Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE038366

[Submit comment/correction]

Sequence	AE038366
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE038366
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAAAAACTTCGCAATTCCTGAGTCCTGACTCCCCTTTTCCCCTTCCCTTC CCTTCCATGCTCCGCACCACCGCCGCGATGCTCCCATCCGCCTCCTCCCT CCGCTCCCTCCTCCGCCTCTCCCGCCGCATCCCTCTCCACCGCCCCCGCC CGCTCCCTAGCCCCCCGCTGCTCCTCCCGCACATCCGCCTCCTCTCCTCC TCCCCGTCCACATCCGGCAGCAACGAATGGGAAGACCTCCTTGGCCCACT GGAGGCGGTCTCCTCGGCCTCCGCCGCCGCCTCCGACCCCGAGACGCCCG ACGGCTCCTGGGGCGTGTTCGACCCCGTCGCCGGCCGTATCGTCATGCAG GCGCAGCCGTCCCCTCCTCCGTCCAGCTCCGACGGGGAGGAGGAGGAGGA GGAGGAGGAGGAGGAAGTGAAGCAGAAGGGGAAACCGATTAGTTGGAAGG GGGAGCGCAGGTGGGCAGATGTGGCCACCGCGAGGAGGGCCGCGGGGAAG GCCGGCAAGGCGGCGAGGGCCACTTACGTCTGCAGCAACTGCGGGGACGG GTTCTCGCAGTGGTGGGGCACGTGCCGGAGCTGCAAGGCGGTGGGGACCC TGACGAAGTACCTCCCGGGGGCTGACCCCGCCGACGACCAGGGGTCGCAC CACGCCGGCCGCTCGTGGATTCCGCAGAAGAGCAAGGAGATGGTGCCCAA GAGCCTTGGGGAAGTCACCAAGGGGTTTGACCAGGAGGGCTGGCGCATAC CGCTGTAATTTTGGAGAAATGCTGGCTTCATTCCTTTTTTCTTCTTCTCT AAACTGTTGTGTAGATGAATCACGAATGATGTTAAGATGTTCAAATTGTT GATTGTTCTATGGGAACATGGCAATTGGCTTTAGGATAGCACTCTCCATG AAACTCAATTGCTTGGTAGCTCGCTGAATATTTTCCCCATTGTTAGCTGA TGATGTATATGATTATTTCTTAATTGCAACTTGCAGGCCAGGGAGCTTTG GGAATGAAGTTGCTCGGGTGCTTGGGGGTGGTGTTGTTCCTGGTAAAACA TCACTCTTACTTCATTGCTACTGGTTGAATGGGAACCTGGTGTTGGAGCT TATAAATTGATTTGTATAATTCAAAACCATTACACCATCTTGCAGTTCCA CCGATGCTTTTAAATTGCTTAGGACTCATCAATTATGGTGCCTGTCTGGC GAAGCTTTTCAGTATAGCTCTTTGTTCGTTTGCCTGTGAAATTGGCCTCA GAGTGACCTATGTACCGCATAGTGTTTATGGACTACAGAACACAACCATG TGCTTAAAATGCTCTCTACTTTAGTTTCTCTGCCACTTCCAAACTGTTTT TGCCTTGCAATATTGCTTGATCTGGCTTGGAACTTGCATCCTCTGCCTAC GTGTTGCACTTGTTCAAAATGTTTGTTGTTCCTTTCTTCTTTACCAGTTT GTATGCGGAAATAACTACTCCCTCCGATCCATATTAATTGTCGCTGAATT TGATGTACCTAGACATGTTTTAGTACTAGATACATCCAATTCGACGACAC TTAATATGGATCGGAGGGAGTATTAGTTTTGGATACCATTATGTATATTT TCTTGTTTTTTAAGATACTTCAGGTATCTCTCCCAAAAAGCATACCAACA GTTGATGTAAACTTAATGCCCAATAATAATATAACTACCTTACGGCAGGT ACATTTGATTGTAGATCGCCAGATTTGAAACCTAGACAAAGAAAATTTCC