATACTCACATAATCTTAATAAAAGTGTGGACTGCTGACTGCTGTATTAAA
GTACGTAAAATCCATTGGGATGATGAGTATCTAAATGACATGGCAGAATT
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TTGGGTTTTGTGAGCTGTATCTTTCCTACTTATCAAGTTTGGAGTTGGTA
GTGAGTTCACTCTGTCACCACTATTACTTATACAATATATGTGGGACCAA
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GAAAAATATCTTCCTCCTATCGTCTTTATTCCCTGACCACTGTCCTCATG
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TGATCAAGTAATTTGTGATCATGATAACTAAGCTGACTATTGATCTTCTG
TGAATTCTGTCCACCATGCCGGGTTTTCTTATTTGTGGGAAATTGAGCTC
CAAAATGCTACTGCGCAATGATCATGTTGACTAAGCTGACCTTATTGATC
TTCTGTGACTGTTCATTGATTCGGTTCTTCGATAAAAGTGCTACTCTGCA
TAAACGTTGCATTCTGACGTCTAGTTCATTTTTGTCTCTATACTAAACAG
CAAGTGCACAAGTTTCTGACTTGCCCCTGCTTTCCATCCTATGATGTACT
TGCAGTCTGTTATTTGTTGGCCTATTCACTGTATCATGTCACTCTTTGAC
AACCTTGCTTTTTATGCAGCATCTGCAGACTCTACTGCTCAAACAGGCCA
TGCAGGTGCAGGTGATTGGCAAGAGGAGATATATCAAATGGTAAGACATG
ATACTGATGTCATCCCTTTTGGCACTCCCTATATTGGAATGTCCTAAAAT
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ATAGTTAGAAGATGAAACAGCATGCCATGTTGGATGTTGGGGCCTTTTAT
TTTTGCATTTATGTTGCCTATCTCTTCTTTGGCTTGTTTCCAATAATCTC
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GAACATGCAGGACCTCTTTATTGCTGTGTTTTTATCATCATGGTGCACTG
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TTTTTGAGTCGCTGTGTAGTCATTGTATAGTCGCCGTATAGTCGCCAAAG
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GACAGCCATACACTATGCATCATCTAGATGTAGTAAAGCCGCAAGGCAGC
AAGTGGTCTTTATTAACCTGGGGGGTTTAATGGCGTTAGTTTCTTATTTT
GTTCTAATAGCTACTTGAGATATCTTGCCAGTGACTTGCAAACCCGAGTC
TAATGAATGTTCTATTTTTATCTCTATATAGCTCCTGCAAGATATTTATG
TGTCTGTAATCTTTGTTTCGACAGATTAAGAGCTTGAAGGACAAATACTT
TGCAGAACTCAATGATTTGTTTATGAAGATCTCTCTGAAGCTACAGCAGG
TTGACAATGCCATACCGCCTCAAAAGCCATCTGAGCAGTATGAAAGAATG
AAGGCCTTTAAATTAATGTTGGAGCGTACACTACAGGTGTTGCAAATTGC
CAAGAATAATATCCAACCTGCTTTGAGGGACAAAATTCCTAATTATGAGA
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CAAGTACAGCAACAGTTCCAGCCACCTGCTGGCCAAGCTCCTAATTCTAA
CATTTCACAGCAACAACAGCCTTCCCAAAGTTTGCAGCAGCATGATAGTC
ATACTAATCCGCAAGCAAGTTTGTCAAGTATGAGCACTGGATTACAGTCC
TCCAGTGCCGGCGGTATCCAGCATGTACCTGCACCTCCAACAACAAACTT
CAATGTCCCATCACAGCAAAATGGTGCAAACGTGCAGCAGCAGGCTGCCT
CTAATTTGGAGGCTGCTCAAGGAAGCAATTTTAATGCTTTGCAGCATGGT
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CATGCTGGAAATGATGTAAACGAGTTGAAGGTTAGACAAGGAACAATGAA
ACCTGGAATGTACCAACAGCACTTGGGCCAACGCAGTAACTATTATCATC
AGCAGTTGAAACAGGGCGGTGCGTTCCCTATTTCGTCACCACAAAGCCTC
CAAGCATCATCCCCGCAAATTTCGCATCATTCTCCTCAGGTTGACCAGCA
CAATCCGTTGCCATCTCAAGTTAAGACTGGGACACCATTGCATTCAGCTA
ACTCACCATTTGTCCCATCGCCATCCCCATCTGTTGCCCCGTCTCCTATA
CCAGTGGATTCAGACAAACAACTCTCCGGCATATCATCACTTACTAATAC
TGGGCAGGCTGGACATCAGCAAGCATCCCTAGTGCCACAGACACAATCAA
TTGCTGTGAACACACCAGGGATATCAGCATCACCCTTGCTAGCAGAATTT
