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GrainGenes Sequence Report: AE000098

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Sequence
AE000098
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE000098
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGCGACCTGGGCGACGTTTCAGCGCAGCTCAAGAATTTAGGAATATAAAT
AAACTACTCCCGTTGCCGTGACCGCCGCCGCCGCCACCGCCGAGCACCCG
CCGCGACAGGCTTCCTATGCCGGAGCCCCAGCTGCTTCCCAGGTCATCCG
TGAGCCGCCACTCCGGCTCCGGCGCCCCTCGCTCTGTTCGTTCTCGCAGG
TGCCCTCCCCCGACCCATCTGTCCTCCCTTTCTATATCTCCCCCCTCCCT
GTAGCGTCGCGTCGGTGGCGAGGAGGCCTCCGGGAGGTCCGCCATGGGCG
CCACGAGCTACCTGAAGAAGTATTCCTGGCTGGGATTGCAGGAGGAGCTC
ACCCATGGTCTTCTGCGGCTCGGTGTTCTGTCAATTTCGCCCCCAAATGA
TTTCAACTTCTGATTTTTTTTTCTTGTGTCGCTGCAGTTGCGGAAGCGAA
TTCAAATTGTAAATTTCTAGAAACAAATCTGCCGCACTAGATTAACCATT
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CGCTAAGGAGACTATCGATCAGGCCAATGACAAGGTGCGCTCATTCACTG
GCTGAATTGTCTCATTGCTGAATCACTAGCAGTAGCCATGCAGGATAACT
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TTAAGCTCCATGGCAACATGATAATAATCCTCATTTACATAATTGGTGTG
CAAAATTGATGTGCGTAGTAGCATGTACCTTCTGTAACATGATTAGTCAT
ACGCTAGACATCATGGATGTACATAACTATCAATTATTGCACCATAAAAA
ATAATATAGGAAACACTAGCAGAAACAGATGACAGGCCACAGCTGAAATC
AAACATCGTCTATCATGTTGCTCGCCATTCATACCGAGACAAATTCATTA
GTAAGCTACTCCAATCCCCGGTATATCTTGTATGGATATCTAATTATCGT
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CTTCGATGATGAGCCCCTTCTTCCACTCCAGCTCCTCAAACTCGTGCAGC
TCCATTTTAACATCTTTGGCAAAATCACGTGTGTCTGTTTGGAAGTCGCC
CATCTCAAGCTCCAACCACCCATCAACCCTCTGTCTTGGGTATCTGACCA
GGACGCCTCCCTCCTCCTCGTGCTCGTGCGGCTCTGATGTTTTAGTATCG
CCTCCGTTGTCACAGGTAGCACGGTTGCAATGATGGAGAGACGCCTTATG
GGTGCTCCCCACCAGCTGGCCACCTAACTCGACGAACGATATCTGCCGTG
GGGAGCTGAGACCTGATGCTTCATGGGTGAGCTTGAAAACGAGGTAGCCT
GCATAGTGGGTGCCGGGGGAGAGCTCACTGCTGTTGATGCTGCCAGAGAC
ACAGAACCAGCAGACTGATAGAAGCTCCGCCACCTTGGAGAATCTGCTTA
ATTAAACGTCAAACACATTAACAACAGTCTTCTATTCCCTGCTATTAATC
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TCCGGGTCTGACCTCTTTGTCCAGTAAAGGTTTTCATTGATCCAAGCAAT
TTCCAGTAGTTCGCTTCCAGAAAGCATGTAGCATTTGGCGCCGTTCTGTC
TATGGAGCCCAAAACTCTAACCATATTTAACAAATCTGTTTTCAGAACAT
