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GrainGenes Sequence Report: AE016839

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Sequence
AE016839
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE016839
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCCCTTCTACTACCCCGCGCGTCCTCGACGAAGAGGGAGGGGCTCGA
GCTCCGGCGAGGCCGCCCCATCCTAGCCCTTGGCTTCCTCCTCCGCGCAC
GAGCCGGGCTCGAATTCGGCGGAACAGGTTGGCATCGAGGAGAATCGGAG
GAAATTGGCAGAGAATTTGTCACAACATCGTCGACCTCCCGGGGCCGCGG
CCATGGCAAAGACGGGTCGTTGCGCTGCCCATGCTCCCGCGAGAGAACAA
CGACACTGCTCACAACGGCACCAGCGTTGCTCCCTGTAGAAGCTGGCTAT
GCTACCCACGTAGTCTGGAGTTGCTCCCCGCTGCGACCATCACTTCTATC
TGCGGAGGCCGACGTTGCTCCCGGCGGCGACATATTTTGCTACATACGGT
GTCCAGAGTTGCTATATTTGGTGACTGGTAATGCTACATTGGGTCGACGC
CGTTGCTACCGACCATGGTGGCATTTGCGACCTAAGCGGCGGAGCTGATT
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TCTACCGGTGAAATCCTCCGACGAGTCTCCGGCGAGGTCAGATATGCTAC
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GGACACGTATCGCCCCGGGATCCGGAGAATCAGGGGGCAGTTATCCCCGG
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AAGGCTGACTGGTGGACCCAGCAGACTGGGTTCGGATAGTAGCAGTTGGT
TCCAGCCGCAACACCAGCAAAAAGAGAGGAGGGCGCCCCGTGGTCGACTC
TCCAAAACCCGCGTGACCAGCGCCCTCTCCCCTGGAGCGACAGATTTGCC
CCAGGTTCGCCCGCCTGCTAATCCCCTCCCTCTCCGGTGTTCCTCCGTTA
AATTCGTGTGTGCTTCTTCGCTCCTGATGCGGTCCCGCCATTTCCCGAGA
ACTAGCTGTTTCGATTTTTGCTGTGGACATAAGTTCTGGACGGGGGATTA
GGGTTTTACTTGGTTTCCACTAGATTATCGGCCGATTCATGTGTTTTCCT
GCTAGTCGCCGGTGCTCAGTTCCGAGATGCGAGGTACCTGTACTCTTGGG
GGTAGCAGGAGGTTGGGGAAGATAGATACGGGATGTGGCCATGTGGGGTT
GTTGTTGGGCTTTGGGTTTGTTTCCTCAGGAAACCGTGTGACTTGCAGTT
GGCTTGTGAAAACCGAGATGTGAGGTTTTGGAAAGGGTTTATGGGTATAC
AGCAACACCACTTTGGGGTGTGAGAGAGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
GGGGAGGTTGCGTGGTAATCTTCCTAGATACGATTTTGCGTGCCTCAAGA
TATATTTGATGAGAAGTAAACACCCCATTTGTTTGGAAGTATGGTTGTGG
CTATAAGGCGACAGGCTTGTCGCAGCGCTTTGGCTGTTTGTATATTTGAT
ACGTTAAGTGTTCTCTGATGGACATTGCCTCATTGCGGCGCATGGTTCAT
GTAGGATGCCAGCAGCAGGTCTCTGTGTTTGCTGTCGATACATTACGTCC
TGTAATAATTGGGTCTCCCTTCCTATCTTCTTCCGGTAACCGTCAGCGTG
GACTGATAACTCCTAACTATACCTTGTGCCGGCTGCAATAGGTTTGAATT
