Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE008878

[Submit comment/correction]

Sequence	AE008878
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE008878
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGGCCGCTGAATTTGGGAGCTCTAGAGGAGCGCGGTCACTATCCGTTAAA GGAAAAATATGCCCCTAGACGAACGGGCGCCGTAGAGAGCAAATGTCCTG CCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCGCTACGCACCGTAGCCCGTAGGTGG CTGCGGATCGGATCGGCCGCCGTGGCCAAGGCCAAGACCACGGCGACACG CGCCCAACGGAATTCGGATTCCCCGCCTAGGTAGGTGGCCTCTCAGACTC AACTCTGAAATCAAAATCGAATAACATGGACTTCCTCTAGTACTACTACC TAGTTCGTCCGTTTCACAAACAGTGCCGTCTAGCTGTTCGATGTTATTCC TCCCTCGGACTAGCTTGCCTTTTTCCCTTTTCCAGACGATGGATGGGATG GACGGATGCAAGGCTCAGTGCGAGCTTGTCACCATCGCGAGCCCTCGCCC TCGGTTTCTACCTCTGGTATATATGAACTGAGCTTTTGTGGCTGATAATA TTTGTGTGCCATGCATCTCTCTGCATTGACATTTTACATCAGGCTGTTTC TGTCTCAACTTCTTCTTCACAAGAAAAAAAAAGAAAGCGGTAGATTATTA TGCTTGGATTCCCCCTATTCCCTAAGCTTCCAGCTAGTATGCTGCTGATT CAGATGAGCAGCAAATAGACGCAAAAAGAATGGCGCCAGGAGACACGAGA AATTCTCACGGAATCTCGTGCCACATTTCTTAATCGGATCATGTTGGCGG CCTAGCTGCTATACTTCCTGTGCCACTGCTTCACGCTGCAACAAGGTATA GCATGTCGTGTCGGAAACTTTGTCTTTTTAGGCACAGGAAGCCATACCAC AAACTTAACTAGTAAATCAGATAAAATTTCCTTTCCCTTTGCTTTCCAAT ATATTTAGTGCACCCATGCAGAGTTCCTTCCCAGTGAACAAAAGAAAAGA GAACCTATATATTATTTCATCCATATCATCGTATTCTGTCTGCTCCTTTT TGCTAATCCGGTGCACTAAGACAAAGGATGTCCTGCAAGAGGAAATGAAA CTTGTATTGGCAGCTTTCCACAGCTTAAACTTGTGGAATGCTGCCAGAAT ATGGCAGCAAAGGAGAACATAGAGTGGCTGCAAGCCTCAACCCATGGATA GAATAAAACTTCGTTATGTCTACTCATGTGAATGCTTCCTTTAGAGTTAA AAGTATTATATTTGTAGCTTAGATCCCATATGCAAGAACATTTGTCAAAC AACTACTTCTTTGCCATATTATTCGAGCTTCATCACAGGATAAGTTCTGC ACTAAAATTGGCTTTAAATACCTTTTTTTTCCTTCACACAAACGCTTTCA AAAGCCTCAGAGTGTAAACACTGATTCAAAAGTACGAATTGTATACCAAA TAAAAAACACAAAATTAAGTAGTAAAAGACAGTACGGAACATGTTACTCA ATATTTTTCAGGTGAGGTCGTGGCAACCGGCAGGAGGATTTGGAGTCGTT AGATGGTATTATTCTTTCTAGCCACGATGGTGGCCTCAAATGTCTCCCTT TAATTTTGAATAATTCCTTCTTGCATTTTCGTCGCTGACTTCTGTTAATT AGGACTTGATATGGACTCAATTGATACAGTAATTCCTTATTCTTTACCCG TTTTATTCAGTGGGAGATGATGAATCAGGGGACCGTACCTAACAACAGTC GTGGCTTGTGAGAAAAAAAATCATGTATTCCTGTCAGAAATATTCCTGGT GAGAAATGCATGAAATCATGCTGCAGCATGAGCATGTAGTGTGTTACATA TTTCAGATACACAAAAGAAGCTACGTAGAACTGTGCAAAAATTTTCTTCG GAAATCATGAATTCCAAACAGCCTTAGAGAGGAAGTCTTCACAACCTTGG CATCAGCGTAGCTTTACTTTAAAGCTGACATGGAGTATGTCATGTGAAAT AGTTATGTTTGTGTTCCAGACAGCCTTAGAGATGAAACCTTCACATCCCC