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GrainGenes Sequence Report: AE026801

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Sequence
AE026801
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE026801
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCTATTCTTCGATAGAGTATTTGGGTCAGGTGATGGATGTCCATCTTA
CCTTGAAGATATATCAGCTGACATTTTGAAGAAGTGTGGCGGATTACCAC
TTGCAATCATCACTATAGCTAGGATCTGTTGCTGTGCCTGTGAAGCCCTT
TCTAGATGGTCTGGATCTATTGTTATTGGACATCGGTATCAAGATGCATG
GACGACAAAGGCCCAAAGCTTATATCAACTGAGTACGTTTCCAAGTTTTT
ATACATAATAATAATAAATTAGCTGAATGTTCTGAGTTTATTTGGATGGG
AATACTAGTTGCTACAGGTTAACCAGTTTGCAGCAAATTAGGTTGCTTGT
TTTAAAAAATTTAAGTGTCTTGGGCGTAGTGTAGGTTTCCTTTCTACATC
TTGCATTCAACAATGTGATTGTGTATGTCACACGAGCTGATTGAATTGTT
TATTTATTTATTTTTGGCATTTTATTAACTTTTATTTATATGCATACTCG
CCATATCCCGTATTGCTGTTTCCAGAAATTGCCGTATCCATATCACCGTA
TCCGTCGTGATGTATCTGTGCTACGTAGATAATTACAATCACAAGTGATG
ACACCTTCCAATCAACAGGCAACACTACTGCTAGCATTTATTAGAATTCA
TATTGTGTCGTCATTCCTTGTTGTTTCATTGGACAGGAGATTCATGTGAT
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AACCAAAAGGGTTCTATAGTATATTTCCTCTGTTACAGGTGAAATTACTT
CTTGCTAGACTGTTTCCTTCTTCTTCTTTTTTCTCAGTGTGATGCTCATA
TTTGAAAAATAGGAAAGTTATGTCACTATCCCATGCACGCTTGAGTGATA
CACAAGTTATGTCATATTTGAATAATACATTTTCTTTAGAACACGGCATG
GTCGGAGTGCTAGAATGTTCGGTCGATGATGAAGTTATGCTGTGACATAT
TGTAGTGAACAAACAACCATTCTGCTGTTGTGATATTTTGTTGTGAAAAA
TATTGCTACTCCTTTCGATCCAAATTAATGTTCTTAGATTTGTCTAGATT
CAGATATATCTAGATTAGATATATCTGAATCTAGACAAATCTAAGAACAT
TAATTTGGATCGGTGGGAGTAGCATATTTCAACATTTTTTGTTGAAATTA
ACGGTGGGGTTTGATCTTTTTCTAGAGTTTGAACTAATAACATATCTTTA
TTAGTTGCCGGCCAGATGAAGTTGGCATATTTTGTCGGATGCTCTCGTAT
CCACGAAGTAGGAGTGTTAGGATGAAACAAGAAGCATGATTTTTAAACTT
ATAGGCTTCTATCTGTGGAACATGTCTTATATTTGATAAGATACATTTAT
GATCTAGCAAATGTGATTTCATTTCATGTAAAAAATCTAATTGTTTGGTT
TACTAATTATCTGCTACTTCCTCTGTCTAGAAATAAGTGACGCATCTAGA
TGCATGCGAATCTAGAAAATCCAAGTTATTTATTTTCGAATGGAGGGAGT
ATAGAATATAACCATGGGATAAATGGCTGCACATCATTTCTGAAGATCTA
GAAACACAGAAAAAATGAGGAAATAAGGCATGAATGAGGCTTCTTCCAAA
TGTATGTCGGTTATACTATGGATTAAGTTAGATTAATCATTTCCAAATGT
