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GrainGenes Sequence Report: AE005311

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Sequence
AE005311
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE005311
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGACACCGCCCCCAATTCCCCCACACCGCCCCCTCCCACCGAATTGCATA
CCACGCACCTCCCCCGACTGCGGCGGCGCGGGACAACCGTCCAGGAGGAA
CGGGGCGACGGAAGGATGGCCTGGGGAATAGCGGTTCTCGACAGAGCGGG
GAGAAGGCGACCCGACGTCGACCTATTAGTCGGGATCGGCAGGGTTCTCG
ACGGAGCGGGGAGAAGGCGACCCGACGTCGATCTATTAGTCGGGATCGGC
AGGGTCGTGACTCGTGAGGATGGCATCCGCCTTGCAACCAGGCGGTGGTG
GGCTTGCTCGCGCGTCGGCCGCAGGGGACATGCCACAGCGAAGTAAAAAT
AGAAAATGTTTCCTCCGCCTCCTCCCTCGGCCCGGCCGTTCCCTTTTTCG
AGTTCATCCTCCTCGTTAAATCGATGCCTATCGAGCCGACGACAAATCTT
CGTGGCGGGAGGCCATTGCCCCCGCCGTTACATACGATGCTTCCTGCGGA
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TCATCTGATCAATGAGCGACTAGTAGTTGATTAATAATTTAGCTGCCTGA
AAGACACTCTCTGCTTTTGATTCCAACTGCTGTACTATCTACATGTTGTT
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AATCCAGAAGTAGTTTGGATGTTTGAATTAACTATCCGTCGTAGGTGACG
AATGGGAGAAATAAGAAGTAAGCACCAACTTAGCAGTGGTCATGCATACA
TTTAAATTGTTGTTGCTCACCATTTGTGTTTCTATCTAGCATGAGCTTGG
AAGTATGCCTTGAATGAAGGCAGTGCGTCTGTTTGTCGAAATATTAGAGG
CCTAACTAATTACATCTTCTTCAATATCTAATTCTGCATAATGGTGGTAG
GAGAAAAATCATGGATGGTACTCTTGGGTTCCCGAGTTCAAACCTCAGCT
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AGATATAAAAGGTTTTATCTGCCAAACTATATTAATTATATATTGTTCAT
CTGATTATTTAGACTTCACTCTATCCTTGAAATTATTGGTCTTTTGAATT
CTTTGTCCGTATTTTGATTTTGTTCGAGAAGAAACCATAGGAAGGGCCGT
ATGTTGTGTTTTTCCGTCCCGGTGCAACGCACGGACAGGGCAGAACGCTT
CTGTCAACCAGCCTTTTCGATACCCAGTACCTCCATAGGCTATGTACATG
GCTAAGAAAACAAGATAGTGTGCTCTTAAGGGTGGGAAGATAACCACCAA
GAATGAACACTCATTCTTGAGGATATCATGAAAAATCGGGGTCAGACTTT
GGTGTGTTCAGAATAGACGCCTAGCTTTACTCCCAGTGCAACGCATGGGC
ATTTGTGCTAGTTCAATATAATGTTTACACCCGGCCTCTGCATAGCTAGG
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TTTAGCCGTGATGTTCTATTTGGCTATTTGTAATTGTAGTGCTGATGTGT
TACAACTTATAAGTAAGAACTTTTAATCATTGATCCAATCTGTTGAATGA
