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GrainGenes Sequence Report: AE016268

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Sequence
AE016268
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE016268
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCAATCGCCGCAAACGGAGGCGTCCCCGTCCATCACAGCTCTCTCTCCCC
CCTCCAAAACCTCTCGCGCCCGCGCGAGAATTCGGGCGCGCGGTGGTCTG
GGCCGCCGGATCTAGGGTTTCCTCACGATGCTCTCGCTGCGTGGCGACGC
GCGCCACCTGGCGGCGCCGGTGGTTCGCGGCCGGGATGACGTCTGGCTCG
GGATCAGCGGCGGGGCGGGGGCGGCTCCTGACGGGCCAGCGCCAGCGGCT
GCGTTCCTGCTGCCCCCGGTGTCCCTGGACGCGAGGACCAATCAACTCGT
CGCGGGTGAGTACCTCCGCTGACCCCTCTCGCTGTTCAACTTTTTTGGCG
CGCGTGGTGTTGTACCGCGGCTATGTTAGTGGAGATTCTTCTGGGCACGG
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TCCTTCTTCTGTTACTGTGGGAAGATCTGAGCTCATTTTTGCCTGTGGAG
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GCCTAAGCGTCGCCTAGGCGTCCTAAAGCGGACGCCTTAAAAACCATGAA
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CTTGCCAGGTAGGTATTCTAGATACAATATTTTGTTGCTGTTGCGTTTGC
TATTTAAATGAATATGCACCTTGAAATTGACCTTTTGATATAAATTGTAC
ACCCTCCCAACTATGATTGATACGGTCAGCATGTGGTCTGTACCTCCTAA
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TGGTTCTTCAAATGATTTAGCTGATGAAGAAGGGCACTTGGCTCTTGCAC
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GGCTATTTATTTCCAGGTTATTACTATTGTGATGCTTTTGCATGTTCCTT
GCTCTAAGTCCATCACTCAAAGTTTTGTTTTCTCTGTAGCTTCGTAATTA
TGATCTGTGTATTGCAAAGAATGAAGAGGCCCTGGCTATTGATCCACAAT
TTGCGGAGTGCTATGGCAACATGGCAAATGCTTGGAAGGTAAGTTGAACA
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TTTGTGGAGCAGCGCTTTCATTTTTATCATCATATCATGCAGGAGAAAGG
CGACGTAGATCTTGCAATTCGTTACTATTTAACGGCCATTCAGGTGTGTT
TGTTAATATTTCCCAGCTTTAACTTCTTTTCGCTACCTTCCAGTCTTTTG
CCCTTCAAGAACACTGCCTATTATTTAAATAAATAACCAGAGCTCCTGTT
ATATTGTTCTTTTGGGTCTGATTGCAACATTTTTACAGAGTTTTTGAGTG
GAGTCAAGGATTTAACAAATATACATGATGTTTCATCTAAAAAACGAATT
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AGACACTTCTTGGAACCAAACCAACTAACGAAGAATTTATCAAACAATCA
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TTGGCAAAAGTTGACAAGGTCCATCGCAGCGCGATGAGATGCTTGAAGGC
