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GrainGenes Sequence Report: AE002553

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Sequence
AE002553
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE002553
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCGACTCAGTGGCAGCCATGGCCGTTGGTAGACCTCGATCTCGATCTCG
CATCTATTGTCTGGGCTCTTCATTGCTTCGATTTGCTCGACAGTCTTCAG
GACATCCTTCGTCCAGGGCAAGGAGCCAAGGAGGAGAAGGGGGCGGGAAT
TGAAGAGCCGGCTGGCGCCCGTCGGTCCCCTTGCCGCCGTCGCCGTCGCC
GCAGGACAGCACCACCCCCGCGCTCTGCTGCCGCCGCCGCCTCATCACTC
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CAACCCAAACCCCTCTACAAATTAGCAAGGTAAAACCAAATCCCTACTTC
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AAAACTAGTGCAGCTCATCTTCCCATGTCGGTCACATGCACACACACATC
GCGAACACATCTTACTTTCTGACCGATCTGATGGTACTAACCAGTTGAGT
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AGCATGTGATAGAATCGTTTCACGATGCACGGGTTAGTATAAGTACAGAG
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TACAAGTTGCTCCAGAGCAGGACCCTTCATCCATCCATCTTGAAGGTAAT
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GTTGTACTTTTCTTTCTTTTATGCTGGTAATCTTACATTATCTACAACAA
GTGGTGGGGGTGATATCTTGGCTTATCTTTATTACAGACACAGCGAAAAT
GGCGATGGTCCTTGATGCTTTTGCATCCTACGTGCAAAATATGCTCACGA
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GAGAAGATGGACGCCAAGCTTAGGGACCTCAAGAACTTCCTCGCCGATGC
TGATAGGAGAAACATCACTGACAATAGCGTGCAAGAGTGGGTTGGACAGA
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AAGGCCATGGAGGGAGGTTCATCAACTGTAGATGTGGGGTGCTTCAACCC
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TTCAACGACGAAACTATGAATGCTGAGTTTGATGAGACGATATGGTTGAG
CATCAACCAGAACTTTGATAAGGTTGAGCTGCTCAGGACAGTCATCACCC
TCGCCGGGGGAAACCATGGTGGCGAAAAAGCATTGGCCGTGCTTCAGCCA
ATCCTTACTGCTGTCTTGAAACAGAAGAAGCTATTGCTGGTGCTAGATGA
TGTGTGGAGCCACCGAGCATGGGGTGATTTGCTTGAGATATCCTTGTCCA
ATGCTGTAGCTCGAGGTAGCCGAGTCCTTGTCACTACTAGAGACGAGAGA
GTAGCCCGAGGGATGAAAGCTGTACTTCCCTATCACCGCGTCGACAAATT
AGAGGAGGTGGACGCCTGGTCACTGCTCAGGAAACAGGTATGTAAGTAAA
GTTTGTTCATCTTCAATAATAATAGCTCTGAGCTTAAATTGTGGTAGAGA
TAATAATAATTCGGCACACTTTTATGAATTTATCTTTTTGATTACAAGAT
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TCCCATGCTGAATTCACAAGTTCACAACACCACAGATATAGGAGTAATTA
TTTTTTAAATTTGGGCTAGTGTCTCTCAAGAATGTTTTTCCCTACGGAAA
GTAAAAAAAATAGAAATTTATGCGCAGTCACCACTTGAAATGCAAATCCA
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AATTTTTCAGCCTGAAGTTGCATCTTCTTTGTCTTTGGCTTGCTGTTGCA
TTTGATTGGCAAAGTACAAGTTTTATGTCCTAAGAAACTTTTGGATTATC
