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GrainGenes Sequence Report: AE029466

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Sequence
AE029466
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE029466
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCAGTTCCAACTCACCAGTCCAAAGCATTCTCTCCACCGGCAGCAGCAGC
GCGCGCTCCCTCTCAATTCCGCCGCCACCACCGCATCTCGAGCAGTTCGC
CGGAGAAGGAAGATGGCCGGAAGGAAGGGAGGCGACAGGAAGAAGGCGGT
GACCCGCTCCGTCAAGGCCGGCCTCCAGTTCCCCGTCGGCCGCATCGGAC
GTTTCCTGAAGAAGGGCCGGTACGCGCAGCGCGTCGGCTCCGGCGCCCCC
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CCTCCAATCCCCTACCCGTTCTTCCGATTCTGCTCTCTTGCTCTCGACGC
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GGAGCTCGCCGGCAACGCCGCCAAGGACAACAAGAAGTCCCGCATCGTGC
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GCTGCCGCCACCGAGGAGTAGGGAACCATAGGTCAACAAGTGCTGATTCT
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CTGTGTGAGATCTGGTGTTTTTTCGGTTATAGATGGTAAGTGTGCAAACC
TCCTTTTTTTTCATGCTAGAGTGAACTATCCTTCCTATGATTGCAATTTT
GTGGTGGAATTCTTGCAAATATTTCCCTCCAATTTTGACTGAACGTAAAT
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GAACATTGATATGGTCCAGATTTCTTTGATGCCTTGGTATCTGTTCCACT
GACTTGAGTTGCAGGTCATACTCCTGCTGTTCAGAATGTTTTAATTTGGT
CTCACTTTGTTTGATGCTTGAACCCGAATCTCTTATCTGTTTGAGGTGGG
ATGAGCTTCCTCTGTTACACGTGGTTATTATTTGCAAACCTACTTAGGAA
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GCAGGTCTTTCGTACGACACCAATGAGATTGCACTCAAGGATGCATTCTC
TCAGCATGGCGATGTTATTGAAGGTGGTGAACCTATCTGTTCTCGATATT
CTTAGTGGTCGACCGGTGATTTTCGTTGATTAGACATTGACCTGTAAAAC
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ATCCAAAGGATACGGGTTTGTCAGGTTCCCTTCGGAAACTGAAGCAGCCG
CAGCATTGCAGAAGATGAGAGACGAGGTGAACTGTGCTTCGTACATCCGT
AGACATAGCACATGTCAAGTTCTTGCAGGATAGTGCTCAGCGTGGTTTTT
ATCCTACAGAGCCAACACGGCTTTCCTACATGATGACAGTTGTTTAGTTT
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TGCTGCTGCTGTACATATAAGTAAGGTGCTTATTTGCTATCGTTTCTTGT
GTTCGGAATCTGTGATGTTAAATCATGTAGTATGCATATATGTTAAATCT
ATTATGTTGAGCAATTCATGTGCTGATCTTAGAATTTGAATGCCATCAAG
TCTCTGTCCATCCAGTATTCCAGTAATATATTATGTATGCTCCAGCATGC
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ACTTTCGAAAAAAATATTTACCTCTGTGAATTAGAGCTTACTTCAGAGTG
CTGCTGCCAAATTAAACTGAGTTTAATTTTCACAATTTTACCAACAGGAG
AGCTGCATTTCTTCAAGCACACATGATTCAGTAGGGATTCACAAAGGGAA
AATTATACTCCCTCCGATCCAAATTAATTGACTCAGATTTGTCTAGATTC
GGATGTATCTAGACATATTTTAGTGCTAGATACATCCGAATCTAGACAAA
