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GrainGenes Sequence Report: AE009954

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Sequence
AE009954
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE009954
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTGATCCCGATCCCATCCACAGCAAGGGGCCTAGCTAGCCTACTGTAAT
ACTCCAGTTGTTCTCTTATGATTCGGTACAAGTGGCAATATACTATAAGC
TTAATTGGAAGTCGTTTTTTTTATCTAAAACTAACCTTGTATAAAGCCTG
TCGCGTCCACAGATCCCCTCTCCTCCCTCGTCAAACTGCGCTTTGCCTCC
GTCGATATCTCTGCCTTTATGCTCCTTGCCCGCGTCGCGGCCAGGCGCCT
CGGGCTCATGCGGCAGTGCGTGTGGTCACCGGCGGCTGGCGGCTCGCGGA
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TGTACTCACCCTGTTCCATATTATCTGACTTTTTGGCAAACCAAGGACTT
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TATTCAACTTCGATCTAGTAAGTTAGAGAATCTGAATTGCCCAAAGACTA
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AAAAAGGTTAAGAAATCATGTCACCGAAACAATTTGACCTCTTTCTTCTT
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ATTTCAAAATATATGATGTTTTAGCCATTTTTGGGAAACACATGTATCTA
GACGTGTTTTTGTGGGTAGATTCACTCATTTTTATCCGAACTTACACATT
AAAAGGCGTCTAGATACATGTGTTTCAGAAAAAAAGTAAAACATCTTATA
TTTTAGAACGGGAGACTATTAAACTTCACAAAGCATTTTGATAGGTCATC
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GTCCAACTGTCGCACGCTTCTATCCCCGCGCTCTGAGAGAGCCATGAGGC
TGCCGGTGCCGGTGGCCGCACCACGCACCATGGACGAGCTCCTCCATATC
CCTGCGCCCTTCCCGCTGTTAGCAGCAGCGCATCTCTGCCGATGGAGTTC
CGTGTTCACAAGCTGGAGGTGTGGTGGTGGGTTTGATCGAGATCCCAGTC
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GTATTGCTACCATTTGCTAAATTTTTGTGTGCTACAACCGCTTATTCGGT
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TACTTTTGTTGTCTATTGTCACTACGTGATTTTGCTACTTTGGTATATTA
TTTTTACTACGCATTCATATTTGTTTTGCTACTTCTGCACAATTTTTTTT
GCTACAACCGCTTTCTGGTTTTGCTACAACGTTTTCGACGAGAGTCGTCG
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TAACATAATTTTTTTCTACATAGTCTCCGGTGAGGTCTCCAGTGAGGTCT
CCGGTGAAATATGTCTTTTATTTGTTTCGTGAAGGAATTATTTTTTAGTA
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GCAAAAGCATGATTGAGTCTTTTCTAGGACACGAGTCACCATGTCCACCA
GGGGCTCCGAAGCTTTTATACCCCGGGGACGCGTACTCCCCATTATAAAA
AAAGACTCTAAACCACATAAACTATTGTACTAAGCTAAGCGTGCGGCAAC
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TTGCATTATTTTACTGTAATTTGTTTTTGTGGGGTGCATTATTTTACTTT
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GGAATCCACTGTTGGCTACGGTGCTCGTGCTGGGTCCGACTCCGACGAGC
