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GrainGenes Sequence Report: AE027955

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Sequence
AE027955
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE027955
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGTGGGGCTCGTTCCGTTAGAGCGGGACCCGCGCCGGCCATCTCTCTC
TTTCATCCCCTCGTCTGATCCTACTCTCGCGCCTCATCCCGACAGCGCTG
ATCCGATCGCGGTGAGTCCCAACCGCCCCTCTCCTGCCCGCCACGGCCGC
ATTCCTCTTCCTCTGCTTCTTCCTCTGCCCGTGCCCCTACCCCTACCCCT
CTCTATCCAATCTCTCCACCGATTCTGGGGATTTGATCTGGTGAGATATC
CGAATGGGGAGAAGGCCAGAGATCAAGGAAGGTTGGTTGCTCCTATCTTC
TTTTTCTTCTCTCACAATTTCTTCAGATGTTATGTTCGTTTTCCCTATGA
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TCTTCTTCTCCCTGCAATTCCGGCCGGTTGCTTCGATAACCTGACGAAAC
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GCGGCGGCCGGTGGCGTTGGGCCCTGGGGTCGTTCGGTCCTGGTGGCAGG
GGAGGACTCCCACTATGGCGACGCACGGCGGGGATGGCCGGAGGGCTGGC
GCAGCGGCCGGAGTGAGCGGCAGCCGGCGGGGCTCGGTCAGCCAGATCTG
GGCCAGGATGGGCCCAATCTGGGCTTGACGGGCCTTGGCCGGCCCATGCC
TAGGTTACCGCGAGTGTGGCTAGGTGCTCCTCTCCCGACCGGGCGTGGCC
GGGGAACAGACCATGGCGGGTTCTGTCAGGCACGCCTCGCCGGCGACATG
GAGGGGCCATGTTTGCTGGGAGCGTCGGTCGTCTGCTCCTTTGTGTTGCC
TGTTGTTGGTCGTCTTGGCCCGAGTCGCTGCTCGTCAAGGTGGTGTCTGG
CCGTGCTAACCCAGGGGGGTGTGCCTTAGACCGGTGGTGGTCCGGCAAGC
CAGGGTGAACTCGGAGGCGACGACGCTGCTGCTTGGTGGCGGGGATCTGT
GGTGGCAGTGTATTCACTGGTGGACGGAGAAGTAGGATCTAACGCTCGGG
TTGGCGGCGACGGTGACACCCTTGCTGCAGTGTGGCGACGGGGCTTCATG
AGCCCTCTTGGGCGAGGCCGGGCCAGTGAGGGTCTAGTTTGCCCCTGTTG
CTACATCCGGTCGGCTATCGCCCTCCGGCGGTGGAGGTAGTCCCCTCCTG
CGTGTGATTGTACCGCCAACCCACGCCGAATTTCCTCCCTTTTGGTCGTA
CTAGTCTCGCACCGGGGCTCACGGTGAGACGGCGGGGGTGATGGCAAGAC
CGTGGTGGCGTGTGCTGGTGGGCGGCCTGCATGGTGGAGCAATTTGAAGT
GTCCGGGAGTGTGGTTTTTTGAGAGGTCGAGAGAAATCCCTGTCATCTTG
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TTCCCCACCTTCCGTAGTGTATCGGGGAAACCCTAGGACTAGTCCGGGCA
GCAGCGTCGTCGTCGTCGCTTTTCTTCTTGGAGGTGTTGCTTTGTACGTG
ACGCTTCGGAGCGCTAGGAGCGTGGTGGTAATCTTCCGGAGGACGCAGCG
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CTGTCTGGCCCAGCAGCGGTCTCAAACGATTGCTATATTTATATAGCTGG
GCGAAAGCCTGATTCGAGGAACTTTTGATATGTAATTTTACGTCATGTAC
TAGATGAATGTTACACAAAATACATTGAGCAAATTGATCATAAAAGTAGA
TATCTTTTCGACGTATTAATTCTCCCAACACTAGCTCACCGGTCATCCTC
