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GrainGenes Sequence Report: AE018821

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Sequence
AE018821
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE018821
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCTCCAGCGTCTTGCGCGCTGCCCCGTTCTCCTTCGCGCACACGGACCTG
CACACGGTGCCACGCCGGTGTCCGGGACCTCCCCCGACCCTCGGGCGGCC
GCCCTCCCCGACTTCCTATACCTCTCCTGTGTTTTTCCCCGCAAGCTAAT
GCCGCTCCGAGCTCCGCAGTCGCCTCGGCTTCCAGATCGTTGCAAAGCAT
GCAGGCCTCTCCGGCCGTGCCGCCGGCGGGACAATCTCTTTCCCATCACC
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CCAAAAATATACTTATCTCAGAAATTTTGGACTTAGACCAAATTCAAATT
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TCATCTGAGCATCCAACAGTATGTTGCCTGCTTTGATATCTCTATGGATC
ATCATCAATCTGGAATCTTGGTGGAGATAAAGTAGGCCTCTGGCTATACC
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GCAACTTGGAAATCAGAACTGTTTCATTTTTGAACTCCACTTCCCCTTGG
GCAGAACTTGCACAGAGCCTCTTCACGGCAATTCTGGAACCATCTTCCAA
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TTAGTAATCCACTTATAAGTAGAGAACATTCTTGCCTTATAAACATAGCC
AAACCCTCCTTGGCCAACAATGTTGGATTCAGAGAAATTATTTGTCGCAG
CAGCAATTTCCCTGAAGCTCAAAATTGGAAATTCGGTGTTCCTATTAGCA
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CTTGGGGCTAGAGAGGACATAAAAATTAGCATAAAACAATTACCTACCCC
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GACATAACTAGTAACAGAATTCGTTGGGTGTTGATCTTTCTCTCGATACC
TGCACAAATTTTAATTCAAGGGGAGTCAACAATGTTTATCATCAATCACC
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AGAGGTTCTCCCCTCCTTGGGTGCAGTTCTCCATGTCAATCAAATCACCC
ATCCATACCAGGCACCTTGTGGCATCTCCATTGATATCCATGTTGCTCAT
GCTGGAGTAAGCATACGCCACACATGAGCAGTTGCTCCTGCATTCCTCCT
TGCACTCGTCAAAGCTTCTGCGTCGGACATGGAGGAACTTGTCAGGGACC
TTCATGCCTGGAATGGTCAAGAAACCATCTCCATGTGCTGTACACCTCAG
CAACTCCTTCCGGCGGCATCCCTGGGGGGTGATCCAGCCTTTATCATCTC
TCGGCTCGAAACCGTCAAGGCACTTGCAAACTGGGACAGTTTCTGCATTG
TCGCAGTAACCATAGGGACCACAGTGGCCGTACATACTGCACTCATTTTC
ATGCTCTATGTAGAGGGCTTTCCATACTGACATGTTGCTTTCCCAGCCTA
GTATACTTACCTTGCCCGAGTAGTCAATCTCCATCCTGACTAGCACAAGG
GAGGAGCCAGTCAGCATGCCAAAGGACATGTACAGCTCGTTGCCGGCATG
ATGCAGTGCCATGTACATGGAAGACTGCTTGAATCCGTCCATGTCGTAAT
TTAGACGAAGGATGGAGCTTGTCCACACCGGGCTTCGCCAGTGCGGCGTT
GAACCATGCCAGACGAAGCGCTGCAGGAGGTTGTCGGGGTCCGCACCATA
GGAGAACCCACCGGGAGATGGGTCCTGTTGGCCTTTCCAAGAAACGAGGT
TCTGCAGTGGGTGCATCTTGTGGCTGAGCCTAAGGTTCATGCCGGGAAGG
AGAGTGTTCGTGGGGTGGTCGAAGCTCTGCCATAGCACAACAGAGCTAGC
