Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE002686

[Submit comment/correction]

Sequence	AE002686
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE002686
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCGCAAATGACCATCTCGTCGGCTGAAATAGCAGCAGTAGCCGCAGC GGCACTGCTCATAGTAGTGGTGCCGTTGTTGCCCGCTGGAGGATCAGCAG CAGGCGACCCGGTGATGCCGATCGGGATGCCCAACTGCCCGACGTCGTGC GGCGGCGTGGAGGTGCCGTACCCGTTCGGCATTGGCCCGGACGCCCGCTG CTACCTGCCGGGGTTCAACCTCACCTGCGACAACGCAGGCCGCCCCGGCG ATGCACGGCAGCTGCTTGACGCCGCCGGCACGCTTCAAGTTCTCAAAATC CCTGACGTGCAGTCCCCCACTCTGTACGCTCAACACGGCGGTGACATAAA AATCGACTTCGAAGACAATGGCAACGGCAACGGCAACGGCACGTTCATCA GTAACTTCCTTAGGCGCGATGGGCCGTACACGCTCGACAGCGGCAACGAG CTCATTCTGACGGGCTGCAACCTGCAGGCCACGGTGAAAGATGGCAATAT CACCGTGGCCAGCTGCACCTCGCTCTGCCGATTCAGGGGCAGCTACGACT ACGAGGACGACAACGACAACGACAACGCGATGATGACCTCAACGTACTTT GAAATGGGCCCTGATATGAGCCGCATGGCCGTGCCATGCTCCGGCGGCAG CAGAGGCTGCTGCCGCGCGGACATCGTTGCGCCGGACGACTATGACAGCC AAGTACACTCGTCCGGCCACTACGACGTGCAGCTCACGTGGTTCGGTTGG AACCGCAGCACCGACCTAGAGGTGCTTCCCGTGCGCTTGTTTTTCGCTGC TAATGGTTGGTTCGATAACAGCTCCGTGTATACCGATCTTCTACAAACAC GTCGGGCTCCGTCAAAAGATACCATGGCAGTACCCATTTTGTTGGCGTGG GAGGCAGTTGGCCATCCCAGCAGCAGCAGCGTCTGCAAGAGTAACCACAG CAAACGCTCGGACGGTACAAGAAGAGGAGCCTATACGTGCACCTGCAAAG ACGGTTACGAGGGAAATCCCTACCTCATCGACGGGTGCAAAGGTACATAA TACTCGCTCTAATCCATAATAAATACTAAAAAAAAATACTCGCTCTAATC CATAATAAGTGTCATTGATTTAGTAGTCTGATCCATAATAAGTGGTGTTG TTTTAGTAGTATGATTCATAATAAGTGTCGTTGATTTAGTAGTTATAGAT CAGAGTGCAAGGATCACTATTCCATTGTTGTTGACTTGTAAATAAACAGT TATTACCCCATTAGCATTCACTCCAATTGACATTTCACATCACTTTATAC TTGTATCATGCCGATTGCTTAGTATCTTCCTTCAGATTAGGTCTTTTGAT TGCATTGCATGCAGTTCTACAAGGTATCAAAGCAAAAGGTCTCAAGTTCA TGCCCCGGCTAACACAATATAAAATAAAAATATTACGGCCCATTTTCAGT CCATGTTTAGGCCAAAAGGAGCCACACGTTAGGGAAAGTGTTCAAGTATG AATGTATTGCCTAGTATTTCCCATCGGATTATTTTTTTTGTTTGCATTGG CTAGAGCAATGTAGTTCAACACATCGTATATATGTTAATGTTTAGATTGG ATAATATGGTCCCTAGCGTTGACTAGAAAATAATTATTTTTAGTCGTTTT AAAAGTAGCAGTCCCATTATATATACATGTGGTAGCTCGTTTAGATTTTT TAAGGGGAAAGAGATTAATTTGAACTAAAATGACGACAAGTATTTTATAC GAGAAAAGCGTAGCTAATTTTATTTACTTTTACTTTCAAATCGATAAGTT