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GrainGenes Sequence Report: AE021525

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Sequence
AE021525
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE021525
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TAAAACCAGTGAAAGCCGCCATCGCCTTCACCCTCGTATCCGCAGCTCTC
CCATCTCTCGCCGGAAGCGGAGCAGGACCCAACACCGCATCATGTCGGGC
ACGGCGGCGGCGCGGGTGCTGCCGAAGGCGGTGACCTTCGTCACAGGCAA
CGCCAAGAAGCTGGAGGAAGTCCGCGCGATTCTTGGCTCTTCCATCCCCT
TCCAGTCCCTCAAGCTCGACCGTAAGCTCCTCCTCGCTCTTTCTTCCATC
TCCTCTACCTCTCCTCCATTTATGTATGTAGAAGGCGTCTGATTAGCAGT
CTGCCAGTCAAGAATTTAATGCTAGACCATGGATGCACAGGAATTGCTGG
TTGATGGGAGTGCTTTTGCTGCATGGCCGTCACTTAGGTGCCGAAACCCT
AGGTTAACACCAGCTGTGGATTCTTATGTGAGGGCGTTATTAAGGTCAAA
CAGTTTTGTTTTTAAACAGCGGACGCTAGCATATACTGTTGGAATCGGTT
ATAGCTGAAAAATGTGAATTAGCAATAGTTTGCATCGGTTTGACAGGCCT
AATCCAATAGAGCTACAGGATGCAGATCTCAAGAGATTCAGTAGCGCACT
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CAAGCAGAGGCACCTCACCACTATCAGTGGCGGCTAGGGTTTCAACCCTT
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CTGGCGTGGTAAAGTAATGCTACTATGGGTAAATGAATAGCAACCGCCAG
ATCTTCAATGGACGCTCCAGATCGACGGATACCTCTTGGGTCCTGACAAT
TCCCCTGCAAAAACATCAGACATGTCCTCAGCTCTGAAACTCAGGAAATG
CTTTTTGGATGAATGCAGAGTCCTAAGTGGCCTGTTCAACTGGTAAATTT
ATCCATTTGATCAACCAGCGAACTATAGGAATGTTGATGTTACCCTGCAC
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CTAGATGTTTCTTGAGATGACTGATGTGGAAGGTAGGGTGAAGCTTGCAT
CCCTCCGGTGTAAGAATCAGCTCCAATCTTCTCCAACACACGAAAAGGCC
CATAGAATTTTGGGTGTAGTTTCAGGATTCTATGAAGACTTAAGGAGGTG
TGCCTGTATGGCTGAATCTTTAAGTAACCATGTCCCCAACAACCAAAGTT
CTTTCAGTTCTATTTTTGTTAGCAAAATGCTTCGTCCTTTCTTGTGCTTT
CAACAAATTCTCTTTGATCTGTGCTGCTATTGCTGCAGTTGCAGAGGAGA
CAGACACAAATGCAGATTCATCCATGGGAAGGAATAGTGTAGCAATGATA
GATGGTGGCTTGCCATAAAGAGCATGGAATGGAGTCATCCTTAAGGAAGT
GTGGAACCTTGTGTTATACCACCATTCAACATGTGCTAGCTAGGTGTTCC
ATTTTTTAGGATGTTGAAATGCCATGCATCTCAAATAATTCTCTACACAT
TGATTGACCCTTTTGGTCTGGCCGTCAGTTTGTGGGTGGTAAGATGTGTT
GAAATGTAGCTTAACACCCACGGACTTGAAGAGATCTTCCCACAACTTGC
