Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE027921

[Submit comment/correction]

Sequence	AE027921
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE027921
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAAGTTCGCAATATCCAATTTCGAAGCGCTTAGAATCAGTAAGGAGAA AGTGAGGCATTTCCATGAGTTTGTGTCCAGAAGGCTTGGTTCCCTCTCCA AGTGTACAACGGACTTGTTCAGGCGCTCTTACTTGTTTCTGATCTTCGAA AGCAATCCTTTGATAGTCCAGCTTATTTACTTCATGTCAATATCTTTTGC TGGTTTTCTTTCCCTGAAGAATCTCAAGTCCCTGAATAAGCCAACTCCAA GGAACTTGGATCTGATGTTCACCTCCGTTTCCACAGTGACAGTGTCAAGC ATGGCAACAGTTGAGATGGAGGACTTCTCCGACCAGCAGCTCTGGGTTTT GATCATACTGATGATATTAGGAGGGGAAGTGTTCACCTCAATGCTCGGGC TGCACTTCAAAAATGCTCGGGCCAACACTGATTATGGCCTCCAGAGAAGA TTGGCTTTCATAAGCAGGGACATTGAATCCTCTGATGTTTTCAACAACAG CAGTCAGAATAATATGGAAGGCATCCAGTCAGAGGAAACCATGACACACA ATCAGGTACAGGAGCACAAAGAGATGAATCAGAACTCTCGGAATATTTTA GCTCATGTAGTGGCAGGCTACTTCATAGCAGCAATTGTTTGCGGCTCAGT AGTCATTGTCATCTTCCTGTGGATTGACTCCAATACAAGAGATCTACTGA AGGGTAAAGATATCAAGGTGTGGACCTTCTCAGCCTTCACAGCAATATCT TCATTTGCAAACTGTGGCTTCACTCCGGTAAATGATAACATGGCGATTTT CAGAAATGAACCCACTTTCCTGCTTCTAATTATCCCGCAGATTCTAGTAG GCAACACTTTGTTTGCACCAATGTTGAGGTTAAGCATATGGGCCTTGGGA AAGGTTAGCAAAAGAGAAGAATATGCTTACATCCTTCAGCACTCAAAGGA GATTGGATATAGACATTTGCAAACACATAAGAATTCTGTCTGCTTGGTTC TGACAGGAGTGTTGCTAATTCTGCTGCAAGCAATGGCTCTTTGTTGTTTT GAGTCGGATTCGAAGGCCTTCGAGGGAATGAAATGGTTCCAGAAATCGGT AGCCTTAGTGTTCCAAAGTGCCAGTTCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCA TTAACATATCGACCCTCTCTCCACCGATTTTGGTGATATTTGCACTTGTC ATGTAAGTTTCCCCCTCTAGCAACTACTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTC AGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTATTGACAGTATATTACCTGGAGAATT GTCATAAATTGAAAACTATGCTCGTTTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAAT ACATAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAAACGACACAAATAGTTCCAAGCT AATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGA TGTCTCAGATTTGTCAAAATTTGAATGTATCTATACACTAAAACGCGTCT AGATTCATTCAGATTTAGACAAATCTACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGG GAGTATATGAAGTTGACAATAGCAATTATTGACAAAGTAGAGAAAAAATA GCTGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGT TCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCATTAACATATCGACCCTCTCTCCACC GATTTTGGTGATATTTGCACTTGTCATGTAAGTATCCCCCTCTAGAACCT ATTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTCAGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTA CTGACAGCATATTACCTGGAGAATTGTCATAAATTGAAAACTATGCTCAT TTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAATACATAGAGAGCATATTTTAGTAACC AAAACGACACAAATAGTTCCAAGCTGATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCA TGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCTCAGATTTGTCAAAATTTGAA TGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATTCATTCAGATTTAGACAAATC TACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGAGTATATGAAGTTGACAATAGCAA TTATTGACAAAGTAGAGAAAAAATAGCTGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGT AGCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCA TTAACATATCGACCCTCTCTCCACCGATTTTGGTGATATTTGCACTTGTC ATGTAAGTATCCCCCTCTAGAACCTATTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTC AGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTACTGACAGCATATTACCTGGAGAATT GTCATAAATTGAAAACTATGCTCATTTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAAT ACATAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAAACGACACAAATAGTTCCAAGCT AATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGA TGTCTCAGATTTGTCAAAATTTGAATGTATCTATACACTAAAACGCGTCT AGATTCATTCAGATTTAGACAAATCTACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGG GAGTATATGAAGTTGACAATAGCAATTATTGACAGAGTAGAGAAAAAATA GCTATCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGT TCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCATTAACATATCGACCCTCTCTCCACC GATTTTGGTGATATTTGCACTTGTCATGTAAGTATCCCCCTCTAGAACCT ATTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTCAGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTA CTGACAGCATATTACCTGGAGAATTGTCATAAATTGAAAACTATGCTCAT TTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAATACATAGAGAGCATATTTTAGTAACC AAAACGACACAAATAGTTCCAAGCTGATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCA TGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCTCAGATTTGTCAAAATTTGAA TGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATTCATTCAGATTTAGACAAATC TACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGAGTATATGAAGTTGACAATAGCAA TTATTGACAAAGTAGAGAAAAAATAGCTGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGT AGCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCA TTAACATATCGACCCTCTCTCCACCGATTTTGGTGATATTTGCACTTGTC ATGTAAGTATCCCCCTCTAGAACCTATTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTC AGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTACTGACAGCATATTACCTGGAGAATT GTCATAAATTGAAAACTATGCTCATTTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAAT ACATAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAAACGACACAAATAGTTCCAAGCT GATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGA TGTCTCAGATTTGTCAAATTTGAATGTATCTATACACTAAAACGCGTCTA GATTCATTCAGATTTAGACAAATCTACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGGG AGTATATGAAGTTGACAATAGCAATTATTGACAGAGTAGAGAAAAAATAG CTGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTT CAAGACATGCCGGTGAAACTGTCATTAACATATCGACCCTCTCTCCACCG ATTTTGGTGATATTTGCACTTGTCATGTAAGTATCCCCCTCTAGAACCTA TTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTCAGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTAC TGACAGCATATTACCTGGAGAATTGTCATAAATTGAAAACTATGCTCATT TGAACAGTAAAAATGGCAGAGAATACATAGAGAGCATATTTTAGTAACCA AAACGACACAAATAGTTCCAAGCTGATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCAT GTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCTCAGATTTGTCAAAATTTGAAT GTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATTCATTCAGATTTAGACAAATCT ACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGAGTATATGAAGTTGACAATAGCAAT TATTGACAAAGTAGAGAAAAAATAGCTGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTA GCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCAT TAACATATCGACCCTCTCTCCACCGATTTTGGTGATATTTGCACTTGTCA TGTAAGTATCCCCCTCTAGAACATATTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTCA GTACTACACTGAGGTTAGCTCTTACTGACAGCATATTACCTGGAGAATTG TCATAAATTGAAAACTATGCTCATTTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAATA CATAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAAACGACACAAATAGTTCCAAGCTG ATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGAT GTCTCAGATTTGTCAAATTTGAATGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAG ATTCATTCAGATTTAGACAAATCTACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGA GTATATGAAGTTGACAATAGCAATTATTGACAGAGTAGAGAAAAAATAGC TGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTC AAGACATGCCGGTGAAACTGTCATTAACATATCGACCCTCTCTCCACCGA TTTTGGTGATATTTGCACTTGTCATGTAAGTATCCCCCTCTAGAACCTAT TCAGGGTGAATTTAACTAAGTTCAGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTATT GACAGTATATTACCTGGAGAATTGTCATAAATTGAAAACTATGCTCATTT GAACAGTAAAAATGGCAGAGAATACATAGAGAGCATATTTTAGTAACCAA AACGACACAAATAGTTCCAAGCTGATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATG TACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCTCAGATTTGTCAAAATTTGAATG TATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATTCATTCAGATTTAGACAAATCTA CGGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGAGTATATGAAGTTGACAATAGCAATT