Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE048152

[Submit comment/correction]

Sequence	AE048152
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE048152
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGTCCTCCACCGCCTCCTCCCCTCCACCAAACCCCAGATACGGCGGAGG CGGCGCCGGTGTCGGAGCGAGGAGAGTGAATACTACAGTCACACGCGCTC TCTCTCCCCTGTTCCACTTCCCCAGCGCCAGCGAGACCGATGAGCGGCCA GAATTTGGAAATGCGTCCGTCTCGTCCGTCTCGGTCGGCCGGGATCGCCG GGCCGCGTAAACGGTAATGCCGCTGCCCCGATACCCACTCCCGTGATCTC ATGATTCCGTGTTATTCGCTGCTTGTCTAGGTTTCACTGGTATGTTCGTA CCTGTGCTAGCAATTCAGTATTATTATTGCTGCATGTCGGATGATGACAG CGTGTTTGAGGACAGGCTTTCGCACCTTAAATGCGGAGTTTCGTTGATTC GCGCTTAAATCCCATGGGCGCATTTGTCGCCTTGCGCCGTTGATCATAGC TAAATGGAGTTTAGTTGCTGAAATGAGGTCAGCTGCCTGGGAAACGAGGC CAGATGGTGCTATTTGTGTGCACATATCTTTAGCAAATGCACTCAGATTG GCTCTTATGACCTCGGTGAGCTCAAGCAGTTCAGTGTGATGACTTTGATC TATACACTATAATTTTAGTATGTACAACCTCCGTTCCAAAATATAAGATA TTTTGAGCTAAAATAGCCTACCAAAACGTCTTGTATTTCGGTACAGAGGT AGTACTTCGGAGTTCAGACTTGACTGATCTGGTTTACATCCACACTCATT AAACAGAGAAGGAAAATCAAAACTATTGTCGTTAGCAACTGAGTTATCCG ATCATACTTATGCTCACAACTGATAATATGGACGTTATATAGTATATTAT TATATTTCTTGATTTATTTAGACACATGACAGTATGAGAACTCCAATGCT ACTTTGTTTCATATCAGATGAATCAAATGTCTGGACTACTTGATTGCCTA CTGATGTTATATGGGCTGTGAATAACTTTTTGTGGATTATATAGTTTCTA AATCATGAGTGGTCCTGCTTTGTTCTAGATACTTCTGTGCCCATCCTTCA GCTTGGTCCTTGGAACCTATTAATCCAGAAAATGAATCTGTTCAGAACTG GTACAGGGTTAATCCAGAAAATTAATCCAAAATATGTACCTTCTGCCACC AACACCACTCTCCTTTTGGCAGTTGAAGAATAGTGCAGCAACTGGTGGTC CGAGATTGTAGAATGCTGAGAAGTCTCTGATGTTAAAATTGGGTCGCCAT CCTGGTGCATAAACTGTCTGCCGTGCTTCCTGTTTGAATAGCACAAAAAC AAGCCGATGAATTCCGGCTGGTGGCCGTGGAGCTTCGTAGGGAACTATTT CATTGCCTGAAACATTGTGTATTCTATATTAGACTTGCTTCTCAATGACT CGATTTTTGTAAGATTTCACCATTTGACATTACACACTGTCTCTGTTCTA ACTATTTTGGACTATATGCTCCTTGACGACTTGACATAGATATTTCCTGT AGTTCTGTGCATTATTGCTCAGCCCTGTGCTGCCTTATTTATTTACCTTA TCTCAAAGTTATATACCTAAGTGTATCTACTATGGGTCTCTGCGACAGAA GTATGGTGGCAAGGCAAATACCATGTACCTTCAGAACGCATATCTGTTGA