Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE014925

[Submit comment/correction]

Sequence	AE014925
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE014925
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGTTCGCGTACGACGGGGAGCATGATGTGTTGCTGAACGATTGGTGGCA CAAGAGCACCTACGAGCAGGCGGCGGGGCTGGCCTCCGTGCCGCAGTCGC TGCTCATCAACGGGCGCGGCAGGTTCGGCAACTGCTCGGCGCTGGGGGCG CCCGCCTGCAACGCGACGCACCCGGAGTGCTCCACGCCGGTGTTCGCCGT GGTGCCCGGCACCGGCAGGACGTACCGCTTCAGGATCGGCAGCATGACCT CCCTTTCGGCGCTCAACTTCGAAATCGAGGTAGTAACAATTTCACCAACC GTTTTCAAATTTCTTTCAGCTCTTCTTGAGTTTGATTGGTTCGAGTCTGT GGAGCTGACCAGCTATAGCTAGCTAGCTAGCTCAGTAAACGGCGTGACTA AATGACATAGCGGGCCGGCAAAAGCGAATACGTAGGTGGACTGGGTGTGC ATGTTCGATCGCAGGGCGGCATATATCGATCTAGACGATCGAGAGAGATC GATCACGGTCAGCTGTTCACATTGCCCCCGATCATATCGAGGAGGATGTG ATGCTCTCGGTCCCCCATGTTCTAGGTCCTGCTACAGCTATCAGTTTAAG TATAATGTACTCCTATACCTTACTTAGCCGTTAATCCCGCAAGGCTGAAT CCAACGTAATACAGTGTTTTCGACAATCGAAGGAGCGTCCGTTCCCGCCG GCCGGCCGTTTAGCCCGTTAGGGTATCTCTAACCGATTCAATGAACTATG CCTATGTATGTCCTTTAAGTGGTGTATTGCTTGTGTTTGAATTTTTCGTA TGTTTAAATTATTTGTTTAAACTATATGTAAGATGTTGAATGCATATGTG GAGTGGTGGAAAAAAATAAGGCAAAAAAAAATTTACTCCTCTAAATTTAG GGGATCGGTTCGGCGCCGACCTCCTTTAGAGGAGTATAACCGTATTGGGA TCGGTCAGAGATGCCCTTACACCCAATTGTGCCATATGCTGCTGCAAATC AATCACCTTGGGAGCTAGCTAGCATGAATCTCAATTCTCAATATACGTAG TGCAAGTTCAAACCAAAAGCTAAATGGATAAAAATATGGACCTTGTTTTT CGCAAAAACTAGCTTGCAGTCCTTGTTCTGTCTCTATTCGTCTCTCTACA AACTATATATACGGTCAGTATTAGCATACAATCATATACCCAACTGCCAG CTAGCTAGCGACATCGATACAATTACAAGCAGGCTACAAGCGTCTTCGTC GCATCAAAACAAAACCACGATCAACACCATCCACCTATAATATCCTACTA TTAGAATTCTTATCATACATTGACCTGTACGTACATGCATGGCCGGAGGC CGGAGGTCAGTATGCGAATAAGTAAAAATGAACATGTATAGCCGGCAAGA GCGACTATGTACGTGGTTGCATGTGCATCGATCTTGACCAAAGACAAAGA GATCGGCCAAGATCACGGTCGATCAGCTAGCTGATGCACGTTCTTCTCCT CCACGTTCCAAGAGTGAAGGGACCGAGCATCCGTCCGTGTCATCGGCCGG CCGTTTCACGGAATTGTGCCATACTCCCTCCATCCGCAAATCTATCTATC AATCTTCTATCTATTTTATTTATCTATCTATCTAAACTATAATATTGCTT GAGGTAGATTCGTCTACCAAAATTTTCGTTTCGATTTTTTCTGGACGGTT TTGCCCCTATGTTTTTGTGAAAATTACCCACCACTACCATCCTGAAGTGA AAAAACGGGTTGATCGCTCCGCCTGCTCCTTCTACCTGCTGTCCGCGCAC