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GrainGenes Sequence Report: AE032156

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Sequence
AE032156
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE032156
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTCTTATGGGCGGCGAGCTCGTTGGTGGAGGGACAGCCAAGCGAGAGGG
TAGCGACCTCGTCACTGGAGATCTACGCCGAGGAGTCCTGCGGCGACCGG
GCGACGGAGGGTGAGACCCACGGTAGCGCGGCGAGATCTCCAGTGGTGTA
CGTGCCGCGCACAAGAGGGACAACCTCTGGTGAGGGCGGATTTGCTCGGA
GTCGAAGATCCGCAACGTAGTTGTCTCCATCGAGTACCCAAGGTAACTGT
CCATGCACAAATTCCCCAATCCCTCCACAAGTGCACGATTCATAATTTAC
AAGTGCAATCCATGTTTCCAGAGAGATCCCGAAACGGCTCGCGTCCTATA
TTTTTTCGGGAAAATTGGATCCATACCATTAAAAGATCCAGTCTTTCGAA
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AGATTTAGTGCCTCACAATGAGCAATGGATGATATAGTTCACCTCAAAGT
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CGCGGCCTCGCCGCCGCTCCACCACTGTCCGCGTCGAGCTCGTCCTCCCG
CAGTCCGACGCCACTCGTAACTGCAATCTTCCCGACGCATCTCGTCCTCC
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GCTGCGCTGCCGCTCTGCTCATCGTCGGAAGGCTCCCGCCGGGGTCGTCC
CACCTCACCGCGGCTTCGCTGTCATCGAATTGGATGCTTTGCCGCAGGCG
GCGAGGCACCGACAGCCGGGAACTCGAATTGGGCGCTAATCCTCGTGAGC
TGGTATGTCCTGCTGATCCTCGTGATCACCCAAATTCCAAGACGTCCTTC
AAATTCATAATCAAGGATTGGGTATTGCTGGCAATGAATTTCAGTAAAGA
AGTAGGTCCTGTTACCAAGTAACCAAGTACTCACCAAGCTAGTAGGTCCT
GTTCAAATTCATAATCAAGGATTGGATATCGCTGACCTTGCCATGTATGT
GTGGCTGTGTGCGCGACCGGTCTGGGTTTCAGAGTTAACATACAGTTCAC
GGTGGTGGCAGAAGGCAATAATGGAGCCAGGCTTTGGGTGGTATTTTTCT
AGCTTCAGAACTTTCGATGGTATTTTTCTAAAGACTGGATCTTTTAATGG
TATGATCTAATTTTCCCTATTTTTTCTGCTTCCTCTCTCTCCACTCGTCA
TTTCCTGACCCCGGCTTTCCCCGCCCCCGCCTGAGCTCCTCGCCGCCGAC
TCCCAATCGTGATCGGCCTTCCCAGCCCGCCGATTCCCCGTCGTGCTCAG
ACTTCTCCGCCACCGCCTGAGATCCTCCCCGTAGATTCCCCCCATTCTAG
GTTGGTCGTCCGTCGTCCCCGTGCTCTGCTCTGGCCGATGGCCCGTCGCT
TTCCACCGATCTCTCCGAGCATGACATGCCTAGACTAGGGATTCAAAGTT
GTAGACAGTTGATCACAAGAACAGCAAGAACAACAGGGGAATTTCTGACT
GAATATTTGTGTTTTGAATTTCAGAGTCAAATTACAATAATCTTGCCAAT
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TCAAAGGAGATCAGGGCTTATAAAGCTTACAGAGTCCAAAACGACAAACA