AAGAAATTCAGGCGATAAAATGTAGTGACACGTTTATGATTGCTTTGCTC
CAATTAGATGCCAAATATTTGGTGATGTGCTATATCTATATCTTATCAAA
GTATATCATGTAAAAATAGTAATTTAAATTCCTTATACTCATTTCATGAT
AGTGTTTTTTATCAATATAGAAATAAGTTACATGGAAGTTTTTAAATACT
ACTTGATTTAAGACATTCTTGCTTTGGGATGTTAGCTACATATCTAGCAA
TGGTCAGCATGTTACAATAGCCTCAAAATAATAGCTAGGCGCACAATTAC
AAAAGTGGGACATCTCTATCTTACAACATTCAACAGTTTGCCGTCAAAGA
AAAATGTATACTAAAATAATAATGACCATCATGCTCTCATTAGTTGACAC
TACATGAAGTGAAAGAATAACATGATAGATTTGAAATAAATTGATAAAAA
AATAAAAAAACTTTGTAGCATGGAATAAGGTACTACTGATATCCCCGTTG
TCGATTAGTAGGGGTTTACTATTTTGGTGCACACATTTATGAGTTTGGAG
GTTGATTTTATTATAGTTTGAGCTTTTTGAGGAATGTATCAACTCTCTTT
CAGCATATATTTCATTTTCTTTAGAGAGGTGCTTTACAACGAAGCTTTAG
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AAGGGTGTAGTTTAACTTTGAATGATATAAAAGGATTATCTAGGACACAA
ATGGAAAATAGTACTCTCTCTGTCCCAAAATATAAGACGCCCGAGGATTA
GTCAAAAGTCAACGTTTTCTAAGTTTGACCAAGTTTATACATAAAATATC
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TTTATAAGGTTTAACTTTTGACTAATCCTTTGGCACCTTATATTTTGGGA
CGGAGGGAGTAGATTTTTTGGCTTGTTAAGATTTTGGATGTACATGAAAT
AAAATGCAATATGGAGTATCAAAGAGGCTAGACAGATGAAAGGCAATACT
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GAGACGACTGCATACGGTAAAATAATAGATGAGCAAGAGGATGAATTGCT
TTCTAACTATAGTACCACATGAGCAAAGTATGCATCATTTTTCCAACTAT
TGATCTTTCATCTAATTCAATATTAACTTATCTTTGCCTTATTAATTAAC
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AGTATATCTAGACCCCTTTTAGTGTGTAGGTTAATGTAGGTTTGGAGTGA
ACCTACACACCAAAAGAGATTTAGATATACTCCTTTTAGAAAGCTAAAAC
ATCTTATATTTTGGAACGAGTAGATGTAACAAACCTACCATCCTATGAGA
AATTCTGACACAATTAGTTAATAACACAAAGGCTCCAATTTATTACTCTC
TCATTGATAACAACACTAACATGGAGAGGTGTGACTTACGAAACTTCTAT
GGTACACATGATTGCTAAAATATGATAATATGAAGAAACACACCACTAGA
AACGTGCATGTAATGAAAGTAAGTGAAGCTTCATCAAATGTTCAGTTGCA
TAATGGATAAACCAAACTCCATTGGAAAAGAAAAAAAAAATCCTAGAACG
CAACAACCAAAAATAAAGAAAGCAAAATGAGTAGAATACATATGTTTGGG
GTTCTAGTTAAGAGCTAACACCACAAACCATAAAATCTTTTGCTCTTTCT
TTCATTAAATTGCAAGGAAATAAAATAGCTTAGAAAGAAAGGAAAAATCA
TTTTGGTGTTTTTACTTTAAGTTGCAATGCAACAAAATAAACATGCTAAA
AATAATCAATGATATTATGCATATAAAATGCAAGACGAGCACTAACCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCACACACACACACACACACCCTAAGTTTAAGCCT
TTGGCCCAGAAAACTTGACCATTTGAATTTATTCGTGAATTGCAGGTATA
