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GrainGenes Sequence Report: AE040050

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Sequence
AE040050
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE040050
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGAGGTTTCTCCCCCCCCTTCATCTCCTCAGCTTGCTCCCACCAAATTC
CGACCGCCGGAGCGCAATCCGAGCCCAATCCGCGCATGCCGCTCCTCCTC
TCCCCCATCTCCACGTGCGCGCCCCCGCCGCGGCCCCGCCTCCGCCGCCT
CTCGCCCCCGCCGCCCATGGTCGCCGTCGCGCCCCCGTCTCGCCCCGTCG
CACACCTCCCCTCCCTCTCCATCGGAGCCCCGCCGCTCCCTCCCCCTGCC
ACGGACGGCTTCGACTGGCTCGACCTCTTCGCGTTCCTCAGCTCCCCCGC
CGACTCCTACCAGATCCCCCAGCCGGAGACGGAGGCGGACGCCGCGCGGG
CGGAGGAGGAGCTGGAAGCGCGGGTGATGGAGGAGCTGGAGAGGGTCGTG
GAGCGCGGGCGGGCGAGGCGGGCGGAGCACCGGCGGCTGCGGCAGCGGCA
GGTCAAGGCGGAGACGGAGGCCTGGGCGCGCGCCGCCGAGGAGTACCGCC
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TTAAACAGTTGAAACTGCAAAAGTTGGATTAGGATTCATCTTACTTTGGC
CGAGGCCTCAGCTATTCTTCTTGTGCATTAGATTTGAATATGTTGTGAAG
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TCTTCACTTTTTCACTCCAGTTTTCATCACAAAATGTTTCCTCTAGGGAT
AGTTGATTTTTCCGTGCGCTGAATGTTAGTTTTTGTTCTGCAGTTCAAAG
TCCAGGCTTTCTTTCAGAAGACTAGGAAAAAATCTAGCAGCAAAAATGAT
CCAGCATTAGACAAGGAGCAGGCCAAATGCCGGAAACTTGTTAAGAGTTT
GTTGAAGAAGCGAAAATTGACTGAAGCACAGAAGCTTGTGCAACAGGAAA
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AATCCTCCTTTTGTTACTGCAGTTAGGGACTCGTCTTATTGAATTGTTAT
TGGATTCGGCATTCGTGCAGTCACCGGCTGACCAAACACCGGACAGTTCT
CCTGATTTTCGACCTGCATTTAAGCATGTACTGCGAAAAGCTGTAGTAGA
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CCGTGTGTTCGCTCTGACATGCCCTGTTGTGTCAGTATCATGTGCTTGCT
TAGATTGGTTTGATGTGTTCTGACATTTTTTATCAAAGAGCAGGAGACTA
AAGAAGAAGCACTTCGTGATAGAGTGTGATCCTCTTGTGCATGAGGGGTT
TGAAAGCACAGTAAGTTTGTTTTGCACTGCTATGCTCTTCTTTTTTGGCT
AGATATAGACGTTTGACCCTACACAGTTGTTTCCTTCTGTTTTTTCTTAT
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TGAATTTCTTTCAGGCTAGACACATGGAGATACCGTATCTTCCTATGCTG
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AATCAAGATTCAAAATAGCAATTTGTGTTTTAGTTAGATGACATAAGTTA
TTGCATCTTTTATCTGATGATCATTTTCCAACCATGATTGTTTCAGCTAT
GATAAAGGTGGACACCTTTTTCTGCCTTCATATGTTATGCGGACACATGG
TGTGAAGGACCAGAAGGAAGCCATCAAGAGTGTTCCAAGAAAACAGCTGC
GAAAAGTATTTGAGGTGTGCTGGCCACCCATATTCGACAGTCTTCATTTA
TATTCCTGAACATGTTTGTCTTGGGATAGTGGCACATCATCAACACTTTC
TATAAGTTCTTTCTTACTATAATGAGTGCTAGTTTCATAACAGTATGATC
TAAATACTCATCGTGCCTTTTATGATTATTTCATTGATGTTTATTCGTTT
GTGCCTGCTTAATTTTAATGAATGAAAGGAGTCTGAACTATGAAGTATTG
TCATATTGGCAGGCATTAGATATCCTTGGGAGTACTAAGTGGAGGGTGAA
TAGAAGAGTACATGATGTTGTTGAGACTATTTGGAGTCGTGGTGGGGGGA
TTGCAGGACTGGTTGATAAGGGAGATGTGAGTCAAGTGCATATGGTTAAT
TAGGGCTGCTCCTTTCAGTCTTTCATAATATGCGGCCACATGTGTTTTTA
ACTACTTGTTTGTGCTGTATAGATTCCTCTACCTGAACAACCTGAAACAG
