Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE009919

[Submit comment/correction]

Sequence	AE009919
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE009919
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCTGAAGCAGCGCGGAAGGCTATCCCGAAAATCGCCGGTTAATCCAATCC CTCGGCGGGCCGCGAGCAGCAGCGACAGCGATGGAGCCGGAAGGTGTGCG GCACCGGACGGTGGACGTGGCGCGTGGGGTGCGGCTGCACGTGGCAGAGA CGGGGCCCGAGGACGGGCCCGCTGTGCTGCTCGTGCACGGCTTCCCGGAC CTCTGGTACGGCTGGCGCCACCAGATGGCCGCCCTGGCGGCTCGGGGCTT CCGCGCCGTCGCGCCCGACTTGCGCGGCTACGGCGACTCCGACGCCCCTG CCGCCGCGGGCTCGTACACCACCTTCCACCTCGTCGGCGACCTCGTGGCC CTCATCGCTGACCTCGGGCAGCCCCAGGTTTGACCATCGGACCCGGTCGG CCTTCCATTTTCAGATCTCCTCGCGCAGGCCATGCTCCTTGCTAAGCTAG CTGAGCTCTCTTGTTCGTGTGATCCGCGGCCTCGCTCGGCAGGTGTTCGT GGCGGGGCACGACTGGGGCGCCAATGTGGCGTGGCAGCTCTGTCTGCTGC GGCCGGACCTGGTGCGGGCGCTCGTCAACCTCAGCTTGGTGTACAACCCG CGCCGCTCCGAAGGGACTCCACTCCAGGCCATCAGGGCCTTTTGCGGGGA AGACCACTACATGTGCCGCTTCCAGGTGAAACCCCTTCATCCTTCCTGTC TTGATTGTGGCAGACAGAATCAATGGTATAATGAGTTGTGTTCCTCTGTC CTGTCGACATTATTGGGCAATGGCTTGTTTTACTGTTCGCTGCGGAAAGT TGAGCGGATTGATGGTTTTAGGTATAATAATTTTGTTACGTTAGACGATT GTTTGCTTGCTTGGCCTTGGTGCTTAACTTCTCTGATACTTGTTCCTTGT GGGCTGTTCTTGATGCTCGAGAAGGGATTGGATTAAGGGCATTGCGAGGA GTACACTCGATTATTCATAGGCAACTAACTGATACTGTAAGCAATTGACT TCGGAACTCCAGATAGAACACTGGAGAAATGGCTAATAAAGAAAAAAAGT AGTAGTATTGTTTGATTGGAGGTTATATATTGCCCAATACGGGTTTAGAT CAGTGGTTGTCGCCCTCACATCCACGTGAAGCAAGCCATTGTTGCCTTAG TCGTCTACACCAGCTCTACGATGATGCCTTCAAGGAGACGATGACACAAC CCGAACTTGCTGATCACCATGTCGAAGAAGCAGCGCCACTGCACATAGTT GCTGCCCATTAGGTCTAGAGTGACGACAACATGGCGGCGGATGTCAACGG TCTGCAGAACAAAGGTGAGGAAAGTGGGTGGAGGTTGCATGGCGTCGATC CCTCGTTCATTCCCCTCTTGAGGGTGTCGTCTTGGTAGATCCACAATACG GGTTTAGTTGTGGTGGCTACTTTGGCAACAATGATGGAAGGTTAGTCTAA ATGGATCTACAACTACAGAGTCGATGTTGACGGGTACCTCCGAACAGTAA AAGTTTTGTTACCTTGGTTTGGAATGTTAGTTCCTCCTGATATTACCTAG TGGGGGTCGAGACGAGACACTCCTCTGCTTCTACGTCCGGCCTCATGTCC TGGTCACCCCGCCTGGGTTCATGGCACCTCGCCTTGCTCCACCTTCCGAG GAATCGGCATTCTCGTGCGCAGGGTCCTCTGCTTCTTATATACAGTCGCC