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GrainGenes Sequence Report: AE007903

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Sequence
AE007903
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE007903
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCCCATTTCTCCCCTGCGCAAAATCCCCACACCCAACCCCCCTCTCCCG
CACTTCACCTATCGCCACCAATCCCTCGACGGCTCCGCGCCTCCTCGCTA
CCCCGATCGAGCTCTCTCCCAATCCCCCCTCGAACCAGCCAGCCAGCCAA
CCCTAGCTCCGTCCTCAGCTCCTCACCACCACCCCAATCCCTCCCCAATC
AGATCCGGGGAGGGGCCCTATCAGTCCGGCCTGCCGCTGCGGACTCGTCG
AGAATCGGGCGCCCTCCCGCGCGCGCGCACTCCCGGTATTGTTCCTACAC
CCCCTGCGCGCGCGCCGGATGTCTCTCGCTGCATTCTGTTGCTCGCTGCC
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GAAGGTTTGATTTCTGCCTACTTTATTGTGGAGTGGTATTACTTTAATAA
ACAGCTAGAAGTTCGTTCTTCAGGGAACCACATACTACACCAACATGAAA
CCCAAAACGTTTAGATATCGAGCAGCAGTATTATGACCCAGCTGGCTATT
GGCTTGTTATGTTCTTGTGTAGCTCACTGCACAGACTACATTTTTGTTAT
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GTAATCCATCAGATCATGCTGTTATATCAATGTACACAGTGTATGAGAAG
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CCAACGTACCAAGAAACAAGATCAAGATCAGTGTACAAATGTGAACTAGT
TATATATTTTCAGATACTTGCATTCCTAAAGAAATTGCAAATGTAAGTTT
CAAGTAGTAGCAGCTGTGTGCTACCACTGTTCCATCCCCTCGTGACTGTA
GAAGGTGGGTTTCCCACCCAAACGCCCAGACTCAACTCAGTGCATACCAA
ACCCATCTTGTCTGCTTCGGGCTTCTAGTCAAAACCCTACTCCAGTCAGC
CGATTTTTGAGTTACCTACATCTCCTGGTCCTGAAAGGCAACCTAGCCTG
GCAAGCTTACCACTCTCGCTTCCTCTGATACAACTGTTGGGCTGGGGAAG
GTTTAAGAACTACGCTATCTAGTTTGAAACCTCATTTATGTTACTGATTG
TTCATCTCAACTTGCAGGTGGCTGGTGCCGTCCATGATAGAACATCTGAT
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TCTTGGATTCCATGTTTTTTCCAACCCTATGTCCCGCTATGCACCTATGT
ATGCGTAATAGCTCGGTTAAATAGATCGTATAAGTAGCACAATTCATTTT
GCATGTGCGTGATCTTATATGTAGAACAATTCAGTTTACATGTGCTTGTC
TTTCGTTTGCTATTTTCATATGTTACTTTATTGACGGTTATGCTGATAAA
TTGATCAAGTTCTGTTGTATGTCTAGGCATATTTATCTCTTCCAGAAGGA
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TCTGGTAATGTTAAACTTGAATGGCTATAATATTCACGAGCTTCTGTAGC
TCTTTCCACGGATACCTGAAAAGGTTGTGAAAACTACAGGAGTTCCATAA
AGTACTGTATTAAATGTTGGTTGATTCTTGATATACGTGAAAACTATATC
AAGTACAGGTTCAGAGAACAAGAACTATTTGTTGTATCTTGTAATAGAGT
