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GrainGenes Sequence Report: AE006118

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Sequence
AE006118
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE006118
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGTTCCTAAAGATTCCCCAAAAGCCCAACACCGAGCTGAAAATCACGAT
TCGACACCCATTTCGAACTGTTCCACTCGCCGGAGGCGGGGCGATGCCCT
CGAGGAGCAAGTCCGTCCGCCGCCGCGGCGATACTGACGATGACGAGGAG
GAGGTCGTCACCGTCTCCTCCGACCCCGACGAGTCGGAATCCGAGGCGGA
GCGCGGGGCGGAGGCAGACGACGACGACGAGTACGTGGCAGAGAGCAGCG
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GGCGACGGCGGGCGGCTACTTCGGGGCGGGCGGCGCGGGGTCGCGGAGCC
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GTCATTTTTCTCTTAACTTGCCTTCCACACACAGAAATTTGTTTTGGCTT
AGTCGACTGTAGCTTGACTAATGCATTCTCTTGTTTGAAGATATTTATGT
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TTATTCCGCGTATCCTTTCAGTTTCTGATGCGGCAGCGGTAGCTCGAAAA
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GATGATTCCTCAAAAAAGGAGGAACCTCTTCCACCTGGCATAGAGCCATT
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CTATAGAAGTTGATCATTTGCTTGTACGTTACCTTCGTCCTCATCAAAGG
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AAGCCTAGTTAGCAACTGGGAAGCCGAGATAAGTAAATGGTTAAAAGGCA
AAGTGCACCTGCTTGCTCTTTGTGAAAGCACGCGTGCTGATGTTCTTTCT
GGAATAGGGAGTTTCTTAAAGCCCTTGAGCTGTCTTCAGGTGTTCTTTCT
CCCAAACTCTTAGCCTTTTTGCAGTTTTTGTACTTACAATCATACCAAAC
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GGCTGAAAAATGACCAGACACTAACAAACAAGGTATACCAATTTGCCAAT
TCAGGTTCTCAAGTTTTTTGCCAATCTGGTTGCACTTCATCCATAAGTGA
GGTGTTTGCACTTGGGTTCCTCCTGATTTTGTTCTGCCCGAACTCATCAA
AACACTTAATGCGCCAGGCATTGGCCGCCCTTCCTTGTACACGGCGTATC
CTGTTGTCAGGTACCCCAATGCAGGTAGTTCTTTGCTTTCCCATTTCTTT
TCATTTTGTAGATGGAACCATTGTTTTGGATTTCGATATATTCATTTTAT
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ATCCAGGAGTTCTAGGGGATGCTGCATATTTTCGCCGATATTATGAAGTA
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TTAACACATAGAAGTGTTTTCAGACATGATTAGATTTGTTATTCAAGTTA
TTTTTGTGTGTTCTGCACCTAAAATTATGTCTCAATATTATTCCCATTAA
TTGCATTCTATCTTCCTTTGTGATGTACTTAACTCTAGCATTATCCACCC
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AATCAGGCAAGTCTTTTCCTTCTGAAGAAGGTTGTCTGCAATACGTAATT
TCGTGCAACTCTATTGTTCACATGTTATGCTATAATCTCCTTTAGATTTT
TTAGGATACATTTCCTTCTTCAGTTTTTTAAGCTTGCTGCAGACTAATTA
CCTTCTGAATTCTGATGGCTTCTCAATGATATTCAGTTTATATTGAGACG
AACGAATGCCCTCTTGTCCAATCACTTGCCACCAAAGGTATGTTTGGCCT
AATATGGTCACCGCGCAATCAAAAACTTAAAAAAATTGTGTACCTACTAG
GCTGCTGTCCATTTTGTTATCTTATAGTGATTCTCTCTTCTTTCTTTCTT
CTTATGTATAGATTGTTGAAGTAGTGTGCTGCAAGCTAACTCCTTTGCAG
ATGACCTTGTACAACCACTTCATACACTCCAAAAATGTGAGGGAACTTTA
TTTGTTCTGAGTCTCGTTCATTAGGCACATGTAAGGCAGTGAGTGTTATA
TTTACAATATTCTATTGTTGACCCTGTCAGGTTAAACGCTTGATTTCGGA
AGAAGCAAAGCATTCTAAAGTTTTGGCATATATTACCGCTCTTAAGAAAC
TATGCAACCATCCAAAGGTAATAATTTCAGTTTAATGTTTTGTCCGTGAT
GCATTAAATAAAAACTCGACCTGTGGGGGGAGGACAGCTCCCACAAAGGT
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ATGCTATTGACGCGTTTGCTTGTCTGCAATGCATTCATCATGCCCTTTTA