ATTGACAGAGTAGAGAAAAAATAGCTGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAG CCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCATT AACATATCGACCCTCTCTCCACCGATTTTGGTGATATTTGCACTTGTCAT GTAAGTATCCCCCTCTAGAACCTATTCAGGGCGAATTTAACTAAGTTCAG TACTACACTGAGGTTAGCTCTTACTGACAGCATATTACCTGGAGAATTGT CATAAATTGAAAACTATGCTCATTTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAATAC ATAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAAACGACACAAATAGTTCCAAGCTGA TTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATG TCTCAGATTTGTCAAAATTTGAATGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAG ATTCATTCAGATTTAGACAAATCTACGGCATCCTTTTAGGACGGAGGGAG TATATGAAGTTGACAATAGCAATTATTGACAGAGTAGAGAAAAAATAGCT GTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCA AGACATGCCGGTGAAACTGTCATTAACATATCGACCCTCTCTCCACCGAT TTTGGTGATATTTGCACTTGTCATGTAAGTATCCCCCTCTAGAACCTATT CAGGGCGAATTTAACTAAGTTCAGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTACTG ACAGCATATTACCTGGAGAATTGTCATAAATTGAAAACTATGCTCATTTG AACAGTAAAAATGGCAGAGAATACATAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAA ACGACACAAATAGTTCCAAGCTGATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGT ACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCTCAGATTTGTCAAAATTTGAATGT ATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATTCATTCAGATTTAGACAAATCTAC GGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGAGTATATGAAGTTGACAATAGCAATTA TTGACAGAGTAGAGAAAAAATAGCTGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGC CTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCATTA ACATATCGACCCTCTCTCCACCGATTTTGGTGATATTTGCACTTGTCATG TAAGTATCCCCCTCTAGAACCTATTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTCAGT ACTACACTGAGGTTAGCTCTTACTGACAGCATATTACCTGGAGAATTGTC ATAAATTGAAAACTATGCTCATTTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAATACA TAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAAACGACACAAATAGTTCCAAGCTGAT TATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGT CTCAGATTTGTCAAAATTTGAATGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGA TTCATTCAGATTTAGACAAATCTACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGAG TATATGAAGTTGACAATAGCAATTATTGACAGAGTAGAGAAAAAATAGCT GTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCA AGACATGCCGGTGAAACTGTCATTAACATATCGACCCTCTCTCCACCGAT TTTGGTGATATTTGCACTTGTCATGTAAGTATCCCCCTCTAGAACCTATT CAGGGTGAATTTAACTAAGTTCAGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTACTG ACAGCATATTACCTGGAGAATTGTCATAAATTGAAAACTATGCTCATTTG AACAGTAAAAATGGCAGAGAATACATAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAA ACGACACAAATAGTTCCAAGCTGATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGT ACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCTCAGATTTGTCAAAATTTGAATGT ATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATTCATTCAGATTTAGACAAATCTAC GGCATCCTTTTTAGGATGGAGGGAGTATATGAAGTTGACAATAGCAATTA TTGACAGAGTAGAGAAAAAATAGCTGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGC CTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCATTA ACATATCGACCCTCTCTCCACCGATTTTGGTGATATTTGCACTTGTCATG TAAGTATCCCCCTCTAGAACCTATTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTCAGT ACTACACTGAGGTTAGCTCTTACTGACAGCATATTACCTGGAGAATTGTC ATAAATTGAAAACTATGCTCATTTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAATACA TAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAAACGACACAAATAGTTCCAAGCTGAT TATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGT CTCAGATTTGTCAAAATTTGAATGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGA TTCATTCAGATTTAGACAAATCTACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGAG TATATGAAGTTGACAATAGCAATTATTGACAAAGTAGAGAAAAAATAGCT GTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCA AGACATGCCGGTGAAACTGTCATTAACATATCGACCCTCTCTCCACCGAT TTTGGTGATATTTGCACTTGTCATGTAAGTATCCCCCTCTAGAACCTATT CAGGGTGAATTTAACTAAGTTCAGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTACTG ACAGCATATTACCTGGAGAATTGTCATAAATTGAAAACTATGCTCATTTG AACAGTAAAAATGGCAGAGAATACATAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAA ACGACACAAATAGTTCCAAGCTGATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGT ACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCTCAGATTTGTCAAAATTTGAATGT ATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATTCATTCAGATTTAGACAAATCTAC GGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGAGTATATGAAGTTGACAATAGCAATTA TTGACAAAGTAGAGAAAAAATAGCTGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGC CTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCATTA ACATATCGACCCTCTCCACCGATTTTGGTGATATTTGCACTTGTCATGTA AGTATCCCCCTCTAGAACCTATTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTCAGTAC TACACTGAGGTTAGCTCTTACTGACAGCATATTACCTGGAGAATTGTCAT AAATTGAAAACTATGCTCATTTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAATACATA GAGAGCATATTTTAGTAACCAAAACGACACAAATAGTTCCAAGCTGATTA TCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCT CAGATTTGTCAAAATTTGAATGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATT CATTCAGATTTAGACAAATCTACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGAGTA TATGAAGTTGACAATAGCAATTATTGACAAAGTAGAGAAAAAATAGCTGT CTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGCCTCAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCAAG ACATGCCGGTGAAACTGTCATTAACATATCGACCCTCTCTCCACCGATTT TGGTGATATTTGCACTTGTCATGTAAGTATCCCCCTCTAGAACCTATTCA GGGTGAATTTAACTAAGTTCAGTACTACACTGAGGTTAGCTCTTACTGAC AGCATATTACCTGGAGAATTGTCATAAATTGAAAACTATGCTCATTTGAA CAGTAAAAATGGCAGAGAATACATAGAGAGCATATTTTAGTAACCAAAAC GACACAAATAGTTCCAAGCTGATTATCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGTAC TTCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCTCAGATTTGTCAAAATTTGAATGTAT CTATACACTAAAACGCGTCTAGATTCATTCAGATTTAGACAAATCTACGG CATCCTTTTTAGGACGGAGGGAGTATATGAAGTTGACAATAGCAATTATT GACAAAGTAGAGAAAAAATAGCTGTCTCAGTTTGCAAAAATCGGTAGCCT CAGTGTTCCAGAGTGCCAGTTCAAGACATGCCGGTGAAACTGTCATTAAC ATATCGACCCTCTCTCCACCGATTTTGGTGATATTTGCACTTGTCATGTA AGTATCCCCCTCTAGAACCTATTCAGGGTGAATTTAACTAAGTTCAGTAC TACACTGAGGTTAGCTCTTACTGACAGCATATTACCTGGAGAATTGTCAT AAATTGAAAACTATGCTCATTTGAACAGTAAAAATGGCAGAGAATACATA GAGAGCATATTTTAGTAACCAAAACGACACAAATAGTTCCAAGCTGATTA TCTCAGGTTGCAGTTAGTCATGTACTCCCTCCGTCCTGAAAAGGATGTCT CAGATTTGTCAAAATTTGAATGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATT CATTCAGATTTAGACAAATCTACGGCATCCTTTTTAGGACGGAGGGAGTA TATGAAGTTGACAATAGCAATTATTGACAAAGTAGAGAAAAAATAGCTGT CTCAGTTTGCAAAAATGCCAAAACATGTCTCATGCTACCTAGACCAAAAT CAGAAAAGGTGCATTCGAAACAGTTGACGCACCTAGACTGCAACCAAAAC AATCATAGAACTCCTCTAGGCAGAGCTCACAAGGACAGAATTATGGTCCC AGTTCAGAGTGCGAGTTTACGGAAAATCAATAATAAACACCTAAGTGACA ACCAAATTTCAACAGCAGGCTACAGTAGTGCTCATGAAAGGAAGGTTCAG TGTCTAATTTCTTGGAACAAGAGGGCCAGAAACCAGTACCATTGAGCTAC CTCTGTATTTTTGCTTTTGTATTAACAGCTCACTAACTTATTTGCAGGTA ACTTCCTTCTAGTACTTCATTCCTCTCTATCTGTGGTGATAGCCAAACCT TGACAGATAAAAAAGAAAGCCCGAATAGCAGAGCAACATGGGAGAAGTTT GTCGTTACCAAGCCTGCTTGTTTAGCAATATTCACAGTTTTGGCATGTAT AACTGAAAGGAAGTCGATGTCCGCTGATCCACTCAACTTCAGCATCTTCA GTGTAATATTCGAAGTGATCAGGCAAGTTGGAATCCTTATACTAGAAGTA ATGTATGACTAAATAAGAATTGTACTGCATAAGAAAAAGTTGAACTATGT TTACCGCAGAAACAGGAAAGCACAGTCAAGCTTATTAACATCATATGTGT TGCTTCCAAACAATTAATGATGCACATTTCTCGTGTGCAGCGCGTACGGC AATGTCGGCTACTCACTGGGGTACAGCTGCGACAAGTTACTGAAGCCCGA CACCGCCTGCAGAGACGCTTCGTACGGGCTCGTCGGCAGGTGGTCCGACG AAGGAAGGCTGGTCATCATCCTGGTGATGTTCCTCGGGAGGTTCAAAACG TCCACACTGAAACGGAAGAAAAACCTGAATGTGCATCCATGTAGTAGATC GCCACATCAGGGGGCAGCAGCAGAAGTGGCTGGAAATTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.