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GrainGenes Sequence Report: AE042907

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Sequence
AE042907
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE042907
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCTCTCTCTCTCTTCCCAGTTCGTCGCTCTCTTCCTCGTCTCCCTCCT
CCGCCGATTCGTGAACCAGAAACTTCGATCTTCTGCCCCCTTCCGATCGG
GTTCTCCCACAGCGCTTGGACCCGGCACCGCCGTTTAAAGACCTCCCATT
TGATCGCGCGGCGCGCCGTCTCGTGTCGTGTGGCCCCGGCAGCGCCGGCG
CCAATGCTCGGCGCGAGCAGCGCTGCCGCCCCGCCCTCTCCGCCTCGACG
CCACGTGGGCGCGGGCCACGACATCGGGTGGTGACATCACATTCTGTTTC
TTATAGGGAACCTGTCCTGTTGACGCGGAGGAATTCTTGTCCCGCTCCGC
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ACGGCTCCGGCGGTGCTAATCCTGACCGGTTTTGTAGGAGGTACAGCCCC
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ATAATTATTTTCAGCTGATTTGATTTATAATGAAATATTGTTGGCTGATA
TTAAAATAGTTTGGCTGCATGCATTCTTGGACAGAACTCTTTCCTTTTTC
AGGTATACTATGTCATATTGAGTGTCTTAATTTCTTGATACATTTATGCA
GCAGATGAGGATGCAATCATGAGGATTTCTTTGAGGCGGTACCATTGCAG
CCACCCATGGAGGCCTCAGATAAAACTTTTGCTGATGTAGTTAAGCTTTT
GACATCATGGCTGCCTCGCCGGTCCAAACCAGACAATGTCTCGAGGGACT
TCTGGATGCCTGACCACAGTTGCCGGGTCTGTTATGACTGTGATACGCAG
TTTACCATATTCAACCGCAGGCACCATTGCCGTCGTTGTGGGCGCATATT
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CAATGGGAGCAAGAGCAAATTGCTGCTGTCAAGCAGATGCTGCCAGTGCT
CAGCCCTTCCATGTCTGAGGCGAGTCTGTTCAGTACGAAGTCAACTATCA
CCATTAATAGTGTTAGCACACAGACTGGATCTTACTCTGCTGGAAATTAT
AAGCATGTGGCTCGGGCTTCCAGCATTGGTCCTCTCCCTCCCAAATTTTC
TCAAGACAAAGTTTCTCATAGAATCCAAGACAGCCATGTGCCTGAGAAAA
GTATGTCCATCATTTCAAACAGAGATGACTCTTCTTCCATTCAGTTTGGC
TATTACACAAACAGGTATTCTGTATAAGACCTCATATCTTATAACATTAC
CCACTATAATTAGAATCAGTATGTTTTTCTGTAAATACCCTTCTATATCA
TAATATGTCCTATGTTTTTCTTAAATACTATTGGTTTTATCTTCAGAAAA
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GCTTGAAAATGCCAAGTCTCATCATGGGACTTTCTTCTTTAGGAGTGATG
ATGAAGATGAAGAGTATGTTGCTTACTGCTCTGACAGGCAGGTGCAACAT
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TGCAACATACAATACATCAATATCAAGGACCGTTCAAGAAAATGTAATTC