ATGGAGCTGTGTCATGCAAGGCACGAAAAATATGATAATATAACTTCCTT TCAATGTTTTTTTTTGCAAACTACCAAAATTTATGTGTGCATGATTATAG GAAAATTATAGGAAGTTGATTGTGTTGACTTGTAATCTATGTGTAAGTAC GTTTGTATGCGTGTGCTGTACTCGATTTTCCTTGGAAGGAAAAAAACTAA CCTGATTTGTAGTGTTAATATTGAAAAGGTTTATATGCACTTAGTATGTG TATGCAAACTTTGGATAAAATACTTGTTTGTATGAGTGTAACGAAAAACC AAATAAGCAGCCATGTATGTTTTACTCCTGTCTTATTCATGGAGGTGGAG CATGTCGAGCCGCGCAAACACTGTGGAGGTGGAGTGTGTCGGCGCCAACT CCAGCAGGGCCGAAATGTTGTCCATCGGCTCCAAGGTCCATGGTGCCGTG TGGGAGGGTCAGACTTGAAATTAGTTATCGGACAGGGCCATATTTCGGTT TAAGTCGCACGGAAGGGCCAGCTCCTAGAAAAAATATCAGTTCAGGTAAC ATGCTAGTTGTAGGAACATAATAATTTCATTATGTTAGCTGATTGTTTGC ATGGTACTTTTGTTCCTTGCGGGCTGTTATTGATGCTTGACAGGATATTT GATTTACGGCAGTTGCGAGGAATAAACTAGTTTTTTTGGAAGCAACTAAT TTTATTGTCAGTCAGTGACTTTGGAACACCATACAGAATAATGGATAAAT GGCCAATAAACAAAAATAAATGGCCATGAGTATTATTTATTGAAGGTTGA ATATTATTTTTAAGTAACATTGAGTTATTGGTTCAATGGAACTCGAATAC TTACCGTTGTTGATTTTTAAGCCAGAAACTAAAGATCATATATCTGAGAT ACAGAGTATGCAAGTATCTTAGTAAGAGACTAAGAGCATTATTTCTGAAA AATGCCTCCAAGTTTTTTTTGTTGAATCTCTATTTGCTGCACAACTAGAG ATGTCCTTTCCAGGGTAAAAATCTCGGTAATTTGACTACCAAAAATTTCA GTAAGGAACTTGAGTGCTTGGTTGAATGAAAATCGGATACTTAGCATTGT CCTTTTGTCGAAACCCCAAATTTAACTTAGGACAGCACTAGGTGTCCCCG GGGGATATGGGGCAAAATCCCCCGCCTCCCCCACCATCCAATCTCACTTA AAAGCCAAATTTCGTCCATCCGATCATTGTAGCAAATTCCATCCTGCAGT AGCGAAATTTGTGTGCTACTGTAGCATTGTTGCAGCATTTTCCCCGCGGT GGGTTAAAAACATACGAAAAGCATCGTAGTATTTGAAAACACCAATGTAG CAAAAAAATATGAGTATATAGCAAATCCACAACAAATCCTCATCCGTCAC AGCAAATCCCAAGATAAAAAGTCAACACAAGCGTGCAGAAAAAAAGGATA ATGTTTGTAGCTGCCCGTGAAAACATTTGCAGCATTGAAGCAAGATTTGC AGTAGACACCCAGTATCGTCAGAGCATCTCGTTCGGGGGTTCGCAGCAAA ACTCACAAGAGTTTGGAGCACGTGAGAAATATCCATGCAGCATAAAAATC TGCGAAAAAACTAACTTCGATTTTGACCTCCGATCTCGCCGTCCGGGCTC GCCGGTGGCGAATCCGGCTCACAGGAGGCCTGTCGGTGATAGATCAGGCG AGCCCGTACCCATTCCCTTGTTCCTTGTTGTCCTTCGAGCATCTCGACGG CATAGAGGACGAGCTCCAAACCAACATCCATGGCAGGAGGTAGGAGGCGG AGGAGGGTCGGAGGTGTGCTGGGGGCAGAGGAGCATGGTGGAGGGCCAGG AGATATGGCAATGGAGGATTACGGGTCAACATCTTTGTTGATAAGAGAGA