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ATGTTAATCAGCAGAAGATGACTGGTCCATTTGTTTTGGTGCTATTGTGA
TCATGCTTTCGCTTTTACTACTGCTACTATGCCTCTTCATCTGATATTAG
CCTTTTTTTTTCAGCATTTTTTCGTGTCTTTTCCAACATGTCAACTTCAA
TGTTGGGCCTCATTTTGTACAAATTCAATAGACTAGCTTTTATGTGTTTT
GACATACCTATTTACATGTGTTGAGGTTCTGCAGGACTCGCGGTTCTATC
CTTACAGGGAAGGACTTATCACCAAATATTGGTGCGTTCTGGTAAGTTGT
GGTAAAAATTTGTAAGTTAAGCCCATGTATAATTTGATTGATCTTTTTCT
TTTGACGAAATTCGGGAGGGGAAAACCCCCTACCTACAGTTTTATTAAAA
GGGGAGAGCTAAGGCAGCTCAAAGTTTTTACATGCATGAGATTACAGAGG
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGCACAGGGGAAAAAAACAAGAGAAAAGAAAGA
AAAAAAAGCAAAGGAAGGAAAATCAATCCGGCCATTCAGATTCCCACATA
TGAAAAGCTTGCTTCTCTTCTCTCTTTGCCCTGAGTGCCCAAAGTTTGCA
TGTTTCCATACACTGCCTGGCCACCGTATAAATTGGGATCTCAATATTGT
CAAAAACCTGCCAGCCAAATGCTCCAAAACGAAGCCGTCACAATCAGAGC
CCAAGCATTTCTTTTTTTCAGGACACCCTTCTCTAGCGTCACCCAAAATA
TCCTCTAAGCCAACACCGCCGCTGAATTGGATACCCATAGATGCAAGAAT
TTATTTAGTTCGGTTACACTCCAGGGCGAAGTGTTCAACCGTTTCTCTGT
CGTTGCATCCGAATGGACATGACTCATTGTCCACAATACGTTGTGTAAAC
AGGACAGTCCTCACTTTAATTCTGCCCTTGACCATGCGCCACACAAATAA
TTTTCCTTTCTTTGGTGCAGTGCATTTCCACACTGTATCCGCGCAAACAT
TTCTGGAACCTCCCCAGTTCATGAGCTTGTAGAAGTTACTTACAGTGAAA
GTGCTTTTTTGGTCCATCCTCTATCTTCTAAGATCAACACTAGAGCTATT
TAAATTGCAAGAGTTTAAGAAGGACATAAGAGCCTCCTTCTCATGCTCAG
CGCGTCAGAAGTTAAGTGATTCAATGGGATTACCCATTCCCCATTCTGCC
AGCAGTCCGCAACGGTGATGTTTGATCTAATGTAACATCCTTATTTTTAT
GGTTTGATTTTTTTTCAAAGGATGTGCTACAGAATAAAATAAAATAATAT
TTTTGTTTTGTTTTTCTTAAATCATTTCCAACTATTTGGAATTATTTTGA
GATATAAAAGAAGGAGAATATTTTCTCAGAGAATATTGTTATTTGAATCT
GCTTTTAATTTGCCAATTTGTTTCTTATTTGGTTATTCCTAAAAATCCTA
TTGGGGTTGGCCCACATCCATGCACATGCGCGCGCATGCATGCAGATCGC
ACCATCACGTTGCTATTATCTCCTCGTGTCCTCTTTGCTTTATTTTGTTT
TTCACTCTGCCGTTGCACCCACCTAGCTTAGGCACACCGACCTGCCGTAT
GCAACTTAATATTTGACGTGTGAGGAATGACATCATTTTCTGATGAGTAA
GGTGTTGATGGCGGGCGTTTCAATCTGACCGACTCGTCTCGTGCGGGCGT
TCAGGAAAACAAATGCTTAGATTAGCTGCATGCTGTGCTGGGATTCTATG
TGTGTGTATGTGTCGAGCAAACTCTCGGTTCGGCTGGGCTGCAGGATTGA
CTCGGCCAGGCCTGCGGGTTGGTGTGCCTAAGCTAGGTGGGTGCATCAGT
AGAGTGAAAAAGAAAAGAAAACCAAAGAGGACACGAGCAACGTGATGGTG