ATGGTAATTATATTCAAGTTGACAAAAAACATATCTCCTCATTTCATTTT
TTTTCTACGAGTGTAAATATATCCCAGCGATTCTAACATAGTTCAAGTTG
ATTTATTTATTAAATTTTTGTTTCATACTTTTTTACTTTGGTTAGGTCAC
TTTTAGGGATAAATGAAAATGACTAAGTCAGCAGCCAAGTAGAAAATAGA
AGTGCATATACAATATCAGCCAACTAGTGGCTCATGTGGAAGGAAGTAAA
ACCTGAACAATAGAACACGCAACCACTTGATGGAAATCCAGGGACCGATC
CACCGTCTTGGGCGGCAGCTTCCGAAGGTACTTGTCAGAGACCTTGGCCT
TGCTAGATCTGGAGCAGGTGTATTTGACAAACCAGTTGCGGATTCACCGG
TCCGGATGGATCCTGCATAGTAGGCAACGGATACAATAGGTTGGGCGGCG
ACCACAATGCCTGTGGTGGCATTTTGTAATTTCTTTAGGTCACATCCGAG
GCGGTTTCCTTTTCTGGTAGGACCGCCTCCTATGCATGTCTATTAGAAGT
GATTTTCAGAGCCGCTTTGATGGGATTACCTGCAACAATTGTCGGAGGCA
GCTGGAAACCACCTAAAGTTGTTTTTTCGGCTGCCTCTGATTGTATTTCC
TCCTGTTACTATGCAAGTTTGTTTCAAGACATTTAAGGGTGAAAGATAAT
CCGCCTAAAATATTACCTACTTGCGAGAATGGATGTACAATCCCCAAACA
TGGATTTAAATCCCAGTGCAAGCGAATTTAGGTTCCTAATTGTATTGAAA
GGTTTTTGAATCCAAGACAATTCAACTTCCTGCTGACTCTGTTTTCCAAA
GTATGAATATATGTATTGTAATATCTATCCACACAAATAAGTGCATAATT
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GCTACCATGATGGTCTCTTGTAATCCAATCTGCGTCGATCAGGAACAGGA
GATGGGGACTCGACATACAAAGAATATCCTCCTCCGCTCTTTTGCATAAA
AGTAGCATATGTTTCATGTCTCGCACCCCAGCAAGCACACTGGACATAGC
TCCGCCAAATTTACAATTTATTTTGTTGAGCATGTTATGATGTCAGCATA
CATAGCTCAGCCAACTTACCCAGTTACCAATTCATTCTCTTGACAATATC
AGTATATGCAGTACATTAACTGGTCTTCCGATTAGTTTTCTTTTTTTTTC
AAGCGCTTATTGTTGACTAAAATTGAATTGATACTAGGCGTTAAGAAACT
ACTATTTTTAAGGCAAACAACTCCTTATTAACTATTGATTTACACTCCTT
GCAGGTAGTCTCGAGTGAGACAGATGTACGTGAAATTGATGCACTCAAAG
ATATTGGGTTGCAGATTTTAGCAAAATGTGATGGTTTGCCGCTTGCCATC
AAAGTAATGGGTGGGCTCCTGTGTCAAAGAGACATAAAACACCGTGAGTG
GGAGATTATTCTGAATGATTCTATATGGTCGCTATCTGAAATGCCCGAAG
AGCTAAACCATCCAATATATTTGAGCTATGAAGATTTGCCTTCTTGCATC
AAACCATGCTTTTTGTACTACTCGCTTCTACCTAAAAGTACACTGTTTTA
TGATAACAACATCATTGGAATGTGGGTTAGTGAAGGATTTGTTCACGGAA
CCTCGGACAACTTAGAAGAATTAGGAAGCAAGTACTACAAGGAATTGATA
CAGAGGAACCTTATAGAGCCAGATACACTGTACATTGATCAATGTGTTTG
CAACATGCATGATGTTGTTCGCTCATTTGCTCAATTTGTGGCTAGGGATG
AGGCACTAGCAGCTCACAGTGCAGAAACTAATCTTGGTAGCAAACTTATT
GCACAGAAGTTTCTTCGGTTATCCCTAGAAAGCAAATCATCAGAGACAGA
TGGGTTATACTGGAGTTCTCTACAAGCACAAACGAGATTGAGAACACTAA
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CCATGTTTACGAACTCTACATACAGATTCTGCAAGTGTTGTTGCATTGGC
TGAATCTTTGCATGAATTAAAGCATCTGAGGTACTTGGGCCTTACAAAAC
TCTGACATCTCTTGTCTGCCCAATAAAATTGGGAAGATGAAATTCTTGCA
GTACATTAACCTCCGAGGAAGCCAACAATTTGTGAATCTTCCACATAGCA