TAGTAAAAATCCTATCCCTATCTGTCACCATGACAGTGGGTAGTCCATGT
AGTTTGAAAACATGATCAGTGAATGCCTTTGCTACTGAGTGAACATAAAT
TGGATGCTTCATTGCAATGAAATGAGCATACTCTGTGAACCTGTCTACCA
CCACCAAGATCAGGTCCTTGTTTTGTGAAATTGGCAATCTTTCAATAAAA
TCCATGCTAATGTGACTCCATGCAAATACATGAATAGGCAAAGGCTATAG
CATACCAGGGTATTTGGAATGTTCAGGTTTATTGAGTTGGCACACATGGC
ATAACTTGATGAATGAAATTACTTCTTGGTTCATAGCTAGCCAGTGGAAC
AACATCTTTGATATGTAGCTCCGCCTCCAGATTGTTCCCCCAATTCTGAT
GTATGGAATGTGGACATGAGCTTGTTTTTCAGATCAATATTAGTCCCAAT
GTACATCTTATTTTTGTATCTGATTATTCCATTATTGAATGAATTATTGG
GCCTGGCTTGGTCAGATACAGCTAGTTGTGCCATGCTTTCCTTGCACTTG
TCATTGTCATAGCTATCTCTGACTTAAGTTACCCAGGTGGGAACTGCTGC
ACTGGTGAACAATTATGTTGGGTCCCTGGCACATGGGGTACCACGACCCA
CTGGTTACTGGGTCCCTCCGCACTCTCGCTAACGGTCTCAAAAGGCAGGC
TCCTTTCGAGAGGCCAAGCGGGGTGCGGAGCGTCGGCTAAGGGCCGGGAC
GGTTACAACACCCCCAAAGACCGGAGCCTCGACAAGGACACCGACATCGG
TGACAAGACCCTCTGCGAGGCGATGATCCTTATTAACGATCACCCGCGTC
ACCCTCGGCGACGCTCCGTGAGGGAAATACTGCAACCCCGCTCCATTGGA
CAAGACGATAACCCAACGGGCAGTCCTGCTGTTCTCCCATCCGCGCTGCC
CTCCTCGGTAAAAGAAGATGTTGCCTGGCCGTTTCCGTGCTAAAGCAGGG
TTGACGACACCGATGCCCCTCAAAGCTCAGCATTACCGCTTTGGTACAAG
GGGGCAGAAGATGACCTGGCGCCACAAAGGGGACGTCACCGGCGACCGCT
GCTTTGGACCGGAGCTCCCTGAAGACCCTAGACCTGTTCCATGTAAAGTA
GGTGCGTGCACCAGCTCTCCTTAGGCGGAATGCGGTGACCCTTCTCGCCA
GGAATTGGGGGAAGAGGTCCGGCGCCACTATAAAAGGAGAGCCACCCCAA
CCTCAGGAGGGGTCGATCCTTACGATCTAAAACCCTAGGCTTTCACTTGC
CATTATACCATCGTGAAGCACCGCGAGTAATACAACCAAGCAGGAGTAGG
GGCTTTACCTCCTCATGAGGGTCCCGAACCTAGGTGAAAAACCACCGTGT
CATCTCTCTGTCGTTCACGAGTTCCGTTGCTGCCATCGTCATCGAGATCT
AAACGTGTGTTCAGTCTCCTCACGAATCCGGGGCTTGTTGGTACCCCAGT
TCCTTCGTGGGACTTCAATCTCCGACATTTGGCATGCTAGGTAGGGGACT
GAGGCGCGCTTTCGAGATCTTCAACGACCTCGACAACATGGCACCTCGTG
CTGACACTCGCGTCGGGCGTGTTGGCCCGGCAAGAAAGGGCAGGCGAAGC
GCGGGAGGACTAGAGCCCCCGCCGTGTTGTCTCCCCTGGCGTAGCGCAGG
CTGAAGACGAGGAAGACTCCTCCTCCCGCCCCTTACGAGAGGCGCTGCTC
CCTGAGCGCGGTGACGCGTCATCCTCATGCGCTGTACCATCCCGCGAGCG
CGAGGACATGCTCACACCGGGGGCTACACGGCTCATGGTGAAAGAACTTC
TCCGCTACCCGCCCGCGGAAGCTGGGCGAGAGGAGTGGCGCGCGAGCCTA