GCGTGCGATTCCCCATCCGGTGGCCGGTGATTGGAACGCCGCCGCTTCCG GCTGGGACTGGAGCACCGCTGTCGGCCAGAACTGGTGCGCCGCTGCCGAT TCGGCCGCCTTCTGACACCAGGTAACCTGCGGCAGCCCCTTCCGTTGATT CTTGCATGGCCCAGCTATGCTTCCTTGCTAGGCTACGATTCCCCATCCGG CGGCCGGGATTGGAGCGCCGCCGCTGTCGCCCGGGATTGGAGCCCCGCTA CGCTGTCTCTGCCGTTCGGTAGTGGAGCGCCGCCGCCGATTCGGTCGCCG GAGCACCACGGGATGCTTCTGTCAAGGTTGGTGGAGGGATGCTTCTGTGA AGGTTGGTGCATGCAGCGACCCAGGCGTGCATGTGATTTGAAAATGAAGA TGCCCTCGACCGTGGGCATGTGCAGTGTGTTATGTGTTTGAGTCTGACAC CTGCTGCTTTTTTTGTTCATGCGTTGTTGATTTCTTCAGAAACTTTTAGC ATGCTCTTGATGCGTGGTGTACAGATGATTCTAAAAATTGGAGGGACGCA ACTTCCTATTGATCTTTCTGTCCTGCTGTATTATCTTTCTCACTACCTAC TATGAGATTTTAATTTCAACGGCCAATAAAAGGAGACTTATGGCAGATCT AAAATTAACTGATTTCGAATTTTGAGCTCTTTCTTCTGTGATGAATTATT CTACCGTGGTACCTGTGTGATTTTAACCAAGTGATTCTCTTTCTCTAATT CTCTAATTCGTTCGGTCGTGTGCTAACAATTTCACCCGCGTACTCTTATG AGTTCTAGGTTATTTTGTGCTAAGTAATTATGCTATGACTCCCAATTATG ATTAGAACAGTAGTGGTAATGAAAATCCAGATTAACAAAGTTGGTCTTTG AATTTTTGGCTGGCATGTTGTGTTTTGCCTGTGCAGCTTGGAAACAACAT CTGTGATGTTTGTCCCCCTAAGACCAAACTATACACTGAACTTCATGTGC CAATTCAAGACCCTATCGGCAAGCTAGCAGCTTTGCGCCCGGTATAACAG GGTGAGATGGATGTGTTGAGATGACAATGACTGTGCGCGCGAGAGAGAGA GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA GAGAGCCAGAAAAGTGATGACGAGAGCATGGTTTGTAGTTTGAGTAACTA AAATGTCCTGATCTATTTCTAAGCTCGATAATATGGGTCGTTGAATGTTA GAACATTTATGTGCATTGGGAAATGTTTTCATGTGCACTGGAAAATGAAA TTTGAGAACCCGTGGCGACGCACGGGCAGCAGGAACTTCTTCTTGAGCCA TGCGGCTGGTAGACTGCGGCCGGTCTGCAGTAAATGCTACCTCCTCCAAT TTTCTAATCTACCTTAGGGTAAAGCATTTCTTATTTCTTTATTACAAATA GAGGAGCTTTGGGTATCTTTGTAATTGTACGACATTTTTATTTCAATCAA GGAGGTGCCACCTTGTACATCAGTTATTTATAAAATTTATCCGCCGAGTA GTCTATATGCTTAAATTATTTTAGCCTTTGTTTAGAGTAGAGTTGTGTTT TTATTCGAAGAAGGAACATTTTTATTTAAATAAAGGAGGTGATACCTTGT ACATCAGTTCTTTATAAAACTTAGCCGCCGAGTAGTTTATATGCTTACAT TTATTTAGCCTTTGTTTAGGATAGGGTTGTGTTTTTATACGAAGAAGGAA ACCTTTTTACGGAGTAGAATCGTTTTCTTTCGAGCAAATAATTTACTGAG CTTACCCTTATCAATTCTCAACTCTAACTTCACGTATCCAATATTGTAGG CAGAAACTTCAATACTTCCTCCGATTCAAATTAATGTTCTCAGATTTTTC TAGATTTAACATGACTAGATATATTTCAAACTAGACAAATTTGAGAACAT TAATATGGCTCGGAGAGAGTATTTTAAGCCATAACTTCACACATATAGAA CACCATAGCATCTCCCGAATCTTGTATACAGTGAGGCGTGAATCTGCTCA