TTCGGTCCTCGACTTTGGACATAACGAGCCACTGTATTTGCAGCGGCCGG
AGCCGGACTACAAGTGCAAGCAGGGCGTGTGTCCCCTAAAACTTAAGTTT
GCTCGAAATCTATATCCAGCTATGTGTACCTCCGTATAAGTGTATTTAGT
CGAGCTGGGTATACTTCACAGTTCTATCGGCGAACTCATATCCCGTTGTC
GTGATCTACGTCTTTGTATGCCATATTTTGAATTTATTTTGCTTTTGCTA
TATAACTCCCGATTTCCACCCCGCAGGCACATGAGTATACATGTACGGTG
AGTATACGTCTAAGAGAACCATACGGCCCTTATGTGTGTTTATACGGTCC
GAAACGAATCAGTATCGAGTTTTTGTTGTCCAAGTTTAAAAAGTAGGAAG
GACACCGAAACAAAAGTGTTGTTTCAAGGAGCGTTTGACAACGGTTTTAC
CCATTAAAAAACAAGACACCTCCCAGGAGTATAAACTATAAACTAATACT
CCCTCCATTTCAAAATAAATAACTTTAGTTTATTTAGATTTGCATGTATC
ACAGTACTAAAATATGTTAGATACATTCAAATCTAAATAAATCGAAGTCA
GTTATTTTAGAATCGGAGGGAGTAACTAGGGAGCTACTCCCGTCCTACAC
GGGCAAAACCCGGCCCGATTCTGAACACCCGTAATTATTCCCTCCACCCA
CTGGCCAATAATTCAACTCCTCTTTCCCCTCTCTCTGCCCCTGGTGCGCT
TTCCCCGAAAATCCTCCCATGGCGTCAACGGCTGGGCTGCAAACCGCACA
CCGGCCACACGGCCACGGCGGGTTAAGCACCACTATCACATCCGCCCACC
CCTGCTTCCGCTCCAGGAATTTTCTACAGCCTCGTCCTCGTCGCTGCTCT
CGACGATGCTCGCATACGGTGGTGGTGGTGGTGGCCAAGGAGGAGGAGAA
GCTGCCCGGGGCACGACGAAGCCGCCGCGACGGCCTACTGGCGCTGCAGG
CTGCTGCTGCGGGTTCCTGTGGCGCCGCCGTAGAGGGAGCGGGTGCGGCT
CCAGGTACGCGCGCGAGCACCTGCCGCTAGCTGGTCGTCGTCGGAGCGGA
TGTGGAGATAGTCGTAGCACCGTAGAGGTAATGCACACCACACTGTACTG
TAGCCGTGAATCGCAGCCGCTCGTTGTGGCTAATCTTCAGCAACGCACCC
GCATGCTATAATAGCTTTGCAATACATGATCCAACCACTTGAGGTCCCAA
AAAAAAAGGCGCAACCACCTCCTACGGCATTCGCTTTACTAAGACACCGT
GTCAATAATGCTCTGTCCGATCAACCATCACATGCAACAAATACCCTGCT
CTCAAGTCTCGGCAGCAACATGTAGTACTAGGCATAAGATAAAAGGTGTA
CTCGTAGCAAATGAAGAAGTTCATATAGTCCACACCAAATGCTTCATGGG
TTCCTGTATTTCGGTGGGTTCCAAAATAGATGATCTTACCTGGAAACTTT
GAACTTCGTTTCAAAAAAAATACAAATCAAATTTGTATCTGGTCACAACT
CATGATGAGTTAGATTGTTTTTTCCAAATTCCAGATACTACCAACATATT
AAACCCTACCAACAACAAGTGATGATGGATTAGTAGTCCTAAGGATGGCA
AAAGCTCTCGGTTTCTTGTTTTATTAGTTATCACATAATATAGCGCATAG
CTCCGGCTCTCACATTTAATAAGAAATAAGAATTTCAGAGTAGACTTCAA
AGTAAATGTTGTAAGATATATGTTTGGACAATATTGTCCATTATCTACAA
TGAAATGTACATGTATAAGAAATAATCATGAAGTAATAGCAAAACATCAA
AAATATTTTGAATCTTTTAGTGTATTTAATAATTTTAAGAACAATTTGTA
AGTTGGATTTAATATATACAATATTTTTCAAATTATATTTATGAAATTTA
AAATCAAGTCTATAAATATTTTTTTATCTATGTCATTAAAATATCCATGT
ATGTGGAACAAAATGTTCATGAATCATCCAAAAATCGTTTCGATTAAAAA
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CCCCTTAAGCGTTAACTCTATTGTATTCAATTTTGATGTTATTTTTGCTA
CATACAAGCAAATGTACATGCATTAACAAAATTTTATATTACATGGATGT
TTTTATAAACTACATGAATAAATTATGTATTATAAGTACCAACTACAAAA