AGGACCTAGATGAAATCCAGAAATGGAAGTGGAGTTTAAAGAAGACAAAT
AAAGCTAACCGCGAACTGCATGCTGAACGATGCGATACAGAACTAAAACT
CTCTGTATGTGTTATAAAGAGGCGTTCTTCTTACTTAGATACTACATTCA
CGTTTTTTAATATGTTATGGTGTTACTGAAGCTATACCTTTTTCTACCTT
CCTGAATAGGTTGCTCGTAAGATGAGAGAGGAGGATGGTTTCTATTATCC
TCACAATCTAGATTTTCGTGGTCGTGCATACCCTATGCATCCACATCTGA
GTCACCTAAGTTCAGATCTATGCCGGGGTGTTCTAGAGTATGCTGAAGGG
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CAAATATGGTGGTGGCATTGAAAAGCTTTCTCATGAGAGCAAGGTAGCAT
TTGTGGAGAATCAGTTGCCTGATATATTTGATTCAGCAGCAAATCCTGTT
GACGGGAACTGTTGGTGGATTAATGCCGAGGATCCTTTTCAATGTTTAGC
TGCATGCATGGATCTTTCTGATGCCTTAAAAAGTTCATCACCTCATCGTG
CTGTCTCCCACCTACCCATCCATCAGGTATTGTATTCGTTGAGAATGAGA
CACACTGCACGCTTCCGCAGGTTTCAAAATTAATTAAAATCATCACCTGT
AAATGCACGTAGACACGTGGACGCTCTATATCCTATTCGTCAGGTATTGT
ATTCGTTGAGAATGAGGCACACCGCACACTTCTGCAGGTTTCAAAATTAA
TTAAATCATCACTTGTAAATGTACGTAGACACATGGAAGCTCTATATCCT
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TGAGGGTATCAGTCAATTAGTCATGCCTTTGCTATAGAGGAAGTGTCAAC
ATTTGCACAATAAGTCGATGAGTTGCTTAATGACATACTTCTTTTGGTAC
ATCCACATTCATGTATATATTGTTTTATTCTGAAAATTAAGTTACTCAAA
TGGGACATTTTAGTTGCTTTATCTATAAGTCAATCTTGGCTGTTAATCAA
ATGATATAGCTCGCTCTAGCAGTTTTTTTTATCACGGTTACCCTTTCTAG
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CTCCTGATCAGACTATGCTGGCTTTGGTGTAAGGTCTATGCACATGTACG
GACTCTCTACTAGTTGACAATGTTCATTTTTTCTTACATTTTAGAGGAAG
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TTTCTCTTAAGCTTGAAATCATATTCCAAATCTAATTTATATGTCCTTGT
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ATTCATAAGCACTGAATCTAATAAGAATAATTGTAATTTTGTTAAGCCTA
GATGAGAATGGAACATTGTTCAAGTATACACAACATGAACTTCTCAACAT
AGTCATTGCATGATGCTCTAGTATTTAGTTGTGGCAGCAATTGGTTTTGA
CATATCAGTACTAATTGTTGGTCACATTTTCATCTATCAGGATGGTTCAT
GCAATGGCTTACAACACTATGCCGCTCTTGGAAGAGACTACGTAAGTTTC
CCTCTCTGCTATATGAACTGGGCATCACTTGGCCTGAGCTTTTTTAATGT
GCTTGTGGTATGGTAAAATAGAACTGGCACTTTATGCTTATATGTAATTC
GATGGTCAATTCTACAGTCAATATTTTTTATTTCAACATAAATTTCTTAC
TGCCTGCAATTTATCAGTAACTGACCAGGTCACAAAACATCTGTATTCGT
TTGCATGTATTTTTTCATGAAATTATGTAGTGGAACTATCCATATATAAA
CACTTGGCACTTGTTTTGTACAGATGGGTGCAGTAGCTGTCAACTTGGTT
CCTGGAGCGAAACCTGCAGATATCTACTCAGAAATAGCTGCCAGGTGCCC
CCCACAGGCTAGCCTACTAGGCGACGCTCAGTTCTCCTTTACTGCAATTA
TTAAATTGCGTTAATAGATTATAGTATTTTGCTCCTGTCTCTTCTGTGGC
ATCTGACAGTTAACTCAGTTTTTAGATTATTGATTTCATAATGCATTTCC
CTAGTGCTGAGTGACACTCAGGATGTAAATTGATAATGCTTTTGCTTAAA
CATGACTGAAGGGTACTGGATGTTGTACGGGAGGACTCAATGAAGGATCC
TGCTACTGACCCGAATGTTCCATTAGCAAAGGTTTTAGTTGATCAGGTTA
GCGTTCTCCCTTACCCCTCTGCCTAAATTAAAAAATATTCTTCTTCATGT
ACTTTCTTTAACAAAACAGTTGAAGACCTGGACATTGTTAGCTTACAGGT
GGATAGGAAGCTGGTCAAGCAGACAGTGATGACGTCAGTTTATGGTGTCA
CATTTATTGGTGCTCGCCAGCAGATTATGAAGAGACTTCAAGAGAAAGGG
CACATTACAGATGAAAAATTGCTCTATAATGTGTCGTGCTATGCTACCAG