GCCGTGCTCGTTGACATCACGTGGGCCGACTTGGTCTCGGCTTCGCCAGT
AGCCCGAGCAGGGGAGGTGGCCTATGGTGCACCTCCATCCTTCGGGGGAG
TGGTTCCCCTGCGGGTGTCATCCTTATTACTCTTGTTCTGGTTGTCATTT
GGCTTCCTCGTCTTCCACAATTATGACATCCATAATTCTTCTTGTCAAGC
TTCTGATAAGGGTTGTTGTAATTGCTATGCTGTCCCTTATCCCTTCTATC
ATCTCTATGGTGTCTCTGATCACGGTCACGCTTGAAGTTAATTTTGTCCC
TCAAATCATGATCTGACTTCCTTTTATTCTAGTTCTTCTTATGGTTGTTA
TTTCTATGCTTCCCAAGGTGCAGCTCCGTATGATGGGAGCCTCTCTCCTT
CCCTTGGTTTTGCTTTCTATCTTCCTCCATCAACAAGTGCTGCCTTAAAT
ACCTCATATTGAGTGTATGTTCTGAATGGCAAAAGGAAATCTTGAACTGT
TCCCATGATGGTGGCAGGGAGTTTAGGACTTCCTCTTGGAACGGATAACT
AGCACTTTTCAGTTCCTCGGCCAAGACAATAAGCTTGTTCAAGTGTATGT
TGACAGATTTGTTGGCCATCTTGGATGTCAGAAATTTATTCACCAGGCCA
GATACTTTCATTAGAGAAACTTCCCCAAAATCCTGTTCCAGCCTTTGCAT
TATGCCATAAGCTGTATCTTCAGACTCATACTCTGCAGCCAAAGAGTGTG
CCAATGAACCAAGCATGAAAACCCTGGCATTCTTGTTATCCTTCTTCCAT
TGCTTAAATTCATCCTCGTGTTCCTGCTTCTCTTCATCAGTAGCATCCTC
TATTGGGTGGTTTGGTTCAGCCATCTCAACAACAACAACAACAACAGAGC
CTTTTGTCCCAAACAAGTTGGGGTAGGCTAGATATGAAACCCAAGCAGAA
ACTCGAGAAAAAAGCAAGTCAAAGCAGAAACTAGTAGAAGCACAAGTAAA
TAAAAGAACAAAAATAGTAAAACAAGGTTCGGGCGCATGGATTGCTGATT
TCCATGCAGCCCTATCAAAAGCCAAAACTCTAGGCACCAATCCTTGAGGT
CCCTTTGAACGGCCTCCTCCCATGTCAACTTTGGTCGTCCTCTACCCCTC
TTAGCATTCAATGCCCCTTAGCATCCCACTATTAACCGGTGCTTCTGGTG
GCCTCCGTTGGACATGTCCAAACCACCTTAATCTGTATTGGACAAGCTTC
TCTTCAATTGATGCCACCCCTACCCTATTGCGTATCACTTCATTCCTAAT
CCGATCCTTTCTTGTGTGACCACACATCCACCTTAGCATACGCATCTCTG
CGACACTTATTTGTTGGATGTGTTGCCTCTTAGTGGGCCAACATTCTGCT
CCATAAAGCATCGCAGGTCTGACTGCTGTCCTATAAAACTTGCCTTTTAG
CTTTCGTGGAACCTTCTTGTCACATAGGACTCCAGATGCTTGCCACCACT
TCATCCACCCTGCCTTGATCATGTGGCTAACGTCCTCATCGATACCACCA
TTGCTTTGCAACATTGATCCCAAGTATCTAAAGGTGTTTCTATGAGGCAC
TGCTTGCCCTCCTAGACTAACCCCTTCGTCCTTGCCTCCAACGCCGCTGA
AGTCGCACCACATATACTCTATCTTTGTTCGACTAAGTTTAAACCCCTTG
GATTCCAAAGTCTGCCTCCACAACTCCAGTTTTCTAGACACCCACCCTGC
TCTCATCTACTAGTACCACATCATCAGCAAAAAGCATACACCAAGGAATA
TCTCCTTGTATGTCCTTAGTGACCTCATCTATCACCAAGTCAAAAATGTA
TGGGCTCAAAGCTGAACCTTGATGTAGTCCTATCGTAATAGGGAAAGTGT