GTCAATGTCAACTCTTGATTTTGATCTCAAATATGAGTTTGAAATTAGAG
TTAAAATTCGATGATATAGTTGGTAAATTTGTGTCCATGTCACGAGTAAT
TTCTCACATTTTCAAGACTATTAAAGTGTGGTTTCTAGAGCGTCACCCGA
TGTGTTTTATTAGAGTTGTCTGTTTTGGACTTTGAATAGCTAATAAAAGA
ACAAGAGGGTGGATCCACAACAAGTTGATACAATGACAATCCAAACAATC
CATGTTTATGATAGTATGTGGCTACTAGTTAAATATTACAAATTGTGTTC
ACTTCATAATCTAAGTTCGAGTAAATTTAGTAGACCCAAGTTTTTTCACG
GTATAAGGTAGAATCTGGGCCATATCTTGCTGGATTTGCGCACGAGTTAT
GTTAATTTGACATGGAATCCCTATATACTCGAGCTATGTAAAGTAATAGA
AAGGTGATGTCAATGTAGGTTACCGAGCTTCACAAAAATGGTTTGTTCCA
GTCTATCATTAGTGTTGTGCTTTTCCTAGTAGAAAGAGTTGTTTCAATCC
TAACTTCTGAACCAATAATATCCACATGGAGTATTCCACAATATTTTTTC
AACAAATAAAAGGCCATAAAATAAATAAACAAACAAATAAGTTTAGAAGC
AACATCAGTGATTAGATGAGGACAAGCAAATTTCATTCTGCGTCGGCTCA
AAACAAAATCATACTAATAGAATGCACATGAACTTCACATTATCCACTTC
TCCACTTGAACCTGTTTTTGGCCATAGGTCGTTAACTTCCTCTTCTAACT
TTTCCCAATTTGACCTACAAAGACAACACGAGATTCGGGTCAGAGAATAT
GAATTTGTACTAGTTTTTCCTCTTCATATATGATTTTTTTTGTAATAGAT
GTAAATTTTATGAGTGAAAATATGTGCATCTATGTTTTTTTTTCACTCAT
CGAGGTGGCAATTTGGTATTGTTCCAGAAATTTAAGCACACAATTGTGGC
CAACTCCTTCTAGGAGGTGTTAGAATAGGGGGATTATGGAATAATCGTAA
TGTCGTGGATTTTATAATTGTGTGGTGGTTTTGTCGTGTTAATACGACTA
ATGAATCTATTTCATGCTTGCAACTAATCAATCTATTTCATGCTTGCAGC
ATAAAGTCAATAACTCTTTGAGGCGAAATTAGGGTTCTTCAGCACCATCC
AACATGTCGGTTTCTATGAAGGATTTGGATCCGGTTTTCCGTGGAGCTGG
ACAGAAAGAGTATCCTTTTGATTTCTTAAAATTATACTTTTTATATGATT
TTCATAGTTTGAATATTTAAAATAATACAACATGTCATCGATATTCTCAT
GAACAGAAATAGCAAAGTGATCTTGTCTATGATGCATGAATAAAATGATC
ACCCACCAACTCTTTCTAACAACCTAGCACCAGTAGGCGCTTGCGCCTAG
AAAATAAAGACCGTCTTGCTCTGATGATATAATTTTTTGACATATAATCT
ATGTTTTATTGGGCAAATCAATGGTCAAACTTAGGCTTTAAAAAATGTGT
GCCCCACCACCTAATTAGGAATGGAGAGGAAGCACACAACACGTGATGCT
TATTTGAATGTTTTCACTATTTTGAGCAGCAAAAACTTTTATTTATCTAG
AATCAAGGTTACATCCGAAAGAAGTATAGATCGAATAGACTCTGGAGGGT
CATCGAGCCACACATGCTCAGATGAAGCCCTAGTTAAGCGTGCTAGCTCA
TGAGCAACACAGTTTGCCTCACGATAAGTATGCAAAAAAAAATCTTCAGG
AATTCTGTAGATAGATGATAACAATCTTCAAAGATGGTAATCCCTTGGCC
AAAATAATCGCCTTTCACCATCGCCCAGACAGTCCAAGGATATAATGATC
ATGTTGCAACAGAGGGATTGGGCTAGAGATAATCCCTCCTTTATTGCATG
TGCCTCAGCAGATAATGCGTAAAAAACCACATCAATCTTCGAGTTAGCTG
CGGCTATGAACTCACCTTGACTATCTAATGACTGCTCTTGCGTATCCTCA
TCAAACAACATCTCAGGTCAAAATCGGAGCACATAATCCTCCAAACTATG
