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GrainGenes Sequence Report: AE001712

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Sequence
AE001712
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE001712
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTTTCCAAAATCAAGTTGGAAGCAGGTATGTCATTATTCCGGAACATAC
GTGATAAAACCTGGGAGGAAAGCCATATCAAAGTATAGTTCTCTTCTGGA
CTCCACCCTTAAACTACAGACTCAATTGTTTTTACGATCCTGCTAAAAAA
TTTCGATGTTGCGTAGCAGCATTTACATTGACTCGGTCAAGTGCTTGCAC
AAGCTAAGAGACCAATTCCTAAATAGAACAGTAGGTCTTGAGAATCCTCC
TCGCCAGATCAGTTGCTCCGCTTTCCTTGTAGATCAGATGCAAATTGAAC
GCGGCCTCTCTTCGTTGGTCGCAGTAGCCACGCCTAAGATCCTGCTGCTG
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TCATGGCTAAAACTTTCTCGTAGTAGACCGCCAAAGTTTTGAGGCCAACA
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ATAATCCCGAGTAGCGGACTGATGTTGACTGATAACAGTAAATCGATGCC
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TGCTCTGTTTGCCTTCAGTAACTCTGCAGATGAAGCTATTGGCCTGTATC
CTTGAAATACACTGTCTGGACGTACTTCATCCAACACTTTGGTTCTTTCC
TGCATAACATCATTTGTAAGCTTTCTGGGTACCTTGACCTTTCGATTAGC
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ATTCCTGCATCTTGCCTTTGTTGTGTAATAAAGTTTGGCAAGCTGCATCT
TTACTTCCCCATCAAGCCACCAAGGTTTCTGTTGGTCCGGGATACTAGCA
GACGGCAACTCTAGATTTTCAGGCGGAGAAAGCATACCGATAGCTTCATC
ACTCTTATCCTCATCAACAAGAAGAGAAGATAATGTCATCCGAACATCGA
CATTGTCCTCCATCCTTTCTAATGCTTTATAGAGGTATGGAATAGCCTTT
GTTTTCTCCCCCATGACTATGTAGCATCGAGCAACTTTCACATATGAACT
ACCATCATTATGAACAACAACGTCTTCAATCATCGAGTAAAATCTCATTG
CATACTCATACCGCCCCAAATTTTCAAGACTGCTAGCGACCTCAGTAATC
AAATCAACGTTCTCCTTTGAACGCTCCAAACACACATCCTGAAGGAACAC
CTCAGCATGCTTCGTATCTCCAATATAAGCCTGGCAGATTACTTCTTTCC
CCTGCAATCGTACTGGCAATTTGTGTTGGTGCCCCAGCAGCAGGTGTGCT
TTCTCGATCTGCCTCAGTGCTTCAGCATGGTTATTATTTTTAAGATAGAG
GGATATCAGTAAATCTAGAAGACCCCAATCGATGTTTGTAGTCTGAGCGT
TGACAAATTCCTCCAACAAATCAATAGCTTTATCAATTTGAGCAGTCCCT
GTACATCTATGCTGCTGTTTTACGAGCGACAACGTTGGAAGGATAAATCC
TGACTATCTGCTCGTAAATCTCCGCAGCTTTGTGATAATCCTGAAGGGTG
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TCAGCGCCAAGTCAATGAGCTTCTTCCACAGAGAGACATCCGTTTTAGCG
ATATACGCGGCCACCAACCCAAAGTTGACGGCCCTGACAAGATCACCATT