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AGGTCGAGGAAAAGCTCCTTCTTGGAGGAGGAATCCACGACGTGGACTGC
CCGCTCCAGGACAGTGTCGCAGTCCGGCGGCAGGAACAACTCCCACACAG
CATCGGAGTACGCCACGGATCGGAAGGTAGAGGATACCACGGAGGCACGG
CAGGCGTCGGCCGGTGTGGTCAGGCCGATAGCCTGCGCTATGCATTCCTC
CGGGAGCTCCTGGATCCTGCCTCCGCCATCTCCGTCCTTCTTTGCCTGCT
TCATGGTCAGGGAATGCATCCCACCTCCGTGCGTTTTATCATCAGTCCAC
AGAGCAGATTAAAGGGCGTCATTTTCCCTCCAAAAAGAACTCTTCGATTT
TTTAAAATTTTACTCCGGAGGAGGACTTGAGGCACATGGGCGGCGAGCAC
GAATATCTGAACCACCCACCTGTTCTTCGAGATTGTTAAATCAGATACAA
TAGAAATCGATATGGGTGAAACTAAAAAGGAATCTGCTGTTAGAAAATCG
GCCCATCACAACAGACTTTGTAGATGGAATGTTGTTTGTCCTAGCCAGAA
GCTTTCTGAATGTGGCCTTGCCACCAATGCTACATAAAGAGCATTAAAGG
GAATATTGCTGTACTAATTTGTTAATGCAAAGTTAGATGGAAAAGCGCAA
CATATATGTTTTTTAAGGGGATTATTGAGGTAAATGGAGGCGAGCGAGCA
CAATATCTGTCACATGGAGATATGGAATAAACCAAAGACGAATATGCCGT
TGGAAAACAAGGTGGGGCGGCCAAGCAAAATTGACCGTGAAGATGAATTC
ATGTTGTCGGATGTAAAGGGGCAATGAAAATCCGTAGTTGTATCAGTTCT
CTTGAATTAGTCAATGTATTGGTTGAAGAGAGTGGCAAATATTCAATTAC
AGCCAGATACACGTATCAGTGGCAAGTCCTGAATTTTCCAGTAATATATA
TATATTGTATATGTTATAGTCGTGTCAGAAATAAACTATTGTTAGTAAAG
ATATATTGATAAATTAGCTGTCTATGTATGATTATATTTTTCAAATGCAC
TTGAGTTAAATGATAAATTTAGCGTACTTGTATTTTATAGTCATGCAATC
TGCTAGTTTCACAAAATAATTATTTAGTGTTGCATAGTACTCTCTGACGC
GAAGACCAGATCTTAAGATTTAGAGATGAAGCAGTTTGGCAGGACCACTT
AATAGGGTTGCCGGGTCATATCAGTCTGCAAAAGCTCCACCTAATATTCC
TTTTACTCTTTCAGTGCCTTTTAACCAAAAAAAAACCTTAAATATACATT
GCAGGAATCGTATTCCCACTTTTTTCCTTCAGACAGAGCTCCACCTAAAT
ATTCCATAGTAACTTTTCAACATGAATTTTTGGCCTTAGAGGCTCTGAGT
GCGTGATGAGTTGAACACAACTGTATAATTTTCTAGCAGAGTCATATCAC
TTTGCACAAGATCAAAAATTAATGGCATGTTCACTATTGAACACAAGGAA
TTGGTCTCAAAGGTCACAACGAGTCACATACAAGAGTTGCATATTCACAT
CACTTTGCCGTATAGTGACTGTTCCGTATGAAGATTTGATCATAAGGGCC
TGCGCAGTAATAAAGTGAGCATTATATTGTGAAATCTCGAGCTAGCATGC
GATATTCTGTGGAAATGTACACGTATCAGGTTGATGTGAAAAACCGACAA
AGTGGCAGCACTATAAATTGCAAAACACCCTAATTTTGAAGTTCTGAAGA
AGACTGAAACGAGCATAAGCTGCAACCCGAGCAAGCATAAGCTCGCCGGT
TGATGACCCTCTGCAGTCCTGCCCAGCCTGCCTTTCCTGCCGTCCCAGCT
GCAAAGCTCTTGCCTTCCTTCTCACTGGAGCACCCGCCGCCACGCTTACG
GCTGTCCTCCTCTCTCGCAGGTGCCATCATTTCCAGTCCCCCACACTCTG
TCTCTCTCTGTAGCATCGGCTTTCCCCAAAAGTTTTGAACTTCAGATTCC