ATGCACAACACACTTGGTTTGTCAGATGTCAGCAAGGAGATAATGTTCTA
GTGGGAGTGCAAGTAGCAGAGTGGGCTAGGAATTGTGTTTAACCTCCTTT
TGTTTCAATTTATGCTTTGACTGAATCTCATGTGCGAACATAATTGTGTT
TTGTTTTCACTTGTTTGCACATATTTCCTGTCATGCGGGGCCTGGTTTAT
GGCCGCCACAAGAAGGAAGAAGTGGCTTGATCCTGAGTCAGGCTTGGTCC
TTATGTTAGGATCTATATTAGGATTTTAGTTCTCTTATAAGTTTGTTAGT
GCTTACGTTATCCTTCAGATTCGGTCCAAGCTTTCCTTTCCTCAAAACCC
TCTTTATAACAGAGGCCACGTTTGAACCATGAGTTATCAAAGAAATAAAT
CCCAAAGGAGATTAAGCTCCCAACTAAGCACGTGAAATTTCCATTAAGCT
AAGATGATTTATTTGTTTCATGGATGCCAGTGTCCATCACTATTATTCTT
ATGCTAAATATCAATCTCTATCATTTGAGTACATGCCATCTTTACATGGT
TCCATTTATTTGATTAAATCTAAAAGCAATTTGTTAGGACAATTTTGTGT
AGTAAGGGGTTCAGGGTGTACTTGAGGTGCAATTAGCACCTCTGATAGTC
ATGGAAATTTCTGGGAAAAGTTTGGCAGTATTGACACAAGATGCATCTAC
CTCGCCACAAAATTTCAAATCCAAAATTGATCCGCACACTGAGAAACAAA
GGAAATTCTCCTGCTGTGAATAGAGTGCACTAGTGTTATTCACGTCAGGA
TTTTCTTTTCTGTTTCTTGGTGTGTGGATTGGATTTGGATTTGAATTTTT
GTGGTGAGCTAGGCGCATGTTGTGTCGATATTGCCAAAAAGTTTCAGATT
CTTTCATGTTTGTCAGTGGTGCTAAACTGCTAATTGCCCTCCAGTACATT
AGTACGCCTCATGTGGCTAGTGCACACAGTATGCCCCTCTTTGCTCTTCA
GTCAAATAAAAATTTATACCTTCGGCAGTTTCTAAGATGGATTATCAGTT
GCAAGGCTGTAAAAGAGATAAAGTGGTCTGATTGGGAACTTTTTTCTGTA
GCTACGTCCAAATTTTGCTGATGCATGGTCAAACCTTGCAAGTGCATATA
CACGCAAAGGGAGAATGAATGAGGCAGCACAATGCTGTAAACAAGCGCTT
GCCCTGAACCCACGTTTGGTATGTGTATTCATATGTTACCAGTAATTCTT
ATTCACTTTGTGAGCTGACATTTTGTTTTATCTTTGATTTAGGTTGATGC
TCATAGTAATCTAGGGAATCTAATGAAAGCCCAGGGGCTTGTGCAAGAGG
TAAGCAAGTTGTGTTCTAGGCTTAGGCAACAGGTGGAACTGTTGGATGAT
CATTACAATTTCATGTGATTCCGTCTTCAGGCATACGCTTGCTACCTTGA
AGCAATACGAATAGATCCACACTTTGCAATTGCATGGTCCAATCTTGCTG
GCCTGTTTATGGAAGTTGGGGACCTCAATAAGGCTATGCAGTATTACAAG
GTAAATATCACAAATGGTGCGAGATTTTGGTGTAAAGGAGAAATATCTAC
TAGTTTCTGTAGAATGCTTCAACCTGAATTGTATAGACTTTTGACCTGTA
TGTGAACAATAGAAATTTATGTTACTGAGTGTTACTGGATCTAAATGTTC
TATGAGTTGCTATGCACAACTAGTTCATCACTATAGACATGAAAAGTTAT
GTAGATCATTACTTCATTAATCAAGGAGTGGGAAGAGGAGTATATCATCT
ACTAACATTTGATCTATGTCGGTGGTTGAACAACCGAGTTTGTCGTTGAT
ACGTTGTTGGCAACATAATGGTTGTACCTGGATTTTAAAATTTGTGAAAA
AGAATCTGTAGGTTTGTACTCACACTAGTTCTGGTTCAACTGCTTGTCGT
