Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE039007

[Submit comment/correction]

Sequence	AE039007
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE039007
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGCGATTAACCGCTCTCTCTCTCGCGCGCGCGACCAAACCAGTCACTGT CAGTCCCCTCCTTAAACCCTAGTCTCTCGTCGCCGCCGCCGCCACGCCAT GGAAACCCTCAAGCGCAAGGCGCCGGACGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCG CGGAGACCAACTCTCGCGCCGACGCTGACTCCGTGCCGCCGGACGCCCCT GCCGCCGCCCCCGAGCGCGTCGCCTGTGTGCACGACGTCTCCTACCCCGA GGGCTACGATGCGTCCACCTCCGGCTCGCGCATCGTCGCCGGTGGCGGCG AGGGCGCGGGACCGGCCAAGACGTTCCCGTTCCCGCTCGACCCGTTCCAG TCCGAGGCCATCCGGTGCCTCGACAACGGCGAGTCCGTCATGGTAAATGT TTACAGCAGCTTCCCGTGCTAATTAAGCTTCCCCTTAGCTCAGTTATCCC CATCAATTCACTCCCGCTGTCAAAAAATCTGGTGCTTCCTTGCTCTGCCC GATGGAATGGGCAATTTGTCTTGCTGTTAAAGTTCCCAAATTTTAGCTGT CTGCCTTCCATGCGTATCTATTTACCAGGTTTCGGCTCACACGTCGGCAG GGAAGACGGTGGTTGCGCTGTACGCGATAGCGATGTCCCTGCGCAACCAG CAGCGGGTCATCTACACGTCTCCCATCAAGGCCCTCAGCAACCAGAAGTA CAGGGAGTTCAAAGAAGAGTTCTCCGATGTCGGCCTCATGACCGGAGATG TCACCATCGAGCCAAACGCCTCTTGCTTGGTACTAGCCCCTTCGCGACCT TTATTCGAGTTCGCTATTTTCTATTTACCTATACTTAAAAGCATGCTCGG AAATGTAGGTCATGACCACGGAGATTTGGCGCAGCATGCAGTACAAAGGG TCTGAGGTCATGAGAGAGGTGGCTTGGGTTATCTTCGACGAGGTGCATTA CATGCGTGATCGGGAGAGAGGAGTGGTGTGGGAGGAGAGTATTGTCATGG CTCCCAAGAACTCGCGGTTTGTGTTCCTTTCGGCAACTGTACCTAATGCC AAGGAGTTTGCTGACTGGGTAGCTAAGGTTTGTCTGCACTTTCCTCTCCT TTTTTACCTTGCCTTCCATAGTTCACAAGAAATCATAAGAGAGTTTTCTG CTCAATAAATTAAAAGGACATGCACATAAGTATCATTATGTCGATGCGCG TAAATATCTATTTCCCCAAATGGAATTTGATGCCATACATGGCCAAGCAT CCATCTGTACCTTCAGCATATGTGCTTCCTGCATAACCAAGGACAGTTTT GTTTCTCAGGTACATAAGCAACCTTGCCATATAGTGTACACCGACTATCG ACCTACACCTCTCCAGCACTATGTATTTCCTGCTGGAGGTGATGGCTTAT ACCTGGTAGTTGATGAGAATGGCAAGTTCAGAGAGGACAGTTTTCAGAAG TCTCTGAATGTCCTTGCACCTGCTAGTGGTGGTGACAAGAAGAGGGAAAA TGGGAAGCGACAAAAGGGCGTCATGGCAGGCAAACCTCATGAGGACAGCG