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TGATTATTTCAGTATATACCATGTTTTGTTCGGTAATTTCATTTGAAGGT
ATTAGATGATTTGATTAGGAAAGTTGGCATGTTATATTTTGCATTTGTAC
TGAATATGGTATCTAATTTTTTTAAAGATCTGTTCAAGTTACCTGATCCC
AGTTCTTACAATTTCTTGCATACTTTGTTCTCCCTTCTTACTTTTTGCTG
CGTTTCATTGTAATTCTGCATTCATCAACATAATGCATACGTGTACCGAT
GCTGGTAGATATTAAGTTGGTATTTAGCATGCTATTCTTGGCATGTAGGG
CTAGAACACTTCAGAGAAACCATTATGTACAATTTCTTGTCAGGCCTCAG
GGACTAATATCTGTTTCTGGATGCATACGTGTACTGATGCAGGTAGATAT
TAAGTTGGTATTTAGCATGCTATTCTTGGCATGTAGGCTTAGAACACTTA
AGAGAAACCGTTATGTATAATTTCTTGTCAGGCCTCGGGGACTAAATTCT
ATTTCTTCAAGTATTGAGCACAAGGTAAACTTAAAAGCAAATTTCTCATA
CGTGCACATATCAAATAACTTCTTGATCTCTTTTTTCGAGAAAACGCAAA
AGACTTTTGCGTTTCATTGCATTGAACAGGTGGAGAGTTTGGGTGTTATG
TGTTTAGATTGACCTTGTGGGTGTTATGTGCGTGCAGATTCTGTTTCTTG
ATCTCTCTGTGTCCTTGTGGGTGTTATGTGTTTAGATTGACAAAATGGTA
TATAGTCACTACTGAAAACTAAATCGTGCCATGTTCCTCAGAGTAGATAT
TTTATTAGGTGATTAACTCGAGCATTCACTAGATTTTTAACAGGAGCCCA
GTATTACTAACTGAAAAACATTTAGTCATGACAATCACAATCCATTTGTA
AAAGTAAAAGAGCATATTCGTAATACTGCTATGAATCTTTATCATATATT
AATGCAAACTCAGACTTGAAAGAAAAAAGTTAGCAGGTTGCAAAGCGCTT
GAAAATATCATTTTTATTACTCCTTATAGTTAAGCAGAGATCTCCCTCCA
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CGCAGCTGCAGAGCAGGTGGCTGGTGGTTTCTCATCAGCAGTTATCGAAC
GTGTTGCTGACAAAACGATGGAATTCCTTGGGAGCAACTACAATCTGAGC
CATGCTACTGAAGAGCTTCTGAACAAACTGCGCACAGGCCTCACCATGGT
GAAGGCCATTACGGAGGTGGCTGACAACCAGATTATCATAGGAACTAGTC
TGACCAAGTGGCTAAGGAACCTCCATGATGCTGCCTATGAAGCTGAGGAT
GTGCTTGACAGATTTGATTCTCATGAGATAGTCGCCGGAAAGAGAAAGGT
GAGTGAGCTCATTTTGTCATCGGTTAGGGCCTTGAGAAGTTTGATTCTAC
CTGATGAGTGCATGAAAATGCTTGAATGTGTTGTGCAAAAGCTAGACCAC
CTTTGTGCAACGTCCAGTACACTTGTTGAGCTCATGAAGCAGAGTATTTC
AACAACCATGAAGGAGAGAATTGGGGGAGAGACTACTTCTCGTGTTCCAG
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ATTATTTTGGATTCATCTGGCTCTGGACCAGAATCCAACAGTGTAAGAGC
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TTGGTATGAGTGGGGTTGGGAAGACTTCCCTTGCTCAAGTAATTTACAAT
CATGGAAATGTGAAGGGTCACTTTAGACAGAGAGCATGGGTGTACGTTTC
AAAACACTTCAGTGTCAAAAGAACATTGCAAGAGGTATTGCGCTCTTTTA
AAGGAAATGATTCATCTTTTGACTACTCAGACAGTTTGGAAACAACAGTG
AACAATATTCAAAGTGTCATCCAACGGGATGGAAGATTCTTTCTTGTGAT
AGACAGTGTTTGGGACGAGATGTGTGACCAATGGAGTAGTTTGCTTACAG