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AAATATCAAAACAATTGTTTAATGAGTCACTGGCCTATGGGAGAGTTGTG
CAAGCTGAAGATCCTTCTCCTTCTTAAGGCAGGAGCTAGGAAATCCAGCA
GTATCACCCTTATGGTAGGTCAGATGATGTGGTTTGTCGAGCGCACTTTA
GGTTTAGAGCGTTCGATGGAGGTCCTCACAAAACGATCAACATGAATCTC
GAGGAAAATCATGTGAATAGAGGGATGTGATAAGACATAGATGTGAAACA
CTATGTGGAGTTGGCATTCGGAAAATAGAAAATATACATGTCATCTTAAA
TATTGGTTCTCCACAGCTTTGAGGTTGCTTAAGCAATGTAAAATTTATTA
CTATAAGACATACAACTTTATTTAGCATTCAACGCACATATTTTGGTGAA
GGAAGAATTATTGATAGTTATGGTTCTTTATGCACTAATTAAGTATTGCC
TGCAGCTACCAAGCCTGCCTTCAGGAATATCTTGACCAGCCTCCCTAAGC
CAGGTGGTGGTGAATATGGCAAGTTCTACAGTATTCCTGCACTGAATGAT
CCAAGGATCGGTAATGACTTTGCCTTTTCTTTTCTACATCTTTTCTTATA
TATATTTTTTCCTCCTCTTGCGTTGGACGACTCAGTTGAGAACGTGCAAT
GCAGCTTTTACACAACATATATCACACTGGAACACAAAATAATTTTTCAG
TTGCATACATTATATTTCAACAATGTTTGACTTGGGAATATATGTTGCAT
CGGCAAAATGCCAACGTGTTACGTTCGACCAGCCCTTAGACCTTTAGTTT
GCACACATGTAGACTGCAATTAAATATGTACTCTATCCCAGGAGTATTTA
GATTTGGAAACTAATTTTCTCTAACAAATATTTCTTTCATCATTTGTCAG
ATAAGCTACCCTACTCCATCCGAATTCTGTTAGAATCTGCTATCCGCAAC
TGTGATAACTTCCAAGTTACGGAGAGTGATGTCGAGAAAATCATTGACTG
GGAGAAGACATCCCCAAAGCTTGCCGAGATACCTTTCAAGCCAGCACGGC
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CGAGTGCATTTTGCTCAGTATTGCCCTCAATTATTCTTTAGGATAACACT
GGGGGACCAGCGGTTGTAGATCTTGCAGCCATGCGAGATGTGATGGCAGA
GCTGGGCAATGACGCCAACAAGATCAATCCTCTGGTAAAACTTTCAACGT
TGTTATCCGAAGATTTGTGACCATCTTTAGTTTTTGTAGCAAAATAAGAA
GCACAAGAAAGAAATTACTATATGTGACGCCGTTGCCCATCAATCCTCCT
GGCGTCTATCTTTTTTATTGAACTATATGTTTCGATACATATTTCTGATT
TGGTTTCTTTCAGATTCCGGTGGATCTTGTCATTGACCACTCGGTGCGGG
TGGACGTAGCAAGGTGTGAGGATGCACTGAAACAAAACATGAGCCTGGAG
TTTAGCCGCAACAAAGAAAGGTTCAGTTTCTTCAAATGGGCGTCTTCTGC
TTTCAACAACATGCTGGTTCTGCCCCCTGGTTCGGGGATCCTTCACCAAG
TAAATGATCTGGATCCAAGGGACATTTTCTTTTGCACTGTCTGAAGAACT
ATTTGTTCTCACTTTTTTTTTTGTAAAACAAATTTCAGGTCAATCTTGAG
TACCTTTCCAGAGTTGTGTTCAAAGCGGATGGTGTCATGTACCCTGACAG
CGTGGTTGGCACCGATTCTCACACCACGATGATTAACAGTCTCGGTGTGG
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CGAACTCAACACTAGCTTTGTTTAATTATACAGGCCACTAATACCGGTAC
TCCCCAACAAGAAAATGATCTTCCTCGAACACAGCACTCCCCTTTTTAAA
CTATAACTGTCCATACCATGCCGACAGGCCACTAAAACTAACAAAGGTTA
ACAGAACAATGCCGTCACTTTTGATTTCCATAGTGGATAAATGTATGAAT
ATAGAATCCCCAATGTTTTGGTCAGATTTAATGAAATGGAGCTAGTACAT
GTCTGATTTCCTTAATTACTAGGTAAATTTTGGAGTGCCTCCAATTGACC