TCTGAGTCAATTAATTTGGATCGGAGGGAGTATTACGAACCATCTAATAT
TTAACTCAACCAGCTAATCACATAACACAAGGGAGCCTTCTTTATTTGAC
CTACTGCCTTCCTTCTTTATTTGACCTACTGCCTTCAAGGAGTTGTAGGC
CTGTAGCTCAACTAGTATAGGAGTAGCACAGAACAAAACATGAATGTATA
TGCCTATAATATAGTTTGTTCACATTTTTTGTTGACATCACCAAGCAAGT
GACAAAACACCATATCATCCCATCAGGCAGTATTGTACCTTATAGCCCTC
TACAGTGATTGCAGGCATGCACAATGCATATTACCTACGATTTAGAATAC
TTGAAGATCAAAACTGGTACGGAAGGCCGATTTGCCTCATAAGTAGTACT
TCTAGGCAGGATGTCAGCCACCCTTTATTCTTCATTCTTGTTGATATCGA
GTAAGGTGCTTATTCGATATCGTTTCTTGTGACCTGTGATGCTAAATCGT
GTATTAAGTATGTTAAATCTGTGATGCCTGACAGTTCATGTTCTGATCTT
AGAACTTGAATATGTCATCAAGTCTCTGGGAAATATCTGTCCATCCAGTA
GTGTATTATGTATGCTGCAGCATGCGTGGCTAACTATTCAGAGTGCCACT
AGATCTTTTTTTTGGCAAATTTATTCAGTGGCATGTAGTAATTTTGGGTG
GACAATTGCATTTCTTCAAGCACGCATGAATCAGTAGAGATTCACAATGG
AAAAAATATATTATGTATCATCTCATATTTAACTCAACCAGCCAATGAAA
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TTCAAGGCTTCAGAGTTTAAATGAGCTGTAGCTCAACAGCACATGAGTAA
CACAGAGCAGGAATCAGAACGTGTACACTTATAATATAAATGAAGCGGTA
AGCATGTACTCTGGATTTTTTGCATTTGCATGATTACAGTACATACTGTC
CAGTGTCCAGTCTTAACTTATTGCTTCACCAATAGCCTAGCTTTCAGTTT
TTTAGCTTGGCAATGCCTGTAGTATCTTGCTTGTTGACAACTGAAAAAAA
ACAGAGGAACACATGATTCCTCACCTTTTTTTCTTCCACTACAATACAAA
TTATTAGCAAAGATTGTTTGGGGTTCTATGTCAATATTAACGCTGGGTTG
TGAACTATTTGACCGTCTTTGGGAACAAATTGATGCCCTGATCTTAAAAA
ATCTTCAGTATGCCCTGACTTACGAAACTTCAGTAAGAAGAACACATTGA
CAGCAGGATACAGTCCTCGACTGATTTCAGCTAAGTGATGGGAAGGAGCG
CCTTGCAACCCCAATCCATGCATGCACGTTGTATAATCAGGGCATACCGA
CTTTCCTCTGTTCAAAACAAATTGATGCCCTGAGCCTGACCTTAAGAAAC
TTCAGTAGGCAAAACACATTGAAGCAACCATTTTTTGTTGGAATCGGAAA
TTATGTACTTTTCCCCCTAATCGGGCATGCTTGCCTCAATCTCATCACTT
GGTTTGCTTGCTGCTATATTGATCTTCATGAAGGATGTAGTGACAAAGCT
CATATGTGTGGTTGCCTCCTAGGAAGGATCAGTGTGATTCCATGTTTACT
CTCATGTCTCATGCCAACATCTCAGAAAGAAATTAAGAAAGTTTACGACA
GGTCTGTTATGAACCGGTGTTCTTAGTTTGCATTCCTATGATATATAACT
GCTCATCAGGTTCTTGTATGCAGGTACAAGCCGGCAACACTGATGAAGTG
CAACCATGGAGATGATAATGATTCCTTTGGCTGAGGAAGGCTCTTGTATT
CCAGCTGTGTGTGTTGGCTGGAGCATTACCGTTAGACAGATCAAGTGTTA
TTGGGAGACATTACGTTGTCCACTAATTTTATCTGGAACGCGGTACTGTT
TTCATGTAATTTTGTCGATCTGTCTAACTTCAGACGATGAACAATGTGTT
GTTCATAATGGAGACTAATGTCAATCCAATGTCCAGCACCAACATGTTAA
TTCCTGGTACATACACGCTACTGAAAATGCACAAAGAACTGACTAGCTCT
TGCTGTAAAAAGAACTGTATAGTTTTTTTTAGTGTTATATGGGTAACATT
CATGGCCATGGATAATTTCCATGGGCCATGGCCCAGTAGCCCATTCATAT
CGTAAACGCACAGGACGCCCTGGTGCGAAACCTTCTCTCCGCCACCACAT
AGAACGCCTCGCCGCCGCCGACGGCGACGATGTGGCGGTCGGGTGCCCGT