CAAAACCAATGATTGGCAAACCCTATCTTAAACGGTTTTGCACACATGAC
AACGAGATGGTCCGTGCTCGTGTGGGTGTTGACCTGTACTCCCGTTTCAT
CATGGGACCCAGGCGTCAGCGTAATAGAATGTTTTTCTCCCATTTTCTCT
CGTCCCCAAATCCGTTACTCGATCAATTCCTTCCGCACGGCCATGCCGGC
CTGGCGGCCTCGACCATCTTCGCCTTGACGCCCTTCTCCTCACATTCATC
CCGGCTGCAGCTGGTACGCGTCCGCACGGCCTCACCGTCCGCGCCAACTG
CTGCTGGCCCGTGGGGAGGATAAGGCGAGGAAGGGGGCGCATGGGGATCT
CCGGCGGGGGAGATCCGGAGAGCGTGGGGACATCCGGCGAGGGGAGCAAC
AGAGCGGGACCGGCGTTGTGCGGAGCACTGGCCTACGCGCACTGGAGTTC
CACTGCGGGACCGGCTCGCGGTGGAATAGATTGAGGAGGACTAGGGGGCG
GTGGCGGCGGCGGCGTCAGATTAAGAAGGAGGCCGACGCCAGAGACCTGT
TCCTTTTGGATGACCACCTCGACCTCCCGTGCGACAACAAGGGGGAACAG
GAAGCGGAGGCGACGGGGCTGGAGGACGGGGAGGCCGGAAGGCGTCGACC
GAATCGTTGGTGGCCGCGGCCTCCACGTGCCTTCTCCTTGCTCTGTGGGA
GGACTGCTGGGAGCGGAGGAGCACGGCGAGGGGATGGAGGCAGGGCGTGG
CGGTGCAGGACCAAGAGCTGAAAGCAGCAGGGCACGGCCACCATCCTTCG
CCGGCACCGTAGGCGACCAAGCAGCTCGTGCTATGCCACATAAGCAAAAC
CGCTCCAAAAACAGCTCAACATGGGGTCACGGGGATTATTGTGTTTTGCA
TAGTTCCGGGGATTATGTGCACCAATTTTGATCTAGGGGGTCTCTGTCCA
TTTTTCGATACTTGTATGTCATGATCCCAATAACTAATGTTCATAGGAGT
GTCATGTAATACACAATACTCCTTAATTACTATGCAGCGGTTTGGAGATA
TGGCGAATTGAAAATTTTAAGCCGGTTGCTGTACCAGCGTCTTCATATGG
AAAATTTTACATGGGCGATTCATATATCATCTTAAAGGTATGGGCGTATT
TCTGCCTTCATTTGAATGCACTTTATTTCTTTGGAACACTGTTGGTGCAT
AATCGAGATTAGATTTTTTTTTACATTTTGAAACATAGAGACCACGATAC
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TCAGCTTTCCTGAGGGATGACTTAGCTAATGCATTGTGCTTTTACTGCAC
CAAAAGGTTTCTCCCCTGATATTCTTTTGTCTCTCTACAGACAACAGCCT
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GCAATTCTGAGAGGCTACACAGGCTTTGTGTCGACTAATAATTGTACAAT
ATGCTCAATATTTTCCCTGGAAGGATGAAGCTGGAACCGCAGCAATTTTA
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TCATGCCACAACCAGGCGGGGTAGCTACTGGGTTCAATCATGTAGAAGTC
AATGAGCAGGAGCACGTTACCCGGTTATATGTGTGTAGAGGAAAACATGT
TGTTCATGTTAAGGAGGTAAGCTATCTGAACGACTGCCTTTTTTCTGTTT
TGGGTATGTTCATTTCTTGATTATGATGCTGTTGTACAAACCAGGTTCCT
TTTGCTCGTTCATCCCTTAATCACGACGACATATTTATTTTGGATACCAA
GTCCAAAATATTCCAGTTCAATGGCTCCAACTCATGCATTCAAGAGAGAG
CAAAAGCTCTTGAAGTTGTGCAGTACATCAAAGACACTTTCCATGAAGGA
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TATTTAGAATCACATTTACAACATCTGATAATTTGGAGTCATCTGTAGAG
GATGGAAGGTTGATGGCTGATGCCGAAGCTGGTGAATTTTGGGCTACTTT