TCCTTTACAGCAAGCTCATATATAGGCTTGAAGTTCCCAAGTGCCACTGA
GATGCGTAGTACCTCGTGGAAGAAAAAAAATCACTGAGAAAGTGAATTTA
AAGAGATCATGGTTATTATACTCTTCTTGGTCTTAAACTTATTTTCTGGG
CATGATTATGGTTTCAACTGTAAAACTTTAGACCCTTAGGTCCTTTCTTG
ATACTCTCTCTGTATAATTCTTCAAGATGCCCTCCATATGGGCACTGATG
TTGCAAACAGGAGATGGTCATTTTAAAAGTTGCTGCTAATCTGATATTGT
AACATTTATGTAAGAATAAAAATAAAAATTGTTTTGAAGATGTATGACCC
CATCGATTGGAATTATAATTCCTATTCGTGCTAAAAGTCAAATGAAAATT
GCTTTTAGGTTTGCCTATTAATACATACATTAAATTGCTATATTAGGTTC
ATTAAAAAATATACTTTCGTGGTGTATGTATTTTATCATTTGTAATACTC
CTTCCGTTCACAAATGTAAGACCTTTTAGATATTTCAAAATGGACTAGAT
GCACTCTAAAATGAGTGAACCTACACACTAAAACACGTCTACATACATGT
GTTTTAGAAAAAGGCTAGAATGTCTTACATTAGTGAACGGAGGTAGTAAC
ACATTGAGCTATCTTATAGAAAATCGAGGTATTAATTAGTAGTCACTTAC
TGCCGTGGAAACTGAAAATACCGAAAAGTGTAGTATTTGTTCGAGATGAG
TTACTGTGCAGGGTCAGGCCCAACCCTGCATGTTCTTTTTTCTCCTCTTT
ATTTCATTTTCTCCTTCATACTGTAAAGTCCTATTTTGAGTCCACATGCC
CCTCCCATCATCCCCTTTTCTCGCTTCCTACACCCATACTGAAGTTACCG
TGCTTCCCTCTTGCACATCTGTAACCGCACAGCGCTGCAACCATCCTGAG
CACCACCCTCTGGTCATCCTTCACTACATAGGTTCTGCTCCTCCAATATT
TGGGTGCAAGTAGAGTCATAGGGGAAGTGACTGGTTGGCACTAAGTAAGC
AGATCAGTGGTGGCAGTCTGCATTGTGTAGATTTGACTTTGATATAAAAA
TGTAGCTTGTGTTAGTGTTCCCTCTCTGTTCTCTCTTCTCTCTGTTCTCT
CCTTCGAGTAAAGGCAGAAAATGAGGGACTAGCACTACAGAGGAGAACAC
ACAGAAGTTTCAGGCAACATATGCCTTCTTCTATTAGCTTTTGCAGCAAC
GGATGCTACACTAGTCAGCAACAAATGCCTACAGAACTTAGCAACACATG
CTTGCACACATATGTATGACACACATACATATGTGCTTCAACCTGACACA
CAGGCTATCTTCTACATCTTGGCTTGCAACTTATGCTAGCCCACAACAAC
CTATGCTAGGACCTATTTATTCTTGTACATGACCCTTTAGATTGCATGTG
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AGTTCTCCCTACGTACCCTGGATACTTCATGACCTAGCTAGCTCCTTTTA
CTAGCCAACTATATTGACAAGATTACTTCTAACAGCAAACACACAACCTA
TATGTGCTCTACAGCCTGCACACATACAACCTATGTGTGCAGATCACACC
ATGACAAGATTACATTCAGGCTAACAGCTTGTTGGCGGCAACAGCTAATA
TTCTTCGAGTGTCACCTCTAAGCACTTCGGCTGCTGTTGTATCGTAGATG
TAATATTGATTCCTTTGTACATACCGGATAAACTTAGTCTCATGAGCATA
TTGAGGCTGTTCTGATGGGATTTCAGTCCCTGGTATGTACAAGGATACAG
TACAGCGATTATGTAACTTATTCGTTTTGCACTTCCTTATGTGCTATGCA
ATCAACTCCTGGTTGGGACATGAAACCAAAATGAAGTTTTTTGATTTTTT