ACAAGTGCAGATGGAAGTCAGGCTAACATGCCAACTCAAGCTCCAACTAA
ATCAAGTGCAGCAGAAAGGCCTCTGGATCGCTTACTTAAAGCAGTTAGTA
TCTTGCCAACTTTATATTCAGTCTTTTGTTTTGTTGTGCTTAATCAGTGT
TTTTCTGACTGCATTGTAGAACTTCACTATTTGAAAATATGGTCATACTG
TTCTGAAGCGTACTGGCGTAAAAAAAAACATGAGGGTCAATGGGAATATG
GCTATAGGAGTTAGATATATCATGCATTTTTCTGGCAAAGTCTTAGGCTG
GTCATAGTGGTAGTATCATACTAGTATCATGCATATGATACTAGTGTATG
CTACTATCTCCATAGTGCATGATATCATATGGTAGTATCATACTAGTATT
ACATTTAATGATTTGTAGAATCTCAATATAAAATTGTGTACAAGATTTAT
TTGCATGAGGATTTTCTAGTTTTACGTGCTATGATACTGTATCTACCTAT
GATATACTAACCATCTCTTTCTTCATTAATTGTTGTGCCACATCAGATTT
TTGCCAACATGGCATGCATGATACTAGCTATGATACTCCCACTAGGACCA
GCCTTATATGGTTCTACCTTGAAGTTTATACAAAAAATTAACTCAAACGT
CAATTAATTAGTTGTTCAAATGATAAGAGTAGTACCTAATAATCGTTGTT
CTTTATGGAGACCTGAGAGATTATCTAACACGAAAATATGTTACTGCACT
TCAATCAACTAGTTTTTCAGATGATGGCAATGGTGCTTACCCATGTTCAA
CTGTGCCACCTTAATATTTGGAAAGCACATTTAACATGAAAGAATATAAT
TGATCTGGTTCTCACCTCTCTTGATTATGACTCATCAGAATTCAGATTTG
TTGTCCAGTAGTCTCAGCTGTTGTGGCAGTACATACAAAGTCATTCACAC
CATTCAATTTCTAATTCTTAAAAATAGTAAATTAGTTCTGTTGATGATAT
GCCATGGTCTGCATTTGCTTTGAGTTACTATATTTTCGCCTGTTTCATGT
TCAACGTTTTGTTATATGCAGTTGCGAACAACACAGCGCCAGACTCTCAA
TGCTGCGGTTAGCGACATACGATCTGTTGTCAGCATGATTGACAGGATTG
CTGGGTCAGCACCTGGTAATGGTTCCAGAGCTGCTGTTGGTGAAGATTTA
GTTGCTATGACAAAGTGCCGGTTACAAGCCAGGAATTTTATAACAAATGA
TGGAAGTGGTGCATCGAAGAAAATGAAGCGTGATACAAGTGCCATGCCTC
TGAATGTGTCATCAGCTGGAAGTGTCAATGATAGCTTCAAGCAAATATTT
AGTGTAGATACCCCTGATCTACAATCAACTGCAACCTCGCGTGTCAAGTG
GCAAAAAATTGAGGTATGTTGTTTAAGATTTTCTGTTGAGAAACTACGAG
AACATGATTTTATCAAGTAGCCATACTTGAAGCATGGTCATTTATTTATT
TAATTTTGCGAGAGAAGGGAAATGGAGGTCATTTGGTGGGAGATGTTTGT
AATTGGTCTACCTTGCGGTTTATCTTGCTTCTTGTTCATCTTTGTGCAGG
TAAATCATGCTCTCATGGAGGAGATCCAGGAGATAAACCAACAGCTCATA
GATACCGAACTCCATGTATGCGAGGACGATGCTGACTCATTCGCTGCAAC
ATCTGATGGGGTGGAAGGGACAGTTATCAAATGCACATTTACTGCTGTGG
CTGTTAGTCCGAGCTTAAAGTCCATGTTTGCATCTGCTCAGATGGTGAAT
TTCTGAACGCACGCACGCCTGATGTGTTGTAGACCTCTATCGTCTGCTCA
TCTTATTTATGTTACAATGTTGCAGAGTCCAATAATGCCGTTGAGGTTGC
TTGTTCCTGCTGGATACCCTAAATGCTCCCCGGTGCTCCTCGACAAATTT
CCTGATGAACAAAGGTAAGTAACCAGTATGGATTCGTTCCCCTGTGTCGT
TCTGTCCTGGTTCTGTAGGTGAATATTGAACTAACTGTACTGCAATGGAC
CTGCATCAGAAACTCCGATGACCTGTCTAGCAAGGCTAAGTCGAAGTTTG
GCATATTGCTGCGGGGTCTAACTGAGCCGATGTCATTGCGAGAAATCGCG
AAGACATGGGACGCTTGTGCCCGCAAAGTCATTGAGGAGTATGCTCAGAA
GACTGGTGGAGGAAGTTTCAGTTCGAGTTATGGTCGCTGGGAGAGTTGTG
TAGTGTAGGTGCATGATCCATGCCTTGTTATGTTGTGCTGGCGTTGAACT
TCATGTTGCGTGGCCGCCAAGTGCAGTTGGCATCCCTAGTGGTTATATAT
TTTTACACATAGACACCTTAATTTAAAGGCCGAGCAACAATGCAGTGGCT
ACCCTTACTCTATATGTGATTATATTTGTGGAAGTGCTCACTGCTGGCTT
GATATGTTAGAGGCCCATTTTGTGGTATACTATGCATATTGTTATAAGAA
GCTGTGAGTATTTGTTAATAAAATATATGAATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.