GGTAAGTGCTTTTCTTGCATCTGACAGACAGGTGTTTTTGCCACTACCTA
TTGATCGTGTTGGAGAGACAAGAACACGCTGTGACTGTTGAATCTGTGAT
GAAGGTAACTTTGGATGCACTAGGACAAATGTTCCAATCTGCCCGTGGTA
TAATGGCATGGCTTGGTGACTGTGCAAAGGTATACTACTACCATATTTCT
GTGTTGAAACGTATTTTGCTCCACTGGTATAAAAGTTGACAGGCATCCAG
TTTTAACTTGTGGCACTACACTTCTGTCTATACATGCTTCTTTGGTAGTT
GACTTGAGATATCAACAGTTTCTCACCGTATCTCAATTCCTCATAGATGA
TTGCTTCAAAAAATCAACCAGTCAAATGGACAAGTGCTGTTGGTCTTCCA
GTTGTTCAGCCCTACAAGAAATATAAAAACTATATGGTGAGCTACTTATC
AGCTGTGGCACATATATGTGCATTTGTTTTGTATATCTATACTAAGTAAG
CACTATACCTATATTCTTCATATGTGTTGGCTGTGCATTTTTGCTTTGTT
TCCTTGAGAAAGCATTCTTGCTCATCTGTGTCAATGCCATGTTTGTTATG
CACCTTTCAAAGCATCACTGCACTTCCACTTGAAGAATACAATTAATTCG
TACATGGGTACACACTTTAGCTTATTGTGATTTGATATGGATCATACATG
TTTTAATTTTCATATAATCCTTTCAAAAAAGTTTGTCCAACTTGTGGAAG
GGGCATTTAGGAATGGTTGGGACACATTCAAGATAAAAGTTTCAATTGCT
TCCAGACACGCTACTATTTTGACTTTATTGCCATTCTGTAAACACTTTGT
GTTATCTGTTTCACTTTCATGCAGATACGAACTTCCTTGCAATGTCTGGC
GTTACGAAAGGAAGGGGATGCAGTGAGTAATACTTTATTCATTGATTCCT
TGCCTATTTCCATTATCATGGTTAATTTTTCTGTTGTAAATTTCAGATCG
CAGTCCAACGACAGAAAGCAGCTTTTCCACCAAATTTTGTGCACTCTCTT
GATAGTTCACATATGATGATGACGGCGATTACTTGCAAAGAGGCTGGTCT
TCATTTTGCAGGTATGTTCTCATTTCTGGTTCCATTGCTAGCATAAAATT
CTATGGAAGTAAACGAACCGGATTACTGTCTAAGATCTACTACATTTAGC
TAAAATTGAACTTCATATATATGTCATGTCCATGTTAACCTTTAGCAGCC
CTGAATAAAAATGTTATACCTGCTACTTGGGTCTGGGTATGCATCCAGGC
AGCACTTCTCCTTGCATTTTTTATCGTTCTATACATCCCCGTTGAGACAA
TGTGTTCTGTCCATAAAGTATGAGATAAGTATAAGGTCGATATAAAACGA
AGTTTTTGGTAAATCATGAATAGTAGGTGCCGTTTCTTGCTGCTAGGTAA
TGTGCGATGATCTAGATAATTATAAAGTGTTGTGTCAGTAGTACTAAATA
CTTGCTCTCGGCATTTTGCAACTTGATTAGCGTACGTTTTTACTAAAAAA
AGTGCCCGCAATCCTCAAGCACACTTCTTTACCTATTATATATTCATACC
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GTCATGATCTCCTTGATGTATCAAACAGCAAATACATAATGCAAATTAAG
TTGACGTTGGATGTTGACTTCAAAAGCTTTGTACTTTCATTACTTGTGAT
TATGATTCTTGTCCGTAAGCAATTCATGTTGCCTTTCTCCGACGTGCTTT
GGCTGCAGGGGTGCATGACTCGTTTTGGGTGCATGCATGTGATGTTGATA
AAATGAATCAGATCCTGAGAGAGCAATTCGTGGAGCTGTACAGCATGCCA
ATTCTTGAAAATGTATGCCTTCGGAACCTGTCTATCCAGTGTCTTTTAAG
CAATACTTTGTTCTTCATCTGATTTATGATGACCACCGCTTATCCTCTGA
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TCCGAGGCCACTATTCACAACACAATCGTTGTGTGCCGGCCAGTGGCTGA
TGGGACAAGTATATCCAAAGCTGAGTGTTGCAAAAAAATTGGCGTAAGAA
GCAATTGCAGCAGCATGTCCATTACAGCCCTGTGACACCAGACACCAGAC
TTGGCTATGCACTCAGCAGTTGAAGCTGGTAATACACTGGGAACAGAACA
AACAAGGTGTTTCGGCGTCGAAAATCAACTTGCTGGACTCTAGAACCAGG
ACCATGCCAAATGGTTACAAGAAGCCTGACCCGAACAAGCCTCGAGTAGT
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GTTCTCTTAGGAATTTTGTAGCCATCACCCTGTAATAATGTGTAGAGTTC
GAGTGTCAAACAGAAACGGGAGAAATGTATATGAGATCCATAGAGATGTT
TTTTGACATGAAAAAGAAATGTACATGAAAAAGTTTTGACTTGGTTGTTT
CGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.