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CCACCTGTTCCTCTTTCCTTTCGCCCTCCCCCTCTTGTTGTCATCCTTGG
GCTTGCGTTTCTTCTTCCGCCGAAGGCCGAACCCTTCCATCATCTGGTCG
AACAGGTTCGCCGACTCCGCTTCCGAGAGCTCCTCGCCCTGTCTCCTCCT
CTTGGAAGACTCGTCCCACTACAACTGCTCCTCGGGGAAGGCCTTCCGCT
TGCGCGACAAGGCGGCCAAGGCCTCGAAATCCCGGATGCTGACGGTGGGT
CCGGCGACGCCGGGGCTCCTCTCCGCCATCTCCACGCACCGCGTCGCGTC
GGCGGCGTCAACGAACTCGTACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCT
CATCGTCATCGTCGTACTCCTCCTCGTCCACGTCCTCCTGCTCGTAGGCC
TCCTCCTCCTCCGTCGCTACCGCCAAGGACGCGAGCTCGTGGCCTTCCTC
CTCCGGCGCTGGCATCGCTGAAGGAGAATACCCCTCAGTGAGCCGCGGTT
TTGGATGCGAAGCGGCAGCGGGAGTAGCTCGTGCCCGGGCGGTAGCGAGC
GCCGACAAGAAGAGGAGTAGCGGAGGCCGGGGTGGGAGGGCAGCGAGAGG
GGCGGTCGTGCAGTAGCCGGCGGCGAGAGGGAGGGCGATGTGGGGCAAAA
CCTGGGTGCCGAGGCCGGTGGGGGAGAAACTGGGCTTCTTTCATGGGCCT
TCAACCCAGACTCGGGTTCGAGCCCGACCAACCACGACCGCAACCGAGCC
TGACCCGTGTCTGGTCGCAGCCGCACCAGCTTCGTCTTCCCGGAGTCCGC
GTCCCCACCAACGACCTCGCCGCGTCTCCTTCCTTTTTACTCCTCACGAG
CAGACCAAATCCAAACTCGATCCAAAATTTCAGCTTAGCTTAGCTTAACT
TATACGATTTCCCACCTCCCTCTCTCCCCCCTTCACACTCTCTCCCCCCG
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CCCCGACGCCACCTCCCTCCCTCCCCGCGGATCCGACGCCGCGGACATCG
CCGGCAACACATGGGACCTCGCCCCATTCACCCCGCCGCCCACCGCGCTC
CGCGGCGGCGAGTTGTACATCTACCGCAACGTCTACAACCTCGTCCCGCG
CTCTATCGGCGAGTGCGGCCGCGGGGGGCTCAGGGCGCTCAAGTTCTTCG
GCAACGACGTCGAGGTGTTGCCCCCGGAGGCAGGGGAGCTGGACGGGCTC
GAGAGCCTGCAGGTCAAGGTCTCCGCGCCCAGGGTCTCTGCGGCGGTGCT
CCGCCGGATGCGTGCGCTCAGGGAGCTCGAGCTGTCAATGGTGCCGCCCA
GGCCTTCCGCGTGCTCCATACTGGTCGAGATCGCCGGGCTCAAGTGCCTC
ACCAAGCTCACCATCTGCCACTTCTCCATTAGGTACGTCTTATTGACACT
GCCTACGTAGTTGTGCAAATTTAGCTCCAGTGTGTAAAATGCTTGTGGTT
ATGTCCTTCTGTGTTCTCGTGTCAAATGTGTCAAATGGTACTTCTGTATC
TCTGGTTTGCAGCTTAAATTTGCTCTCTTTGCTGTGTAATTTCCCGGTGT
CATACCATGGATCTAGGAGAAATGGATGAGTGTAACAAACCGTTAGTGGA
GTAGCATCTAGTCCTAATTACGTATGCATACTCGTTTGCTGCAGTTTGTC
ATGCCCACTGCCCAATAGCTTCTGGTAATCATGATGCTTTGCCATTTGTT
AAAGCAAACTGAATGAATGGCTGGGGCTGCTTTTAACTTGCGCTTTAGCC
GCTATCATTATGCCTGCATTTTTTGTTATGTCGCTACAGTATAGTTTGTA
GCGGCCATTGGTGTATGTAGGAGCATTTGGCTTGCTCACCTTGAAGCTAA
CTATCTGTTATGCCTTCTGTCTCTTGTTTGGCAGTGATAGGGCATTTGTT