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TGAAGTGCAGGAACACCTTCTGGATGAAGCTAGAGTCTTCCCAGGTAGCT
GCTTCGACAGGAAGATTACCCACTTGATCAACCATCGAACTACTGGAATG
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TTGGGACTGCCTTTGGGCCAATGTGCTTTTTGAGTTGGCTGACATGAAAG
GTATGATGCAGTTTGCACCCCTCAGGTAGAAGAATCTGGTAAGAAGTGTT
GCCCACCTTAGCGAGTACCTTAAAAGGCCCATAATATTTTGAGTGAAGTT
TCAAGCATCTGTGTATGCTCAGTGATGTATGTCTGTATGGTTGTAATTTG
AGATAAACCATATCTCCAACCTCAAAAGACCTTTCCACTCTGGATTTGTC
AGCAAAATGTTTCATCCTTGCTTGGGCCTTTGCCAGATTCTGCTTTATTT
GTTCTGCAATGATTGATCTTTGCTGATCTGGAGAGAAGTTGTCAGTATTA
GTTTCAGCTGGGAGTAGCATTTCAGCAAGCAGTGGAGGAGCTCTGCCATA
CAGTGCTTGAAATGGTGTCATCTGAAGGGATGTGTGGAAACTAGTATTGT
ACCACCATTCAGCCATTGACAACCAGCTATGCCACTTTTTGGGCTGCAGG
AATGCCATGTTCCTCAAGTAGTTCTCCAAGCATTGATTTACTCTCTCTGT
TTGGCCGTCTGTTTGGGGGTGGTATGAAGTACTGAAATGGAGCTTTACTC
CCATTGCCTGAAACAAGGTCTGCCATAAGTTACTTGTAAAGATCCTATCT
CGATCAGTAACAATAACTGTAGGCAAGCCATGGTATTTGAAAACATTGTC
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TAAAGTGGGAGTATTTAGTGAATCTGTCCACCACCACTAGTATCATATCC
TTATTCTCAGAAAGGGGAAGGCCTTCAATAAAATCCATGCTAATGTGAGT
CCAAGCAAAGTCTGGTACTGGGAGTGGCTGTAGCAGGCCAGGATACAAGG
AGTGTTCAGGTTTATTGATCTGACAAACAGGGCATGCTTTTACAAAGGAT
TGCACTACTGATTTGAGGCCAGGCCAAGCAAACAGGAGTTTGATTCTCTG
ATAAGTTGCTTTTTCCCCAGAATGTCCTCCCAATTCAGAGTTGTGCAATG
ATTGTAGCAGCTTTTCTCGTAGGTTACTTCCTTGACCAATGTACACCTTG
TGCTTATATCTTAGGACTCCACTTGTGAGAGTGAAATGTTGGATTGCCTG
TGGGTCCAATGTTAGTTTGGTGATGTAATCTTGACATTTTTCATCATTCT
TGTAACTATCAGTGACTTCTTGTATCCAAGTGGGAATAGCTGTGCTAGAG
AAAAGTTGTCTCAGCTGATATTTTACTCTAGACAGAGCATCAGCCACCTT
GTTCTCTCTGCCCTTTTTATACTCCACAGTGTATTGATATCCAAGGAGTT
TAATCAACAGTTTGTGCTGGATTCCTTCTGTGAGTTTTTGTTCATGGATA
TGTTTTAAACTCTGTTGGTCAGTCCTTATGACTAACGAGCTTGCTGCAAA
GTAATGTTTCCATTTTTTAGTGCCTCTGTGATTGCCATTGCTTCTTTATC
ATATGTGGAGAGGGCTGCAGCTTTGGGTCCAATTGGTCTGCTCATAAAGG
AAATGGGTCTGCCTTGCTGCATCAAAACAGCTCCTATTCCATATCCACTT
GCATCAGTTTCCAGGATAAAAGGTTGGGAGAAATTTGGCATTGCAAGGAC
AGGTGTAGTTGTCATTTTCTGTTTAAGCTCCTTGAAAGCAGTTTCTTGAT
CCTCTGTCCAAGAAAACCCCTCTTTCTTCAGAGATGAGAAAAGTGGTTTA
CAGATGATGCCATAATTCTTTACAAATCTTCTGTAATACCCAGCTAGCCC
CAAGAAGCTTCTGAGTTCTGTTACAGTAGTAGGTGTTGGCCATTGGACAA