GCTCTTCTCTCGTCGCAGCCAAATCCCCTCCGAACCTTGGTCCAGACTCC
ACCCCCACGCCTTCTTCCCCGTTTCCTCTCCTCCTCCTCGCCAGTTCCAG
ATTCCGCGTCCTCCTCCTCGCCGCCGGCCTTCACCGGCAACCTCAAGGTG
ACTCACCTGTCTCTCTCTCTTGTTGTTAATAGAGCACCAAGGGTATGTTC
CCGAGAGCCACGCGATCCACATTCCTCCCCCACCGCTGGAGCCTCACGAG
ACCTAGCTAGACGGCGGCGGCGATCCGGAGGTAGTAGTACAGCCAACACC
AAATCAATGACCACCTCTTCTAGCTTGTAAAATTCTAGATTTGTGTGAAT
AAATTCTACATGCTGAAGGTGAGACGTTGGCAACAATGGTTCCGTCTACA
CGTGTTGACCTTTTTTTGACTGCTGTTAGTGCGGTCAGCCTGCCACTGAA
TCAGAAGAACATATTTTATACTAGCATGATAATGGAACGGTTGAAATAAT
CAAGCTGCTATTTTTTATTGTTGCTTGGTAGTTGATGAACCGAATGTTCT
CTGTGATCTTATTTGTTTGAGTACAAGAAGCTGCATCTGTTTGATTCTTC
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GACAATCGCTAATCAATTTGTGATGTAAATGGTTGCTAGTTTCACGTACT
GTCATGTTAGTTGAGTATAGATTGAGGGTTTTCAGTGGTAGCAGTACAGC
CAGCACCAAATCCATTACACCTCCTAGTTCTCTTCCTACTAGGTTGTAAA
ATTCTAGGTTTGTGTTAGTAAATTGTATGTGATATATGGTTTGCTGAACG
TAATCTGAGACATTACCGAGAACCGTTCGATCTACACATGTTGACTTGCC
TTTGCTAGGCAAGTTTGTGATTGCTGTTACTGCACTCACCCGCCACTTAA
TCCACACAACATGTGAAGTAACATCGTAATGGAACAGTTCAAAATGTTAA
GCTGTTATTTCTGATAAGTACTTCTTACCGTGACAAATAGCTGTAGAAAA
ATATAATTTCTGATGAACCGTATGTTTTCCGTGAATCAATAAGTTGTGAT
CGATGGCATGCTGTGTTACAAATATTGCAAAGCAAACTATTAAATTCAGT
AGAATTTTCCACAATGATGATAGCAAAATATGAATGTACACAATTATTAG
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CAGTTACATATTGATGTACAGGTTTATCTGACTGAACTTTTGAATAAAAT
TCAGATAGACAAAGGTGTCCACGACAAAAACTGAAGCTGAAAAGGCCAAG
TTCAGATCATTACCTTCTGAAGCTAAGTGAAGCAGAGAAAAGGATGGCGC
CGATCCAATCTGAAGCTTGACGAGGAGCGAGCAGCCATGCTTTAGCACTG
CCCATAAACCAACTTTTTTACTTAGTTATGACTGTCTGATTGTCACAGTT
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GCTCCCTTAACCATTCTGCCTCAATTGTTCCAGAGTCAAGTGCCACAAGC
TTAGCCTCCATGGTGGATCTAGTGAGGTTGGTTTGCTTGCTGGACCTCCA
TGACACTGCTGCACCACCAAAGGTAAAAATATACCCACTTCTTGCTTTAA
TTTGGTCAGCATCTGAGATCCAATTAGTGTCACTATAATTCCTCTCGAAT
ATCTCATTACTCTCTCTAATGCAACCCAGTGTTCTTTCGCTGGAATTGGA
ATTGAACCTACTTAAGTTGCTAACACCAAATGATATATCTGGTCTTGATG
CAGTAGCTAAATACTTTAGGGACCGATTATTCACCAATCACCAGTACTTC
AACTGGTCTCGAGCTTGACCTCTGTTCTTTCGGAGCTTTAGACTAGGGTC
ATAGGGTGTTGGTGAAATCTTTGAATCCTCATAACTATAGTGATTTAATA
TTTTCTCCATGTAATGGGATTGATTTAATGTGACCCCGTTCTCACCCTTT
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GTCAAAGTTATGAGACAAATATGATTTAACATCATTAATCACCTCAATAT
TATAACCTAATATTAAGATGTCATCCACATAAAGACAAAGAGTTACTCCC
TCACCCCCATCAAATTTATGGTACACAGGTTTATCAGCATCATTCACCAA
AAACCCAGCAGACACCAAAGTTTTATCGAACTTTCGATGCCATTGTTTCG