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TTGGGCTCAAGCTGACTGGAAAGTTACAGGATGGTGTCAGTACTACTGAC
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CGCAAACATGACGCCAGAATATGGAGCTACTATGGGTTTCTTCCCTGTAG
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GTATGCTCCTCTACCAACATACTCCATTGCCCGTACCATATCATAGCTAA
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AGGGTGCGTGGCCCCTTTCTTCTTAAGAAAATAGTTGGATTAAATTAAGA
CTGAGCAGCTCATAATGGTTTCTACGAAACATTGCATATTATAGGACTTG
CTTTGTTGGGTTGGGCTATGTGCTAACTTTATTCACAGAGGAAAGATAAA
TCCCAACCAAACAATTATCTTTCGCCATCTCAGAAAGCCGAAGAGTTAAA
AATTAGAATCATGATTTTACAAAAACCATACTCCCTCTGTTCCATATACT
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TAAAGTACAAGATCTATGTAATGTGAAAGCATGTTCCATTTTTTCTCGTA
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TCAAACTTTGTAACATTTAACTTTGATTAAACCTAATATGTGGAGTAATT
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AAAAACTGTGTACATAATTATGAAAACCAAATCTTGCATTTTGATTTAGG
TGTTGATGATTGAAGCATATTTGCGAGCTAACAAGATGTTTGTGGACAGC
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TTGAACCTTGAATTTGGGTGCATATTTCTTCTCCAATTGAAGGATATTTA
GCTCATCCTATGAGTTCCTTCATGTTTTTCACAATATAAATACTCTGATG
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AAAAACATTCCAGGGTTACGCAGTGCCAAAGGAACAACATGATAAAGTTG
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GGCTGGTCGGCGCTCCGCCACAATGATCTGTGGTTTGGGTTGGGTTGTCA
TACCCTGTTTCCTTCTTCTGACCATGCGACAACACTTGTCTTCAGGTGAA
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GAACATGGAATTGCAGTTGTGTCGTATAGAACATGGGAAAAAATCGTCAA
AATTTTGCTCAAAATTCGCAAAAATTACTAATCTTGGGGAGGGGCGAGAA
AACATGATTTCGTTCAAAAATTCTGATTAAATTTGGAAAATTCTCATACA
TACCCTTCTAAGTGAAAAAAATCACTTAATTGTTATCAACTATGTATTGG
TCCATGGTTGACGGGCCTGGGGCATTATGCAAGGTCATGAGTCCGATTAA
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TGGCCGATTTTTTAAAATTTCTTCTTCGAAATTTCATAAATTTCGTGTAA
GGCTATGGGCACAAGAAAATTCCAAAACGAAATACTCCCTCCATCCCAAA
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AGTGTGTAGATACATTCGAATCTAGATTAATGAAGTCACTTATTTTGGGA
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TGGATTATTCATGCAGTGGCCTTCAAGAATATCTGAACAAGCAAGGGTTC
CATATTGTCGGATATGGTTGTACCACTTGCATCGGCAACTCCGGCGACCT
TGATGAATCTGTATCAGCTGCCATTACGGAAAATGGTATATGCTCGTAGC
TCAGGGTTCTATCCACGCTGAATATTTGTCGCTGCAATGAGTTCGTGTTT
AAGGTTTATATGTTTTTGGCTTAGACGTTGTTGCTGCTGCCGTGCTGTCG
GGCAACCGTAACTACGAGGGCCGCGTGCACCCTCTGACTCGGGCTAACTA