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TGTTGACTACATTAAGCTATTTAATAGTGTTCAGGCTGACATCTGCATTG
CTTTTCCATCATTTATAGAAACATCCGTGAAGAATTACTTCAACATTGCC
AAATGAAATGAATTTATCTAGTATACGATTGTAGCACATATTTGTTCTTG
TGAATTAGCGGAATGGTGGACCTAGCACTTATGGTGGCTTATGTGCAGCC
TGGGTTTACAGTTTAGAGTAGTAGTCTGTCAGTATGCTGTGTTATTTTGT
TGCATTTATGAAGAATGTTTGTAACTAAGGATATATGCTCTGAACTGTAG
GATGGAAGTAACAGTGATCGTGAGAGTAACGATTCACTGAAAGCTTCTAG
GAAGCCGAAGCGTGGTCGTGCAAAGCTTCAGTCTGTGTCGAAGACATCTG
ATACACGCTACCCTGATCTATTGCAATCTCAGCCTGCTTCATCGAGCTAT
GGATGCCTTTCTTTGTTGAAGAAGAAACGTTCTGGAGGTAATTTCAACAT
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AGTAGCATATTAGCCTTTGCCCTTTTCCTTTTTATATCTTTTCTTATTCT
CATTTGAATCTAATAAAGTTGGGAATAAAGTTTTATCTACAAAGGAAAAC
CAGGGGTGGGCTAATGCGTCTCAGTTCAATTGACAGTCTTCCTGCTCTGA
GAAATTGAGCACTTTGGTTCAGAGGTTCGGATCAGAAAAAAAGATATGGA
GGGAAGTCGGTCCATTGGAATTTAGGGATGAACCTATTTTAGTCGCCCCC
TCACCCCAGTTTGCAGAGCAGCAATCGAGGAGGGCGAGCGTTATGTTAAC
TAGGTTTTTTAAATAGATACAACATAGCAAGCAATCAGGAGGTTATGCAA
AATTAGTAACCCATTCATTTAGACGAGAACTCCATTTTCTCCTTTCTTTC
AATCAATCATTTTTCAATAGCAAAATCAAAGCCAGAAATAATCAAGAGAT
AAACTGTGGCCTCCTTACTTTGCACGGCTTAGTGGCAATAGAGGAGGGAA
GGGCTCTGGCCTCTGGTGATGCCCTCACTGGGGGCAGATATGGTGGCCTC
AAGTGAGAAGTGGGAGCTGAGTGGAGCCCGGGCGGACAGGATGTGCTGGA
CAGAAGATAGAGAAGGGCAGGGCTGGCAACCGGCTCCCTCAGCTGCTGAT
GAACCGCAAGGGGATAAGGCAACGGTGACTTGAGTTCTGCAGCGCTTGCT
CCTGCTCTCCCTCGCCTAAAGGAAATGGACCTGCTGATGAACTGCAAGGG
GATAAGGCAACGGTGACTTGAGTTCTGCAGCGCTTGCTCTCGCTCTCCCT
CCCCTAAAGGAAATGGATCAATCCATTCGATCCAGTGGATCAAGTGTAGC
ACACTCTTTGGCCCAAATGTTCGATCTATGCAGTTTATATATGAGAATTC
GGTTGCTAGAGTAGGTGCGGTTCTGAACTGGGACGAACCATGCCACTCCT
AAGGAAAATATAGCAATTCACAGTTTCATTCACTAAAAGCATTGAGGTCC
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GAATTCAACTGTGAGCACAAAACATTTCACAATCTACTATGAAATCATAG
GAAGGCAGCCTAGTTCATTTGGGTGCGGGAGTGGATGTGCAATCCCACCA
CCTGGGCTCATGTCAGGATGACATGAATTTGGGTTATTGTTTATACTGTT
CGGGGCTTCCCATACATATATTTTAAAAAAATTGTAAGATAGAATCCTGT
ACTATCTTTTATGGTGAACATAGTTTTGGTAAAAGATCTCGAGTTCTCGA
CAGTAGTATACTTTTCTTGGCATGTCTTGTAGCTTCAGCTTGTCTGTCTA
GGAGCTAACCTGTCTTATCCACTTGGTTTTTGTGAAGCTGGAGTCAACTT
AATGAAAAAGCCAAAAGTTGATCTCTCTGGCTTTCCCCCTATTTTTGACC