CAAAGGAGTTATCCTCTTGTGCAGTTGACCATGGATTCCCCAGCACATTG
CCGGTCACCAGAGTGGAGGATGAACCAGAACTTGATAATAGCTCAGAGTG
TGGGGCTGCGTCGTCCATTTATGCTCTGGAAACTGCAGATGCAACTTCAG
TAGATTTTGAGAAGAATGATTGTTTTTGGATTCCCCCTGAACCAGAAGAT
AAAGAAGATGAGCTGGAAACTGATCTGTTTGATGATGACAATGACGGCGA
TGATCCTTTATCTGATGGTGGAAGGCGTTACCTTCAATCATCAAGTAGCT
TCGGTAGTGGAGAATTTCGAAGTAGAGATCGCTCAACTGAAGAACATAAG
AAAGTAATGAAGAATGTTGTTGACGGACATTTCAGGGCTTTGATTTCTCA
GCTGTTGCAGGTGGAGAATATTGCATTAGAGGAAGGTGATGAAATGGGTT
GGTTGGAGATTGTTACTTTGGTATCATGGGAAGCTGCAAACTTCCTCAGA
CCAGACACAAGCGAAAATGGTGGCATGGACCCTGCTGGATATGTCAAGGT
TAAGTGTTTAGCAAGTGGACAGCGCAGTGAAAGGTGAATTATCCCTTGTT
TTTATACAATAGGCTCGAACTAGCTACAATTCAGAACTTCATTGTCACCC
ATGAAGCTCTCTCTCTATATATTTTTGTCCCTCTTGGGTTACATCTAGTT
AGAGGTGATCCAGTTGGTACCATCAATTAGCATAAGATGACTTTGATGGT
ACATAGAGACATTGGCATCCCGAGTCCTTCGAAATCCCCATGCTCAATTT
CTGCATTTTTTGGATTAAATCGAATTTGCATTCTGATGCTGCATTTGGTT
GTACAACGCCGCACCGGCCACGCCCCAGGGCCGCCACCATGGCCACTATG
CCCTGGCCCCAGTGCGCGCACGGCAGCACGATGCCAACCTCTATGTGGCA
CCTTTCTCTGAGCCTATTTCTTTAATTTGGACACCCGAGGTGCATGCAGC
CGTTGTACACCGCGGCGTGGTCTTCTGGCCAGACTCGGGTTCAATCTGGA
CAGAAAGGCGTGGAAGGGCACACATCAGGAGGGAAGGGCAAGGAAATTAG
AAGAGAGAAATTTTCTAGGGGTTTTGTGCAAAACATTACCACATGGCAGT
GGTCAACCTGGCACGGGTGCAAGTCAAAGCTTATGCGGCGACGGTAGGAC
CTGAGATGACACACTTAACAAACTTGTAGAACCCGAATCTGCATTTTCAT
ACAACTAGGACTAACTTGACACCCCACACATAGTTTTAGGACTTGCGGTG
CATTTTACTCTTGTTTGATTATTATCTGAAGCATGTATCCATTTTCTTTC
AGCACTGTTGTAAAAGGAGTAGTCTGTAAGAAGAACGTCGCACATAGGCG
CATGTCTTCCAGAATAGAAAAACCTCGTCTCCTTCTACTTGCCGGAGCTC
TTGAGTATCATCGAGTTACGAATCAGCTGTCAAGTATTGACACGTTGCTC
CAGCAGGTTTGTGAAGCTTTTCATATTTTTCTGTTATCACTCTTAAGCTT
TGCATTGACCTTATATATATATTTTCTATAATATGCACTATGCAGGAAAC
AGATCATCTTAAAATGGCAGTCGCGAAGATTGTAGCTCAAAAACCCAACC
TCCTTTTGGTTGAGAACTCAGTTTCTCGCTATGCTCAAGATTTGCTTCTT
GAAAAGAACATATCACTGGTTTTAAATATTAAGCAATCCCTCTTGGAGCG
TATTGCTCGTTGCACAGGTGCTCAGATAGTTCCGTCTATTGATCTCTTAC
CATCTCAGAAACTTGGCTATTGTGAGCTGTTTCATGTAGACAAACATATT
GAACATTCTATGACTCCGGGTAATAAGACTAAGAAAATGCTGAAGACCAT
GATGTTTTTTGAAGGATGCGCAAAGCCATTAGGATGCACTGTAAGTGATA
