Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE006554

[Submit comment/correction]

Sequence	AE006554
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE006554
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TTCAAGCCCACGAAAGTGTTCCAGAAGAAGCCCTCCCAAATCCCAATCCC CTCCCCATCGCCACGACACGACGCTGACAGTCGCTTGCTCCGGTCTCCAG AACTCTCGCCATGCTTCCAGCCCTCGCCGTCGCCTCACCGACGCAGAGCG CCTCTCCCGCGCTCTCCAGCCACGGGCGCTACCACCTTCACCACCACGGA GTCCAACTGGATCTCCGCCGCCTCCCTTCCTTAGCCGCCGCCGGCCGCGT TCGCGGTCGCCTCCTGGCCAGCGCATTTGCCTCCGCTGATGGTGGCGCTG GACAGGTAAGCTCTCGTCATCTTTACAATATCCCCTCAAGGCATTTACTT ATATACTCTACTCAGAGTTATTCATTTCAATTTTGCTAAAGAAGCTGCGG TTAGTCTAAATAAGCTGTGGTTAGTTCCTCGCTTGCTTCAGTTGCTTCAC AATTTTCCTTTGCGATAGTATATGTTATTTCAGGCTGTAGCCACAAACTT GACCTGGATCAAATAGCGACACGTAGCGTTTTGACATATCTGTTTGTATG ATTCGAAATAACTCTTTGAATGAGCTAGAAGAGAGTTCTTATCCATGAAC TAGCTCTAGTTATCCAGTGAAAATCGGAAGCAGCATTTTTCCTTTGCCAT AGCATATATTCTTTCTCTTAATTTCACTCTTGTACGCTATGTTATTAAAG TAGGACCTTCCTACTGTCTTCCCAGTTGTTCGTTATTTGTTTTTCTTTCT GAATTATGAGGGTTACTTGGTATCAAAATAATCAAAATGCTCCATATCTG CTATATAATTGATTTCGTGTCAAATCCACGTGAGTGACCACAAGTATTTG TACGGAAACAATTGTCACATTCTAATGGGATGAGCCGGCTCTCGTATATA TGTGAGATAACCCTGTTTTATGATTCTTGACTGAGCTTGTGTGTTGAAAT ACATGAACAACTAAAATTTGACCTGTGTGTAGTCTTCTGTGTTACCATCT TGTTGTTCTCATGTATGTCCTGGTACTTCTTCAGCAGTTACCAATGTTGA ATTTTTACTATCACGAACTTTCTCTACATACACTTTCTATTGGAGTTATT GTGGTTTAAAACATCAAATAAATTTTATTGCTTCTGTTAGGATGTTGGTA GTTCTGAGAGCACCGCAAGCTCAGGATCTGCATATGTTGGTCTCTTTGTC CGAATGCTTGGCTTGGACAATGACGCTCTTGACAGGGAACATGCTATTTG CACACTCCGGCATTACTCCCTTGGTGGACAGAAGTGCATCGATGAGATCA TGCAGTTCCCAGGTTGTATCAGCCTCATCACCAGCCTCCTCAAGTCAGAG TCCTCTCGTGCTTGTGAAGCAGCAGCAGGCCTTTTGCATAATATAACTTC AGTGAAGTTATATAGAGATGTGGCAATTGAGAGTGGAGCAATGGAAGAAA TATTTAGCCGGCTCCTTACATCCACGATAACCCCAGAGGTAACTGCGAAC ATAACCACCAGCAGTTGAATGTTCTCTCCTTCCGTCCACATTAGCTGCAA AAAGATACAACTCAGTCCATTTCTGGCTTGCTTGGTAGATGGTAGCAGTG GAAAGCCGGGCAGACAAAATTGATTTTGAAAGAATCCTGAATTACCTGAT GACTTATCCAGACATATATTCTTTTGCAGATGAAGGAGCAGTGTCTGTGT