AGTTGAAGATAGATTATATATAGGTGAAAATTTTCCATTGGTGAGCTTAT GAAAAAGTGACATAGATAATTTGATAGCCTACCACTAATTGTGTCAATTC CCTCAAATTAGTAAATGCATTAGGTAGGGCATGCTATGGTATTTCTGTTT AATCCATTTAAAATGTTTTAATGTCTGCTTAAAATTTTAAAACTAGCTCG TGATTGAATAGTAGAAAAACATATCTATCTACTATCCCAAGCCAGATAAA TAGGTTAGGCTAATATTTGGTCCATGTATTACTAAAGATATATTTGGCTG CTAATGTAGCAATGTGGCTAAGACATAGTGCTGGTATTTTTTCTGGGGGA CATTTGCAGTAGTGTTTTCTGATAGCCATAACTATGTTTTGTGTGCTCGT GCTAATAAATACCTGTGCGCTAGTACTAGTAGGCAGCATCTTTTATAGGA TATTATGCACTGTGACAACTGTACAGCTTGGTATTTTAAGCGATATATTT AGTGTTTTGTTTTCAGTTGGAAATGGAAGTTAGCTTGTTTGAAAAATCTG AAGTATATCTCATAAATTTGGAATGTAGGTGTATCTTGTATTTCTGTGGA CCTGCACAGAAGATACCGTTGCTCAAACATTATATGCTGTCTAGCAGTGA AGCAGGTGGCACTTGTCCATCAACTTGATTTCCAGTTGAAGTCTCGCCAC ATTCACAAATATCAACAAGTGGGTCCCACAAAAAGTTACACGGTTTCAGA TACTCAACTTGGGGTGCTGTTGGGCAGACAACAACCGTCCAACTGCTTAA CCTGCATCCAAAACAGGTGCAGTCACATATTAGGGCAGGGTCCACCCCCT CTCTCTAACGTGCTTTGCATTTGATTCACAGGTATGTGCACTTGAAATAT TTCTGTGTAGTTTAGTGTTCAGCACGGGAATCACAAATTTTACTTGAAAA CTACCTAGTTTTTATTCTTCTCAGTTGCTGCAGTGTCACCTTAAATCCAG AAAGATGAGAAGTATATGGATATATAGCCAAAATGCCTAAGGTAAGGACA AAGGATCTCAGCATATGGTACGGTAACTTGTTAAATCAATCTGATATGCA GATGTCAGTGACTAATAGTGTATGTAGCACACATTGAAATCAGTTTGTGA TGACTTTAAGTCTTGAACAACTATTGACTTGATCATATTCTTTAGTTCAG TAGATGCATTAATTTTCTAAAATCCTTGTGGATATCTTCCCTTGAATTTT TTTATTCTTCTGGGAATACTAAGCTTGGATGCAGGCTTAGAACTATAAGA AGTGATGTGCTCTCTTGAATTTTTTGATTCCCTAGCATTTTCTTTGAAAT AACTGATTCCTTAACAGGTGTCACATAAATACGAGTACTTGCATAGGTAA ACACAATTTACAGATTGTACCCTAAACTCTATAATGCCTGCTGGCTACAC AAATTAAGGCACCGTGCGCACTGTAAATATGTTACTTGTCATCTTCAAAA TCTATGCAAACATCATTTTGTAGCAAAAAAAAAAAAAACGTTTACTTGAT TATTCCATCAAAGAATTACATGTATATGCTTAGTTTACAACAATGTTTTT ATGGAACACGTGGCATTGGCAATAGCTGTGTGGCCATAACTACTTATTCC CATCTCTATCATCATTTGGTTTTCCATTTGACATAAAATTTTCTAACTAC TTATTACATTGGCACTGTTGACAATTGAATAAGTTCAGCGATCTGCGTAT GTCATGTATAATTATTCAATTATTAGAGGTTATGTAAGGTGTTACCCACC AAAACGTGCATCTGTTGCCTCTGGGATGTCTGTCACCAACCTGTACAAAA