GAAAATAGGGATAAGAAGGGGGAGACGGAGCGAGAGCGACCGACCAGGAC GATGTGATTGTCCAGAGGTATTGTATCATTTTCCTTTAACTTCTCACGTT ATCAACACATTGTAGTTCTTCAAGGGCACCATGTTTTCTTTTGAAGCTTT ATTCACTGCACAACTACACATATCTTTATCTTCATTCTTATATAGTTTTG AAATGCTGACGCCGTGAGGGTGGTCTGATCACTTTCAGGCCACATCACAG TTTTATATGACGAACGAATGACATGTGAGCAGATATAGATGATTTGGTCT TTCTTAATTTATTTAAATCCGTAGCAGTGCACAGAAATTGTGCTATTATC CCTGAGTATCAGGTAAAACATCTCGGTAATGAGCACCAAATTTTTTAGTG AACTTGAACACAATAACATCTCTCTGCAGAGCTGTAAAAGCTAACAATCT GGTGTATGGCAGTTAGTACAGTTAGCCTTATAAAACCTTAAATGACTTTC GTCTCAGAATGTCATGTTCTATCATGTAATCACGTGGCTTTTCCCTTTTG AGTATATAATTTGGACCATTCTTATCTGCAGATTCAGGTTAAAAAGTATC TCCTAGAGTGGAATCAGAGATTACCGTTTAATTGTTTTTTTTCTAGGATA CAGTTTTATTCTACAACAACATCACTTCAGATTTGGTTTGTCAAAAATGA TTGCACATACTAATAACCAAATTATGCATGCAGGACCCTGGAGTTGCTGA AGCTGAATTTGCTCTATACGACCATAGGCATAAGTTTAAGGCAATCCTTG GAATGCGCAATTCAGCTCCTATTATTCTATCCAAGGGAAAAACCTTCTTT GAGTCGCTTGATTCGGATGGTACTCTCCCTGCATGGTTGTCTGAAGAAGA TATTTCCTACTACGCTGACAAATTTGACAAGACAGGGTTTACAGGAGGGC TGAACTTCTACAGATGCATGGACTTGTATGTCGTCGATGGCTCATTCTCA CTGTCTTGCTTTTACAAATATACGGCTTTATTTTTTGTTGTTAGTCAGGA AAGTTATTTTGTAGGATTTACAGGGAAGTTACTTATTTTCAATGGAAGAA TCATTTCATCTGGTGACTGATGTCTGTATGCTTTAGAGTTCACATCATAT GCTAACTGTAAACTGAAAAGAAAGGAACCTAGTGGCAGATCTGTCGAAAT TGCTCTTTTCACCAGCTTTAAGTTGATATATGTACGTCTAAACTACATAA CCGTTTGTGCCAATTTCAGTTCAGAAGTTTATTTGTGAAGGCATTGGCCA GAGCTAAACGCAGGAATTCATGAGATACCGCTTAACTTCTTTTGTGTTCA TGCAGGAACTGGGAGCTTTCTGCACCATGGACTGGAGCTCCAATAAAAGT ACCGACAAAATTCATCATTGGGGACCTCGACGCCTTATACAACGCACCAG GGGTGAAAGACTACATTCACAAGGGTGGCTTCAAGGCGAACGTGCCAAAT CTGGAGGACGTGGTTATCCTGGAGGGAGTGGGGCACTTCCTCAACCAGGA GAAGCCTGATGAGGTTTCAGAACACATTTGTGAGTTTTTTAGCAAGTTCT GATGATATAAGCACAGTCTTAGGAAGCCTACTTGCTCCGTTGGTGTTTAT ATACAGTTATATGTTAATGTTGTCGACTATAGATACCATGATACTAAGTG GTATTATCTAAATAAAATCATGCCCACCCTTCATGGGCAAGAAGAAGAGG AAGCAGAATGACAGCTCCACCTCCACCTCCACCTAAACCCTAGCCACTCC CTCGCTGGTGATCTCCCTGATCCCCGGTGAACAACCATTTCTGGCCCGAC CAGCCTCTCCGGCTCATCCTCCTCCATCCTCCACCCACCTTTTTTCCTCC