TGGTCTGCATGCATGCACGTGCATGAATGTGGGCTAACCCCCAATGGGAT
TTTTATGGAACCAAATAAGAAACAAATTGGTAAATTAAAAGCAGATTCAA
ATAAAATATAGAAGTACTCTAAGAAAATATTCTCTTTCTTTTATATCTCA
AAATAGTTGGAATTGATTTAAGAAAAACAAAACAAAAATATTATTTTATT
TTGTTCTGCAGCAACATCCTTTGAAAAAAAATCAACCCATAAAAATTAGG
ATGTTACAATTATACCCACCTTATAAGGAATCTTGACCCCAAGATTTGGC
TTAAGAGAAAAGATTTGGAAACTCCTCGTGGAGGGCATCCTCTCGTTCCC
ATGTCGCTTTATCCTCGCTATGATTGCTCCATTGAACCTTACAGAACTTG
ATCACGTTCCTTCTCATTGTCCTTAACTGCTCATCGAGAATTTTAACTCG
GTATTCCTCGTAAGTCAAATCATCCTGAACTTCTATGGCATCCCAAGAAG
TTTTTCGAGCCTCTTCCTCTGGCTTATGAAAACATTTCTTTATTTGAGAC
ACGTGGAACATGTTGTGCACCTTGGACGATTTCTCAGGTAATGCCAACTC
ATAAGCAACCTCTCCACGCCTAGTGGTGATTGTAAAGGGTCCAATGTATC
GGGGTGCCAATTTTCCCTTTAGTCCAAAACGACACATCCTGCGAGGTGGA
GATACCTTCAAGTACACAGCGTCACACTTCTGAAATGCTAAATCATGACC
ACGTCTATTGGCATATACCTTCTGTCATGATTGAGTGGCCCGCAACCTTT
CCTGAATCATCTTTACTTGTTTATCTGCCTCCTCAAGAGTGTTAGGTCCA
AAAACTTGATTTTCCCCCACTTCATGCCAATTTAGTGGGGTGCCGCACTT
TCGTCCATACAAGAACTCAAACGGAGATATCTGTAAGCTTGCCTAAAAGC
TATTGTTGTAAGAGAACTCAACATACGGAAGACTCTTGCCCTAGGTGCGT
TTGCAAGTCAAAGCACAAGCCCGAAGCATGTCTTTCAATATTTGGTTCAC
TCGCTCAGTCTGTGGATGGTAAGAAGTACTAAAATTCAACTGTGTGCCTA
AGACTTCATGGATCTTCTTCAAGAACCTTGAAGTGAATTGGGTACCTCAA
TCAGACACAATCTTCTTTGGAACTCCATGTAGGCAAACAATTCTGGCCAT
ATATAACTCGGCCAATTTCTACCCATTATAAGAAGTCTTCACTGGAATAA
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CCTGATGACGTCCTCTGAAGTCCTGTAATGAAGTCCATCCCGATTTTTTC
CCACCACTCAGGAACCTTAAGTGGTTGAAGTAGTCCTGCAGGCTTCTGAT
GCTCGGCCTTGACTCTTCGACATACATCACAACGAGATACATACTCCGCA
ATTTCACGTTTCATGCTAGACCACTAAAAACTATCTCGGAGATCATGGTA
CATCTTCATACTTCCTGGGTGTATGGAGTATGATGACTCATGCGCCTCTT
TCATGATTGAGTCCTTGAGTTCTTTTTGGTTTGGCACTAATAAAAGTTCC
CGAAACCAAATATTTCCCTTTTCATCCTCGCTGTAGTCAGGTGCTTCTCC
TTACTTGATCTTCGATTGAATCTCTTCGATTCCCTTGTCATTCTTATGAA
CTTCTCTTATTTGATCTTCTGGAGTGAACTTGACTTCTAACACATCCTCA
TTCTCACCAAGACTCACATTCATGTTTAACTTCCTTAATTCCTCATGCAG
TTCTGGTTGGGCTTCCTGCATCATAAGATTATTGCATAAGATTATTGCAG
TAAACCTTTTTGCTTAACGCATCAGCTACGACATTGGCATGTTGTAGTCC
TTAATTAATTCTAGCCATCTCATCTGCCTAAGATTTAAATCTGGTTGGGT