ATACCTTTATTTTGCGACCCTGAGCCTGCTAAGCTCGCTTGTTCGATCCT GGGCTTACTAAATTCATCTCCCATCTTGTGCCATTCCATTTCCGAGCTAT ATCGAGTTGTTCACCATGTTTGAGAAAAGGCGCATCTATGATCCGGAATC TACTAAGCTCGTTTCCCATCTCTGCCATTGCATTTTTGTGTTTCATTGAG TTGTTGACCTTGTTCAACAAAAAGGGCATCTGATGTGTTGCATGAACTTT TTCTGTACTTCACGGCATCAATTCATTACATACTGTTTTTCATGAATCGC CTTCACACGTGTAGTTTTGCAGGCTCCTTGGTTTTAGTAGGTGGGGATCC AGGTGTTGGCAAAAGTTCGTTGATGTTACAGGTAAATGTACACATCTGGT TATTCATTGTTAATTTGACGTGCCTTCTCTTCTTGCGTTTCAACCCACTA AGACCACTGCATTCAGTTATTTACTTGTACTTTTGGAATTCAAAAATTTA TCAACTTTAATTACTTACATTTTGAGTAGTGGAGACTTGGAGTTCGAAAT TTTCTGCACCTAATTCCTTAACTTGGAATCTGACATAATTCTTCTATGTA GCTTGCTTCTATCATATCTGACGGTTCCGAGGACCATGGGTCTTCTCCTG TTGTATATGTGTCTGGTGAGGAGGTTGGTTATAGACTTGTCCTATCTCCA TCATTTGCACCTTTCTTAACTGTTTTGTGTTCTTGTTGAGAGAAACTTCT AAAGACTATTCCATATAACACTCTTATGATAGCCTTCTATTTTTGATATT CTCAAACTGATACCTGAAACATTTCTTTAATAAAAAAAACTGTAACTTTG CCCGCAGAGCATTGAGCAAATTGCAAATAGGGCTGACCGGATGAGTATCA GGTCTAAAGATTTGTACCTATACTCTAGTACAGATATTGAGGTAACATTA TTTTGCTGCATCATTTGCATATTTATTTTCTTAGATTCATCGACCTTTGT TTTAAGGAAGCACAAATATACTATGCCAGTTGTACTTTTGGAGTTTGGAG AACTGAGCCTGTAGTTTTATTAAGTAATCTATATTTTACTAATGTCGTCG AGTGTTAAAGAGCACTGGACCCTCCTTGTCACTTATATGAGAGCTTCCGC ACCACCTAATAAAGTTACTGAGTACTGATGGAGTAGGTACTTGAATTTTA CTCCATACTTAGTTACTTTTTTTTTAGCTGAAAACTGTAGGGGAGGCCCC GACAGTAAGTATTATTAAAGAGAAAAAATATTTACAAGAGAGGGGGGATG TACAAGAGGGCTTAGCCCAGGGCATAGCCCAAAGAGAGTTACAAAGCGTC TAGCCAGGCTACAAGATAGGATTTCAGATCATCCTTCATTCTGTAAGATA GAAGGAAGATGTCTCTTTTAAAAGAAAAAGACCAAGCACTAATAGAGGGA GTGGCATTATAAAAAATAAGGGCATTCCTTTGCTTCCATATATTCCAGGA GGCGGTTGCAAAGACTTTGAAGAAGAACGGCCTTCGAAAGTTGGATTTAG CAGTGGCCATCAACTGAGGGAGTTCTAGATTGTCTTCAAGCCTGATGTTG ATGGATTGCCAACATTGCTTACTGAAGTTGCAGTTCCAAAAAAGGTGGTC CCTGGTTTCAAGATGTCCTTCGTCGCAGAGGCTGCATATGCCATTATCGT CAAGAGAGAAAGTTTTCCTTAGTAGCATCTCCTTTGTGTTCAGACGGTCG TTGGCGAGAGCCAGAAGAAAGATTTAATCTTGGGAGTGCACTTTGATTTC CATATCCACTCATAGATCTGGAATTTATTATTGTATGGTTCCATTGTATG ACTAAATGGTATATGTGTGTGTGCTCCAAGTTTTCACCAGGCAACCAAAA TAAACTGCTTAAGAACCATATACTTAAATAGAGCTTGACAATGTTGGTTT TCTTGTAGAACGTGCATTCTGCCGGCAATCTAAAACTGTGCTTTCATGGA