GACTTTGTTGTACAGTTGTGGTTATAGATGGCTATTGTAGCTAAGTTTGT
TTGTCCTAAGACTGAAAGTGTACTGATCTGATGGTTAGTGCATATGCTTA
AAGTTTAAATGCTTGAATGCCGATTAAAAGTATTTATGGTCTAAATTTAG
TTGCAGTAATAGGTTAAATTCTCAGTCTCTGGAGTGAAAATCCTCATGTT
TAGGCACTGTTAGGAAGAAGAGAGCCCACCAGTGCCGTACGACAAAAAGT
CACAAAGAGAACTATATGTATAATTGTTTTACGAAAATATGCTGGTGTGG
TCTATGGTTTGTACCCTTAAGAGGCACATTATCTGTGGTTAGCAAGCATA
TCCTAAATAAGAGTTGGTGAGGCGTGGGTCCATGCCTCCTACTTCTTCCC
TCGATGCTAAAAACTCTACACATTTACTACTAAAACGCAATGGAACCTCC
TGCATAAATTACCTAACAAACTCCTAAAAACCAATGTAGATTAACCATGA
CGCATTGCGAAGGACAAGACATGACTCTGTCTTAGATGAAACTCTGATGA
GCATGGCTGTGTAGCTGAGCGTGGAGCCAGCTTAGCCGAGGACAATGGCT
TAACATGATCGGTTATATATTTTATTTGTTCGTGGCATAGCATGGGTATT
TAGCTAGTAAAATAGATAATGACATAGCTGAATGGTTTTCTTCACTTATA
AATAATATCACAACAAAAAACCATCATGTTACGTGCAGTGGATATCCATC
ATTCATCAGGATCTTTGTTCAATATTGGTATATCATATATGCATGAAAAA
TAATCAGAATTAATCCAGTGCTACCGTGGTGCGTACTTGAAGTTCCATAA
ATTCCCTATGTATAGAGCTAATGCTGGGCATTGCTAGTTGTCTTTTATGC
ATTAGAGTACATACAACATTGAACTGCTGAACAGGTGCAACCTAAGGGTC
TTGCAGTAAAACCTTCACATGTCCCTTTTTCTGTAGGCAAGTCCTGCAAC
ACAATGAACAAAACACATATTTGCAAGATCTGAGTTGAAATCACATTATT
ATATGCTATTTTTCTAATTTTGCTATTTGTTAGGACCAAATTTTGTAGAC
ACTACAATAATGGCATCATCAAGTAGTTCACCATCCCCGAGCTTTAGTAC
TGTGCATGTCTTATTTACACGAATATTACTATTGGTGCCACCACTTGCTT
ACAATGCTTGTTATCCATCCGCAGTGCCAAGTTACTATATGCTTTCTTCC
TCATATTCTTAGCATGGGAAATGACAAAATGAAGAAGTAAACTAAAACTA
AATTCTCATATTATTATGTGAACTGCCCCCTTTGATCACATGCCACAAGT
CATGTAGCAACTGTCGGCAATTTTTTTAGCTCCAAACTTGTTACTTATTA
CCTTGAGTTCACCGCAGTTGGATATTCTTACTGTAGACTATTAGAAATAA
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AGACGATAGGTTTGCTGCATATCATCTAGTTCCACAAACTGTTGATTTGG
ACAGTTGAAACAATTATGGGGGTTCTTGTATGGTGTTCGACAACGATTTC
TGTTTTATGCTATATTGACTTATTTATTTTCTCTTGCTCCCTGGAAATAA
ATGGTGGTTTAACATTCCTTCCTAACAATCTATAGGTTCCTCCCCCCTGA
GATAGCCTCTCTCAAGAAGCTCCAAGAACTTGATCTGTCTTTCAACAAGC
TGAAGAACTTGCCCAACTGTATAACCGAGTTGGGTGCCCTGAGATTCCTC
AAAGTGACTAACAATAAGTTGGTAGATTTACCCTCAGGAATCTCTTCTAT
GAGATGTCTCGAAAGCCTTGATTTATCAAACAACAGATTGACTTCCCTTG
GATCGGTTAAACTTGTTTCTATGCTTACACTGCAGTATCTAAATCTTCAG
GTATATTCTTGTCAGAAGTTTTGCTGCATCGGTTCCTAATTATTTGTATG