GTGAAAAGTAGTTTCAACTGTAGGTTCAGAGTTTATAGACAGTCTGTTAG
TTTTTACTGCAACCGTAATTTGCTAAGCGTCAACATGTCGAGCTGCGGCT
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TTCTTGTCATGATCTGTGTTGAAGTATTTGTTTTTTTCCTTTTCAATTCA
AAAAAGTATTTATTTTGTGCAAATATGATTTGATAGGTTATGAGAAAATT
CTGGGCTGTTGTTGCTTGTGTTACTGTTCTTTATAGCCATTCAGCATCAG
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TGGTTATCTTGGTATTGCAGCTGATCTATGACACCATAAAAAGTAGCAAG
TCGGGAGGCTCCGATTTTGATGACTGCCTACGCTTTTTCCCTCCAGAATT
GTTTCAAGGAAGGTATGCCTTACTTTTCTCACTAGCTTCTCAAGCTAATC
CAACTTATCTGTATTGTTTATTTATGCAAGATCCGGATCTTGGACTGGTG
GAGGAGGAATGTGGGTAGAACTATCTGGCAAAATGCATGTGTTGGCTAGA
TTGCTGGGGCACCTCCGACTAAAAACCGATGATCGTATTGTCCTGGTATC
AAATTATACTCAGGTCAGGTGTTTCTAATGTATTATCTTGATATGACATT
GTATCATTGTGTTAAGGTTCTGTTGGTATTGGTAGGTTCATCAGGAATGG
ATGTCGTAATTTTGAACGTATCTCCTCTTGTTAATGAACTGGCAAAGCTC
TTGCTGTGTATGTTCCAAAAATAAAATAAGATGGATGGAGCTACCGTTGG
TGATGACAAAATTTGTATCTGCAAAACATTCCTGAGTCTTGCAACAATAA
ATCGAACAGGAATATGGAGGACTTCAACCCTGGCCGCCACCCTGCAGCTT
GAGGACAAGCTGCTTGTCCGGGAGGGGTGTAGTGTTGTGGATGCTAGTAA
GATGGATGCAGCTGGCCGGACGGCAAGAAGACCAGGATGTTCGTATTGGA
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CATGTCTACCCAAACCCTAGCAGCCACGCCGTCTGGCTATCTTCAGCACG
GTAGTTATCCCGTTGTGGATCCAAGTCCACAATACGCTGCTGGCGAGTGG
CCGATCGACTGGAGTAGGCTGTAGGAGAGTACCATCGACGTTCCTGCCCG
GCGCTACCCTAGCTCCCTTCGACCTGAAGATCACGCCGAGTCGCCGCCGC
CAGGCGCAATTCCCATCCTGTTCTCTCGATGGGTTTCTCTTCTTGCTCCC
AGAAGTTGCGGTCGTTCACTCGACCGGTTTCTCTTCTCGCTCGATGCCTT
AATCAGAATTCAGAAGCTAAGACAACTAGAGGAGGTGACTGGCGACGTGT
GGTTCGAGTGGAGGGAGAGCAGCCTTGCTCGATCACGCGCAGTAGGCCAG
CCTAGTGAGACTATACGGCCCAACAGGCTACAGGCAAGAGGCAACACACA
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ATGATGCTAGCTAGCTGAATAGGTATATACACCCTTTTTTTCAAACGAAA
TTATAAATACTCCTGAAAAACGAAGGGATGTTCGTAAGCCATCATTAATG
CTAAAATCTTCATTGGTTACTGTCATGTTAATGGTCAGACCATATCCTGT
GGACATGCTAATTATAAGAAGTATGCAAGGTATTACAACTTACTGTATTC
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GTGTGGCCTAGTTTCTGTTCGTAGAAGATGCTAGTTACAGTTTATTTGCT
ATTTGGATACCTGCACAGCTGGAAATGTTAACCATTATCATTGTCTAAAA
GTGCAGACATTAGATTTATTTGCACAACTGTGCCGGGAAAGAAGATACCC
ATATGTTAGACTTGATGGCTCAACATCCATTAATAAAAGACAAAAGTTGG
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TGAAGAATTTAGAACCTACCACTATATCTGAAATTACTGTATCTGGCAGG
ATGAATTTGTCTTTCTACTTAGTAGCAAGGCAGGTGGTTGTGGGCTTAAT
TTGGTGGGTGGAAATCGATTGGTTCTCTTTGACCCTGATTGGAACCCTGC
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GGTTCTTTTTAACTACACACCTTGTATGAGCTGAACCTTTTAGTCTATTG
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ATCCAGTGAAGGAAATACTGAGTTGCTGTCTACTTCTTCTGCTGACAGTA
TGATATGCCACATTCATCTTTAGGTATATCAGCGCCAAATGTCAAAAGAA
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CAATACTGATTTCTCACATCTTTGTTTCACTTTTACAGGGAAATTCTCTT
TCAACAGAGGATCTGCGTGATCTGTTTACTTTTCATGAACAAGTCAGGTG
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GGAACTGGGTGGTAGAAAGACATCGACATTGCTAACTTCTTTTCGTTAAT
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CAGTGTTCTGCTGGGGATGAGGTGATAGCCGCAGTTCATGTTTCTTATGT