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TTGCAGAGGGCTAGCATGAAGTAAATGAGTACTCATTCGATTTGTCGTGG
ATCTGAACTTACCACGTGCCTCATTAATGCCACCCCATGGCGTCGATAGA
TGCGAGATATATGATGTTCTGGAAGGGTTTTAAGGAGATTGTTCTGCAAT
GCTAGTAGATGTGGTTACGCGTGTCTCTAGATTTATTTGGTGGCAAGCAA
TCTCCTCATTTTGGGCAGTACGTTGTGCACCGTCGCTGCGCTTTGTCGTG
ATGTTGAATTGGCAGCCCATAAATTTTGATGTGTAAACAGTTCTCTGATA
ATCATGTTCATTACACCTAATGGCTCAGGTAGGATGCTCTTAGGTCTGTT
TGTTTGCTTGTTAGCCTGTAATATTTTGGTTGAGTACGAAAAAATGCCTG
CAGTTCTGAGCTACTCTTATTTGTTTCCTAATCTTTGTTGTACTTGCAGT
TACAGACTTGAGATCGCATTGGGTGCATATTATGGCATCTGATATAAGAC
CACTTAACAGAAAAAAATGCGAGGCGCCTTCACTTGGCCACCAGAACTTT
GGAGACCAAGCTTTTCATGGCAAATGTCAAAGCTGCAATGGTGTTGGAAA
GCCATCTCATTCTAGAGAGAATGGCATTTCTCTGAAAGAACACTGTGTAA
CATGCAGTTTTAAGTCTGATCATGCTGATGCTTTATTAGTAGATGGGGTG
AAAGGTTCTCTAGCAAGATCAGGACATATTGACAGTGCGGGTTGTGGTGA
TGATGGTTGTCTGCATGACAAGAATGGAAGTTGCATGGCTTTCGATGATC
AAGAGTCTGATAGAGAACAAGGTGGACATACCCTGGATGATCTGTTCTTC
TTTAACGATGAAGACGAGGATGATATTGACTGGGAACCTGCTGCTCGCGT
TGTTGAAAACAGATGGTTTTGCTTGAACTGTACGGTCCCAAACTTGGATG
AGGTTACATATTGCCAGGTAATATCGTTTTCCTTTTGTGATCAGTCGGCC
ATATAGCTTGTTGCAAACTTTATCAGAGTATTATCCAGTCACATACGTTT
GACACGTGTACTTGATTCTTTTCTCATACACTAGAATTGCCATGAGCTTA
AGGGATCTGAGGTAGCTGGATATGATGATTTCAAAACTCACATTGCGCAG
GCAGCTTTGGTATCTGCTGACACAGGTGCTGTTTTCACTTGTAGCTATAT
TTTCCCATTCCTTCCCAATTCATATCATCAAGTATCAGATATCAGTTATG
AAGATAACTGATTTCAGTATTCCCTTTCACAAACTTATCTGGGTGCACCG
ATAACCTCTTACCATAATATGTCACTGCCTTTGATACTAGATCATGAATG
TTCTACTTTCCACACCTTCCAAAATTCTTCAGACAATTCTTCCTGTCTGA
ATTATGATGAATGTAAGGGTTAATACAACAGCATTGACTAATAATGTTAG
TTGGAGTATTTCAGCACATCTGAAAATTCGGCAGAAGATATAAACACATG
AAAACAATTCTGAACACCCCTACCTAGGGGTGTGTTTGGTTTGAGCCCAA
GCAAAGCATACAATAAATTTGGCTAGCCCAAATATTTGCTAAGGTTCTGG
TTACCCATGTCTTGGTCAATATTGTAAGAAAATAGACTGAGAGTGGGCAT
GCCAAAATTTTGGCAGCCATCCGATCAATGCTAGCAAATTTCTCTTGCCG
AGTTTCAAATCTAGAGAATTCTAGACTTCATCTAAAATCCACCTTTCTCA
TACTTTGAATAATAAGGCTAAGTCTTACTGGAATAGTTTTACAACAACTA
CCTTGTAATACTTAATAATCAGACTAAGAAACCAAAATCGAACAAAGCAA
AAGGTCCCTAGTAAACCTTATTTACGAAGACCAATGCAAACTATGAAGTA
TCATCCCTAGGCTCAGCTAATCATTCTTGATTGAAGTAGCGACATATTTA
CAATACTACTATGTCACAAAGACTTCCCAAGCTAGCATCATTTGATCAAT