AATCATTGCGTATATGTAAATGTAGATATCAACGAATGCAACTTTGGACA AACAAGCACTGGGTGCTACGGTGAATGTATCAACACGGAAGGATCGTACA TGTGCCGGTGCCCACTGGGAACCACGGGCAACCACTCCATACCTGGTGGG TGCGTCAGCACAACTTTCGTTGCGCCAGGTATATCACTAAGAAACTACTG CATTTTTGGGCAATTCCAGATTGATAACCTCTCTGCATTTTTTTTTTGAC AAACCATACTATGATATATTACACTCCCTCCCCTTTGGGATGTAATAAAG CAAGGAATTTTTTTTTTCAAAGTCAAACAATGTAAAGTTTGGCCATGTTT TAGAAAAGGCCATTAACATATCTAACCAAATCAGTATCGTTAGATACACC ATGCAATTTTTTTCATATTATAGGCATACAATATTATATCTATTGATACA CTTTTGTAAAAACTTTGTCAACCTTCACACTATTATAATTGAAAAGACTT GTGTGCCTTATTTTTAAGAACAGGGTGAATAATACTATTGAATATTACAT GATAGAGATACAAGAGTTGTCTATATCGAATACAAAACAATCTAACAGAA ACGCATCTAGATCGTCAAACTCTTTCTTCTTCAAAGTCACATTATTGTAG TTTTTGAAGGCAACCACATGAAAATGACACATAGACCAGACAATAGACTT GTGAATATCAATGAGAGTTTCTCTATAATTTTTTTTTTGAGCCAAAATGC AAAGGTTATGTGCTTGATTAACCAACATCGACAAAAGTACCGACCCATCA TTCCAGGGAAAAGCAAATGAACAACCTTGTTGACGTTGCGCAGGGGAGTC AGACAGGGAAGAGTCAAGGAATTCATCCTCGTAACCGCCTAGTCCGTAAA AGGAAGGGGGAGGGTAGAATACATACCACCATAGTCGAAAACGCAGCTGT CGAGACAACTATTGTGAGTACAAACCTCCTCGTGATAACCATATTGTTGA TGATATCGTCTCCTTTGACATGGTGGCCAAAAGGAAGGCGCCTACCAAAT CCCTAAACTAATCTATTGAAAAAGACTACTTTTAATTTAAAAAATCACGC ATTGATCTGGTTCCTTGCACCTACAAACACATAGAGTAAGGGGGAACCGG TCAATGGAGAAGGAGGAATTGCGATTGGTTTCTTTGTGGAGACGGCGATT GGGTCAGGCGACTCGAGCTTTAGCGCATTCCCTTTCTCCACCTGAATCTC ATTAAAATGTAGAATTATAGGGTGCGACTGAATACAATGGCAAGTAATCA CGCCATGCACTAGTTAGGGTTGGTACTTTTTATTTAGTTAGTTTTTCAAT TCACTCAAATTCTTTCTTTTTCTTTAAATAATTAGTCTCGGGTCTCCGGA TGCTTGTTTTGGAGCTCGGATATTGGGACCAACCCTAATAGTATTAATAT TTTGGTGTTGGAATACTAGTGCAAATTCACTTACGAGTCAAATCTAAATT TTCATGTGACCCATATTACAATTGCCATTGGCGGACGACAAACAATGTCA CAACCAATGACCTAACATAAAATAGCCATGAAATCTGACATGCAGGTTTG CCTAATCAACCTAGTGATGACCATGGGCAGATCTAGCATCCCTCCGGTAC GAGCAGTTGGTCGGGCTCTACCACAGCACAACACTTAACTCATGTGGAAT TTTATGGCGACATACACAAGGAAATGGTATTTTACACAACTAGCATGGCC GCTCTCGCAAATGCAGTGACATTGTTTTAAGGGTATGTACAATACGGTAG CGTCAGCCTTCTCTTATAGTTGCCACTTCAGATTTTCACTTAGTTGGAAG AGAGAGAATTAAGAAAAAGAATGTTGCCTTCCCTTAGAGCATGACTAATA GCACCCTCAAATCGGCAACCCTTAAATCGCAAGTACAAGTGCCCGTACTC GGGATTTAGGGTTTCAAACTCGTAAACGGAGAACAGTGCCTATAAATCCA ACCCTTAAATTGCGATTTGAACTGAAATTTAAATTAACAAGGGAAGATCG