CGGTCTCACCATCTCCTACACGAACACTTGTCACAACATTAGCATACATA
TCTTTGATGAGGGAAATGTACTTCGTTGGGACTTTGTGTTTCTCTAGTGC
CCACCACATGACCATCCTTGGTATCTTGTCATATGCCTTCTCCAAGTCAA
TGAAAACCATATGTAGGTCCTTCTTTTGCTCCCTAGATCTCTCCATAAGT
TGGCGAAGCAAGAAGATCGCCTCCATAGTGGATCTCCCAGACATGAAGCC
AAGTTGATTTTTAGTGACGTTCGTCACTCTCCTCAAGCGATGCTCAATCA
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TTAAGTACAACTTTGGATATCTTCCTTATTCTTCAAGATGGGTACTAATG
TACTTTTCCTCCACTCATCGGGCATCTTGTTTGACCGAAATATGTGGCTG
AAAAGTTTAGTTAGCCATACTATCGCCATGTTTGCAAGGCATCTCCATAC
TTCAATGGGAACATCATCGGGACCCATGGCCTTCCCTCCTTTCATTTGTT
TTAGGGCTTCCTTAACCTTAGTCTCTTGGATCCTCCGAACGAACCGCCTA
TTTGTGTTGTCAAAAGCATCATCTAGCTCGGGCGTAATGATCTTACTCCC
ATCATTGAAGAACCCGTCAAAGTAGTCACTTCATCGCTTCTTGATCTCCT
CATCTTTCACTAGAACTTGATCGGCCTCGTCCTTGATGCACTTCACTTGG
TTGAGGTCTCTTCTTTTCCTCTCGCGGATTTTTGCCATTCTGTAGATGCC
CATTTTGCCTTCCTTTGTGCCTAGTTTTTCATATAACTCATCATAGGCCT
TCCCTCTAGCTCCGCTCACCGCTTGCTTTGCGTACTTCTTGGCTTCTTTG
TAACTCTTCATGTTGCTTGTGCTCCTATCCTGAAACCAAGTCTTGTAGCG
CTCCTTCTCCTTGATAGCCTTTTGGACATTCTCATTCCACCACCACGTGT
CCTTAGGCTCTTTCTTCTTGGCTTTTGCCACTCCAAGCACCTCCCTAGCT
ACCTTCCGAATGTGCGTGACCATCTTCACCCACATGCTCTCTGCATCTCC
ATTTTCGTTCCATGGCCCTTCCGCTATCATCCTCTCCTTAAAGGTCTGTT
GGGCTTCCCCTTTAAGTTTCCACCATTTTGTTCTTGTGATTTGAGCACAT
TTGTTCTGCACAACACGTGTGTGGAATCTAAAATTGGCCTCCACAAGCTT
ATGTCGCACCACAACACACTCTCCAGGTATCACCTTGCAGTCCAGACAAG
CTCGCCTATCCATTCTCCTAGTAAGGACAAAATCAATCTGGCTAGTGTGT
TGGGTGCTACTAAAGGTGACCAGATTAGATAGCCTCTTCCTGAAGAGGGT
ATTAGCCACCAAGAGGTCGTAGGCTGAAGCAAAATCTAAGACGTCCTTAC
CCTCCTGATTTCTATCACCCAACCAAAAGCCCCCATGCACCCCCTCAAAC
CCCGTGTGAGTTGTACCAACATGACCATTGAGATCTCCTCCTATGAAGAG
CTTCTCATTGGTGGGTACGGCACTAACCAAGCACTCTAGGTCCTCCCAAA
ACTGTCTCTTAATGCTCGAGTCAAGCCCAACTTGAGGGGCATAAGCACTG
ATGACATTCAGCCATCTCAACAATATAGTCAATGTTCTCATAAGCAAATA
AAGTGATTTCCTCTTCCAAACCGTGAAGTTATTTCCATCCAGTTTGTACG
CTCGCATCAACTCAACAAACACAGCATTGGAGGCCATTGGGGTGAAGAAC
TTGCTAGGAGATGTTGTCCTGTTTCAAGTAGGTGTTCCGTCAAACAGGTT
TCGTGTATATCCCTGCAGCTATCCGGCATCGGCGAACGACACAAGTACCG