AGCAGCAGCAGCAGCCAATGACCGGAGGACGAAGTTTCCGGCGTTATCCA
GCGTGGCTTCTGCCGAGATGGAGGAATTGACGACGCTGATGCTGTTGTTC
GATGTCCAAAGAACACGACCGTTGCTGTCAGACAAAACTAGGTCGGATCC
GCTGGTCACTGCAAGATTTGCAGAGGTAAGATTCGTGATTGGTGCAGCAC
GGTTGCAGACCCATACCACGGTGAACTCTGGGATGCTGTTGTACCATATG
CCGACATAGGAATGGTTTTTGGTGGAGTTTGAAGATGGGGAGAAGAAGCC
CAGCGCGAATACTCCATCTTCGGAGACAAGAATGCTACCGGGGAAGAGCG
GCTTGCCAGGGACAAGGCTGTGGTCAGATGCACAGAGAGGCACTGGCCAA
GAAAGAAACAGAAGAATAGCGTATACGGGAAGTGAATACATTGGCATTAT
TGGCCTACTGCTTGATTGGAGGGTCATGGGAGTGGCGGGGAAATATATAG
AAGCAACGAGAGCGAGAGTCTGCCTTGGATATTTGTGCTCTCTAGAGCTA
TTCAAAATTAGTGAGCTTTCCAGTACCATATCAGTCACCCTGGCCTCTTT
CTTCTCTATCAGACCACGCGTAAGTGAGATTTATGTGCTGATTAATCTCA
ATCGTTGAAACACCACGAGTAAAAATCTCATGGTTTTTCTTCTGTCGTCT
TAAGGCTCACGGAGCCTATGCTGCACCGAATCAAGCCTTTTCCCCGTTTC
CTATTCGTGTATAACAGACTACTCTGCCTTTCTGTTTCTATGGGTCCAGG
ACCCCGTTTCCTATTCGTGTATAATAGATTACTCTGCCTCTTTCCGTTTC
TCAGTGTCCAGGACCCCTTTCAATTGATCGTCGATTCTGCAAATCTTACT
TAACTGCAACAACGGCATCAGGCTCTAGGACGTGACTCATAGCAAATCGG
TTGCTATGCGTGTCATCTGTGTCACACACTACTCAGCACGTGATAAGCTA
TTTTCAAAACCGTTTAAGCAAGCATATCATTACTCTTTCCGCTTAACAAG
TGCACAAGAAAGATTGTCAGGAAATAATAGGAGTCCATCAATGAAGCTAT
GCTAGATTCTGGAGGAGTAGCTTAACTTACCTTTTACTGTTGATACGAAA
TATATATGTTCCTCTGTCTTCTTTTGTTTCATATATATTTCCCTATTGGC
AGAATTTGTCAATCTTAGTTTTTCGGTGTAGATCAAATATCATGTTAATT
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TTCTTCCACATAGCATGCACTCTCATGAACATACAAATGTGAGCACCGGC
ATTTGAATTTACCTAAAGGCAGGGCCTGGCAGAGACAGTGCCTCTCAAAC
AAATTAAGGTTTAATTAACCCTACGTCTTAATTTGGGCACCTCACTGCGA
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TCTAGCTTAGCTTCTGGAGATAACTAACCAACTGCAGCTATTTCTAGCCC
CAGACGTCCTTGGTATGGAGTTTGCTTACTTTCCGAGGAACGACATGGAG
TTTGCATCCTAGCAGAAACAGATAGTACTCCCTCCAGGTCAGTTTACTAG
ACACAGTACAAAAATCATACAGTTTCAAAACTACTGCAACCTAAGGCGTC
TTTGCATTAATTCATACGATCAATTAGGTCGGTGACTCTCCTCTTTACTC
TCACATGAGGTGTGAACAGGAGTTGCATGCATGTGTGAACCAAAATATGT
GGTGTGAAAGGGAACTTATTAATTATGAGACCCAATCAGCTCCTTCGGGA
GAAAGTAATTATGGCATAGTTTCTCCTTTTTTTCTCCCAATCATCTATCG
CCTAGGTCGCAGAGAATTGCCATGCGCGCCTAGCAAACCGATCTAGAGGG
AGTAGTAGTTTGCAAGCCAGCATGTATTTTTTTGAAAGAGAATATTTTAT
TGATTCTTTTTTTCGAAGATTTAATTGATTCTTTAGAACCAAGAAGTATT
TTTATACCAATCAGAGGAACATTACATATTCTTCCCAAAGGTCAAGGATG
TGTACACCGATAATTTTTCAATATAAATTTAGGAAAATGACAGGGTTCAA
AGATGCATATCAAGAAAAGAATTACAAAATTAGATACTTCGTGTACTGTA
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ATTCGCATATAATAGACTACTCAGCCTCTTTCTGTTTCTCTGTGTCCAGG