ATGTAGGCTTTTTGAGGCACTCTTTTATGGTATTCGTTGTGTACTGCTTT
GGTCAACTCTCTAGTTATGTTGTAGGAGTGTTATGTAACTTGTTTGTTCC
TGAATATTTGTAATGTGAGCTTGAAGAATAGATTAATTGTAATGTGAGTC
TGAATTTGTTTTTCAGAGTGTATTTATTTATTTTAAGACACTTTACAAAT
GGTCCTTACTTGTTTTTAAGGAATTTTTGTGCCTGCATTTACTGTATTAT
GCCTTGAACTATTTTTTGAGGCATTTTTGTAAACTGCCTACAAAGGTTCT
TTGAGGCACTTCGAAAAATGCCAACAAAATTATTAGAGGCTCTCCTCAAC
AGTGCCTTAAAATTTATTCAAAGGCAATTTTCGAATTGCCTCAAAAAATA
TATATTTAAAGGCATTTTCAGAAGTGCCTCAAAAAACTATTTTTAAACGC
TTTTTTAAGTGCCTTAAATGATTTTTCCCTACACCATTTGATTCGGCATT
ATTTTTATTTCCTTCAAAGTTTTTTGGAGGCACTCTTAATATTTTTAAGG
CACTTTTTTGTGCCTCTAATAATCAACCGTGGTGTAGTGACGGTGTCGCG
GATCATGCGGTGGTCAGCATGAGGATGGATCATGTCGTAACCATGAGAAC
GGCCGGCCAAGAAAATGTATATATACACGAACCAAGATCTACAGCAGTCT
AAACCTAATCGTACTTGATAACGTATAGAGGCTTTATCAGATCACGCTCC
ACTACTTCTTTCGGTGGGAACACCATTACGTCAATCTAAACATAAGTTTA
AATTTGAACTTGGATGGATGGAGAGTGATGGGTTCTATGATTTGGTGAAG
GCTATTTGAAAAAGACCGGTTAGTGCTGCAACACCCATACATCGTTGGAA
TAGCAAAATGCGTGCCCTACGCAAGTTCTTTCGTAGTTGGGCCAGACACA
CGGCCGAAATCCTAAAAAGGAGAAAATACGCCTTTCGACCATCATTAACG
ATTTAGAGGCTTGCGCAGAAGTTAGGCTATTATCTGCACAAGAGATTGAG
CTAAAAAACCAATCAAATGCGAAAATTGCCAGACTTCTTCGCGAGGAGGA
ACTCAAATGGTACCAACGCGAGGAGATGCGAGTACAAGATACTTTCATGC
AGTCGCAAATGGCAAGCATAAGAAAAAACTTATTCACTCTTTAATTCAGG
ATGAAGATACGATTGAGGGCCAGGAGCAGCTAAAAGCTTATATTACTAGT
TATTATAAGGACTTGTTTGGGGCACCGTCAGAAAACTCTTTCGAATTGGA
TGAGTCTCAAACAGGTGATATCCCGCAGGTTTATGTTGAGGAAATTAACT
TTTTAACCGCTCTTATACCGAGGAGAAGGTCAAGAGAGCTGTTTTTCAGA
TGGAACATAACAAAACGTCAGGTCCTAATGGCTTTTCAGCATAATTTTAC
CACCAATTCTGGGAAGTCATTAGAAAGGACATGATGCTTCTCTTTTCTTT
TCTCCACGTTGATCAGCTAGAACTGTTTAGACTAAATTTTGGCAACATCA
TTTTACTACCTAAGGTTAATAATGCGGAACAAATTGAAGGATCCGCTGTC
GCCTATACTATTTAATATAGTGGCTGATATGCTGCCTATTCTGATTGAGA
GAGCTAAGGCTGTGAATTGAAGGACTAGTTCTCCATCTTGTTGATGGTGG
CATTTCTTTCTTTAATACACCGATGATACTATCTTTTTATGGAACATGAT
CTAGAGAAAGCTAAGAATCTGAAATTAATATTATCAACATTTGAGCTTCT
CTCTAGATTGAAAATCAATTTTCATAAGAGTGATTTGTATTGTTTTGACG
AGGCTGAGAACATATAGAGGCCAAATAAAACCACGATAAATTTGTTCAAA
TATCAGCCGGAACATACCTAAATGTAAGGTTTTGTGACCGTCGTTCACAA