TGATAGGTCACTAACTACCTAAACGCATAATAGAAACATTATTAGTTGGA CATAAGATATTTCATATTCGTGATTTGAGATTTTTTGGAAACCCAGCAGA AAAACTGCCTATTCATTAAGGAGAGAATACATATGTATACACAAGGGATG GCGTGTTTTTTGGGTGGAAGGACATCCGAAAACCCTCTACTGCATGCGGA TTACTCCCCAAGGGGCACATCTCCAGCCACCACAGCCTGTGGCCCTCCTG TCACCTCACAAATGTGCTAAAGAGCTAGATAGGCAACCTCAAGATATGTT ATCTGCACTCTGTTGAAAATGTTTCTGTTTCTTTTCTTCCACACGTTCCA GATGACACTGATGAAACAGCCACTCCTGGCTTTTTCCTTGGGTGTGGGCA TGTTGCAGATCATGTTACACCACCAAGAGTCCACAGAGTTATGCGAATGT GCCACGATTTAAGATTCTTTTACCAGCTAACCAAATCAAATAATCTATAT CTTGGCCAAAATCCAAGATAAACTGATAAACTACCGACGTTTCTCTTCTT GTTCCACAGGATATTTTGGACAAAATCCAGCCATTGTCTCCGAGGGCTCT TATTGTTGATTCAATTCAGACAGTTTATCTAACAGCATTTGCTGGAAGTG CTGGGAATCAAGTGCAGGTATTTCAATCAATACTTTCTCGATTATGTTGA AGCATGCTTTGAGTACTTCTTACTAAATCATATAAGCATGGGTTCATGCC GGGTGCAATTATAATAGTTTTTCCTAATTGTTTGACTCTCCAAATGTCCA ACTCAACTAAGGTAACTTTATGAATACATAAAGCTGATCTTGGAGGAGAA CTTGACTAGTTCTCTGAATTAAGTATTGAATCTGGGTTATAATTTAATCT TGTGAACTAGAGTACAAATGCATACCAAATATTCTTTAAGTTAAGTTCTG ATACTGAACATGCTGTTATTATTCTTACAAATGCTCATTTGTTTCTTCGC TTGCTGAAAAAAATGTCCTATTTTTTGCGGAGCATAGGTCAAGGAATGCA CATCTGCCTTGTTAAGTTTTGCAAAATTGACGAACATCCCTGTTTTCTTG GTAAGTTACACACAGCGAGAAGTTTATCATTTGTCCTTCATAAATTGGCG ATTATATTTCCTTGATTATGTTCTCTCTCTTTTTCTTTCTCTAGATTGGA CATGTCACAAAAACTGGGGATATTGCTGGCCCTCGTATTCTAGAGCACAT AGTGGATGTTGTTTTATATATGGAGGTTGGTAAAATACCGCTTCCTAGCA CATGTTTTGCCTATAACTTTGTGATATTTAGCAGAACTTTATCGATTATA CTACCTCCATTCCAGAATAGGTGTCTCAACTTTGTCTGGATTCGCATGTA CCTACACACTAAAACATGTCTAGATACATGCGAATCTAGACAGAATTGAC ACTTATTTTGGAACGGAGGTAGTACCTGTGTATGCTGCCTGAGGATGCCT TGTTTTTTGCAATATTTGCGTGAGAATGTCTTTTTTTGGTAAAGAATTTG CTACCTATCGTTGATTCAAACCGTATAAACCCATTTCAGTTTGCCTTCCT AGTCAAACATGGGCCTGTGTGTACAAAACCCGTTTTGGAATTTTTGTGTT GACTTTTTTGGGCTGTGAGCTGACTAGGATGGAAATGACTTTTTGAAGTT TCAGATCAGTGTCATTGTTCTTTATCTGTTATGATCCCCCGTTTCCATAT GACTTGGACGGAAATGGCTTTTCGAAGTCATTTTTGCATCTTGCTTATAC TGTTTTCCCCTTTTGTCTGATCATGGTTTGTCCCTGCAAAGATTTCCACA TTAGAACGGTGTCTCCTATTCCTGGAATCATCTTCTGTTTGCTGTGCATT TCACTGAAAACAAACATCAAGATTCTTCATCTATTGTGACTGCCCCCTTC