ACATATTCAAGATGGTGAAAATGATAATTCAGCGGCAATATGACCCTGTG ATTCTTTTCAGCTTTAGCAAAAAAGAATGTGAATTTCTTGCTATGCAGGT AAGTTCGTTTCTAGATCAATAGTCGATTCACATGATATAAGTGTTTTGTG GCTTAAGGAATTAAATGTCTTAATTGATTATGACTTCCCTGCCTGTCTTA TAGATGGCCAAAATGGACTTAAATGGGGAGGATGAGAAAGTGAACATTGA AACCATTTTTTGGAGTGCCATGGACTTGCTTTCAGATGATGACAAAAAGC TTCCCCAGGTTTCAAATATGCTTCCCTTATTGAAGCGCGGCATTGGCGTG CATCATTCTGGTCTGTTGCCCATTTTAAAGGAAGTCATTGAGATACTTTT CCAAGAGGGCCTCATCAAGGTTAGCCAATCTTATTGATCACTCGGCTTCC TGGGTTGCTTCTATTTTCTTGCCTCAAAACTGCGTATATTGTTGTAAGTG TGGTAGTGTACCAATGCTCAGCCTAGTTGCATTTTACTTTTTTTGGAGTA ATAACATTATGCCCTTCTTGCTTGAAGATAAAACTGTGTGCCTTAGAAGG TGAGAGTGTAGTTCTTGGTTTCACACTATAGGAACATATGATGAATTAGG TCTTTAGGATAGTTGTTGCTGAATTGTAGTTTTGTAGTGAACATGGAGTA TTTCTTTTCTTGAATTTGCAATGCAATATGTGTATGTTAGATTCTTTTTG TAATCCTAGGGCTTCTATGAACAATAGCACTGTTAAAGTTGAATCAAAAG AAAATGAGTGGTCTAAATATTGTCAAGTACTTATTTGTCTATATTGTGTG ATATGAACTGATGATTTGGACCTATTTATTTTATTTGAAATGTAAGTGTG TATTCTGCTTTGTGCCTTCTAAATTTCTTGCTGACATTGAAATCTGGTGT TGTAGTGTCTGTTTGCCACAGAAACATTCAGTATTGGATTGAACATGCCT GCAAAGACTGTCGTGTTCACCAATGTACGAAAATTTGACGGAGATCGGTT TAGATGGTTGTCAAGTGGAGAGTACATCCAGATGAGCGGCCGTGCTGGCC GTCGAGGTATTGATCAGCGTGGTATCTGCATATTGATGGTAGATGAGAAA ATGGAACCCTCAACAGCCAAAATGATGCTAAAAGGAGGTGCTGATAGTTT GAATAGGTCTGTATCATGTACTCCTTGCTCCTACTTTTATCTACAGAATA ATAATGTACATATGTCCTGGCTGAATGTTGTGAATAGAAAGGCCACTTGG ACCTGGACCAAGACTCTGAAGTCTGGGATTGGCCTTCACAGTCTGATGAG TCACTTGTTTAAGGCCATAACTACGGCGATAACTTAATAATGCCGTCTAC ACATGCTATGCTAGTTCCTTGCATCTTGGAATCTTGAGTTAGCATTGCTT AAGTTCTCATTTACTGTTTCTTCGAGTTGTTTAAAGGCACATTTTTCTTC TATTTTGCTGACTCTCACATTATTAACTTGATTAGTGCCTTTCATTTGAG CTACAACATGTTGTTGAATCAAATGCGCTCCGAGGATGGTGATCCAGAAA AGCTTCTTCGGCATTCATTCTACCAATTTCAAGCAGATCGAGCTCTCCCT GATCTTGAGGTTTGATGAAATGAAATTGTTTATGTGTTTTTCCCTTCAGA AATTATGGGAATCTGCTGGCTGCCTCTTCTGGTCTGTTCATTATTTATCC TTGTAGCTAATCTTGGGAAACATCTCTGTTAGCTTTGGGTATACATGCAT GTTCTTTGAGTCCCATGTATTTAAGGAATATTATTTGGGCTCGTCCCTAC