TCTAAATACTCTAAGTTTGTGACCGTCGTTCACAATCTAAATACTCTAAG
TGCTTTACTACATATATAGTCCCTTTGTTTTATAATAAATATCACACTTG
TTAGCAAGATAAAGAAGAGGTAGGTGGTTTTGTGTAAATTGGAGCACCAA
GGCAACGCGTGGTCGGTTGGTTTTGTGTAAATTGGAGCATATTTTGTTCC
TTGCTCCTCTCTCAAGTCACGCCAGGAAGCATTCTTGCCCCTTTCCCTCC
TCCCCTTTCTCTCAAGTCTCATCAGTCACCAAGCCAGCATCTTGTTCCTT
GCTCCTCTCTCTCTCTCTGTCTCAGTCAGTCAGTCACGCCGGCTGGAAAG
CATTCTTCCCCATTGGCTCCCCTGCATCCCTCCTTGGCTCCTAACGCCCG
CCGTCGATCGCCGCAGCCAGGCCGAGGACGGCGCCGGCTAGCAGGAGGAT
CCCCGAGCCGTGAGTTGGCCTGCCCCCTCTGTCGACTCGAATTTAATTGA
ATTGAATCGCCGCAGCCGGCAGGAGCTACGTCCTCACTGATTTACAGTAC
TTATTTGAATCGCCGCAGCCCAGGTTCGTTGCGTCCCTTCCTCCCTCATG
CAGCTTATCCACTGCTTGTGTAAATACCCACCAGCTTGCATGCTTAATCC
TGCTCAACACCCATTTATTACTCCCTCCGCTCCATATTCAGACTAAAGTT
TGTCTACATTCGTATGTATGTATGTATCTAGTTAAATATTTATACTAGAT
TCATTCATATCTAAACAAAGTCGACAACACTAATATGGATCGGAGGGAGT
AGAATAGTTTGTCAGCTACTTCATCATCGTGTAGTAAGTAGGCTTCAAGC
AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTCATGTGTTGTGTTGACATATACTATACA
CTAGTATTATCTGTGGTTCAGTTACTGAGTTATGTATTCACACAGTTTTA
TCGCTGCTGCTCCATTTTATTACTGCTGGATGCAGTTTGACTGCCTTAAT
TGCGACTACGATCGGAGTTGGGGCTACTGAAATCGATTAGCTTAGCTATG
GATGGATGGGTCTGTCAAACTTCACTAAACATGCTCTATACTGAATTTGC
TAGCTTATCTTATATTTTTTGAAACGGAGGGAGTAGTACTATGGAATAAC
CATAGAATTCAGAAAACAAACTGGAGTTTCTGAGCTTATATACTAGTGTA
CACTTGAGCATCAACTTCATTTCAGGACTCCTCATTTAAACAAACTATTA
CTGGGTTATAGGTTCAGATAGTTTATCACCGTTTCTGAGCTTATAGGTTC
AGATAGTGTTGGCATACAGTAGTATTTGAGGTTCAGTTACTGGGTTATGT
ATTCACACGGTTTATCACTGCTGCTGCATTTTATGCCTGGACACCTCTTC
CAAAGTTTCAGCATTTGTCTCGAATACAGTTTGACTGACTTAAAATCGAT
TAGCTATGGATGGATGCTCTATACCGTCTGTCAAAGTTAACTGGTTCACT
ACTCCCTCTGTTAGGGATTGTAAGGCCCATGGGTCACTTTGATAGGATTA
AGAAAACCAATAACTCACCCTCTTGATTACTGTATGCACCAATAATTGTA
CATGCACGAGAGAAGAGAAAGAAAAAGAAGACCATGCATTGGAGGGGAGA
TGATAATAAGTGACAAAGGCCTTGTAATTCCTAACATTCTAAAATAGCTC
TTAGGCCTTACAATCCCTAACGGAGGGAGTATTTCTCAATTCAAATCTTC
GCACATATATACAAATCGTTCTTAAGTAATGATCTAAAATAAGCCCTCTG
CATTATTACTAGGTACTCGGAGATGAGATGCATACAGTTGTCTTGACTTT
GGCTAGCAGGTGAGGCTATTGATATTAATAGCTGTGCATGGTCTATTGTA