TAACTACTTCCCTGTTATTTCTTCTATGGCAGCTGGGCTGCAAAAGTGCA
TGTACTAGTATATTTTACAGAAAGAGACATAATGCTACTTAGAGATTAGG
GTGATCGTAACATTAACTTGTTAGCTTACCTCCCTTGCTTGCGAATGTAT
TGCAAACCGAAAGGTCCCAAAAGATTAACTTATTTTTCTCTTAAAAAGGA
TTGACTTGTTTGGGACGGTGGCTTGCAGAACTATTTATTTCTTTTTCAGC
AAGCTACGATAATACGTCTGTACATTTTTTTTCCTGTCATCCTCCAGTTT
GTCTGCATAAAGCATTGAAACAGAATCTCTTCCTGAAAATTATCTTTTTG
GCCTATATGACCTACAGGTTATGCTGAAAGGTGGTAGCATGGATGAGCTA
AAGAGAATTAAGCATGTGGTCCACTATGGCATATTTGCAGCATATCACTT
GGCCTTAGAAACATCTTTCCTTGCAGATGAAGGTGCCACCCTGCCAGAAC
TTCCCTTAAGGTCTCCACTGACTGTAACCTTACCAGATAAGAGATCTACT
GCAGACAACTCTATTTCAACGGTGCCAGGTTTCATAATTAATATATCTAA
CAGCCAACAGGCAACTGATAGTTTTGAGCACCTTGATACAGACTCTGTTA
TATCAGCTGACCCAAGCGGTACAGCTGTGGTTGAACCACTAGTAGACAGT
GATTCTGTTACTTCTCAAAAGGCCAAATCTCGTTCGTTTGGACCTTTGTG
CACCAATGGTTGTAACTTTAACAGCAGGAATGGTGATAAACTAGAGAAGA
TCACTGCAATTGCAGATTCTGTATCCATGTCTACAGTAGCTGCATCTGAT
GTACTCACAGGTCATTCACATATATATTCTACTGGAGAGAAAAGGTGTGT
GTATTCTGGTGATTACCATGAGGATTATTCAACCAGTTCAGATGGCAAGA
TAGTGAGAGCAGATTCAATCAACTCTAATCATCATCAGAGCTTGTCTGTG
GTCAGCACAAACATCACTAATTATTCTAATCTCAAGGATCCATCTGAGAG
TTCAAATGCTTTGCCTAATGTGAGAATCATCAACACTAACAATTTGTTTG
TAGTGCAACCAGTGTCTACTCCTGCAGTACAAAATCAAGAAACCAGTCAA
GGACATGACATGTCATCAAATAAGGAAGAAGTTGTGCCTTCTGACCATCA
GAGCATCTTAGTCTCTTTGTCCATACGTTGTGTATGGAAAAGATCTATTT
GTGAGCGAGCCCACATGTTACGTATCAAATATTATGGCAACTTTGACAAG
CCGCTAGGAAGGTTTTTGCGTGAATCCCTATTTCATCAGGTTTTTATCCT
TTCCTTTTTGTTTCCTGCACGTGTAAGTTCATGTACTTCTTCCCATTCTT
CACATGTATCACGGTTGTTGCAATGATTTATACAGGGTTATCAGTGCAAA
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GAGAAAGGGATGAGAAAATTTGGATGTGGCACAGGTGTCTGAAGTGCCCG
CGGAGTGATGGATTTCCACCAGCGACTCCTAGGATTGTCATGTCTGATGC
TGCTTGGGGTTTGTCACTTGGTAAATTTTTGGAGCTTAGCTTTTCAAATC
ATGCAGCTGCAAGTAGGGTAGCCAGTTGTGGTCATTCTCTCCACAGGGAC
TGCCTTCGATTCTATGGGTAAGCTGTCTTTAGATGTTAACCTTTCCAGAC
TGAATTAATCTCGGTTGATTTTCATAGTGGATATGGAGTAGGCACCTGGA
AGGCTGGCCATAAATCCAAGGATTACGAGTCGACAAGTCGAGCCGAGTCG
TTGGGGTACCGACTCATAGACTAGTCGAGACTAGTTTAGACTACTGCTTG
ACTAGTCGACATGTAATTCAGCAGTAGTTAGTACAAAATAATATCATGTA