GTGCCTGCTTGAGGCCATGTAGAGTTTTCTTTAACCGGCACACCATGTTT
TCTTGGCATTTAGTTTCGAAACCATCAGGTGGTTGCATATGAATTTCCTC
TTCTAGTTCTCCAAAGAAGGTTGTTTTAACATCCATTTGATTGTTCAGGA
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TGGTTGTAGCTTTCTCTTGAAAATCTACTTGCAACCAATTGGTTACACCC
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TTTCTCTTTGAGCTGCCTCTCTCCAGTAGTGAGCACCAGCAGATGTGTAT
GCCTCAGAGATGGTTCTAGGTTCATCCTCTAACAAATATACAGCAAATTC
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CTGCTTTGCTGTTATCGTTTCCTTCGATGTGAGATTCAGGAAAAACTAAG
GGCTTGTTTGGTTCACAGAATGTAATTTCTACTGAATGCTCTCTTTCTGA
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TATTATTTCTGATTATTACTTGTTACCATGACAGTAGCTATTTCACATGA
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GTATCTATTTGATTCTTCCTGAAAAGGGAAAGAAGTCTACAATTAAATCC
TGAAAAAGAAAGAAGTCTACAATTAAATCCTGAAAAGGAAAGAAGTCTAC
AATTAAATCCTTAAGTGTAATGTTTTCCTGCATTGTTCCTATAATTTGGA
TTTTATGTAATTTTTGAACCTGCTGTACCAATTACTGGAGTAATAGAAGT
CTATCGCAGTGGCGCTGACACATACTATTCCAATATGTGCAGAAAGCGCT
TGGAGGTTTGAGAAGAATCGATTTAGACGGGCTGTGATGGCGTGTGTTTG
ACGCGAAGGGCCAGGTCAGGATTCTTTTGCTTGTTCAACTGTGAGGAACT
TTACTCTGGGGAATGGTTATGCAGTAAGCTACTTTCCCCTTTGTGACAGG
TGCTTGGACGGTTGGCATCCCAGATAGCTATTGTGCTTCAGGGCAAGGAC
AAGCCGACCTATGCACCTCATGTGGAAAATGGAGACATGTGCATTGTAGT
CAATGCAAAAGATATCAGTGTTACAGGGAGAAAAATGACTGACAAAATTT
ACTACTGGCACACAGGGGTAGTATTTATTCTAGCAAATACTGTTCAAACC
TTGTTTGGTACCATAATTAATTTTCTTCTGTTATGCGTGTTTTCCAATAT
ATTGGCCATCTGAAAGAAAGAAGGTTGAAGGACCAGATGGCAAAAGATCC
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TAGTTGAATGCCCGTGCGTTGCTATGGACTCTTAATTTTCTTTTGTTGTC
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TATAATCGATTGAAATTATGAAAAATGATTATTAAAATCGACGAAGAACA
CATGTGACAAAATTCTTTTTTTACTTCTCTTGAGCACGAATGTGACGAAG
TCTATCACATCGCCCCCTCCCGCCATTATCTAAAAAAATACCTTGAATCC
CAAAGCTCTTGAGTCTCCAAAGTGGAACATCAGATGTTGAACTTTACTCA
TCCTTGCCCATCCTATCCTAGTGAGGTAAGCAATGCCGCGTTCAAGGGGG
CTCAACTTGCCAACATGATGTCCTCTGATCGTTTCCTCGGTAAGGGTGCA
CGACTCGAGTGGTTGATAGCTAAGAAAATATTTGAATGCCCCTAACTATG
ACCATTAAAATTTATCAATTATAAGTTAAGCACATGATTTAATTTTAATT
TTTGTATAAATGACCGATTGTGAAGAGAGTTAGTATGTCGATATAACATA
TTATTACTATGTCTAAAAAGAAAGAGTAACAACTGTAGCCTTTGGGAATT
GGGATGTAGACAAACTCTCCCATATCATATCACAATTTTTAGAGTTCATC
TCTCGAATATAGTACACTAATTTGTGCATCCAATTTGAACCGAAGTGGAC
CACACGTGAACTGCAACCGCTTTTGCTAGCTGAACAATAAGTCAGTCTTA
ACATTCTAATTCTTGTCCATACCCATCTCTATGCCTTAATTTGTTTCTCC
CCATCGATTAGTCAGGACCCAGGACTCCCAAAATCCCCAAAATAGAGAAG