GATTATCATGCTCTCTAGCTGTTCTCCATTGGGAAAATTTCTTTTTTTGC GCTTTATGATTAAATTAATGCTAAGAAAAAAACATGAGGAATGTAACAAA GGAATATAACTAGGTGCAACCAACATGGTAAATAATTATGATATGGTTTT TATCAATGTTTTTATGCATAAGTTGTAAAGTTGTTTCTTTTGTTCCGTGA ACCCACTAGCTGAGTAGGGTCATAAGTAAGCTAGACCCCACATGCCAGTA CTTTTGTTTAGACCAACTGAGACTTCAATGTATGGTTTTAGAGGCTACAT GAACAACTTTTTCAGCAACAAATCTACAGAGTTACTGATACTGATTCTAG CATGAGCAACCAAGCTATGAGCTACACTATTGCAACTCTCTCTTTACAAA GACATTTAAATAACGTAGTCGCATGCCATCTATTAATTGATGTTATTTAT CAGGTAGCACATGGAAGAAAGGTTCCTCCCTAACTGGTATAATACTCCAC AATTAGTTTCACGCAAGAGACCCAAGTTTGACCAAAGAAGAAACAGCTTT GATTGCCTCAAGTTCTGCCTCCTACGCGAAGAGCAGCACCAATCCAGTTT CTAGTCTGTCGAGGAGAGGGAGCAGCCCATGGTGATAGCGAGCCCTAGAT CTCCGCTACCTCCGTGCACGCCCTCGCCAGCGCCGCTGCTGACCCCGCTG CCTCCGAGCAGGGTCTCTCCGGTGCAAAAGCAGACCGCCTTCCTCCAGCG AGGATGAGAGAATGGTGCGGATGGGGAGGAGCCCTACTTTTACAATTGTC TTGAGTCGAAGATATAAAATTTGACCAACTTTACAGTATATATTAGCAAC ATATATGACTTCAAATTGATATATCATGAAACTCTACTTCAAAACGGATC TAGTGGTACTACTATTTTGGTATCATAAACGATGCTAGGTTTTTCATAAT AATTGGTGAAACTTTAAAAGGTTTTACTTAAGACATACCTAAAAGTACAC TTATTTACGGACAGAGGGAGTATGCAAATCAATCACGTACGTTGGGAGCT AGCTAGCATGGTGTATATCTCATTACGTACGTAGTGCAAGTGGAAACCAG CATTCAGTAGTTATCTAGCTAATGAACAAATATATCAGGACCTTAGTTAT CCGGAAACGACTAGCTTCAAGTGTAGTTGTCTTTCTCTATTCAAAAGGGT AGCTGGCCTGGAAGCTGGAAGTAGCTATTACTACTTATTAGACACAATTG TAGTGATCATCAGTACCGTACGTGTAAGCATGCATTATACGCCCAACTGC CAGCGACGACGTACGATACACAAACACAAGGACGTTACAAGAATACACAA GAGAGGCGTCAGATCTCACATCATAACAAAACTACGATTGGCACACCATC CACCTAATTATTATCCTGCTTATATATCATACGCCGACCTGTATATCCAA ATCAAGACTTCATTCTCATCTACTACTAGTACCAGTGGACAGCTTCATGA TCGAACGCAGCGATCCCACCTTGGCGTTCGTGTTCCCGGCTTATCACAGC CACCGTATACTTCTGGATTCGGGCAAAACTCCTATTCTCCAAAGATGCTA GCAAGTTTCACTTTAGTCCATAGAAAAGTACAGAAGTAGTCTGCAGCCCA CCCACCGGGAGAGGATAACACCTCGTCTCCTCGCCCAATATCCCTCGACC TCGTCTCCCTACCCCCCTCCTAGCGCCGCCGCCTCCACCTCCTAGTCCCC TGCCGCACCATCAAGGTGACCAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCCGCGTCCCGGCGTCCCCGTCTTCCATGTCAACGACCTCCTCATGGTCT TCATGTCCATGGACGCGAGCGGTTTCCCTCCATGCCGGCTACCCATCTCG GCCACGCCGGCGGCGGCTTGACGGCGACCACGTGCAACAAGCCGTCTCTC TGCCTCCTCGCTGACTACAATGGCGAGCACCTCCTCCACCGCAGTGCCCT