GGATAGTGTAGCATGCAAAGAGTGCTAGTGCTAACCCTTTAAAATTCTGT
TGTTAAATTCGAAATACATTAAAATATAGAAAAGCGAAGTTTCCTATGAA
TGGTAGCATTTATCTTTTTGTATTTTTTTCGTACCCTTTAATTTATCACA
TGCTAGATTTTCCCGTTTTGGTTACTCTAAACAGAAAATGAATTTGAACC
TGAATTTTTTCATAGGTGGTAAATTGACTAACTCCACCCTGTAGTTTTTT
TGGTGGAATTTTTCTTGTTCAAGAATGCCTAAACCAAAAACAATTGCATG
GTTGCGGCAAACAGTGATCGCATAGCAAGTGTTGACTGTATGTACTGTAG
CTCTATGTGTTTCTTTTTTATATATTCTCACAAAATAGATGGTTTATTTG
CTTTAACCTTCCTAACTACCATTCTGATGGGTGATGTCCAATGATTTGAA
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CTTAAGCCATCTTTTGCGGATGCACATCTTAACCAAGGGAATGTGTACAA
GGTAAGTCTTATGAACTCTGGCATTTGCTTGTGGCCTGGGAAGTCGTCAA
CAATTGGTTATGGAGCATTTTGGCTTGTCCAGGCTATGGGAATGCTCCAG
GAGGCAATTGCTTGTTACCAGCGTGCTTTGCAGGCGCGCCCTGACTATGC
GATGGCTTATGGTACAGTCTTGCTTTACCCTTTGTGTGCAAGGACATATG
GTAGGTTTGGTTTGTGTCCAACAACTACAATGCTAATTGTTGGCAACTCA
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AAGAGGGGAATCTGGCTGCTATTTGTTGAACCGTACGTGGAAACATCCAA
AAGTAGCTAGAATAATGTCAGGCAAACTTAGGATTAATCAAGTACCAAGC
AAGTCTAGATTTTATTTGCTCTGGCTGAAAATTGGTATGGTACCTGTTGG
ATACCTGACTAAACCTACCATTAGTCCTTTTTTCTTAGGATCTTGCAAGT
TTTGTGAGTGTAAATACTAATTTAGTTACATTTTCCTTCTTAGTCCATTT
ATTAGATGTTCATCGTGGATGAGATATGTTCAAGCTTACAAGAGAATGGT
CCTTTCTTTACCTTCAAAGTAGAGCCTTAGTATACCTCGTAATGCAAAGG
ACGGGGGGACATTTTATGCAGGTAATCTTGCTGCTATCTACTATGAGCAA
CGCCAGCTTGATATGTCAATTCATTGTTACAGTCAAGCTATACTATGTGA
CTCTCGGTTTGTGGAAGCATACAACAACATGGTAAGCTCTTGAAGTACTC
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TTGGCTATCTTTGATAGGGTAACGCACTTAAAGATGCTGGGAGACTAGAA
GAGGCAATTAATTGCTTCCAAGTATGGTACACTTCATTGCTGTGACTTTC
CATATTTTGTTCTAGTCCTAATCTGTTCACATATTTTTTGGTGCAGTCAT
GCCTTATGTTGCAGGCAAACCATCCGCAGGCTCTTGCTAACCTTGGAAAC
ATTTACATGGAGTGGTAGGATTCTCATACGTTGTTATCTTTGATACCCCA
GTATGTTGATGCGCTTTAAGTGCGTAGACTAAAATAAGATTGCAGGAACA
TGATAAGTGCGGCTGCTTCATTCTACAAAGCAGCAATTGCTGTTACATCT
GGGTTGTCTTCTCCACTCAACAGTTTGGCAGTCATATACAAGCAGCAGGT
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GATTTTAGTTTACCCCTTTTTTCCTGATTCTTTTCTTTGGGTGCATCAGG
GAAGCTATGCTGATGCTATTGCATGTTACACCGAAGTACTTCGTATAGAT