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TATCCATAACACAATAGTGTAAAAAATCAATAAAATAATTTGCTTTTAAC
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GTATACCAGCTTGGTGAAATATCATGGTAACATTCTCTAGAAATATTCTT
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GACAAAATCTCATGTTATGAAAGTGATTGAGGGTTATGAAACAATAATGT
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TCTGAGGATGGAAGAGGCAAAGTTGCAGGTTACTGTCTGCCGATTTATCA
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AAAGAGGAGGCTGTCAACTCTGTACTACATGCATAGAAGTTGGTCATCTT
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TTATCTCCGTTCATGTTTAATGGTCATTCTGGATCCTGCATCCTGACTTC
AGGTATGGCGCGTGAATGGAAATAAGAAGACTCTTCTTTCATCCACCGAA
CAATCAAAAATTTATACCGGAGATTGCTACATTTTCCAATACACATATAC
TGGAGAGGACAAGGAGGAATGTCTTATTGGGACTTGGTTTGGGAAAAAGA
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TCACAGGCTAGCAAGATGGTCCAGGCCGCAAAATTTCAGGCTACAATGGT
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CTTGCTTCTGCGCAGGCTCGCCTTTATGAAGGGAAAGAACCAATTCAGTT
CTTTGTCATATTTCAGAGTCTCCAAGTGTTTAAGGTTTGATTCTGACAGG
CTGGCACTGTTGGATAATTTGAGCTGAACGTAACATCTTTTTTCTCTCTG
AATTTTCAATGTAGGGAGGCCTTAGCTCTGGGTACAAGAGCTTCATTGCT
GAAAGTGGTCTCGATGATGATAGTTACTCAGAAGCTGGGCTCGCCTTATT
CCGGATCCAAGGTTCAGGATCAGAAAACATGCAAGCAATTCAAGTTGATG
CAGTAAGTTCATAACCATATTTTGTTTGTAACTAAATTCATAACTTCATA
TCATCTGCTTCATCTGTACCATCCTTTCACTAGGTGGCTTCCTCATTAAA
TTCGTCATATTGTTACATTCTACATGATGGAAACAGCGTGTATACATGGA
TTGGGAACAATACGACCTCAGTGGATCATGACTTGGTTGAGAGGCAGCTA
GATGCAATCAAGGTGTGAATAATATACTCCCTCCGTCCAGAAATAACTGA
CTTGAGTTTGTCTAGATTCGAGTGTATCTAGACGCATTTTAGTGTATAGA
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TAGGAAAATGTTAAACACTTTTGTTTTTGCAAATTTCATGCTTGGTATAT
TGGTGTCATGTAACCCTTGATTGACCTCCTACAAAGGTTTGCCATATGTC
TGTAACAAATGTAGTTTCGACATTTGCACGTGTTATTCTATTGGCACAAG
ATGAGCTCTTGTTCTCATTGCGTACCAACATTTGATGTTTTAGCCCTCAC
CATTGTCATCGCCCTCATCACTATAATGGTTGACTGTTGCTATGATGTTC
TCTAAAATAGCTTTCTATGGCTAATCTTGGGTTTACATTTTAATTTGTGC
TCCATTTTTTGGTTATACAGTCAGAACTGCCATCCAGGTCACAAAAAGAA
GGCAGAGAAACCGACAAATTCTGGGAATTACTGGGTGGTAAATCAAAGTA
CTCGAACAAAAAAATAGAAAGAGAGCAGGAAAGTGACCCTCATCTTTTCT
CATGTATCTTATCCAAAGGTAATCACTAACAAGGCATTGTATGGAGTCCT
