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GrainGenes Sequence Report: AE028458

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Sequence
AE028458
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE028458
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCGGTGACGCAAACGCGACGGGCACCTTGCTCGGTTCAGGCCGAGATCCA
CTGATCCATCGACCCATCCACCTGCGCGCGGGATCACGCACCGGTGAGCC
ATCACCGACGCGGCGCCACCAAACGGCAAGCCCAAACGCACTACAGAAAC
AATACAACTCGCCGTCGTCGTGCGCCCCGGCCAAACCCCCACCCCCTCAC
TACATCTCCACGGCTCCGCCCCTCCGCGGCGGGAGCTCCCTGAAGCTCCC
CCACCACTTCCCGCGCTACACTCCTTCCTAGTCCTCCCGCCCCTCGCATC
CACAGGCCTCCGGCTCCTGGGCCGGGCTCCGTCGATTCGGGTCGGGGCGC
GCCGGGGCCGCGGGGCGGATCAGATCCCGCGCGGCCGAGCCGGGTGCGCG
TGCGGAGTGATCGGGCGGGCGTGCGCGTGCGGATCAGATCTATGCGCGAG
ATCTAGGCGGGCGGGCACGGCGGTGACGAGCCGCCGGTGATCGGAACCGG
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AGGAAGGTATCTATCGTACACGCCACCACTGTTGCTCAAACCCTTTCTCC
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CTCTGTACACTGGACATCAACACTCAGTCCCTAAATTCTGCATGTATCAG
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ACATTCTCTATGTTATGATTTCCTTTTTAGAAGTATCGGAACTTGGAAGC
ACTGTATTCATGCTTCTTTTCGTAACTAATTCCAAATGTCTTTGTTTTAT
AGAGCATGGATATGCTGAGTAGAGAATATAGCTTTCTCTCTGTCTATTTA
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ATCAGGATCCCGTACGTCAAACTCTGATGGAATGGGATTCTTTAATCCTG
TCATGGCCTTCATGGGACATAATGGCGAGGAGAGCTCTACGGAAGAGTCA
GAAAAGCAACAATCACCAGCAGTAGAAGAGAATCATAGGGTCACCACCGA
GCCACCTACATCTGAAACAGATGCTTCTGAAGTACCAGCAACAGCACAAG
CTCTAAAACAGCCTTCAGAATTAGAAGAGAACACTAGCAGCTCCACGGAG
TCGCCTGTATCTAAGGCTGATGTTTCTGATCAATCTGTAAGACCACAGTC
TCCAGCATGTTCTTCAACAGCAGAAGAAAAACATGATGGCTCCACCAAGT
CACCTACATCTAAGGGGGACACTACTGAAGTATCAGAAACAGCACAGTCC
CCAACACATCCATCTATAGCCGAAGAAACTTCTGGTGGATCCATTGAGAC
CAGTAACTCAATTGTGAAGGAAACCCAGGGTCATCAAGACACTGAATATT
CTGATCCTAATGATGAAGCATTACCGAGTCAGCCTGATGCATCCGTCGGG
GACATACCTGGGGATAGAACATATTCACCTAACAAATTGGATCAATCAAG
TGATATGGGAGCGGAAGCATCTATGCATGCTGGAAAGGAAGACACGGATG
ATGGAAACACCTCCCGGTCACAACCAGCAGAATCGATGGTCTCTTGTTCA