ACCATTTGGAACTTCTCTACTGATCAAAATTTACGGTACAAGATTTTAGG GAGTGATATGGTAATACTGATTGTTAGGTTCCTAGATGACGAAGATATAA AAGTCAAAGAGGCTGCTGCTTGTATCATATCAAATTTAACTTTAAGTCAC TCTTATCATGGAGATCTTGTCGAAGCAGGTGTAATTCCGAAACTGGTAAG TTTTTGTTCGATTTTTTCTGTTAAACAAACAAGTCATGTTAACACATGCT TGCATTAAGTTAACTCTGTAGGAACTATCTACACCGTATTTCACAAATGC TGTTGTTATAGTTTGTCTTGCTGAATGCTCTGAACTCTGTAATGAGAAGT CTTAATATATTTTAATATCAAATATTGGTACTCCATCTTAAAGAAAATCT CAAGTTGACCTTGCGAACAAAAAATGCAATTTATTTCATGTTAGTGCAGG AATTGAGTTTATGCCAAGCTATGGAGAGGTACAATTAAGTAGAAGATGAA TTTCTGTTACATGACGAACTAGTAAGATTAATGCTATTGTAATACCATGT ATTCCTGATGAACTGTTCATAATTTGTTTTGTGGAAATATTGTTAATATC TGAGTATTTAGGCCTAAATTGTAGCGTGTGTAGCAGTGTTATGTGGACCT GTTCTGCACTGACATAGATCTGTCCTTTTTGAACCATATAAAAGTACATA TTATCTTTGAACAAGCATGTTGTTCAATTCTTATTCTATCATTTTTTATC ATACGTTTCTCGTCTTTCTGAATATCAATTTTTCCATTGGCTGCATTGGC AACTGTCATAAGTTAATTTTTATTTTCAGTCTCGTGATAAAATCCCAGTG CTTGTCTATTTGGATTACATTCTCCTGGTATCATTTTCTTAGATATATTT ACTAGCATTGCTTTGAATTAATCTTGGAGTTGTTTTTAGGTTCATCTTTT CCAAACCAAAGAAGATGATTATAAAACTATCAGAAAAGAAGCTAGACGTT CGTTACTGGAACTATCCACAGATGATAATTACCATGCCATTATAGTAGAG GAGGGTCTAGTCCGGGTTCCTCTGGTTGGCTCTTCTGCATATAATGCCTT CAGACCTCAACCTCATTCATGGCCCTCTTTTCCTGATGGTTCTGAAATTC AGCGGAGCTCACAGCCTTCAAAATATGGTGCAACTGAATTGCTTCTTGGC CTGAGTGTCAGTGAGAAGAAAACTGAACCAGATGAAGCTAAAATTAATGC TATGATAGGGCGTTCTAATCAGCAATTTCTTGCGCGTGTTGGAGCTATCG AGCTGGATGATGAAGGGAAAGAACAATCTGGAACTCAAAGGAATGATCTG TATACCATCTTACCTTGGGTAGATGGTGTTGCACGGCTAGTTTTAGTCAT TGGTCTTGAAGATGTCTCTGCAATTGCAAAGGCTGCTAAAGCAATTGGTA ATGCATCAGTAAATGAACACATGCGCACTTCATTTAAGGAAGCTGGGGTG GTTAAACCTTTACTTCAGTTGCTGATGCATAGTGATATACCTGTTAGAGA AGCAAGTGCTTATGCATTGGAAAAACTTAGTGTGAGGTATTATTGTCTTC CTTCTCAAAATCAAACATGTTTGCAGCAATGATATAAAATAATATTGATT AGAGTAATAATTACATATAAAAAGCATCCATTTGTTTTTAAGTATTGCAA CTTCAACACATTAATTTGTTTTCGTATAGGTTAGACTGTTGAATAAAAAC TAATTTCATTAGCTCAATTGGTCAGTTGCTTAGATATCTTCCTATATTTG TACATATATGTCCGTGTGCATCGGATCTAACAGAGCAAATATCAGGTAAA AACCCAAATTGAGTGTAACACAGTGGTTACCATGTAAAGAAGTTTCTAAA