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GTAGTGTTGATTAAAACATGTCTTTCAGGAATTTTTGGCAACTGTTAACC
AATACCACGTGTATCTTGCAGGTTTCTTTTGTTTTCACCAATCAGATTGA
TGGGAAACTTGTTCCAGTTGAATCTATGGTGCGATTACCAACTCATCAAC
CAAATGGAATGAAAGCTAGTGGAGAAAAAGAAGCGCCAAAAATATTTTCT
CCGAGCAAACCTGGAAGGCAATCTTTACTTGGCAAGAATTTGAAGATGAC
GGGATTCAATCTGAAGAATTCATCTTTGAAATGTCCAACTAAATCCAAGA
GGGCATCTCCAATTTGCTTGCAAACGTTGAATAAAACCAACCCCTTATCG
GATCATCAACCTCAGACTAAAAGAATTCATGTTGCTTCTGATATATCTGA
TGATGACTTTGTTTGAGTCTATCTGACTTAAAATTCTTCATTGATAATGT
AATCCGTTGATCTGTATTATGTTGTGTAAATACTGTCATCTGCTTTCTGC
AGTGTAAATACTGCATAGAATTACGGTGAGTTAACGAGTCCTCCTAAAAA
AATCCACCATGAGCTTGCATCTGTTTGTAAAATGCATATCAAACATATTT
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TGAATAGAGCATTATTCATCACTTGGTCTTTTCATCAGCGTAAGAAAAAC
TGACATGGTTGCTGATTACTTTCAGATCATTTCAAGACAAAGGGCTGCAC
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TTGCAGTCTTGCCACAGAATTTTCTTGGCAGCTGTGTATTTGTCTATGGA
TCCACTTTTCACTTCATTTGATGCTGTGTTAAAATCTTGAGTCCGTTTTA
GCAGTGTACAATTTCCACAAACTGTCCATAATGTACTCTTATATTCATAG
GCCAGCAATTCTCTCCCTGCTCGTTATACATGCAATTCTCAGGTAGAGTT
TGGTTGTAGCTGTTACCGTAATAGAGGTTGAGGAAATTGTGAGATCTGCG
GTATGCAAAGAGACCAACTGGGGGATTTCAGCATGTTGTTCTGATAGACA
ACTAGATCAGGCACTCGGCTGTTTGCTTTCACCACCAGCTGTTTGTTATT
TAGGCCTTAGCATGTGGGTGACAGCCATACCTTTCAGTTAGTCTATTAAA
AGCTTGGCATTTGCACTGTTGCACTCACCCCCCCTTAGCATAGTCAAATC
AAAGTAGTCATAGATCCAGCCCAGCGACTATTTAGTATCATCTTGGACAA
GCATAAACTGAAAAATTGGAAATTCCTGCTTATGCAGTTGCTCACGCTTC
TTGACTCTAATCAAAATAGAACTTTGATGCAATAAGCTGGATGTTTCCCC
CCTAGATCATCCTTAATACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGACGTGGGTT
TGTCTAGACTCGGATGTATCTAGACACGTTTTAGTACATAGGTTCATGCG
AATCTAGACAAACTCACGTCACTTATTTTGGGACGGAGGGAGTATAATTT
ATTGAATTTGGGTTTAGAATTTGGACACTGTCGCTGATAAGGGAGAAATT
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TCATTCACACCCATCACATGTGCAGTCACAAAAGTTAACACATTGCTGGA
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AGAGCTCACTAAAACCTTGACCATCATGTGATACTTAAGGTTTTCAAGCA
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CTTTTGTTCCTAACATGTCATTGTATTTGCAAGAATATTTTGTACATAAT
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TCTTATGCTCATTGTCTGTAGGAGACTTCTGCAAAACTTCAGATTTGTGT
GGTATGGATGGAGTATCCAGTTGCTAGTAATTCTGCTACTGAAGCATGTT
AGCTCCATCTATTAGCATGCTACTGTGAGATGACCTGAAACTACATGATT
ATTTATAATGGTACTATTTCCACTAGGAACACTATAGTTGTGATTTAATA
CAATAGGACATGCATTACTAAGGAACATGAACTCTTTGACTGGTCTGCTG
TGAGGTGACCTGTAGGAGGCATAGGACGGAGGCCCGTGTTATCAATTGTC
ATGGAGATGGAACCAGTGCGAGGAGGATCCTTTGGGATCACATGGTCCTA
TTCTGAGAGGTTGATGTCGCCAGCTCACTCTGGCTAATAACAAACCAGTC
AAGTATCGGTCAAATGATTTTGTTACCTACTTTCTCCCTCCTGCTGGTGC
CCAGCTGATTCCACTCCCGGACAATCTTTAAGCCAGTTAGCATTTCTTTT
GTTAATCCTGCATGTCTATGCGTATATACGCATCTCTAAATCTGCCAGAT
TAGAAGTTTTAGTTTATCTTTCTATAGAAAATTAAGAGTTTCAGTGAATA
GAAGGTCCCAATCATGGTTGAAAATTCAAATTTTGAAGAAATTAGAATTT
TAATTCTTATTGGATGTTAGGTTTAGACTGTAGCATGCATCATTTTTACT
AGATTTAACCATCATCACTGGCACAATCCTGTCCCTCTCTTGAGAAAACT
ATAATCCCTTGCGCCAGCGATATATGGTGATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.