GAAAATATACTTTATGCTCTTATGATCTGTATATATCTCACATCGTTTAC
AAATAATGTAGTGTCTCTAGATCTTCAAAGAATGTACCACGGTAGCCAAT
TTCAAATCATGTGAGGGATAGTTTACTTCATGTGGACGTAGTTGTCTCGA
TGCATATGCTACGACCTTGCCTTGTTGCACGAGAACACAACCCAAACCTT
GTTTGGATGCATCACAATAAACTTCAAAATCCTTCAGAATATGTGGCAAC
ATTAGCACTGGAGCAGAAGTCAGTCTCCTCTTGGGTTCTTGGAAACTAGT
CTCACACGCTGGTGTCCACTCATACTTGTTCTCCTTCTTTATCAACTGTG
TCATCAGTCTCGTGATTCTTGAGAAATCTTTTATGAAGTGGTGGCAATTT
CCCGCAAGTCCGAGGAAGCTATGTATCTCTGACACATTCTTCGGTTGTTT
CCAGCTAAGTACTGCCTTCACTTTGGCTGGATGCACTGCTACCCTTCAGC
TGAAATGACATGACCAAGAAAGTCTACTTGTTTCAACTAAAACTCGCAGT
TGCTAAACTTGACATAGAGTTGATGTTCTCTAAGCCTTTCTAGAATAATC
TGTAGGTGTTTCTCGTTCTCTTCTTCGTTATGAGAGTAGATCAGTATGTC
ATTAATGAACACAACAACGATGAATTTATCCAAGCAATCCATGCAAACTT
TGTTCATGAGATTCATTAAGTAAGCTGGTGTATTCGTGAGTCCAAATGAC
ATCAGTGGAAACTCATAGAGGCCATAACGAGTAAGAAAGCTGTTTTGGTA
TGTCTTCCGGTCGGATCTTCAACTGATGGTATCCTGACTTGAGATCTATG
TTTGAGAAAACAAAAGCTCCTTTCAACTATCAAACAATTCATCAATCCTC
GGCAAAGGGTATTTGTTTTTGATGGTTACTTCATTCAAAGCACGGTAGTC
CACACACATACGGTAGTCCACACGCATACGCATGGAACCATCCTTCTTCT
TCACAAACAACATCAGTGCTCCCCAAGGCGAGGTGCTCGGTCTAATGTAT
CCCTTCTCTAAAAGTTCCTGGATTTGTTTCTTCATCTCAGCTAGCTCATT
TACTAGCATTCTATATGGTCTCTTTGCAATTGGGGTAGTGCCTGGCACTA
ACTCAATGGAAAACTCTATCTCACGATCTGGTGGAAGACCTGGTAACTCC
TCTGGAAAAACATGTAGGTATTCCTTAACCACCCTAACATCTGACACAAC
CATCTCCTTCAAGCTATTCAACAAGTTGTCTACTGCGGTTTCTAATGCTA
ACTCGGGCTTGTAATTCACCTAAGTTCCTTCAGTACCGGTCAACGATATA
ACTCTAAGGCCACAATCTATCGTAGCTTTGTGTTTCCCTAACTAGTTCAT
GCCCAGAATGACATCTAATCCTTTAGAGTCTAACACTATGAGGTTTGCTA
GAAACTCTACTCCCTCGATCATTATTGCCACTTTAGGGTATTTTAAACCC
GACATACGAATTCCCCCTGGTGATTGTACTGCCGTTGACTGACTCATACC
TTAGTTTTCAAATGGTGTTTTCAGCAAATTGCTTGAAAACAAACGAATGG
GAATCTCCCGAATCAAAAAGTAACCATAACATGAGTTGATTGGGAACATA
CCAAGAACAACATCTGAGGCTTCATTAGCCTGTTCCGTTGTGACGTGGTT
GACTTGACCACAACCTGGCTGTCCTGAGGCATGAGGTGTGCCTCCTAGTG
TAGGCAGTATGCCTCACCCACGTCCCACTGTTGTTGTCTTGGCAGAAGAC
CCCTGAACTTTACTGGTGTCGGCCCCATGTTCTTCTTGTTCGGGCATGCA
GCAGAGAATTGTCCCTCCACGCCACAGTTGTAGCATGCCTTTCCAGCAGT
GTTAGCATGGTTTCCTTTGACTTCAGCTCTTGGAGTACAGTAGGCATTGT