ATATAGAATGTTTGAAGTCATATAGGCTTTTCAGAAAAGCAATACTATTG TTTATAGCAAAGGCAAAAGAACATGCAAATTTCCAAAACCATACAACTTC ACTCTTTTTATGGAAGTTCACATGCAAGTCTGACAAGGTTGATGCCCTTC TTTTAGGGAGAAAGATGCTTATCTCATCGACTGTTACGGTCAGTGAAGAA TCGTTTTGGTTCAACAGACGAGGTATACAGTATGCCCCTATGTTCCTGTC AAATATAATGCATTTCTTAGTTCATAAAAAGCATCTATGTCGGACTTACC TGTCCTGTTAGTGCTAAGATTTTTCTCCTTAGTTGCCTATTTCAATTCAG GGTGGCTAGTAATATTATATCTTCAGTAGATTATACCATGATTATTGAAT TTCTTTCTATGAAAGTCTCTCCAGCCTATGCAGCAAGGATCCTACAGTGA GATTAGTTTCCTCTGCAGCAATGATCCTACAATGATTCACTACAGTTTTT TATTTTAAATCACTTATGCAACACAGCATTTCATTCGAAATACCAACGTT CTGCTTGTCTAAAAAGAAGTTTCCTACCTATTTTCCTTTACATGTTATGT TGGATTCTGTTCGTGAGATATGTTCCTTTTTTTGATAAAATGGAAAGGAC CTTTGCTCTTCATTTCATTGAAAAGATAGTTTTGGTTACATCCTCCTAAG AGGCACATTACAACTCAGTTACAGGTGAATTAGTGCACATCCCAAGTGGA TGGCAACACAACTCGAAGTCTTTTTGTGCCTGCTCGTGTCCAAAGACTGG CTTCTTCCTTGATCTTGGTGACCAGGGACTGGGCAGAAGGCCGGGTACCC TCGAAGATGCATTCGTTCCTGTGCTTCCAAATCATCCAGGGTATGAGGAG CGCCGCTGAAGCGAGGCCCTTGCGCATCTGCTTGGGTGTGTTCTGCTTGG CACATGTCACCATTCCATGAGTGGTTTCTCCTGATCTGGTGGTCCTGTCG CCATTCTCAACCATGCCAGGATCTCATGTCAGGCTTGTCAGGCGATTTGG AAGCTATTAAGGCTGTTCCTGAGACATTAAATGGTTATTTTAAAGCTATT AAGGTTCTTTAGGACATTGCAGTGGTTTCTCGAGAGCACTTAAATATTTT CTACTTTTGTGTGTAGATTTTATTAAAAGCATCGTTGTTCGAGCCATAAC ATCATCTTACTGGAATTAGTAAAGATGATCCTACTAACTAGATTCCACTT CATAGCACACCAGTCACAAACTGTTCCTAATGCAAATGTATGCTACTTAT GCCTTTTCTTTGTCAGCTTGGTGTATTTGAAATGTCAGAATCTGGTCTGC AAGCTGTTCTGAATCCTAGTGAGATGTTCTTAACTGAACATGCATCTGAT TCTGAAATACTGGCTGGGCTTGCTGTAGCTGTTGTTTTGGATGGGTCCAG GACCTTCGCTATTGAAGTTCAGGTACTACATTTGACGACCATTCTTTAGT TTGCTCTCTTAGTGTAATGTGTCGAGCTTACATTTTTCAAAATAAAACTT TACCAATAAAATTCATCTTCCATTGCAGTGAGGGTTTTTGGTATAGAATG TAATTCCAGTAAGAAAGGTTAAGAAATTACTATGTTATACTGTTATGAAC TAGACTCACTATTTTGGTAAAGCTTGTACTGTGCCCGTGGTACTGTGCTT TGTTCATAACCTTTTCATCACTTCACTCTATGTTTTTGGAAAAAAAAAGC TTCACTCTATGTTGGACCTTATAAGGACCATTCGAAATCTTGGGCACCCT GGACATTGCAGCAGAGTTTATACCTGGAATGTTAAAAGTTCTGAACATAC GTTTGCCTTTCTTTTGCACATTTTAGACTGCACTGGAAGAATTACGTGTC TTTGTCTGTGAGATGTGATTTGTATCCCTTTTTCAGGCACTGTGTGTTAC TAGTTCTCGTACTCGAGGACAAGTTGTTGGCATACCAATAAGCAGGGCTG