GGACCTGATTAACTACTTGTTCGCCCTTCAGAACAGCTGTCTGGTTCAAC
GCTGAACAAGATTCCTTATCCGTATCTCATTTTCCAAATACATGGTCGAC
TGGCCAGCTGCATCTTCCTCCCCAGGCTGTGAAAACTTACCTTAGAGTCT
AAACCTCCTCTTCAGCGCTGTACAACTAGCGTGGAGGAGATTGTGAAACA
TTGGAACGGTACTAGAGTTGGAGGTGGAAAGTTGTGCCGCTCACACATTG
ACGAAGTGTATTCAAGCCTAGCACAGTAGTTTAGAGCAATGGGGTGCATG
CCGCTGCATCAGTTTTTCATGTGCCTGTTTGTATTAAAAGTCTTCTCAGC
TAGTCACACTGATTATGCAGCATCACCACCGGTATCTACAGCTATTGGCT
TTGATGAAAGAATGTTGCTCCACAATGAGGCAAGCTGTGAACTTACGATT
TATGTACTTTGAGCTAGTATATTGCATGATATAGTGTTCCTAAACTGGCA
TGGATGCTCGTCATAAATATTTAATTGCTTTTAATTGCGGTGTCAGTGAA
CCTTTTCATTTGATTGCTTGTGTCCAGGATATGCTTGTTCTGCAACGCAT
TAAAGAAACAAAACATGAACTTATAAGCACAGCTTTATATTACTGATTTC
ATACTCCCTCCGTCCTGAAAACACATTTAGTGTATACATGCAAACTTAGG
CAAATCTGCGACATCCTTTTCAGGACGGAGGGAGTAGTGTGAAAATATTT
CAAGATGGGATCTCAGTTTCTGTATTTACACTAGAGATGCAAGTGGGTCA
CCATTAGGGTACCCTCTACCCTCTTTGGTTCAAAAAAATGAACTAACTTC
TCTAAAATGATGATGTCATTGAAAAATTAGTTCATTTTTTGAAGTAAAAG
CGTAGAGGGTACCCTAATGATGACCCACTTGCAGCTATAATTTACACCTA
GTATGTACAATTGAATAATTTATTCCCTTCAAACATATAAGGTTATAATA
ATTATTTCACAAAACTAGTTGCATATTAGAAGTTTGATTCTACGAGGTCC
TGTCTTTTTGGCCTCCTCTATATTTTTCTGTCAGAATGTATAGTCTGTAA
TTTCTATCGTACTGACATTTCATATTTGTATGTCTTATCAGATTGAAATT
AAACCAAATCCACATCCAGAAAGACCTGACCGTCTTCGTGCAATTGCTGC
TAGTCTTACTGCTGCAGGTGCACACTAAAGATTAGTATAATTATTGAGCC
ATTTTCCAGCTTTGTGTATTCAGAAAAAGCTACTGCAGAAAAACTCATGC
GTACAAGTTCTGTGATTCTTCTTTGCGCAAATATTAATTTTAATATTTAT
GATTTGATGATAGTCTCCTCTCACAGGCATATTGTAGAATGTAAACTAAA
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GTTGTACTGTAGCATATACAGATAACACGATCCTCCTCCTGATCATATTC
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TCTTAGTACCTCCTCGAGAAATCACTAAGGAGGAACTCCTGATGGTAAGA
GTCCAACAATGTTGCTTTACAGTCTTACAGATCAATTAGTTTTGCTGCAA
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AAGCATCGAGCAGACAAAGAACATGCTTTACAGGTACTATTTGTGTAGCT
CGAAGTTAGAAATGCCATTATATATTCGTATTACAATCTTTAGTTTTAAA
TTTAAAGTTTTGTTATTAATATAATAGATTCATGATCAGCATGTCTTGCC
TATTTGGTGTCTCGTCATTCCTGGAAAGCTTTCATTGTTATAATATTATG
CTCTGGGTTTATGTGTAGTTACTTCACTTCGGATACTTACGCAAATGGAC