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AATGGCATACCTAGGGGATTTCGTGTTCTAACAAATTTGAGGATAGTACG
TGGGTTTCCAGTCCTGGAGGATGGTGATTGGTGCAGTTTGGAAGAGTTGG
GCCCTCTCTCTCAGCTCAATGAACTTGGACTACATGGATTAGAGAATGTA
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TACCGGCCTATACTTATCATGTCATGGTAGATTGGGAAATGATGGGCAGA
TTGAAGAGGAAGATAGTGTTTCTGAGGAAGAGCAACAACGAATCGAGAGG
GTGTTTGATGAGCTCTGCCCTCCGCCCAACTTAGATCATCTTTCCGTCAA
TGGTTATTTTGGCCGACGGCTCCCAAGGTGGATGATGTCATCAGCAGCTG
TGCCTCTCAAGAGCTTGAGAATTCTGTTCGCAGAAGACCTAGCTTGCTGC
ACACAGCTTCCTGATGGCTTGTGTCAGCTCCCCTATTTGGAGTTCATTCA
GATCCGCCGTGCTCCAGCCATCAAGCGTGTTGGACCTGAATTCCTTCAGT
CCCACAATCACCAAAGTCCTCATCATTCCCATGTGGCGGCTGCCTTTCCG
AGATTGCATGAGATGAAATTAGCGGGAATGCTGGAGTGGGAGGAGTGGGA
ATGGGAGGAGCAAGTACAAGCCTTTCCTGTCTTGCAGAAGCTTACACTAC
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GAATTTTGCATCTCTGGTTGAGCTGGAAGTGGCTGTAAACCCTAACTTGG
TGAGGATCACTAATCTACCCAGGTTGCAGAAGCTTACCATCTTTGAATGC
CCAAAGCTGAAGGTACTGGAGGTTGTTCCTGGACTTCAGAGACTCGTGCT
CAAGGATAGCAACATGGAGACTCTCCCAGAATACATGGGAATTAGTATAA
ACCCAAGGCATGTGGAGCTACACTGTAGCCTGCCTATGCTTGCTTCCATA
GCCGCAGGACAATCTGGCCCTGAGTGGGACAACTTCAACCATGTTGAGCA
TGTCAGGGCATATGCACGTGAAGGAGATAATCCAAGGAGATGGTATGTGT
CGTACGCGTCTAACCCCTACAACTTGGACACAAATGTAAACCTATCTTCC
ATGTCCAGAGGTAAGTTACATTGCCCATTCATCTTAATTTATCCTCTCTA
TTTATTACGTCTGTTCTTTTGTGTTTTACTTTTCATCTGCATGTTTGGTT
TTTAATATATTTCCGACATTCTCATTCCTCTTGAATGAGGTGCAAGTCCT
ATCCAACTATTAATTTTACAGGATGTTAGAGAAGATGGACTATTTACATT
GAGTCAGTTTTTCTGGTAAGGGCATTTCCGTAAAAATCTGACCGCCCAGT
TCTTCTTCTGAGGCTCATATAATAGTTTCTGGACACACCGCCGCGCTCAC
CCTTGGTGTCTCGTTCCTTCCACCTCCGGACACACACTCATTGTTCCGTG
TAGCCCTTGCTCACTACAATTAAGTGATGCCATTATTTGTATGTGATGTG
CTGATGCCTGACCAGAGAACAATGGCATGTATGCACGTGTACATATGAGA
TCTCTACCCATATCTGTATGTGTAGTAAGAAATCAGTTGTTGGATTTTGA
CTTTCCATCCTTAGTCATTACATTGTTAAGATAAACAAAGCTATCGTAAC
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GCTTTTTATCATTTTGTAACTGCTATTTTGTTGCCCCCACAAAAAATGCC
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GGTTTTCTGGATCTCGCTATTTTAACGCTGTCAGAGTTGAGCTCTTGCCT
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AGACCTTAGGATCCTCTGTTGGTATGGGCGAGTCAACCGTTTCGTTGGTA
ACTGAGAAGTTCGTTGCTGCTATGTGTGAGCGAGAAGCAACCACTTGTTC
TGGCCGAATTCCAGCAAAATGCGTAAGATCAAATCCATTTTTGACAACAG
GCACAATATGCATAACTGTTGCGGTCTTATATTTACAACACATCCCATTT
GGATCACAGCAGGGGCCAAGGGCCTCAGGGATGTATGGCGAACGACTTGG
GATGTGCACTAGTGTAACCCTGTAATAACTGATAACTGTAAGCCTCTTAG
GAGGTGTGTAGTGTGTACCAAACCCTATCTTTCCAATGAAATGAAACGCA