TGCGCGCATTCATCATCCAGTACATGGATATTGCAAACTTATATCTAAAA AATAGTGTTGGAAGAGCTCGCGGAGGACGTCGTCGTGTCCTGGTATGTCC AAAATGCCGCTCCTAGTCGGCGGCGAGGTCTAAGTCACCACCTGCCGTCA TCGGCGAGCTCCTAGTCATCGAGGACGATCACGTCGGTCTAGGGGGGCAG AGAAGCTGGGGGGTTAGCCCCCAGTTCGTCCAGCGCCAGCAGGCGCGCTT CTTGGCCCCAACGGAGCGGATGCGGCGCCGCTCTTCGTCGTTGCCGCCGG ATGCGCGACGGACACTCCCTCCTCCTCCTCCCCCCAGCACGGCCACCGCC GAGTCCGCAACTCCCGCTCCTGCTCGCCATCTCTCTCTCGCGCGGAAATG GGAGGAATTGCTCGCCAGAGTACGCGCGAAAATGCAGCGTCGACTAGGGT TTGCGGCGGAAGGACACGGGTTCTGACCCGTCTCCGCCCGCCCGGCCGGT AGATAGAGGGGCTGCAACGGGCCTTTCACAGGCCCCTGTGAATTCTGTTT ACGGGCCGAGCCGTTTACAGGCGCTAGGCGCTGTTAGCTCGATGGCCCGG CCACGAGCCCGTGTAACCGCCGGAATTTTAAGAGCGCCGACGTTTTAAGG GTGTTGTTAGACTTGCTCTTAACTAAGAGATGATCCCTTAAAAATAAGAG AAGACAATTTTCTCCATTGTACCTTGTGCCTTCTCTTATCAACATAATTT CTTACTATAATTAGCAAATTCACAATTATTCTTAGAGATAACAATAAGAG ATGATCCATTGTCAGGCGCAAGTGAACCCATTATGAAAAATATATAAAAA ATAAAATTTAAATTGTCAAGAAAATCTAAACGAAAATTTTGCCTATACAT CCAGACATTTTATGTCCGTACACCAGTTTTCAGCAAAAATAAACATTTTA TGTGGTTTCTTAAAAAAGACAAAAAAACATGTTCATGAATAGACAGTTGG AAAACTGAAATTTATCTTTTTTATATGGGACACCTAAAATGTTCTTTTCC CATGAAAAGTTGTGTACGGACTCCGGATGTACATGCAAATTTTTTTTTTG AAATTTTTAATATTTTAAATTGTGGGTTCATTTGCACCCATGAGCCGAAT TGGATTTCCGATGATCCATTGTACAACTTATTTGTATTGCCTTCTCTAGA TTATGTGGAGGGATAAAAGAAGACACGCCTTCACATATTTGTAATGGCTG AGAAATCTCCCACTCCTCCGTAACGAACTCATTCACATGTGTTCCTCGTG TCATGTAACATAACTACACCAACATGGATGACAATAATTTGCCACTTATA TTGTTTGAATTCAATATACAACCTGTTACATTTTGATGCATTACACACCA TTGAAACGGAAGGAAACGAGTACCCCCTCCGTCTCGAAATAGACGTCAGA GATTTTGTGTAGTTCGCATATACCTAGATACCGAAATAGACGTCAAAGAT TTTGTGTAGTTCGCATATACCTAGATACCTAGACGAGGTACATGCGAATC TTGACAAATCTCCAACATCTATTTCGAGATGGAGGGAGTAAGAAATTTAT AGTTCAAATTTGGATGAACCTATATACTAAATAATGAAATAATGTTCAGA TTCATCCAAATTTTAACAAATCTAAGACATCTATTTTGAGATGGAGGGAG TATAAAATATGACTCATAATAACTTAACTAATTTACGAAGAGAGCCATAG AGATTACTATCAACATTATCAATTATTATCAACTAAACACTTTGCTTATT TCTAGGTCAGTATATTGGAAATAGCTTGCGAGGTTCCATAGTGTAAGCAT TTCTAGTTAAACTGCTAAAAAAAGCTTATATAATGTAAGCATTTCTAGTT AAACTGCTAAAAAACTTATATTTTGAAACAAAGGGAGTAACTCGAAAGAT ATTACATGTTTGCTACCTCCAACAGAACCAAAAACTTCAGCAATTCACAC