CAATCAAGAAGAAAAATAAGCAAGACACCACCTTTAGATCTTTGATCTGC AACAGAACTGCTCATATATGATGCAAAATAACCTATTAAAAGGTAAATCA TGTTATTAACAAAAATCTTCATTATTGGTCATATTGTAAGTTTCTGTAAG GATAGTTGAGTTTCCAAACCCGGATCAGATTAAACTATCATTTATATGGT ATTTTTACATTTATTTATTGCCAAATTCTTGATAGTAAGTAGCTAGAGAG AACTTTATGAATCATTCAAACTAAGAACTTGGTGTTGCAAATAGCCAACA TGTTTTATTATACCATTCTATGGGATACTGATTGATGCCAAATTCTACAT TATTTTGTGATAGGCAAGTTTCCTAAAATTTTCTGCTACTTTTAGCTTCT ACATATTTTTCACCACAAAATATTGACATTCTTGAACTAAAAATTGCAGT TTATTCTGGTTTATAAACAAAAACCATAGCTGTGTTTAATATGAATAAAT GTTGTTTAAGCAACAGGAGTATATCTTCTACCAGTAAGCATTAGTCGTTT CAAAAAACCAATAAGCATAGTGGCATAGTGCCACCACTTTGGTCTGTTGA AGAGTCCCTTTGTAAGCATTGCATGGCATCCTCACATTGCTTATAGTTTC CCTAACTGTATTATTTAGATCAAATGCATATTAAATGCCAGTTTCAGTTA CATCACATGCATTTGTTCGTAACTGTTGAAGTCCTTGAAGTTATAAAGGG ATAAAATATTTGCCTAGGGACTGGAGAAACTATTATAAGATTAAAAATCC ACACTATTGTTTATCTAATTTCCAAGCTACCGGATATTATCAATTTGAGA ACCAATGGTAGTTGGTAAGAATGACAATCTGAACAATGAGACTTAGCTTA AGGGATTATGGTGCTAGAAAAGAATTAGATTACCGCAGAAACTGTATTTT CTTACCCAATAGCATATAGAACAAGAGTTCTTCAGCTGTTGATGTATGGA AAAGAAACACCCCCCTCCTTTTTCGAGAGGGCTGCATTCCAATCCTGCAG GTTATCTAAGTAAGGGGTTCTTGAACTATAAACATATAAAGAATGTGGCA AGTAGCGCTCATAGTTTTTTTAAGTAATTTTCATTACCGAGAGTTTATTA GAGTATGTATAAATACTTGTGTAATAAATACAATATAAGCTCACCAATGC AAATATTCCCGGTATTCTGGTTTGCTTGGACTTGGCGCATCAGGATCCAC CATGACCTTATAAGAGGTAAGTTCTTTATCTTAGCATTTAAATTTTTATA TAAAGGGGAACTTGCATGCCTAATAGAAGAATTATGACACAACTCTACAA AGCAAAAGAAAAGAGGAAAAAGAGAACACGAGAGGGGAGGGGGTCATTTA TGTACTTTTCCATAGTAGGTTCAGACTGGTGATTGGATGTTGAATATTCC ACAGACATTCTAATTAACCTGTCTGTGTAGCTCTGTCTTTTTGGTCGAGT AGAGGATGTTCATAGCAGCAACTATGCAACTTTAATACTAGAGAGCTTCA AAAACTCCACCTTTAAGCAAAGCAGATGGCTCAGGGTCTCATCCCAGCCA ATATTCTTATACTGTACTGTACAAACAAGATAGGGTGCGGGTGCATATGC TAAAAATCATGTACCATCGATGTACTTGATCATTTCCAACAGGCTATTAG GTGATCCTCTTTGCATAAGCAACACATACTATCTGGGGTGGTGGTCTAAT TTTTTCTCACAGAAATATTCTGTATAACCTATATCTATGGTGTTTTTGTT ATAAAATATCACCTCTGGATTTCTACAATAACCTATATTTGTGCTTAAGT TTCTTTAAAATGTGGGTTCCTTTTGAGTAAGGAACTTATATAAAACAGTA