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CTGCAAATCTTACTTAACTGCAACAACGGCATCAGGCTCTAGGATGTGAC
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TTCCACTTAACAAGTGCACAAGAAAGATTGTCAGGAAATAATAGGAGTCC
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ATTTCCCTATTGGCAGAATTTGTCAATCTTAGTTTTTCGGTATAGATCAA
ATATCATGTTAATTTGAAGTTCTGTGTCATCTAGATTTAGTATTGCTAAC
CCGCCGGCAGTCTTTTCTTCCACATAGCGTGCACTCTAATGAACATACAA
ATATGAGCACCCGCATTTAATTCACCTAGAGGCAGGGTCGGGCAGAGACA
GTGCCTCTCAGACAAATTAGGGTTTAACCCTACGTCTTAATTTGGGCACC
TCACCGTGAAAACAGTGCACATGAAAGATTGTTACAATACAGGTTAAGAA
TGTGCAGCAACTAGCTTAGCTTCTGGAGATAACTAACCAACTGCAGCTAT
TTCTAGCCCAGACATCCTTGGTGTGGAGTTTGCTTACTTTCCGAGGAACG
GCATGGAGTTTGCATCCTAGCAGAAACAGATAGTAGTAGTTTGCAAGCCG
GCATGAATTTTTTTGAAAGAGAAGATTTTATTGATTCTTTTTTTTCGAAA
ATTTAATTGATTCTTTAGAACCAAGAAGTATTTGTATACCAATCAGAGGA
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CAATATAAATTTAGGAAAATGACAGGGTTCAAAGATGCATATCAAGAAAA
GAATTACAAAATTAGATACTTCGTGTACTGTACAAAACCATCTTCTATAA
GATTTGGTGAACTAAGTGTCAGAGTGTCAGAATTTCATGAACAACCAAGA
GCCAGTATCATGGTTTCGGAGCCTACGCTGCACCGAATCAAGACTTTTCC
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GTGTCCAGGGCACCTTTCAATTGATTGTCGATTCTGCAAATCTTACTTAA
CTGCAACAACGGCATCGGGCTCTAGGACGTGACTCATAGCAAATCTGTTG
CTATGCGTGTCATCTGTGTCACACACTACTCAGCACGTGATAAGCTATTT
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ATTTGTCAATCTTAGTTTTTTGGTATAAATCAAATATCATGTTAATTTGA
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TTCCACATAGCGTGCACTCTAATGAACATACAAATATGAGCACCCGCATT
TAATTCACCTAGAGGCAGGTCGGGCAGAGACTGTGCCTCTCAGTCAAATT
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ACATGAAAGATTGTTACAATACAGGTTAAGAATGTGCAGCAACTAGCTTA
GCTTCTGGAGATAACTAACCAACAACTGCAGCTATTTCTAGCCCCAGACG
TCCTTGGTATGGAGTTTGCTTACTTTCCGAGGAACGGCATGGAGTTTGCA
TCCTAGCAGAAACAGATAGTAGTAGTTTGCAAGCCGGCATGTATTTTTTT
GAAAGAGAAGATTTTATCGATTCTTTTTTTTCCGAAGATTTAATTGATTC
TTTAGAACCAAGTATTTGTATACCAATCAGAGGAACATTACATATTCTTC
CCAAAGGTCAAGGATGTGTATACCGATAATTTTTCAATATAAATTTAGGA
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TACTTCGTGTACTGTACAAAACCATCTTCTATAAGATTTGGTCAACTAAG
GGTACGAGTGTCAGAATTTCATGAACAACCAAGAACCAATATCATGGTTT
CGGAGCCTACGCTGCACCGAACCAAGACTTTTCCCCATTTCCTATTCGCA
TATAATAGACTACTCAGCCTCTTTCTGTTTCTCTGTGTCTAGGACCCCTT
TCAATTGATCATCGATTCTACAAATCTTACTTAACTGCAACAACGGCATC