TGTTTCCATGAAAGTAAATAAAGAAAGAAGCAGGGAAAACGTTCCTTCCT GCAAACAATGTGTTTTTGACTTGCTTTTACCCATGTATGATCTAGTTGCA TGCTCGGAAGATTCTTCAGAATGCTGCCCAAACTGTGTTTTTTTGCATTC TCAAGTGCTTCACACATGCATACTTGCACTAATACTTCTGTTGTAAGGTG TCCAGATATCGATGTCCCTAGCCAGCCTGTATACCAGTTCATGTTCGTAA ACTGGCTGTTATCAGTTATCAATTACCATAGCAGTGCTTTTGGTTGCCAT CAAAATAACTTTTACCAACAAAACCCCCTTTCTACTGAAGCATTATATCC TAGAATAAACTTTCTGACATTCTCTGTTTGATTTTTGTGCAGAAGCAAGT GGGAGAACTGGAAAAAGAGAGAAGTTCATTGGTTATTGAAGATGAGGAGA GCGTGAAGGATTATTATGATCTCTTACAGCAGCACAAAACTTTAAAGAGT GATGTCCGTGATATTGTACTTTCGCCAAAATATGCTCTGCCTTTCTTGCA GTCCGGTAGGCTTGTTCGTGTTCAATACAGTACAGATGAGCAACCCACCT TCTCTATTGATGAAAATGTCACATGGGGAATTATAATAAACTTTGAAAAG GTGAAAACCAGTGTTGAAGGTAAATATACCCATCTTGGTTAGTTTCCCTC TTCTATTCACTGGGTTTGCTTAAGTTGTTTGGCAGTGGAATTTGATAATC GATGTTGTAGTTGAAACACTTTGGGTGGATCTTCCGCTGAAGATTAGTCT CAAGCAGAAGATATGCCAATTCACGAATCACTGCAACAATATTCTAATAT GTTGCGATGCATATTTTTCCTATGGCCTTGTTGTCTACCCTTTTACTCTC AGAATGTACTGGTCTACAGCCAAGTGCCTCTTCGAAGTTCACATAAGTAA AACCATGCTTGTCTGAAGTAATGACTGAGTAAAACGATGTCTCTTGAGAG TTACATTGATCCAAAGCTAAATAGATTAGTTATCTGTTTATGACGAGCCT TGTCTATGAGAGCTCAATGTCGGCTTGTTTCAGATGAACTATGAGACTAC CATGTTGTTTTTATCCCTACCCTGTCTTTGTTTAATTCTTGAAGTAACTA GATTACCTATGGGACTCTAAGGCCTACTTAAAGGTCATCGATTTACTACA TTAAAGAGGGAAGAAATACTGGAAGCTGTTTGTAGTTACTTGTCTGCTGA TGTCTGGTTTTTCTTCTTACAGACCGGAGGCCCGAGGATTATGATTACAC TGTTGATGTCCTCACCAGATGTTCTGTAAACAAGGATATGAGCGGAAAGA AGATTATGAAGATTATACCTCTCAAAGCCCGTGGAGAACCGGTTGTTATT TCGTTACCACTTTCTCAGGTTATTTACTTTTCCCATTTCACCGGTTAACA TATTATCTTGTAATGGTTTATCACATCACGACATTGTTGGTATTCTTTTC TAATCCTAAATTGAACTGAATAAACAGATTGATGGACTAAGTAGTGTTCG AATGTACATACCTAAGGATCTTTTGCCTGTAGAAGCTCGAGAAAACACCT TGAGGAAAGTTGAAGAAGTGCTTTCAAGGTTTTCTAAAGATGGTATTCCT CTATTGGATCCAGAAGAAGATATGGAAGTAAGAAAATCTAATGCATACCA TATCTTCATGTTTCCTCTTATTTCATGCTAATAATTTTGTTCATTTTAGG TAAAATCAAGCTCCTACCGGAAAGCTACCAGAAGAATAGAAGCTCTCGAG