CTTCTGATCTCTCTGGATCGCATGGATCCAGAATGGCACTGGAAGGCTAC ATACTCCATAGACGGCGATAGAAAACGGAGGATTTTTGATGGTTCTCTTC GACTCTGGATGGCCAAAAACTGGATGGTCCTTCACGACGCCAAGGGTAAG ACGATCATAGGCAGATTCATGGACGATGGTGAATTGGTTCACCCCGGATC TAAGGTAATTTTCACTTCTCATTCTGCCACGGTGGGGTTTTGTGTTGTAT GGCCTAGATCTGCTGATCCGTCGGATCCGGAGTCTCCTTGTTTCTTGGTT GATGATCATAGCAGTTCGACCAGTTTGGCCCAGGATGAGATTCATATGGC TGTCTATGATTCTATAGCTATGGGATTGGATTTCTCGTTTGGATTTGATT TTAGAAGAAGGATGAAATCCCTTTTTGGCTCAACAGTGCATCCCTTAGGC AACGCCGATCATTTTCTGCTAGTGGTGTCCTTTGGAAGGACAAAATTTAG ACTGAATGAAGATTCAGTGGGGCTGGCACTTGAATCATGCATTGGTGGCA ATTGTGATGATCTGACAGTGCTTAAGCTAGGTGAAAGAACTTTCAGGTTT TCCGTCAATTCAAGGGCGATTGGTTTTCAGGTCTATAATCTCAGGTCCTT TGAATGTGATAGCTTCAAATGTTATTTTCATCTCTTCTCAAATGGAGCCC CCCTTTGGCAGAAAGAGTTTGACCGCTGGCAGAAGCAATGTTCAGATGAA TGGATCCTTATTAGTCCAAACAAAAGAAGAATTTTTTGAGCTATGAAAGC CTTGGAGAAGAAGCCTTCTCGTCCTGTTCTCAAAAAAGGTTTCAGTTCAG CTAGGAAGAATCTATCCTTTGCAACTCCTTTAAAATATCCAGCCCAGAAA GATTATGCTTTGCCTATCTCTAAAGATGCTGCATCTGATCATCTAGTAGC TGTACATGACTGTCCTCGGATTAAAAAGAATGCAGGTGAGCAATCGTCTG TTCATGTGGCGGGTGATGTTGGAGTTCAGGAAATTTCAGTCTCCGAGGCT TCTTCTTCTGGCTTGACTGTTTCTGAAAAGAACAGTCAATCATGGTTGGA ACTATTTCTCTGTCTGCTGGGGTTAACCCGGTTCAGTTGGTCTCTTTGCC TCTGGGGAATTCAGTTGCTACTGGTTCAGGTTCTGAGGTAAATTCTGCGA CTAAGCAAATTCTGCGACATTGCTTTCAGATTTTGGGATTGCAGGAGATG TTCGGCTATGGGACATAAAGTTCAAGCTTGCACTAATAATATTCGCTGTC GGAATTGTTTTAATTATGGTCATATTGCCAAGTCGTGCTTCAACGGATAT TCTAAGAGGTTAAAAAAGTGGGTTCCAAAAAGGGCGAGTTCGGGTATTTC GCCCGTGCAGTACCAGGACTCCACGGTCTCTCCAACTTCGACACCAAAGG AGCCGCCGCCCCTGTCAGTAATACAGAGTTCCACGCCTGCAAACCCCAAC TCATTTCCTGTAGGTTCGGCTGCTCCATCTCCTCAGCCGCCTCCAGTGCA AGCTCGCCCACCGGAATCTGATCCCATGACAGTCTTTGAGGTCGATCCTA TGCCTTGGCTACCATGGGGACATCACATCATTGATGGTGGTGACACCAGG CTGCCACGCACATACTACTCTCAAAATTCGCCGCCCCAGCACCAATCGTT CTGCATCGGCATTGTGGAGCCTGCACCGCCTCAGCTAGATGAAGTGCTCT GGAGAAATCAGGTAGAAGAATTTTTGGCTGGTCCTCTGAATCGCAATGTC ATTGTTACTCAGCCTAGCTTGTTTGGAGTTGGTCTGTTCCACCTTAGTGG CCCCAATGCTGTTAATGCCCTTGTGCAACATGGACACTATCAGCTGCACA