AATTGTAATTCTTCTAGGTGTATCCAGGGACATTAAATTGATTTTTTGTA TTAGAAAGGTGATCTTCACTATTTTTAAAAAGCAGATCCACTCTGTTGAG TGGGTGGTACTTTGCATACATTATTTTTATATCGGAAAGGTACTTATTGA AGTTTTACTGTCTATTTTTTTGGGGAAAATGCAATGACATTGCGTTTCTT TTCATTGCAAAGAAGAGTTATGTTGTACAATCCACCGTTTTACTGTCTAT TCTCCCTGCCATGTGTGCTGCTGCTGTCAAGGCACCATTGCCACACTTGG GTCAAAGCTCCTTTACCAGGCCTAGGGCCCTTACCTAAACGAACAACAAC ATACCATTATTCATCTAGTAATTGCCTATGCTTTATTCAGACTAATAAGT TAGGAGTTATGCTTCGGTACAACCCCCACAAAAAGGTTTACGTAAGGCTA ATTGTGTCCTTCAACTTGCTTACTAATCAGTAGCGCCTTCCCACAATCAC GATGGCTGCCTAAACTTCTCCACGGCGCTGGCGCGCTAGGCCGTCATGAG CAACCCAGCATGGTCAGTTTCACGCGGAGAGTCCTCTCCTGGAATGCACT GCGTGAGTGGTAAAATTTAATACAGGACTCAGCCCAGCTGCCAATTGCCG ACTATGGCATAAGCCTGTCGTTTTCATGGCTGTAATCCTTGGGATGGCCT GTGAACTGGAGTAATAGAATTACAGGGGCAAAAGTTGACCAAACTAACAT TTTCAACTGATGGGGTAGGTTTCAATCTCCACTTGCAACTTTGCATTGGA AAATGTAGACCTTTCCTACAAAGTGTTTTTATATCTCCAAAAACAATGGA TGGCAGAGATAAGGTGTGTACCCGCATGCAAGCTCACCCACAACTTTCAC CTTTCCAAGGGGTTTACCTCGTAAGTTAAAGTGTCTTACATAACCTGTAT TGGTGAATGTTCTCCATAGAAGATACAGTATAGTAGTGAAGCATTTTGTA GCAGACCGTGTCTCTACCGGCTACCAGATAGCATGTTGTGCTAATATGAG GGCAACATGCTGAAATCTGTTTCTACAAAATTCTGAAAGGTTTATGGTTA TGCCTTAGTGCGTTACATATTCTCCTTTTTTTCTAGTTCCAAAGTTCGTG CGAATATCAGAGCAGAAGGTGGTCTAGAACTGCTTGCAAATGTAGTGAAG GATCCAGGTACCCCAGTAGAACAACTGGAGAAGGTGACAACCTTTAATAT TGTCTGCTTAATTTTCTAAGTTTCAAGTGTATTGTCAGGTACTAACTGGA CAGCTGCGATGCAGATGATCGACATACTTTCTCGAGTACTTGACATGGAT ACCAGCATTATTACTGAGGTGAATTAGGCTTCTCAATTTGTCAATTATAC TTGTTCTTTACCGAACCTGAATTACAATGTTTCAAATTTATCAGCTGGAT TACTATGCTAGTACTGGGTCTGAGGATATAGTGAATGATGAAAAGTGCAG TCAAGGTAATGTAGATGGTGGGCTCAATGGAACATCCCACAAATTATTGA AACAAGACGAGATTGCTAGGTTCGTTTTAATCTTGTTACATTCCTGAATA TCATTTACTTGCAAAGTTCACAGCAAATCTGTCAGCTCTTACCCCTCTAT CTGTAAGTAAGTGATGTTTTAGCTTCATGCGCACCTGAAGAATCTATATA AGACTACAATCCTGCTTATATTAATTTTGTGAACAGTACTCCTAAAATTG AGGTCAAGCTCTGGTGTCTTTGGAGCTGCAAATGAAATGGATTATTTATG CTTTCAGACCATTAGTTGATGTCGAAATACTTCTTAGCGTATCCATATAT TTCGCCAATCAGTGTATTTCAGCTCTTCTGTACAGTACATAGTCATGATT TGGGTTTATTCACCTTCTAATCCTACAAATATGGCAATATCTTAGTACTA