CCTACTGCAGCTGATGCACTAGTTAATAGAGGAAATACATTTAAGGAGTT
TGGAAGGGTAGCTGAGGCAATTCAGGATTACATACAGGCTGTGACAATCA
GGCCAACTATGGCGGAAGCTCATGCGAACTTAGCTTCAGCTTATAAAGAT
AGGTACGCCCTCTGTTCCGAATTATAAGTTCTGGCATTTTTCTGAATCGC
ATGTATATAGACGCTTTTTAATGTGTCTGTTCACTCATTTCCGTCTGTAT
GTAGTCCATATTGAAATATCCAAAACATCTTATAATTCGGAACGGAGGGT
GTACTATTTAGCAATCAAGATAATATTGCAGTTTGGGTATTACCATCCAG
TTTTTATTGTGTTATTACGTTTCTGGTTAAATTTTATCTTTTGAAATGTG
ATCTTACACTGTAGTGGACATCAAGAAGCAGCTATAGCTAGCTATAAACA
AGCTCTTTGTCTCCGTCCTGATTTTCCAGAAGTAACGTGCAACCTTCTGC
ATACTCTACAGGTAAGATCTATTCCACATAATTATCTAATTTGTCCAACA
GAACACAGAAGCATGCGATCATATATAAAACTCTCTACACTCTCCACGTG
TTATCAAGATCACGAGAACTAATTTTATATGTTTACTCGTTAGCATATTT
CTTGAAACCAAAGTACCGATGTACTTCCTTATGGTGCACTATGTTATCAT
GGACTTGTTTATACAATACTTTGGATATTGAATATTTAATGACCCTGAAA
GGAAGCTCATACAATTGCAGCTATGCCAAGGAAAAGACACTAACTGAAAA
AAGTGCTACCCATGTTTTTTTCACTGCAGAGTGTTTGTGACTGGGAAAAC
AGAGAGACTATGTTCCACGAAGTTGAAGATATAATCAAACGGCAGATTAA
GGTTCCCCTTTGTGATAAATTTCATTTCATGAAGTAATGCTAGGAATAGG
ATAAAGTTGAATAGTGGAAATATCCTGAGTCATGACAAGCTTTGGTTATT
GTTCAAATAGATGTCACTTCTGCCAAGTGTGCAACCATTTCATGCTATTG
CTTATCCTATTGATCCATTGCTCGCCTTGGAAATCAGGTATATCCCCTGT
TGGATCTTGCTGAGCTGCTATTTGCACCATCAGTGGTATTTTCTACTTTG
TTATTTACACTATATTTTTTGCTTTCAGTCGCAAATATGCTGTCCAGTGC
TCTTTGATCGCTTCTCGCTTTGGGTTGCCACCATTTGTCCACCCACCCGG
TTTACCTGTGAGGGCAGAGGGTAAACATGGTCGACTCAGGGTTGGGTACG
TACCTAAAGGCACTTCTATCATATTTGTTGGGTTCCAACAAGTGACTAAT
AGGCATCTCACTGATTTTGCAGATATGTTAGTAGTGATTTTGGTAATCAT
CCGCTTTCCCATCTCATGGGTTCAGTTTTTGGAATGCATAATCGTGGCAA
TGTTGAGGTAGCCTACCTTTCTTTATTCTCCCTTTACACCTTATGGATTT
ATTGTATCAATAACTCATCGATTGGCATGCTAGGTTTTTTGCTATGCGTT
GAGCCAAAATGATGGCACTGAATGGAGACAGCGTATCCAAGCTGAGGCAG
AGCATTTCATCGATGTGTCTGCCATGGCATCAGATGCGATTGCCAAAATG
ATAAATGAAGACAAAATACAAATTTTAATCAATCTTAATGGCTACACAAA
GGTAATACTTAGAATTCTCCTTTTCATAGCCTGTTAATCTTTGTTCCCAT
GCTCACTTCTCTCCAGTGACAAGCTCATGCTATTACTCTGTTTATTGCTG
AGTTTTTTCCTTCACCTTTGTTTGCATGTATTATATATTTATGTTGGGTG
TGCATATGCTATTCTTGAGGTTACTAGGTGGTATCACTAAGTATCTTGAA
ATATACAATCAAGTGTGTTTTAAAATAAGAACCAGCTCAGCATATTTGTG