TAGGGATTCACTAGATCCTTGAGACGGCGAATAACTCTTCTCAGACGCCA
CATCATCTTCACTATCTGTCTAGGAGAACACTCAGAAGCGTCCTCCGGTT
AGATCCTTGTCACCGCCGGCGATGGTGGGTTGAACGCCGGAGACACCTCG
AGAGTCGCCCAACCCCTTCCCAACCGTCATATCACCTGTAGATCTTTCAC
AACCATAAAGAAACTTGATGTCCAACACTTGTTGTTGTACTCTTTGGGCT
TGTATATAACATTGTCTCCTACCTATGCATGTAGATGCAAGGCCTTTGCG
TTTTCTCAAAAAAAAAATTGGTGTTGATGTGCATGCTTGAGGTTTATGGG
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GTGTGAACACCTAGATATCAGTAGGAGGGAAGGCAATAGGTATTTCATTT
TATTGGAGTCCATTGATCTGCGATTCAGGTGGTTTGCTAGCTATTACTGA
TTTCATGTGCTCTTCATGTACCTGGGTTATTTCCTTATTACATTCTGGTA
TTTGTATTGGTTAAGAGCTAAGAATTGCAGATGTTAATATTAGTAAACAC
ATTTCTTTTGTATCCTGGGATTCTAGTTAAGAGTATAGGAGTCCAGACGT
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TCTGGACCCCATACACTTAAGAATTAGGATTATGATGCCCTACATGCAAC
AATTGAGTTGCCGACAGATATAAGTGCAGTGTGCTGCTGGGACATAGTTC
TGAATAGCCAGTAAAGAGTATGGCAGTGGTATATCCCATTTTATGTTCCA
TTTGGTCAAAATACGCTTATTCTTAATTTCTGATGATAGTTCCCTCTGTT
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AGAAAGCGAGAATGGCTGCATCTCAGGTCTGTCTATGTTTCTGAATACTA
AAACTGTGGAGACAAATCCTACTTTCCTATCATTGTTGACTCTGCATAAA
TGAATCTGCATTGCATTGTCCATATAGGTGAATGGCCCTGTACTTGTTGA
GGATACCTGCCTATGTTTCAATGCACTCAAAGGTTTACCAGGTGAATAAT
TTCTTTCTTTTCACTTATTAAATTAAATGAATTTGATTTTCACAGTGTGA
CATAATTTTCTTTCTTGCTGCAGGTCCCTACATGTAAGTCATTTCTTCTT
TTTACCAAGTTACAGATGACAAACACCCTTCGCTTCTACAACTTATTTGG
AGAATGCCCTTCACATATCCAGTGTAACTAACCCTTTTGTCCCTTTGGGC
ATCTTGCACATATGAATGCACAGAAAATGGTTTCTTGAGAAGATTGGGCA
CGAAGGTATGACTAACCAGTTCTTATACATTTTCCCAACTTCATGCTCTA
TAATGTTTGAGTTTGCGAATTCATGCATACTATATTTGCAATTGTAGGTT
TGAACAATTTGTTAAAAGCTTATGAAGACAAATCAGCTTTTGCTATGTGC
ATCTTTTCCCTTGCTCTTGGACCAGAAGAGGAAGCAATCACATTTGTTGG
AAAAACACCAGTAAGATGCTTCTTCGAATTTGGAGAATTCTGTCACTGTA
ATAATAATGGATAAATTAGCTAGGATGCTAGCTTCAGTCACGCTACTTCC
AAGATGCATATCCCTTCATAGCATAGATATGCTTAAACTGATATTTGCTG
GTTTGTTCTGTTTATTAGTTCAAAGTGGTGCTACATTTTATAGGGATCAG
TGTGCTACCGTTTTGGATACTAGAAAGTATCTAGTGGCCAGAAGGCTATA
AGGCTCTTACCTTATCTAAAAATAAATAAATTCTCTGGTAGACCATAAAG
GGGAGAAATGCATTACTATAAGGGCATGTACAATGGAAAACACTTGCACA