GATGATGTAAATGAGTCCAGGGTGAAAGTTGTTCAAGAATTTGATATCCA
AAAGGAAATAATCAGCCCACAGGAGAACAGTGACATTGTTGACAAAACCA
GTCATGGGGAAGTCAAAGTGCCTGATGTTGAAACTAATACGGCCGAGAAT
GGGGAAGAAAAAGATCAAACAGAGGTGCATGCAGTATGTGTTGTCGATAA
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TTGTGGACAATGATCCAGACTTGCAAAATGAGTTGGTACCAGCTTCTGCA
TACACGCCTATTGGCCCTGTAGAAGCTCATGCAAATGATTTGAGAAAAGA
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GTTCTGTCGTTGAACTAGAGAAACTAAAACGTGACATGAAGATGATGGAA
GCTGCATTGCAAGGCGCTGCAAGACAGTCTCAGGTATCATTTCCACATGC
TCTAGCATTTACTGTAGCAATTCAGTCGTAGCTGTTTGTTTTGCGAAACT
TGACATTGGGTTGACCATCCGATTCTATCCCACTTGTCTGTTGAGGAAAC
GGATGGTTTTGGTCCATCACCACTTCGTCCTTCCATAAATTGAGAAATTC
AGTCATCCCACCAAATATGACGGATGATGGAGCAACCCATCTAGGATGAG
ATGATACCTCAAATTAATGCTTTGTGGGATCGTACGTGTAACATTATGGA
AGTTATTGCTAGATGATTATCCAGTTGGAAGTAAACCTTTTTAGTTACAT
GAATTCATATTTATATAACTGAAAGTGCCAGCCATAAAGTACACTACTTG
GAGCATAATACCTTACCACATCTATTTTCATGTAGTGCAATCTGTTTTCA
GGTATTAAACCATTGTGTGCTTGCTAATTTGTTCGTAAACTTTTATTCAC
TATGAATTTGCTTTACTCGTGAAGGGTTCCATCTTGTTTTTCTTTTTTAG
CGTAATGCTTTTAAAAGACAACTCAGTTATTTAATATGTCAGATGGGTTT
AGTTCCAAAGAGGACCAGCATGCAATTTTCTTTTATTAACACCATATTGA
CTATTCCGCTATATGTTAGCATGGGGCTTACTTATCACGAGGCATTGTCT
GCTGCACATTTCCCTTAACAACTATTACATGCGCGTTGGAACATCGTCAA
AACATTGAATAATTTTAATGCCCTATGTTAGTCATTTCTTTTTGACATGC
ATGGCCACTCAGTACTATTTTAATGTCGAACAACACCTAATATTTTCTGC
AGTCCAAAGCTGATGAGATTGCTAGATTGATGAATGAGAACGAGCAACTG
AAATCAACAATTGATGAGCTGAAGGTATGTTTGCTAAGCATATTCCTTAT
CTTTTGCCTTCCGGAAACAGATATTTAGAATGTCTTTAGATTAGAATCAG
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ATACAACTAGTCTCTGCGATAAATTTCAGATTAGTTATCTTTTTCGTATT
GAACAGGGTAAGTCAGCTGAAGCGGAAATTGATGCGCTTAAGGATGAATA
TCACCAACGAGTAGCAACTCTTGAAAGGAAGGTGACACACATTATCTTTT
CTACTTAATAATTTCTATCGTCAATTGATCACCACATATGTTAGTTCTTT
ATGATAGTGCAAGTAGTAATTGAAGATTGTCTTTTGTGCTTTAACAAAGA
ACTATTTAGCTACAATCTGAACTTTTTTTTTCCTGTAATGCTTCTAGTTC
TGAACCATTTGACTAGTTGGATGCACTGCACATTCTGTATAGGTGTAACT
TTTAATATATTAGTTTACTAGGAGTTGAGACTATGTTTGTAGAGATCAGA