ATAGATTTGTTAGATTTGTCCATGCGGATAATGCTGATGATAATCATAGA TCTCTGCAAGGATTCCGTAAGGGCTGGTTGATGTTTTTGGGAATTCCGCC TGATTATAGGAACGACCTGGATATAGCTAATGCAGTGTCTACTTTTGGTC AATACCACTACTGGAACAACAAGGACCCAATCATGGATAGGGTGTTGGTA TTTGCATCGTTTCCATCTCCGCAGCTAGTGCCTCGTGATGTGGTTTTTGG AAAGTTTGTTACTATTGGTGGAGCCTGTGAATCTTGGACGGCACCAGTTT ACATATTAACTGCTGACTTTGCCGATGCTCTACCTGCTGATGAGGACCTG ATGCCTCCGCATCCTCTGCCAGGGCAACTTCAGCATGATCTCAATATGTC CGCCGTCCCACAGTACCCAGAGATTGGATGGAATGCAATCCCACAGGCAA ACATCCAGGAAGCGGATCACCCTCATAATGAGAATGCCAACATTAATGAG GCAGTTGTGGAGGAGGTTCAGGAATCCATGATGCTGAACCCATCTGATAA TTCTGGTTCCTCTGCTAATATGCATGTCAATGATCCAAAACTTTTGGTGT CCGGGTTTAAACCTAAACCATGGTATGATCCAAAACTTTTGATGTTGAAA CAGCAAGTAAATGCTGCAGTTCATGTGGATGTGCTGCAAGTTGGCCATGT GTTTGGTCCAGTACTCCCCCCAGATATGCAATGGACAAGGATCTTTCAGA AGATCTTGCCGGTGTTTGGCAGCAAAGTGGTTCCTCTTTCTCTGCAGGTC CCGCCTTTCTCTTTTCTTAAGCGTTGATGGGCTGATGCGTTTGACTTGGA TGTTACTGTTCCATCATATATGTCTGCGTTTCAGTCTGACGTTGGTGAAA GGATTGTTGTTCCTGCTCATCGACGATCGGTTGCTCGGGCTCTGTCTTTT GATGAAGCTGCAACACCTTTGTCTCCTCCAGTTTTTGCTGCATCTCCCCT GTCAGTAAAGCAGAAGAAGTCTCGTAAAAAAGTTTCAGTCGTTATGCCGG AGGAGAGGCGTTTCACTTGCAGTAGTCTGAAGTCAGATGGACATAGGCCC AAGCCAATATTGTCTGCTCCTGTCAGGCCAAAGAAGAAAGCTAGAGCCAA ACTGCTGGTGGTGGTTCACTCTGGAAATTCTGAAGAACCTGAGAACTCAC ATGACGATGATGCTGCGCAGGAGGAGCAGTCTGCCTTTCCTGCTACTCCG ATTCTGTTGATGCAACGGGTGGGAAGAGAGCTGGGTATTGACCCTGCTAA ACTGACGAAGGAACGGCTTGAAGCTGAAACTGAGATTGCTGCTGCTAGAG AAGGTGTCAATGGTAAAGTTTAAAGAGGAAATCAGGGTGATAGGGCCACA CCGTTCAACTGGCTCTGCTACTGTTCATCTATCTGCAGTCTTTGTTAGAG TCGCTTCTTCAGTTTATGCTGCTGTCTCACGGTCAGCTTCTGTCAGTGCT AAAACTATCAGTCGTCTCGTTGTGCTTTTGTTTGGGGTTATGCTTCAAGC AGTCTCGTACTTTGTCAGTGTGTTCATTATGTTAGAATAGTACTAGCACA TGTGCCCGTGCATTACGACGGGAGAGAAAAGTCGACACCGCGAAGTAGCG AAAGGTATTTTTTTCAAACCGAAAAAACCTGCTAAAAAGGCTCAGAGGCA AGTCATGGAGTTTTTAGACGAGCCTTTGTGCTGATTGTACCCGTACTTTA TGAGTTAATAAAGCTGGCAGGCATTGTTCGTTCCTCTTCTTCTTGCAAAG TGAACACCGGCTAAACTTTCGATAAACAATCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.