TCCGTGGTGGTCGAGTTGCACGGCAGGAGGAGCCAAATCTTTCGCCCTCC ACCCCTTCTATAGCATAGGTCGCCGCCCTCTCGTGGTGCTCGAGCATCGT GGCAGGACACGAGGTGCTGGTCGCCGTCATTCTCCCCAACTACCATCAGG TCCTCACGAGCTGGACACCAACGCAAGATCTGACCTCGCTCCTTTCTCCC CTTTGTTGATATTTTTTCTTTCATATCTTTCTATGTGGATCTTCTGAATC TTGTGTGGTTCATACAAGTTTAGATCTGATCTGCATCTTTTTCTCATGAA CCTTTCCTTCCGTTTTTTTGGTATGAGTTTACTTGATCCATGTATGAATC TTGGATGTTGCACTTGATTAGTGTTAAAATTACATATCTTGATGGTGCAT AGAGTACCCGAAGTATTAATTAGATAAATTTTCCCTAGAACTTTTATGGA ACTCTTGTGAATTATTATGTATCTTGTAAGAATTGTGTGTGAATCTTCGA TGAACTGAGTCTTTTTGTTGAGTCATCATGGATATGTATATGTCAATAAT CTCAATATAAATCTCCTATGAATCTGCCAAATATTGCTACCTAAATAATC TTGCATGAGTCTGCCAAGATTCAACGTAGTTTCCTGTTAAACCTAGATGG TTTTTTTGTATCTTTGCTGAATCCAGTGAAGTTTCATATATTCTTTCAAG TTTTAGTGGAGATTCTTAGATGTTTCTCCGAATTATGTATGAAACTGATT TATCCAGTGTAAATCCACTAAGTTTCTATCAAGTTCATTTCATGTTCCTT GCAAGTTTCATTCCTATGATCAAGAAATATGTGCAGCATTAATATTTCGG GATTTAGGTTTTATTACGAATGAAACCTGTAAGTATCTTATGTGAATGTT TATAATCTTGAGTATCAATTGTGACTCTGAAATGATATAGTAAATCTTTC AATATATTATATGAACTATTTATGTATCTTTGAGGAAACATGTATAAATT TTATGTATATTGTTCTGTGAAATTGTATGTATCTTAATACATTTTCAAAT CTGCTGTGAATTTTTCTTCTTTTCTGGAAACGGGAAATTGTATGTGTTTT TAATTAGAATTTCTAATTAAAATGGGTTAAGTAAATAAAACAGAGAATAT TTTATATGTCTCTAAAGAAAACGTAAAATAAAGTTGTGCCAAATTGCTCC TTCATGAGACGTTTCCTGAAATTTGTCCAACGTCTTTACTTGGAACTTTT TTCCCGCATATTTGGTTATTGGAAGTTGTACAAAACATAGTGCTGCAAAT CTAATTTATTTAATGCTACGGATCCTAATTTTGTTGGTTAAATTTTCTGT GATGATTTGTACATATGTAGAAATCTGAGTTTTTTTTTACTTTGCTACTT GCTGTATGCAAAAAAACCTTTGAAATAAATTATTCTAAGAACGGTGACAA TGCAACAAAATAATTCTGGTTGATAACTATATAAAGTATGTTTCGAAATT ATTGCAAAATAAAGTTGTACATTAGACAAGGAAAGTGAAAAATCTGTGTT AAATAATGGGAGGACCTCCTCACGTGAATTGAAATTAATAGAGGGACAGT TTTGCATCTAGCACGGGAGCCGGGATAGGACGCGCTGTACATGCACGAAT CTAGAACGGTAGTTGAACGAGTGGGATAAGTCCGGGACACGAACGTCCGG GTGGTATTGCTTTTTCGTTCATGATCGGACATATCCAACGGCTAGTTAGT ATTAGACGGTACTACATTCATTCTCTGTTATAATTTATTATTCGTGCGTG CGGTACCACACGCTAATAACCGGAGCAAGCAACACGAGCTCTCCTACTCT CGTCAATGCATGGAGTAACGCGCACGTATGTGCGCAGATTAGTCGAGCAA GCTTATCCCAATTAGCGTGCGGAAGATGCTCTTGATATACTAATCTACCT GTTGTAGTAACGTATACTTGCCTAATTACGCTTCTTGACCATGTTGTGGT