CGTGTTATACAAGTGTTCCTGAGAATTTATCTGATTATATTCAAGGCATT ACCTCTTCGTACATGAGAGTTATCTCTTAGTTGAAGCTGTTTTTCCAATG AAAGGTTATGTTTGACACCTAACACAATGCCTGGAAAACCTTGTACACTA TACATATCATGATCCTACAATTTATTGCATCACTTACAAGTGTGTAGAGC TTCGTCCGGTCATGACCTTCAATCTCAACCTGTGGTGCATTGAGCACAGC AGATGCTCGTAACCCAGTGCCATTTGTAATCTCCTTCTCACCATAATTAA TCCTCATCGTAGCTGACTTTACGAAAGGATCCAACACATCACCAATTACC TGGCTCAATGCCAAAGGATCCCTTCCCCGCGACATAACTCAGTATTATTA CTGAACTGAAAACTGTATGAGAGGATTTTACTGACGCCTTGGTCGTGGCG ACTAAGGGTGGGAAATATTCAATGTGGTGGAAGGGCTAGCCAGAAAATTT CTGTGTGGAAGAGCAGTGTAGTTCGACGTAGATTTATATTAGGAGCGAGG CATCCACCTTTATGTTCTCAACATTCTATTGTGCACTATGAGCAAATGGA ATCTAACTTTTCATATCATATTGTTTTCCCTATAGTTGCTTCTCTATTGC ATGGAAATATTGAGCGCCTATCAATCTCCAGATGGCCTAGTTGTGGCTGT ATGATCTTTGTGAATGGTTTCTGTGGTCAGTTGTTCCTGCATATATTCTC CAAAGATCTGGAGGTATGCTTAAAGCTCCAAGAATTAGCCTCCCCTGCAT GGCGCCTTGCCTGGGCTAGGACAAAGGTTTGCCGCTAGTCATTTCATGTT CAACGATACTTCTGTGAGTGGTGAGCACTCAGCTGTAGAAAGAATATTTT GATCAACATCAGAATGCAAGAGTATGAAACCTGGGGAGGTAGAAACAGGT CATTAGCAATCTTCTTTCATCTTTTATGCTTTTCCTTGACGGCAATGGGA GTATCTAGTACTTCGCCCTTCACCCTCGATGGGATAACTATTCGCAGTCG CAGGACCTGTCCTACAATACCCCTGTTTATGTGTTTTTATCCCTTGTATG CTAGCTGAGTGAGTCACCTACTAAGGCTTCTTATGGACAAAACTGTCAGA CAGGTTTCATGAGAGACCAGATAGATGTTCAAAACTTCAAATATTTGCAA TTAAACTAGCATGTTGTGGCTATCCTTGTGTTCTTGAGAAGAGCAGGTTG TCTTATTGTGATTCATTTTCCGTAAGCTTGGGCCTCCTTTGACTTTGACA TCTTGTAACCAGATTAGGCAAGCTAACAGTTCCTATATTGGGACATCATG AGTACCTGCTTGACTTTGTGAGGCTGGTTAGTTCTTCTATGCTGTATTGT TGGTTATCTACTAGCTAGAGAATGTAGCAACTGACAAGTCTTGATCAGGA GGACAAGGTGGTCAATAGTGGCAACTGTTATGATTGATACTTGGAAGCTT TTGCTTGGGAGAACTGGTTCTTCACTCATCTCCAGCTTTTCTCATTATGT TTTAACCAATTGCAGAATCTAATATAATGGGTTTGGGAAACCTGTATTGA CCACTTCCATTGCTCAATTATCTCAATGAAGCTTATGGCTTCAGCTGCTT GATAAATTAAGACGTTTTCTGGTGACCACGAGTCTATAATGCGATTCTTG TACAAGAATTTGACAAAATGCATCCTTTTTGAGCTCAGACAAGGAAAAAA TGTTAATGTGCATATGTTTGGGAGAAAAATAATTCCTTAACTACATCATA ACATCTGCTAACTACACTTTTGGAGTGTACGACAAATTACTCTGTAGATA