GGATCTCAAGCAGCTCTTGTTTGGTTTTATAAACTTGTCATTCTGCTTCA
TGCGTTTACTTTAACAGGGTGCAAGGAATGAAATTTTCGCGATGCAACCA
GCACCTATTCAAGTGTCATACATGGGTTTCCCAGGGACGACGGGCGCTTC
TTACATAGACTACTTGGTTACGGACGAGGTTGGAGTTTTTCTAATAAATT
TGACCTTGCCCAATAGTTTCTTAGCTTTAGATGCACTAATTTGACTTTTG
TTGTTTGCAGTTCGTTTCTCCAACTCGCTTTGCACATATATACTCTGAAA
AGCTTGTTCATCTTCCACATTGCTATTTCGTCAATGACTACAAGCAGGTT
CCCTTCTGTTGCACTATGTTATGTTTTGCTCTATTTCATTCATGTTTTTT
CTGACAACGGCTACTTTACTAGAAAAATTGTGATGTCCTAAGTCCTGTGT
GCCCGCATAAAAGATCAGATTACGGGTTACCTGAGGATAAGTTCATCTTT
GCATGCTTTAATCAGCTATACAAGATGGATCCAGAAATTTTTGATACATG
GTAACTTCCCATCACCTGTACTTCTCTGTATAGTTTATTGAAAGCATAGA
TATATTCATTATGTTAATGTTTGTCAACTCTCTTTTGAAGGTGTAATATC
GTCAAACGTGTTCCAAACAGTGTGTTGTGGCTCTTAAGGTTTCCAGCCAC
CGGTGAAATGAGAGTAAAAGCACGTAAGTAGTAGATTAAATATTTCTTTG
TTGCCTGAGCTTTTCATCTGGAAAAGGAGAATCACATGAACCAACTGATT
TTAACGTCGATAATACTGGAATGCTTTTTTGTACAGATGCTGCTGCAAGA
GGAGTGAGCCCTGATCAGATCATATTCACAGATGTTGCTATGAAACACGA
GCATATCCGAAGAAGCGAATTAGCAGATCTTTTTCTTGACACGTATGCAG
TTAACCAGTTGTTACATTGATATAAGCACATGAGTTCATACTGATACTTG
CTGCATTACAGGCCCCTTTGCAATGCACACACAACTGGTACCGACATTCT
ATGGGCTGGCTTGCCGATGATCACACTTCCACTAGAGAAAATGGCAACCA
GAGTAGCTGGTTCCCTGTGTTTAGCGACTGGGCTTGGAGATGAGATGATT
GTTAGCAGGTAAGCATTGATTATAATCTGTTTATGCTGTCTACGATGGTA
TGTACATAGTTTACCCTTTCCTTTTTCTGATTTTAGCACGAAGGAGTACG
AAGACAGAGCGGTCGAACTGGCAACAAGCCCAGCAAAACTCCAAGCACTG
ACCAACAAGCTTAAAGAAGCCCGTTTAACGTGTCCATTGTTTGATACGGC
TCGATGGGTAAGTGATTGCTGCACGAAGTCAAAATGTTCCTGTTTGATAC
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CGGAACCTTGATAGAGCGTATTTCAAGATGTGGAATCTTTATTGCTCTGG
CCATCATCCGGAGCCGTTTAAGGTGAAGGAAGACGACAAAGAGTTCCCAT
ATGATAGATGAGTGGCGTGAAATCTCGGCTGTGTAGATAAAAGCAGAGTT
TGTAGCGTAGTACAATCATTTAACTGGTATGTCTGCGCCCTGTCCCGCTG
TATCCCGCATGTAGTCCTACATATTGTACCAAACGGAGAAGCATTCTAGG
TTTAGCCGTCTATTTATGTGTGCCGACAGAAGATTATAGTTCTGTTGGTG
CCTGATTGTTGTATACTATGAACCGCATCTCCTGCTGCTTTGTGTCGGGT
GTTAGAAAAACTTAGCTGCAAGTCTGCAACGACACAAGATGAGTGTTTGA
AAAATCTAATATCATTATGTTTGTCGCTATTGTTGTTGGCTTTGATGGTG
TTCAACCTGTTCTCGTTTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.