GTTGGAAGTTATGACTAGGCTTTGCTGGCTTGGCAGTTACTCCACGATAA
CCCGGGTGGTTATTGTTCTTATGGCGTGAGCTTCCAGCTCCATGATGATC
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CTTCCAGAATAGCCTTATTTATTAGACTTTGGAAAATCGGAAAATCATGG
AACACCAACCTATCCTTCAAACTTGGGTTCAATCCCCTCAGGAACCTAAC
AATCTTGCCTGCTTCAGTAGGGATATCTGCTTTCCCATAGCGTAATAATT
GAGTGAAGTGGTCCCAATATTCAGAGACTGACATCTTTCCTTAGACATGA
GCTCGAAATTCATCCCTCTTTAGCTCCATGAGACCAGCAGGAATGCGTGT
AGTGCGAAAAGCTTCTGAAAAATCATTCCAAGTGATTGCCTCAGCATTAT
CATGTGCATCATAAAAGCTCTCCCACCAATTTGCAGCTACACCCTTGAGT
TGGTGCGCCGCAAACTTCACACGTTCCTATGCATCAACATTGACCAAATT
GAGCTTCCTCCGAATATCCTTCAGCCAATCATCAGCTTGTCCGTTGATTC
TGCAAAAGTAGGTGGCTTTGTCCTCATGAACTCTGCTAACTTGGACTGGG
ATGGAGGATGATGACCTTGTTTTGATTTTGGTTTTGGTTTTGGTTCTGAT
TCGCCATGTTGGCAGCCTTCTGCTGCAGTAACTGTGTTTGCATCAACATT
ACTTGCGCCATGTTAGGTGGCTGCGGCGGTGGTGGCTGCTTTCCCTCGTC
CTCAGTATCGATATCAATGTCATGGACTTCACCCTCATCGAAGTTCTCTT
CGAATGCCGGTCCGCGACTGCGTCCACGTCTGCATCCTCCGCGACCACGA
CCTATGTTGGCGTTCATCCTGTTGTCGCTCAAGATTAAAATAGACGAGAG
GGAAATAAACTGCCCCAAAACCAAACTTGCGTGTACAAACAATTGGAACA
TCAAAGAAATCCAAACGAGAGAACCAAATTTATCTTAAATCTCACACACG
AAAGGTTTAGGTAGAATAGTAGCTATACCACATATATGGATTGGTATAGT
CTACTAGACACACATGCAAATATTTAAAATAACTAACGTCTGCTCACATA
TTATTAAATAAAGGCTCTCTCATGGCTCCGTATAGTCTACTCGTCGAGAT
AACCAAACTGTTCTACGTACAAGTGTTTAGGCGCTGGTACAAAGTGCAGT
CCACTATGCTGTTCAGCTGTGTTCTCTCCTTCCAGGCTTGCAGGAATACG
TTCTTCCGGATCTTCTCCTGCGACGCTCTAGTCCGAAGTTAAGCAACGCC
ATGCGGGTGAGCGTGGGATCGTCCTCATTCCGGTACCTCATGTTCTGACA
GAGCACACCTTCATCGTCTCGGTAGGCAAAGTAACGGAGTTGTGTGTTGC
GCAACTCATTTTGGTAGATACCCGGCATCCTCTGCATCGCCTGGTGAATG
GTATGGATGGTGGCATCCACAAAGTCCGCTCCATCAGCAGTGAATTGGTG
TCCTTTTGCTCCCGCGTGGCTTCCATGTAGTGATAGGTTCGGGAACACCA
CCAAGGTAACTCCCACTAACTCCTCGCCCCAGACATTCTGAAAGGTGTGT
CCAGTCGCTTCTGTGTCACAGTCGTAACCCAGCCTTGTCAACATGTCACG
AAACTCCTAACCAAGGTGTTTCCGAACCTATCACTACATGGAAGCTGCAC
GGGAGCAAAAGGACACCAATTCACTGCTGATGGAGTGGACTTTGTGGATG
CCACCATCCATACAATTCACCAGACGATGCAGAGGATGCCCGGTATCTAC
CAAAATGAGTTGTGCAACACACAATTCCGTTACTTTGCCTACCGAGACGA
TGAAGGTGTGCTCTGTCAGAACAGGAGGTATTGGAATGAGGACGATCCCA
CGCTCACCCGCATGGCGTTGCTTAACTTCGGACTAGAGCGTCGCTTGGTC