TGCGCTTATAAGATAAAAAGAAAATATAATAAAGTCGGATTTATCACCTA
AGCGCCCTGGCTTCCAACGCAAAACGCTTATTCGGGTAGCTTGCCAAAGC
AGGTAAGCGCTCGTTTGTGCAAATGTGGTGACGCTGGAGTTCCAGCGAAA
AGTTAAAAACATCCCCTGACAGCCAAACCGAGCAAGCTGGAGCTGAGCGA
GCAGGGAGGAGGAGAGGCCGGGTGGCGCTTGGGCTGGCGGCGGCTTGGTG
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GCGGTTGTCCACAAGGTGGAGGCGATCGAGCTGGGGCCTGGCCGGAACAC
GGCATGGCGGATTGCGACTGGGCAAGCCTGGGGATAGGACGGCAAGCACT
AGGTGGGAGGCTGGGTGTTGCGCATGTGTGGGAACGAGTGGGGAGGACAA
AAGCGAAGGGATGGGATCGAGCGGGGAAGGAGGCCTACGCTCGCTCGCGT
GAGCTCACTCTACCGTTCCAAATCTTCATCCAGTTCAATGGCTAGTTCAA
GGAGAAGCTGGAGTAGCTATCTACTTAGGTTTGTAATATGATGTTTTAGT
TTGATCTGTTCTTCTTTGGCATGGATTCATTTCTCGATTCTCTCCAATTT
GGTTCAATCACGCCAGATAAAAGACTACAAAAAACTCTGTTACGGATGGA
TGGAAAGCTCCCTACGATCAATCTGGATTCCGTTAAATCTGTTGAGAAAA
AGCCTCGTAGGAGTTGGTGATTTTTTTCTGTCTAGCACCTGCCGCCACTC
AATCCGGATCATGTGAGAAAAAAGGGCCTTAGCGCCTGACGTGACTTCTG
CTGTTGACGCAAACCAGAATCCCAGGATCAGATGGGATTTTGCCGTATCG
GCTGGGAATTGAAGCCTAGCGCCTGGGCTAAGCGCCCCCATTGTACATGC
CCTAAGATGTAAAGTAGTTTTTACCTTCAACCTCCATTGGTAAGCATTGT
TGCCTTGGATCATGTGTACCTTGCTTAAAGAGGCCCATGCTCAGTTTTCT
ATCATGATATCCTGATCAGAGCACTTTGAATCCCAGGAAGTACAATTGCC
ACCTTCACGAATAATTTAATGACATCTTTTTATTATTTAATGACATCTTT
TTACTAGAGATCGTTAGCTTTTGGACTGTGTTTAAGACTTCTCCATATGC
AGGGAAAAATTGTACCTGCCAGAGGTCCTGCTGATTTTGGATGGGACCCT
GTATTCCAACCAGATGGATTTGAACAAACGTGAGTGTATCATTTCAATTT
CTTTCATGCGGATCATACTGACAGCTCAATGTGTTGCATATACAGGTATG
CTGAGATGCCCAAAACAGAGAAGAATCAAATTTCTCACAGAGGGAGAGCC
CTTGCGTTGGTCAAAGAACATTTTGCTTCTGCTAACTACACAATTCAGAG
TGATGGTTTGGCTTAAATTTGTTTTGAAGCAGCAAATGAACATTATATGG
AATATGAACAAAATATTTGTCAAATGTTCCAAGCTATGAGAGCGATATCA
TTTGACTCGATAGATTCAGTATCAAGATGTCCTATGCTATTCTATTTCAC
TACACTGGTACATTTTTTGTATCATTCCCCGTCAGGCTTTTGGCTTTTAT
TTCATTAACGACAAAAGGTCTGATTGAACAGGCTCAGTAGAAATCTAGGG
ATAAGTTCATAAATACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATATTTTATCTT
CTGTGAAACAAATGTATCTAGACATCATTATGGTGGTATCTAGACACTTG
TGTGCCTTTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.