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GCTTAACTTACCTTTTACTATTGATAGGAAATATATATGTTCCTCTGTCT
TCTTTTGTTTCATATATATATTTCCGTATTGGCAGAATTTGTCAATCTTA
GTTTTTCGGTGTAGATCAAATATCATGTTAATTTGAAATTCTGTGTCATC
TAGATTTAGTATTGCTAACCCGCCGGCAGTCTTTTCTTCCACATAGCGTG
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GCAGGGTCGGGCAGAGCCAGTACCTCTCAGACAAATAGGGTTTAACCCTA
CGTCTTAATTTGGGCACCTCACCATGAAAACAGTGCACATGAAAGATTGT
TACAATACAGGTTAAGAATGTGCAGCAACTAGCTTAGCTTCTGGAGATAA
CTAACCAACTCCAGCTATTTCTAGCCCAGACATCCTTGGAGTGGAGTTTG
CTTACTTTCCGAGGAATGGCATGGACTTTGCATCCTAGCAGAAACAGATA
GTAGTAGTTTGCAAGCTGGCATGAATTTTTTGAAAGAGAAGATTTTATTG
ATTCTTTTTTTTTCTGAACCATGCAGGTAAAGAAAAAAGAGAGGCCAAGA
TGGCCAAAGATTATACTATGGCTTAAGTTCACATCGTTGGGTTGACTGCT
AACCCTCAGTCTCATCCCACTGCTGCGGCTCGGTAGAAAAAGCTCACCAC
CGCTCATACGTGCTCCACGTTCTCCTCCACGGCTCCACCTCCTTATCCAT
CGCCCCCACCCGCACCTCCAATGCCTGGGTCGTGGCGGCCGTCTTCTCTG
GTCCTGCAGAGTAACGAAGTCAGCTCCCCCTTCCCTTCCTTCTCATGTCG
ATCTCGATCTGCGAAGGGAACTCGTCCCCTCCGCAAGCCGCCAAGCACAT
CACATCGGTGCGTATTCCTTGACTTGACCGCGGACGCGGTGGCCCTGGAG
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TTAGCTGACCCCGTACAGTCGTGTTCCAGGGCAATTTGGTGTACCGTAAT
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TTTCTACCTCCTATTTTTTCCAGGGAGTGATCAAAATCTAGAACTGACTT
CTCCCAAAAAATTATTTGCAGTTTCACCGTGCTTTTTGAACTTTTAAGCA
TCGACTTATAAGTCCTTAGTTCTTCTGCATAAGTATCATATCACAACGTG
CAACAACTGTATTATTAAAATTTTAATTCAGGCTGGTAATAGATTGTGAC
TATACTGGGTATACTTAATAGTATGAAAATGCTTCTGCGTGCAGGTGCTG
CACAATGAGGAGATATTGAGCAGCTTAATATGGCTAAAGAAAAGTGGAAA
AGCATTGAAAGCAACGGTTCACCAATAAAGTTAGATTGCTATCGATTCTT
GAAATTGTCTCTCTAACCTTAAACATCATGTTTAACTCATTATAGTTTAA
TTTCTTGTCCACAATAGCAAAAGAAGGATCTTGTAGGGACAGACCAAGGA
CGGTAAGCCAGAATTCTTTTAAATCTACTGCAGATTTTGGTCGGAACATC
TTGGAAAGGGGAATGGAGTAAAATCAAGGGTTAATTGAAGGCATAAATGC
CATTGCAACAATTTTTCCTATATATTGCAGTTAGCCCAGATGTATAAGAC
TATCATGTGGTTAAGAGGGTGCCGAACAATCACTTAACAATCAGAATAAT
GTAGTTTGCCCACAGTTTCCTGTCACATTGAATGTTATGAACTTACTGTA
GCTACCATGCAATGGATGCTTTGGAAGCTTTGTAAGGCAAAAGATAACTC
AAATTAAATAATATATTTTTCTTACCACCTGATTGAGCGTAACATCTTAC
AGAGCACAGGAGGCGAGAACTACCACCAGCTGAAAATTCCATCTAACCAA
CATAAGTCAATGAAGAAGTAAATCAATATCTAGCTCTCATACTTATTAAC
CGTGCTGCAATATTCTAATTAATCCATCTATTTTAGGCCCTCACCTCTAA
AGAGGAAAGTGAAACCAAAATCGCCCCTAGAAAACAAACATAGGAAGACA
GCAGGAGGTACCAAGTCCGTCGAAGCTAATGATTCAGATGCAGTCGGTTC
TCTTGCTCATTCAGGCTCCGACGAAGGTGTGAAGTCCGGTATGGCTACTA
AGCGTTGATTTTATGCTTATCGATAAGATGCATGTCGTTTCATTATAGAT