GTGAGCTGTATTAGTGAGGTTCAGTAAATGCTATGGCCAAAATCTCATCA
GTTTCTATTTTATTGCTTACTGTTTCTGGGACATAAGTCTTCCTCAGTGT
CCTTGTTCATCTAGACTTTTTTTTACAAACACCGACATGTTTGTAATGTG
CATGCCTCAATGTGTCTAGGTGTATGCACTAACCAAAGAACGAGATACAT
TAAGGAGAGAGCAAAATAAGAAAAGTGATGCAGCTGCTCTTTTGAAAGAA
AAGGACGAGATTATCACTCAGGTCATGGCTGAAGGTATGCAGAATTGTCG
TTTTTGTGCCTGTTCTTGTATGCTTATGTGTGAACAATGGTTGACTTCAC
ATTAGTTAAATTATTCTGTTATAATGTTGAGAATACGAAATTACAAATTC
TATCATTTGAAACAATAATACTTTGACGATTTCAAGTATTAATGTTACCA
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GCGTGCTGTAACACTCTGATCTTATGATCAACGGTAGGCTACTAGGCACT
AGGCATACACATGGGCCTGATGTGTATGTAAGTTTGCTGATATTCATGCG
TTCGCTGCGTTAGTCCCCATACATACTATGCTCCCCATGTGATTATTTCG
GCCTCTATTGGCACTAACATCTGGTGTTAACCAATGAAACAGGCGAAGAG
CTATCGAAAAAACAAGCTGCTCAAGAAGCTACTATACGAAAACTGAGAGC
ACAGGCATGGAATATAACTCTTATCACTACGCTTCTGAAGTAATATAATT
TTCAAGTTAATCAAGTTTTCTCTCTTTTTTTGGCTGAAGCTAGATTCGTG
AGTTTGAAGAAGAAAAGCAACGGTTGAACTCAAAGATCCAGGTAAAAAGA
CAAAAAATATGTTAAAAGGACAGTTTTGTAATCAATTAATTAATTCATGC
TATTTTTTCTTATCTGCTTTAATGACACACATTCAGTATTTGTGTTTGCT
GCTTGCATGATACAGAATCAGTTTTGCAACCATTTTAGTGGTTTATTCTT
CTCTGTTTTGATCATGTGTGGACACAATGTGCTGAGTGGTTCCATTAAAC
AGTAGTTTGCCTAACCTGCACAGCTTGCTTACAGTTCATGATTTTGTTTA
ACCAGACAAGTCTTATTTTTTACTTGGTGGATTTATATCTCTGAAATATT
GCTTGAACTCAATAATGGAGTTAGTTCGACTTCCTGAAGGAAGCACTTTT
GCTCCCTTGATGAGTTTTGTTTGCTGTCAGGCTTAAAATGAACTCATGCA
CTTAATTTTATTACTTCACAGATTGAGGAAACAAAGGTTGAGAGCATTAA
AAGAGACAAGGCGGCAACTGAGAAGTTGCTACAAGAAACAATAGAAAGAA
ATCAAACTGAACTTGCAGCTCAGAAGGAGTTCTACACAAATGCTCTTAAT
GCAGCCAAAGAGGCTGAGGCATTAGCTGAATCAAGAGTCAACACAGAAGC
CAAAGTTGAGCTCGAAAGCCGTTTAAGAGAAGCTTGTGAAAAAGAAAATA
TGCTGATTAACACAATCGAAGAGTTGAGGAACGCTCTTACCAGACAAGAA
CAGGAGGTAAGTCATGAAAACATGTGCATCTACAATTCATTATCCTCGGG
ACAATTAGTCTGTGGATCGTGTTGATCTAATTGTAACCTATCACTTTGTT
GATAATTTTTTATGGAAAGCATTATTTTTTGCACTATTCTACTTCAGAAT
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AGGGCTTTTTTGGTTTTAGTTGGTATTACAGAGTAAAACTAGTCATAGAC
CAATTGTCATGTTATTTCATTATTTAATACTTCAGGCCAGTGAACTTCGT