TTTTGATTGTCGACATAATTTATACTGGCTTTGACATTGCTGATTCTGAT
CTTCTATGTTTTGGTTTATGTTTGTTGTTTGGTGCTTGTTCTACGACATT
CACTCACTTTTGGAACCAAACGTTTAACATTTTGTCAGAACCTGATTAAC
AACTGTACTTTGTAAGGAAATTAGCGTGGCACCTTTGAGGAAAATTAACA
ACTAAACTTGGGAGAGAATTAATACCTTCGAGAAAAAAGACTAAAGTGAT
GCGATCCTGTTAAATGTAAGGGAAGAAGGTGTTGGAAAGCAGAACATACT
TGCAGGGGAGGTATATGGCAGAAAGAAAAGTTGTGGGGGTGTTAGTTCTA
TGAAAATATTAGCCATTAATTTGCATTATCTTTTTTATAAAAAAACTTGG
GCTAATTGATGCCATAGATGATCTTACTGTGGATGTTTCCTTATGTCTTC
TATTTATGCTTACAGATTAGAATATCAGATCCTGACAGTTTCCTTTCCTG
TTTTGAAGTTCAATAGGATCTCCCATTCTTTTATGATCCCCTCTTGGCTA
TGCTGCGACATGAGGGAAAATGGTGAAAATGCTTTGAAGAGGGACAAGCT
ACAATGTCAACGTATTGCAACCATTAGCAGTTCGACAGAACCTAGAACTG
CCAGTCGCACTTGCAATGGTGTGCTCTCATGCTCAACCACAGACACTTCC
ACAAATTTAAAAGCTCATACCACACAGAAAACGAAGAAGGGCTGGAAGCG
ACGGGATTGCCTGCAACAGCAGGCTCGCCAGGAGCGTTTAGAGTCCAGCA
GGAGCAGGCTCAGTGAAAATGACATTGATGAAATGGCTGTGAACATGACT
GAAGATGAATGCCTTTCTAGTGTGCATGATATGGAAAACAAGCCAGTGAT
GAAAGACATTGCTGAAGAAAGCTCGGAACGGGATCTGAAGGAAACAAGTT
CCATATCTGAAGACCTATCTTGCATAGTCGATTATGACTCGGATGGGCTT
ATAAAGGATAGTGGCATGATGCTTCAGGACCAATATGACGATGAGAAGAC
TGGGATAAATATGAGAGGTTGTGATGACAACAGTTCTGGTATCAGCGCCG
AGCCTGCTTATTTGAGCAGGAGCAACATTATTGAGAATGAACTTGAGGAC
ACTGCTTCATCAACACGCAATGCTGTTGAAGTTGTTGAGGAGAACCTTTC
AGAGTCCTCTAAATTAACGTCGAAATCTAAAAGGCATCCTGATATGGACA
GCAATCCTAAGCCCAGCAAATGCCCGAGACCATTTGACGACTGCTCAAAG
TTATCTTATAAGTACAGTGTGGAATCATTTTGCAGCATAGATGACCATCT
ACCAGATGGATTTTATGACGCGGGACGAGATATGCCCTTTATGCCATTAG
AGGAGTACGAGCGCAGTATTGGACTATATGCGCGTGAAGTTATTCTGTTG
GACAGGTTGATGCACATTCCTATCCGTAGTTGGGTGATTTGCATTTGTAT
ATGTTTTATGCTCTTTCTGATTGGTTTATTTGAGAGTATAACATATATTT
GCAATCTTCCTAACGACTTTGCTTCTTCAATGTAGAGAACGAGATGAAGA
ATTGGATGCAATTGCTTCTTCAGCACAGCTATTGTTATCCAGTTTGAAAA
GGCCAAACTATTCTGAAACAGATGAAGATGCAGGCCAGGACTTACTAAGG
GCGTCAGTTCTTGCGTTATTTGTCTCTGATTGTTTTGGAGGCTGTGATCG
AAGTGCTTCTCTTAGGAGAACAAGGGGAGCTATTGTTAGCTTGAGGAAGG
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GAGGCATCAAAGCAGGTCAATACACCTTCAGGGCACTTTGATTTTTCTGG
TCTCTGTCACAAATCAATACATATCATCAAGGAAAGAAGAAATTCTGGTG
TTGTACCGATAGGGGCACTGCAGTTCGGTGTTTGTAGGCACAGAGCTGTC