TTGCTTCAATTTTTGTAGGATCTGTAGCAGCTCCTTGTCCAGTAATGATG
TGGCCAAGGTATTCCACTTTAGGCTGAGAAAAAGTGCATTTCTTCCTCTT
TGCAAACAACTTGTGTTCCCTGAGAGTTGTAAATATCTGCTGTAAATATC
TGCTGCAGATGTAAGATATGTTCTTCCAAGGACTGACTGTAAATCAGTAT
ATCATCAAAGAAGACTAAGGCAAATTTTCTCAGGTATTTTGCTAGAATTG
TGTTCATCAACTGCTGAAAAGTTGCAGGTGCATTTGTGAGTCCAAAAGGC
ATGACCACATATTCATAATGGCCTTGGTGTGTGCTGAAAGCAGTTTTATC
AATATCTTTCTCATTCATTCTGATTTGGTGGTACCCACTTCTAAGGTCAA
TCTTAGAGAAGATTTGAGCTCCATTGAGTTCATCCAACAAATCCTCAATA
ACAGGGATGGGAAACTTGTTTTTGATTGTATGGGCATTCAGTTTTCTAAA
GTCAATACAAAGCCTCCAATCAAAGTCCTTCTTTTTGACCACTAGAGCTG
GGGAAGGATATGGACTGTTGCTTAGTTGAATGAAGTGATTCTTGAGCAGT
TCAGCTACTAGCTTTTCCATGATGTTCTTTTGGTGGTGGGGAATTCTATG
ACACCTTTGGTTGATGATCTTGGCATCCTTGTCCAAGTTAATGACATGGT
CACAGGCTCTTTTTGGTGGCAATTCAGTAGGTTCAGCAAATATATCCTGA
AATTCTGACAATACAGCTTCCACTTGCTCTGGGATTGGTTGCTCTTCAGT
TGTTACATTCAGTACAGGAGAAATCCACAAGAGTGCTCCACATATTGAAT
TATCTAACAACTTCTTCACTTTACTGCTGTGCTGTATATCTGGAGATGGA
GGTAAACTTGCATCAAGGAAAGTGACAGTTTCTCCATTATTCTGCACTTT
AAGTGTTAATGCTTTCAGATTGAGTTCCACTGGGCTGTGATTATAAATCC
AGTCAGCCCCAAGGATGACATCATATCCTCTCAATTTGAGAACCCGAAAG
TCAGATGTAAATGGAACACCTTGAATGTCATATTGAATATCAGTACATGA
GAATGCTGTCCAAAGTGTTTCTCCATTAGCTACTTGCACCTTTTCCTTTT
TTGTAGGTGTGATTCTGCATTTAGCTTTTTCAGCCAGTTCTGGAGTAATG
AAAGTTGTTTTGCTCCCACTGTCTACCAAAGCCAATCCCTGTTCATTTCC
AATAGTGACTGGAAGTGTGAAAGTGTACCTCTTGGTTTTGGCGCCCTTGA
AAGCGTGCAGAGAGAGTGCCAATGGGGGGTTGTCAGAGGTTTCTTCAGGG
GTGTCAGAGTCCTCCTCATACTCATGTATGTAAATTACTTCAGGGTTGTC
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AGACTTTCTTATGGCCAGGAAACCAATGTTCCTTACATTTGTAACAGAGG
TTTTTCTGCTTGGCCTGTTGGATGATTGCAGCAGTTGTCGATGGTGGTGG
AACCAGAGCTGGGGTTCTTGGTTGTTCCACAGTAACTGGCCGTCTGGTAG
AGGGATAGAATTGTTTTGGAGGTGTAGGTGGTGGTATCGAATTTTCCAAA
CGGCGAGCATACCACATTGCTGTCTGCATATCCTGTGGTTTTAGACACTG
CAGGTGTGTCTGTATGTATGTGGAGAGGCTAGAGACGAAGCTGTTGACAT
AATAGTCATCAGGTAGTGTTGGATTGTCCCTCCTGAGCAGGTTCATAGCT
TTTTCAAACCTAGTGATATAATCAGCTACTGTGGATGTTTGCACTAGGGA
GTGGAATGTCCTGACATTATCACAGATTGAGGTGACTGAGAATCTATCAG
TTAGATACCTGCAAAATCTATGCCATTGGATAGTGGATGTAGCAAATCCA
GTGCTTCTCCACCATTGCATAGCAGGCCCAGTGAGGTATGTCACTACCAC