GAACATATAAGCAGCCTCAACCTAGTTTCATGAAATGCAGATGAGCTCAC ATATCAGGGTCGCCGGCATATAACATTGCAGGCGAGCTCACAGATCGTGA CACGTGCCGTTGTAAGCCGATGATCCGGCCAGGTATAGATGGCGACCCCG TTAGATGGCCGGTCTGTCTTTTTTTTTCTGCCAACGGCTAGACTGTGCTG ACGCACACCCAAAACCGTTGGCATAGCTACATATGCCAACGGCCATACCT ATGCTGACAGCCAAAAACCTATGCCAATGGACCATTTGCCTAGCAGACGG CTATCGTTGGCTTACCCTATGCCGACAGATTTTTGCCTTCTGTCAACGGC TTCGGCGTATCCCCTCTTTTCTGTAGTGCTTATTTTTCACTTACATAGCA CGATCAAGCTGTTTTTGTTTTCCTGAGGGAACAACCTGACAAAAGTTTAT AAATCGATTTACAAATGGCCATTCTTTTACAACATATGATGTCGCCACCA CACTTATTCTTTTACAACATATGATGTCGCCACCACACTTATTCTTTTAC AACATATGATGTCGCCACCACACTTTTTTGGTCATCGTTTGTGCTTGAAA CAGGTAGATGCATGGCGTGCGGGAATATGGAGGTGCCGTACCCGTTCGGC ATTATTGGCTCAGACGCAAGCTGCTACCTACCGGGGTTCGGCCTCGTGTG TGACACTATCCATGATCCTCCGCAGTTGTTCCTGAGCAACAGCCGCTTCA GGGTCGTTAATATCTTCCTACCCAACAACACAGTGCGCGTCATCGGAACC GACGACTTTATCCATGTATCGCCAGCTGATGGGATCACGACATTCAGCAC AGGATCGCCTTTTTCCCCCGACGGAGAGCAGGCCCAATACTCGTTGTCTG ACGGCAACGAGCTCATCTTGACGGGGTGCAATGCACAGGCAACGCTGCTG GGGCAAGGTAACCCGGCCATCATCAGTGGGTGTGCCTCCTTCTGCTCCGA CAATGACACCGGTGTCTTGGGCAAGAGGTGGCCAACAAACGGCATCCATG GTGGAAGTGGAATCGGTGGCGGCAAGTACTGCTATGGCATTGGATGCTGC CAGGCTCGCATCTACGAGTCCATGAACGGAATGCCCAGTCATCTGAGCTT CAAGTGGTTCGACACTAACAGAACCGGGAATTTCTCACGGTTGCCCACTT ACGTGTTCATCGCAGAGGATGGATGGTTTGACCATTCAGGTGCAGCCCAC AAATTGATGCGAGAGAGTCAGAACCAGACGTCGGCAAAAGACCAGCTGGA GGTTCCTCTTCTTCTCCTGTGGGAAGTCTTGCGCTTGCATAATGATGATT CATCAGCCTCGCATCCAGACTGCAATAGGCAGGAAGCCCGCGACCTATGC CAGAGCAAGCACAGCCAGTGCGTACCTGGGAACAGAGGATATACGTGCCA GTGCCACGACGGCTACCACGGCAACCCATACCTCCAAGACGGATGCAAAG GTACGTCCCATCCAATTCCATCGATTACAAAATGTACTACAACTACTATT AATTTACATGCATGCAAAATGGAATTTACTGAATTTCACCTTTTGATTTC TTGTCTCCAGGTGGGCACGCCAAATTCGTCAAAGGTGAGCAAAAAATGCT GCAACTTTTATTTTTCCTACCTACGCTAATTCGGCAGCCTGGTATTCTTT TACTCAACTTAGATCGCTTCTTCTCATATGCTGCCAATATTATTTCATTA AAATCATTAATTTATTAGGCCTCATTCGTTTGCTAGGGATTGAATCCCGA TCTGGATTTGAACCAGCATTGGATTTGGTGACACCCCATGCTACACCCAA TCCAAACCTAGATAATTTCCACGCATGGATTGATTTTCTATTTTTTTCAA GACCGTTCGTTTATGCACGTTCATAGCTGCTGAGTTCGCTCGATGCGTAG TCTGGGAAACAATCCATGGATCAAGTGGAGATGTTTTTTTTCCAGCTCAA TTCATAAGAAAATGGCTTGGATGGCTTGGGCTGAAATCCATGGCCTGGAT