AATGTCACTTAGTTCAGGATGGCAATATTTTGTAAACAAAGTATCTTATC TGTGGATGGGGGTTTTACTTTTACTTTTGTTGGTGAAGCCCTCTCTGTTG GAATGTAATGTCCATCCCTTTCTCTTAGTTTTGAGGTTCGAACTTTTGGG CAAACTGGTAAATGCATAGAATTGAATATGGTATCAGAGCCAACAGGTCT TGAGTTGATGAGCCGACCAATACACTAGTCCCTCGTCCCCGTTTTGACTC GTTTTTCAATGTCAAAGTTTGACCATCAATTTGACCACCGAAACATGGGT TATATGTCCTGAAAGTTATACCGTTGGATTCGTATTCGAATGAAGTTTTA AATGGTATAATATTTTTATTACAAGTGACACATGTATTATTGGTCAAACT TAAAAACATGGAGGGAGTATTAATACATCAATCCCACCTCTAAGGTCTGC TGGATCGATATTGAACTATATTGCTTGCGTTTATCCACACTTCACATTTG AGTGAATTAGTTAGTGCTGTAAAGCTTCAAGCATAGCCAACGCATCCAAA AAACCGAACTGATGGAAAGAGCTAGACAATCCACATACACTATAACACCC CCTCTCATGTGTGATATGGGGAAGTCAACATGTCAATAGAAGAATCTCAC ATATGACTCAAGAGACCTATGCATGGAAACAGAGCGGGCAACAACAGTTT TCAATAAATTGCTAAAGCGGACACATGAACACAACACCTTATGCTCTGAT ACCATGTCAAGCTTCAGGCACTAGCCAACGCAGCCAAAAGTCCAAACTGA TGGAAAGGCTAGACAATCTACATATATACACTACAACAGGTGCATCCAAT TCAATATGGTATCATGGCCAAGGCGTCTGGAGTTCAAGACCTGGCCGATG CACTATTAATAAAACTAATGGCGGCCTACATTGATCCCAGTGTAAGGCTC TGGTAGAGCCTAGACGTGAGGGGGTGTTGAAATATATTGTGGCCCTTCTC CATCAGTTCGGACTTTTGGTTGAACTAATTGATGCATGTGATTCAATAGT CTCCTTGGATAAGCTTGAATTCATATTACTGGATCATTATTTATCTAGAA AGTATGTACAAACAATTGATTTTATCATCTTCTTGGATCTCCTGATATGT GTTGTATATCTTCTACTGTTAACAACGTTCACTCCTGATTTTTATGTTTG TAGTGAGTCGATCTTTGACTTTGATGTCATCTCACGCTTAACCAAAGTTC TAAAGGAATCATCTCCAAGCTTGCAAGCAAAATGTTCTACTGTCCTGGAG CATTTAGCAGCTTCTGAGAAAAATGCCACTGCCATGACTGGTGCCTGCAC TGCGTCAGTGATTGAAACTGTTCTGGGAATGGTGTTCATTAGTGGTAAGT AGTTTGATTCATTTTTGCATAAAAATTATAAATGCAGATGCAAACATGAC TTTTTTGACTTATTTCTATGTAAGATTGTTATGTTTGAGTACTTAATTGT CCGAGAGTTATGCCATATGGTCTAGGTGCAATGTCCTGATTTTTCTTAGT TTTAAGTAAAGCAAATTTTGGATAAGCATGGTGTGTGTAAAGAGTTCAAT AGCCCATCGACAATAATAATGTTAAATCTAGTGCAATAAAGCAGCAAAAG GAGGAGAGTTGATAGTAGTTCATTTTAAAAATCTACTGCATATAAATTTT CACACCATGCAAAAGGTATGGCAGTAAATTCATTTTTGCATCCTGCCACC AAACTGATCAATTTTTGAATTAGGGTGCTTACATAGTTATTGGAAAGCTC TTGGCTTGGGTTAGGGGTGCTTACATAGTTATTGGAAAGCTCTTGGCTTG AATTAGGGTGCTTACTGAACTTCCTTATTTGGCATAAAGTGTGTGAGTTT