CAGTCTCCACCTTAAGATACCTGCATAACACGTGAACACAAAATGTCTGG
AATTCATCTAATTACTTGTTCTCCGAACTGTTCATCTACTTTGAAAATTT
TATTATCATCTTAGGCCAGCCAACTTTGATGTCAATAACTCAATATAGTC
TTTTGCTCCTGTAAATAATAATAATGTTAAATATATTGTATGCTTGTTGC
CATCGCAATGTAGTCCCTCTAATCTTCCTACTCCCTCCGATCCAAATTAA
CGTTCTCAAATTTGTCTAGATTCGAATGTATCTAGCACTAAAACATGACT
AGATACATTCGAATCTAGACAAATCTGAGAACATTAATATGGATCGGAGG
GAGTATTTTATTTTGTACGTGAACATGAGATTGTTCATCTTTCACTGAAG
CTACTCTGTTCATATTCTCATTTTGTATGGGATATTAATAGTATCTTTGA
TGCCTCTTGTGCTCTTTATACATGTTATTTTTGCACTGAATTTAGCTGAT
GGCATGTGTTATTATTTTCTACTCGCCAATTTAGGACCAATAAGTATTTA
ATGGTTGAAAATACGGCCTCTGAAATTTGCTTCATGGCTGCACAGTATTA
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TTGAACAAAGAAAATTAGGATTGAGGTCTTGAAACTTGTCTAGACTTGTT
TGTAGGGAACAGGCCACGTGCTGTTGGAAAAAGGACTCCACGAGTGCCTG
TTGCAAGCATGTACCAGCGTGATGACAAGATAGGTCCAGCAAATAGACAA
GCAAAACAAGATGCTACTAATGGTGACGATGAAGGTGCTCATGTAGCTGC
TCTAGCTCTGGCAGAGGTCTGTCAAAGAGGAGGCTCACCTCAGGTTTCTC
AAACACCTGGAAGATCAAGTGATCGTATGTTCCTGTCTCCTGTTAAAAGT
ACCGACAAAAAAGTAAGAACCCAGAATCTATTTCTTCTTTATCTCTAGCT
CACTCATTTTTCAAAGTAATTGCATGACCAAATCTGTATATGCTTGCAGA
ATGCTGATTCAGAGATGGGAAGCTCAAAGATGCATGGATTTCAAGTAGAC
GCTGATTATCCGGAAGGTAGCTTAGGAAGCAGGGAAGCAGAGACTGGTGA
CCACTCCAAAGATGCTTTTTATTTTATGAATAATGAAGATTCTGCATCTG
GCAAGGCTAAGCAGAAATTAAAGAGGCCTCTGAAGAGAAAAAAGAAAGCT
GCACACAAAACAGACGATCAATTCGAGGATGACAGAGAGGCTTGCAGTGG
CACCGAAGAAGGGTACAGCGCCAGAAAGGCTAAATATGAATCAGAGGTGG
ACGCATTAGGAAGTAAAGCTTCATGGCTATCTAATAAATCAAACAAAAGA
AGTCGCCAGCTATTTTTTGGTGGTATGTCTGTTCTAGCAATATCTTTTAT
TTTAAAATAGGTAATGAGATTATTGAAATATGACCATCTTCTAGGGTTCT
AGCATGGTGAAACTTTCAGTAAAGTTAATGGTTTAGTCTCATCTTTTATA
AAGTTGGTGTAGTATTTTCTCAACTTTTGAATACAATAGACATATTCATA
TTATCAAATGACAATAGTATACCAGCACAATGGACAATGGGTTGAGTTTC
TTATAGTGCAGTATTTGCTCGATTGTGTGCTGAAAATAAGTATGTCCTAA
GCTGTGATGGTTAACTATCAAATTTTATTTCAGAATAATGGTTGTCTTGT
TGGGTTGTTGCATTTGTAAAATCAACTCAATCTCCCTACCATGGAAAACT
CAAACATTACTATGTAATGATTAGTTGATTACTACACTGAAATCGATGTT
GCTATACAAACTTCGCGAGGAGGATCTATTGTTCTTTCTAATGCAGTCTG
TTCGGCTTTGCTTTTTACCCATATATTGTTTATTTTACTGTGTAATGCTT
GCTAAGTTGTAAGGGTAACTTGTTGGAATTCTTGCTTTCGTATCTATGTA