TATAATGAACTGGTTACACAAGTTCCTGAGTCGACAAGGCCACTCTTAAG
GCAAATTGAAGCCATGCAGGTATTGGTGCTTCCATAGATTTTCCCTTGTG
GTGTGGTTATATATCTTCCTTTCCTTATTGGGTGTATGTATACTACTTAT
GCAGTTTGTGGATTGAGTTTTTTTCTGCAGTCAGAAGTAGGCTAATCAAT
TCTGTGTTAATATTAACAGGAGTCAGCTGCTCGAAGGGAAGAAGCTTGGG
CTGGCGTGGAGAGAACCTTGAACTCTCGCCTTCAGGTCTACTATGTTCTG
ATTTTTTTGTTAACAGTGGTCTGCGAAAAAATAACTAAGATAACTAGAAC
TATCAACATGAGCTTTATCGTTATAAACAAATGTGATTTGGGACTTCGGA
GGAATGGCTGTAAACTATGTCATTACAGCTATTTTCATGTATTTGTTTAA
TCCAATCAGGCATAAACCCAGAAACACAGCAGAAATATTTCAGTGGCATA
ACTTTTTTTGTTCTACTCAAATATGCAGGAAGCAGAAGCGAAAGCTGCTG
CCTCAGAAGAAAAGGAGCGGTCTATAAATGAGAGACTGTCACAAAGTTCA
TCCCGCATAACTGTTCTGGAGACCCAGGTTTGTGCGTCAATTTCTTCTGA
GACAAAAACATGTGACATTGCTTTAGTCTATAACCATAGTTTTTGGCATC
AATTTGAAACTTTAAGTGAGAAATGTAGTTCTTTTGACATGGATGTTGGT
CATATGCAGATTACAATTCTTAGAACAGAGCAGACACAGCTGAGCCGATC
TCTTGAAAAGGAGAGACAGAGAGCATCTGAAAGTAGACAGGAGTACCTTG
CAATTAAGGAAGAGGCGGCAATGCAAGAAGGACGCGCAAAACAGCTTGAA
GAAGAAATAAAGGAGCTTAGAGCTAGGCACAGAAAGGAGCTGCAAGATGC
AGCAGAACACAGGGGGCTCCTTGAGACGGTAGTCAACTTACTATGTGAAT
CATTGTTTTCTGAACATAACTGGATATACATGTTAATTAATCTGGTTGCT
TTGAGAACATGTACCGAAGCCACGTTTTTTCCTGCCAAAATCATTAGTGA
GCCACAGGGACACTTTCTCTAAACTTAATCAAACATACTCATATGACGCA
ATTTTTGTACTTTGGGGTTGTCTAGTAGCAGAATTTTGTAGCGTCAAGAG
TAATTTTTCACATGAACAATATTAGTCATATATGTCACCAATCCTTGCTA
TACTAATCTCCTGGTTCATGCATTACCAACGCGGCAAGATTAATGCCTCT
TACGATATCTTGCGTGAATTGCACTTCCAGGACCTTGAAAGGGAAAAGGC
TGCCAGGGCAGAACTTGAGAAAACTTCTTCCCGCGAGTCACCTAAAATTC
CACTTCCAGATCAAACTAGTATGCACTTCATTCGCCTCTGATTAATTTCT
GTGAGTTCAATCTTACTATATATTTGTTTGTCACCTTACCTGTGGATCTG
TTGGTTCCTCGTTGCTTCTTTTCAAGAAAATGTTCCCCACAGAAAGCTCT
CTAGTGTTAGTAGCCTGGAAGAAAGCCATTTCCTTCAAGCATCGCTGGAC
TTGTCAGATAGCGCTTCACTGGAGAGGAGAATGTCTGCAGAAAGTAATAT
GTCATACTATCTGAGGAGCATGACTCCAAGTGCTTTTGAGTCAGCACTCC
GTCAAAAGGATGGAGAATTGGCTTCTTACATGTCACGCTTGGTGTGTATA
TTCATCCTTTTAACATTTCTGCTGAAATTGTTTAATTTATACATCATCAA
GTCATATCACTTTGATTTAGGCGTTCTAGAAACTGACAGTAGGTGATTAT
TAAAGCTGGGTCGTCTCAAAGTATACCAGTTGGAGCCAAAAGCTGTTTTA