CTAATGAAGGTATCTTGTTGTTCTATTATCTGAACTTGTTTTCCGTGTTT
GCTGTTTGAAGCTTTGACATGCAACCTTGTCTATTGTAGTACTTGTGCGA
CCGGGCAGATCCTCCAATTCCTTGTGAACTTGTGAGGGGGCATCTTGACT
ACACCCCTCATGCTTGGAATGTCGTCCCTGTTAGACAAGGGAGTGAGTGG
GTAAGAATGATCGTTGATGCATGCTACCCCACAAACATAAAGGAAGAGAT
GGATCCAGAGTACTCTTGCAGGTAAGCGCCTTGTGAATGCGCCTTGTGAA
TGTATAGGGAAAAACACTTACTCCATTTCCCCCCTCTCGAATTTATATGT
TGGCAACTAGATTGCACTATCCTGTTTCTGTCATATTGTCATTATTCAGT
TACTGCTGTTTCAGTGTTAAATCAATTTTGTGACAAGGTTAAAAATATGA
CCTACAAATGCATTACAGCATTTCTGTCATGGCTAAATTTATATTTCTGA
ACCTTATTTATGTTTTATGCAATCTAGCTTATGACTTGAATTGCAAATGG
TCAGTATGTGTAATAAAATACCCCTACATTCCCCCCAAAAAATAGGCATG
GAAATAAAGGTTTGAATTTATCTTTAGCAAACTCCTCTGCCAATCTGGTA
ATTTAAACTGATTGCACAGCAATCCTCAAGGCTTTTAAAGAAGACAGTGA
AGATCGGTCACTTATTAGCCTGATTGCAAAGGCGTTTAGACTGAAGAAAC
TCCCTGATAGTCAGGTTATTTTTAGCAAAGATTAGTAGAGGCTGTAATTC
AGTAGCTGATGATCTTTGCCAGTTCGGTCGTAGAGTGTTAGGGGAGGTGT
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ATAAAATATATTTTCATATTGTATTTATTCACTATTGTAGATTTTCATAT
TTTCTTCAATATTTGGTCAAACTTAGTAAGCTTTGACTTTTAACCAAATT
TATTAGCCTTGTTATTTGGAACGGAGGTAGTAAGATCTTGTAATGCCAAG
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TAGCTGTAAGTCTGTCAGGTTATGTTCATACATTGTGTGTAGTTGCCATG
CATTGGTATGATATGGCATGTTTACCAATCCTTCCAAAATTGTAACCTGT
CCATGACATTTTCTTTTATTGGTATGATACATCACATTAGAGTGCCCTGT
ATTGGTATGATACGTCACTTTTTTCACTTTCCTAAATGCCTTCCTTCCAT
TTTTGATTTATTGCTTTGCTCTTACCTACCCTTTTGTTCTTCTGTTATTT
TGTTTGCCTGATGTTAGGGGGTCTTATCTGCTGATCTAGTATTGCTTGCA
TATTAGTCATGCTGCTTCATCGAGGTGCTGAAAACAAGTGTACATGCTAC
ACGCTGACTCTTTCTGAAACCAAAACCGTGATCCTATATTTGATTACGAA
TCATTTATATGTGTTTCAGGTATGTTCCGCTCAGTAGACTCCATGTTGCA
CTTGATGATGATACAGCTCGGTCTTCCTTCCCTTCAGTCTCACTTTGCAA
AGAAATAGAAGCTACTTCTTCCAGTGCTGTCTACCACTGCAAAATTGGTT
CTGTTGATGCTGCAGCAAAGGTTCATGTTTTTCCCTTCTAAATTTTCTTC
CGTGCCTTTTATTATGTTTCATGTATTTACTTGGTGTTTGTGCCAAATAC
AGATACGGTACCTAGATACCCGCCGTGCTTCTAATGATGAAGTTAAAACA
TTTGAATACAAGCTTCTTGGGGAAGTAAGAATGCTGAATGCCCTAAGGAA
CCACAGATCCATAGTGGACATATATGGTCACCAACTTTCTTCTAAATGGG
TTCAAGACGATAGTGACAAAGAGTACAGGATAATGCAGTCTGTAATCTTA
ATGGAGTATGTGAAAGGAGGTTCTCTGAAGGTAAATGCCTTTGTTCATGT
TTATGACTCTTGTATTTGTTGAAGTCTTTGTTGTTTAGATGTTCTCATTG