ATGTGATAATATCTGTAAGTATCGAATCATTTCTATAATACTTCCAACCA ATAAAACATGTGTCACTCATAAGCATTTGCTATGCTGTATATATCTTAAC GAAATCTATGGATATAATACCTGATGCATAATGTTGCAAGTTTATTCTAG GTCACTAACCCCTGTATTTTGGTGTTAGAGCAGCATGAAAATACATCTAA TGCCAACTAATCTCTTTTCTTAACCCTACAGGTTCTTATGAAGCAAGCAG GTCTCAAACTTCAGGATAGTGTAAGCTCCTGAAGCTTCTATTTTCATAGC TCTTTCTAGTTGCATGCAGGTAACAGTATTAATTCAGAGCTACAGTCGGT AAGCTGGCGTCAGTTTAGTTTCAGGAGACCTAATTTACTGATTTGCACCA ATACTCCTCCAAGCCACATATGTGTCCTGGAATGTAGGGGCATCGAAACA AATGCTGGCATGCTCTAACGTGTATTTAGTGACTATTATTACCTGGATGA CAGTGGCCTAACTGTAGTAAGTGTGCAAGGATTCGGGTCGATTTTAACTA TACATTTAGATGTTCTGTTGCCATCTTTGCTCTGCATTCTGCCTTTGGTA CGACTGTCTGTTTGCGTTGCAGGTTATTTTTCTGAATGTGGTTAGTGGCT TTGAGTTGTCAGAGACCGCAGGAGATTTGGCAATAGCTGCTTCTATTTGT AGCAGGTAATTCCTTTTGTGGTTTATGTATGGGTGATCATAGCTATCGAT ATAGTTTCAGTTAGCATAAGTACTACCACTTCGTGTGTGTCGTTCTGGAT ACATACGGACACGTTTTGCATATCTGTAATTTTTTCTTAAATTAATACAT TATAGTTTGGGCTGCAAAAAAAGAGTAAAAAATGTGACCCCCAAAAGGCA AAAAAAAAAAAACTCGATTTTGCACCCCCACATTTTTTTTTGGTGTATGT CACATCTTAGAAAATATGTTGATGAAAATTGGTAGGCACATGCTAGACAT GTGTATGTGCTTGTATATTTTGCCAGAATTTTGTGAGTTTGCAGAATGTA GTTTACTAATTGGATCTGAAACTATTATTCGCTAGACCCCCCCCCTCTTT AAAAACATCTCTGCGCATGGGCCCTGTGTTAGATTATGATGCAAATATTC TTTGGCGTTGCTAATTAAGATTTTCTGAATAAAATTTGGATAAATATCAC AGATTTAAGAAATGTGTAGAGGTTCATTTTTTTGTGTATATTTCCATATC TGTTTTTTAAGTATACCCATTTTCTCCTTCCTGCAGTTTCTTGGAATTTC CTATCCCAAATGATATTGCGTTTATTGGAGAGATCGGCCTTGGGGGTGAA CTTAGAACTGTAAGTTTATGCTTTTCTGTTTTGTCATGATTTCATGTTGA TCTGTTTTGCCTGATCTACCGGTGTTAAAGGGTTTTCAGCCTACTCGGAC TAAAATTTGTTGTACTCCGTATTAATGTCACTTTCATATTTCATCTTTTA AGGTGCCAAGAATGGATAAGCGGGTAATGGCTATCGCCAAGTTGGGATAC AGGAAATGCGTCGTTCCCAAGACTTCGGAGAAGCTGCTGAAACCGCTTAA TCTCGGCGGTATCCAGATCTTGCCCTGCAACAACCTGAAGGAGTTCATAA ACACCGTGTTCAGGCCCGAAGGATGATGCTCCATCCTGGCGGGCTGCTCT GCTTGCTATTAGTAGCTGGCTAACTGACTGTAGGTGTTGAGCGTGCGTAG GTCCATCTGTCAATATCTCGGATAGTTCGGTTGATGCGCTGATTTGATTT GCTAGTACTACAACGTTTCACGACGAGAGCCATTTTGTGCCGGTCCCTTT TGGAGACTGACGAGAGCAGTTTTTCACGGTTGAGCGCGCATTTTTTGCTG GAGCTAGGCTTGAAAACGGAACG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.