CTGTTTACTTTGGAATCAGCAAAGCTCTACTTTAAACTCACATGGTTCTA AATCTTGTCAAAATATGTCGTATGTGAAATAATAATGTTTGCTAAGACAC CTAGCATACCGTATCCACGCCAACTAGGTTGTTCGAGAAAAACATAAACT AAGTTTGAAATGCATATAGGCATTCAATTCAGTTATGCAATATTTGTGAA AATTCCTTTTGCTGTTCCTAGTAGCAGAAAAAATGTGTAAACTTTTCAGT AAAGACAACTGTTGACCTTTCACTTGTGCAGCCCACTTTTCAGAATATAT TCTTTTAACAGAATTTTTTCAATGCTTCACGTTTTCTTAGGATGAGCATA TGAAATAGAAGAAATATATTCTAAAATCAGGAATATGCAGGCTCCAAAGC CCTATGGCACAACACAATCATGGCCTATAATCTCCAACAAATAGTAAAAA TTAGGTAGTTCATAACCTTATATTTAAAAAAACAGAACTTCATAGCCCCT ATGCAGCCTCTGTTCTCTCAAGCAAGGTAGGGACAAAAAACACATTTAGA CCACATAATTTAGCCCCTATGTAGCCTCTATTCTCTCAAGCAAGGTAGGG ACAAAAAATACATTTAGCTCACATAATTTAGCCTGAGCTGTCCCCCCATA TGGTTAACCTCAGTGGATAGAAAACTGCAGAGCTAGTGCATATGATTCCT TCTGCATGTAGTGCACTCACGCAAGAAGAAAAATTAGGTGAAAATCCCCT GCATTATTCTGCTATCACAAACCCTAAGGGGTTATTTTAGATTTGACTTA GGACTTTGTTTAATCCCATTTAAATTTGGATCGTCGAGAGGGGATCAAAG CCTACCACTATTCTGAAATCCGAAAGCTTCCTTGCACCATTTGTAAAAGT GGAATCACTTTCTTGCTAGCAGGATCTAAGAATAGCAGAGTTTGTTTTTG AAAAGCTGACCTCAAAGGGGGGAAAAGGATTGCTGCTGAGGAATATTTGG GCCGATCGGTGATGTAAACCTGAAAGGATTTATAATGGATATGTAATTAC CATGGAGTTAAAGCAGCAGAAGTGCGCGGAAATTCTTATAGGCAGATCCT TGTAGTTCCTCTCAGTGCACAATTTTGCAGGTACCTGTTACTGTCAGTTC TCACTGACCTGTACTACATGCTTGTGTTCAATAGTTCTCTTTGCTGTACT GCAGTATCAAAGCCTTCATGAACAGTGCCTCCATGTTTTTTGATGCGATT GTACCAATTTTGTGTGATATCTGCCTGTGTCACTGCCTACACCTCAGAGA TATTTCTGGAATCTTCCTTGCTGCAGTTTGCAGAAATTTGCACTGTATCT CCTAGCGAATGAAACGGTACCACTTGCCATATCCAGACCTCTTGGGTTTC AGTTCCGCGTCGAACTGCACCTTGAGCTATATCGAGAATATGGATAATTT ACGTTCCATTCTGTATTTACATCTATTGCTGGTTTTGAGAATTACAATAG TACGAAAAAAGCCTCCTGCGTCAAAGCTGCTGTGTGCTTTGCCTGTTTGT CCTAAATATAGGATTTTGTCCAGAAGGATCTTTTGATGCTCATTCCTCGT CACTGTGATCTCTATTTTGTTCAGTTCCATGCTGAATCCCCCCTGAAATG CCAGTGAAAAAACTTCATTTCAGAGCTTGAGTGCAGTGCTGAACCACGCC TTAAATTCCACTCTAAATACTTTATTTGTAGAATTCCAATTTACTGTTTA ACTGCACCTTAAGCTCTAATGATATTTTCTCTAATGGGTTTTTAGTTTTC GATACAGTAGCTAACCGTGCCTTAGATTACTGCAAATGCAGATTTTTTCA GTTTCACTTCAAGTTCAGTTTCAAAACACGTCTGATATTTTACTGCAAAT CCAGATATTTCCTGCGAGTTACAGTTCAGTATTGAACTGTTTCTCCTCAG GACGCGGAGTTTCAAGATTGAGGAAGTCACTAGAGACACTTCGCTACCAA CGTGAATGTCAATTTGACTGAAAGGACAATCCGTGGTTTTATTCCCGGTG GTTTAGGGTTACAACCACCCTGCCAACAATTGGTTCTCACGGTATTTCTC TGTGGAGTCTTCGCATGCTGAAAATACTACTCCTTTCGTTCCAAATTAAT TGAAGTTTTAGAATAGTCCCGGGTGCAACTACTTTAAGCTTGACCAAGTT