ACTCAGAAGAGCTTACGGTCCAACATGTACTGACACTTTTGTTTTTTCTA
TGCTACCAATATTAATGTTGGGGATTCTAGATGGCAATTTGAAGGTAAGA
AAAACGAATATGTGAAGGCTTTATACCTGAGAATGCATGTCTAATGGCAG
TTTATTTCGAATACTACTTGGACAGGTCAAAGAAGTACATCACTTTACTC
AGGATGATCTGGTGGCAGAGGATGTTTTCGTTCTAGATTGTCACTCGTAC
TTATTTGTTTGGTTTGGGCAAGAGGTTGATGCCAAAGTGAAAACACAAGC
TATGGATATCGGAGAGGTAATAGTGTCAAAATTATGTGTAGTTTAATTAG
AAATCACATAACCTATGTGGTCTCATACTTTCTTTTTCTCAATGCTACTG
TACCAGAAATTTATTGCCAGCGATTTCCTCATGAAAAATCTCTCCCGAGA
AACAACGATTTTCACTGTTTCGGAAGGAAGCGAGCCTCAGTTTTTTACTA
GGTTTTTCACTAGCTGGGACCCTGCAAAATCATTGGTAGGTTTTTCTTGG
TCTTTTGGTTAGGCGTTGGTTGTTATTTTGGTATGTGGATTTCATGTGTT
TGTTATGAAATTAATTACAGTTCCTGATCTTTGTGATTGCACTGATACCT
AATTAGCCCTTACATAGTTTTAGGACTAAAATGCACTGCATTCACTTTTG
TTTTTTGTTGCAGATGCATGGCAGTTCATACCAAAGGAGGCTTGCCATTT
TAAAAGGTGGGGCAAGACCGTTGATTGATGTAAGTCTTAACCTAATCATC
CTCCGTCATACCCGGGTTTTACGTCACATATGCTAGTGCATGTTGGTCGA
GTTTTTTTATATTTGAAATAAGGCGTAAAAAGTGGATTGCATAATTGGAA
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TCAAGTATTATGCAACTCGGTGTCAATTTTATCCTACTGATTACTTGCTT
AAACAAACTACTATCTGTGTTGTCAGAAACCTAAAAGGCGAACACCAGCA
GTTTCAGGAAGAGCTTTGGCACAGGATAAATCCCAGCGCTCAAGAAGCAT
GTCCACCAGCCCAGAATGTCACCGTATCCGAGGAAGATCTCCAGCCTTCG
CAGCACTAACTTCCACCTTTGAGAAACCTAGTACCAGGAATCTTTCCACC
CCTCCCCCTGCCATCAAAAAGCTTTTCCCTAAATCTACCGGACCTGAAAC
ATCGAAGCAGACTGCTATCAGTGAACTCACCAGTTCTTTGGAGGGTCCCT
TGAGAAGTGCAATACCCAAGCACCTAAGAGGTATGTGCAACACAACTGTT
TGTAGATTGACGGTTGTGCTAGAACAGGGATGAATAAACGTTCTATTGTC
TTGAAAAAATCATATTTTTTCGATATTTCACAAAATTAATCGAGCCCAAC
TGATGCAGATAAGGCAATACAAGAGGACACGGGTGGCGAAGATGAGGCTG
AAGATGACGAGGGGCGTACGATCCACCCATATGAACGCGTCACAACCACG
TCCGCGGACCCTGCGCCTGACATCGACATCACCAAGAGAGAGGTGCGCTG
AGCAGAACAACTGTTTTTCCCAGCTTCTCATTCATTCAAACTGCTGTCTG
ACATTTACTGCTGAATGCAGATTTACCTATCAATTTCCGAGTTCAGAGAG
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GGCAATGGGCAACTAATTTTGAGGAGTGTTTTTTTCTAGGCTCTGTTTCT
TCCAGTAAATAGATCTTCGAGGAGCTTTTTTTAATACATACAAGTTCAGA
GCTCAGTAGCTCACGCAGGTTCTGTTGTCGGGTATCAGCGTTGCTGTATT
TCTTTTCTTTTATATAAACTTGGTCGCAGAGGAGGTGCACATGATTGAAA
CGTGAGTTGTAGCCTGGTGTGATGGCGCCGAAGCATATGTATAGAGCATC
AGCAAACTGCCGAACCAGTGCAGTCGCCATATTCGTTTATGTCAATAAAG
CTTGATAATGTTTTGCTGACCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.