GGTTGGGGTTAAACGAAGAGCTTAATTTTATGGCCTGGAAAATTTACATA GCTGGGTTGGAAAAGGCTGGATCGGGCCACAATCCACAGCAATCCAAGCC ACCAAGGGATTAAACGAACGGGGCCTTAGTGAAGTGTAGATCGAGGGTAC TAATAGGCATATGTACCAGCCCTCTGAGAGATAGATAGCTTTTTAAAAAA ATGTGTGCTCCTACCTTTGACTGTTAGTACGAGAAACATTCATGTTGATC CATGACAAAACAAAACTTTGTTATCAGATTTGTAATAAAAAATATATTTT CTAACAGGTATCTATTACTTACTACCCTCATTAGTAACACTATGATTTCT TAGTGATAAAACATGCAATAAAAAGTTCAAACTTTGAATGCTAATGCATT AAAAATATTTGGAATTGCAATATAAATTTGTATTATTGGGAGTTTTTCAT CAGAAATTTTATGTTAATAGTACAAAATTCACAACTTGCTACTAACATAT AATTACAAAAGGTAGCTGTCAAATATAAGTATTGGAGACAATAAGGGAAT GTGAAAATCTATGTAGGGAGTAATCTAAGTATATGAAGGTAAAAAAGAAA AATGGAAAATATAGTCATCAATTTTAGTAAAACAAAATATCAAGCCATTA ATTTCAGAGACCAAACAACAAACAATTGTAACAATCAGTAGTCTTTCAGA TTCTGGTATTGCCAGATACCTATAACTTCCGATATCAACCTGACTTCAAA CGCACAACACTATGAAAGCACTTTTCTATACATATTTAGGTTTGGTTTAT AGTTTTACACACATAGAAGAGAAAATGAATTACAATGTGTATTTTTTTCA GGCATAAGCATGATTATTGGAGTTGCTAGTGGGGCAGGCCTTATATTTTT GGTCCTCATTGCATACTATGGTTCCTACAAATTTAAGCACCGGAGGGCAC AAATATTAAAACGAAAGTACTTCGAGCAAAACCGCGGGCAATTGTTGCAA CAATTGGTATCTCAAAGAGCTGATATTGTAGAGAAAATGATCATAACCTT GGAAGAGCTAGAGAAAGCAACAAAAAAATTTGATAAAGCTCGTGAAATTG GTGGTGGTGGGCATGGTACGGTATATAAAGGGATTTTGTCCGACCTCCAT GTTGTAGCTATCAAGAAACCAAAGATGGTGGTGCAACGGGAGGCTGATGA GTTTATTAATGAGGCTGCGATCCTATCACAAATCAACCATAGGAATGTAG TAAAGTTATATGGTTGCTGCCTCGAAACTGAAGTCCCAATGTTGGTCTAT GAGTTCATATCCAATGGAACCCTTTATGATCATCTTCATGTCGAAGGACC AATTTCATTGTCATGGGATGACAGACTAAGGATAGCAACAGAAACAGCAA AATCTCTAGCATATCTTCACTCCACAACTTCAACACCTATCATCCATAGA GATATCAAGCCTGCAAATATACTTTTGGATGATACTCTAACAGCAAAGGT AGCGGACTTTGGAGCATCAAAATACATTCCATTGGAAAAATCGGGGTTAA CAACAATGGTGCAAGGTACACTAGGATATCTGGACCCTATGTACTATTAC ACATGGCACCTCACTGAGAAAAGTGATGTCTATAGCTTCGGTGTTATGCT TATAGAAATGATGACTAGAAAGAAGTCATTTCCCTATATGGCTTGTGAAG GCAATGGCCTTGTGGCACATTTTTCTACCTTATTTGCAGAAGGCAATGTG ATGCAGATATTAGATCCACAAGTTCTGAGTGAGGGTGGAAACAGAGTTGA AGAGATCGCTGGAATTGCGGTAGCATGTGTAAAATTAAGAGGGGAGGAAC GGCCAACCATGAGACAAGTGGAGTTGAGACTAGAAGCAGCTCAATCACCC GAGGAATTTGATCAGAATGGTGATGTTGCCATAAATTATCCATTAGAATG CACATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.