TATTGAAATATATCAACATCTACCACACCTGTTTAGTTTTACTAGATTGA TAAAGTATATTTCCCTAGTATATAAACTGATGTTGTACATATTACCGTAT TTTTCTGTACGTCCAGTTAAACTTACAGAAGTTTGATTTAAGACAAATCT AGAATTTCAAGCAATTTGGAATGTATGGAGCCATGGAGTAATATTTACTC TCGGAATTTTAGTTCCATTTTGAAGTGGCACTAGTGAAAATATCCATAAC TCTGTCTCTGTGCATTTAAATCTATTGATACTGATTCCGGTGTTACAGTA ATGCGAAAAAACGACAAACCTCTTGCAAGAATAGGTGCCATAAGTTTTGC CTTTTCCTGCTAAATATGGGGGTTTTGCCTAGATGAACCTTCCTTTAGCA CGGAGACAGTGAGACATCATTGTCCTTATTTTATTTTTCTTTTCTCCTAA GAAAGAAAAGAAACGGGGTTATGCTTATTCCTCGTCATTGCGACTTGGGT TATATATATATATATATTCATATACTATTTTGGAATTGTGATGCGGAATT AGTGGGCATTTTAACACCTTATCATGATAACGCGGATGAAAAAAATGGTT AGGAATTGGCTAAAAGGGTCCTAAGTAAATTTTTTATACTTGGGTTCCCT CTCCACTCCCAAGGATGCATATATTCTCCTGTGAGCAGGGCCAGAAGGAG GGCCCTATGATTCATCCTAAGTTTAGTTAGGCAACATAATTTTGAGCTTG ATTAGTACTAGTATGCCTATCTGTTATGGAGCAGTTACGTCGAAGGCCAC ATACCTACCTATCTACCATAGTTCGGTTTAACCCAGCTCCAACGTTTTAC TCCCTCCCATGCCATGCCGTTGCGCGCGTGACCCTTGGCCAGCACACCTC GAATCCCCTCGATCGCCCCTTTTCCCTCCCGCGCAGGCCGGATTCCCTGG ACGTACATACGCACAGGAGGAGTACAGCTAGATCGCAGCGATCGAGCGAC GCACGGCGCACGCAGAGCCGCCAGCGCACCCACTGACACGGACACGCGGG TCAGTTGCCGGACTGACCGCGAGCCTGCCGTTCATACATAGTAGGAGTAG TATATATTCCCACACCGCCGCGCGCTCACCCTATAAATACAGCTCAGTCG GGCCTGTGCACTTCGTACTTCCACAAGCATCAAGCTAGCCATAGCCATAG CCAGCCCCAGCTACCACCACCTGATCGTACTACGTACGTGCTGTTTGTCG CCATGAGCTCCTCCGGTACGTACTAGCTAGGTCCGCTTGAGCTTCTTCAT TCTCTTCCACACGCTGATTATATTGGACGCCCCGATGATCTCACTGCTGC TTTACTAATGCTGGCTTGCAGGCTCCCGCGGCGTGAGGCGAGAGTATGGC CGGACGTACGTGGTGAGGCCCAAGGGGAGGCACCAGGCCACCATTGTGTG GCTCCATGGCCTCGGAGACAATGGCGCCAGGTAACTAACCATGCTTACAC TCTGCGCATGTGTTCTTACTACCAAGATTATTGGTTTTTGTTTAACCATG CAACATGAACAATATATTATATATGAGGTCAAAATTGCAAGTGCTCTCTG AACTGCAAACCAACCCGCCAGTGCTCCCCCTAGCTGTAGATAGATATAGA TATCAGGCAGCACAAAGCTAGAACCAGCAGCAGTTGCTGTCTGAATGCGA CCCAGCCATGGCGTCAAGGAACCTAGCTAGCTAGCTAGCAGGTATGGACG GGATGGATCGAGGAGCTACTAGCAGGAGCTATAGGCCACCTCCAGACGTC GGTTCACATCGACAGATCGCTTTATTCTCCCACACACACACACACACACA CACACACAGACCTCCCTTTGCTAGAAATGAGTGATAAGAGCTCGCCATTT CGGTCCATGCATATATTCCTAGTATTGCTTTGCTCCGAACCTCATCAGAT ATCTCCTCACTCCGTCTCCTAACCTCACGCGCCTTTCTATATTTCTTTCT TTCGCTAAGTAACTACTATAACTAAAAACAACGATGGGTGGGAACCACGA AACTGTACTACTACACAGAAAAGGTAAACTACTCGCTGGACGACGATCGA ATGTCAAGCTAGAGATAACATCACTGGCCAGTTTAATATCATCTCTGCTC ACCTGAGGTACCTTATGTCTGCCACCCACAAGAGAATGCATGGAAAAATA CTTCAGTTTTTCTTTAATATACACACATGCCATTTCTTGGTCTTGCCCTC