TTGTGTCCTTTGATCCAGTGGAGTTCTAGCTGAATCAAAATATTGTTCTA
TGGTCTAAATCCAGGAGTCTGCATCTTCCCCATCAAATTCAGGTATGTTC
AGCTTGGCTGGTTTGACCATGAGTGTTGTACTTTTCCTCATGTCCTGCTG
GGAGTTGTTTGTGGGAAATGTCCTCCCTTTTGCAAGATCATCTAGCCCTT
CCTCTATCTGTTCTGTGAGATTAGCTGGATGTTGTTCTTTGGCAGCCTGT
TCAATTCTAAGTTGTTGCAAATGTCCAGGATTCTTCTGATTACCATAATG
AGGATGCCTATATGGAATCTTATAAGTATCATCAAGGTTCTGTTCCCTGC
CCTGGTGATCATGCAGTGTTCCATGCCCAACAACTGTTGCCTGTTGTGGG
TGCTGTCTGTGTTGGCCAGCGCCCATAAAGGTGGGGCCTTGAGGGGTGAT
CATGTAAACACTACCTTGGCCTGGGGAGGTAGTTGGGATTGTACCTTGTT
TGAGTTGCTGTGCAGGTACTTCAGGAGGTGGGGAAAGATTGTCTCATACC
TCTGCAGGAGGGGCCGTGAAGAACCGATCCAAATTTGTCTGAATGTTGGA
GAGATTTTCCTGGATGGACATGAAGCTTGTATTGACATTGGAGGAGAACT
CAAGAAATTCTTTGCGGTCCTCTTCTCTATATCTCTGCAAGGTCTGTATG
TCCAACTGAAGAGATTGCATCTCTAGCTCTTCGGTGGTGCTTGATTCGCT
TACTTTAGGCATGATACAAGGAGAATTTTACAGACTGGTGATGTACCAGA
AAAACTCGTTGTATGAAGATGGCTAACTGAACTTGAGGAGGAGTTTTACG
CCTGTGAGTGGCAACCCGACTCAATCCAGTCAGTCCTGCCGCCGCCACGC
CAACGCCGCCGCGCCGCCAGATGGTACACGGATCTGGGAGGGAGGTGGGA
TTTTACTGCTGAAGAAGGGTTCTTGCAGCAACCACACCCTTTTCCCTGGA
TCTGTACCCGAGCTGTGCCACCGCCGCCAAGCCGCCGCCGACTGCTCCCT
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GATTTTACGAGAGATCCCAACCTCACCACGCGCGCGACGTACGCCTACGA
GGACCAGATGTCTCTGATACCAATTGACATGCCTAGACTAGGGATTCAGA
GTTGTAGACAGTTGATCACAAGAACAGCAAGAACAGCAGGGGAATTTCTG
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AATCCTCAACAGAGGCGGCTAGGGTTTAACCCACACAATAATTGATGCCC
ATCTCAAAGGAGATCAGGGCTTATAAAGCTTACAGAGTCCAAAAAACGAC
AAACAACAGAGTGGTTGAGAACCAGCTGTAAAGTTTAACAGCCACACCTG
AAGGATTTGGCGCGAAATTGTACTGAAGCGCCTGTGTCGTTGGATGGAAG
ATCGATGGTTCCTGACAGAGCACCACACGCGTCGCTTGGGTGGGGACAGG
CGTCATGGGCCAGTCCATGGCCAGCCACCTGCTCGCCGCCGAGATAGCCA
CCGTCGTCGCCGCCGCGGGCTGCGCGGCAATCGACGCCCCTGTATCAGGC
GGCGACTGCGGGGCTCGCAACACCCGCCTCTCAATCTTCGTCGGCGGCAA
CGCTGCCGTCGTCGCCCGCCTAACGCCTCTCTTCAAGCTGGTGGGCACCG
CCCTGCACATGGGAGGTCCGGGATGGCCGTGGCGTTATCCGGCGGCGACT
AAATCTCAAGCCCTGTCCCTCCCGGCGATGAGCCAGTAGGCTGCCTCTCC
CCATGTATGCACTCCTCTGCCCTGTTTCTGACGTGCTCTCCGACGCGTGC
TCGCCCCTTTCCAAGATTTTACCCACCTTGCTTTGACCCCTTCCCCCACA
TCTCTGACTTCCTCCTCTCACTTCCCCTCTGAGGATGCCTACTCCTTTGA