GCAACTATGTGTGGAAGTTCAGTAGTTCCCGCCCACATCTAAGGAAATTG
ATATTAATAGAAAAGCCGCGTCATGGTCACAGTATTTTTATGTGTGGAAA
TTGATACCATGACAGACCTGTTCCCTGTTCATGGCCTCAACCCTCTACTG
CTCCCATAAACAAAACACAGCACGACAGTTTGCCTCATTTCATAGCATGG
AATCAAAAAATGAATTGGAGTTTCTGAGCATATATGGTGTACTGTGGTAC
ATCACTTGTCTCATCAACTTCATTTCACGACTCCTAACAAGTAGCGACTA
TGCGTATAGGTTTCTTACAAACAACTAATTTCGCGTTGACTGCTTAGAAA
ATATCCAACACCTAGCAGCTGTGCTAGTAAAGCACTTCGACTTCAGTATA
TCAACTTGATTTGTGCTATACTAGTGCCTTGTATACATCCCATAAAACCG
CGCTTTAGCTTATTACTAATTTGCCTAGCTTCAGCTCCGACACTTTAATA
AGTCCGCACATCGGTTCGCTCTGGCCATCCACGGCTAGATTCAGTGCAGT
ATACCGTCTTCATTCGTGCACCATTAGAAACACCAACTCTAGCTTGCTGC
CTATTCATAAGCAGATGCGATTATCCCTTTCTGTCTGACTCGATAACAGG
CAGCTACTGTGATAGTTCCCGTCTCGTTCCCCTCAGAGATTTATTACTAG
AATATTTTGGCTAGCTGGCTAGTTCATCCTGCCGTGGCTTCAAGCAGCAA
CAGCAGCAGCTGTTTATCAGTGTTGACTCAAGTTTATTTACTGGGTTATA
TATTCAGATAGTTTACCACTGCATTTTACTGTTGCCTTTTCAGACCTAAA
TAACAAAACCGAATGATCCATCTCTAGCTTCAGCTTCCTCTGTCGATCGA
CTGGCTCTGACTGAATCTAAATGAGTTCATGTCTGTTAAGTCCTTGTGAA
GTTAGCCATGCGTAAGTGTACTGTTTCTTGCACACTGCTAGACAGTATCC
TACTCTTCAGTTGTCAAACTGAGATCCTCCTATTCTGCAAAGTTTCCTTT
AACCTAGCTGGATCCACTAACAGCACGATTTCCCGACAGAGGGGGAGGGA
ACGGATCTTGGCCTGCTGTACTAGGCTTATCCTACTGTGGCTTCAACCAG
CAACAGTAGTAGCCCATCCCGTTGACATACATTATTAGTGCTGACTTAAT
AAAATGATGTGACAATCCAAACTATAACCACAAAAAATGTACAGATTATC
AGTGTTTAAAGTTCAGTTTATGGGATACACATTCAGATAGTTTTATCACT
GCATTTTACTGCTCCATTTCAAAGTCTGCACCTAGACATCTATTTCAAAG
TTTCTGCTTCTGAATACAGTTTGACTGACTTATCTGCGAATAGGATCGGA
GTCGGGGCTAATAAAATCGATTAGCTATGCATGATCTATACTGTCTCTGA
AAGTTCACTAAATGTGCAGTGTATCCACTTATTAGCCCCCTTCACTGAAT
TTTAAGAACTTGCTCTGGTAGACTTGCTAAATGTGGAGTATCTACTTTGC
AGCCCCCCCTCCCTTCGTACTTAATTTTAAGATCTTTGATATCTTATTCC
TGCCAACTTGTCGTTGCTCCAAGTAGCAGCAGCAGCAGTGCATTCCTGTC
AGCTGTTGAAATACAGTATTTTGGTTGCTATGGACTGCATACATACTTTT
TAGAGCAATAGTAGAATGTAGATAATGACATTTCTTCCAAGTTTTGGCAT
TCTGGTGTACATTTGACTTTGATCGGTTCACTATGGCTATCCACCGTTGA
GATTCAGCATCCAATTCATGATTGACACTTCACTGTCTTCATGTACTACT
AGAAACACAAACCAGCTTTCCTGTTGCCTTTTCATGGTCTCAACCTACTC
CCATAAACAACCGTGTTTTAAGTTCTTAATTTACCTCATTAAAGAAAAGA
AAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAAAGAAAAGAAAAGAAAAGGCTTTCTTATC
TCACCTTATAGCTCATACCACATACTTACTAGTTACTAGTACGTACTGGA
GTAGTATATCATGCTGTACCATGAACTAACGCCGATAAATACTTTCTTCG
GACTAATTCTCTAGCACAGTGACTATGAGTACAGGCTTCTTGAAAATGAT
TCGGCATCCTTGCATAACAGACATGACATTTTTCTTCATCCCTACCTTCG
TCCAATAATTTTCCATTCATTCATTCACTAATCATGATACATGTGCTTTC
TTATGCAGATTAATTGTGAGCATACTGTTCGTTGGTGCTATCAAGATTCA
GCTAGTGAGCCAAGAGATCTAGCTGAGCAGATGGTGGGAGGAGTTGTGAG
CGTGGTGACTGGGGTGATGAACCCCCTCATTGGAAAGCTCACCGCGCTGG
CGGACGACGAGTACAAGAAGCTCAAAGGGGTGAGGAGGCAGGCATCCTTC
CTCGTGAAGGAGCTCAGTGCTATGAATGCTGCCCTTCACAACCTGGAGCT
CATGGATGAGCTCGATCGAGTGGTCAAAGATTGGAGAGACCATGTCAGGG
AGATGTCCTACGACATGGAGAACTGCATCGATGACTTCATGCATCAATTC
GGACATGAAGATGCCAAAGCAGGCTTCGTCAAGAAGACCACTCGGTGTCT
CAAAAAGTTGTGGAAGCGTCTTCGGATCGCCGCCCAGATCAAACAGCTTA
AGACTCTTGTGATAGAAGCAAATGCTCGACGGGAGAGGTACAAGATTGAT
GATTGCAAGCCTAGTTCTGGCTCTGGCGCTGTTGACGCCACTGTTGACCC
GCGTACAGTCGTTGTTGACCCACGACTACGAGCAATTTACCAGGAGGGAG
CCAGCTTTCTGTGTATTGATGGCCCAACGGCGGAGCTGGCTAGTTGGTTG
ATGGACACTCAGGAGAAACTCAAGGTGTTGTCTATTGTGGGATTCGGAGG
TCTCGGAAAAACTACAGTTGCCAAGCAGCTGTATGACAAGTTCAGAGGGC
AATTCCATTGTGAGGCATTCTTCTCTGTTTCACAGAAACCAAATATCAAA
CTGCTTTTCAACGGTTTAGAAGCGAAACTTCATATGACTCGGTTTTCCCA
TGCTCGCGAGATTGAAGACATCATTCAAGATATCGGGGAACATCTAAAAA
ACAAGAGGTGGTTGTTTACTTCCAATAGTCACTTGCATGGGCGGCTTGTC
ATGCTAACTAATGGTTGTATCTATGCCTCTAGTGAAAATACTTCTTTCAA
ATATAGAATGATCTATGTTCCGTATGTGCTTAACTGATCTGGAATCCGGA
ATGCTTTTCCATTCAGTATGATAACTCCTAGGAGAATATATATTATATCC
CTCCAGTCAAATGACTAGTTATTTAAATTGTACACACATGCGACGCAGCA
CAATGCTCGTGAGTAGTGAGAGTACAAGGCTCGTAGGGCATAAAGATAAC
TGAATACAGAGAGATAATTTCAGGCATAGAAGCATGTCAAATGATGATGA
ACATTAATTCCCTTGTTAGACCATGTTATTTAGGCTAAAATATTGTATGA
TTATCCTTATTCGGCTCTATGAACATTAAACCCCATGAATCTAGTTTCTT
AGATTCCTTTCTTTAAATTTTATAGTCGCATTTTACAATTTAATTTTTTA
TGTGACCTATATAAACAATTCTCTACAGGTACCTTATTGTGGTTGATGAC
TTGTGGGATCAATCAGTATGGAATGTTCTCAGCCGTGCCTTTCCAAATGA
AGGTAATGGGAGTAGACTGATAGTGACAACAAGAGTGGAAGGTGTGGCCG
GCATGGCTTGTCACAATGATCAGGCGTCCATCTACAGAATGAAGCCCCTC