TCTCGCCTCGCCACCTCTGGTTGTTGTCTACGCTCTTGCTGGCACTGTAA
GTAGGCATCGTCTCACCTTGATACTGCTCTCATACATGCATAGCTCTCTC
AATCTCTTTGCATGGTGGTTAACATGGGCTAAATACATTTTTTTGCCGTT
TTAGGTTGACATTGATTTTGAGAAGGAACCCATTGGTGTTGGGAAGGACG
GCAAGGAGGTTTATTTCAGGGATGTATGGCCTATAGCTCAAGAAATCGAA
CAGGTACCGAAACTTCACGAGGGCATTGGGCTTATTTGATTCAAAGGAAT
CTCATATGAATTTTGGAGGATTTTGATCCTTAAGAAATTTTCCCCTGAAT
AGCGTTCGAATCATAGGATTAGATCCCTAGAAAATTTTCCCATAGGATTG
CATTGTATTTTGTTTTGGAGGAAATTTTCAATTCACTCAAATCTTATGTT
AAAATTCCTTTATTTTTGTCCTTTGAATCAAACCCAGCTTAAAGAAAATT
TCTGTAGATTCAAAATCCTATAGGATTCAGGTGAACATGAGTACATGACA
CTCTAATCCCGCGGTTTTCTTATTTCTATGTTTTTCTTATCATGTGAATC
AAACATGACCTAAGTTTGATCTGATTATATACAACTACAAGTCTATAACT
GAAATGCTACTTGATCGATGACCAGGTTATCAAATCCAGTGTGCTGCCGG
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GACCTACATCCACAAGCCAGCGTACCTTGAGAACCTGACCATGTCCCCGC
CCGGCCCGCCCTCGGTGAAGGACGCCTACTGCCTGCTCAGCCTCGGCGAC
AGCATCACCACCGACCACATATCGCCCTCGGGGGTTATCAAGCCGGGCAC
CCCCGCCGCCAAGTATCTGTTGGAGCGCGGCGTGGAGCCCAAAAACTTCA
CTACGTACGGCAGCCGACGTGCCAACGACGAGATCGTCGTGAGAGGGGCG
TTTGCCAACATAAGGATTGTGAATAAGCTTCTCAAGGGAGAGGTTGGGCC
CAAGACCATCCACGTCCCTACTGAGGAGAAGCTTTATGTTTTCGACGCGG
CCATGGTATGTGATCTTCTACTTTCTAAGTTGACTTACAAATAAGTACTC
GACTAATTTTGAACTCATTGAATTACTATCCAACCTCGCTCCATTACTAA
AACGACACACTTTTTAATAAGCATATATAGTTCTCAGGGACCATGCTAGG
TTTATAAAAAATCAAGCAACCTATAAATAAATAAAAACAGTTTTAACATC
TTTTGTTTTGTCTGTTGCCATTTTTAATGAATGCAGAAATACAAGTCGGA
GGGTCATGACATGATCATTCTTGCCGGTGATGAGTACGGGGCCGGCAGCT
CTCGTGATAGCGCTGCCAAGGGTCCATTGCTCCTGGTAATCCATTTGTCT
CCATGGATAGACGTTAGCCCGATCCTCGGTCTTGTTTCACAAGAGCTAAT
TAGCAAGTCGTGGTGTGTTTCAAACAGGGTGTGAAGTCAGTCATCGCCAA
AGGCTTCGAGCGCATCCACCGAAGCAACTTGGTTGGGATGGGTATCATCC
CTCTCTGCTTCAAGGATGGGGAGGATGCTGATTCGCTCGGTCTCACCGGG
CATGAGAAGTTCACCATCGACCTCCCAAGCAACATCAGCGAGATTAGTCC
TGGCCAGGATGTGACCGTGACTACAAACACTGGGAAATCCTTCACTTCCA
CTCTTTGCATCAACACGCAGGTATGTTAAAGCCATCATGTAAATCATTTT
GCATATTAATATACATTCTTCAAAGTACTCTTGTTATTATTAATTTAGTG
ATGTAGATTTTATTAACCTTTTTTAAGTCTATTACAAGCTACATTGTTTT
GTTCTTGCTTGTGGTGTAGGTGGAGCTTGAATACTTCAACCATGGAGGCA
TCCTCCCCTACCTTATCCGCAAATTGGCAGAGCCGAGTGAGGAACAATAG
CTGAGTTGTATTGGCTACGCAAGGGCATGATTTTATTCTTTATTAATCAA
TTGTTTGTACCCTCTTGATCCCATGCTATCTTTCACTTCTTGTAATAAGT
TCTTCACAAACATTCAATACGAAGCAAGCCTTCAACAGAAGTTAAGAGGG
GACAAACTAGTTGATTGTGTACTTCATCCTTTATTTATAAAGACAACCAG
TGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.