GAGCTTAGCGTATGACTTCTGTTATCCCAGATGGTCATGAGGAGAAAGAG
GTAGCACTTAGCTGAGAAAGAAACACAAAAAGAGTCTAGAGGATATATGG
AGCTGAAAAAGGAAAAACCTGATGGTAATAGTTTGAGCAACAAGGAGGAA
TAAGACGATGAAACTCTTGTAAGCGACTAAGCATGACCCTCTCTTCAAAA
CTGGACCCAGTTATTTGATTCCCTTCTTTTGTTTTGTGTTGAATCTGCAG
AGTGTCTAGAGAAAAAGCACATCGCTACCAAAGCTTAGGAACTTTGGGAC
GTCAGAGCAGCACATTCCTTGCTTTCTTGGGGAAAAGTGCGAGTCTTTGC
TGACACCGGTATTTACCTATTCATGGAAAAATCTTAGTATTACCAAACAA
CCGTTCAAAATTGATTTAGTAAAGAAGGAGGTGCAACTCTTACAGGATTG
TAATCTTATGTTGTTACACTTGGTTCTCTTGCCAAACTACTGTAATGACC
AACAACCCATGAAGTAGATAAGATTTGCATATATGTGTGAAATTATGGCG
ACAGCCACTAAACAAAATTTTGTATATCACATGTTGCATTTTTCATGTAA
ATTGATCATGCTGAGTAGTTGTTAGAACTATGCTCGCCATGGCTAATTTG
TAATGTTTAACATGCTCTTATGATTTGCTGGGCAAGAAGATGTCTGAAAA
AGGTTCATGTGCTTGTGAGTGATAGAATCTCCTTTTAGGATCACACGTTT
CACTGCTTGTTGTTCCGCTTCGTATCAAAATGTCTATGGTGTCCTACAAA
TGTTTACTTTAGGAAGGCCTCGCTAAAATTCCACCGGACTTGATGAGCAT
AGCGAGGCCATGCCCTATGATGCATAAATTTACTTTGCCCAATGTGACAA
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AATGGTTTGCTGGCATCAGTTAAAAAAACCTTTATGTTGAGATTGTTGAG
AGCTTGAGAAGGCTACAATTTTGCTCTGAACATGTTGTTTTTTCTTGCAG
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GCATCCATTGTAGGTGGTTCTAACATGCTTTGGTTGTTTAATCATTTACT
TTACTTAGAATAGCAGAACCTAATTACTAGAATTTTGTTTCATCAAAAAC
TATCTGCCCTGTATGTTGCGGGGCTGCTATGATAAGTTGTTCCTTTCAAG
TAGACTTCATGTCTTAATATGGTAAGTGATTGCAGCTAATTATAAAGGTA
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TCCCTAAGAAAGGAAAATAGTACTATATATATTGTTAATGTTGAGATCAA
AATCAGAGAAAGAAAAACACCCATGTCCCAGGAAGGACAAAATATTGCCG
ATCTGTTTGACACATCTATGTGTTGGTCGTTCGTATGGTACCCGTGCTTC
TTTCAACTGGCTTATATAGTTATATTCACTTACGCACAATTACTCCTCCA
TCATTTTTTGTCATTTTTTTAAATTATTGCTCGGAGGCTTGCTTTGGTAC
GGTGAAAATGTTGCATTATGTTTCTTTGCAAGTTGGCAAGATTTTTTTTT
GTTCCTAGAGGCATGCTCCTGGTCGAAGCAAGAAATGTATTGCAATACAA
CTTTGTTGGCTGGTTTCCTGCGCCTAGTTAGTATCTAATTAGCTTCTTTT
TTCCTTAATCTGTAACTTTTGTTGCTGCATTCCTGATTAGTTTCTACTCC
TCAAGGTATGCATGCACACAGCTGGTGAAATCCACTCCCATACTCCCGGC
TCACTCCTACCTTAGACGACTGCACAACGATTAAGAGGCAGCGCTGAAGC
ATGGAATCCTTACGCATGTCAGATAAAACTTTCTACGAGTGCACCGCAAG
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AATTCTTTACAACCAAGAAGTATCTTGATACCAATCAGAGGAACATTACA
TATTCTTCCCAAAGGTCAAGGATGTGTACACGGGTAAATTTTTTATATAA
ATTTAGGAAGAAATGACAGAGTTCAAACATGCATATCAAGAGAAGAAATA
CAAAACTAGATACTTCTGTACTGTACTGTACTGTACTAAACCATCTTCTA
TAAGATTTGGTGAATTAAGGGTAGGAGTGTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.