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AGTTTGATACTGTCTGGACGTGTCCACAATGGATTTGCACTGGTACTGTC
TGCTGATCTCATATATTTTTTTTCATCTCACTTTTGTGTGTACCATGATG
CACCTGGGAATTATTTATTAAATCTCCGTTGCATTTCTGTGGTACATGAT
GCTGATCATGTGTTCTGTCCTTGTCTACCGGATGACAGGTGAGACCTCCT
GGGCATCATGCTGGGGTAAAACAAGCCATGGGCTTTTGTCTTCATAACAA
TGCAGCAGTGGCTGCATTAGCTGCACAAAAAGCAGGTGCCAAGAAAGTCT
TGATAGTTGACTGGGTAATGCTATTTACATGTTTGCATAGTTAAATTTTA
TTGGCACGCACCAAAAAAATCACTTGTAAAGTTGTAATATGTCTAATTTA
GTGTAAATAGACACGGAAGTACGTGTACCAGTCTCATCAGTGGAATTGTT
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GAAGGGGACAAATCAGTGAGTTCTCAACTAATCATATTTATGTTGTGTTT
ATAATTTCTCTCCTCTTCTTTTTTCAGTGAAACTGTTATTGATTTGATTA
CTATATTTCCATTTGCATGCCATTGCTACTACAATGAGCATCCCGATTTC
CAAATTTGCAGTTCTTATATGTATAGTTTTTATTTCTTCAGGTTCTGTAT
ATATCATTACATCGCCATGAGGATGGAAGCTTCTACCCTGGAACTGGAGC
AGCACACGAGGTGGCTATCTTTGAAGTGTTGGAATAACTCACCAGTAGAA
CTGAATGAATTTATGGCCTGAGCTGAATATGTATAAGGATACGCCAGTAA
TCTAATTTATCCCCGCTTCCATTGTATACAGCTGTTTTCAATTGTCAGGA
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TCTATTATTAGTGAGATGCCCTGACAGGAGTAGATGATATAACAGCTTAG
GACCTAAATTTAAATACTATTTCATTCATTAGCTTTGAGTGCTATTTAGG
ATGACAAATCTAACAGCTTAGGACCTGAATTTAAATACTATGTCATACAT
TACCTTTGAGTACATTTAGGATGATGTATATCTAGCATACGTTTGTACTC
CAGTTCATTTTGCCACTATACAGCTGTGCTGCATCCAATTGGACCCAATA
ATCCATTGTAACCAAATTTGGGATCAATGTTGTGTGTCTTTTACAATTGA
CATAGCTCCTTGTAAGTTTGATCCAAGACGTGTAAACTTGCATCTCATTA
TTGCACACATATAACTTCAGGTGGGAGTTCTGGATGGCAAAGGATTCTCA
GTCAATATACCTTGGAGCTGTGGAGGTGTAGGAGATAATGACTACATATT
TGCTTTTCAGCATGTGGTGCTTCCGATTGGTATGTTAGAAGTGTGATATT
AAGATATGTGCTACTTACTCTGCTTTCTAATAGTAGAAGTTTCTCAACCC
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TATTTTATTCTCACGCTTCCATGGGCACCTCTCTTTGTGATATTTACCCA
TTGCTTCTTTTTTACATTGAGGTTTCAACACTGCATATTCTCATTTTAAT
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TGTCTTCAGTTGGTTAGACAACTGTGATGATTCTGAGGCACATTTGTACC
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GTTGCTGAGGAGCTCACTGGAATGGATGGGAGATATATTGAGTTTGTTTT
ATCATATTTGGTGTTTAGTAGTAGATCTTACTCAAATAAGAAAACGATAG
ATTACTTATCAAAGGGTGGATTGAAAACCCAGTTTTAACTTTCAATCCTC
ATCCTTTGATATTATTCATTAATACTTGTGTGCTACTTGGGTCATTTGGA