CTTCTTTCAGAGGTGGTAATCACACAGGACTTCACCACAGTTTAATATTT TATCCACCAGTATATTTTCTTACCATGGTGATGTTAATCTGTGATATTCC TACATGGTTTAATATATGTAAGATAATAACTGTTTAATGTATGTTATACC ATCATCATGTAGTCATGTTTAGTTACTTCTTTCCTTGTGCACAGAATACA CAGCTGTACAGAATAATTCTTACCCAAACAGGAACAGGATGAGCATCTCC TGATTCAAGCTGAGATAGGTGCTATCATTCTACGGAGGAGCTTACATCCA AACTGTACCAGTACCTGCAAGAATACCACATGCAGCTGTCTCGGCTCTCC ACATAAACATCAATATCAGCTAATAAGGAGCACCATGAAGAATCCATGCA GATTTTGTATTTTCAGCTGGTAATAAAAGGTGAGGACCACTGGCTGCTAC ATTTTGTATCCTTTACTTTCGCATCAACTTCAGAATAAGTGCTCCGTACT GCGGTAAGCCATTTCTTTCGCCTTTTCTGGTCAGGACGCATGCGAGACAA TATTAGACCTACTGGTATACGGGAGACACTTTGCAGAAAACAAGTTAAGT CTCCAAAATTGCTACCCAATCCCTTCATGCAAATGGGGCCTTAAGGAAAT CATGTGGTAAAGGGTACCATAAGTCTTCCAGGAAAACATAATTGCATGTA GTACCACGATCTCGAGGAAAAACAATTGAGGGAAACAGGCTAAGAAAAGG ACACTCAACCTAGTATTTTTCTTTGTCAATATTTAAATGGTGCAAATTAT TGTTTTCCAAAGAGACTTGTCAACAAAGGAGCGGGGCCACGGCTACCTTT GGCATCAAGGAAGCTCTTCCCGTGGTACGAACTGTTTTTGACATTTAGAT AAGTACTTTTGCACGTGTATTGGTACTGATTTTTGGTGGGGAGATGCTAA TATACGGTGAGATCACAACCTACTTTTTTGTATGCATAGGGAATATACTC AACATGTCACAATCTTGTTGGAATAAAGGTACAGTCTTGCAGATCAGATG GGCATCTCTTGCTAGCAGAAAGGCATAGAAGATCAACTTCGAATTGCTGA AAGTTCTTGCATGACAACTGCAGGGGAAAAGGCAACAAGGAACTCCCCTG CACTGCAAACTACCTACACCTGACTTCTGTGGATGAATTCTCGCCATGCA TGCCACATTGCTAACGCTCTCTGCTGCCTATGGTCCCTCTCGATTGTTCG CGGACCAGCTGTAAACAGCGCTAAAGTTCATCTAATCCAGGTCAGAGCTG AATCTATTCTAATGGGGTGCAATCTTATCATTTGGCATTCTGCATCTCAA AATGCCACATGTGGCTTTACGGCATATATACTCTTTCCCTAGCTATTTGT CATGACGGGCTACAGTGCGGGCATTACTGGATACAGTAGCAGCAGGGGGG GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCAGGAACAGAGTAAATCGGCGCCGCAGTT GGCTGCTTGCTGATGAGCTGGCCCAGATACTGGATCGGCGTGGATTGCAT TCTGTTGTGTACTAATGGGAGTGAGCAGTGGGCCCAACAGTGGCTGAATT AGACTGATGTAAAAGCTACACCGTCCCTCAGTCTTTCTCAAGTAATGAAA AGCGACGGCTGTTCTCTCCAATTGATCATCTCCTTTCCTGCTTTCTTTTC CCCTTTTTCTGTGCTGTTGTGGTCTTGCCATGACAGCGATCATATCCTGA GCCGACGGGGACATAATATTGTTCTTGCAAGTTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.