ATAACTGAACCTGTTATTTTCAAATTAGGGTTATTTGACAAAATTACTGA
AAGAGGGCAAGAAACATGTACCTGTGGACCTGGCATTTTACATTGCTCGA
GAAGTTGCTTGTGCCTTATTGGAGATGCACAGAAAGCTTGTTATTCACCG
AGATATAAAAAGTGAGAATGTTTTGGTTGATCTGGATTCAGAGAGGAGTC
ATGGAACACCAGTAGTCAAACTCTCTGATTTTGACAGATCCATTCCTGTG
CATTCTCTATCCCATACATGCTGTATAGCTCACCTTGGCACATATCCACC
CAATGTTTGTGTTGGGACACCTTGTTGGATGGCTCCAGAGGTTCTTCAGG
CTATGCATGAGAAAACTCAATATGGGCTGGTAAGCATTCGTTTGAACACT
GCGCTTTCCTTTTTATTCTCAACACATTTGAATAGTTCTGAATACCAACT
GAGGAAACCATTTGGTATTTGTGTTTTGTACGGTAGGTATTAGTTGAGCT
ATGTTTTTGACTGTCTTGCAATTTTCGGTAGTTCTGTGATGTGTTAACTG
TGACATTAATATTCTTCAGTGCTTTTCTTAGCTAATCTTGTGCAATTGTA
TGTTTGTGTTAATCTATTTTTTTTGTATGTTTGCATGTGAGCTTATGACA
ACTCTTTACACCAAAGGTTACTCTGATGATCTGATCGCTTTAGCTATCCT
GTGTCGTAATTTGTATGTCCTGTATGTATATTGCTTATAGTGTAAAGCCA
CTTGGATTTAGTATATTAAGAACCACTTGAATTGATAAACTATGCTAATA
TTGGAAAAATAGGCCCCCAGCTACCTACTAAATTATGCTAGACCCTAGCC
TCAACCAGCACTCTCAAATAAGGCCGTACTGATGCGAGTATATATGGCTT
TGATGCAGGAAGTAGATATATGGTCATTTGGGTGTTTTATATTTGAGATG
CTCACACTTCGTAGACCCTACGAGGGACTACCAGATTCAGAAATTTATGA
TCTCATAAAGGTAAGACCTCTACATCAGAAGCAGGCTCTTGATTTTGTAG
TTGCTAGTGGTTTCAAAAAAATAAAAATAAGCATGTACTAACTATCTTCT
GATTTCCATTTCATCAGAGGAAGAAGCAAAGACCGAGGCTAACTAAAGAA
TTAGAATCATTCTGGGCAACGGATGAGCCAATCACACGGCTGAAGTTGGG
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TTTACCAGTGCACCAGAGGAACTGCATCTAGGCGCCTCAACGCTGAGCAA
ATTTACAATTCGCTTTGCTCCTTACCCACATGCTATGACCTGAGCTGAAC
CTGTGGATCCTGAATCGGAAATCTGATGGTGAGGCACACAGCCTGCTGCT
GGATCGGCCTAGGTCAGGGCAGATCAAACTGGACGGTTATAGCAGGTCAC
TGAATCTGTCCAACTTCGACTGCTTCGAAGTTCTAACCAGTATACTCCAC
ATTTCACTGATGTTGGTCTTGGGGTGGGTGGCACAGACCGGGCACGAGAA
GTCAAACCAAGGTGATGCGACCTTGGGTGCCGAAGCTCCTCCTGAGTCAG
TTTTGTAGCAGCACCGCATCCCGGCTCACCTGTGTTGTACTAGCAGTAGT
CTTCATCTCGTCATGTATGTGTGTGTGTGTGTATGTTATGTAATTTTATC
AATTTTCTATTATTGATTATTTAAAGGTGTCTAAGTTAACAATTTGGGTC
ATTTAGAGCCCAAGGCACTGCTGGACAGGGCTCATCTTTATGTATTTGTT
TATGTACAATTGTCGGTCCGCCATTGATCCATGTAAGCCTCGAATATGTT
GAGCTGTGTAACAAACGGGAGCTGATACTGTTTGTTGAAAAAGAGAGGCT
GTTTGTTTGTGTTGTAATGTATCTTTCATTCCTGTAGAGTTTTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.