GTCTTAGGTGCTTCATTTTTCTTGTTGATATGCCAAAGCACGTCGAATGA
TTTCAATCCATGGAGATTTTTATTTAACCTGATCATTTATAGGTCACTCC
TGCCGGGTACTCTCAGATGTCGGCCATGTTAACTGCTTGTTCAGAAGGAA
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ATACGGAGATAAATGAACATTCAAATGTAGACAAGATCTAGAATTTGAAT
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ATGTAGCATACAATATACTCCCTCCGTTCAGAAATATAAGATGTTTTAGG
TTTGTGAATCAAATGTATCTAGACGTGTTTTAGTGTATAGGTTCGTAGAG
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TTTCAATTTGTTTTGCAATTAAATTCGATGTATTTTTGTACTTGAAAGGC
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ATACAATCTTCGGTCTATATCCTCATCGGCTACTGAAGTTGTCAAGGTTT
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CACAAACATGTTCAACTGGAATTAGCTGCTTTAATATCATCCATTATCGT
TGTTATTCATGAACAAATCAAAACCTTTGTGTTAGGACATCAAAAGTTCC
AGAGCCATAATTTAGTATTTGGTTCAGTATTTGTTTGCTTTTAATGCAAA
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GAAGATACTTCAGCATTTTCATATTGTCATCCTTCATTTGTTGTAGAATA
TATGTTTAAAAATAGAGACATCTGCTTGAATCATTACAACAGAGAGAGTA
ATTATGGTTACTATGTTATCATAATGGAAATCTATCCTGGGAATACTTTG
ACACATGTAGGTCCTACTTGGGGATAGTCCAAGTCACTGTACAGGTGCAA
CTGCACCATCAAAGGAGGGCATGCAGACTGTTTTACAAGTTCTCGAGATC
CAGCAAAAATATTGGCCAGTTTTAGTTCCAATCTTTGCATCACTCCAGGC
GCAGCAGGGGCCAACTTCTTCCAAATATGGTAATGAAAAGGAGAAGTTAC
ATTTTTACCATCCAACCCTAGTATTGATTTGTAGTCAACCTTCCCAAGAA
TAGTGGGGGTACTGTATTAGTCTATGTAAGCATATGCTTGTTGGTCTGAT
TCCTACTCCCAAATTAGTATGTACTAGATTATTTCTCCACATGCCATACA
GCTATCAGGATTAATAGATCACCTTGCTTTTGTCTAGTTAATGGGGAAAA
CAAGCTGAAGAGAAGGATGCTTGCGGCAAGACCAGGGCCCCTGTGGTGGA
AATGGGGAAGCAAGAGGCTTCTGTACGAAGTACTATTTGAGGGAAGCGGT
CCAAGAAAGAGCAAGGCCAAAGGAAAATGAAGATTGACTAATGAAACAAA
ACCCTAGGTTGTGTAGTGATGCTGAAGCCCCCTGAATTGCTGGTCTTCTT
GGCATGGCTAGTGTAGATTGCTGATTGGGGGTTCCTAAAGCAGATTAGTT
TGCATAAACAGAGCCATTTTTCTGACCGAACAATTCACCGGTGGTCACCG
TCATTGATGGTTTTAGGGAAAATCTGACAGCAGTCATGTTATGTAGACAT
GTGCTAGTTCTAGCAATGCATCAAAATTTACCATCCATCGTTCCATCGTA
TGATGCTGTGGCAATTAGCAATGTGGATCTTAACCCTGACATTAGCGAGC
CAGCCTTGATTGGATTTGACATCTACATGGTCACTACTCACTAAAGTTCC
AGGATGAATGTAACCCATCGTAAAGAGAACTTGAAGATAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.