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CGTTCCTGCAGGAGTTCGGGAACCGGGGGACTCCTTTGGCGATGGAGGCG
ATGCACATGATGGCGCTTTGAGATCAGGCTGCTATCTGCTGGGTGGTTGG
TTTGGGCCTGTTAAGTTGAGGTCTCGGTGCTCACGGTTGCTTTTGGCTTG
CTGTAGGCAGATAGGGAGCTATAAATGATTGGGAAGAAGCATGTCAAGCT
GCAGGCGGTTGGATCATAGCTGTTGAAATGAAATTACTTTGCTCTATAAA
GTATGTTTTCATGTGAGGAGATACCATGCATGTAGCTGTAGGTCCAAGCA
CCAAAGCTAAAACTGCTAATGATTGGTTTATGTGTCATCACCATATTCTT
ATTCATATACCTATGTCATTAGAACTACTAATTAGCATAGAGGTTTTTTT
CACATTACACTACAGATACCTGCAACAAAGTGAACTAATCATCTCTTAGA
GGCCCTTTTTATTAAGATATGAGATCACCAAATATCACAGTAGTACATAT
CCCTACAACAAAAGGCATTAATCATATCCATAAGTGCCATTTTAGTTGAG
AGATGAGATCACCAATTATGCACACGCAGTTCTGTAGGGCTACCGACGAG
CTGTTGTGTCACGTCCAGCTGCAGCACCACGGAGGGATCTGTGGAGTGTG
TGGCATCTCTTAATGTTTGCAGAGAGAGGGATATATGGATGCTGACCAGA
TCTTTGGAAACAAGGTAAATAAATCCCCTCCCTAAATCATTGTACTTCAG
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TTCGTGTATTTTGTTTCCTTCCATCCTCACATGTGCCTTCAGACAGTTGT
GTATTCTCTCGGCTTAATGCTAATTGGTGCAGTATGTTATCTGCCAAGCT
CATTCATGTATGGTCGGTTGGTCATATATCGAACTTCTGCAATTCTGTTG
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TGTGCAGGTGGAGTGTTTTTCCTTATCCCGCTTTGTTCTGCACAGGTGGA
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AACTGAGGATGGTTCACGCTATTCAGGAATAAAAGAAGTAATAGTATGTT
CATATGTCTCTGTCTCTGTGATATGCAGCTACTGAAATATAAGTATGCCA
AGTGCTTGATTATCTGTAGTAGTGTCAATCCAGCACTGCAGGTATGCCAA
GTGCTTGGATGGTGCAAGCACCATCTCTTGCATATTGAAACTTCAAACCT
GAATACTCTTATGCTGTTTTTAGGCCTACTTTTTGGACACTCCTCGAATC
ACGTAAAACGTCGTGAATATCAAATGGAGTGGAGATACCAATGGATCAAG
GTTTTCCTTTTTTCCCTTTGCATTTGATCTCACCCATATTTGATCTAGAG
ATTCAGTGGTAACTCCTACCCATATGAGGCTGTACTCTCTTTGTTTAGTA
GATGTAGTAGTAAAAATATGGAAACTTGGAAAATCTGGTTCTACAAGCAA
GACATTTTTATCTTATGCCCTTTCTCACAAGGCCATGTCGCGATTATAAA
TTTGTGTGGTCGTGCCTATCGGATAATCCAATAGATTTTATACTTGCATT
GATCCATTCTTTTCCATGTGCAAAAAAGATTCTACCCATCTTGAATGTGC
AAAAGAAAAATCCATGCTAATGTTGGAATGTTGTTCTGGTTTAAGCACAA
GAAAACAAATTTGCTACTCGCAAGGTCATTTATTATTTTACTTTTGGACA
GTATAAGCCGACTAGATGATAGTTCTCACTGATTTAGAGCTCTTCACTGG
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GATGTATCTAGAAATGTTTTAGTACTAGATACATCCGAATCTAGATAAAT