GCAGTCACCGGTATGCTGGAGGATACACGTCACCTTATCCATCACTATCA
GAAGAAGAGATTGGTGGAAGCTAACACAACCTTGGTGGCTGCATGTGAGG
CTGCTGAGGCTACCGCGGAGATTGCCGCCCAAATGGCAGACTGGTGACTT
CTACTCGTCGAGATAGCATGTGAAAACAGAGCAGGGAATTGGGTGGAAAG
GGGCCCCTCACTAGTCCATTTATCTTTCCACAAAGATGTACTTGTCCCGT
TGCCAAGTTGAACACATGTCACTTCTCTGTGACAGTCAATTAACCCACAG
ATTTGGGTCCAAGCTCTGGTCTGAGTTTGCATTTGAAGATTGATGCAGTA
TTTCTTTGCCCAAGTCTTCAAAACTTGTTCAGAAGCCTCTTTCTTATAAT
AATTTTCAATATGGACATTATTTTATGGTCTTGCCACTTGCCATCCATGT
GAAGCACCGCCCGTGCTTCCTTGCCATTGTTTACACAACAATTTTCACTA
TGTTAAAATTTCATCCCCCGGTGAGTACATTTTACATGATATTTCCTATG
AATGTAGTGTCTCAGCTGCAAAAGGTTAATGTTTTTATTTCTATGTGTGT
TTACCTCTCCTGTATGTATTCTCAAACCCATGCATTTTATTTGGATATCT
CGAAGGCTAGAGATTCAGCTCTATATCTAGGACTTCTGGGCCTATTTGTC
AACTAATTAGCAGCTAGCTGAAGTTTTGTATCGGTATTTTGAATTACTGT
ATTGTATTTTTGAAAGTTAATTCTCTGACTTCCATCTTGCAGAGATGAAT
CCATCTCCCTTCCTTTTTTGGGGTATGTTGGAGTCTCTCTTCTGCCATGT
CATGCACACACTATGGATCTGGACTCTGGAGGGTCTCTCTCCCGTGCGCC
CTCCCTCCACCCACACGCAGAGCATAAAACCAAACCCTACTTGTAGATGC
TTACTGTAACTTAATTCTTGGGAAATCAACACCTCAGATGGTTTTCCTGC
TGATGGGCTCTTGGATGCGAACTCGCAAACGGTTCGTTGTACTGTGCTTT
TCAGTAGCGGTAATTCGTTCTGGGATTCTGAGTAGAGGCAGCCGACGATT
TACCTTATCCTGTTATATACTGTACCTCCTACATTTTCACAACATATGGA
CCACAGTTATTTTAACCAAGACTAGAGAAACAACTCTAGACAGTACCGAG
CTTCCGTATGGATCCAGTGATTACTACTTTGTCTGATCTTTCATGGTGAT
ATTAATCCTTGGTACAACCTGTACCATCAGTTTGACATAACGTGGGCTGC
CGCTGCCGTTGTAGATACCTCCGTCTTGCTTCTGGAGGTCGGTCCCCGAA
CGGATATACTGTTGGCCCATTTTCTTCCGTCCTGGTAAAATCACAAGCCC
ATTGTCACGTTGCTGTTTACTAGTCCACTATGTACTGCAAACCTTTGCCT
GCTCCCAAGAGTTTTGTTTTTGTTTTTATACAAAGTTCTTCCCTTTGGAC
AGATATACTATGTTCTTTCATCGTGGTGGTCGAAGCAAAGTCCAAACGTA
GCACTTGTGCACTTGGGCCGTGTGCTACCGGTAAGCGTGCTGAACTTCGT
CCATGGTCACGCCAACAAAATCTGCGTAGCTGCTGCAGATACTGTTCTGG
CCTACCAAACTAATTCACATCATCTCTTGGTTTCCATGAGGTACAGACGG
AACTGAAAACTCGTTGGCTGCCCAAGACGCCACCTACGTCCAAACCAGCT
TCCTTCATGTTTGGTGCGAAAAGCCATGCCCGTGTATGTCAGTTCTTGCA
TGGTTTTCCTTGTCTCGTAGCGTCTATCCGTGCTCGAGGTACTCAGGGAT
CGGCTTTTGCGTTTTGGCGACGTGCGAGAGAAGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.