CTCTGCTATGCAATCTCGCCCTGTCATTGCTGGACCCCCAGTAGATCAGT
CTTTGTGGCGGGGAAGAAGAAGCGGAGTGGCTGGTGTGTGTGCCGTCCAG
GGTCGCTGCCTCCCGGATTCCTCCACATAGGGATACTGCGCGACCGCCGT
TTTCCCGGTGCCCGCCGCAGAGCTCGCCTCCTCTCCGTCTTTGGCCGCGA
GCGCAAGGTCCGCCACCGGCACCTCCACGACCCGCCGCCCGTGGACGCGA
CCGCAGGGTCTGCATGCCCCGCCGCTTGCGCCGACACTCGCCCGGCCACT
TCTACCCGCGGCGCTGCTCCTAGCCCTGATCTCCATCGCCAGCACGCCGT
CAGCCTCCCCCCGACCTGGACGCCCTCGACGACAGCACGTCGGCTGCTCT
GTCTCCTTGCAGCTGCATTGAACACCACACGCGCGTCCTGCACTTCCTGA
AAAAACTGAGCCCTTCTCCTCCCCGACGCCCTCCGACCAGCAGGGACCTC
GGCAGCCTGCTCCACTCCGCCCGACGCGCGCGCCACCCCACCCATGCTTC
TCCTCGGCTACCTTCCTGCAGCGCCGCCAGAACGCAAGCTCGCGGCGTCG
TTCCCCCTCGACCTCTTCCCTGTCACCTACGACCGGACGCCTGCCCTGAA
ACTCGACGCCTCCCACACCCCCTGCTTCTCCTCGGCTACCTCCATGTAGT
ACCACCAGCACGCGAGCTCGCCGTGCCGTTCCCCGTCGCCTCCTACCCGT
CCGGCGTGTTCCCCTCCTCCAGCGCAGCGCCGCCAGCTCTGGGGTTCGCT
ACCGCCCAGGTCGTCAACGAAACGTTTCTTCAGCGGTGGCAATTCTAGTA
ATTTTAATTGACTCCAGGGACAAACTCGTCCAAATAAAAAAGACGTATCA
GACCATCAAGACCATAAGCCTTTTAATAGTAAAGATTATCTATCATAATA
AGAATTACTCCCTCCGTTCCATAATATAAGATGTTTTAGCTTTTATGAAA
CGAGTGTATCTAGACTCCTTTTAGTGTCTAGGTTTATCTTATATTATGGA
ACGGAGGGAGTACATCATTATAGACTGAGCACTTTTATCATGCTCCAGTT
AAATGGTGACCATGCTGCTTGTTATTATTCCCTAAGCCGGCCAGTCTGTA
TAAGGAAAAACCGCGAGAGAAGTTTATTCATACATACTCCCTCCGTTTTA
AAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGAGAGTGTATCTAGAACACTTCT
AGTGTCTAGGTTCAATTAAATTTGGAGTGAACCTAGACACTAAAAGAGGT
CTAGATACACTCCCTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGA
GGGAGTACTATGCTACCTATGTCTTTTTAAGTTTCTGCGATGTATTTCTA
TACCATAAGATCCCATCCATTAACCCGTTCTTTTATGCACATTGAGTTGC
TGATAGGCCATTTAACAGTAACTAGTTTGTGACGGCATCCTCGTCTAACA
CCCCAGTATTCTCCAGTTCAGGGAGATGCGTCCTAGTGCAAGACGTGCAC
TGGTACTGTCACGGAAGAAAGAGCAGGACAGGAATGCAAAGGCGCAAGGC
AAAGCCAAGGGAGGCTGAGGTCGCCGCATAGGCACCTTCAGGTCTTTGTG
TGTCTGGACTTGGGAGACCGATGATTTGCGTCGCTGCGAAATTCATCCGA
TGCATTTCTGAATGATCTGTTTATCTATTCTGCTGCTGCTGATGATGTAA
TTTTTGCTCCTGCTGGTGGTGTAATGCTGTCAATTAATGCCTGTGGCCAC
CATGATGGTGGAAGCAATCACAAGAACACACGAGAAGATATATATATATA
TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCAGTGCTAT
AATGTCTGCAATTGCTGTACACCAGAAATAATCGTGGTCAAAATCTGCTC
CGAGTTCATGTGAAGCTCATTTCTCTTTACATTGGGTTGCTTTTGCTTTC
CACCATAAGCTGATTAGCTGGCACTACATTAAGGTTGTATAAGTGAGGCC
ATGCCAGCCACACTCACTTCAAATGAACAAATCATACCTAGTTTACGTGA
TCATGACAGGAATGTCTGAGTAGGAAGAGAACCTATTGGTTCTTGTAGAT
CCTGGAACAGGTACTGATTCCTGTGATAAACCCTTGTTGAAGTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.