ATTCATTCATACTAGTGCAAAGCAAGGAATATGTTTGGCATGATTTTTTT CCTTTCCTTTCTATCTTTCTTGAGTTCATTATACATACATGTGTCAACTG TCAAGTGTGTCAGCTGCAAAAATGTTCCGTTTCTCCCACTTGTTTGCTTT TCCAGATCACTAGTGACTCGACTGCATGTTTCGGTCCAGACACACACACC ATGCTCGTACGTGTAGCCGCAGTGGTCTTGGTCAATCCTGCCAGTATTTA TCATATGCCAACTAGCAGCTAGTAGTACACAGTATTCCTTCCTCACTCTC CACTCTCCCTCTCTTATTCCCCAATCCTTGCTTTTCTAATGAACACGCGC ACGCGTCTCTCGTCGAATATATATGCTCATGTCATGTTACAATCGATGCT TTCATGAATAGGAGCTACCACTAAAATATCTATTGTACACAAGTTGCCGA CTATAGCTGCGATATTTATTATTTCAGGAGACACCACTGACCTAATATGT TTTCCTCCCATGTTTTTTTGTCTTGTGCAGCTGGTCCCAGCTCCTGGATA ATCTCCCACTGCCGAATGTAAGTTGAACTAATCATGCAGACATCTACCAT CCTATTCCTAATTTCCTATTCCTCTGACCACCGTAGTGTATGTATAGCTT CATCAGATTAATGTATGAAACTTATCTGAATCTGAATCACTTTGTTCTGT CGGTTAAGGATAAGAAGAAGAAACGTTTTTTGAAGCTTACCTATGTTCAG AATAATTATCGAAGCTGAATGCATCTCTGTGCAGATCAAATGGATTTGCC CTACTGCCCCAACACGGCCTGTCGCGGCTTTCGGTGGATTCCCCTGCACT GCATGTGGGTTTCTCTGAAATTACATATGGCTTGGCTGCACAGCCTGCTG CAGCTTTGCTTTTCCTCAAATTACAAACTGATCATCATTTTTCTACTGAA ATCAAACAGGGTTCGATGTGGAGGACACCTCAGTGGACGGCCGTGATGAC ATCGAAGGGCTGGATGCTTCAGCTGCGCACGTGGCAAACCTGCTGTCCTC CGAGCCATCTGATGGTACTTAACTTTTTGAATATGCTTGATGATCGGTTG ACTGAAAACGGTAATTACTAATTCCATTGAAATTGTAAATTTGCATTCTT CAGTGAGGCTTGGGATTGGCGGTTTCAGCATGGGTGCCGCCGCTGCCCTC CACTCTGCCGCATGCTATGCTCATGGAAGGTTCACCAATGGTGCCGCGTA CCCGATTACCCTTAGCGCCGTTATTGGGTTAAGCGGATGGCTTCCCTGCT CAAGGTCTGATTCTTTGATATGTTTGTAAGAATAAATTGTGATATTGTTG ATGAGTTTGTAGCTCATACGTGATGTTCTTGATGTCTTGTTGTCCAGGAC CCTAAGGACCAAGATGGAGAGCTCACAGATTGCTCTTAGGAGAGCTGCTG CCTTGCCAATCCTGCTCAGCCATGGAAGAGGTTAGCATTTCTATTTGTTT TGTACTTCATGTGTTAAATACGTTGAGTTTTTTTTTTCAATTTTTCCAAG TAGTACTAAAAATAGTTTGTTTCTTCGTGTTGCTGCAGCTGACGAGGTCG TCACATACCGAAATGCTGAGAGGTCGGCCGAGTTTCTGCGAACCTCAGGC TTCTTATATGTGAATCTCAAAACCTACAACGGGTACTACAGATGAATATG CACAAGATCACTTCCTGTCATATTTTTCTTCCAAAATTTAGTACTGACAC CATCTCATTTATGCAGACTGGGCCATTATACTATTCCTGAAGAAATGGAT GATGTCGCCAAGTGGCTCAGCGCAGGGCTTGGACTTGATCGATCCCGCGG CTAAGTTCCAAGATACACACGCGGTATGGTGGCGTTGGTGGTGACATATA TGAGACAAAGTATTGACAATATAGAGGAGAAGGTTGATGATAGGTTAACT AGATAAAAATCGTTTTGAGTTAACATCTGCCATGAGTTGATGATAGCTTG TAACACACTATGTGCTTTAATTCCTCACTACTGGATTTCATGTTACAGTT GTAGTTTACTAGTAAGAGTTGTACTACCTTGTTACTACTAAAGAGGATGC CTGTAATGTAGTATTGTATTGCCGTGGTTGACTATACAAGCTAGTAATTA CTGATGATATTGAGTTCTACTGTATTAATCACTAGTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.