AATGAACAACACTCAAGAATGCTATTCTTCGATAGAGTATTTGGGTCAGG
TGATGGATGCCCATCTTACCTTGAAGATATATCAGCTGACATTTTGAAAA
AGTGTGGCGGATTACCACTTATAATCATCACTATAGCTAGCCTGTTAGCT
AGTCAAGAAGGGTCAAGGAGTGGTTGGGAGAATATAAGGAGTTCTCTGGG
TGCCTGTTCTACCATAAATCCCACATTGGAAGATATGAGGAATATACTGA
ATCTTAGCTACATGCATCTTCCTCTTTATCTCCGAGCTTGCTTTCTGTAT
CTTGGTATGTATCATGAAGACGAGGAAATTGAGATGTCTGTTGTGATTCG
GGAATGGGTAGCTGAAGGCCTTGTCAGCAGAATGCATGGAACCGATTTGA
TGGATGTTGGAAGGAGTTACTTCAATGAACTAATCAATAGAAGCATGATT
CAGTCTGTAACACGCAATCAAGGAAAGATGATGTATTGCAGAGTACATGA
TTTAATGCTTGATTTGATCCTCAGCAAGAGTGCAGAAGATATTCTTAAGC
GTGGCGTCCAGTTCAGAAGACATCATAAAATTGCAAGGCTGTAGATACAA
GGTTCGCCGGTTATCCCTGAGGTCCATGGCCGGTGGTGCAACAAATGGAC
CGACCATTGGTGCTAACTTGCTGTCACAAGTTCGATCATGTGCATGGGCC
AGGAACTCCATGCCCCCTATGTTGTTGTTCAAGTATCTCAGGGTGCTCAC
CCTTTACGGCCGTTATGATGGTTTAACAATTGACCTCACTGCTATCAACC
AATTGTTCCAGCTAAGGTATTTGAGTGTTGAAGCAGACTATGGTAGCATA
GAGCTCCCTTGTGCACTTAAAGGGCTTGTTTACTTGGAGACGCTGCACCT
AGCTGGCGGTTTGAAAAACAGCTTCCCATCAGATATCATTCACTTGCCCA
GCCTGTCCTATCTGCATCTTCCAAGTGGTGCAACTACTATCGAAGGAGTC
GAGAATATGAAATTACTGCGTACACTGCTTTGGTTTGACCTAGCGAAGAA
CTCGGCGAAGGATATTAGGGGTCTCGGCGAGCTGACCAACTTGAGGGAAT
TACGGTTGTGCGGCAGCGATTTGGAGACATCAAAAGTTGATGCTTTGGTT
TCCTCTGTTGGAAAGCTCCATAACCTGAAATATTTATGCATAAGTACTCT
CCTTGTAGATGAGAGTAACCAGCTGGGTTTATTATCTAGTAGTCCTTTTA
AACATATTGAGAGACTTGAGCTGTTGAATTGGAAGTTCCCTAGAGTCCCC
AAATGGATGGGTGATCTCCATTGCCTCCGTGTCCTGGAACTCCGTTGTAT
GGAGATGCTGGCTGAGGTTGTTCATGTTCTTGGAAAGCTGCCTTCCCTCG
TGTTTCTCCATTTCACGGTGACAAAAATCGCCGCGGCAGAACGGGTTGTA
TTGGGCAAGGGAGTATTCCCTGTTCTGGAGCATTTCGCATTCTGGCCTTG
GAAAGGAGACGCTATGGAGTTGTTGGTGTTTGAGGGAGGGGCTATGCCCA
AGCTACGAACCTTGAGGCTAGTGGTGAATGAGTGGGGCGGCAGTACACTG
GTGGGCATGGAGCACTTGATACTCCTTGAGAGAATTCTTTTGTTTGTGGA
CAGTGGTGGCAAATCCTCATGGATCAGAGATGATTTATTCTCTGCTTTCA
GGAAGGCCTCACAGCTGCACCCAAACCGTCCTTCCGTTGCATGATCGTAA
AATTTGTTATTTTGTTTGGTGAGCTGGTGTTGCAGCGCCGTAGTTGATTG
ATGTTGAATTAGTGATTTGCAGTTTGTAATAAGCAAATAATCTGCTTGAG
TGTTTTGCGCTGCTTCCAACTTTTTTATTTTATTTTATTTTGTGCTTCTT
TATGTACTCGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.