TGGCAACCAGATAGGAGATTAATAACTAAAACTGACATAAGTTCAGCACA
AGTTACATAACATAATAATGCTAGAATCTAGAACTTCATGTAGCGAGTCT
AGAATAGCTAGGGTTCCCGATTTTCTTCCTGAGCGCCTCACGAAATTGAG
TCAATGGACTCAAACAGCAGAACTAGCCCATGATTAGTCGTGCGACACAA
TAGACTCGAGGAAATAGTCGAGTCGACCAACCGAGTCGATGGTCAGTTTA
GGACTTGTAGACTAGTCGTTGGACTAGTCTAGACTAGACGTTGGACTCAC
ATCCTTGCATAAATCTCATACTGAATTATAAAAGATTGGGTAATTTGGTC
TCTGATGTTCTGCTTTTGTATGTAGGTTAGGAAAAACGGTGGCTTGCTTC
CGATATGCACCTATTAATGTTCATTCAGTCCATGTACCACCTCATAAGCT
TTATTTTACTCACCAGCCTTTGGAGTGGATACAGAAAGAAGTAAACGAGG
TGTGTATCATACAACAATGGAAGGCTTGGTTTGCGTAAAAATTGAGTCTG
TTTCAGCCTTTTTCAAGCATGTTAAAATTCTCTTCAATTTTTAGTATTTT
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AATTTGATAGGTTATTGACCGGGCAAAGGTTCTATTCGACGAAATATCAC
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GTGGAGTGTACCAATTATATTGCTGAACTTGAGAGCATGTTTCGAAAGGA
GAAGTTAGAATTTGAGGTTCGCTGCCTTTTGATACTGCTTTCTTATACCA
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AGCTGTACCACATGTACATACAGGGGTGAGAAAATCTGCCATCTGTTGAT
GTACAACTCGGCAAAATGTATCACTGACAAGTGAAACCCCAACTCATTTT
ATTTTTTAGAGAATAAGGCCCAGCTCCTTTCTCTCTGGTTTCATGTCAAC
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TGAGATTTAGTCCTAAACATTCTGCATATCTAGTGATAACAAACACAAAA
AAGGTGCTACCATGTCAACCCTCTTGGTGTAGACATGAAATCAACTAGAA
AATTCCAAAACATCTGTGAAACTTGCCATTGAAATTATTTGAGCACCATA
AAAAAATTCAATTCCATTCCTTTAGTCCTGCATGTATGCATTGTTTACGA
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TTTGAAAAAGGAAGTACCCAAATGTCAGCCAGACATTCTTGAGATTAATA
GGCTGAGGAGGCAGTTACTCTTCCATTCATACTTGTGGGATCAAAGGCTG
ATATTTGCTGCAAGAACAGACAAAAATCGGCACGAACTATCCAACATCAG
GCCAGGTGATAAGGAGAGAATCCATCCTGTGGATAGTGTTGCTGAGCCAA
ATGCCACAGAACAGCCTCAAAGTCTTATTAGTGGCTCTGGGGCTGCTAAT
AAAGATGTTAAATATGCTGAAAATCCTCAGGTGAGCATCATTGGACAGAA
TTGCAGTGGAGTTGATTCAAGTAATAGCTATTGTAATCTTGACCAGCGAA
TGCCCACAAGTGAGTCCGAGTTCCTCCAAAGAAACATCCAAACACCTTTG
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AGCAAGGTAACAGTGCCAGATTCTACAGCATCGTCAGAGGACTCAGAAGA
ACACGTCAGTGAAATTACACCTTCGTATGCCTCTGTGTTGCTAAACAAGC