GCAGAAACCTTTGGTCCTGATTTTACCTAACTGGACTTCGTTTGGCAGAT
GAAAGCTCGGCTCTCGATGCATTACATACATTAGCTGATATATCTGTGAA
TATTCTACAACCTTCTTCCAATGCTGAATCTGGTTAGTCTTATCTCATAC
TATGGTGCTAATTCAGAAATTGCAAGCTATATTTTATTATTTAATTTCCT
TGCACCTTATTTTCTTCATTATCATCATATCATGTACTACCTCTGGCCTA
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GAATGGGCTGCGACAATTAATTAAAGCCAGAGGTAGTAATAATATTTACT
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GTTTAGTACTTGAGTTCTTGCAATTGCTATACAGTGATGGAGTCAGAACT
GATCATCAGTGGGGTTCCAGTATGTAGATCTAATCTTTTGGGGAGTCTAA
TTAAGGGAATTTTGCATAAATTCTTATACGTACCAGGACCATGTGTAGAC
CCCCACAGCTCCGAATGTCCCTACACAACTGGTGCTTCCTTTTGTCTTCT
GGAAGAAATGGATGCAGTAAATGTTTCAATAATAATTGTCATTATTGTAA
TGCTATTGATCACCTGCATGGATTGTCGACTAGTTTTCTGGGCAACACTG
TAGTTGTGCTCTGCCTTGAATGTAGCAGAGATTTGCCCTGCATGCCTTCC
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GGCCACAGTAGACTTTGTGTAAGTTTTAGCGGTCAGACCATGAAGTGAAA
ATCTCAGAAAAGTTATGAACAAAGGTGGTTTTGCAAATTTGTTTTTATTG
ATATGATAAGTTTATAACATTTTGTGTTTGATTATGCTACTTATTTTCTA
GAATCATCAGCACACATTAAGGATGAGAGCAAAGACACTGAATCCGATGA
GAAGCCTCATGCAGCAGTACCATTTTTTGAGAAAAATAATAACTCCAGGA
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AAAAGAAAAGGAAGTCTTCCACAGGAAAGGTACCTCCAACATTATCACCT
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CGCTTTTTCGTTTGTTGCTCCCGATAAACATTTTGCATTTAAACATGAGC
CTTCAGTTGACTCTTTTGCATTTAAGTCCAATGTGAAACATTTTTCATTT
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TTCATTCGCTAGATTAACACTGGGAAAATAGTGGCTTAAGAATAGTCTCT
GCGAAACATACTCCAAAAACCTAGTCGCATTGCTCAGATTTGTCATTTTC
TCTTGCAAATATTTTTTGTCAGTCAACAAGTCAGTCTAACAAGGATATTG
GTTCTGTCTATGTATCGTCTGCGACAGTAAGAGATTGCCAAAATATGTTT
TGGTCAATGTGAACTTAACTCTTTATCTAACTTCCACCACCATTTAGTAA
AAATAACAAAATGTAGCTTTCTCAGATCCTTAATCCTTAAACCTCCATTT
GGGACAACATACCTAAGAGAATGGCACTATTTTGTAGTTTGACCTTGTTT
CTTAAGAAACTTTCTCCTTCTCTTATCCATGTGGTATATAGTTTTTGAAA
TCAATGGGATATAGCAAATGGGGAGGCCACTAAGATGTACCTTAATCGAA
GTAAATTTTATTGCTGTTGAGGAATTTTCCTGTGTGCTTAAATGGCACAA
TATAAATTTGCTTGTATATCTGCATTTGCTAGGTTTCTGCAGAAGAAGGG
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CAAAAGAAGCCATGGATAATATGGAGACAACACAAAATGCAATAACTCAG
CAATCTGACTCGACGTCGAAGGCTAAAAGCCGGCGCAAATTAGGCATTTT