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ATATACAGTGTACATTATAAGGTAATTATAATATTGGTAAATCCATGTTG
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ATTACTTTTCAATTTCTTGCAATATTGTTAGATTTCTTTCTCAAAAAGAT
ACATGTTATCCCTTTTAGTTAATCCATAATGTATCTATATAGTTAGTGTT
TTTCTTTCAATATATAGTATAGCCGCCCCATATTTTGTTTTTGCATTACT
TTTTTGTTCTCTAAAATCTGCCATTATGGATATAACAAATTATATTTTGG
CTCATCTCTTTCATAAACAGTATGTATATATTTATATTTTAGTAGCTTTT
GACATCATCAGCTTACTCATTTTTACACATTGCAAGTGTAAACATATTTT
CACTTAGCAAATGGAATATTTGTTGTCCCAATAGAATTTCCAGGTTTTGC
TTACAAAATCATGATAAAAATCATGATAAAAGTCTAAGAAAAGAAACATT
GTGTTAGCAAATCTGATGCTACAATAAGTTTCCATTTCTTCTACAAGAAA
AAACTATGCTTACACAAATGTTCTTCAGTAGTTGGGTGTTACATTTCAGC
TGCTACATCTCGATTACATGGTGACTCCAGCTGAGTGTTACATTTCACCA
AGAATGTTTGATCTAAGGCCTATACGAAAGTATTATTGTATTGCATCCCA
AACTTGCAACATATTTTGCAGATTTATGGCGTGTATGTGTATTTGTCAAA
GAAAATATACATGACTGGGTTCAAGATGTCGGCTGACAATGCATTTCTGT
TATATTTTGCTGGAGATCATCCTTTCATGTCTCTGCACGCAATGCTATCT
ATATCTTTTTGAGATTGGGTTGTTAATGGTGAACTAGAACTAATTCAGTG
GACACAAGAATATGGCTCAGTTGGGGACATGGTTACTCAGATTGCTGATC
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TTAAGGTCTTGCCATCTTATCTTGCCGATTCAACACAAAATTCTCTAGAT
GGCAAGTGTAAAATGTCCAGTACTTAACATATCCATACATGCTAGCATTA
CCGTGGATGGAATCTTGCATGTTGCCATGGTGAGTTTTACAGGCTCTTTC
CTATATTAACTCCTACTGATATGTACAATGAATATTAATTCGTTATAATC
AAAGTTACCAAACATTAATTTTACGCAATTGGGAGATTTGCCTAGCTGTT
AATGTAACCATATTTTTGTTCAATCTTTGGAGTCTAAGTTTGTGATTAAT
TACTCCCATCGAACTCTGCAGGATCAAGGTGATCCTCAAGCAACTAAGCT
CAGGTGCCTGCATAGTGACAATCAACTTGCTGAAGGTTACTCCTAGCTTA
CTCTACTTTCTGCTCTTTTTTATTGTAGCCATCCAATCTAATGAAACACA
TGTTATCTGTATATGTAACTCTTGATCTGCTGTTTTAATTTGAATGTGTT
TGCGTGAGCATATGGAGTAGAGACCGATCTACTAATGCGCAAGAGAATGA
AATTGAAATACAATGGCTATTTTCTCCGGTTGAAGAGAAAGCAGTATAAG
ACTAACTGACTGTGACATTGTATACAGTGATGTTAATTCAATGTGGTGGC
GTTGTATTTCTATGCCATTTCTTCTTTAACTTTCAGAACATTCAGTTATC
GCATTTGACAAGTCATATATTCTCTGTTAAATTAGTCTGCTAAATTCAGA
CTAAATAGTGAATTGATCGAATGCCTTGGCCAGTTACTATGCACATGCTG
AACAAGCAGAGAGAAAAAAGTTCAGAGCCCATCGTGAGTGCACATATGAA
ACATCTTTGCTTTTTTAGATCAAGAAAATGGCATTGACTGTAGATTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.