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CAATTGTACCGTTCTCTTAACAAGCAGTGGAGTCGCTCAAAAAGGTTCGA
CGCGCTCATTGAATATACACCTCTTTATATTCCGTTCTTAAGGGCGGTGG
AGCGCCAGATTGGGCCCAAATTTCTCTTTCCAATCGGCATCAATGACACT
GTAGTTGGAGTATATGATGATGAGCCTACTAGCATTATCGCTTATGCACT
TTCCTCTCATGAATACCATCTTCAGCTGTCAGATGAGCTGGAAAGAGAAG
CAACAGACGTTCCGCTCCCACTCCGTGATTCCAGAAGTGTCTCATTAAGT
GAATCAATGGATGAAACTACTTCTGAACTTCTAAGAAGTGTTGTATCAAC
AGAGGACAATATTCTCTCCATTCCAGGAAGCAAGAACCCATCCACTCCGG
ATCCATTTGTATATGGTAAAGTAACTCATATAAAGGTGAATTTTGGAGAT
GAAGGTCCTCTAGAACAAGTGAAGTACACTGTGATTTGTTACTATGCAAA
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AATGTTTTCTTTGCAAAATCACTGGATGACAGGTTCATAATTAAGCAGGT
TACCAAAACGGAATTGGAATCTTTCATGAAATTTGCTCCGGAATATTTCA
AATATCTGTCAGAGTCAATTGTCACAGGCAGTCCTACTTGCATTGCAAAA
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TTGATGGAAGTGAATATTCCATATATTTTAGAGCATTATTAATCAATGAA
AGCAAGGGAGTGAAACTATCCCTCCATGTATGTATACTGATGTTATTCAC
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AACATTGTACTGTTTCAGAAGTAGTCGCCCAAGCTATATTTTCTTTGCAA
AGTATAAAATGCATTTGTTTATGAGCTGAGGAAATGACTAAATACTTAAA
ATTACCTGATTTAATTTTGTTTACTTTTACGCGTGATACCATGTGGGGCC
ACCAGGACCCAGTATTATGCACTCTGTGGAAAGACTTAGGGCCAGCAGCT
GCCGAGGCTTAGCTTCTTTAGTTTCCTTGTTTATTAAGTTATATAGTTTC
CAAAGGTAGGCAAGATAGAGTTGGTTAAAGATGGGAAATCATTGGAAGTT
CGGGAAGGTTTGATCTGACTTTAGGTCTAGGATCAGGCTAAGTAGCTTAT
GTGAAGGCAATCCGTGTAGCCTAGAGGCATCAATCAATTATTCAAGAACC
CAGAAAGGGAGTCTTTACCTACACAAAACCCTACCTCACCTACCACCGTG
TCAAGGTGCAGCCAGCCCACACGGCTGCGCTCTGAGGAGCTTAGGTTGTG
ACTTTACTTGGTTAGAAAATCATCAAATTACATCTGTAAAATACATGCAT
ATCGATACTATACAAAAAATAGCATTATGACTCTTAAGATACAGCTTCAA
ATACTTCTTTTTTCAAATATTAATTCTCTAAGGCATTACGTTAATTTATC
CAAGTCATCCGTTGAGTGATGGAACAACCTGAAATTTCTTTTTTCAAGAA
AACACGAAGGAGTCTTTGCGTCTCATTTCATTGAAAAGATAGAGTTGGGT
TTACAGGCCTCCTAAAAGGAAAAGGGGAAAACAAGTGATCCTGATAGTTG
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CCATTTGGGCTTCTTAATGTGATTTTTTATTTAGATGCTGAATCTTCAGA
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AAGATCAAGATATAACCCTGATTCGAATGGTAGCGATAAAGTACTTCTTG