GAAAGCACTTGCTCCGGAGTGTAAGCCTTCTGAGGGTGCTGATGATTCCT
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CACTGTTTATCTTCCCGTTTTCTTCGGAGATGGTGCATGTCTGAATGGTT
TTACAGTGCAATTGATTACCCATGGTTTGCGAAGAGTGAATTTGTCGAGT
ACCTGAATCATGTTAAGCTGGGTCATGTGCCAAGGCTGACTCGTGTTGAG
TGGGGTGTTATAAGGAGGTCTGTTATCTTAAGTTGATTTGTTTGCTTTAG
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GTCGATTGTCGAAGCAGTTTTTACACGAGGAGAGAGACAAGCTTTCTCAG
TATCGTGAGTCAGTCAGGCAACACTATGCTGAACTCCAGTCTGGTGTTCG
AGAAGGTCTACCGACTGATCTTGCTCGGCCTTTAGCAGTTGGACAGCGTG
TTATAGCCTGTCATCCCAAAACAAGGGAACTTCATGATGGCAGTGTTTTG
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TGTTGAGTTTGTGATGGTAACCAATGTCTTATCTACTTTCTGGTTTGACT
ATTTCGCTGGCATGTTTTATTTTATGTCTTCTGGTTTAAAACATTTTCTG
CCGATTGTTTAGATTTCCTGGATTCTATTCTGCAATGTATGATTTCAATG
AACTGATTCTCTTCACTTGTCCATGTGGATGAAACAAAAAACTATGAGTC
ACTAATGCTGAACTTGAAAATTAGCAGAATATAAACATTTTTGTTTTGTT
TTTGTTCCTTGCTTTTCACTCTTTGCATTTGAGTATGCTTTGACCAAGCA
CACCCATGGCTTTGCTTTAGTACCTTGTTGGCATCACTTTTTTCTGCTGT
TAATTGTTTTTTTGCTGTGAATCTTTAACAGTTGCTTAGTTCAGCCACAA
AGAAATGTCGTTTTGTACACTCACATAGTCCCCAGAACACAATTTTGATT
TTCAACCACAAGTCACAATCCAAATACACCCTATGCTTTCATGTGATTTG
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GCATTCGGATGGGAGAATTTTCTATCTGGGTGGTTTAGAGCAAATGATTC
CTTTTCATCTCCATTCAAATATAATACTCCCTCTAGATACATTCAAATCT
AGACAAACTCAAGTCAGTTATTTCTGGACGGAGATACATTCAAATCTAGA
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TGTTAATATTGAGGAGCTTGTTATGTTGCAGGATATTGATTGTATGCCAC
TACACCCACTGGAAAATTTCCCTGAATCTCTCAGAAGGCAAAATATCGTG
AATAAATACTGCAGCAGCTTCTCAGAAGTAAAATTTGAGGATCAATCCAA
AGAGTATGGTGGTGGAGGTGCAGCAAGATTCACACCAAATGTGAGTTTCG
ACAGTGCTGATGCAACTTCCTTTGTACTTTCTAGTCACCCAATAAGTATT
CTAATGAACCAAGCTAAGGTGACAGCATATTCAGTGGAAGCTTTAAAATG
TATGTACTCAATGTGGAATAACCTAATTGTTTTCCCTTTTGGGATTTCTG
CAACAGGGAGACACATTTGATTCAGTTGCACACGCCAAAACTACAGTAAA
TGAGGCTACAGTTGCTGCACAACAGGCAATGTATAGCCAGCCATGTACAC
TGTCACAGCTACAGGAAAGAGAAGCAGATATAAGGGCTCTTGCTGAACTA
TCACGTGCTCTTGATAAAAAGGCAAGTGCAACAGACTTGAGCCTTGTGAT
TGTGTTTCTCTAGTGTTTGAAGATGAAAACGGATCCACTTCTGTTTTTTA
AAGTTGGAAGCCCCAGTTGATGATTGAATTTAGATGAATCGATACAACCA