CCATAGCCTGTGAAGTGCCTGGGAGTGTAGTTCTTGTCACAACACAAAGC
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CTACCAATGTTGCTGCTCAGAATAATCAGAATCTTTTGCTAATTGGTGAG
CAAATAGCAAAAAGACTAGATGGTCTGCCGTTAGCAGCAAAAATAATGGG
AAATCTGTTGAGGTCCAGATTAAATGTTGACCAGTGGAGGTGCATCCGAG
AGAGCGATTGGTGGGACCTGAGTGAAGTTCTTTGTGGAATCCTTCCTTAT
ATGGGAATTAGTTATCAAGATCTACAACCTAGACAAAGGCAGAGCTTCGC
TTTCTGTTCAATCTTTCCACAAAATTACTTGTTTGATAAGGACAGATTGG
TCAGTATGTGGATTTCTCATGATTTCATCCAACAAAGAGAATTTGATGAC
ACTAGGCTAGAGGATATCGGAAGTAAAATGTTTGATGAACTTCTACAAAG
ATCATTTTTCCAGGCTACATTTGACAACAAAAGGTACACTATGCACGATC
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AATTGGTGATCAACTGCATATTGATGAACTAAGCAAGTATAAAAATCTGC
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TCACGTGGATGTGCTGAAAAATATGCTGCCCAACATTGCATCCTTGAGAG
CATTGAGGTTCCTTGATCTTTCTTTCACACGAGTCAATAATTTCCGCAAT
TTCCCTTGTAGTCTTCAAGTTCTATACCTCCGTGGATATACCCGCAATTC
TATTCCTCAAAGTATTAATAGGCTTGCCAAGTTAAAGCACTTGTATGTTG
ATGCTACAGCTCTCTCTCTGATTCCTTGTATCGGGCAACTGAGTCAATTT
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TGAGTTGAAGAATATGCAAGAGCTATCTGGTAAAATCTGCATCAGCAATG
TCCATGTTATTAAGAACAGGCATGAGGCAAATGAAGCCAATATGATCTTG
AAGAAACACCTTCAAGCTGTGGTGTTGAAGGGGAGAAATGTATCCAACGA
TTTACTCGAAGGATTGCAGCCACACTCAAATCTACAAGAGCTCATGATCG
AAGGTTATGGCGCCACATCTTTACCAACCTGGATGTCACAGGCTCACATC
TTCACCAAACTCCATTCCCTTCATGTGGTAAACTGCCGACTTTTATCCAT
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GCTTGCCATCAGTGAAGCATGTTGATGGAACATCTTTTGGTTGTCTCGAA
AGTTTGGAGAACTTCAGAGTTTCTTCGTTGACATCATGGATAGACTGGAC
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TATCTGTATCTCAGAAAATGCGGAGGGTTACGTCTGATTGACGGGTTACA
CTGCTTTCCGAGCCTCAGGGAAGTTGATGTTCTTGGCTGTCCAGACATCC
TTATTGGATTTTCAGGCAGATCAGATAGACAAGATGAGCAGGTTGCACTT
CACCTCACTAGTCTGGCAACGGATGTCAGCTTGTTAAATGGACATTGTTT
CCTCCCATCGGTGCGAGTTCTGCACATCGCTTATTTGGAGGCTAGTCATT
TCACCCCGGAGCAGGAGGAGTGGTTTGAGCAGTTAGCCTCCGTCGAAAAA
ATCGTGTTTGATTTCTGTTCTTTTCTCGAGCGTCTCCCTTCGACACTAGC
CAGACTCGCCTCCTTGAAAGTACTTCATATCAAAGTAACGACCCCGGCAT
CGCTGGCAGGAGCCGTACCACAGAACCTCCAAGAGTTGATTATGGATGGC
TTTTATCCTGAGACGGAAAATAACTTCAAACCGGGGGGATCAGATTGGGT
GAACTTCTCGCATGTTCCGTATGTTCGGCTCAACGGGGAGACGGTCCAGA