ATGAAAATTTACTTGAAGTGATGCCTACATCCCCTATTTTTGTCGGGAAT
AAGGCGAAGCGGCTTCTGGAGAGAGCTGTTTGGAATGATACTGCATTCCT
TGATGTAAGTGCAGCTCATGTGCATACTTGATTGACATCTATTGTGTTCC
TCTGTAGTCTATATCATATAGTCCATCCTATGTGGTTTATCTTCTGCGAG
CTGTGTTCTTTCTCTACCACCATGACCATGAGAATCTATTGAACTATTAG
TATTTTCTTCCAAAAGAAAATTTTCTAGTTGTGTTACTCATAGGTCAATC
ATACTAATGACATACATATATATACATTTAGCTGCACCAGGGGTTCCGTG
CCTCTTGTTCTTTTGGTGTAAAATCTCAAGACTAGGTTAAATTATGTAGC
CATCTCTGGCCTTTCTTCAGATTTACCAGTCTGTAGCTCTGTGTCACAAC
ATAAGTCATATTGACACGGTCCATCAGTTTGAATGAAAATATGTTGGTCT
GCTCTGGTGTTATATTTGACCTGCTTAGATTCCAAGATGAAAAATGTATA
TCAGTGAATTCATTCATTTTGTTGGTAGTTTATAAACATATCATGTTATG
GTTGTCTTGTCAGAGGTGTATCCATACAATGTAGGCCCAGCATGTGTAAC
AGGTACTGCTATGTAACTTATATTCAGGATACGATCAATAATTGGAACGC
ACAAGCCAGATAGTATTTTGTTTCCCTCGTTGTTCTGTTCTTTCACTCTG
TTATTATTAATCTATTACTCATTCTCAATATTGATAACCGAAGTCTACTG
TAATCTAGGCACAAAGAGGAATATATTTTTCTCAACAAATGTGTTTAGAA
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AAATAGGTGATCTGATAAATACTTGCTCACAGCTAGTGCCGCGTCTAAGA
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ATGAGTTAATATGGCATGCATTTGATCGTACAATAAACAAGTGCAGTTTC
TTATAGAAATAACTTTGTTGCAGTCCATCGACGTAATGGATTACTCTTTA
CTTGTTGGTGTTGATGAGAAGAGGCATGAACTTGTTATGGGGATCATAGA
TTTTATGAGGCAATATACATGGGACAAACATCTAGAGACATGGGTGAAAG
CTTCAGGAATATTAGGTGGACCAAAGAATGTATCGCCAACTGTAATTTCA
CCAAAGCAGTACAAAAAGCGTTTCAGGAAAGCCATGTCAGCCTACTTTCT
TGTTGTCCCGGATCAATGGTCGCCTTCAGTAATCATCCCCAGCAAGCAAG
TATCTGAAAGCGGCCAAGATAACGATCAGTTGGTCTCCACGGGATCATCA
GGCATGCTGGATCGTTAAGATGCACGGGAATATTGTGGAACAACTCCTTT
TTCTTCTTCTGATGTTTATAGATTTTGATCTGTTGCAGTTTTGCTCATTC
TTTTTTATTTACCACATTTATCTGGTGCCTTCTTCATTCTTTTTTTGGGG
GAAGATCAAGATGTACAAAATCTAGCTGAAATTCTTGAATGTTATAGATA
GAAAATTAACAGGTGTATAGGAGTGTATAAACATGAGTCTAGTGCATTGG
GATATCATATTATCCAGAAAAAATAGAATCATTTTTGTTGCCATTGCAAA
CATTTTTTTGGCTTTATGTTTGTTTATATGGTTCAATGTATGTTATTTCT
AGGAGACTTGCCTTGTGTAGAAGAAACACATCCTGGAGTGTAATTTTGTA
TGTGAGTTTCTGGGAATTTGATGTACATCCATGGAATTAGCATGATGATG
CAAATTTTGTCTTGTGAGGGTGTAATATATTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.