TACGAGTTTGCTTTGGTTCCCACCTCATGCCGTTATGTAGGGCTCTAGGA
TCGTCCAAATACCATTGTGGGGCAACAGTGTCCAATAATAATTTATTGGT
TACACATGCTTTAGGAATTTTACACGATCCAAGTGCACAGTATTTATCTC
TGAACTATTTTATCTTTTGTAGGAAGCTTTGCTGGTAGAGTTGAGGCACA
TGAATGAAGAGGTGTCTGGAAAGCAAAAGGATGGAGAAACTATTAGAGAT
TTGGAGCACTTCAGGAAGCAATATGCCATGGTGCTTGTACAGCTAAGAGA
TTCGAATGATCATGTAATTCCCAGTTCTAGATGTCACTTGCAGTAGTTTT
TTGTGCGGGTTTCATGCACTTACAAGATTCAACAATATATTTTCATACTC
AGGTGGCTTCGGCCTTGCTTTCTCTGCGGCAACGTAACACATTTCATGGG
CAACCAACACAGTCATATCCTAAATGCACGGAAAATGGTGGAGCTTTTAA
TAGAACACCAGACACATGTAACCTTTTTGGTTATATTAATCAGGAGTCTG
GATCCCAAGTGATGGAAATTATTGAGACTTCGAGGTCCAGAGCTAAAACG
ATGGTTGATGTTGCTATTCAGGTTAGATACTCATACCTATTTGTATTTCT
ATCACTATCATGTTAGTTATCCAGGCCAGCAGTCCTAGATGTTCACCATC
CACATCTGGTAGTACAGATCAGTTTCACTGCATGGTAATAGTTAGAAGTG
TATATGTTGTCAGAATGCAGAAAGTAAACTATTTTCAACCAGTTCATGAA
ACCTATACCGCTCTTCTATCTTCACAAGATCATATTAATTTTAAAATATT
TCAAATTGGCAATCTAACAGTAAATATTGAGGTAATGATAAAATACGTGA
AACTAAAAGAGAGTAAGTAGCAAAGAGAACCTAATTTTGTTTCAACAATC
ATATATGTTCGGTTCAGTCCTTCAGGGAACTAAAGATTCTAGAATTATTT
CGATTAATCACCTGCACATGATTTGTTGATGATTTCCTCTTTCATTTTTG
CAATCAATATTCTGTATGCTGCACCCTTGAATTTGGTTCATTGTTGGATG
CGTGGAGCATATAGCTCCTAGATTTTTTTATGTCTGAAGCATTGCCTATT
TTATTCTTTCCATGTACTTTTGGTGTGAGTGAAGTAGAAAACTTTGCTTT
GTTTTTAATTTACATGCTGTCCTTTTTCTGTGTAACCAGGCGATGTGCAA
AGTAAGTGACGGGGAGAATGCTTTTGCGAAAATAGGGGAAGCACTAGACA
ATCTGAATATCCGTGGCACCGGCTCTGGTTCAAGCATACTAGGCATAAGG
CGGATACCTCCCGATTCGGGACAGGCAAATTCAGCCTGTCAAGATAGCAG
CACGTCTGGCCGCTTTGACCCTGCGACAACTAATATTTCCAGTCCTCGAT
TGCCCAACGGCCGTGATTCCGAAGCCCAGTTCCCTTCAGAGTTGATTTCA
TCCTGTGTAGCTACCATCCTTATGATACAGGTAAACCATAGTGCATATTC
TTCGGTGGTGATGTGTGTGTCTGGTGGTTTATTGTTGGATCCACATCTCA
ATCTTTTCAATGCATCAGAATTGCACGGAGAAGCAGTATCATCCTGCCGA
AGTGGCTCACATTCTCGATTCAGCGCTCTCGCGCCTGCAACCGTGCAGCT
CGCAGAACGTCCCGATCTTCAGGGAGATTGAGATGTGCATGGGTATCATC
AAGAACCAAATGCTGGCGTTGATACCCACTCCTAGTGGCTAGCTGTGACA
TGGCTAACGTTCTTTCTTGTGTTATACATATGTAGGGGGTAAAAAACTTG
ACAATGAACGTGCTTATGCGGTGTGTATTCTTAATCTTACAGCCTGTATA
AGGTGTAACTTATTAGTTATTGTTATATATTTGTTGTATTCTAGTATTAT
TTATTGTCGTTGACTGATGGAAACTTTACATGTGTGCTCTCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.