ACCTGTCGGTTACTGCTGCTTCAACGTCTTCAGACCACCATATTTGAGGA
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GTAAGCACGTGTTTTGCTCTGTAGTTTCTTACTTTTTTAATATATTTCTA
CAAGATGCATTATGACACCTCGCAGGTCCCTCTTTTAGCCTCTGATCGTT
TCACTTTCTTTTATACAAGAGGGAGTGTATGACGGTGGTTTGATCCTTGT
GTGTTGCGCTGTTGCACACGTAACTGACAGAGATGGTGGTAATCTGAAAG
GCTTGGCGCATAGGTACTATTCTCCTGTCCTGATGGTACATGTCTCCAAC
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CTTGTTCAGTCTTCTGGGAAGCAAGCATGATGATTGGTAAATCCATGTCT
GCTCAGTGGACTTGTATTGCACAAACCAGCGAGATACTGAGGAACAAGTG
ATTTGTCAATTAACTCAGCTGGCTAGTGCATCCAGGGCAGTAATCCTGAC
GAGCAAGCCCAGGCAGATCAAGGAGAAAGAGACGGAGGACAAGGAGACCG
TCCTCACCAAGGTAACTGACCAATACTTTGCTGCTCATCTCTAGGTGCGC
GTCGGAAAGGGGGCATTAGGATTATTTTGGACAATTATAAACTTTCTGTT
GATCATGTCATTGCAAGCATTCAACATAAGTTCTTCATCGCTTTTTCCAA
GAACTAAATTATATATTGCGACAAGGGTTCATATCTATTGCTGCATTCGA
CGTGATTAATCCGCTGGTGGCACTCTTCTCATCTGTGTATGCTGCCATTG
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GTAGCGCTGCAGCAATTGGGGCAAGTCGATGTTGATTTCCGCGCCTTCAG
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TGGTGGACTAAAAGACACTTAACTCCATGCATGCTCACTGCACTTGGTAG
TTCCGAGGAAGATCATGTGACGTTAGGGGTCTTCACATAGGTAGAAAACT
GATCGTAAAAAATATTTTTGTTTGGCAATTTCACACCTTTGACTGACCAT
ATATCATGAATGAACTCAACACTAACTAGACTATTTCTTTTATTAAGCTA
TTATTGTGTTGAGAGTTCATCCGCATAGCTGTATTCAATGATACCGATGA
ATATGAGAACGATGGCATTACCTACAGGTGGCGGCTGGGCACCGAGGTGT
TTTGAGACCGATGACGCTGTTGCTGATGGTGGACGATGCACTGGAGCAGT
CGGAGAATGTCCACCGTGCCTAGTGTTTCCTCAGCAGGAAAGATCATACA
GGGTAACCTTTCTATTTGCTCTGTGCAACAGTTCTTTTGTGTACACCATT
GGTTGCAACTGAACTGAACTGTAGTTTACTGAACTTATGGCATGTGTACG
CTGTGAACTGCAGGTGAGTTGGTGAACATCTTGTACAAGAGGAAAGAGGG
ATGTTTCTGGTTCCAAGGAAGACAGCTATCGACTCGTCCCGTCGCCTCAC
TGGCGTCATCTTCGCCTCACTTAGCATCTGCATTCAGTCTGGACTTGCGG
CTGTCTCTGAATGATGAGATGCGCGAGATAATTTCTGCTCGAACTTGTAG
TTGATCTGTTTCAGGGCACAAGACAAAATGTACCATGTGGCACACAGCTT
AGCTCTTGTTGAACTTAGATGCCCTTTTCTTTCTTCTCTTGGCAGCAACC
CTCAGATTCGATTGTATCGCCGTAGGGCAAAGTGAAGGCAGTCTCCAGTT
CTGCGATATGTTCATCATACCTGTTGAGCCTCATTGTGATCTGTTTAAAT
TGTCAGTGTTCAAGATGTAGATTCCAAAGTTTCAAGGGAAAAAAAATGTC
TGCTACCATGGTATTTGTTTTTGGCAAATGTTAGCCTGGTAGTAACATTA
CCAAGAGCTCAAGGAAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.