AGTTTATTTGAGAAGCATGATGACATCCGTAGTGCTCCCCATATCCAACA GAGGCTGAAGGTGTTTCATGCTAAGCAAGAAATATCAGCCAAAATAAAGT CTATAAAGAAAACAATGCGGGCTTCGACTGCTCTAGCCTTTAAGGACGAG CTCAAGGCCCGAAAACGAGTTCTTCGTAGGTTGGGGTAAGGCATCCTTGA CTTGACACTCAAAATGATGTTAGTATTTGAAGTGCCCGCTCCTTAGATAC TTGCAAAACGAACTTTGTTGTTACAGAATATTGATGGAACTAGGCAACAT AACGTTCTCATGTTTATGACAAAGTTCTGCACTGCAGATGTTGGATTCTT AGGAAGTATTTATTGCCGAAATATTTGCAGGAGAACAAATTTATGATCTT TCTGCTTGGGTGACTAATGAAAACAGACACATAACACTATTGGTAAATTG GATGATCATTTACTGGCTGACTTTAATGTGAATGACAACCTCGTTGTTTG AAAATTACAGATATTTATAGGTATTCATTGTAAAATGCAATTTGATTGTA TATTTGATAATGTGCAAGATCATGTTAATTGTCAATTGTGTGAATGTAAA GAAATTCATCTGTTATCGTCAATTTCCGACCTTTTGCGTGTCGTCAATTC TTATCGATCTATGTTATTTCCTTTTCAGATACATCACCAGTGAGGGTGTC GTCCAAGTGAAGGGCAAAGTGGCATGTGAGATCAGCTCAGCTGATGAATT GACACTGACCGAACTTATGTTCAGTGGTACTTTGAAGGATGCTACTGTAG AGCAGATGGTGGCTCTGCTTTCTTGCTTTGTGTGGCAGGAAAAGCTTCAG GATGCCCCAAAGCCAAGGGAGGAACTCGACCTGCTCTTCTACCAGTTGCA AGAGACGGCTCGAAGGGTTGCTAACTTGCAGCTCGAATGCAAGGTACCAA ATTTACTACAGTAATAAACAACCATCTGAACTGTTGCGCTATAGTGATAT ATACTAGCTTCATAATCGGGCCCTAATGCTAAAACCTGCTGCGGTCCCCC CCTTGCCGACGACAGATTGAGATCGACGTGGAGTCATTCGTGAACTCCTT CCGACCTGATGTGATGGAAGCCATGTATTCGTGGGCCAGAGGGTCCAAGT TCCACCAGATCATGGAGATGACTCAGGTGTTCGAAGGCAGCTTGATCAGG GCCATCAGGCGGCTGGAGGAGGTCCTGCAGCAGCTGATCCTAGCGTCCCA GTCGATCGGCGAGACCCAGCTCGAAGTGAAACTTGAGGAGGCTGTCAGCA AGATCAAGAGGGACATTGTGTTTGCGGCGTCCCTGTACTTGTAACGTGTT CTCGCTGGCGCCATGCATGCATGCATGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTGGT CACTGATCACAGGAGCTCATGTGGGGAGATAGAAGGAGGTTATCGTTGTT TGCTTCTATTCTTGACCGGTGTCGTTGACATGATGGACTTGCTTGATTTG CTGTAACATTCCCTGGAGCTGTGTCGTTGCCACAGATAAATTTTGTCTCG GGAGTCCTTGTAGCTTGTACAACTAAGTTCTGATTAAATTGATTAGAGCT GGTCCAAGTCTTGTGCTCATTTTCCTCTGTACACAGAAATTACAGATGTA CTACTACTTGATATCTTATTATTTTAGAATGAGTTAGATGTTGTAATGCC TTCTTGAGGGATAAATCTTGCAATGCTACATTAGTGTCACTAGTTTTAAG TTGCATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.