AAGAGTCCTTTGCGCTTTCTCGAAAAAAAAAACCCATCCCATTTGGATCA
AACTGTGACCATGAGAAGAATGACAGCTTTTCAATGCAAGTCATCATGGA
TACAGAGATGAGGTTCACAAACATTTGGTTGGGGCCGGCATGTATCATGA
AACAGTCGAGCGTTTTGGAGGACTCTCAAATCTTCAAGGTGTGTGAGGAG
GGTGACTGGATGAACGGCAGAAAGCTGAATGTAGCATCAGATGGATCAGA
AGTCGAAGAATACGTGATTGGTGATGCATGATACCCTCTTCTCCCTTGGC
TACTCACACCTTACGAGGAAGAAGACCTCTCAGACTCCAAGGCAGAGTTC
AATAGGAGACACTCCGCAGCCACGTCATGTACACAAAAGGCGCTGGCAAG
GTTCAAAGACACATGGAAGTACCTGCAGGGAGAGACGTAGTGGCTGGTCA
ATCCAGACACTCTAGGTGAGACAATCAGTGCATGATGCAGCCATGCCGAT
GAGGGTCGAGGAGCCTGATTACAGTAAAAAGTGTGCCAGCTAGCAAATGA
GGATGCTGTGAGGGCGAGGTATATGTTGTTGAAGTACATCTTGACCACCA
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GTCGTTTCCATCCTTCATCTGTCTCATCGTCCCAGTGGCAGTGGATGAAG
AGGACGACTGTGAATTAGTTTCATCAGGCTCAGGGTATTAAGGCAAGAAG
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TCTTCCAGCTTCATTTAAGGTACCACTGCTAGCACGATGAAGTCATGTTA
TTCTCTCCACCCAGCAATGTCACAGTTCTTCTGCCTGATTTTGTTCTTTT
GATATGGCACTAATGCCAGTGAGAATCTTCAAGTGATTAATTACATAACT
CTGAAAAGAAAGGTAACTGGTACAGCTATCAGCGATGTGCTATGCAAAAC
ATCAATGCCTATTAACTGAGCTCTTATGCGCATCCCTCTCTTGTCAGTAG
CCTATATGATTTGAACAGTAAAGTTAGCAGCTATAGCATGCATGGAAATA
AAAATCTTGATGCGTTAAACCTCCTGGTGCGTAGTTGGATATCTCATAAA
ACTAAAACCTTGTTTGATCAGGTGAAAGGGCAGCCTACATCCTGCTGATT
GGAGCTTTTGATTGCATGAATCCAGAGCAGCCCTGGCAATGGAGCCAAAG
ACTACTTTGATGCCGCAGCATGACCTGAAGCTCAACGTTCTCTAATTTTG
GCCATCCATCTATTTGGCAAGAGATCCCGTTTGACAATGGCAGTCTATTC
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GTAGATGCATGGACACTATCTGTGATTTCCATCAATCAGTTGATGTGAAC
TGAAGAATCTGCAAACATTATGCCAGGGAAACATGTACATTCACCACCTG
GTGTATGTTTTGTCAGTTATCTTATTCAGTGCATGGAATTTTGAATATAT
CAACTTTTCTACTACCTTAGCCCAAACTTCAGATATATTGGGGGCTATTT
ACCATTAAGCATTAATTGATAAGAGAAGGTTAAGAAAATGACCTTGATCT
TAATAACAGAACTAGACTGATATCTTGAGTCAGTTCTTCCTAAGATCAGC
CAAGAAACTCCAGTAGTTGTTGGTTGTTGGTTGGTGGAGACTTCTTACTT
GCTTTGGCTTCAGAAATCAAAATTGCTGGCCAACTTTTGATAAGGTTCAC
AACAGGTTGCTATATCACATCATCCACTGATTTCTTATTCAGTTACTGCA
ACTTGGAACAAGTCAGCCAAAACTGGTCAATCAGGACACGCCCAAGCAGA
TGCGCAAAGGCCTGCTGCTCTCCTCACGCCTTGGATGATCTGGAAACACC
GAAAATGAGTGCATCTTTAAGGGTTCCCAGCCCTCTGTCCGCGCCCTTGT
CGCAAAGATCAAAGAGGAGGTCAATCTCTGGGCTAGAGTGGCACCCAAGG
GCTCCCGGTTGTCCTGCTGTTGACTTGAGATGTGCACTGATATTCCTGTA
TGTTTTCTATCATGCCTCTTAGGAGGATTGTAAATCTTGTGTTTTCTCGA
AACAAATCTCGTGTTTTCTAGCAGCATGTCGTGACAACTCAGTCGCCATT
TTAGGTAAAATATCGCCGATGAACAAGTTATGCACTCCAAATTCATTTGA
CCAGTCCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.