TCTTGTCTATTCCAACTTCCAACACGATATGGTTTGAAATGATCCATCCA CGACTCGATTTAATTGCTCGGAAAATGCCGATTCTCCGCACACGAAGTAA CAATGTAATTCTTGTATCTGTGTCCGTTAGCTTGCTAACATAAGTTGTTT TGGCAAATTAACATCTCACTTGAAGAACAGGGCGAGTTGCTGGTTTATGC ACATCCATCTTCTTTTGGATCAAGCTAGCGCAGACTCGTCTATTTCGCGT TAGGAACTGCATGTTGGATTTAGTGTTAATAAATGCATGTAACCTTAGTG TATTCTTCTTCTTCCATTCCCACTTCTCATTCTTCACAACGCAGAAATAA AAAGTTGACGAAGACTTGGGACCTGAGGAGAGCGAAAGGAGTAAGGCGAC ACATGCTGTCTTACGTATTTTGGCCTAATCGGTGATAACCATGAATAAGC CATTTCGAGGGACAAGTTTTCTCAACTCACATGCTGACACTAACTCAAAA AAGTCATAAGAAGACACGCCAAATAACATGGAAACTGCCAGATAGCTTCG AGAGCCGCACACGACTTCGGGGGTCAACTTTGGTTGCTTTGCTTCTGGGT GTAGCGCGTACTTCCTCCGTTCCAAGTTTGATTAATAAGATTGGGCTCCC AATATTTTTGCCTATGACTCTGTGCTAGAGTTGCATAAGACTGGGCTCGC AATCTAGAACCAAAATTGTACAAAGTGAAAATTAAGGCTCGAAATGTCGA ATTACCAAATTCCACATTCCAAGCCCAAGATTACACAAGAACACATTGTA TGCTAGCACATTACGTGCAACCTTGCACTAGTCTAGTAAAACAAGTAATA GTTAATCACTCTGAACAAGTTGAGAGTTAACTACCAGATTAACTAACACT GCTAATGATGGATATATTGCTTAAAGGCTCTTGAATTAATAAATCTAAGT TTCGGACGATCTAGTTGCTGTAGTCATAAATTATATTCTGAAATTAATTA TAAAAATATTACCTAATAATTCAACAAATCTAACTTCAGGGTCATCCAAT GACGGTGGTGGAGACAGACGGGCACTACGTGAAGCCATTCATGGTGAAGA ACCTCAACATCTACTCCGGTGAGACCTACTCCGTGCTAATCACGGCCAGG ACCGCAACCGCAACTACTGGCTGGCCTCGAATGTGGTGAGCCACAAGCCC GGCACGCCCACCGGCACCGCCATCCTGACCTACTACGGTGGCCGGAACAG CCCGCGCGCGGTGCCGCCCACGACACCACCCGTTGGGCCGGCGTGGAACG ACACCACATACCGCATCAACCAGAGCGTCGCCACTGCGGCGCACCCGGCA CACGTGTACACCCCTCCGCCACGCTCCGACCGGACCATCCTCCTGCTCAA CACGCAGAACAAGATCGACGGCCGGATTAGGTGGGCGCTGAACAACGTCT CCTTCTTGTTACCCCACACCCCCTACCTGGTGACCCTGAAGGACAAGCTC CATGGCACCTTCGACCCGCGCCCGCCACCAGAGACATACAAGCACACAAC ATATGACGTGTACGGGGTGTACGGGGTGCAGGCGAACCCGAACGCGACAA GCAGCGACGGGCTGTACCGGCTGGCGTTCGGGTCCGTGGTGGACGTGGTG CTGCAGAACGCCAACATGCTGGCGCCCAACAACAGTGAGATCCACCCGTG GCACCTCCACGGGCACAACTTCTGGGTGCTCGGGTACGGCGTGGGGAGGT TCGACCAGGCGGTGCACCCGGCGACATACAACCTGAGGGATCCCATCCTG AAGAACACGGTGGCGGTGCACCCCTACGGATGGACGGCGTTGCGGTGGAG GGCGGACAACCCCGGTGTGTGGGTGTTCCACTGCCACATCGAGTCGCACT TCTTCATGGGCATGGGCGTCATCTTCGAGGAGGGGATCGAGCGCGTCGGG AAGCTGCCACGGGAGATCATGGGCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.