GCTGATTTACTCGCAGCATCATGAATGTTTGCATATATTTTATTGATATT
AGCACTTGGCTTGTGCGACACATTGTTTGTCACTACCATGGTGGAACTAC
CGCTGCTGGCCTCCCTGAGCTCAACTGTATTTTGCTCATAATCGTTTTGT
TTCTGGCTGTTTCCGTGAGGTGCCTGGTTACCTAACTTATGTTCAACATC
ATCTAGAATGTAGTACTTCCTCCGCCCAGAAAAGGATGTCACAATTTTTT
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CAGCCTGTAAATGGCATCAAGAGATCTCCAGTCCCATACTGATGTTAGTT
GCTACAAATTCATGTGCATACTTGTGTATTTTAATGCCTGAAGAAGCTGA
AGCAGTAGCTTGGAATAGTTTTATGACTTTTGCTTTGATGGGCATGTTTT
TATCATGACATCAGTTTGCCTCAAACTCTGTAACCATCATCTAGGATATT
TTATGCTTTACTAATTCTACAGGTGTTAGCATTTAAACGCTCGTGTTATT
GTCACTGCACTAATGTTGCTACTATGTTACAGGCCTCATTGGAATCTATT
CGGAATTCTCTGGCAGAGGAGCTGGTAAAACTGACGGAACAAGTAAATCC
TTGTGAACCTACTGCATTCTTATTTCATTATCTATGTGGATGCTAATTGG
ATTGATTTTTGTATGCAGTGTGAAAAGTTGCGGAATGAATCTGCTGCTCT
GCCTGGCCTAAGGGCTGAACTGGAAGCACTGAAACAAAGACACTTCCAAG
CTCTAGAACTTATGGGGGAACGTGATGAAGAGGTATGGCTGCCATCCAGC
AAATTAGGACTTACTACTAATCTCTTTGTGTTAATGACCTTAGCACAAGA
TACTCCAAAATCTGTCATTATATTTAGCCTCTGTTATATGGTAAAAATAA
GTCCAGTTCTAAGAATTAAACTGGTAGCAAGCTTCACATAGTAGAATCCT
GCAACTTCACTGAATTAGCAATCATTGTAGTGACTTTTAGTTTGTGGAAC
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GTCCCTTTCAGATTTGATACTGTTTAAAATTACTCTGTGCTACTGCTAAG
CACCGGCATTCTGCACGTTTTGGTTGTAACCGTCATGATAGCTACGAGTC
AGGTTGCATTTATTGGCACATTTACTCCCTCCGTCCACAAATAACTGACT
TCGATTTGTCTAGATTCGCATGTATCTATACAATAAAACATGTCTAGATA
CACATGCGAATCTAGACAAATGCAAGTCACTTATTTCGGGACGGAGGGAG
TACATGATTAGCTGAGTACCAAGAAAATGATCGAGTAAACTCAGTTAATA
AGTACACACACCGCGCTGTTTTGCAGTTGGAAGAATTGCGTAATGATATC
GTTGACCTAAAGGATATGTACAGAGAACAAGTCGATCTTCTTGTTAGCCA
GGTTTGAAAGCATATTGGTTGAAATTCTGCTTGCCTTTCTAGAGAACCTA
ATGAACAGTGTTGGTCTAAAACATTTCCTTTTATCAGCTCCAGACATTGG
GCGCTCGTGTATAGTGCTATTGACCAAGAGATTTTGAAGGCTGAAAATAT
TTTTCCACAGTTCAAACTATGGCGAGCTGGGAGTTCACAATTATACGACA
CTGTACAATGTGAAGATTTTTTGTTGTTGATTTCATTAGATAGTTTGTTG
TATACTAGATTTGAACATATAACAGTTTTGCATTTATTGTTTGCAACATT
TTCATTCATAAGAGGGTAAGTAACCTTAACATTTTAACAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.