TACTGGCGCAAGTGAATAAGGGTTTGGGTACATGCTACAGTATAGCTAGC ATCATGGTCATCGTGTACTTATTGCCTTTGGTGATGTAACCCGATTGTCA TTTACTTGCTATTTGTTCTTGATGTGTGACAGATAACTTGGAGTGATATT TTTTGTGGCAGGTACAGCTGGCATAATAGTATTTTACTAACACTGATGCA TCAGAAGTGGTTTTTCTACTGAATATTGTCTTAAAGTTTTTTGTTGAGTA GTATTATGGTAGAACAAAGTTTACCTTAATATTGCCATCTCATATGCACT GCTTCTGTGAAGTAATTTTTTGTGCTATATAACAGGGACTATAGGTGATC CTGAATATCTTGACGAGCCTCCTACTCTTGTGATTGAAGTCAGTCATGCT GTGGCTTCAACTCTGAGGTTACTCACAAAGTTGTTGAACTTTGATATTTT CGTTCGCAGCGTAAATACTGTGAAAATTGTTAGTCTGTTAAGGAGGATGC TCAAGTCCAATATTCCCCTAGAGTCAAAGGATTGGGTCACATCATGCCTC GTTAAACTAGAATCAAGGGGTGCCTTGGTTGATCGGAATGTTGGTGGTAT AGGCACGGAGATAACTATCCACCACACTATTCCCAGGCTAGTTAAGGAGA TGATGACCTCATTTTCTTTTGAAAAGAAAAGAAAAAATGTAATAGAGCTG AACAGGATAATGTCTGGAGGTGTGATGGAATACACAAGAGCAGTTGCCAC AGCTGGAGGTATATTTCCACTGGTAAAAATGATTGAAGAAAGTGAAGGGG ATGTATTGGAAGCAAGTCTATCTGTCTTGTATAATCTAAGCATGGACCCA GAGAATCACCCAGCAATAATTGCTGCTGGAGCAGTGCCTCTGTTGAAGCG GATTGTGCATGTCGAAAGCCCACACTGGAAGCGCGCTCTTCAGTTGCTGA GGACATTGCCCGTATGAATGACTTCACAGGCAGGAAATGCCCATTTCCTC TCAATACGCATTAAGCTGCGCTGGCAGGTATGCTGTTAAGTTCTTGGCCT GTTTCTGGCAATTCTTTTATCCAAACAATGTTGCTACAGTTAAACAGCAA AATAGGCCACTTAGTTACTGTTTGACCCACTGGATACCTCCACTCTAGGG TATTGTTTGACTTCTTTGACAAGGTGCTTTAGGTTGATAGAGTAAAGTTT TCAGTAGATCATCTATTGGTGGAGTAATATTTCTACTGGTTGAATCTTCT GAGAATTTGTTTCTGGACATCCAAATTTCAGGTTCTTGGACTTTTTCTTC TTCCTGGATGGTCTTGTTCAAATTCAGAAAATAGTTTAGACTTTAGATGC TTTCCGTTCATTTACTTACTGTATCTGTTTTTTCCCATATATTGACATAT TGTTGTTTGGAAAGTTTATCAGCGATGCTTGCGTGTTATTCTCCTGTGTT ATGTACTGCCTCATATTTGGTGTTTCTTGGTGTGCTCATCTCTTTATAAA TACTGTTTTTTTTTTCCAAATACACAACAGAAAATCCATAATATTGACTA GACATTCTCTATCTTCTTTGCAGTTACTGTGTTACATGGAGATCACAGCT GACGACTGAAATATTAGGAGAATTTCATAATAGGGAGTCTTACTGAGACC GGAGGAGTTCCTAATTCCCAGCGCCTCAACAATGGTACCACCATTTGATG AGTACGGTGCATAGTCCAGCAATGAACATATTTTTCGCTGGTAGGTAGGT GAATGACAATGTTGTGAGCACCGATGAATACTTTTAGACCTGGTAGTAAT CTCTAGGAGAGTGAACACTGTAGAAGTTTCAACTGGTGATTGTTATCTGC CTAATACTCCCTTCGTTTCAAAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.